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7mkb

Human leukocyte antigen A*0201 in complex with SARS-CoV-2 epitope YLQPRTFLL

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 74.7 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MHC class I antigen

Homo sapiens

UniProt U5YJM1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 25–298 片段：UNP residues 25-298 Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） Spike protein S1 × 1 （P0DTC2） GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；290 K；17% PEG10000, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 0.1 M ammonium acetate 分辨率 1.90 Å R-free 0.209

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7MKB Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6O4Y Structure of HLA-A2:01 with peptide MM91 提交 2019-03-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–298（274 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295.15 K；30% PEG 4000, 0.1M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2M LITHIUM SULFATE
分辨率 1.58 Å R-free 0.205
6O4Z Structure of HLA-A2:01 with peptide MM92 提交 2019-03-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–298（274 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295.15 K；30% PEG 4000, 0.1M TRIS-HCL PH 8.0, 0.2M LITHIUM SULFATE
分辨率 1.50 Å R-free 0.193
6O51 Structure of HLA-A2:01 with peptide MM90 提交 2019-03-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–298（274 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 6 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295.15 K；30% PEG 4000, 0.1M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2M LITHIUM SULFATE
分辨率 1.55 Å R-free 0.225
6O53 Structure of HLA-A2:01 with peptide MM96 提交 2019-03-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–298（274 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295.15 K；30% PEG 4000, 0.1M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2M LITHIUM SULFATE
分辨率 1.40 Å R-free 0.210
6Z9W Human Class I Major Histocompatibility Complex, A02 allele, presenting LLGWVFAQV 提交 2020-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–299（275 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；PACT premier screen, condition D02: 0.1M MMT buffer, 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.281
6Z9W Human Class I Major Histocompatibility Complex, A02 allele, presenting LLGWVFAQV 提交 2020-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 25–299（275 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；PACT premier screen, condition D02: 0.1M MMT buffer, 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.281
7LG2 Human leukocyte antigen A*0201 in complex with SARS-CoV2 epitope ALWEIQQVV 提交 2021-01-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–298（274 aa） 片段：UNP residues 25-298
未记录 GOL GLYCEROL × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；290 K；25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 0.2 M magnesium chloride
分辨率 2.40 Å R-free 0.254
7LG3 Human leukocyte antigen A*0201 in complex with SARS-CoV2 epitope KLWAQCVQL 提交 2021-01-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–298（274 aa） 片段：UNP residues 25-298
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；290 K；20% PEG4000, 0.1 M sodium acetate, pH 5.6, 20% isopropanol
分辨率 2.30 Å R-free 0.248
7Q9B MHC Class I A02 Allele presenting EAAGIGILTV, in complex with Mel8 TCR 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 AAA 25–299（275 aa）
链 FFF 25–299（275 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K
分辨率 3.24 Å R-free 0.277
9QQE Cryo-EM structure of the SN230G6 Fab - HLA-A*02:01 human alloantibody-HLA complex 提交 2025-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 25–299（275 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；1X Phosphate-Buffered Saline (PBS)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å

共 9 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 U5YJM1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–274； UniProt 25–298

Beta-2-microglobulin

Homo sapiens

UniProt P61769

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 21–119 片段：UNP residues 21-119 MHC class I antigen × 1 （U5YJM1） Spike protein S1 × 1 （P0DTC2） GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；290 K；17% PEG10000, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 0.1 M ammonium acetate 分辨率 1.90 Å R-free 0.209

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7MKB Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1A1M MHC CLASS I MOLECULE B*5301 COMPLEXED WITH PEPTIDE TPYDINQML FROM GAG PROTEIN OF HIV2 提交 1997-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；18% PEG8000 0.1M SODIUM CACODYLATE PH6.5 0.2M CALCIUM ACETATE
分辨率 2.30 Å
1A1N MHC CLASS I MOLECULE B*3501 COMPLEXED WITH PEPTIDE VPLRPMTY FROM THE NEF PROTEIN (75-82) OF HIV1 提交 1997-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；18% PEG8000 0.1M SODIUM CACODYLATE PH6.5 0.2M CALCIUM ACETATE
分辨率 2.00 Å
1A1O MHC CLASS I MOLECULE B*5301 COMPLEXED WITH PEPTIDE LS6 (KPIVQYDNF) FROM THE MALARIA PARASITE P. FALCIPARUM 提交 1997-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；18% PEG8000 0.1M SODIUM CACODYLATE PH6.5 0.2M CALCIUM ACETATE
分辨率 2.30 Å
1A6Z HFE (HUMAN) HEMOCHROMATOSIS PROTEIN 提交 1998-03-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.277
1A6Z HFE (HUMAN) HEMOCHROMATOSIS PROTEIN 提交 1998-03-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.277
1A9B DECAMER-LIKE CONFORMATION OF A NANO-PEPTIDE BOUND TO HLA-B3501 DUE TO NONSTANDARD POSITIONING OF THE C-TERMINUS 提交 1998-04-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6；20% MPD, 20% PEG 6000, 1% GLYCEROL, 100 MM SODIUM CITRATE, PH 5.6
分辨率 3.20 Å R-free 0.305
1A9B DECAMER-LIKE CONFORMATION OF A NANO-PEPTIDE BOUND TO HLA-B3501 DUE TO NONSTANDARD POSITIONING OF THE C-TERMINUS 提交 1998-04-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6；20% MPD, 20% PEG 6000, 1% GLYCEROL, 100 MM SODIUM CITRATE, PH 5.6
分辨率 3.20 Å R-free 0.305
1A9E DECAMER-LIKE CONFORMATION OF A NANO-PEPTIDE BOUND TO HLA-B3501 DUE TO NONSTANDARD POSITIONING OF THE C-TERMINUS 提交 1998-04-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.9；4 M SODIUM FORMATE, PH 7.9
分辨率 2.50 Å R-free 0.260
1AGB ANTAGONIST HIV-1 GAG PEPTIDES INDUCE STRUCTURAL CHANGES IN HLA B8-HIV-1 GAG PEPTIDE (GGRKKYKL-3R MUTATION) 提交 1997-03-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：EXTRACELLULAR
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；30% PEG 4000 0.1M SODIUM CITRATE, PH 6.5 0.2M AMMONIUM ACETATE
分辨率 2.20 Å
1AGC ANTAGONIST HIV-1 GAG PEPTIDES INDUCE STRUCTURAL CHANGES IN HLA B8-HIV-1 GAG PEPTIDE (GGKKKYQL-7Q MUTATION) 提交 1997-03-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：EXTRACELLULAR
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；30% PEG 4000 0.1M SODIUM CITRATE, PH 6.5 0.03M AMMONIUM ACETATE
分辨率 2.10 Å
1AGD ANTAGONIST HIV-1 GAG PEPTIDES INDUCE STRUCTURAL CHANGES IN HLA B8-HIV-1 GAG PEPTIDE (GGKKKYKL-INDEX PEPTIDE) 提交 1997-03-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：EXTRACELLULAR
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；30% PEG 4000 0.1M SODIUM CITRATE, PH 6.5 0.2M AMMONIUM ACETATE
分辨率 2.05 Å
1AGE ANTAGONIST HIV-1 GAG PEPTIDES INDUCE STRUCTURAL CHANGES IN HLA B8-HIV-1 GAG PEPTIDE (GGKKKYRL-7R MUTATION) 提交 1997-03-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：EXTRACELLULAR
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；30% PEG 4000 0.1M SODIUM CITRATE, PH 6.5 0.03M AMMONIUM ACETATE
分辨率 2.30 Å
1AGF ANTAGONIST HIV-1 GAG PEPTIDES INDUCE STRUCTURAL CHANGES IN HLA B8-HIV-1 GAG PEPTIDE (GGKKRYKL-5R MUTATION) 提交 1997-03-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：EXTRACELLULAR
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；30% PEG 4000 0.1M SODIUM CITRATE, PH 6.5 0.03M AMMONIUM ACETATE
分辨率 2.20 Å
1AKJ COMPLEX OF THE HUMAN MHC CLASS I GLYCOPROTEIN HLA-A2 AND THE T CELL CORECEPTOR CD8 提交 1997-05-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 12% PEG 20000, 100 MM MES, PH 6.5
分辨率 2.65 Å R-free 0.276
1AO7 COMPLEX BETWEEN HUMAN T-CELL RECEPTOR, VIRAL PEPTIDE (TAX), AND HLA-A 0201 提交 1997-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
突变：Y67C, K91C EMC ETHYL MERCURY ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；CRYSTALLIZED FROM 10% PEG 8000, 100 MM MGACETATE, 50 MM NACACODYLATE, PH 6.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.320
1AO7 COMPLEX BETWEEN HUMAN T-CELL RECEPTOR, VIRAL PEPTIDE (TAX), AND HLA-A 0201 提交 1997-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 B 21–119（99 aa）
突变：Y67C, K91C EMC ETHYL MERCURY ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；CRYSTALLIZED FROM 10% PEG 8000, 100 MM MGACETATE, 50 MM NACACODYLATE, PH 6.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.320
1B0G CLASS I HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN (HLA-A2.1)/BETA 2-MICROGLOBULIN/PEPTIDE P1049 COMPLEX 提交 1998-11-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 11–110（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN THE HANGING DROP VAPOR DIFFUSION METHOD. THE RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 12-16% PEG6000, 6% DIOXANE IN 25MM MES BUFFER, PH6.5. THE HANGING DROP WAS A 1:1 MIXTURE OF THE RESERVOIR SOLUTION AND THE PROTEIN SOLUTION WHICH CONTAINED 10MG/ML PROTEIN IN 25MM MES BUFFER, PH6.5., vapor diffusion - hanging drop
分辨率 2.50 Å R-free 0.304
1B0G CLASS I HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN (HLA-A2.1)/BETA 2-MICROGLOBULIN/PEPTIDE P1049 COMPLEX 提交 1998-11-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 11–110（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN THE HANGING DROP VAPOR DIFFUSION METHOD. THE RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 12-16% PEG6000, 6% DIOXANE IN 25MM MES BUFFER, PH6.5. THE HANGING DROP WAS A 1:1 MIXTURE OF THE RESERVOIR SOLUTION AND THE PROTEIN SOLUTION WHICH CONTAINED 10MG/ML PROTEIN IN 25MM MES BUFFER, PH6.5., vapor diffusion - hanging drop
分辨率 2.50 Å R-free 0.304
1B0R CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-A*0201 COMPLEXED WITH A PEPTIDE WITH THE CARBOXYL-TERMINAL GROUP SUBSTITUTED BY A METHYL GROUP 提交 1998-11-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：BETA 2 MICROGLOBULIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.50
分辨率 2.90 Å R-free 0.314
1BD2 COMPLEX BETWEEN HUMAN T-CELL RECEPTOR B7, VIRAL PEPTIDE (TAX) AND MHC CLASS I MOLECULE HLA-A 0201 提交 1998-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.1；12% PEG8000, 20MM MOPS, 100MM MAGNESIUM ACETATE,PH7.1
分辨率 2.50 Å R-free 0.312
1C16 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE GAMMA/DELTA T CELL LIGAND T22 提交 1999-07-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å R-free 0.334
1C16 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE GAMMA/DELTA T CELL LIGAND T22 提交 1999-07-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å R-free 0.334
1C16 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE GAMMA/DELTA T CELL LIGAND T22 提交 1999-07-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å R-free 0.334
1C16 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE GAMMA/DELTA T CELL LIGAND T22 提交 1999-07-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å R-free 0.334
1C16 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE GAMMA/DELTA T CELL LIGAND T22 提交 1999-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 21–119（99 aa）
链 D 21–119（99 aa）
链 F 21–119（99 aa）
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å R-free 0.334
1CE6 MHC CLASS I H-2DB COMPLEXED WITH A SENDAI VIRUS NUCLEOPROTEIN PEPTIDE 提交 1999-03-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.0
分辨率 2.90 Å R-free 0.274
1CG9 COMPLEX RECOGNITION OF THE SUPERTYPIC BW6-DETERMINANT ON HLA-B AND-C MOLECULES BY THE MONOCLONAL ANTIBODY SFR8-B6 提交 1999-03-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.9；4 M SODIUM FORMATE, PH 7.9
分辨率 2.70 Å R-free 0.253
1DE4 HEMOCHROMATOSIS PROTEIN HFE COMPLEXED WITH TRANSFERRIN RECEPTOR 提交 1999-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–119（99 aa）
链 E 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 8000, TRIS, TRIMETHYLAMINE HCL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.265
1DE4 HEMOCHROMATOSIS PROTEIN HFE COMPLEXED WITH TRANSFERRIN RECEPTOR 提交 1999-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 8000, TRIS, TRIMETHYLAMINE HCL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.265
1DUY CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-A*0201/OCTAMERIC TAX PEPTIDE COMPLEX 提交 2000-01-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；13-20% polyethylene glycol 6000, 25 mM MES buffer, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.15 Å R-free 0.254
1DUY CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-A*0201/OCTAMERIC TAX PEPTIDE COMPLEX 提交 2000-01-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；13-20% polyethylene glycol 6000, 25 mM MES buffer, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.15 Å R-free 0.254
1DUZ HUMAN CLASS I HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN (HLA-A 0201) IN COMPLEX WITH A NONAMERIC PEPTIDE FROM HTLV-1 TAX PROTEIN 提交 2000-01-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；13-20% polyethylene glycol 6000, 25 mM MES buffer, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.250
1DUZ HUMAN CLASS I HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN (HLA-A 0201) IN COMPLEX WITH A NONAMERIC PEPTIDE FROM HTLV-1 TAX PROTEIN 提交 2000-01-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；13-20% polyethylene glycol 6000, 25 mM MES buffer, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.250
1EFX STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THE HUMAN NATURAL KILLER CELL RECEPTOR KIR2DL2 AND A CLASS I MHC LIGAND HLA-CW3 提交 2000-02-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG 20000, calcium chloride, sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
1EXU CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN MHC-RELATED FC RECEPTOR 提交 2000-05-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；295 K；ammonium sulfate, glycerol, tris, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 2.70 Å R-free 0.247
1HHG THE ANTIGENIC IDENTITY OF PEPTIDE(SLASH)MHC COMPLEXES: A COMPARISON OF THE CONFORMATION OF FIVE PEPTIDES PRESENTED BY HLA-A2 提交 1993-06-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å
1HHG THE ANTIGENIC IDENTITY OF PEPTIDE(SLASH)MHC COMPLEXES: A COMPARISON OF THE CONFORMATION OF FIVE PEPTIDES PRESENTED BY HLA-A2 提交 1993-06-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å
1HHH THE ANTIGENIC IDENTITY OF PEPTIDE(SLASH)MHC COMPLEXES: A COMPARISON OF THE CONFORMATION OF FIVE PEPTIDES PRESENTED BY HLA-A2 提交 1993-06-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
1HHI THE ANTIGENIC IDENTITY OF PEPTIDE(SLASH)MHC COMPLEXES: A COMPARISON OF THE CONFORMATION OF FIVE PEPTIDES PRESENTED BY HLA-A2 提交 1993-06-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1HHI THE ANTIGENIC IDENTITY OF PEPTIDE(SLASH)MHC COMPLEXES: A COMPARISON OF THE CONFORMATION OF FIVE PEPTIDES PRESENTED BY HLA-A2 提交 1993-06-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1HHJ THE ANTIGENIC IDENTITY OF PEPTIDE(SLASH)MHC COMPLEXES: A COMPARISON OF THE CONFORMATION OF FIVE PEPTIDES PRESENTED BY HLA-A2 提交 1993-06-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1HHJ THE ANTIGENIC IDENTITY OF PEPTIDE(SLASH)MHC COMPLEXES: A COMPARISON OF THE CONFORMATION OF FIVE PEPTIDES PRESENTED BY HLA-A2 提交 1993-06-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1HHK THE ANTIGENIC IDENTITY OF PEPTIDE(SLASH)MHC COMPLEXES: A COMPARISON OF THE CONFORMATION OF FIVE PEPTIDES PRESENTED BY HLA-A2 提交 1993-06-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1HHK THE ANTIGENIC IDENTITY OF PEPTIDE(SLASH)MHC COMPLEXES: A COMPARISON OF THE CONFORMATION OF FIVE PEPTIDES PRESENTED BY HLA-A2 提交 1993-06-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1HLA STRUCTURE OF THE HUMAN CLASS I HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN, HLA-A2 提交 1987-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 M 21–117（97 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.50 Å
1HSA THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF HLA-B27 AT 2.1 ANGSTROMS RESOLUTION SUGGESTS A GENERAL MECHANISM FOR TIGHT PEPTIDE BINDING TO MHC 提交 1992-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 THE FRAGMENT CRYSTALLIZED WAS THE EXTRACELLULAR PORTION OF THE PROTEIN CLEAVED FROM DETERGENT MICELLES WITH PAPAIN
分辨率 2.10 Å
1HSA THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF HLA-B27 AT 2.1 ANGSTROMS RESOLUTION SUGGESTS A GENERAL MECHANISM FOR TIGHT PEPTIDE BINDING TO MHC 提交 1992-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 THE FRAGMENT CRYSTALLIZED WAS THE EXTRACELLULAR PORTION OF THE PROTEIN CLEAVED FROM DETERGENT MICELLES WITH PAPAIN
分辨率 2.10 Å
1HSB DIFFERENT LENGTH PEPTIDES BIND TO HLA-AW68 SIMILARLY AT THEIR ENDS BUT BULGE OUT IN THE MIDDLE 提交 1993-03-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ALA ALANINE × 1 ARG ARGININE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å
1I1F Crystal structure of human class i mhc (hla-a2.1) complexed with beta 2-microglobulin and hiv-rt variant peptide i1y 提交 1999-04-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 12–110（99 aa） 片段：BETA 2-MICROGLOBULIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN THE HANGING DROP VAPOR DIFFUSION METHOD. THE RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 16% PEG8000 IN 25MM MES BUFFER, PH6.5. THE HANGING DROP WAS A 1:1 MIXTURE OF THE RESERVOIR SOLUTION AND THE PROTEIN SOLUTION WHICH CONTAINED 10MG/ML PROTEIN IN 25MM MES BUFFER, PH6.5.
分辨率 2.80 Å R-free 0.315
1I1F Crystal structure of human class i mhc (hla-a2.1) complexed with beta 2-microglobulin and hiv-rt variant peptide i1y 提交 1999-04-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 12–110（99 aa） 片段：BETA 2-MICROGLOBULIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN THE HANGING DROP VAPOR DIFFUSION METHOD. THE RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 16% PEG8000 IN 25MM MES BUFFER, PH6.5. THE HANGING DROP WAS A 1:1 MIXTURE OF THE RESERVOIR SOLUTION AND THE PROTEIN SOLUTION WHICH CONTAINED 10MG/ML PROTEIN IN 25MM MES BUFFER, PH6.5.
分辨率 2.80 Å R-free 0.315
1I1Y CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN CLASS I MHC (HLA-A2.1) COMPLEXED WITH BETA 2-MICROGLOBULIN AND HIV-RT VARIANT PEPTIDE I1Y 提交 1999-04-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 12–110（99 aa） 片段：BETA 2-MICROGLOBULIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN THE HANGING DROP VAPOR DIFFUSION METHOD. THE RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 18% PEG8000, IN 25MM MES BUFFER, PH6.5. THE HANGING DROP WAS A 1:1 MIXTURE OF THE RESERVOIR SOLUTION AND THE PROTEIN SOLUTION WHICH CONTAINED 10MG/ML PROTEIN IN 25MM MES BUFFER, PH6.5., pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.20 Å R-free 0.289
1I1Y CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN CLASS I MHC (HLA-A2.1) COMPLEXED WITH BETA 2-MICROGLOBULIN AND HIV-RT VARIANT PEPTIDE I1Y 提交 1999-04-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 12–110（99 aa） 片段：BETA 2-MICROGLOBULIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN THE HANGING DROP VAPOR DIFFUSION METHOD. THE RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 18% PEG8000, IN 25MM MES BUFFER, PH6.5. THE HANGING DROP WAS A 1:1 MIXTURE OF THE RESERVOIR SOLUTION AND THE PROTEIN SOLUTION WHICH CONTAINED 10MG/ML PROTEIN IN 25MM MES BUFFER, PH6.5., pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.20 Å R-free 0.289
1I4F CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-A*0201/MAGE-A4-PEPTIDE COMPLEX 提交 2001-02-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 1PG 2-(2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；PEG 8000, Tris-HCl, NaCl. PEG 400 as cryo protectant., pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.40 Å R-free 0.173
1IM3 Crystal Structure of the human cytomegalovirus protein US2 bound to the MHC class I molecule HLA-A2/tax 提交 2001-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：recombinant residues 1-99
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；PEG 6000, MPD, Tris, pH 7.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.20 Å R-free 0.240
1IM3 Crystal Structure of the human cytomegalovirus protein US2 bound to the MHC class I molecule HLA-A2/tax 提交 2001-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：recombinant residues 1-99
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；PEG 6000, MPD, Tris, pH 7.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.20 Å R-free 0.240
1IM3 Crystal Structure of the human cytomegalovirus protein US2 bound to the MHC class I molecule HLA-A2/tax 提交 2001-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 21–119（99 aa） 片段：recombinant residues 1-99
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；PEG 6000, MPD, Tris, pH 7.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.20 Å R-free 0.240
1IM3 Crystal Structure of the human cytomegalovirus protein US2 bound to the MHC class I molecule HLA-A2/tax 提交 2001-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 N 21–119（99 aa） 片段：recombinant residues 1-99
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；PEG 6000, MPD, Tris, pH 7.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.20 Å R-free 0.240
1IM9 Crystal structure of the human natural killer cell inhibitory receptor KIR2DL1 bound to its MHC ligand HLA-Cw4 提交 2001-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 21–119（99 aa）
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG6000, magnesium chloride, ethylene glycol, N-(2-acetamindo)iminodiacetic acid , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
1JF1 Crystal structure of HLA-A2*0201 in complex with a decameric altered peptide ligand from the MART-1/Melan-A 提交 2001-06-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：BETA-CHAIN OF MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX CLASS I MOLECULES
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；16% PEG, 25 mM MES and 0.10% NaN3, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, at 293K
分辨率 1.85 Å R-free 0.225
1JGD HLA-B*2709 bound to deca-peptide s10R 提交 2001-06-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG 8000, Tris-HCl, NaCl; glycerol as cryo protectant, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.90 Å R-free 0.194
1JGE HLA-B*2705 bound to nona-peptide m9 提交 2001-06-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG 8000, Tris-HCl, NaCl; PEG 400 as cryo protectant, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.10 Å R-free 0.250
1JHT Crystal structure of HLA-A2*0201 in complex with a nonameric altered peptide ligand (ALGIGILTV) from the MART-1/Melan-A. 提交 2001-06-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：BETA-CHAIN OF MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX CLASS I MOLECULES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；16% PEG, 25 mM MES, 0.10% NaN3, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, at 293K
分辨率 2.15 Å R-free 0.252
1JNJ NMR solution structure of the human beta2-microglobulin 提交 2001-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.4；310 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl, 70 mM phosphate buffer；压力 ambient
NMR测量条件 pH 6.4；310 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl, 70 mM phosphate buffer；压力 ambient
NMR样品组成 0.68 mM beta2-m; 70 mM phosphate buffer NA, 100 mM NaCl. | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.37 mM beta2-m; 70 mM phosphate buffer NA, 100 mM NaCl. | 100% D2O
分辨率未提供
1K5N HLA-B*2709 BOUND TO NONA-PEPTIDE M9 提交 2001-10-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291 K；PEG 8000, Bicine, NaCl, glycerol as cryo protectant, pH 9.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.09 Å R-free 0.148
1KPR The human non-classical major histocompatibility complex molecule HLA-E 提交 2002-01-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；ammonium sulfate, PEG 400, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.289
1KPR The human non-classical major histocompatibility complex molecule HLA-E 提交 2002-01-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；ammonium sulfate, PEG 400, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.289
1KPR The human non-classical major histocompatibility complex molecule HLA-E 提交 2002-01-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 21–119（99 aa）
链 D 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；ammonium sulfate, PEG 400, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.289
1KPR The human non-classical major histocompatibility complex molecule HLA-E 提交 2002-01-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–119（99 aa）
链 D 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；ammonium sulfate, PEG 400, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.289
1LDS Crystal Structure of monomeric human beta-2-microglobulin 提交 2002-04-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；289 K；4-8% (w/v) PEG4000, 20% Isopropanol, 100mM sodium citrate, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
分辨率 1.80 Å R-free 0.233
1LP9 Xenoreactive complex AHIII 12.2 TCR bound to p1049/HLA-A2.1 提交 2002-05-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG3350, 25mM MES , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
1LP9 Xenoreactive complex AHIII 12.2 TCR bound to p1049/HLA-A2.1 提交 2002-05-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG3350, 25mM MES , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
1M05 HLA B8 in complex with an Epstein Barr Virus determinant 提交 2002-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 CD CADMIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.90 Å R-free 0.283
1M05 HLA B8 in complex with an Epstein Barr Virus determinant 提交 2002-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 CD CADMIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.90 Å R-free 0.283
1MHE THE HUMAN NON-CLASSICAL MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX MOLECULE HLA-E 提交 1998-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–119（99 aa）
链 D 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5
分辨率 2.85 Å R-free 0.235
1MI5 The crystal structure of LC13 TcR in complex with HLAB8-EBV peptide complex 提交 2002-08-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG, ammonium acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.288
1N2R A natural selected dimorphism in HLA B*44 alters self, peptide reportoire and T cell recognition. 提交 2002-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACY ACETIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；298 K；30% PEG 4K, 0.1M citrate, 0.2M ammonium acetate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.261
1P7Q Crystal Structure of HLA-A2 Bound to LIR-1, a Host and Viral MHC Receptor 提交 2003-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 4000, Sodium Acetate, Tris, L-Cysteine, Triton X-100, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.309
1PY4 Beta2 microglobulin mutant H31Y displays hints for amyloid formations 提交 2003-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：H31Y
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；300 K；PEG 4K 31%, glycerol 25%, ammonium acetate 0.2 M, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.90 Å R-free 0.313
1PY4 Beta2 microglobulin mutant H31Y displays hints for amyloid formations 提交 2003-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：H31Y
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；300 K；PEG 4K 31%, glycerol 25%, ammonium acetate 0.2 M, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.90 Å R-free 0.313
1PY4 Beta2 microglobulin mutant H31Y displays hints for amyloid formations 提交 2003-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 21–119（99 aa） 片段：H31Y
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；300 K；PEG 4K 31%, glycerol 25%, ammonium acetate 0.2 M, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.90 Å R-free 0.313
1PY4 Beta2 microglobulin mutant H31Y displays hints for amyloid formations 提交 2003-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：H31Y
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；300 K；PEG 4K 31%, glycerol 25%, ammonium acetate 0.2 M, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.90 Å R-free 0.313
1Q94 Structures of HLA-A*1101 in complex with immunodominant nonamer and decamer HIV-1 epitopes clearly reveal the presence of a middle anchor residue 提交 2003-08-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；PEG 4000,sodium acetate,sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.40 Å R-free 0.272
1Q94 Structures of HLA-A*1101 in complex with immunodominant nonamer and decamer HIV-1 epitopes clearly reveal the presence of a middle anchor residue 提交 2003-08-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；PEG 4000,sodium acetate,sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.40 Å R-free 0.272
1QQD CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-CW4, A LIGAND FOR THE KIR2D NATURAL KILLER CELL INHIBITORY RECEPTOR 提交 1999-06-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 11–109（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG 8000, calcium acetate, sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.0K
分辨率 2.70 Å R-free 0.275
1QR1 POOR BINDING OF A HER-2/NEU EPITOPE (GP2) TO HLA-A2.1 IS DUE TO A LACK OF INTERACTIONS IN THE CENTER OF THE PEPTIDE 提交 1999-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
突变：B2M HAS AN ADDED METHIONINE FOR BACTERIAL EXPRESSION 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；14% PEG 6000, 25 mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K
分辨率 2.40 Å R-free 0.284
1QR1 POOR BINDING OF A HER-2/NEU EPITOPE (GP2) TO HLA-A2.1 IS DUE TO A LACK OF INTERACTIONS IN THE CENTER OF THE PEPTIDE 提交 1999-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
突变：B2M HAS AN ADDED METHIONINE FOR BACTERIAL EXPRESSION 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；14% PEG 6000, 25 mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K
分辨率 2.40 Å R-free 0.284
1QRN CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN A6 TCR COMPLEXED WITH HLA-A2 BOUND TO ALTERED HTLV-1 TAX PEPTIDE P6A 提交 1999-06-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；287 K；seeding with hanging drop vapor diffusion; 50 mM MOPS pH 7.0, 75 mM MgSO4, 13% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
分辨率 2.80 Å R-free 0.273
1QSE STRUCTURE OF HUMAN A6-TCR BOUND TO HLA-A2 COMPLEXED WITH ALTERED HTLV-1 TAX PEPTIDE V7R 提交 1999-06-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 11–110（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；seeding with hanging drop vapor diffusion; 50 mM MOPS, pH 7.0, 75 mM MgSO4 and 13% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.80 Å R-free 0.290
1QSF STRUCTURE OF A6-TCR BOUND TO HLA-A2 COMPLEXED WITH ALTERED HTLV-1 TAX PEPTIDE Y8A 提交 1999-06-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 11–110（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；seeding with hanging drop vapor diffusion; 50 mM MOPS, pH 7.0, 75 mM MgSO4 and 13% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.80 Å R-free 0.286
1QVO STRUCTURES OF HLA-A*1101 IN COMPLEX WITH IMMUNODOMINANT NONAMER AND DECAMER HIV-1 EPITOPES CLEARLY REVEAL THE PRESENCE OF A MIDDLE ANCHOR RESIDUE 提交 2003-08-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；PEG 4000, ammonium acetate, sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.22 Å R-free 0.255
1QVO STRUCTURES OF HLA-A*1101 IN COMPLEX WITH IMMUNODOMINANT NONAMER AND DECAMER HIV-1 EPITOPES CLEARLY REVEAL THE PRESENCE OF A MIDDLE ANCHOR RESIDUE 提交 2003-08-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；PEG 4000, ammonium acetate, sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.22 Å R-free 0.255
1R3H Crystal Structure of T10 提交 2003-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；MPEG5000, MGCL2, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.272
1R3H Crystal Structure of T10 提交 2003-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；MPEG5000, MGCL2, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.272
1R3H Crystal Structure of T10 提交 2003-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；MPEG5000, MGCL2, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.272
1R3H Crystal Structure of T10 提交 2003-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；MPEG5000, MGCL2, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.272
1S9W Crystal Structure Analysis of NY-ESO-1 epitope, SLLMWITQC, in complex with HLA-A2 提交 2004-02-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0M ammonium sulphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.267
1S9X Crystal Structure Analysis of NY-ESO-1 epitope analogue, SLLMWITQA, in complex with HLA-A2 提交 2004-02-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0M ammonium sulphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.279
1S9Y Crystal Structure Analysis of NY-ESO-1 epitope analogue, SLLMWITQS, in complex with HLA-A2 提交 2004-02-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0M ammonium sulphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.273
1SYS Crystal structure of HLA, B*4403, and peptide EEPTVIKKY 提交 2004-04-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；295 K；PEG 4000, 0.2M Ammonium Acetate, 0.2M Sodium Citrate, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.271
1SYV HLA-B*4405 complexed to the dominant self ligand EEFGRAYGF 提交 2004-04-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；295 K；PEG 4000, SODIUM CITRATE, AMMONIUM ACETATE, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.70 Å R-free 0.224
1TMC THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF A CLASS I MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX MOLECULE MISSING THE ALPHA3 DOMAIN OF THE HEAVY CHAIN 提交 1994-12-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1TVB Crystal structure of Melanoma Antigen gp100(209-217) Bound to Human Class I MHC HLA-A2 提交 2004-06-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：beta-chain
未记录 GOL GLYCEROL × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 3350, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.216
1TVB Crystal structure of Melanoma Antigen gp100(209-217) Bound to Human Class I MHC HLA-A2 提交 2004-06-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：beta-chain
未记录 GOL GLYCEROL × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 3350, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.216
1TVH Crystal structure of Modified Melanoma Antigen gp100(209-T2M) Bound to Human Class I MHC HLA-A2 提交 2004-06-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：beta-chain
未记录 GOL GLYCEROL × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 3350, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.247
1TVH Crystal structure of Modified Melanoma Antigen gp100(209-T2M) Bound to Human Class I MHC HLA-A2 提交 2004-06-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：beta-chain
未记录 GOL GLYCEROL × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 3350, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.247
1VGK The crystal structure of class I Major histocompatibility complex, H-2Kd at 2.0 A resolution 提交 2004-04-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG 2000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.06 Å R-free 0.240
1W0V Crystal Structure Of HLA-B*2705 Complexed With the self-Peptide TIS from EGF-response factor 1 提交 2004-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；18% PEG8000, 0.1M TRIS PH 8.0
分辨率 2.27 Å R-free 0.246
1W0W Crystal Structure Of HLA-B*2709 Complexed With the self-Peptide TIS from EGF-response factor 1 提交 2004-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；20% PEG8000, 0.1M TRIS PH 8.5
分辨率 2.11 Å R-free 0.245
1W72 Crystal structure of HLA-A1:MAGE-A1 in complex with Fab-Hyb3 提交 2004-08-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；MES PH 6.5, NACL 600MM, 19% PEG3350, 80MM DIOXANE
分辨率 2.15 Å R-free 0.248
1W72 Crystal structure of HLA-A1:MAGE-A1 in complex with Fab-Hyb3 提交 2004-08-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；MES PH 6.5, NACL 600MM, 19% PEG3350, 80MM DIOXANE
分辨率 2.15 Å R-free 0.248
1X7Q Crystal structure of HLA-A*1101 with sars nucleocapsid peptide 提交 2004-08-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；25% PEG 5000 MME, 0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M MES PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
分辨率 1.45 Å R-free 0.181
1XH3 Conformational Restraints and Flexibility of 14-Meric Peptides in Complex with HLA-B*3501 提交 2004-09-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.48 Å R-free 0.208
1XR8 Crystal Structures of HLA-B*1501 in Complex with Peptides from Human UbcH6 and Epstein-Barr Virus EBNA-3 提交 2004-10-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 URE UREA × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.2M MgAc4H20, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.5, 20% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
1XR9 Crystal Structures of HLA-B*1501 in Complex with Peptides from Human UbcH6 and Epstein-Barr Virus EBNA-3 提交 2004-10-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 URE UREA × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M NH4Ac, 0.1M tri-Sodium Citrate dihydrate, pH 5.6, 30% w/v PEG4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.79 Å R-free 0.232
1XZ0 Crystal structure of CD1a in complex with a synthetic mycobactin lipopeptide 提交 2004-11-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 JH0 6-(HYDROXY-HEXADECANOYL-AMINO)-2-{[(4S)-2-(2-HYDROXY-PHENYL)-4,5-DIHYDRO-OXAZOLE-4-CARBONYL]-AMINO}-HEXANOIC ACID 2-[(3S)-1-(TERT-BUTYL-DIPHENYL-SILANYLOXY)-2-OXO-AZEPAN-3-YLCARBAMOYL]-(1S)-1-METHYL-ETHYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG 2000 MME, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.277
1XZ0 Crystal structure of CD1a in complex with a synthetic mycobactin lipopeptide 提交 2004-11-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 JH0 6-(HYDROXY-HEXADECANOYL-AMINO)-2-{[(4S)-2-(2-HYDROXY-PHENYL)-4,5-DIHYDRO-OXAZOLE-4-CARBONYL]-AMINO}-HEXANOIC ACID 2-[(3S)-1-(TERT-BUTYL-DIPHENYL-SILANYLOXY)-2-OXO-AZEPAN-3-YLCARBAMOYL]-(1S)-1-METHYL-ETHYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG 2000 MME, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.277
1YDP 1.9A crystal structure of HLA-G 提交 2004-12-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.264
1YDP 1.9A crystal structure of HLA-G 提交 2004-12-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.264
1YPZ Immune receptor 提交 2005-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 19–118（100 aa）
链 D 19–118（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.40 Å R-free 0.330
1ZHK Crystal structure of HLA-B*3501 presenting 13-mer EBV antigen LPEPLPQGQLTAY 提交 2005-04-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.2M Ammonium Acetate, 17% w/v PEG 3350, 100mM Cacodylate, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.60 Å R-free 0.231
1ZHL Crystal structure of HLA-B*3508 presenting 13-mer EBV antigen LPEPLPQGQLTAY 提交 2005-04-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.2M Ammonium Acetate, 17% w/v PEG 3350, 100mM Cacodylate, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.50 Å R-free 0.227
1ZS8 Crystal Structure of the Murine MHC Class Ib Molecule M10.5 提交 2005-07-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1 M imidazole, 20% PEG 1000, 0.2 M calcium acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.308
1ZS8 Crystal Structure of the Murine MHC Class Ib Molecule M10.5 提交 2005-07-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1 M imidazole, 20% PEG 1000, 0.2 M calcium acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.308
1ZS8 Crystal Structure of the Murine MHC Class Ib Molecule M10.5 提交 2005-07-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1 M imidazole, 20% PEG 1000, 0.2 M calcium acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.308
1ZS8 Crystal Structure of the Murine MHC Class Ib Molecule M10.5 提交 2005-07-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1 M imidazole, 20% PEG 1000, 0.2 M calcium acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.308
1ZS8 Crystal Structure of the Murine MHC Class Ib Molecule M10.5 提交 2005-07-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1 M imidazole, 20% PEG 1000, 0.2 M calcium acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.308
1ZS8 Crystal Structure of the Murine MHC Class Ib Molecule M10.5 提交 2005-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 B 21–119（99 aa）
链 D 21–119（99 aa）
链 F 21–119（99 aa）
链 H 21–119（99 aa）
链 J 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1 M imidazole, 20% PEG 1000, 0.2 M calcium acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.308
1ZSD Crystal Structure Of HLA-B*3501 Presenting an 11-Mer EBV Antigen EPLPQGQLTAY 提交 2005-05-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：beta-2-microglobulin
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；0.2M ammonium acetate, 17% w/v PEG 3350, 100mM cacodylate, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.70 Å R-free 0.246
1ZT4 The crystal structure of human CD1d with and without alpha-Galactosylceramide 提交 2005-05-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 AGH N-{(1S,2R,3S)-1-[(ALPHA-D-GALACTOPYRANOSYLOXY)METHYL]-2,3-DIHYDROXYHEPTADECYL}HEXACOSANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG3350, potassium fluoride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
1ZT4 The crystal structure of human CD1d with and without alpha-Galactosylceramide 提交 2005-05-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG3350, potassium fluoride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
1ZT4 The crystal structure of human CD1d with and without alpha-Galactosylceramide 提交 2005-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
链 D 21–119（99 aa）
未记录 AGH N-{(1S,2R,3S)-1-[(ALPHA-D-GALACTOPYRANOSYLOXY)METHYL]-2,3-DIHYDROXYHEPTADECYL}HEXACOSANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG3350, potassium fluoride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
1ZVS Crystal structure of the first class MHC mamu and Tat-Tl8 complex 提交 2005-06-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；(NH4)2SO4, Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.257
1ZVS Crystal structure of the first class MHC mamu and Tat-Tl8 complex 提交 2005-06-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；(NH4)2SO4, Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.257
2A83 Crystal structure of hla-b*2705 complexed with the glucagon receptor (gr) peptide (residues 412-420) 提交 2005-07-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 6 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；14% PEG4000,100mM Tris/HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.40 Å R-free 0.150
2AK4 Crystal Structure of SB27 TCR in complex with HLA-B*3508-13mer peptide 提交 2005-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；200mM Potassium Iodide, 16% PEG 3350, 100mM Na Cacodylate, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.278
2AK4 Crystal Structure of SB27 TCR in complex with HLA-B*3508-13mer peptide 提交 2005-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；200mM Potassium Iodide, 16% PEG 3350, 100mM Na Cacodylate, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.278
2AK4 Crystal Structure of SB27 TCR in complex with HLA-B*3508-13mer peptide 提交 2005-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；200mM Potassium Iodide, 16% PEG 3350, 100mM Na Cacodylate, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.278
2AK4 Crystal Structure of SB27 TCR in complex with HLA-B*3508-13mer peptide 提交 2005-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；200mM Potassium Iodide, 16% PEG 3350, 100mM Na Cacodylate, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.278
2AV7 Crystal structure of HTLV-1 TAX peptide Bound to Human Class I MHC HLA-A2 with the K66A mutation in the heavy chain. 提交 2005-08-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.234
2AV7 Crystal structure of HTLV-1 TAX peptide Bound to Human Class I MHC HLA-A2 with the K66A mutation in the heavy chain. 提交 2005-08-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.234
2AXF The Immunogenicity of a Viral Cytotoxic T Cell Epitope is controlled by its MHC-bound Conformation 提交 2005-09-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACY ACETIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；200mM Ammonium Acetate, 17% W/V PEG 3350, 100mM Cacodylate, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.234
2AXG The Immunogenicity of a Viral Cytotoxic T Cell Epitope is controlled by its MHC-bound Conformation 提交 2005-09-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACY ACETIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；200mM Ammonium Acetate, 17% W/V PEG 3350, 100mM Cacodylate, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.234
2BCK Crystal Structure of HLA-A*2402 Complexed with a telomerase peptide 提交 2005-10-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：residues 1-99
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；1.6M Ammonium Sulphate, 0.1M Sodium Chloride, 0.1M HEPES, 10% v/v Dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
2BCK Crystal Structure of HLA-A*2402 Complexed with a telomerase peptide 提交 2005-10-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：residues 1-99
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；1.6M Ammonium Sulphate, 0.1M Sodium Chloride, 0.1M HEPES, 10% v/v Dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
2BCK Crystal Structure of HLA-A*2402 Complexed with a telomerase peptide 提交 2005-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：residues 1-99
链 E 21–119（99 aa） 片段：residues 1-99
未记录 SO4 SULFATE ION × 8 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；1.6M Ammonium Sulphate, 0.1M Sodium Chloride, 0.1M HEPES, 10% v/v Dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
2BNQ Structural and kinetic basis for heightened immunogenicity of T cell vaccines 提交 2005-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：BETA-2-MICROGLOBULIN, RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2；pH 7.20
分辨率 1.70 Å R-free 0.253
2BNR Structural and kinetic basis for heightened immunogenicity of T cell vaccines 提交 2005-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：BETA-2-MICROGLOBULIN, RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2；pH 7.20
分辨率 1.90 Å
2BSR Crystal structures and KIR3DL1 recognition of three immunodominant viral peptides complexed to HLA-B2705 提交 2005-05-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.50
分辨率 2.30 Å R-free 0.280
2BSS Crystal structures and KIR3DL1 recognition of three immunodominant viral peptides complexed to HLA-B2705 提交 2005-05-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–99（99 aa） 片段：IMMUNOGLOBULIN DOMAIN, RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.50
分辨率 2.00 Å
2BST Crystal structures and KIR3DL1 recognition of three immunodominant viral peptides complexed to HLA-B2705 提交 2005-05-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.50
分辨率 2.10 Å
2BVO Structures of Three HIV-1 HLA-B5703-Peptide Complexes and Identification of Related HLAs Potentially Associated with Long-Term Non-Progression 提交 2005-07-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.65 Å R-free 0.235
2BVP Structures of Three HIV-1 HLA-B5703-Peptide Complexes and Identification of Related HLAs Potentially Associated with Long-Term Non-Progression 提交 2005-07-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.35 Å R-free 0.215
2BVQ Structures of Three HIV-1 HLA-B5703-Peptide Complexes and Identification of Related HLAs Potentially Associated with Long-Term Non-Progression 提交 2005-07-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.267
2C7U Conflicting selective forces affect CD8 T-cell receptor contact sites in an HLA-A2 immunodominant HIV epitope. 提交 2005-11-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.50
分辨率 2.38 Å R-free 0.314
2C7U Conflicting selective forces affect CD8 T-cell receptor contact sites in an HLA-A2 immunodominant HIV epitope. 提交 2005-11-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.50
分辨率 2.38 Å R-free 0.314
2CII The crystal structure of H-2Db complexed with a partial peptide epitope suggests an MHC Class I assembly-intermediate 提交 2006-03-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5；25% PEG 6000, 100MM AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM CHLORIDE, 50 MM MES PH 5.0
分辨率 2.55 Å R-free 0.297
2CIK Insights Into Crossreactivity in Human Allorecognition: The Structure of HLA-B35011 Presenting an Epitope derived from Cytochrome P450. 提交 2006-03-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6；0.105M AMMONIUM ACETATE, 0.0525M TRI-SODIUM CITRATE DIHYDRATE PH 5.6 AND 15.75% W/V PEG 4000
分辨率 1.75 Å R-free 0.227
2CLR THREE DIMENSIONAL STRUCTURE OF A PEPTIDE EXTENDING OUT ONE END OF A CLASS I MHC BINDING SITE 提交 1994-08-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å
2CLR THREE DIMENSIONAL STRUCTURE OF A PEPTIDE EXTENDING OUT ONE END OF A CLASS I MHC BINDING SITE 提交 1994-08-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å
2D31 Crystal structure of disulfide-linked HLA-G dimer 提交 2005-09-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；293 K；CAPS, PEG8000, NaCl, pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.298
2D31 Crystal structure of disulfide-linked HLA-G dimer 提交 2005-09-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；293 K；CAPS, PEG8000, NaCl, pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.298
2D4D The Crystal Structure of human beta2-microglobulin, L39W W60F W95F Mutant 提交 2005-10-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：L39W, W60F, W95F NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；288 K；15% PEG4000, 25% glycerol, 0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.10 Å R-free 0.265
2D4F The Crystal Structure of human beta2-microglobulin 提交 2005-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；288 K；20% PEG4000, 25% glycerol, 0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 1.70 Å R-free 0.233
2DYP Crystal Structure of LILRB2(LIR2/ILT4/CD85d) complexed with HLA-G 提交 2006-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：residues in data base 24-219
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris-HCl pH8.0, 45% PEG400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.278
2E8D 3D Structure of amyloid protofilaments of beta2-microglobulin fragment probed by solid-state NMR 提交 2007-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 40–61（22 aa） 片段：residues 40-61 (in UniProt numbering)
链 B 40–61（22 aa） 片段：residues 40-61 (in UniProt numbering)
链 C 40–61（22 aa） 片段：residues 40-61 (in UniProt numbering)
链 D 40–61（22 aa） 片段：residues 40-61 (in UniProt numbering)
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 245 K；压力 ambient
NMR样品组成 myloid fiber in a solid state
分辨率未提供
2ESV Structure of the HLA-E-VMAPRTLIL/KK50.4 TCR complex 提交 2005-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；19-22% PEG 3350, 0.2M Potassium Iodide, pH 6.9-7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.292
2F53 Directed Evolution of Human T-cell Receptor CDR2 residues by phage display dramatically enhances affinity for cognate peptide-MHC without apparent cross-reactivity 提交 2005-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：Beta-2 Microglobulin, residues 21-119
突变：K91C NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；85 mM HEPES, 8.5% Iso-propanol, 17% PEG4000, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.231
2F53 Directed Evolution of Human T-cell Receptor CDR2 residues by phage display dramatically enhances affinity for cognate peptide-MHC without apparent cross-reactivity 提交 2005-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：Beta-2 Microglobulin, residues 21-119
突变：K91C NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；85 mM HEPES, 8.5% Iso-propanol, 17% PEG4000, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.231
2F54 Directed evolution of human T cell receptor CDR2 residues by phage display dramatically enhances affinity for cognate peptide-MHC without increasing apparent cross-reactivity 提交 2005-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：Beta-2-microglobulin, residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；85 mM HEPES, 8.5% iso-propanol, 17% PEG 4000, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.286
2F54 Directed evolution of human T cell receptor CDR2 residues by phage display dramatically enhances affinity for cognate peptide-MHC without increasing apparent cross-reactivity 提交 2005-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：Beta-2-microglobulin, residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；85 mM HEPES, 8.5% iso-propanol, 17% PEG 4000, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.286
2F74 Murine MHC class I H-2Db in complex with human b2-microglobulin and LCMV-derived immunodminant peptide gp33 提交 2005-11-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；290 K；20% PEG 6K, pH 8, VAPOR DIFFUSION, temperature 290K
分辨率 2.70 Å R-free 0.298
2F74 Murine MHC class I H-2Db in complex with human b2-microglobulin and LCMV-derived immunodminant peptide gp33 提交 2005-11-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；290 K；20% PEG 6K, pH 8, VAPOR DIFFUSION, temperature 290K
分辨率 2.70 Å R-free 0.298
2F8O A Native to Amyloidogenic Transition Regulated by a Backbone Trigger 提交 2005-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 21–119（99 aa）
链 B 21–119（99 aa）
突变：P32A 突变：P32A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；31% PEG 4000, 25% glycerol, 0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate; drops contained 1ul of ~19 mg/ml protein, 1ul of mother liquor, and 1ul of 0.05M sodium acetate pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.70 Å R-free 0.227
2FYY The role of T cell receptor alpha genes in directing human MHC restriction 提交 2006-02-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；17% PEG 3350, 100mM cacodylate, 200mM ammonium acetate, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.50 Å R-free 0.236
2FZ3 The role of T cell receptor alpha genes in directing human MHC restriction 提交 2006-02-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；17% PEG 3350, 100mM cacodylate, 200mM ammonium acetate, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.275
2GIT Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the modified HTLV-1 TAX (Y5K-4-[3-Indolyl]-butyric acid) peptide 提交 2006-03-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：beta-2-microglobulin
未记录 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 FMT FORMIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, HCOOH 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.219
2GIT Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the modified HTLV-1 TAX (Y5K-4-[3-Indolyl]-butyric acid) peptide 提交 2006-03-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：beta-2-microglobulin
未记录 GOL GLYCEROL × 4 FMT FORMIC ACID × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, HCOOH 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.219
2GJ6 The complex between TCR A6 and human Class I MHC HLA-A2 with the modified HTLV-1 TAX (Y5K-4-[3-Indolyl]-butyric acid) peptide 提交 2006-03-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 13 3IB 3-INDOLEBUTYRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；297 K；PEG8000 30%, 0.1 M Sodium Cacodylate, 0.2 M Ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 2.56 Å R-free 0.250
2GT9 Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the decameric Melan-A/MART-1(26-35) peptide 提交 2006-04-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：Beta-2-microglobulin (Residues 21-119)
未记录 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.75 Å R-free 0.213
2GT9 Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the decameric Melan-A/MART-1(26-35) peptide 提交 2006-04-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：Beta-2-microglobulin (Residues 21-119)
未记录 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.75 Å R-free 0.213
2GTW Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the nonameric Melan-A/MART-1(27-35) peptide having A27L substitution 提交 2006-04-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 FMT FORMIC ACID × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 3350 24%, MES 0.025M, HCOOK 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.55 Å R-free 0.218
2GTW Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the nonameric Melan-A/MART-1(27-35) peptide having A27L substitution 提交 2006-04-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 FMT FORMIC ACID × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 3350 24%, MES 0.025M, HCOOK 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.55 Å R-free 0.218
2GTZ Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the nonameric Melan-A/MART-1(27-35) peptide having A28L substitution 提交 2006-04-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 3350 24%, MES 0.025M, NH4Cl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.217
2GTZ Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the nonameric Melan-A/MART-1(27-35) peptide having A28L substitution 提交 2006-04-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 3350 24%, MES 0.025M, NH4Cl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.217
2GUO Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the native nonameric Melan-A/MART-1(27-35) peptide 提交 2006-05-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：Beta-2-microglobulin (Residues 21-119)
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.244
2GUO Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the native nonameric Melan-A/MART-1(27-35) peptide 提交 2006-05-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：Beta-2-microglobulin (Residues 21-119)
未记录 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.244
2H26 human CD1b in complex with endogenous phosphatidylcholine and spacer 提交 2006-05-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 6PL (4S,7R)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 6UL TETRACOSYL PALMITATE × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；1.5 M ammonium sulfate 5 % (v/v) isopropanol 0.1 M Na citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.241
2H6P Crystal structure of HLA-B*3501 presenting the human cytochrome P450 derived peptide, KPIVVLHGY 提交 2006-05-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；18% PEG 3350, 0.1M ammonium acetate, 0.1M cacodylate, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.239
2HJK Crystal Structure of HLA-B5703 and HIV-1 peptide 提交 2006-06-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：Beta-2-microglobulin domain (Residues 21-119)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.85 Å R-free 0.237
2HJL Crystal Structure of HLA-B5703 and HIV-1 peptide 提交 2006-06-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：Beta-2-microglobulin domain (Residues 21-119)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.50 Å R-free 0.226
2HLA SPECIFICITY POCKETS FOR THE SIDE CHAINS OF PEPTIDE ANTIGENS IN HLA-AW68 提交 1989-10-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å
2HN7 HLA-A*1101 in complex with HBV peptide homologue 提交 2006-07-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；25% PEG 5000 MME, 0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M MES, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
分辨率 1.60 Å R-free 0.212
2J8U Large CDR3a loop alteration as a function of MHC mutation. 提交 2006-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；1.0 M NACL 20% PEG 8000 MES, PH 6.5
分辨率 2.88 Å R-free 0.293
2J8U Large CDR3a loop alteration as a function of MHC mutation. 提交 2006-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；1.0 M NACL 20% PEG 8000 MES, PH 6.5
分辨率 2.88 Å R-free 0.293
2JCC AH3 recognition of mutant HLA-A2 W167A 提交 2006-12-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.292
2JCC AH3 recognition of mutant HLA-A2 W167A 提交 2006-12-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.292
2NW3 Crystal structure of HLA-B*3508 presenting EBV peptide EPLPQGQLTAY at 1.7A 提交 2006-11-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Cacodylate (pH7.7), 16% PEG 3350, pH 7.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.236
2NX5 Crystal structure of ELS4 TCR bound to HLA-B*3501 presenting EBV peptide EPLPQGQLTAY at 1.7A 提交 2006-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；0.1M Na Cacodylate (pH6.4), 0.2M CaCl2, 16% PEG 3350, 3% 1,6Hexanediol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.327
2NX5 Crystal structure of ELS4 TCR bound to HLA-B*3501 presenting EBV peptide EPLPQGQLTAY at 1.7A 提交 2006-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；0.1M Na Cacodylate (pH6.4), 0.2M CaCl2, 16% PEG 3350, 3% 1,6Hexanediol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.327
2NX5 Crystal structure of ELS4 TCR bound to HLA-B*3501 presenting EBV peptide EPLPQGQLTAY at 1.7A 提交 2006-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；0.1M Na Cacodylate (pH6.4), 0.2M CaCl2, 16% PEG 3350, 3% 1,6Hexanediol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.327
2NX5 Crystal structure of ELS4 TCR bound to HLA-B*3501 presenting EBV peptide EPLPQGQLTAY at 1.7A 提交 2006-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；0.1M Na Cacodylate (pH6.4), 0.2M CaCl2, 16% PEG 3350, 3% 1,6Hexanediol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.327
2P5E Crystal Structures of High Affinity Human T-Cell Receptors Bound to pMHC Reveal Native Diagonal Binding Geometry 提交 2007-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：BETA-2 MICROGLOBULIN, RESIDUES 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；293 K；85 mM HEPES, 8.5% Isopropanol, 17% PEG 4000, 15% Glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K, pH 7.50
分辨率 1.89 Å R-free 0.236
2P5W Crystal structures of high affinity human T-cell receptors bound to pMHC reveal native diagonal binding geometry 提交 2007-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：Beta-2 Microglobulin, RESIDUES 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 11 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；293 K；85 MM HEPES, 8.5% ISO-PROPANOL, 17% PEG4000, 15% GLYCEROL, PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, pH 7.50
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
2PO6 Crystal structure of CD1d-lipid-antigen complexed with Beta-2-Microglobulin, NKT15 Alpha-Chain and NKT15 Beta-Chain 提交 2007-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：beta-2-microglobulin
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 AGH N-{(1S,2R,3S)-1-[(ALPHA-D-GALACTOPYRANOSYLOXY)METHYL]-2,3-DIHYDROXYHEPTADECYL}HEXACOSANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；13% PEG 10K, 0.1M bis-tris propane, 0.2M tri-sodium citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.293
2PO6 Crystal structure of CD1d-lipid-antigen complexed with Beta-2-Microglobulin, NKT15 Alpha-Chain and NKT15 Beta-Chain 提交 2007-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：beta-2-microglobulin
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 AGH N-{(1S,2R,3S)-1-[(ALPHA-D-GALACTOPYRANOSYLOXY)METHYL]-2,3-DIHYDROXYHEPTADECYL}HEXACOSANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；13% PEG 10K, 0.1M bis-tris propane, 0.2M tri-sodium citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.293
2PYE Crystal Structures of High Affinity Human T-Cell Receptors Bound to pMHC RevealNative Diagonal Binding Geometry TCR Clone C5C1 Complexed with MHC 提交 2007-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：BETA-2 MICROGLOBULIN, RESIDUES 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 9 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 3 7PE 2-(2-(2-(2-(2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHOXY)ETHOXY)ETHOXY)ETHOXY)ETHANOL × 1 GOL GLYCEROL × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；85 mM Na HEPES buffer pH7.5, 8.5 % iso-propanol, 17% PEG 4000, 15% glycerol, pH 7.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.30 Å R-free 0.283
2RFX Crystal Structure of HLA-B*5701, presenting the self peptide, LSSPVTKSF 提交 2007-10-02 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å R-free 0.268
2UWE Large CDR3a loop alteration as a function of MHC mutation 提交 2007-03-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；14% PEG 8000, 1 M NACL, 25 MM HEPES, PH 7.8
分辨率 2.40 Å R-free 0.290
2UWE Large CDR3a loop alteration as a function of MHC mutation 提交 2007-03-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；14% PEG 8000, 1 M NACL, 25 MM HEPES, PH 7.8
分辨率 2.40 Å R-free 0.290
2V2W T CELL CROSS-REACTIVITY AND CONFORMATIONAL CHANGES DURING TCR ENGAGEMENT 提交 2007-06-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.237
2V2W T CELL CROSS-REACTIVITY AND CONFORMATIONAL CHANGES DURING TCR ENGAGEMENT 提交 2007-06-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.237
2V2X T cell cross-reactivity and conformational changes during TCR engagement. 提交 2007-06-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.238
2V2X T cell cross-reactivity and conformational changes during TCR engagement. 提交 2007-06-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.238
2VB5 Solution structure of W60G mutant of human beta2-microglobulin 提交 2007-09-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：YES 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.6；310 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1.0
NMR样品组成 95% WATER/5% D2O
分辨率未提供
2VLJ The Structural Dynamics and Energetics of an Immunodominant T-cell Receptor are Programmed by its Vbeta Domain 提交 2008-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.272
2VLK The Structural Dynamics and Energetics of an Immunodominant T-cell Receptor are Programmed by its Vbeta Domain 提交 2008-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å R-free 0.288
2VLL The Structural Dynamics and Energetics of an Immunodominant T-cell Receptor are Programmed by its Vbeta Domain 提交 2008-01-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.60 Å R-free 0.242
2VLL The Structural Dynamics and Energetics of an Immunodominant T-cell Receptor are Programmed by its Vbeta Domain 提交 2008-01-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.60 Å R-free 0.242
2VLR The Structural Dynamics and Energetics of an Immunodominant T-cell Receptor are Programmed by its Vbeta Domain 提交 2008-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å R-free 0.281
2VLR The Structural Dynamics and Energetics of an Immunodominant T-cell Receptor are Programmed by its Vbeta Domain 提交 2008-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å R-free 0.281
2X4N Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to residual fragments of a photocleavable peptide that is cleaved upon UV-light treatment 提交 2010-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；100 MM MES PH 5.5, 20% PEG 1500. CRYSTALS WERE FROZEN IN 100 MM MES, 30% PEG 1500, 10% GLYCEROL
分辨率 2.34 Å R-free 0.274
2X4N Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to residual fragments of a photocleavable peptide that is cleaved upon UV-light treatment 提交 2010-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 7 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；100 MM MES PH 5.5, 20% PEG 1500. CRYSTALS WERE FROZEN IN 100 MM MES, 30% PEG 1500, 10% GLYCEROL
分辨率 2.34 Å R-free 0.274
2X4O Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to HIV-1 envelope peptide env120-128 提交 2010-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.239
2X4O Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to HIV-1 envelope peptide env120-128 提交 2010-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.239
2X4P Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to a photocleavable peptide 提交 2010-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES PH 6.5, 20% PEG1500
分辨率 2.30 Å R-free 0.222
2X4P Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to a photocleavable peptide 提交 2010-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES PH 6.5, 20% PEG1500
分辨率 2.30 Å R-free 0.222
2X4Q Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to a photocleavable peptide 提交 2010-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1M MES PH 6.5, 20% PEG1500
分辨率 1.90 Å R-free 0.206
2X4Q Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to a photocleavable peptide 提交 2010-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1M MES PH 6.5, 20% PEG1500
分辨率 1.90 Å R-free 0.206
2X4R Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to Cytomegalovirus (CMV) pp65 epitope 提交 2010-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES PH 6.5, 20% PEG1500
分辨率 2.30 Å R-free 0.220
2X4R Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to Cytomegalovirus (CMV) pp65 epitope 提交 2010-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES PH 6.5, 20% PEG1500
分辨率 2.30 Å R-free 0.220
2X4S Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to a peptide representing the epitope of the H5N1 (Avian Flu) Nucleoprotein 提交 2010-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 2.55 Å R-free 0.247
2X4S Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to a peptide representing the epitope of the H5N1 (Avian Flu) Nucleoprotein 提交 2010-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 2.55 Å R-free 0.247
2X4T Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to a Peiodate- cleavable peptide 提交 2010-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES PH 6.5, 22% PEG1500
分辨率 2.30 Å R-free 0.236
2X4T Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to a Peiodate- cleavable peptide 提交 2010-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES PH 6.5, 22% PEG1500
分辨率 2.30 Å R-free 0.236
2X4U Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to HIV-1 Peptide RT468-476 提交 2010-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；100 MM MES PH 5.5, 20% PEG 1500. CRYSTALS WERE FROZEN IN 100 MM MES, 30% PEG 1500, 10% GLYCEROL
分辨率 2.10 Å R-free 0.234
2X4U Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to HIV-1 Peptide RT468-476 提交 2010-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；100 MM MES PH 5.5, 20% PEG 1500. CRYSTALS WERE FROZEN IN 100 MM MES, 30% PEG 1500, 10% GLYCEROL
分辨率 2.10 Å R-free 0.234
2X70 Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to a photocleavable peptide 提交 2010-02-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；VAPOUR DIFFUSION HANGING DROP AT 293K: 2 MICROLITER OF 5 MG/ML PROTEIN IN 0.1 M MES PH 6.0 WAS MIXED WITH 2 MICROLITER OF 0.1 M MES PH 6.5, 20-22% PEG 1500. SEEDING WAS USED TO GET BIGGER CRYSTALS
分辨率 2.00 Å R-free 0.225
2X70 Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to a photocleavable peptide 提交 2010-02-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；VAPOUR DIFFUSION HANGING DROP AT 293K: 2 MICROLITER OF 5 MG/ML PROTEIN IN 0.1 M MES PH 6.0 WAS MIXED WITH 2 MICROLITER OF 0.1 M MES PH 6.5, 20-22% PEG 1500. SEEDING WAS USED TO GET BIGGER CRYSTALS
分辨率 2.00 Å R-free 0.225
2X89 Structure of the Beta2_microglobulin involved in amyloidogenesis 提交 2010-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 27–119（93 aa） 片段：RESIDUES 27-119
链 G 27–119（93 aa） 片段：RESIDUES 27-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 6%PEG4000, 0.2M AMMONIUM SULPHATE, 0.1M NA-ACETEATE PH4.6
分辨率 2.16 Å R-free 0.267
2X89 Structure of the Beta2_microglobulin involved in amyloidogenesis 提交 2010-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 27–119（93 aa） 片段：RESIDUES 27-119
链 E 27–119（93 aa） 片段：RESIDUES 27-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 6%PEG4000, 0.2M AMMONIUM SULPHATE, 0.1M NA-ACETEATE PH4.6
分辨率 2.16 Å R-free 0.267
2XKS Prion-like conversion during amyloid formation at atomic resolution 提交 2010-07-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.04；压力 1.0
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 100% D2O
分辨率未提供
2XKU Prion-like conversion during amyloid formation at atomic resolution 提交 2010-07-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–119（93 aa） 片段：IMMUNGLOBULIN, RESIDUES 27-119
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.04；压力 1.0
NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.04；压力 1.0
NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.04；压力 1.0
NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.04；压力 1.0
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 100% D2O
分辨率未提供
2XPG Crystal structure of a MHC class I-peptide complex 提交 2010-08-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 22–118（97 aa） 片段：BETA2-MICROGLOBULIN FORM PI 5.3, RESIDUES 22-118
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；0.1 M BIS-TRIS-PROPANE, PH 8.0, 0.2 M NA/K PHOSPHATE, 20% (V/V) PEG3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.247
2YPK Structural features underlying T-cell receptor sensitivity to concealed MHC class I micropolymorphisms 提交 2012-10-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；16% PEG 8000, 50MM MES PH6.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.252
2YPL Structural features underlying T-cell receptor sensitivity to concealed MHC class I micropolymorphisms 提交 2012-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.3；pH 7.3
分辨率 2.40 Å R-free 0.277
2YXF The high resolution crystal structure of beta2-microglobulin under physiological conditions 提交 2007-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；25% PEG 4000, 25% Glycerol, 0.06M ammoniumacetate, 0.1M MOPS, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 1.13 Å R-free 0.195
2Z9T Crystal structure of the human beta-2 microglobulin mutant W60G 提交 2007-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：W60G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；0.1M MES, PEG 4000, Ammonium acetate, glycerol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.214
2Z9T Crystal structure of the human beta-2 microglobulin mutant W60G 提交 2007-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：W60G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；0.1M MES, PEG 4000, Ammonium acetate, glycerol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.214
3AM8 Crystal Structure of a Human Major Histocompatibilty complex 提交 2010-08-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；294 K；14-19% PEG 3350, 2% MPD, 0.2M MgCl2, 0.1M Tris, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.80 Å R-free 0.251
3AM8 Crystal Structure of a Human Major Histocompatibilty complex 提交 2010-08-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；294 K；14-19% PEG 3350, 2% MPD, 0.2M MgCl2, 0.1M Tris, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.80 Å R-free 0.251
3B3I Citrullination-dependent differential presentation of a self-peptide by HLA-B27 subtypes 提交 2007-10-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M Tris, 25% PEG 8000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.86 Å R-free 0.233
3B6S Crystal Structure of hla-b*2705 Complexed with the Citrullinated Vasoactive Intestinal Peptide Type 1 Receptor (vipr) Peptide (residues 400-408) 提交 2007-10-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；281 K；0.1M Tris HCl, 24% PEG 8000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 1.80 Å R-free 0.223
3BGM Crystal Structure of PKD2 Phosphopeptide Bound to Human Class I MHC HLA-A2 提交 2007-11-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；17% PEG 8000, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.232
3BH8 Crystal Structure of RQA_M Phosphopeptide Bound to HUMAN Class I MHC HLA-A2 提交 2007-11-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；17% PEG 8000, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.65 Å R-free 0.231
3BH9 Crystal Structure of RTY Phosphopeptide Bound to Human Class I MHC HLA-A2 提交 2007-11-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；21% PEG 3350, 0.1M sodium thiocyanate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.229
3BH9 Crystal Structure of RTY Phosphopeptide Bound to Human Class I MHC HLA-A2 提交 2007-11-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；21% PEG 3350, 0.1M sodium thiocyanate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.229
3BHB Crystal Structure of KMD Phosphopeptide Bound to Human Class I MHC HLA-A2 提交 2007-11-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 22–119（98 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；24% POLYACRYLIC ACID, 0.1M HEPES, 0.09M MgCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, hanging drop, temperature 298K
分辨率 2.20 Å R-free 0.256
3BO8 The High Resolution Crystal Structure of HLA-A1 Complexed with the MAGE-A1 Peptide 提交 2007-12-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Fluoride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
3BP4 The high resolution crystal structure of HLA-B*2705 in complex with a Cathepsin A signal sequence peptide pCatA 提交 2007-12-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；23% PEG 8000, 0.1M Tris buffer pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.85 Å R-free 0.222
3BP7 The high resolution crystal structure of HLA-B*2709 in complex with a Cathepsin A signal sequence peptide, pCatA 提交 2007-12-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；23.5% PEG 8000, 0.1M Tris buffer pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.204
3BVN High resolution crystal structure of HLA-B*1402 in complex with the latent membrane protein 2 peptide (LMP2) of Epstein-Barr virus 提交 2008-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；20-22%(w/v) PEG 20 000, 0.1 M HEPES buffer pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.55 Å R-free 0.268
3BVN High resolution crystal structure of HLA-B*1402 in complex with the latent membrane protein 2 peptide (LMP2) of Epstein-Barr virus 提交 2008-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；20-22%(w/v) PEG 20 000, 0.1 M HEPES buffer pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.55 Å R-free 0.268
3BW9 Crystal Structure of HLA B*3508 in complex with a HCMV 12-mer peptide from the pp65 protein 提交 2008-01-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 3350, pH 7.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.75 Å R-free 0.235
3BWA Crystal Structure of HLA B*3508 in complex with a HCMV 8-mer peptide from the pp65 protein 提交 2008-01-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 3350, pH 7.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.30 Å R-free 0.209
3BXN The high resolution crystal structure of HLA-B*1402 complexed with a Cathepsin A signal sequence peptide, pCatA 提交 2008-01-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；24- 27%(w/v) PEG 20000, with 0.1 M HEPES pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.86 Å R-free 0.219
3BZE The human non-classical major histocompatibility complex molecule HLA-E 提交 2008-01-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；14-19% PEG 3350, 2% MPD, 0.2M MgCl2, 0.1M Tris, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.296
3BZE The human non-classical major histocompatibility complex molecule HLA-E 提交 2008-01-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；14-19% PEG 3350, 2% MPD, 0.2M MgCl2, 0.1M Tris, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.296
3BZE The human non-classical major histocompatibility complex molecule HLA-E 提交 2008-01-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；14-19% PEG 3350, 2% MPD, 0.2M MgCl2, 0.1M Tris, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.296
3BZE The human non-classical major histocompatibility complex molecule HLA-E 提交 2008-01-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；14-19% PEG 3350, 2% MPD, 0.2M MgCl2, 0.1M Tris, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.296
3BZF The human non-classical major histocompatibility complex molecule HLA-E 提交 2008-01-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 23–119（97 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；19% PEG 3350, 0.3M NaCl, 0.1M Tris, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.269
3BZF The human non-classical major histocompatibility complex molecule HLA-E 提交 2008-01-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 23–119（97 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；19% PEG 3350, 0.3M NaCl, 0.1M Tris, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.269
3C9N Crystal Structure of a SARS Corona Virus Derived Peptide Bound to the Human Major Histocompatibility Complex Class I molecule HLA-B*1501 提交 2008-02-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；273 K；0.2M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1M HEPES sodium, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K, pH 7.50
分辨率 1.87 Å R-free 0.227
3CDG Human CD94/NKG2A in complex with HLA-E 提交 2008-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；291 K；Ammonium sulfate, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.40 Å R-free 0.279
3CDG Human CD94/NKG2A in complex with HLA-E 提交 2008-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；291 K；Ammonium sulfate, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.40 Å R-free 0.279
3CII Structure of NKG2A/CD94 bound to HLA-E 提交 2008-03-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；1.8M ammonium sulfate, 0.3-0.7% sucrose, 100 mM Tris (8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 4.41 Å R-free 0.355
3CII Structure of NKG2A/CD94 bound to HLA-E 提交 2008-03-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；1.8M ammonium sulfate, 0.3-0.7% sucrose, 100 mM Tris (8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 4.41 Å R-free 0.355
3CIQ A regulatable switch mediates self-association in an immunoglobulin fold 提交 2008-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 21–119（99 aa）
链 H 21–119（99 aa）
链 I 21–119（99 aa）
链 J 21–119（99 aa）
链 K 21–119（99 aa）
链 L 21–119（99 aa）
突变：H13F 突变：H13F 突变：H13F 突变：H13F 突变：H13F 突变：H13F CU COPPER (II) ION × 6 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；288 K；28% PEG 3350, 200 mM ammonium tartrate dibasic, pH 7.40, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 288K
分辨率 2.90 Å R-free 0.264
3CIQ A regulatable switch mediates self-association in an immunoglobulin fold 提交 2008-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–119（99 aa）
链 B 21–119（99 aa）
链 C 21–119（99 aa）
链 D 21–119（99 aa）
链 E 21–119（99 aa）
链 F 21–119（99 aa）
突变：H13F 突变：H13F 突变：H13F 突变：H13F 突变：H13F 突变：H13F CU COPPER (II) ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；288 K；28% PEG 3350, 200 mM ammonium tartrate dibasic, pH 7.40, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 288K
分辨率 2.90 Å R-free 0.264
3CZF Crystal structure of HLA-B*2709 complexed with the glucagon receptor (GR) peptide (residues 412-420) 提交 2008-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；291 K；14% (w/v) PEG 4000, 20mM Tris/HCl pH 7.5, 150mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 7.50
分辨率 1.20 Å R-free 0.149
3D18 Crystal structure of HLA-B*2709 complexed with a variant of the latent membrane protein 2 peptide (LMP2(L)) of epstein-barr virus 提交 2008-05-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：Residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 6 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；20% PEG 4000, 0.1M MES, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.74 Å R-free 0.233
3D25 Crystal structure of HA-1 minor histocompatibility antigen bound to human class I MHC HLA-A2 提交 2008-05-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 22–119（98 aa） 片段：UNP residues 22-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；298 K；20 % PEG 10K, 0.1 M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 7.50
分辨率 1.30 Å R-free 0.204
3D2U Structure of UL18, a Peptide-Binding Viral MHC Mimic, Bound to a Host Inhibitory Receptor 提交 2008-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.4 M Mg(NO3)2, and 16~22% (w/v) PEG 33500, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.21 Å R-free 0.259
3D2U Structure of UL18, a Peptide-Binding Viral MHC Mimic, Bound to a Host Inhibitory Receptor 提交 2008-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.4 M Mg(NO3)2, and 16~22% (w/v) PEG 33500, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.21 Å R-free 0.259
3D39 The complex between TCR A6 and human Class I MHC HLA-A2 with the modified HTLV-1 TAX (Y5(4-fluoroPhenylalanine)) peptide 提交 2008-05-09 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；TRIS 0.1 M, PEG4000 15%, MgCl2 0.2M, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 2.81 Å R-free 0.269
3D3V The complex between TCR A6 and human Class I MHC HLA-A2 with the modified HTLV-1 TAX (Y5(3,4-difluoroPhenylalanine)) peptide 提交 2008-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；TRIS 0.1 M, PEG4000 15%, MgCl2 0.2M, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 2.80 Å R-free 0.278
3DBX Structure of chicken CD1-2 with bound fatty acid 提交 2008-06-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PLM PALMITIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG4000, 0.1M sodium citrate, 10% isopropanol, pH5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.266
3DHJ Beta 2 microglobulin mutant W60C 提交 2008-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：W60C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M Na acetate, PEG 4000, Ammonium acetate, glycerol, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.212
3DHM Beta 2 microglobulin mutant D59P 提交 2008-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：D59P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M Na acetate, PEG 4000, Ammonium acetate, glycerol, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.222
3DTX Crystal structure of HLA-B*2705 complexed with the double citrullinated vasoactive intestinal peptide type 1 receptor (VIPR) peptide (residues 400-408) 提交 2008-07-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1M TRIS HCL, 25% PEG 8000,, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.10 Å R-free 0.262
3DTX Crystal structure of HLA-B*2705 complexed with the double citrullinated vasoactive intestinal peptide type 1 receptor (VIPR) peptide (residues 400-408) 提交 2008-07-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1M TRIS HCL, 25% PEG 8000,, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.10 Å R-free 0.262
3DX6 Crystal Structure of B*4402 presenting a 10mer EBV epitope 提交 2008-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 9 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；Citrate, Ammonium Acetate, PEG 4000, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.251
3DX7 Crystal Structure of HLA-B*4403 presenting 10mer EBV antigen 提交 2008-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；Citrate, Ammonium Acetate, PEG 4000, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.210
3DX8 Crystal Structure of B*4405 presenting a 10mer EBV epitope 提交 2008-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；Citrate, Ammonium Acetate, PEG 4000, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.255
3DXA Crystal Structure of the DM1 TCR in complex with HLA-B*4405 and decamer EBV antigen 提交 2008-07-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；Bicine, Lithium Sulfate, PEG 3350, pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.50 Å R-free 0.330
3DXA Crystal Structure of the DM1 TCR in complex with HLA-B*4405 and decamer EBV antigen 提交 2008-07-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；Bicine, Lithium Sulfate, PEG 3350, pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.50 Å R-free 0.330
3DXA Crystal Structure of the DM1 TCR in complex with HLA-B*4405 and decamer EBV antigen 提交 2008-07-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；Bicine, Lithium Sulfate, PEG 3350, pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.50 Å R-free 0.330
3EKC structure of W60V beta-2 microglobulin mutant 提交 2008-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：W60V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M Na acetate, PEG 4000, Ammonium acetate, glycerol, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.240
3FFC Crystal Structure of CF34 TCR in complex with HLA-B8/FLR 提交 2008-12-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 6 NA SODIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293 K；11% PEG 20000, 0.2M LiSO4, 0.1M Tris, 6mM CdCl, 4% ethylene glycol, 4% dioxane, pH 8.4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.268
3FFC Crystal Structure of CF34 TCR in complex with HLA-B8/FLR 提交 2008-12-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 5 NA SODIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293 K；11% PEG 20000, 0.2M LiSO4, 0.1M Tris, 6mM CdCl, 4% ethylene glycol, 4% dioxane, pH 8.4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.268
3FQN Phosphorylation of self-peptides alters Human Leukocyte Antigen Class I-restricted antigen presentation and generates tumor specific epitopes 提交 2009-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 22–119（98 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；13% PEG3350, 5mM CdCl2, 5mM MgCl2, 0.1M NaCl, pH7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.65 Å R-free 0.197
3FQR Phosphorylation of self-peptides alters Human Leukocyte Antigen Class I-restricted antigen presentation and generates tumor specific epitopes 提交 2009-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 22–119（98 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 CD CADMIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；13% PEG3350, 5mM CdCl2, 5mM MgCl2, 0.1M NaCl, pH7.4, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.70 Å R-free 0.189
3FQT Phosphorylation of self-peptides alters Human Leukocyte Antigen Class I-restricted antigen presentation and generates tumor specific epitopes 提交 2009-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 22–119（98 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；13% PEG3350, 3mM CdCl2, 3mM MgCl2, 0.1M NaCl, pH7.4, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.80 Å R-free 0.204
3FQU Phosphorylation of self-peptides alters Human Leukocyte Antigen Class I-restricted antigen presentation and generates tumor specific epitopes 提交 2009-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 22–119（98 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 CD CADMIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；13% PEG3350, 3mM CdCl2, 3mM MgCl2, 0.1M NaCl, pH7.4, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.80 Å R-free 0.202
3FQW Phosphorylation of self-peptides alters Human Leukocyte Antigen Class I-restricted antigen presentation and generates tumor specific epitopes 提交 2009-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 22–119（98 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 5 CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；13% PEG3350, 10mM CdCl2, 10mM CoCl2, 0.1M NaCl, pH7.4, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.93 Å R-free 0.196
3FQX Phosphorylation of self-peptides alters Human Leukocyte Antigen Class I-restricted antigen presentation and generates tumor specific epitopes 提交 2009-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 22–119（98 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；13% PEG3350, 5mM CdCl2, 5mM MgCl2, 0.1M NaCl, pH7.4, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.70 Å R-free 0.197
3FT2 Crystal Structure of a citrulline peptide variant of the minor histocompatibility peptide HA-1 in complex with HLA-A2 提交 2009-01-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；12-15% w/v PEG 6000, 0.1 M NaCl and 0.1 M tri-sodium-citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.218
3FT3 Crystal Structure of the minor histocompatibility peptide HA-1His in complex with HLA-A2 提交 2009-01-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；12-15% w/v PEG 6000, 0.1 M NaCl and 0.1 M tri-sodium-citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.231
3FT4 Crystal Structure of the minor histocompatibility peptide HA-1Arg in complex with HLA-A2 提交 2009-01-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；12-15% w/v PEG 6000, 0.1 M NaCl and 0.1 M tri-sodium-citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.224
3GIV Antigen processing influences HIV-specific cytotoxic T lymphocyte immunodominance 提交 2009-03-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.238
3GIV Antigen processing influences HIV-specific cytotoxic T lymphocyte immunodominance 提交 2009-03-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.238
3GJF Rational development of high-affinity T-cell receptor-like antibodies 提交 2009-03-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.251
3GJF Rational development of high-affinity T-cell receptor-like antibodies 提交 2009-03-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.251
3GSN Crystal structure of the public RA14 TCR in complex with the HCMV dominant NLV/HLA-A2 epitope 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；18-24% PEG 3350, 0.3M LiSO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.290
3GSO Crystal structure of the binary complex between HLA-A2 and HCMV NLV peptide 提交 2009-03-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；9-20% PEG 6000, 0.1M tri-Na Citrate, 0-0.1M NaCl, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.229
3GSQ Crystal structure of the binary complex between HLA-A2 and HCMV NLV-M5S peptide variant 提交 2009-03-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；9-20% PEG 6000, 0.1M tri-Na Citrate, 0-0.1M NaCl, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.12 Å R-free 0.246
3GSR Crystal structure of the binary complex between HLA-A2 and HCMV NLV-M5V peptide variant 提交 2009-03-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；9-20% PEG 6000, 0.1M tri-Na Citrate, 0-0.1M NaCl, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.226
3GSU Crystal structure of the binary complex between HLA-A2 and HCMV NLV-M5T peptide variant 提交 2009-03-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；9-20% PEG 6000, 0.1M tri-Na Citrate, 0-0.1M NaCl, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.242
3GSV Crystal structure of the binary complex between HLA-A2 and HCMV NLV-M5Q peptide variant 提交 2009-03-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；9-20% PEG 6000, 0.1M tri-Na Citrate, 0-0.1M NaCl, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.242
3GSW Crystal structure of the binary complex between HLA-A2 and HCMV NLV-T8A peptide variant 提交 2009-03-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；9-20% PEG 6000, 0.1M tri-Na Citrate, 0-0.1M NaCl, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.81 Å R-free 0.227
3GSX Crystal structure of the binary complex between HLA-A2 and HCMV NLV-T8V peptide variant 提交 2009-03-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；9-20% PEG 6000, 0.1M tri-Na Citrate, 0-0.1M NaCl, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.247
3H7B Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the Tel1p peptide 提交 2009-04-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.88 Å R-free 0.242
3H7B Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the Tel1p peptide 提交 2009-04-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.88 Å R-free 0.242
3H9H Human Class I MHC HLA-A2(A150P) in complex with the Tel1p peptide 提交 2009-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaF 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.226
3H9H Human Class I MHC HLA-A2(A150P) in complex with the Tel1p peptide 提交 2009-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaF 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.226
3H9S The complex between TCR A6 and human Class I MHC HLA-A2 with the bound Tel1p peptide 提交 2009-04-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；PEG4000 15%, TRIS 0.1M, MgCl2 0.2M, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
3HAE Rational development of high-affinity T-cell receptor-like antibodies 提交 2009-05-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.9；294 K；12% PEG 8000, 50mM Mes, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
分辨率 2.90 Å R-free 0.283
3HAE Rational development of high-affinity T-cell receptor-like antibodies 提交 2009-05-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.9；294 K；12% PEG 8000, 50mM Mes, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
分辨率 2.90 Å R-free 0.283
3HAE Rational development of high-affinity T-cell receptor-like antibodies 提交 2009-05-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 K 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.9；294 K；12% PEG 8000, 50mM Mes, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
分辨率 2.90 Å R-free 0.283
3HAE Rational development of high-affinity T-cell receptor-like antibodies 提交 2009-05-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.9；294 K；12% PEG 8000, 50mM Mes, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
分辨率 2.90 Å R-free 0.283
3HCV Crystal structure of HLA-B*2709 complexed with the double citrullinated vasoactive intestinal peptide type 1 receptor (VIPR) peptide (residues 400-408) 提交 2009-05-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1M TRIS HCL,25% PEG 8000, , pH 8.000000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.95 Å R-free 0.245
3HG1 Germline-governed recognition of a cancer epitope by an immunodominant human T cell receptor 提交 2009-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：Residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；23% PEG 550 MME, 0.1M TRIS, 15% Glycerol, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.304
3HLA HUMAN CLASS I HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN A2.1 提交 1989-10-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å
3HPJ Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the WT-1 (126-134) peptide 提交 2009-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.236
3HPJ Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the WT-1 (126-134) peptide 提交 2009-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.236
3HUJ Crystal structure of human CD1d-alpha-Galactosylceramide in complex with semi-invariant NKT cell receptor 提交 2009-06-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 AGH N-{(1S,2R,3S)-1-[(ALPHA-D-GALACTOPYRANOSYLOXY)METHYL]-2,3-DIHYDROXYHEPTADECYL}HEXACOSANAMIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291 K；0.1M Tris-HCl, 0.2M magnesium chloride, 12% PEG 10000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.279
3HUJ Crystal structure of human CD1d-alpha-Galactosylceramide in complex with semi-invariant NKT cell receptor 提交 2009-06-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 AGH N-{(1S,2R,3S)-1-[(ALPHA-D-GALACTOPYRANOSYLOXY)METHYL]-2,3-DIHYDROXYHEPTADECYL}HEXACOSANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291 K；0.1M Tris-HCl, 0.2M magnesium chloride, 12% PEG 10000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.279
3I6G Newly identified epitope Mn2 from SARS-CoV M protein complexed withHLA-A*0201 提交 2009-07-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；0.1M Ammonium acetate, 0.1M BIS-TRIS, pH6.0, 13-17% Polyethylene glycol 10,000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
3I6G Newly identified epitope Mn2 from SARS-CoV M protein complexed withHLA-A*0201 提交 2009-07-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；0.1M Ammonium acetate, 0.1M BIS-TRIS, pH6.0, 13-17% Polyethylene glycol 10,000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
3I6K Newly identified epitope from SARS-CoV membrane protein complexed with HLA-A*0201 提交 2009-07-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M BIS-TRIS pH 5.5, 10% w/v Polyethylene glycol 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.243
3I6K Newly identified epitope from SARS-CoV membrane protein complexed with HLA-A*0201 提交 2009-07-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M BIS-TRIS pH 5.5, 10% w/v Polyethylene glycol 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.243
3I6L Newly identified epitope N1 derived from SARS-CoV N protein complexed with HLA-A*2402 提交 2009-07-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Tris pH 8.9, 25% w/v Polyethylene glycol 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.40 Å R-free 0.284
3IB4 The double mutant of Beta-2 microglobulin K58P-W60G 提交 2009-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：K58P, W60G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） PE4 2-{2-[2-(2-{2-[2-(2-ETHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M NaAcetate, 0.2M CH3COONH4, 20% Glycerol, 22% PEG 4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.25 Å R-free 0.181
3IXA Human Class I MHC HLA-A2(A150P) in complex with the Tax peptide 提交 2009-09-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaF 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.230
3IXA Human Class I MHC HLA-A2(A150P) in complex with the Tax peptide 提交 2009-09-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaF 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.230
3JTS GY9-Mamu-A*02-hb2m 提交 2009-09-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；(i) 0.1M Tris-HCl pH 5.5, 0.12M ammonium sulfate, 38% polyethene glycol monomethyl ether 20000; (ii) 0.1M MES pH 6.5, 0.32M ammonium sulfate, 38% polyethene glycol monomethyl ether 20 000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.248
3JTS GY9-Mamu-A*02-hb2m 提交 2009-09-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；(i) 0.1M Tris-HCl pH 5.5, 0.12M ammonium sulfate, 38% polyethene glycol monomethyl ether 20000; (ii) 0.1M MES pH 6.5, 0.32M ammonium sulfate, 38% polyethene glycol monomethyl ether 20 000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.248
3JTS GY9-Mamu-A*02-hb2m 提交 2009-09-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；(i) 0.1M Tris-HCl pH 5.5, 0.12M ammonium sulfate, 38% polyethene glycol monomethyl ether 20000; (ii) 0.1M MES pH 6.5, 0.32M ammonium sulfate, 38% polyethene glycol monomethyl ether 20 000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.248
3KLA Ca2+ release from the endoplasmic reticulum of NY-ESO-1 specific T cells is modulated by the affinity of T cell receptor and by the use of the CD8 co-receptor 提交 2009-11-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：beta-2-microglobulin
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；16% PEG 8K, 20mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.65 Å R-free 0.239
3KLA Ca2+ release from the endoplasmic reticulum of NY-ESO-1 specific T cells is modulated by the affinity of T cell receptor and by the use of the CD8 co-receptor 提交 2009-11-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：beta-2-microglobulin
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；16% PEG 8K, 20mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.65 Å R-free 0.239
3KPL Crystal Structure of HLA B*4402 in complex with EEYLQAFTY a self peptide from the ABCD3 protein 提交 2009-11-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 20-28% PEG 4000, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.96 Å R-free 0.253
3KPM Crystal Structure of HLA B*4402 in complex with EEYLKAWTF, a mimotope 提交 2009-11-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 20-28% PEG 4000, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.60 Å R-free 0.241
3KPN Crystal Structure of HLA B*4403 in complex with EEYLQAFTY a self peptide from the ABCD3 protein 提交 2009-11-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 20-28% PEG 4000, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.244
3KPO Crystal Structure of HLA B*4403 in complex with EEYLKAWTF, a mimotope 提交 2009-11-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 20-28% PEG 4000, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.263
3KPP Crystal Structure of HLA B*4405 in complex with EEYLQAFTY a self peptide from the ABCD3 protein 提交 2009-11-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 20-28% PEG 4000, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.230
3KPQ Crystal Structure of HLA B*4405 in complex with EEYLKAWTF, a mimotope 提交 2009-11-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 20-28% PEG 4000, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.84 Å R-free 0.269
3KPR Crystal Structure of the LC13 TCR in complex with HLA B*4405 bound to EEYLKAWTF a mimotope 提交 2009-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.2M NaOAc, 12-18% PEG 4000, 0.1M Tris, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.279
3KPR Crystal Structure of the LC13 TCR in complex with HLA B*4405 bound to EEYLKAWTF a mimotope 提交 2009-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.2M NaOAc, 12-18% PEG 4000, 0.1M Tris, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.279
3KPS Crystal Structure of the LC13 TCR in complex with HLA B*4405 bound to EEYLQAFTY a self peptide from the ABCD3 protein 提交 2009-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.2M NaOAc, 12-18% PEG 4000, 0.1M Tris, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.269
3KWW Crystal structure of the 'restriction triad' mutant of HLA B*3508, beta-2-microglobulin and EBV peptide 提交 2009-12-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACY ACETIC ACID × 7 GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.6；298 K；0.1M cacodlyate, 0.2M ammonium acetate, 18% PEG3350, pH 7.6, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 2.18 Å R-free 0.251
3KXF Crystal Structure of SB27 TCR in complex with the 'restriction triad' mutant HLA-B*3508-13mer 提交 2009-12-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；298 K；0.1M cacodlyate, 0.2M potassium iodide, 18% polyethylene glycol 3350, pH 6.7, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.291
3KXF Crystal Structure of SB27 TCR in complex with the 'restriction triad' mutant HLA-B*3508-13mer 提交 2009-12-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；298 K；0.1M cacodlyate, 0.2M potassium iodide, 18% polyethylene glycol 3350, pH 6.7, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.291
3KXF Crystal Structure of SB27 TCR in complex with the 'restriction triad' mutant HLA-B*3508-13mer 提交 2009-12-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；298 K；0.1M cacodlyate, 0.2M potassium iodide, 18% polyethylene glycol 3350, pH 6.7, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.291
3KXF Crystal Structure of SB27 TCR in complex with the 'restriction triad' mutant HLA-B*3508-13mer 提交 2009-12-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 J 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；298 K；0.1M cacodlyate, 0.2M potassium iodide, 18% polyethylene glycol 3350, pH 6.7, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.291
3KYN Crystal structure of HLA-G presenting KGPPAALTL peptide 提交 2009-12-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；18% PEG 3350, 0.2M potassium formate, 0.1M HEPES, 10mM cobalt chloride, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.40 Å R-free 0.299
3KYO Crystal structure of HLA-G presenting KLPAQFYIL peptide 提交 2009-12-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；16% PEG 3350, 0.2M potassium formate, 0.1M HEPES, 10mM cobalt chloride, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.226
3KYO Crystal structure of HLA-G presenting KLPAQFYIL peptide 提交 2009-12-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；16% PEG 3350, 0.2M potassium formate, 0.1M HEPES, 10mM cobalt chloride, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.226
3L3D Crystal structure of HLA-B*4402 in complex with the F3A mutant of a self-peptide derived from DPA*0201 提交 2009-12-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M tri-sodium citrate dihydrate, 12-30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.231
3L3G Crystal structure of HLA-B*4402 in complex with the R5A mutant of a self-peptide derived from DPA*0201 提交 2009-12-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M tri-sodium citrate dihydrate, 12-30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.264
3L3I Crystal structure of HLA-B*4402 in complex with the F7A mutant of a self-peptide derived from DPA*0201 提交 2009-12-17 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M tri-sodium citrate dihydrate, 12-30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.242
3L3J Crystal structure of HLA-B*4402 in complex with the F3A/R5A double mutant of a self-peptide derived from DPA*0201 提交 2009-12-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M tri-sodium citrate dihydrate, 12-30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.289
3L3K Crystal structure of HLA-B*4402 in complex with the R5A/F7A double mutant of a self-peptide derived from DPA*0201 提交 2009-12-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M tri-sodium citrate dihydrate, 12-30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.275
3LKN Crystal Structure of HLA B*3501 in complex with influenza NP418 epitope from 1918 strain 提交 2010-01-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；15-25% PEG 4000, 0.2M NH4Acetate, 0.1M Na-Citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.252
3LKO Crystal Structure of HLA B*3501 in complex with influenza NP418 epitope from 1934 strain 提交 2010-01-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；15-25% PEG 4000, 0.2M NH4Acetate, 0.1M Na-Citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.238
3LKP Crystal Structure of HLA B*3501 in complex with influenza NP418 epitope from 1972 strain 提交 2010-01-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；15-25% PEG 4000, 0.2M NH4Acetate, 0.1M Na-Citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.244
3LKQ Crystal Structure of HLA B*3501 in complex with influenza NP418 epitope from 1977 strain 提交 2010-01-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；15-25% PEG 4000, 0.2M NH4Acetate, 0.1M Na-Citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.230
3LKR Crystal Structure of HLA B*3501 in complex with influenza NP418 epitope from 2009 H1N1 swine origin strain 提交 2010-01-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；15-25% PEG 4000, 0.2M NH4Acetate, 0.1M Na-Citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.266
3LKS Crystal Structure of HLA B*3501 in complex with influenza NP418 epitope from 1980 strain 提交 2010-01-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；15-25% PEG 4000, 0.2M NH4Acetate, 0.1M Na-Citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.260
3LN4 Crystal structure of HLA-B*4103 in complex with a 16mer self-peptide derived from heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2 提交 2010-02-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；0.1M citrate pH 5.6, 14-20% PEG 4000, 0.2M NH4OAc, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 1.30 Å R-free 0.177
3LN5 Crystal structure of HLA-B*4104 in complex with a 11mer self-peptide derived from S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase 提交 2010-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；0.1M citrate pH 5.6, 14-20% PEG 4000, 0.2M NH4OAc, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 1.90 Å R-free 0.241
3LOW Crystal structure of Beta 2 Microglobulin domain-swapped dimer 提交 2010-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–119（99 aa）
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å R-free 0.266
3LOZ Crystal structure of Beta 2 Microglobulin amyloidogenic segment LSFSKD 提交 2010-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 74–79（6 aa）
链 B 74–79（6 aa）
链 C 74–79（6 aa）
链 D 74–79（6 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.241
3LV3 Crystal structure of HLA-B*2705 complexed with a peptide derived from the human voltage-dependent calcium channel alpha1 subunit (residues 513-521) 提交 2010-02-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20%(w/v) PEG 8000, 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.94 Å R-free 0.224
3M17 Crystal structure of human FcRn with a monomeric peptide inhibitor 提交 2010-03-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；277 K；2uL protein:peptide with 2ul solution of 100mM sodium phosphate/citric acid, 20% PEG 3350, 8% ethanol, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.325
3M17 Crystal structure of human FcRn with a monomeric peptide inhibitor 提交 2010-03-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；277 K；2uL protein:peptide with 2ul solution of 100mM sodium phosphate/citric acid, 20% PEG 3350, 8% ethanol, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.325
3M17 Crystal structure of human FcRn with a monomeric peptide inhibitor 提交 2010-03-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；277 K；2uL protein:peptide with 2ul solution of 100mM sodium phosphate/citric acid, 20% PEG 3350, 8% ethanol, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.325
3M17 Crystal structure of human FcRn with a monomeric peptide inhibitor 提交 2010-03-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；277 K；2uL protein:peptide with 2ul solution of 100mM sodium phosphate/citric acid, 20% PEG 3350, 8% ethanol, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.325
3M1B Crystal structure of human FcRn with a dimeric peptide inhibitor 提交 2010-03-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；294 K；2ul protein:peptide with 2ul buffer containing 100 mM phosphate/citric acid, 22% PEG 1000 and 8% ethanol , pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 3.10 Å R-free 0.397
3M1B Crystal structure of human FcRn with a dimeric peptide inhibitor 提交 2010-03-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；294 K；2ul protein:peptide with 2ul buffer containing 100 mM phosphate/citric acid, 22% PEG 1000 and 8% ethanol , pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 3.10 Å R-free 0.397
3M1B Crystal structure of human FcRn with a dimeric peptide inhibitor 提交 2010-03-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；294 K；2ul protein:peptide with 2ul buffer containing 100 mM phosphate/citric acid, 22% PEG 1000 and 8% ethanol , pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 3.10 Å R-free 0.397
3M1B Crystal structure of human FcRn with a dimeric peptide inhibitor 提交 2010-03-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；294 K；2ul protein:peptide with 2ul buffer containing 100 mM phosphate/citric acid, 22% PEG 1000 and 8% ethanol , pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 3.10 Å R-free 0.397
3MGO Crystal structure of a H5-specific CTL epitope derived from H5N1 influenza virus in complex with HLA-A*0201 提交 2010-04-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；25mM MES(pH 6.5), 16% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.30 Å R-free 0.247
3MGO Crystal structure of a H5-specific CTL epitope derived from H5N1 influenza virus in complex with HLA-A*0201 提交 2010-04-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；25mM MES(pH 6.5), 16% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.30 Å R-free 0.247
3MGO Crystal structure of a H5-specific CTL epitope derived from H5N1 influenza virus in complex with HLA-A*0201 提交 2010-04-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；25mM MES(pH 6.5), 16% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.30 Å R-free 0.247
3MGO Crystal structure of a H5-specific CTL epitope derived from H5N1 influenza virus in complex with HLA-A*0201 提交 2010-04-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；25mM MES(pH 6.5), 16% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.30 Å R-free 0.247
3MGT Crystal structure of a H5-specific CTL epitope variant derived from H5N1 influenza virus in complex with HLA-A*0201 提交 2010-04-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；25mM MES(pH 6.5), 16% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.20 Å R-free 0.237
3MGT Crystal structure of a H5-specific CTL epitope variant derived from H5N1 influenza virus in complex with HLA-A*0201 提交 2010-04-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；25mM MES(pH 6.5), 16% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.20 Å R-free 0.237
3MGT Crystal structure of a H5-specific CTL epitope variant derived from H5N1 influenza virus in complex with HLA-A*0201 提交 2010-04-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；25mM MES(pH 6.5), 16% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.20 Å R-free 0.237
3MGT Crystal structure of a H5-specific CTL epitope variant derived from H5N1 influenza virus in complex with HLA-A*0201 提交 2010-04-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；25mM MES(pH 6.5), 16% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.20 Å R-free 0.237
3MR9 Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with HCMV pp65-495-503 nonapeptide M5A variant 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 6000, 0.1M NaCitrate, 0.15M NaCl, 3.5mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.93 Å R-free 0.266
3MRB Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with HCMV pp65-495-503 nonapeptide A7H variant 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 6000, 0.1M NaCacodylate, 5mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.40 Å R-free 0.244
3MRC Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with HCMV pp65-495-503 nonapeptide V6C variant 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 6000, 0.1M NaCitrate, 0.15M NaCl, 3.45mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.223
3MRD Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with HCMV pp65-495-503 nonapeptide V6G variant 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% PEG 6000, 0.1M MES, 5mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.226
3MRE Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with EBV bmlf1-280-288 nonapeptide 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；15% PEG 6000, 0.1M NaCitrate, 0.1M NaCl, 5mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.10 Å R-free 0.204
3MRF Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with EBV bmlf1-280-288 nonapeptide T4P variant 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 6000, 0.1M NaCacodylate, 0.1M NaCl, 7.5mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.257
3MRG Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with HCV NS3-1073-1081 nonapeptide 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；17% PEG 6000, 0.1M NaCitrate, 0.05M NaCl, 5mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.30 Å R-free 0.202
3MRH Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with HCV NS3-1073-1081 nonapeptide N3S variant 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；9% PEG 6000, 0.1M NaCitrate, 5mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.308
3MRI Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with HCV NS3-1073-1081 nonapeptide G4M-V5W variant 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；9% PEG 6000, 0.1M NaCitrate, 0.1M NaCl, 5mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.296
3MRJ Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with HCV NS3-1073-1081 nonapeptide V5M variant 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；13% PEG 6000, 0.1M NaCitrate, 0.05M NaCl, 2.84mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.87 Å R-free 0.230
3MRK Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with AFP137 nonapeptide 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% PEG 6000, 0.1M NaCitrate, 5mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.40 Å R-free 0.232
3MRL Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with HCV NS3-1073-1081 nonapeptide C6V variant 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；15% PEG 6000, 0.1M NaCitrate, 3.6mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.41 Å R-free 0.279
3MRM Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with HCV NS3-1406-1415 decapeptide 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；18% PEG 6000, 0.1M NaCitrate, 0.02M NaCl, 5mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.250
3MRN Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with HCV NS4b-1807-1816 decapeptide 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；18% PEG 6000, 0.1M NaCitrate, 0.1M NaCl, 5mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.298
3MRO Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with Melan-A MART1 decapeptide variant 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 6000, 0.1M NaCitrate, 0.1M NaCl, 3mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.35 Å R-free 0.279
3MRP Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with Melan-A MART1 decapeptide variant 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；13% PEG 6000, 0.1M NaCitrate, 0.1M NaCl, 2.61mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.227
3MRQ Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with Melan-A MART1 decapeptide variant 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；17% PEG 6000, 0.1M NaCitrate, 0.1M NaCl, 2.61mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
3MRR Crystal Structure of MHC class I HLA-A2 molecule complexed with Human Prostaglandin Transporter decapeptide 提交 2010-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；15% PEG 6000, 0.1M NaCitrate, 0.1M NaCl, 3mg/ml protein conc., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.224
3MV7 Crystal Structure of the TK3 TCR in complex with HLA-B*3501/HPVG 提交 2010-05-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；15%PEG 3350, 0.2M LiSO4, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.286
3MV8 Crystal Structure of the TK3-Gln55His TCR in complex with HLA-B*3501/HPVG 提交 2010-05-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；15%PEG 3350, 0.2M LiSO4, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.276
3MV9 Crystal Structure of the TK3-Gln55Ala TCR in complex with HLA-B*3501/HPVG 提交 2010-05-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；15%PEG 3350, 0.2M LiSO4, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.331
3MYJ Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the WT-1 (126-134) (R1Y) peptide variant. 提交 2010-05-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, KCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.89 Å R-free 0.230
3MYJ Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the WT-1 (126-134) (R1Y) peptide variant. 提交 2010-05-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, KCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.89 Å R-free 0.230
3MYZ Protein induced photophysical changes to the amyloid indicator dye, thioflavin T 提交 2010-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：H13F HG MERCURY (II) ION × 1 TFX 2-[4-(dimethylamino)phenyl]-3,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-3-ium × 2 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；25% PEG 3350, 50mM diammonium tartrate, 5mM Thioflavin T, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.223
3MYZ Protein induced photophysical changes to the amyloid indicator dye, thioflavin T 提交 2010-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–119（99 aa）
突变：H13F TFX 2-[4-(dimethylamino)phenyl]-3,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-3-ium × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；25% PEG 3350, 50mM diammonium tartrate, 5mM Thioflavin T, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.223
3MZT Protein-induced photophysical changes to the amyloid indicator dye, thioflavin T 提交 2010-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：H13F CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；5mM ThT, 50mM diammonium tartrate, 22.5% PEG 3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.256
3MZT Protein-induced photophysical changes to the amyloid indicator dye, thioflavin T 提交 2010-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–119（99 aa）
突变：H13F CU COPPER (II) ION × 1 TFX 2-[4-(dimethylamino)phenyl]-3,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-3-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；5mM ThT, 50mM diammonium tartrate, 22.5% PEG 3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.256
3MZT Protein-induced photophysical changes to the amyloid indicator dye, thioflavin T 提交 2010-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 21–119（99 aa）
突变：H13F CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；5mM ThT, 50mM diammonium tartrate, 22.5% PEG 3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.256
3MZT Protein-induced photophysical changes to the amyloid indicator dye, thioflavin T 提交 2010-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 21–119（99 aa）
突变：H13F CU COPPER (II) ION × 1 TFX 2-[4-(dimethylamino)phenyl]-3,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-3-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；5mM ThT, 50mM diammonium tartrate, 22.5% PEG 3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.256
3MZT Protein-induced photophysical changes to the amyloid indicator dye, thioflavin T 提交 2010-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 21–119（99 aa）
突变：H13F CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；5mM ThT, 50mM diammonium tartrate, 22.5% PEG 3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.256
3MZT Protein-induced photophysical changes to the amyloid indicator dye, thioflavin T 提交 2010-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 21–119（99 aa）
突变：H13F CU COPPER (II) ION × 1 TFX 2-[4-(dimethylamino)phenyl]-3,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-3-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；5mM ThT, 50mM diammonium tartrate, 22.5% PEG 3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.256
3NA4 D53P beta-2 microglobulin mutant 提交 2010-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：D53P 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） PE4 2-{2-[2-(2-{2-[2-(2-ETHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；PEG 4000, Sodium Acetate, Glycerol, Ammonium Acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.269
3NFN Recognition of peptide-MHC by a V-delta/V-beta TCR 提交 2010-06-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；0.1M MES monohydrate, pH 6.5, 12% w/v PEG 20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.39 Å R-free 0.222
3O3A Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the Peptidomimetic ELA-1 提交 2010-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, KCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.212
3O3A Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the Peptidomimetic ELA-1 提交 2010-07-23 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, KCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.212
3O3B Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the Peptidomimetic ELA-1.1 提交 2010-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, KCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.238
3O3B Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the Peptidomimetic ELA-1.1 提交 2010-07-23 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, KCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.238
3O3D Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the Peptidomimetic ELA-2 提交 2010-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, KCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.219
3O3D Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the Peptidomimetic ELA-2 提交 2010-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, KCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.219
3O3E Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the Peptidomimetic ELA-2.1 提交 2010-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaF 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.230
3O3E Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the Peptidomimetic ELA-2.1 提交 2010-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaF 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.230
3O4L Genetic and structural basis for selection of a ubiquitous T cell receptor deployed in Epstein-Barr virus 提交 2010-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
突变：K111C GOL GLYCEROL × 11 SO4 SULFATE ION × 7 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；0.16 M Ca Acetate, 0.08 M Na Cacodylate, 12.5% PEG 8000, 20% Glycerol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.54 Å R-free 0.296
3OV6 CD1c in complex with MPM (mannosyl-beta1-phosphomycoketide) 提交 2010-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：beta-2-microglobulin
突变：C-terminal fusion to CD1c ectodomain, N52Q, N57Q, K108G, N128Q, N241Q, W242G, CD1c a3 domain replaced with CD1b a3 domain NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 D12 DODECANE × 1 MK0 1-O-[(S)-hydroxy{[(4S,8S,16S,20S)-4,8,12,16,20-pentamethylheptacosyl]oxy}phosphoryl]-beta-D-mannopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.45；291 K；0.1M CHES pH 9.45, 1.05M sodium citrate, 25 mM triglycine, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
3OX8 Crystal Structure of HLA A*02:03 Bound to HBV Core 18-27 提交 2010-09-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1M HEPSE pH7.5, 1.4M sodium citrate tribasic dihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.16 Å R-free 0.234
3OX8 Crystal Structure of HLA A*02:03 Bound to HBV Core 18-27 提交 2010-09-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1M HEPSE pH7.5, 1.4M sodium citrate tribasic dihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.16 Å R-free 0.234
3OXR Crystal Structure of HLA A*02:06 Bound to HBV Core 18-27 提交 2010-09-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1M HEPES pH 7.5, 10% w/v Polyethylene glycol 6,000, 5% v/v (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.214
3OXS Crystal Structure of HLA A*02:07 Bound to HBV Core 18-27 提交 2010-09-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；0.1M sodium acetate tridydrate pH 4.6, 8% w/v polyethylene 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.75 Å R-free 0.207
3PWJ Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the HuD (G2L,I9V) peptide variant 提交 2010-12-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.215
3PWJ Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the HuD (G2L,I9V) peptide variant 提交 2010-12-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.215
3PWL Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the HuD peptide 提交 2010-12-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.65 Å R-free 0.195
3PWL Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the HuD peptide 提交 2010-12-08 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.65 Å R-free 0.195
3PWN Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the HuD (G2L) peptide variant 提交 2010-12-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K
分辨率 1.60 Å R-free 0.214
3PWN Human Class I MHC HLA-A2 in complex with the HuD (G2L) peptide variant 提交 2010-12-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K
分辨率 1.60 Å R-free 0.214
3PWP The complex between TCR A6 and human Class I MHC HLA-A2 with the bound HuD peptide 提交 2010-12-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；30% PEG3350, 0.1M TRIS, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.69 Å R-free 0.259
3QDA Crystal structure of W95L beta-2 microglobulin 提交 2011-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：Form pI 5.3 (UNP residues 21-119)
突变：W95L PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；19-20% PEG4000, 20% glycerol, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.57 Å R-free 0.198
3QDG The complex between TCR DMF5 and human Class I MHC HLA-A2 with the bound MART-1(26-35)(A27L) peptide 提交 2011-01-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；PEG 30%, TRIS 0.1M, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 2.69 Å R-free 0.278
3QDJ The complex between TCR DMF5 and human Class I MHC HLA-A2 with the bound MART-1(27-35) nonameric peptide 提交 2011-01-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；PEG 24%, TRIS 0.1M, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 2.30 Å R-free 0.299
3QDM The complex between TCR DMF4 and human Class I MHC HLA-A2 with the bound MART-1(26-35)(A27L) decameric peptide 提交 2011-01-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；PEG 24%, TRIS 0.1, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 2.80 Å R-free 0.284
3QEQ The complex between TCR DMF4 and human Class I MHC HLA-A2 with the bound MART-1(27-35) nonameric peptide 提交 2011-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；PEG 24%, TRIS 0.1M, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 2.59 Å R-free 0.269
3QFD Human Class I MHC HLA-A2 in complex with Mart-1(27-35) nonameric peptide 提交 2011-01-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K
分辨率 1.68 Å R-free 0.211
3QFD Human Class I MHC HLA-A2 in complex with Mart-1(27-35) nonameric peptide 提交 2011-01-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K
分辨率 1.68 Å R-free 0.211
3QFJ The complex between TCR A6 and human Class I MHC HLA-A2 with the modified TAX (Y5F) peptide 提交 2011-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；297 K；PEG 24%, TRIS 0.1 M, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 2.29 Å R-free 0.271
3QZW Plasticity of human CD8 binding to peptide-HLA-A*2402 提交 2011-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；0.1M MES monohydrate, pH 6.5, 12% w/v PEG 20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.80 Å R-free 0.260
3QZW Plasticity of human CD8 binding to peptide-HLA-A*2402 提交 2011-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；0.1M MES monohydrate, pH 6.5, 12% w/v PEG 20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.80 Å R-free 0.260
3REW Crystal structure of an lmp2a-derived peptide bound to human class i mhc hla-a2 提交 2011-04-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22% PEG 3350, 0.2M AMMONIUM IODIDE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.239
3REW Crystal structure of an lmp2a-derived peptide bound to human class i mhc hla-a2 提交 2011-04-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22% PEG 3350, 0.2M AMMONIUM IODIDE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.239
3RL1 HIV RT derived peptide complexed to HLA-A*0301 提交 2011-04-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.222
3RL2 HIV Nef derived peptide Nef73 complexed to HLA-A*0301 提交 2011-04-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2M calcium acetate hydrate, 0.1M Sodium cacodylate trihydrate, 18%(w/v) Polyethylene glycol 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.39 Å R-free 0.265
3RWJ Rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-HW8 提交 2011-05-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å R-free 0.256
3S6C Structure of human CD1e 提交 2011-05-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：P61769 residues 21-119, P15812 residues 32-303
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.6；293 K；10% PEG 6000, 0.2 M Sodium malonate, 0.1 M magnesium valerate, 0.1 M sodium borate , pH 3.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.296
3SDX Crystal structure of human autoreactive-Valpha24 NKT TCR in complex with CD1d-beta-galactosylceramide 提交 2011-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GCY N-[(2S,3R)-1-(beta-D-galactopyranosyloxy)-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl]tetracosanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；30% PEG 400, 0.1M Tris, 0.1M MgCl2, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.12 Å R-free 0.273
3SDX Crystal structure of human autoreactive-Valpha24 NKT TCR in complex with CD1d-beta-galactosylceramide 提交 2011-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GCY N-[(2S,3R)-1-(beta-D-galactopyranosyloxy)-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl]tetracosanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；30% PEG 400, 0.1M Tris, 0.1M MgCl2, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.12 Å R-free 0.273
3SJV Crystal structure of the RL42 TCR in complex with HLA-B8-FLR 提交 2011-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.2M ammonium tartrate, 14% PEG 3350, 7% ethylene glycol, pH 8, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.321
3SJV Crystal structure of the RL42 TCR in complex with HLA-B8-FLR 提交 2011-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.2M ammonium tartrate, 14% PEG 3350, 7% ethylene glycol, pH 8, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.321
3SJV Crystal structure of the RL42 TCR in complex with HLA-B8-FLR 提交 2011-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.2M ammonium tartrate, 14% PEG 3350, 7% ethylene glycol, pH 8, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.321
3SJV Crystal structure of the RL42 TCR in complex with HLA-B8-FLR 提交 2011-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.2M ammonium tartrate, 14% PEG 3350, 7% ethylene glycol, pH 8, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.321
3SKM Crystal structure of the HLA-B8FLRGRAYVL, mutant G8V of the FLR peptide 提交 2011-06-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 20% PEG 4000, 0.1M tri-Na citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.212
3SKO Crystal structure of the HLA-B8-A66-FLR, mutant A66 of the HLA B8 提交 2011-06-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 20% PEG 4000, 0.1M tri-Na citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.60 Å R-free 0.234
3SPV Crystal structure of a peptide-HLA complex 提交 2011-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；15-20% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M Na-Citrate, pH 5.6, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.30 Å R-free 0.219
3T8X Crystal structure of human CD1b in complex with synthetic antigenic diacylsulfoglycolipid SGL12 and endogenous spacer 提交 2011-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 T8X 2-O-sulfo-alpha-D-glucopyranosyl 2-O-hexadecanoyl-3-O-[(2E,4S,6S,8S)-2,4,6,8-tetramethyltetracos-2-enoyl]-alpha-D-glucopyranoside × 1 ULI tetracontane × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；1.9 M Ammonium sulfate, 0.2 M Ammonium acetate, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.211
3T8X Crystal structure of human CD1b in complex with synthetic antigenic diacylsulfoglycolipid SGL12 and endogenous spacer 提交 2011-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 T8X 2-O-sulfo-alpha-D-glucopyranosyl 2-O-hexadecanoyl-3-O-[(2E,4S,6S,8S)-2,4,6,8-tetramethyltetracos-2-enoyl]-alpha-D-glucopyranoside × 1 ULI tetracontane × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；1.9 M Ammonium sulfate, 0.2 M Ammonium acetate, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.211
3TID Crystal structure of the LCMV derived peptide GP34 in complex with the murine mhc class I H-2 Kb 提交 2011-08-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 8K, Cacodylate, Magnesium Acetate, DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.65 Å R-free 0.192
3TIE Crystal structure of the vaccinia derived peptide A11R in complex with the murine MHC CLASS I H-2 KB 提交 2011-08-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG 8K, Cacodylate, Magnesium Acetate, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.25 Å R-free 0.219
3TIE Crystal structure of the vaccinia derived peptide A11R in complex with the murine MHC CLASS I H-2 KB 提交 2011-08-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG 8K, Cacodylate, Magnesium Acetate, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.25 Å R-free 0.219
3TLR Crystal Structure of the tetrameric Beta-2 microglobulin DIMC20 mutant 提交 2011-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 21–119（99 aa）
链 B 21–119（99 aa）
链 C 21–119（99 aa）
链 D 21–119（99 aa）
突变：S20C 突变：S20C 突变：S20C 突变：S20C CD CADMIUM ION × 10 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；293 K；Hepes 0.1 M pH 7.7, CdSO4 0.12 M, sodium acetate 2.4 M, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.45 Å R-free 0.266
3TM6 Crystal structure of the beta-2 microglobulin DIMC50 disulphide-linked homodimer mutant 提交 2011-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 21–119（99 aa） 片段：Full-length Beta-2 microglobulin
链 B 21–119（99 aa） 片段：Full-length Beta-2 microglobulin
链 C 21–119（99 aa） 片段：Full-length Beta-2 microglobulin
链 D 21–119（99 aa） 片段：Full-length Beta-2 microglobulin
突变：E50C 突变：E50C 突变：E50C 突变：E50C PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；imidazole-malate 0.2 M, pH 5.5, PEG 600 24%, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.263
3TM6 Crystal structure of the beta-2 microglobulin DIMC50 disulphide-linked homodimer mutant 提交 2011-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 21–119（99 aa） 片段：Full-length Beta-2 microglobulin
链 F 21–119（99 aa） 片段：Full-length Beta-2 microglobulin
链 G 21–119（99 aa） 片段：Full-length Beta-2 microglobulin
链 H 21–119（99 aa） 片段：Full-length Beta-2 microglobulin
突变：E50C 突变：E50C 突变：E50C 突变：E50C PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；imidazole-malate 0.2 M, pH 5.5, PEG 600 24%, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.263
3TO2 Structure of HLA-A*0201 complexed with peptide Md3-C9 derived from a clustering region of restricted cytotoxic T lymphocyte epitope from SARS-CoV M protein 提交 2011-09-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Ammonium acetate, 0.1M BIS-Tris pH6.5, 17% polyethylene glycol 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.230
3TZV Crystal structure of an iNKT TCR in complex with CD1d-lysophosphatidylcholine 提交 2011-09-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 LSC (4R,7R,18E)-4,7-dihydroxy-N,N,N-trimethyl-10-oxo-3,5,9-trioxa-4-phosphaheptacos-18-en-1-aminium 4-oxide × 1 HEX HEXANE × 1 D12 DODECANE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 17% PEG 4000, 0.1 MgCl2, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 3.06 Å R-free 0.288
3U0P Crystal structure of human CD1d-lysophosphatidylcholine 提交 2011-09-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 LSC (4R,7R,18E)-4,7-dihydroxy-N,N,N-trimethyl-10-oxo-3,5,9-trioxa-4-phosphaheptacos-18-en-1-aminium 4-oxide × 1 HEX HEXANE × 1 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 4 UND UNDECANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M Tris-HCl, 2.0 M Ammonium Sulfate, 0.03 M glycyl-glycyl-glycine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
3U0P Crystal structure of human CD1d-lysophosphatidylcholine 提交 2011-09-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 LSC (4R,7R,18E)-4,7-dihydroxy-N,N,N-trimethyl-10-oxo-3,5,9-trioxa-4-phosphaheptacos-18-en-1-aminium 4-oxide × 1 SO4 SULFATE ION × 7 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M Tris-HCl, 2.0 M Ammonium Sulfate, 0.03 M glycyl-glycyl-glycine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
3U0P Crystal structure of human CD1d-lysophosphatidylcholine 提交 2011-09-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 NBU N-BUTANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M Tris-HCl, 2.0 M Ammonium Sulfate, 0.03 M glycyl-glycyl-glycine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
3UPR HLA-B*57:01 complexed to pep-V and Abacavir 提交 2011-11-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 1KX {(1S,4R)-4-[2-amino-6-(cyclopropylamino)-9H-purin-9-yl]cyclopent-2-en-1-yl}methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；0.1M NaCacodylate, 0.1MNaAcetate, 25%PEG 8,000, 15% Glycerol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.00 Å R-free 0.228
3UPR HLA-B*57:01 complexed to pep-V and Abacavir 提交 2011-11-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 1KX {(1S,4R)-4-[2-amino-6-(cyclopropylamino)-9H-purin-9-yl]cyclopent-2-en-1-yl}methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；0.1M NaCacodylate, 0.1MNaAcetate, 25%PEG 8,000, 15% Glycerol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.00 Å R-free 0.228
3UTQ Human HLA-A*0201-ALWGPDPAAA 提交 2011-11-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M potassium/sodium tartrate, 0.1 M Bis-tris propane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 1.67 Å R-free 0.244
3UTS 1E6-A*0201-ALWGPDPAAA Complex, Monoclinic 提交 2011-11-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M sodium citrate, 0.1 M Bis-tris propane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 2.71 Å R-free 0.269
3UTS 1E6-A*0201-ALWGPDPAAA Complex, Monoclinic 提交 2011-11-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M sodium citrate, 0.1 M Bis-tris propane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 2.71 Å R-free 0.269
3UTT 1E6-A*0201-ALWGPDPAAA Complex, Triclinic 提交 2011-11-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M sodium citrate, 0.1 M Bis-tris propane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 2.60 Å R-free 0.274
3UTT 1E6-A*0201-ALWGPDPAAA Complex, Triclinic 提交 2011-11-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M sodium citrate, 0.1 M Bis-tris propane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 2.60 Å R-free 0.274
3V5D HLA-A2.1 KVAELVHFL 提交 2011-12-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；25 mM MES pH 6.5, 12% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.264
3V5D HLA-A2.1 KVAELVHFL 提交 2011-12-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；25 mM MES pH 6.5, 12% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.264
3V5H HLA-A2.1 KVAEIVHFL 提交 2011-12-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；25 mM MES pH6.5, 12% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.63 Å R-free 0.214
3V5H HLA-A2.1 KVAEIVHFL 提交 2011-12-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；25 mM MES pH6.5, 12% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.63 Å R-free 0.214
3V5K HLA2.1 KVAELVWFL 提交 2011-12-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；25 mM MES pH6.5 12% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.31 Å R-free 0.228
3V5K HLA2.1 KVAELVWFL 提交 2011-12-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；25 mM MES pH6.5 12% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.31 Å R-free 0.228
3VCL Crystal Structure of HLA-B7 with the HCMV pp65 peptide RPHERNGFTVL 提交 2012-01-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NI NICKEL (II) ION × 4 GOL GLYCEROL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；18% PEG2000-MME, 5-10mM NiCl2, 0.1M HEPES, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 1.70 Å R-free 0.217
3VFM crystal structure of HLA B*3508 LPEP155A, HLA mutant Ala155 提交 2012-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1M sodium citrate pH5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.241
3VFN crystal structure of HLA B*3508LPEP151A, HLA mutant Ala151 提交 2012-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1M sodium citrate pH5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.211
3VFO crystal structure of HLA B*3508 LPEP157A, HLA mutant Ala157 提交 2012-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1M sodium citrate pH5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.279
3VFP crystal structure of HLA B*3508 LPEP158G, HLA mutant Gly158 提交 2012-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1M sodium citrate pH5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.85 Å R-free 0.266
3VFR crystal structure of HLA B*3508LPEP-P4Ala, peptide mutant P4-ala 提交 2012-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1M sodium citrate pH5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.85 Å R-free 0.232
3VFS crystal structure of HLA B*3508LPEP-P5Ala , peptide mutant P5-ala 提交 2012-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1M sodium citrate pH5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.85 Å R-free 0.216
3VFT crystal structure of HLA B*3508LPEP-P6Ala, peptide mutant P6-ala 提交 2012-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1M sodium citrate pH5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.223
3VFU crystal structure of HLA B*3508 LPEP-P7Ala, peptide mutant P7-ala 提交 2012-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1M sodium citrate pH5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.65 Å R-free 0.226
3VFV crystal structure of HLA B*3508 LPEP-P9Ala, peptide mutant P9-ala 提交 2012-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1M sodium citrate pH5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.55 Å R-free 0.204
3VFW crystal structure of HLA B*3508 LPEP-P10Ala, peptide mutant P10-ala 提交 2012-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1M sodium citrate pH5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.279
3VH8 KIR3DL1 in complex with HLA-B*5701 提交 2011-08-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；16% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1M tri-sodium citrate pH 5.6., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 1.80 Å R-free 0.237
3VH8 KIR3DL1 in complex with HLA-B*5701 提交 2011-08-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；16% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1M tri-sodium citrate pH 5.6., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 1.80 Å R-free 0.237
3VRI HLA-B*57:01-RVAQLENVYI in complex with abacavir 提交 2012-04-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 1KX {(1S,4R)-4-[2-amino-6-(cyclopropylamino)-9H-purin-9-yl]cyclopent-2-en-1-yl}methanol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；293 K；28% PEG 8000, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M cacodylate, pH 6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.218
3VRJ HLA-B*57:01-LTTKLTNTNI in complex with abacavir 提交 2012-04-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 1KX {(1S,4R)-4-[2-amino-6-(cyclopropylamino)-9H-purin-9-yl]cyclopent-2-en-1-yl}methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；293 K；28% PEG 8000, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M cacodylate, pH 6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.213
3VWJ Ternary crystal structure of the human NKT TCR-CD1d-C20:2 complex 提交 2012-08-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 DB3 (11Z,14E)-N-[(2S,3S,4R)-1-(alpha-D-galactopyranosyloxy)-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]icosa-11,14-dienamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；295 K；8% PEG 10000, 0.2M magnesium chloride, 0.1M Tris, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.09 Å R-free 0.292
3VWK Ternary crystal structure of the human NKT TCR-CD1d-4'deoxy-alpha-galactosylceramide complex 提交 2012-08-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 4GH N-{(2S,3R)-1-[(4-deoxy-alpha-D-xylo-hexopyranosyl)oxy]-3-hydroxyoctadecan-2-yl}hexacosanamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；295 K；9% PEG 10000, 0.2M magnesium chloride, 0.1M glycine, pH 10.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.94 Å R-free 0.250
3VXM The complex between C1-28 TCR and HLA-A24 bound to HIV-1 Nef134-10(2F) peptide 提交 2012-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；80mM HEPES, 8mM Cobalt(II) chloride hexahydrate, 8% PEG 6000, 4% 2-Methyl-2,4-pentanediol (MPD), 8mM betaine hydrochloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.267
3VXN HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-10(wt) 提交 2012-09-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；5% PEG 8000, 50mM ammonium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.246
3VXO HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-10(2F) 提交 2012-09-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 8000, 200mM ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.61 Å R-free 0.242
3VXO HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-10(2F) 提交 2012-09-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 8000, 200mM ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.61 Å R-free 0.242
3VXP HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-10(6L) 提交 2012-09-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 200mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.269
3VXP HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-10(6L) 提交 2012-09-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 200mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.269
3VXR The complex between H27-14 TCR and HLA-A24 bound to HIV-1 Nef134-10(wt) peptide 提交 2012-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350, 0.1M ammonium phosphate dibasic, 10mM barium chloride dihydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.242
3VXS The complex between H27-14 TCR and HLA-A24 bound to HIV-1 Nef134-10(6L) peptide 提交 2012-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；9% PEG 3350, 10mM iron(III) chloride hexahydrate, 100mM sodium fluoride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.230
3VXU The complex between T36-5 TCR and HLA-A24 bound to HIV-1 Nef134-10(2F) peptide 提交 2012-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；10% PEG3350, 0.1M sodium nitrate, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.323
3VXU The complex between T36-5 TCR and HLA-A24 bound to HIV-1 Nef134-10(2F) peptide 提交 2012-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；10% PEG3350, 0.1M sodium nitrate, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.323
3W0W The complex between T36-5 TCR and HLA-A24 bound to HIV-1 Nef134-10(2F) peptide in space group P212121 提交 2012-11-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；16% PEG 3350, 0.1 M diammonium tartrate, 0.2% n-dodecyl-N,N-dimethylamine-N-oxide (LDAO) 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.250
3W39 Crystal structure of HLA-B*5201 in complexed with HIV immunodominant epitope (TAFTIPSI) 提交 2012-12-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M sodium acetate, 0.1M Bis Tris propane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.347
3W39 Crystal structure of HLA-B*5201 in complexed with HIV immunodominant epitope (TAFTIPSI) 提交 2012-12-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M sodium acetate, 0.1M Bis Tris propane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.347
3WL9 HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef126-10(8I10F) 提交 2013-11-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20%(w/v) PEG3350, 200mM sodium nitrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.66 Å R-free 0.226
3WLB HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef126-10(8T10F) 提交 2013-11-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20%(w/v) PEG3350, 200 mM sodium phosphate dibasic, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.245
3WUW KIR3DL1 in complex with HLA-B*57:01.I80T 提交 2014-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 22–119（98 aa） 片段：Beta 2 Microglobulin, UNP residues 22-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；16% PEG3350, 2% tacsimate(pH 5.0), 0.1M tri-sodium citrate pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.239
3X11 Crystal structure of HLA-B*57:01.I80N.L82R.R83G 提交 2014-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；12-20% PEG4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M tri-sodium citrate pH 5.4., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.15 Å R-free 0.231
3X12 Crystal structure of HLA-B*57:01.I80N 提交 2014-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；12-20% PEG4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M tri-sodium citrate pH 5.4., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.219
3X13 Crystal structure of HLA-B*0801.N80I 提交 2014-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；12-20% PEG4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M tri-sodium citrate pH 5.4., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.207
3X14 Crystal structure of HLA-B*0801.N80I.R82L.G83R 提交 2014-10-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；12-20% PEG4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M tri-sodium citrate pH 5.4., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.229
4E5X Crystal structure of a complex between the human adenovirus type 2 E3-19K protein and MHC class I molecule HLA-A2/Tax 提交 2012-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：Beta 2-microglobulin
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；0.8M succinic acid pH7.0 0.1M calcium chloride dihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 1.95 Å R-free 0.241
4E5X Crystal structure of a complex between the human adenovirus type 2 E3-19K protein and MHC class I molecule HLA-A2/Tax 提交 2012-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 21–119（99 aa） 片段：Beta 2-microglobulin
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；0.8M succinic acid pH7.0 0.1M calcium chloride dihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 1.95 Å R-free 0.241
4EN3 Crystal structure of a human Valpha24(-) NKT TCR in complex with CD1d/alpha-galactosylceramide 提交 2012-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 AGH N-{(1S,2R,3S)-1-[(ALPHA-D-GALACTOPYRANOSYLOXY)METHYL]-2,3-DIHYDROXYHEPTADECYL}HEXACOSANAMIDE × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；291 K；17 % PEG 4000, 0.1 M ammnonium acetate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.57 Å R-free 0.266
4EUP The complex between TCR JKF6 and human Class I MHC HLA-A2 presenting the MART-1(27-35)(A27L) peptide 提交 2012-04-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 16% PEG10000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.88 Å R-free 0.295
4EUP The complex between TCR JKF6 and human Class I MHC HLA-A2 presenting the MART-1(27-35)(A27L) peptide 提交 2012-04-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 16% PEG10000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.88 Å R-free 0.295
4F7M Crystal Structure of HLA-A*2402 Complexed with a Newly Identified Peptide from 2009 H1N1 PA (649-658) 提交 2012-05-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：unp residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium nitrate and 20% (w/v) polyethylene glycol 3,350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.289
4F7M Crystal Structure of HLA-A*2402 Complexed with a Newly Identified Peptide from 2009 H1N1 PA (649-658) 提交 2012-05-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：unp residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium nitrate and 20% (w/v) polyethylene glycol 3,350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.289
4F7P Crystal Structure of HLA-A*2402 Complexed with a Newly Identified Peptide from 2009H1N1 PB1 (496-505) 提交 2012-05-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：unp residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris and 10% (w/v) polyethylene glycol 3,350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.216
4F7T Crystal Structure of HLA-A*2402 Complexed with a Newly Identified Peptide from 2009 H1N1 PB1 (498-505) 提交 2012-05-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：unp residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris and 10% (w/v) polyethylene glycol 3,350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.227
4F7T Crystal Structure of HLA-A*2402 Complexed with a Newly Identified Peptide from 2009 H1N1 PB1 (498-505) 提交 2012-05-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：unp residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris and 10% (w/v) polyethylene glycol 3,350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.227
4FTV The complex between the high affinity version of A6 TCR (A6c134) and human Class I MHC HLA-A2 with the bound TAX nonameric peptide 提交 2012-06-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG3350 24%, MES 0.025M, NaCl 0.1M, pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K
分辨率 2.74 Å R-free 0.260
4FXL Crystal structure of the D76N Beta-2 Microglobulin mutant 提交 2012-07-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：D76N NA SODIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；18-20% PEG 4000, 20% glycerol, 0.2M ammonium acetate, 0.1 M MES, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.40 Å R-free 0.186
4G8G Crystal Structure of C12C TCR-HA B2705-KK10 提交 2012-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；16% PEG 8000 and 0.1M MES pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.257
4G8I Crystal Structure of HLA B2705-KK10-L6M 提交 2012-07-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；24% PEG 3350 and 0.3M Na2SO4, pH 8, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.225
4G9D Crystal Structure of HLA B2705-KK10 提交 2012-07-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；24% PEG 3350 and 0.3M Na2SO4, pH 8, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.233
4G9F Crystal Structure of C12C TCR-HLAB2705-KK10-L6M 提交 2012-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；16% PEG 8000 and 0.1M MES, pH 7, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.238
4GKN A2-MHC Complex carrying FATGIGIITV 提交 2012-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；25% PEG 8000, 200 mM Ammonium Sulphate, 200 mM MES Buffer, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.75 Å R-free 0.299
4GKN A2-MHC Complex carrying FATGIGIITV 提交 2012-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；25% PEG 8000, 200 mM Ammonium Sulphate, 200 mM MES Buffer, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.75 Å R-free 0.299
4GKS A2-MHC Complex carrying FLTGIGIITV 提交 2012-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；25% PEG 8000, 200 mM Ammonium Sulphate, 200 mM Cacodylate Buffer, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.35 Å R-free 0.285
4GKS A2-MHC Complex carrying FLTGIGIITV 提交 2012-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；25% PEG 8000, 200 mM Ammonium Sulphate, 200 mM Cacodylate Buffer, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.35 Å R-free 0.285
4GUP Structure of MHC-class I related molecule MR1 提交 2012-08-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 6FP 2-amino-4-oxo-3,4-dihydropteridine-6-carbaldehyde × 1 CL CHLORIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.02M MgCl2, 0.1M HEPES, 22% polyacrylic acid 5100 sodium salt, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.20 Å R-free 0.260
4GUP Structure of MHC-class I related molecule MR1 提交 2012-08-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 6FP 2-amino-4-oxo-3,4-dihydropteridine-6-carbaldehyde × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.02M MgCl2, 0.1M HEPES, 22% polyacrylic acid 5100 sodium salt, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.20 Å R-free 0.260
4HKJ Structure of Cowpox CPXV203 in complex with MHCI (H-2Kb) 提交 2012-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.55；293 K；10% PEG6000, 4% glucose, 2% ethylene glycol, 0.1 M tri-potassium citrate, 0.01% azide, pH 5.55, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.253
4HKJ Structure of Cowpox CPXV203 in complex with MHCI (H-2Kb) 提交 2012-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.55；293 K；10% PEG6000, 4% glucose, 2% ethylene glycol, 0.1 M tri-potassium citrate, 0.01% azide, pH 5.55, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.253
4HKJ Structure of Cowpox CPXV203 in complex with MHCI (H-2Kb) 提交 2012-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.55；293 K；10% PEG6000, 4% glucose, 2% ethylene glycol, 0.1 M tri-potassium citrate, 0.01% azide, pH 5.55, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.253
4HKJ Structure of Cowpox CPXV203 in complex with MHCI (H-2Kb) 提交 2012-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 N 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.55；293 K；10% PEG6000, 4% glucose, 2% ethylene glycol, 0.1 M tri-potassium citrate, 0.01% azide, pH 5.55, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.253
4HWZ Structure of HLA-A68 complexed with an HIV derived peptide 提交 2012-11-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M HEPES, 30%(v/v) Jeffamine ED-2001, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.40 Å R-free 0.233
4HX1 Structure of HLA-A68 complexed with a tumor antigen derived peptide 提交 2012-11-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；100mM Tris, 8% PEG8000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.226
4I48 Structure of HLA-A68 complexed with an HIV Env derived peptide 提交 2012-11-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M ammonium acetate, 0.1M Bis-Tris, 17%(w/v) PEG10000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
4I4W Peptide length determines the outcome of T cell receptor/peptide-MHCI engagement 提交 2012-11-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；291 K；0.2M Ammonium sulphate, 22.5% PEG 8K, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 1.77 Å R-free 0.222
4JFD Preservation of peptide specificity during TCR-MHC contact dominated affinity enhancement of a melanoma-specific TCR 提交 2013-02-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 SO4 SULFATE ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M TRIS, 15% PEG 4000, 17.4% glycerol, pH 7.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
分辨率 2.46 Å R-free 0.248
4JFE Preservation of peptide specificity during TCR-MHC contact dominated affinity enhancement of a melanoma-specific TCR 提交 2013-02-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M BIS TRIS Propane, 20% PEG 4000, 0.2M Ammonium sulphate, 17.4% glycerol, pH 7.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
分辨率 2.70 Å R-free 0.250
4JFF Preservation of peptide specificity during TCR-MHC contact dominated affinity enhancement of a melanoma-specific TCR 提交 2013-02-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M TRIS, 15% PEG 4000, 17.4% Glycerol, pH 7.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
分辨率 2.43 Å R-free 0.263
4JFO A2 HLA complex with E1A heteroclitic variant of Melanoma peptide 提交 2013-02-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；25 mM MES, 24% PEG 3350, 10 mM NaCl, pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
分辨率 2.11 Å R-free 0.296
4JFO A2 HLA complex with E1A heteroclitic variant of Melanoma peptide 提交 2013-02-28 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；25 mM MES, 24% PEG 3350, 10 mM NaCl, pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
分辨率 2.11 Å R-free 0.296
4JFP A2 HLA complex with G4A heteroclitic variant of Melanoma peptide 提交 2013-02-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；0.1 M sodium cacodylate, 20% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulphate, pH 6.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
分辨率 1.91 Å R-free 0.228
4JFP A2 HLA complex with G4A heteroclitic variant of Melanoma peptide 提交 2013-02-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；0.1 M sodium cacodylate, 20% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulphate, pH 6.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
分辨率 1.91 Å R-free 0.228
4JFQ A2 HLA complex with L8A heteroclitic variant of Melanoma peptide 提交 2013-02-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 11 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；25 mM MES, 24% PEG 3350, 10 mM NaCl, pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
分辨率 1.90 Å R-free 0.297
4JFQ A2 HLA complex with L8A heteroclitic variant of Melanoma peptide 提交 2013-02-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 8 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；25 mM MES, 24% PEG 3350, 10 mM NaCl, pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
分辨率 1.90 Å R-free 0.297
4JQV HLA-B*18:01 in complex with Epstein-Barr virus BZLF1-derived peptide (residues 173-180) 提交 2013-03-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–119（99 aa） 片段：mature protein (UNP residues 21-119)
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M citrate, pH 5.6, 0.2 M ammonium acetate, 16-26% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.214
4JQX HLA-B*44:03 in complex with Epstein-Barr virus BZLF1-derived peptide (residues 169-180) 提交 2013-03-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–119（99 aa） 片段：mature protein (UNP residues 21-119)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M citrate, pH 5.6, 0.2 M ammonium acetate, 16-26% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.231
4JRX Crystal Structure of CA5 TCR-HLA B*3505-LPEP complex 提交 2013-03-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 3 IOD IODIDE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；298 K；16% PEG 3350, 0.2M KI, 0.1M Na-cacodylate pH 6.7, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.257
4JRY Crystal Structure of SB47 TCR-HLA B*3505-LPEP complex 提交 2013-03-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；12% PEG 10K, 0.2M Na tartrate, 10mM HEPES pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.233
4K71 Crystal structure of a high affinity Human Serum Albumin variant bound to the Neonatal Fc Receptor 提交 2013-04-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；1.7 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.255
4K71 Crystal structure of a high affinity Human Serum Albumin variant bound to the Neonatal Fc Receptor 提交 2013-04-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；1.7 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.255
4K71 Crystal structure of a high affinity Human Serum Albumin variant bound to the Neonatal Fc Receptor 提交 2013-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 21–119（99 aa）
链 F 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 38 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；1.7 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.255
4K7F Newly identified epitope V60 from HBV core protein complexed with HLA-A*0201 提交 2013-04-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M Bis-Tris, 20%(wt/vol) polyethylene glycol 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.259
4K7F Newly identified epitope V60 from HBV core protein complexed with HLA-A*0201 提交 2013-04-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M Bis-Tris, 20%(wt/vol) polyethylene glycol 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.259
4KDT Structure of an early native-like intermediate of beta2-microglobulin amyloidosis 提交 2013-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：unp residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES, 1.6 M MgSO4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.274
4KDT Structure of an early native-like intermediate of beta2-microglobulin amyloidosis 提交 2013-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 21–119（99 aa） 片段：unp residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES, 1.6 M MgSO4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.274
4L29 Structure of wtMHC class I with NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.09 Å R-free 0.201
4L29 Structure of wtMHC class I with NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.09 Å R-free 0.201
4L29 Structure of wtMHC class I with NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 V 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.09 Å R-free 0.201
4L29 Structure of wtMHC class I with NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 X 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.09 Å R-free 0.201
4L29 Structure of wtMHC class I with NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 13 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Z 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.09 Å R-free 0.201
4L29 Structure of wtMHC class I with NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 14 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 b 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.09 Å R-free 0.201
4L29 Structure of wtMHC class I with NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.09 Å R-free 0.201
4L29 Structure of wtMHC class I with NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.09 Å R-free 0.201
4L29 Structure of wtMHC class I with NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.09 Å R-free 0.201
4L29 Structure of wtMHC class I with NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.09 Å R-free 0.201
4L29 Structure of wtMHC class I with NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.09 Å R-free 0.201
4L29 Structure of wtMHC class I with NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 N 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.09 Å R-free 0.201
4L29 Structure of wtMHC class I with NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.09 Å R-free 0.201
4L29 Structure of wtMHC class I with NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.09 Å R-free 0.201
4L3C Structure of HLA-A2 in complex with D76N b2m mutant and NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
突变：D76N CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.64 Å R-free 0.218
4L3C Structure of HLA-A2 in complex with D76N b2m mutant and NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
突变：D76N CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.64 Å R-free 0.218
4L3C Structure of HLA-A2 in complex with D76N b2m mutant and NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 V 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
突变：D76N CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.64 Å R-free 0.218
4L3C Structure of HLA-A2 in complex with D76N b2m mutant and NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 X 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
突变：D76N CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.64 Å R-free 0.218
4L3C Structure of HLA-A2 in complex with D76N b2m mutant and NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 13 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Z 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
突变：D76N CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.64 Å R-free 0.218
4L3C Structure of HLA-A2 in complex with D76N b2m mutant and NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 14 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 b 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
突变：D76N CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.64 Å R-free 0.218
4L3C Structure of HLA-A2 in complex with D76N b2m mutant and NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
突变：D76N CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.64 Å R-free 0.218
4L3C Structure of HLA-A2 in complex with D76N b2m mutant and NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
突变：D76N CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.64 Å R-free 0.218
4L3C Structure of HLA-A2 in complex with D76N b2m mutant and NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
突变：D76N CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.64 Å R-free 0.218
4L3C Structure of HLA-A2 in complex with D76N b2m mutant and NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
突变：D76N CL CHLORIDE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.64 Å R-free 0.218
4L3C Structure of HLA-A2 in complex with D76N b2m mutant and NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
突变：D76N CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.64 Å R-free 0.218
4L3C Structure of HLA-A2 in complex with D76N b2m mutant and NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 N 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
突变：D76N CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.64 Å R-free 0.218
4L3C Structure of HLA-A2 in complex with D76N b2m mutant and NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
突变：D76N CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.64 Å R-free 0.218
4L3C Structure of HLA-A2 in complex with D76N b2m mutant and NY-ESO1 double mutant 提交 2013-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
突变：D76N CL CHLORIDE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M ammonium sulphate, 2% PEG 6K, 100 mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.64 Å R-free 0.218
4L3E The complex between high affinity TCR DMF5(alpha-D26Y,beta-L98W) and human Class I MHC HLA-A2 with the bound MART-1(26-35)(A27L) peptide 提交 2013-06-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；12% PEG3350, 0.1 M Tris-HCl, 0.25 M magnesium chloride, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.56 Å R-free 0.266
4L4T Structure of human MAIT TCR in complex with human MR1-6-FP 提交 2013-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 6FP 2-amino-4-oxo-3,4-dihydropteridine-6-carbaldehyde × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.225
4L4T Structure of human MAIT TCR in complex with human MR1-6-FP 提交 2013-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 6FP 2-amino-4-oxo-3,4-dihydropteridine-6-carbaldehyde × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.225
4L4V Structure of human MAIT TCR in complex with human MR1-RL-6-Me-7-OH 提交 2013-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 1VY 1-deoxy-1-(7-hydroxy-6-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropteridin-8(2H)-yl)-D-ribitol × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.209
4L4V Structure of human MAIT TCR in complex with human MR1-RL-6-Me-7-OH 提交 2013-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 1VY 1-deoxy-1-(7-hydroxy-6-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropteridin-8(2H)-yl)-D-ribitol × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.209
4LCW The structure of human MAIT TCR in complex with MR1-K43A-RL-6-Me-7OH 提交 2013-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 1VY 1-deoxy-1-(7-hydroxy-6-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropteridin-8(2H)-yl)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.2M sodium acetate, 0.1M Bis-Tris-Propane pH 6.5 and 20% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.40 Å R-free 0.227
4LCW The structure of human MAIT TCR in complex with MR1-K43A-RL-6-Me-7OH 提交 2013-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 1VY 1-deoxy-1-(7-hydroxy-6-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropteridin-8(2H)-yl)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.2M sodium acetate, 0.1M Bis-Tris-Propane pH 6.5 and 20% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.40 Å R-free 0.227
4LCY Crystal structure of HLA-b46 at 1.6 angstrom resolution 提交 2013-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M BIS-TRIS pH 5.5, 25% POLYETHYLENE GLYCOL 3350 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.201
4LCY Crystal structure of HLA-b46 at 1.6 angstrom resolution 提交 2013-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M BIS-TRIS pH 5.5, 25% POLYETHYLENE GLYCOL 3350 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.201
4LCY Crystal structure of HLA-b46 at 1.6 angstrom resolution 提交 2013-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M BIS-TRIS pH 5.5, 25% POLYETHYLENE GLYCOL 3350 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.201
4LCY Crystal structure of HLA-b46 at 1.6 angstrom resolution 提交 2013-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M BIS-TRIS pH 5.5, 25% POLYETHYLENE GLYCOL 3350 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.201
4LHU Crystal Structure of 9C2 TCR bound to CD1d 提交 2013-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 JLS (15Z)-N-[(2S,3S,4R)-1-(alpha-D-galactopyranosyloxy)-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]tetracos-15-enamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；12% PEG8000, 0.1 M Tris-HCl, pH 7.0, 0.2 M magnesium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.87 Å R-free 0.243
4LNR The structure of HLA-B*35:01 in complex with the peptide (RPQVPLRPMTY) 提交 2013-07-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M MES monohydrate pH 6.5, 12% w/v Polyethylene glycol 20,000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.208
4M8V Crystal structure of Human double mutant beta2-microglobulin Q8H-L65T 提交 2013-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：Q8H, L65T 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；289 K；20%(w/v) PEG 3350, 0.1M Bis-tris, 0.2M Ammonium acetate, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 1.95 Å R-free 0.240
4M8V Crystal structure of Human double mutant beta2-microglobulin Q8H-L65T 提交 2013-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–119（99 aa）
突变：Q8H, L65T 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；289 K；20%(w/v) PEG 3350, 0.1M Bis-tris, 0.2M Ammonium acetate, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 1.95 Å R-free 0.240
4MJ5 Crystal Structure of HLA-A*1101 in complex with H1-22, an influenza A(H1N1) virus epitope 提交 2013-09-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M Ammonium acetate, 0.1M BIS0TRIS PH5.5, 17% w/v Polyethylene glycol 10K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.40 Å R-free 0.245
4MJ6 Crystal Structure of HLA-A*1101 in complex with H7-22, an influenza A(H7N9) virus epitope 提交 2013-09-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M Ammonium acetate, 0.1M BIS0TRIS PH5.5, 17% w/v Polyethylene glycol 10K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.57 Å R-free 0.247
4MJI T cell response to a HIV reverse transcriptase epitope presented by the protective allele HLA-B*51:01 提交 2013-09-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2M NaSO4, 0.1M Bis-Tris Propane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 2.99 Å R-free 0.304
4MJI T cell response to a HIV reverse transcriptase epitope presented by the protective allele HLA-B*51:01 提交 2013-09-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2M NaSO4, 0.1M Bis-Tris Propane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 2.99 Å R-free 0.304
4MNQ TCR-peptide specificity overrides affinity enhancing TCR-MHC interactions 提交 2013-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；TRIS 0.02M, 20% PEG 4000, 0.01M NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.74 Å R-free 0.284
4N0F Human FcRn complexed with human serum albumin 提交 2013-10-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：unp residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.2；298 K；4% Tacsimate, pH 4.0, 12% PEG3350, 30 mM Sodium Acetate, pH 5.2, HSA/FcRn 10 mg/ml, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 3.02 Å R-free 0.260
4N0F Human FcRn complexed with human serum albumin 提交 2013-10-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa） 片段：unp residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.2；298 K；4% Tacsimate, pH 4.0, 12% PEG3350, 30 mM Sodium Acetate, pH 5.2, HSA/FcRn 10 mg/ml, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 3.02 Å R-free 0.260
4N0F Human FcRn complexed with human serum albumin 提交 2013-10-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 21–119（99 aa） 片段：unp residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.2；298 K；4% Tacsimate, pH 4.0, 12% PEG3350, 30 mM Sodium Acetate, pH 5.2, HSA/FcRn 10 mg/ml, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 3.02 Å R-free 0.260
4N0F Human FcRn complexed with human serum albumin 提交 2013-10-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 21–119（99 aa） 片段：unp residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.2；298 K；4% Tacsimate, pH 4.0, 12% PEG3350, 30 mM Sodium Acetate, pH 5.2, HSA/FcRn 10 mg/ml, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 3.02 Å R-free 0.260
4N0U Ternary complex between Neonatal Fc receptor, serum albumin and Fc 提交 2013-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：beta-2 microglobulin, unp residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.2；298 K；4% Tacsimate, pH 4.0, 12% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.303
4N8V Crystal structure of killer cell immunoglobulin-like receptor KIR2DS2 in complex with HLA-A 提交 2013-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；16% PEG 3350, 2% TACSIMATE, 0.1M TRI-SODIUM CITRATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.257
4N8V Crystal structure of killer cell immunoglobulin-like receptor KIR2DS2 in complex with HLA-A 提交 2013-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；16% PEG 3350, 2% TACSIMATE, 0.1M TRI-SODIUM CITRATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.257
4NNX Crystal structure of PKD2 phosphopeptide bound to HLA-A2 提交 2013-11-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 CD CADMIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；11% PEG3350, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.15 M sodium chloride, 0.003 M magnesium chloride, 0.003 M cadmium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.236
4NNY Crystal structure of non-phosphorylated form of PKD2 phosphopeptide bound to HLA-A2 提交 2013-11-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 CD CADMIUM ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；15% PEG3350, 0.1 M HEPES, 0.2 M sodium chloride, 0.003 M magnesium chloride, 0.003 M cadmium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.229
4NO0 Crystal structure of non-phosphorylated form of RQA_V phosphopeptide bound to HLA-A2 in complex with LILRB1 提交 2013-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；18% PEG3350, 0.1 M HEPES, pH 7.4, 0.2 M ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.309
4NO2 Crystal structure of RQA_V phosphopeptide bound to HLA-A2 提交 2013-11-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG8000, 0.1 M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.249
4NO3 Crystal structure of AMPD2 phosphopeptide bound to HLA-A2 提交 2013-11-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；12% PEG3350, 8% tacsimate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.232
4NO5 Crystal structure of non-phosphorylated form of AMPD2 phosphopeptide bound to HLA-A2 提交 2013-11-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 22–119（98 aa） 片段：UNP residues 22-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；19% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris propane, 0.1 M sodium tartrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.237
4NQC Crystal structure of TCR-MR1 ternary complex and covalently bound 5-(2-oxopropylideneamino)-6-D-ribitylaminouracil 提交 2013-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.3；293 K；12% (w/v) PEG3350, 0.2 M sodium citrate, 0.1 M bis-tris propane, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.216
4NQC Crystal structure of TCR-MR1 ternary complex and covalently bound 5-(2-oxopropylideneamino)-6-D-ribitylaminouracil 提交 2013-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.3；293 K；12% (w/v) PEG3350, 0.2 M sodium citrate, 0.1 M bis-tris propane, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.216
4NQD Crystal structure of TCR-MR1 ternary complex and non-covalently bound 5-(2-oxopropylideneamino)-6-D-ribitylaminouracil 提交 2013-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 Q87 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；12% (w/v) PEG3350, 0.2 M sodium citrate, 0.1 M bis-tris propane, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.227
4NQD Crystal structure of TCR-MR1 ternary complex and non-covalently bound 5-(2-oxopropylideneamino)-6-D-ribitylaminouracil 提交 2013-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 Q87 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；12% (w/v) PEG3350, 0.2 M sodium citrate, 0.1 M bis-tris propane, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.227
4NQD Crystal structure of TCR-MR1 ternary complex and non-covalently bound 5-(2-oxopropylideneamino)-6-D-ribitylaminouracil 提交 2013-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 21–119（99 aa）
链 F 21–119（99 aa）
未记录 Q87 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；12% (w/v) PEG3350, 0.2 M sodium citrate, 0.1 M bis-tris propane, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.227
4NQE Crystal structure of TCR-MR1 ternary complex bound to 5-(2-oxoethylideneamino)-6-D-ribitylaminouracil 提交 2013-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2L4 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxoethylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；12% (w/v) PEG3350, 0.2 M sodium citrate, 0.1 M bis-tris propane, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.10 Å R-free 0.222
4NQE Crystal structure of TCR-MR1 ternary complex bound to 5-(2-oxoethylideneamino)-6-D-ribitylaminouracil 提交 2013-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 2L4 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxoethylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；12% (w/v) PEG3350, 0.2 M sodium citrate, 0.1 M bis-tris propane, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.10 Å R-free 0.222
4NQV Crystal Structure of HLA A*0101 in complex with NP44, an 9-mer influenza epitope 提交 2013-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.6；277 K；0.2M MgCl, 0.1M Na-citrate pH 5.6, 15-20% PEG 6K, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.39 Å R-free 0.291
4NQV Crystal Structure of HLA A*0101 in complex with NP44, an 9-mer influenza epitope 提交 2013-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.6；277 K；0.2M MgCl, 0.1M Na-citrate pH 5.6, 15-20% PEG 6K, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.39 Å R-free 0.291
4NQV Crystal Structure of HLA A*0101 in complex with NP44, an 9-mer influenza epitope 提交 2013-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.6；277 K；0.2M MgCl, 0.1M Na-citrate pH 5.6, 15-20% PEG 6K, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.39 Å R-free 0.291
4NQV Crystal Structure of HLA A*0101 in complex with NP44, an 9-mer influenza epitope 提交 2013-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.6；277 K；0.2M MgCl, 0.1M Na-citrate pH 5.6, 15-20% PEG 6K, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.39 Å R-free 0.291
4NQV Crystal Structure of HLA A*0101 in complex with NP44, an 9-mer influenza epitope 提交 2013-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.6；277 K；0.2M MgCl, 0.1M Na-citrate pH 5.6, 15-20% PEG 6K, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.39 Å R-free 0.291
4NQV Crystal Structure of HLA A*0101 in complex with NP44, an 9-mer influenza epitope 提交 2013-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.6；277 K；0.2M MgCl, 0.1M Na-citrate pH 5.6, 15-20% PEG 6K, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.39 Å R-free 0.291
4NQX Crystal Structure of HLA A*0101 in complex with NP44-S7N, an 9-mer influenza epitope 提交 2013-11-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.6；277 K；0.2M MgCl, 0.1M Na-citrate pH 5.6, 15-20% PEG 6K, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.283
4NQX Crystal Structure of HLA A*0101 in complex with NP44-S7N, an 9-mer influenza epitope 提交 2013-11-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.6；277 K；0.2M MgCl, 0.1M Na-citrate pH 5.6, 15-20% PEG 6K, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.283
4NQX Crystal Structure of HLA A*0101 in complex with NP44-S7N, an 9-mer influenza epitope 提交 2013-11-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.6；277 K；0.2M MgCl, 0.1M Na-citrate pH 5.6, 15-20% PEG 6K, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.283
4NQX Crystal Structure of HLA A*0101 in complex with NP44-S7N, an 9-mer influenza epitope 提交 2013-11-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.6；277 K；0.2M MgCl, 0.1M Na-citrate pH 5.6, 15-20% PEG 6K, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.283
4NQX Crystal Structure of HLA A*0101 in complex with NP44-S7N, an 9-mer influenza epitope 提交 2013-11-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.6；277 K；0.2M MgCl, 0.1M Na-citrate pH 5.6, 15-20% PEG 6K, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.283
4NQX Crystal Structure of HLA A*0101 in complex with NP44-S7N, an 9-mer influenza epitope 提交 2013-11-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.6；277 K；0.2M MgCl, 0.1M Na-citrate pH 5.6, 15-20% PEG 6K, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.283
4NT6 HLA-C*0801 Crystal Structure 提交 2013-12-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–118（98 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.05M CALCIUM CHLORIDE DIHYDRATE, 0.1M BIS-TRIS, 30%(V/V) POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 550, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.84 Å R-free 0.229
4O2C An Nt-acetylated peptide complexed with HLA-B*3901 提交 2013-12-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M ammonium acetate, 0.1M Bis-Tris (pH 6.5), 17% (w/v) PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.202
4O2E A peptide complexed with HLA-B*3901 提交 2013-12-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M ammonium acetate, 0.1M Bis-Tris (pH 6.5), 20% (w/v) PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.98 Å R-free 0.208
4O2E A peptide complexed with HLA-B*3901 提交 2013-12-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M ammonium acetate, 0.1M Bis-Tris (pH 6.5), 20% (w/v) PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.98 Å R-free 0.208
4O2F A peptide complexed with HLA-B*3901 提交 2013-12-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.2M sodium formate, 20% (w/v) PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.213
4O2F A peptide complexed with HLA-B*3901 提交 2013-12-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.2M sodium formate, 20% (w/v) PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.213
4ONO CD1c in complex with PM (phosphomycoketide) 提交 2014-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：N52Q, N57Q, K108G, N128Q, N241Q, W242G PMK (4R,8S,16S,20R)-4,8,12,16,20-pentamethylheptacosyl dihydrogen phosphate × 1 CL CHLORIDE ION × 6 MLI MALONATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.4；291 K；1.05 M sodium citrate, 100 mM CHES (pH 9.4), and 25 mM triglycine, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.71 Å R-free 0.271
4PJ5 Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT TRBV6-1 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, sodium acetate, bis-tris-propane
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4PJ5 Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT TRBV6-1 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, sodium acetate, bis-tris-propane
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4PJ7 Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT TRBV6-4 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.50 Å R-free 0.219
4PJ7 Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT TRBV6-4 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.50 Å R-free 0.219
4PJ8 Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT TRBV20 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 3.30 Å R-free 0.213
4PJ9 Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT TRAJ20 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.00 Å R-free 0.199
4PJA Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT B-B10 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.68 Å R-free 0.216
4PJA Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT B-B10 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.68 Å R-free 0.216
4PJB Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT B-F3-C1 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.85 Å R-free 0.225
4PJB Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT B-F3-C1 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.85 Å R-free 0.225
4PJC Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT C-A11 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.50 Å R-free 0.213
4PJC Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT C-A11 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.50 Å R-free 0.213
4PJD Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT C-C10 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.78 Å R-free 0.226
4PJD Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT C-C10 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.78 Å R-free 0.226
4PJE Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT B-B10 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 6 ACT ACETATE ION × 3 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 1.95 Å R-free 0.197
4PJE Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT B-B10 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 1.95 Å R-free 0.197
4PJF Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT B-C10 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.45 Å R-free 0.212
4PJF Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT B-C10 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.45 Å R-free 0.212
4PJG Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT B-F3-C1 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.40 Å R-free 0.213
4PJG Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT B-F3-C1 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.40 Å R-free 0.213
4PJH Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT B-G8 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.00 Å R-free 0.198
4PJH Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT B-G8 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.00 Å R-free 0.198
4PJI Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT C-C10 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.50 Å R-free 0.228
4PJI Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT C-C10 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.50 Å R-free 0.228
4PJX Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT C-A11 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.25 Å R-free 0.203
4PJX Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT C-A11 TCR 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 GOL GLYCEROL × 2 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.25 Å R-free 0.203
4PR5 Crystal structure of a HLA-B*35:01-HPVG-D5 提交 2014-03-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；16% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate and 0.1M Na-Citrate pH 5.6, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.213
4PRA Crystal structure of a HLA-B*35:01-HPVG-Q5 提交 2014-03-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；16% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate and 0.1M Na-Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 1.85 Å R-free 0.225
4PRB Crystal structure of a HLA-B*35:08-HPVG-A4 提交 2014-03-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；16% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate and 0.1M Na-Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 1.75 Å R-free 0.234
4PRD Crystal structure of a HLA-B*35:08-HPVG-D5 提交 2014-03-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；16% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate and 0.1M Na-Citrate pH 5.6, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.75 Å R-free 0.234
4PRE Crystal structure of a HLA-B*35:08-HPVG-Q5 提交 2014-03-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；16% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate and 0.1M Na-Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 1.65 Å R-free 0.202
4PRH Crystal structure of TK3 TCR-HLA-B*35:08-HPVG-D5 complex 提交 2014-03-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 23–119（97 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6；298 K；18% PEG 3350, 0.2M LiSO4 and 0.1M Na-Citrate pH 5.6, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.253
4PRI Crystal structure of TK3 TCR-HLA-B*35:08-HPVG complex 提交 2014-03-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；18% PEG 3350, 0.2M LiSO4 and 0.1M Na-Citrate pH 5.6, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.261
4PRN Crystal structure of a HLA-B*35:01-HPVG-A4 提交 2014-03-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；16% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate and 0.1M Na-Citrate pH 5.6, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.65 Å R-free 0.222
4PRP Crystal structure of TK3 TCR-HLA-B*35:01-HPVG-Q5 complex 提交 2014-03-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；18% PEG 3350, 0.2M LiSO4 and 0.1M Na-Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.229
4QOK Structural basis for ineffective T-cell responses to MHC anchor residue improved heteroclitic peptides 提交 2014-06-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate, pH 6.5, 15% PEG 4000, 15% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.262
4QRP Crystal Structure of HLA B*0801 in complex with HSKKKCDEL and DD31 TCR 提交 2014-07-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1 tri-Na citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.248
4QRP Crystal Structure of HLA B*0801 in complex with HSKKKCDEL and DD31 TCR 提交 2014-07-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 4 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1 tri-Na citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.248
4QRP Crystal Structure of HLA B*0801 in complex with HSKKKCDEL and DD31 TCR 提交 2014-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 21–119（99 aa）
链 G 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 12 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1 tri-Na citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.248
4QRQ Crystal Structure of HLA B*0801 in complex with HSKKKCDEL 提交 2014-07-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1 tri-Na citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.209
4QRR Crystal Structure of HLA B*3501-IPS in complex with a Delta-Beta TCR, clone 12 TCR 提交 2014-07-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.3 M KCN, 24% PEG 3350, 2% EG, 10 mM spermidine, 10 mM L-Proline, pH 8, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.258
4QRS Crystal Structure of HLA B*0801 in complex with ELK_IYM, ELKRKMIYM 提交 2014-07-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 22–119（98 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1 tri-Na citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.40 Å R-free 0.216
4QRT Crystal Structure of HLA B*0801 in complex with ELN_YYM, ELNRKMIYM 提交 2014-07-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1 tri-Na citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.40 Å R-free 0.204
4QRU Crystal Structure of HLA B*0801 in complex with ELR_MYM, ELRRKMMYM 提交 2014-07-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2M ammonium acetate, 16% PEG 4K, 0.1 tri-Na citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.60 Å R-free 0.202
4R9H Crystal structure of dimeric S33C beta-2 microglobulin mutant at 1.9 Angstrom resolution 提交 2014-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：S33C 突变：S33C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；25% PEG4000, 0.2 M imidazole-malate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.247
4R9H Crystal structure of dimeric S33C beta-2 microglobulin mutant at 1.9 Angstrom resolution 提交 2014-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
链 C 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：S33C 突变：S33C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；25% PEG4000, 0.2 M imidazole-malate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.247
4RA3 Crystal structure of dimeric S33C beta-2 microglobulin mutant in complex with Thioflavin (ThT) at 2.8 Angstrom resolution 提交 2014-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
链 C 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：S33C 突变：S33C TFX 2-[4-(dimethylamino)phenyl]-3,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-3-ium × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；25% v/v PEG4000, 0.1 M sodium chloride, 5 mM thioflavin, 0.1 M HEPES sodium, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.206
4RA3 Crystal structure of dimeric S33C beta-2 microglobulin mutant in complex with Thioflavin (ThT) at 2.8 Angstrom resolution 提交 2014-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：S33C 突变：S33C TFX 2-[4-(dimethylamino)phenyl]-3,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-3-ium × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；25% v/v PEG4000, 0.1 M sodium chloride, 5 mM thioflavin, 0.1 M HEPES sodium, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.206
4RAH Crystal structure of dimeric S33C beta-2 microglobulin mutant at 1.4 Angstrom resolution 提交 2014-09-10 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：S33C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；28% v/v PEG400, 0.2 M calcium chloride dihydrate, 0.1 M HEPES sodium, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.40 Å R-free 0.209
4RMQ Crystal structure of the D59N Beta-2 Microglobulin mutant 提交 2014-10-22 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：D59N PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；27% PEG4000, 15% glycerol, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.46 Å R-free 0.193
4RMR Crystal structure of the D38N Beta-2 Microglobulin mutant 提交 2014-10-22 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：D38N PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；21% PEG4000, 15% glycerol, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.53 Å R-free 0.248
4RMS Crystal structure of the D53N Beta-2 Microglobulin mutant 提交 2014-10-22 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：D53N PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；27% PEG4000, 15% glycerol, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.249
4RMT Crystal structure of the D98N Beta-2 Microglobulin mutant 提交 2014-10-22 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：D98N PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；27% PEG4000, 15% glycerol, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.24 Å R-free 0.199
4RMU Crystal structure of the D76E Beta-2 Microglobulin mutant 提交 2014-10-22 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：D76E PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；24% PEG4000, 15% glycerol, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.40 Å R-free 0.192
4RMV Crystal structure of the D76H Beta-2 Microglobulin mutant 提交 2014-10-22 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：D76H ACT ACETATE ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；30% PEG4000, 15% glycerol, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.46 Å R-free 0.229
4RMW Crystal structure of the D76A Beta-2 Microglobulin mutant 提交 2014-10-22 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：D76A PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；21% PEG4000, 15% glycerol, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.40 Å R-free 0.213
4U1H HLA class I micropolymorphisms determine peptide-HLA landscape and dictate differential HIV-1 escape through identical epitopes 提交 2014-07-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；22% PEG 4000 and 0.2 M ammonium sulphate, 0.1M sodium acetate
分辨率 1.59 Å R-free 0.194
4U1I HLA class I micropolymorphisms determine peptide-HLA landscape and dictate differential HIV-1 escape through identical epitopes 提交 2014-07-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 20% PEG 4000 and 0.2 M ammonium sulphate
分辨率 1.92 Å R-free 0.207
4U1J HLA class I micropolymorphisms determine peptide-HLA landscape and dictate differential HIV-1 escape through identical epitopes 提交 2014-07-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；10% PEG 6000, 10mM magnesium chloride
分辨率 1.38 Å R-free 0.196
4U1K HLA class I micropolymorphisms determine peptide-HLA landscape and dictate differential HIV-1 escape through identical epitopes 提交 2014-07-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate, pH 6, 15% PEG 8000, 15% Glycerol
分辨率 2.09 Å R-free 0.226
4U1K HLA class I micropolymorphisms determine peptide-HLA landscape and dictate differential HIV-1 escape through identical epitopes 提交 2014-07-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate, pH 6, 15% PEG 8000, 15% Glycerol
分辨率 2.09 Å R-free 0.226
4U1L HLA class I micropolymorphisms determine peptide-HLA landscape and dictate differential HIV-1 escape through identical epitopes 提交 2014-07-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；0.1 M TRIS pH 8.0, 15% PEG 4000 and 15% glycerol
分辨率 2.06 Å R-free 0.209
4U1L HLA class I micropolymorphisms determine peptide-HLA landscape and dictate differential HIV-1 escape through identical epitopes 提交 2014-07-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；0.1 M TRIS pH 8.0, 15% PEG 4000 and 15% glycerol
分辨率 2.06 Å R-free 0.209
4U1M HLA class I micropolymorphisms determine peptide-HLA landscape and dictate differential HIV-1 escape through identical epitopes 提交 2014-07-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：Beta 2 Microglobulin
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 26 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；10% PEG 6000, 10mM magnesium chloride
分辨率 1.18 Å R-free 0.180
4U1N HLA class I micropolymorphisms determine peptide-HLA landscape and dictate differential HIV-1 escape through identical epitopes 提交 2014-07-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：TRIMERIC
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；10% PEG 6000, 10mM magnesium chloride
分辨率 1.77 Å R-free 0.199
4U1S HLA class I micropolymorphisms determine peptide-HLA landscape and dictate differential HIV-1 escape through identical epitopes 提交 2014-07-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；0.2 M Lithium Chloride, pH 8, 20% PEG 6000
分辨率 1.76 Å R-free 0.207
4U6X Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with ALQDA, a 15 mer self-peptide 提交 2014-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；277 K；18-22.5% PEG 3350, Hepes pH 7.5, 0.1M MgCl2
分辨率 1.68 Å R-free 0.202
4U6Y Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with FLNDK, a 15 mer self-peptide 提交 2014-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；277 K；18-225 PEG 3350, Hepes pH 7.5, 0.1M MgCl2
分辨率 1.47 Å R-free 0.189
4UQ2 Crystal structure of HLA-A1101 in complex with an azobenzene- containing peptide 提交 2014-06-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2 M AMMONIUM SULFATE, 15% W/V PEG4000, 0.1M TRI-SODIUM CITRATE PH5.6
分辨率 2.43 Å R-free 0.251
4UQ2 Crystal structure of HLA-A1101 in complex with an azobenzene- containing peptide 提交 2014-06-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2 M AMMONIUM SULFATE, 15% W/V PEG4000, 0.1M TRI-SODIUM CITRATE PH5.6
分辨率 2.43 Å R-free 0.251
4UQ3 Crystal structure of HLA-A0201 in complex with an azobenzene- containing peptide 提交 2014-06-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.10 Å R-free 0.221
4UQ3 Crystal structure of HLA-A0201 in complex with an azobenzene- containing peptide 提交 2014-06-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.10 Å R-free 0.221
4WDI Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2014-09-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：Human beta2-microglobulin, residues 21-219
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M Sodium malonate, and 0.1 M Bis-Tris Propane, pH 6.5
分辨率 2.31 Å R-free 0.283
4WDI Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2014-09-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：Human beta2-microglobulin, residues 21-219
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M Sodium malonate, and 0.1 M Bis-Tris Propane, pH 6.5
分辨率 2.31 Å R-free 0.283
4WJ5 Structure of HLA-A2 in complex with an altered peptide ligands based on Mart-1 variant epitope 提交 2014-09-29 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：Methionine residue is introduced as start codon GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；Good diffracting crystals were obtained by streak seeding
分辨率 1.65 Å R-free 0.179
4WJ5 Structure of HLA-A2 in complex with an altered peptide ligands based on Mart-1 variant epitope 提交 2014-09-29 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：Methionine residue is introduced as start codon GOL GLYCEROL × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；Good diffracting crystals were obtained by streak seeding
分辨率 1.65 Å R-free 0.179
4WO4 The molecular bases of Delta/Alpha beta T cell-mediated antigen recognition. 提交 2014-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 JLS (15Z)-N-[(2S,3S,4R)-1-(alpha-D-galactopyranosyloxy)-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]tetracos-15-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.1；293 K；27% PEG1500 0.1M Sodium Malonate-imidazole-borate (2:3:3 molar ratio) 3% PEG3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.237
4WU5 HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-8(wt) 提交 2014-10-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 200 mM sodium nitrate
分辨率 2.40 Å R-free 0.271
4WU5 HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-8(wt) 提交 2014-10-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 200 mM sodium nitrate
分辨率 2.40 Å R-free 0.271
4WU7 HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-8(2F) 提交 2014-10-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200mM sodium nitrate, 20%PEG3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.287
4WU7 HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-8(2F) 提交 2014-10-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200mM sodium nitrate, 20%PEG3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.287
4WUU Structure of ESK1 in complex with HLA-A*0201/WT1 提交 2014-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.25；291 K；0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5, 25 percent PEG 3350
分辨率 3.05 Å R-free 0.254
4WW2 Crystal structure of human TCR Alpha Chain-TRAV21-TRAJ8, Beta Chain-TRBV7-8, Antigen-presenting glycoprotein CD1d, and Beta-2-microglobulin 提交 2014-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 JLS (15Z)-N-[(2S,3S,4R)-1-(alpha-D-galactopyranosyloxy)-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]tetracos-15-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；9-10% PEG 6K 0.1M MES 6.0 4% Ethylene Glycol
分辨率 2.48 Å R-free 0.244
4WWK Crystal structure of human TCR Alpha Chain-TRAV12-3, Beta Chain-TRBV6-5, Antigen-presenting molecule CD1d, and Beta-2-microglobulin 提交 2014-11-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–119（119 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 JLS (15Z)-N-[(2S,3S,4R)-1-(alpha-D-galactopyranosyloxy)-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]tetracos-15-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；18% PEG8000 0.1M CHES 9.5
分辨率 3.10 Å R-free 0.256
4X6C CD1a ternary complex with lysophosphatidylcholine and BK6 TCR 提交 2014-12-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 42H (4R,7R,18Z)-4,7-dihydroxy-N,N,N-trimethyl-10-oxo-3,5,9-trioxa-4-phosphaheptacos-18-en-1-aminium 4-oxide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium citrate, bis-tris propane, PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4X6C CD1a ternary complex with lysophosphatidylcholine and BK6 TCR 提交 2014-12-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 42H (4R,7R,18Z)-4,7-dihydroxy-N,N,N-trimethyl-10-oxo-3,5,9-trioxa-4-phosphaheptacos-18-en-1-aminium 4-oxide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium citrate, bis-tris propane, PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4X6D CD1a ternary complex with endogenous lipids and BK6 TCR 提交 2014-12-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 OLA OLEIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium citrate, bis-tris propane, PEG 3350
分辨率 2.98 Å R-free 0.229
4X6D CD1a ternary complex with endogenous lipids and BK6 TCR 提交 2014-12-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 PAM PALMITOLEIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium citrate, bis-tris propane, PEG 3350
分辨率 2.98 Å R-free 0.229
4X6E CD1a binary complex with lysophosphatidylcholine 提交 2014-12-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 MLT D-MALATE × 1 42H (4R,7R,18Z)-4,7-dihydroxy-N,N,N-trimethyl-10-oxo-3,5,9-trioxa-4-phosphaheptacos-18-en-1-aminium 4-oxide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20 mM DL-malic acid, 40 mM MES, 40 mM tris, PEG 1500
分辨率 2.10 Å R-free 0.234
4X6F CD1a binary complex with sphingomyelin 提交 2014-12-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 3XU (4S,7S,23Z)-4-hydroxy-7-[(1S,2Z)-1-hydroxyhexadec-2-en-1-yl]-N,N,N-trimethyl-9-oxo-3,5-dioxa-8-aza-4-phosphadotriacont- 23-en-1-aminium 4-oxide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20 mM DL-malic acid, 40 mM MES, 40 mM tris, PEG 1500
分辨率 1.91 Å R-free 0.224
4XXC HLA-B*1801 in complex with a self-peptide, DELEIKAY 提交 2015-01-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.6；273 K；14-20% PEG 4K, 0.2 M NH4Ac
分辨率 1.43 Å R-free 0.235
4Z76 Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2015-04-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；291 K；G9V crystals were grown in 20% PEG 6000, 0.2 M calcium chloride, 0.1 M Tris propane pH 8.0
分辨率 1.88 Å R-free 0.230
4Z76 Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2015-04-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；291 K；G9V crystals were grown in 20% PEG 6000, 0.2 M calcium chloride, 0.1 M Tris propane pH 8.0
分辨率 1.88 Å R-free 0.230
4Z77 Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2015-04-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 4 15P POLYETHYLENE GLYCOL (N=34) × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；20% PEG 6000, 0.2 M calcium chloride, 0.1 M Tris propane pH 8.0
分辨率 1.85 Å R-free 0.253
4Z77 Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2015-04-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 15P POLYETHYLENE GLYCOL (N=34) × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；20% PEG 6000, 0.2 M calcium chloride, 0.1 M Tris propane pH 8.0
分辨率 1.85 Å R-free 0.253
4Z78 Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2015-04-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；4% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate pH 4.6
分辨率 2.30 Å R-free 0.233
4Z78 Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2015-04-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；4% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate pH 4.6
分辨率 2.30 Å R-free 0.233
4Z78 Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2015-04-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；4% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate pH 4.6
分辨率 2.30 Å R-free 0.233
5B38 KIR3DL1*005 in complex with HLA-B*57:01 提交 2016-02-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；14 to 18% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.30 Å R-free 0.251
5B39 KIR3DL1*015 in complex with HLA-B*57:01 提交 2016-02-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；14 to 18% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.50 Å R-free 0.229
5BJT Crystal structure of human FcRn with a peptide inhibitor at multiple sites 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.7；277 K；1.6 M ammonium sulfate, 20% glycerol, 0.8 M sodium acetate
分辨率 3.20 Å R-free 0.339
5BJT Crystal structure of human FcRn with a peptide inhibitor at multiple sites 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.7；277 K；1.6 M ammonium sulfate, 20% glycerol, 0.8 M sodium acetate
分辨率 3.20 Å R-free 0.339
5BJT Crystal structure of human FcRn with a peptide inhibitor at multiple sites 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.7；277 K；1.6 M ammonium sulfate, 20% glycerol, 0.8 M sodium acetate
分辨率 3.20 Å R-free 0.339
5BJT Crystal structure of human FcRn with a peptide inhibitor at multiple sites 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.7；277 K；1.6 M ammonium sulfate, 20% glycerol, 0.8 M sodium acetate
分辨率 3.20 Å R-free 0.339
5BRZ MAGE-A3 reactive TCR in complex with MAGE-A3 in HLA-A1 提交 2015-06-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M ammonium chloride, 0.1M HEPES pH7, 15% PEG 8000
分辨率 2.62 Å R-free 0.268
5BS0 MAGE-A3 Reactive TCR in complex with Titin Epitope in HLA-A1 提交 2015-06-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.2M Ammonium Chloride, 0.1M MES, 20% PEG 4000
分辨率 2.40 Å R-free 0.262
5BXF Apo FcRn Structure at pH 4.5 提交 2015-06-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；.1M sodium citrate pH 4.5, 20% PEG (4000)
分辨率 2.85 Å R-free 0.314
5BXF Apo FcRn Structure at pH 4.5 提交 2015-06-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；.1M sodium citrate pH 4.5, 20% PEG (4000)
分辨率 2.85 Å R-free 0.314
5C07 1E6 TCR in complex with HLA-A02 carrying YQFGPDFPIA 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M sodium cholride, 0.1M HEPES pH7, 20% PEG 3350
分辨率 2.11 Å R-free 0.237
5C07 1E6 TCR in complex with HLA-A02 carrying YQFGPDFPIA 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M sodium cholride, 0.1M HEPES pH7, 20% PEG 3350
分辨率 2.11 Å R-free 0.237
5C08 1E6 TCR in Complex with HLA-A0e carrying RQWGPDPAAV 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M sodium cholride, 0.1M MES pH6, 20% PEG 6000
分辨率 2.33 Å R-free 0.272
5C08 1E6 TCR in Complex with HLA-A0e carrying RQWGPDPAAV 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M sodium cholride, 0.1M MES pH6, 20% PEG 6000
分辨率 2.33 Å R-free 0.272
5C09 HLA class I histocompatibility antigen 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M sodium cacodylate pH6.5, 15% PEG 4000, 0.2M sodium acetate
分辨率 2.48 Å R-free 0.259
5C09 HLA class I histocompatibility antigen 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M sodium cacodylate pH6.5, 15% PEG 4000, 0.2M sodium acetate
分辨率 2.48 Å R-free 0.259
5C0A 1E6 TCR in complex with HLA-A02 carrying MVW peptide 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES pH7.5, 15% PEG 4000, 0.2M sodium acetate
分辨率 2.46 Å R-free 0.232
5C0A 1E6 TCR in complex with HLA-A02 carrying MVW peptide 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES pH7.5, 15% PEG 4000, 0.2M sodium acetate
分辨率 2.46 Å R-free 0.232
5C0B 1E6 TCR in complex with HLA-A02 carrying RQFGPDFPTI 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 30 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES, pH 7.5, 15% PEG 4000, 0.2M sodium acetate
分辨率 2.03 Å R-free 0.231
5C0B 1E6 TCR in complex with HLA-A02 carrying RQFGPDFPTI 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 25 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES, pH 7.5, 15% PEG 4000, 0.2M sodium acetate
分辨率 2.03 Å R-free 0.231
5C0C 1E6 TCR in complex with HLA-A02 carrying RQFGPDWIVA 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES pH7, 15% PEG 4000, 0.2M sodium acetate
分辨率 1.97 Å R-free 0.227
5C0C 1E6 TCR in complex with HLA-A02 carrying RQFGPDWIVA 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES pH7, 15% PEG 4000, 0.2M sodium acetate
分辨率 1.97 Å R-free 0.227
5C0D HLA-A02 carrying AQWGPDPAAA 提交 2015-06-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M sodium malonate, 0.1M BIS TRIS propane, pH 6.5, 20% PEG3350
分辨率 1.68 Å R-free 0.214
5C0E HLA-A02 carrying YLGGPDFPTI 提交 2015-06-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
未记录 BR BROMIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 GOL GLYCEROL × 4 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M TRIS pH8, 25% PEG 4000, 15% glycerol
分辨率 1.49 Å R-free 0.179
5C0F HLA-A02 carrying RQWGPDPAAV 提交 2015-06-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 GOL GLYCEROL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 4 ACY ACETIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M TRIS, pH 8, 20% PEG 8000, 15% glycerol
分辨率 1.46 Å R-free 0.181
5C0G HLA-A02 carrying YLGGPDFPTI 提交 2015-06-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M sodium nitrate, 0.1M BIS TRIS propane pH6.5, 20% PEG 3350
分辨率 1.37 Å R-free 0.188
5C0I HAL-A02 carrying RQFGPDFPTI 提交 2015-06-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M potassium/sodium tartrate, 0.1M BIS TRIS propane, pH 8.5, 20% PEG 3350
分辨率 1.53 Å R-free 0.191
5C0J HLA-A02 carrying RQFGPDWIVA 提交 2015-06-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M sodium sulphate, 0.1M BIS TRIS propane, pH 6.5, 20% PEG 3350
分辨率 1.64 Å R-free 0.214
5C9J Human CD1c with ligands in A' and F' channel 提交 2015-06-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–118（98 aa）
未记录 DAO LAURIC ACID × 2 STE STEARIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.2M Magnesium chloride, 0.1M Tris pH 8, 10% PEG 8000, 1:1 protein to precipitant ratio.
分辨率 2.40 Å R-free 0.200
5CFH human beta-2 microglobulin double mutant W60G-Y63W 提交 2015-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：W60G, Y63W 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 10000, HEPES
分辨率 1.49 Å R-free 0.230
5CKA Human beta-2 microglobulin double mutant W60G-N83V 提交 2015-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：resideus 21-119
突变：W60G, N83V GOL GLYCEROL × 2 ACT ACETATE ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES, 21% w/v PEG 4000, 15% glycerol, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 1.70 Å R-free 0.226
5CKG Human beta-2 microglobulin mutant V85E 提交 2015-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
突变：V85E ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M sodium acetate, 30% w/v PEG 4000, 15% glycerol, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 1.75 Å R-free 0.232
5CKG Human beta-2 microglobulin mutant V85E 提交 2015-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：RESIDUES 21-119
突变：V85E ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M sodium acetate, 30% w/v PEG 4000, 15% glycerol, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 1.75 Å R-free 0.232
5CS7 The crystal structure of wt beta2-microglobulin at room temperature 提交 2015-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；30% PEG 4000, 0.1M sodium acetate, 15% glycerol, 0.2M ammonium acetate
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5CSB The crystal structure of beta2-microglobulin D76N mutant at room temperature 提交 2015-07-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：D76N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；30% PEG 4000, 0.1M sodium acetate, 15% glycerol, 0.2M ammonium acetate
分辨率 1.72 Å R-free 0.223
5CSG The crystal structure of beta2-microglobulin R97Q mutant 提交 2015-07-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
突变：R97Q ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；27% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate, 15% glycerol, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 1.50 Å R-free 0.225
5D2L Crystal structure of TCR C7 in complex with HCMV NLV epitope presented by HLA-A2 提交 2015-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；30% PEG 400, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 0.2M MgCl2
分辨率 3.51 Å R-free 0.355
5D2L Crystal structure of TCR C7 in complex with HCMV NLV epitope presented by HLA-A2 提交 2015-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；30% PEG 400, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 0.2M MgCl2
分辨率 3.51 Å R-free 0.355
5D2L Crystal structure of TCR C7 in complex with HCMV NLV epitope presented by HLA-A2 提交 2015-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 N 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；30% PEG 400, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 0.2M MgCl2
分辨率 3.51 Å R-free 0.355
5D2L Crystal structure of TCR C7 in complex with HCMV NLV epitope presented by HLA-A2 提交 2015-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；30% PEG 400, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 0.2M MgCl2
分辨率 3.51 Å R-free 0.355
5D2N Crystal structure of C25-NLV-HLA-A2 complex 提交 2015-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 IMD IMIDAZOLE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG3000, Imidazole, Calcium Acetate
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
5D2N Crystal structure of C25-NLV-HLA-A2 complex 提交 2015-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 IMD IMIDAZOLE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG3000, Imidazole, Calcium Acetate
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
5D5M Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT M33.64 TCR 提交 2015-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 2.20 Å R-free 0.222
5D5M Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT M33.64 TCR 提交 2015-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 2.20 Å R-free 0.222
5D7I Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT M33.64 TCR 提交 2015-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PRO PROLINE × 1 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
5D7I Structure of human MR1-Ac-6-FP in complex with human MAIT M33.64 TCR 提交 2015-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 PRO PROLINE × 1 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
5D7J Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT M33.64(Y95alphaF) TCR 提交 2015-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 1.97 Å R-free 0.222
5D7J Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAIT M33.64(Y95alphaF) TCR 提交 2015-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 1.97 Å R-free 0.222
5D7L Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAV36 TCR 提交 2015-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 3.40 Å R-free 0.337
5D7L Structure of human MR1-5-OP-RU in complex with human MAV36 TCR 提交 2015-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 3.40 Å R-free 0.337
5D9S Structure of HLA-A2:01 with the 11-mer peptide F11V 提交 2015-08-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；30% PEG 5000 MME, 0.1M Tris-HCl pH 8.0, 0.2M lithium sulfate
分辨率 1.87 Å R-free 0.223
5DDH Structure of HLA-A2:01 with the 12-mer peptide F12K 提交 2015-08-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；30% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl 8.0, 0.2M lithium sulfate
分辨率 1.50 Å R-free 0.218
5DEF Crystal structure of B*27:04 complex bound to the pVIPR peptide 提交 2015-08-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；28%(w/v) PEG 8000, 100 mM Tris-HCl pH 7.0
分辨率 1.60 Å R-free 0.174
5DEG Crystal structure of B*27:06 bound to the pVIPR peptide 提交 2015-08-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20%(w/v) PEG 8000, 100 mM Tris-HCl pH 7.0
分辨率 1.83 Å R-free 0.193
5E00 Structure of HLA-A2 P130 提交 2015-09-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.1mol/liter bis-Tris (pH 6.5), 20% (wt/vol) polyethylene glycol 3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.205
5E6I Crystal structure of TCR PF8 in complex with flu MP(58-66) epitope presented by HLA-A2 提交 2015-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 J 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M immidazole pH8, 0.2M calcium acetate, 10%(v/v) PEG8000
分辨率 4.00 Å R-free 0.338
5E6I Crystal structure of TCR PF8 in complex with flu MP(58-66) epitope presented by HLA-A2 提交 2015-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M immidazole pH8, 0.2M calcium acetate, 10%(v/v) PEG8000
分辨率 4.00 Å R-free 0.338
5E6I Crystal structure of TCR PF8 in complex with flu MP(58-66) epitope presented by HLA-A2 提交 2015-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 N 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M immidazole pH8, 0.2M calcium acetate, 10%(v/v) PEG8000
分辨率 4.00 Å R-free 0.338
5E6I Crystal structure of TCR PF8 in complex with flu MP(58-66) epitope presented by HLA-A2 提交 2015-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 U 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M immidazole pH8, 0.2M calcium acetate, 10%(v/v) PEG8000
分辨率 4.00 Å R-free 0.338
5E9D RD-1 Mart-1 High bound to Mart-1 decameric peptide (ELA) in complex with HLA-A2 提交 2015-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；300 K；PEG 4000, 0.002 M Zinc Acetate, 5% 2- propanol.
分辨率 2.51 Å R-free 0.232
5E9D RD-1 Mart-1 High bound to Mart-1 decameric peptide (ELA) in complex with HLA-A2 提交 2015-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；300 K；PEG 4000, 0.002 M Zinc Acetate, 5% 2- propanol.
分辨率 2.51 Å R-free 0.232
5ENW Structure of HLA-A2:01 with peptide G9L 提交 2015-11-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；30% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl pH 8.0, 0.2M lithium sulfate
分辨率 1.85 Å R-free 0.244
5EO0 Crystal Structure of HLA-B0702-RFL9 提交 2015-11-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；18% PEG 4000 and 0.1 M Ammonium acetate, 0.1 M Na-cacodylate
分辨率 1.70 Å R-free 0.212
5EO1 Crystal Structure of HLA-B0702-RL9 提交 2015-11-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG4K, Ammonium acetate, Na-cacodylate
分辨率 1.85 Å R-free 0.259
5EOT Structure of HLA-A2:01 with peptide G13E 提交 2015-11-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；30% PEG 5000 MME, 0.1M Tris-HCl pH 8.0, 0.2M lithium sulfate
分辨率 2.10 Å R-free 0.237
5EU3 HLA Class I antigen 提交 2015-11-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 0.2 M Ammonium Sulphate, 25 % PEG 4000
分辨率 1.97 Å R-free 0.255
5EU4 HLA Class I antigen 提交 2015-11-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M Tris pH 8.0, 15 % Glycerol, 20 % PEG 4000
分辨率 2.12 Å R-free 0.211
5EU4 HLA Class I antigen 提交 2015-11-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M Tris pH 8.0, 15 % Glycerol, 20 % PEG 4000
分辨率 2.12 Å R-free 0.211
5EU5 HLA Class I antigen 提交 2015-11-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 GOL GLYCEROL × 10 SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 0.2 M Ammonium Sulphate, 25 % PEG 4000
分辨率 1.54 Å R-free 0.201
5EU6 HLA Class I antigen 提交 2015-11-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；0.2 M sodium sulphate, 0.1 M Bis Tris propane pH 6.5, 20% w/v PEG 3350.
分辨率 2.02 Å R-free 0.222
5EUO PF6-M1-HLA-A2 提交 2015-11-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG3350, Imidazole
分辨率 2.10 Å R-free 0.281
5EUO PF6-M1-HLA-A2 提交 2015-11-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 IMD IMIDAZOLE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG3350, Imidazole
分辨率 2.10 Å R-free 0.281
5F7D Structure of HLA-A2:01 with peptide G11N 提交 2015-12-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；30% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl pH 8.0, 0.2M lithium sulfate
分辨率 2.30 Å R-free 0.257
5F9J Structure of HLA-A2:01 with peptide Y9L 提交 2015-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–118（98 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；30% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl pH 8.0, 0.2M lithium sulfate
分辨率 2.51 Å R-free 0.276
5FA3 Structure of HLA-A2:01 with peptide G9V 提交 2015-12-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；30% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl pH 8.0, 0.2 M lithium sulfate
分辨率 1.86 Å R-free 0.235
5FA4 Structure of HLA-A2:01 with peptide Y16R 提交 2015-12-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；30% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl pH 8.0, 0.1M lithium sulfate
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
5FDW Structure of HLA-A2:01 with peptide Y10L 提交 2015-12-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；30% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl pH 8.0, 0.2M lithium sulfate
分辨率 2.70 Å R-free 0.285
5GR7 Mouse MHC class I H-2Kd with a MERS-CoV-derived peptide 37-1 提交 2016-08-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5, 16% w/v Polyethylene glycol 8000
分辨率 2.40 Å R-free 0.257
5GRD Crystal structure of 10-mer peptide from EBV in complex with HLA-A1101. 提交 2016-08-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate, 30% PEG4000
分辨率 1.80 Å R-free 0.226
5GRG Crystal structure of dual peptide from EBV in complex with HLA-A*11:01 提交 2016-08-11 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；290 K；0.1 M Ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris, 22% PEG 4000
分辨率 1.94 Å R-free 0.243
5GSB Mouse MHC class I H-2Kd with a MERS-CoV-derived peptide 37-3 提交 2016-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5 , 16% w v Polyethylene glycol 8000
分辨率 1.80 Å R-free 0.222
5GSD Crystal structure of LMP2 peptide from EBV in complex with HLA-A*11:01 提交 2016-08-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.2 M Ammonium acetate, 20% PEG4000
分辨率 2.30 Å R-free 0.273
5GSR Mouse MHC class I H-2Kd with a MERS-CoV-derived peptide I5A 提交 2016-08-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 20–119（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium HEPES 7.5, 30 % v/v 2-Propanol
分辨率 2.20 Å R-free 0.231
5GSR Mouse MHC class I H-2Kd with a MERS-CoV-derived peptide I5A 提交 2016-08-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium HEPES 7.5, 30 % v/v 2-Propanol
分辨率 2.20 Å R-free 0.231
5GSV Mouse MHC class I H-2Kd with a MERS-CoV-derived peptide 142-5 提交 2016-08-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；291 K；0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 6000
分辨率 2.00 Å R-free 0.252
5GSX Mouse MHC class I H-2Kd with a MERS-CoV-derived peptide 142-2 提交 2016-08-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；291 K；0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 6000
分辨率 2.50 Å R-free 0.242
5GSX Mouse MHC class I H-2Kd with a MERS-CoV-derived peptide 142-2 提交 2016-08-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；291 K；0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 6000
分辨率 2.50 Å R-free 0.242
5HGA HLA*A2402 complex with HIV nef138 Y2F-8mer mutant epitope 提交 2016-01-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；291 K；0.1M MES monohydrate pH 6.5, 12% w/v Polyethylene glycol 20000
分辨率 2.20 Å R-free 0.250
5HGA HLA*A2402 complex with HIV nef138 Y2F-8mer mutant epitope 提交 2016-01-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；291 K；0.1M MES monohydrate pH 6.5, 12% w/v Polyethylene glycol 20000
分辨率 2.20 Å R-free 0.250
5HGB HLA*A2402 complexed with HIV nef138 8mer epitope 提交 2016-01-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.5, 12% w/v Polyethylene glycol 20000
分辨率 2.40 Å R-free 0.218
5HGB HLA*A2402 complexed with HIV nef138 8mer epitope 提交 2016-01-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.5, 12% w/v Polyethylene glycol 20000
分辨率 2.40 Å R-free 0.218
5HGB HLA*A2402 complexed with HIV nef138 8mer epitope 提交 2016-01-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.5, 12% w/v Polyethylene glycol 20000
分辨率 2.40 Å R-free 0.218
5HGB HLA*A2402 complexed with HIV nef138 8mer epitope 提交 2016-01-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.5, 12% w/v Polyethylene glycol 20000
分辨率 2.40 Å R-free 0.218
5HGD HLA*A2402 complexed with HIV nef138 Y2F mutant 10mer epitope 提交 2016-01-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.5, 12% w/v Polyethylene glycol 20000
分辨率 2.07 Å R-free 0.224
5HGD HLA*A2402 complexed with HIV nef138 Y2F mutant 10mer epitope 提交 2016-01-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.5, 12% w/v Polyethylene glycol 20000
分辨率 2.07 Å R-free 0.224
5HGH HLA*A2402 complexed with HIV nef138 10mer epitope 提交 2016-01-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.5, 12% w/v Polyethylene glycol 20000
分辨率 2.39 Å R-free 0.222
5HHM Crystal Structure of the JM22 TCR in complex with HLA-A*0201 in complex with M1-F5L 提交 2016-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；50mM Tris-HCl, 70mM NaCl, 16%PEG10K, 14% glycerol
分辨率 2.50 Å R-free 0.289
5HHM Crystal Structure of the JM22 TCR in complex with HLA-A*0201 in complex with M1-F5L 提交 2016-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；50mM Tris-HCl, 70mM NaCl, 16%PEG10K, 14% glycerol
分辨率 2.50 Å R-free 0.289
5HHN Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with M1-F5L 提交 2016-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；18-22% PEG 3350, Na citrate pH 6.5, 0.1M MgCl2
分辨率 2.03 Å R-free 0.215
5HHO Crystal Structure of the JM22 TCR in complex with HLA-A*0201 in complex with M1-G4E 提交 2016-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；50mM Tris-HCl, 70mM NaCl, 16%PEG10K, 14% glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.279
5HHP Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with M1-G4E 提交 2016-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；18-22% PEG 3350, Na citrate pH 6.5, 0.1M MgCl2
分辨率 1.90 Å R-free 0.209
5HHQ Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with M1-L3W 提交 2016-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；18-22% PEG 3350, Na citrate pH 6.5, 0.1M MgCl2
分辨率 2.10 Å R-free 0.227
5HYJ 1E6 TCR in Complex with HLA-A02 carrying AQWGPDPAAA 提交 2016-02-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.2M sodium citrate, 0.1M BIS TRIS propane pH6.5, 20% PEG 3350
分辨率 3.06 Å R-free 0.293
5HYJ 1E6 TCR in Complex with HLA-A02 carrying AQWGPDPAAA 提交 2016-02-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.2M sodium citrate, 0.1M BIS TRIS propane pH6.5, 20% PEG 3350
分辨率 3.06 Å R-free 0.293
5IB1 Crystal structure of HLA-B*27:05 complexed with the self-peptide pVIPR measured at 295 K 提交 2016-02-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M Tris HCl, 16% (w/v) PEG 8000
分辨率 1.91 Å R-free 0.192
5IB2 Crystal structure of HLA-B*27:05 complexed with the self-peptide pVIPR 提交 2016-02-22 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K
分辨率 1.44 Å R-free 0.161
5IB3 Crystal structure of HLA-B*27:05 complexed with the self-peptide pVIPR and Copper 提交 2016-02-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M Tris HCl, 16% (w/v) PEG 8000
分辨率 1.91 Å R-free 0.204
5IB4 Crystal structure of HLA-B*27:05 complexed with the self-peptide pVIPR and Nickel 提交 2016-02-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NI NICKEL (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M Tris HCl, 16% (w/v) PEG 8000
分辨率 1.95 Å R-free 0.202
5IB5 Crystal structure of HLA-B*27:09 complexed with the self-peptide pVIPR and Copper 提交 2016-02-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M Tris HCl, 16% (w/v) PEG 8000
分辨率 2.49 Å R-free 0.272
5IB5 Crystal structure of HLA-B*27:09 complexed with the self-peptide pVIPR and Copper 提交 2016-02-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M Tris HCl, 16% (w/v) PEG 8000
分辨率 2.49 Å R-free 0.272
5IEH Structure of HLA-B*40:02 in complex with the phosphorylated endogenous peptide REF(p)SKEPEL 提交 2016-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；150 mM Tris 8.0, 20% PEG5K, 8% ethylene glycol
分辨率 1.50 Å R-free 0.183
5IEK Structure of HLA-B*40:02 in complex with the endogenous peptide REFSKEPEL 提交 2016-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；150 mM Tris 8.5, 23% PEG8K, 70 mM potassium thiocyanate
分辨率 1.80 Å R-free 0.188
5IM7 Crystal structure of HLA-B5801, a protective HLA allele for HIV-1 infection 提交 2016-03-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M MES pH 6.5, 15% PEG4K, 20% 2-proponal
分辨率 2.50 Å R-free 0.233
5IM7 Crystal structure of HLA-B5801, a protective HLA allele for HIV-1 infection 提交 2016-03-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M MES pH 6.5, 15% PEG4K, 20% 2-proponal
分辨率 2.50 Å R-free 0.233
5INC Crystal structure of HLA-B5801, a protective HLA allele for HIV-1 infection 提交 2016-03-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；291
分辨率 2.88 Å R-free 0.248
5INC Crystal structure of HLA-B5801, a protective HLA allele for HIV-1 infection 提交 2016-03-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；291
分辨率 2.88 Å R-free 0.248
5IND Crystal structure of HLA-B5801, a protective HLA allele for HIV-1 infection 提交 2016-03-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M MES pH 6.5, 15% PEG4K, 20% 2-proponal
分辨率 2.13 Å R-free 0.229
5IND Crystal structure of HLA-B5801, a protective HLA allele for HIV-1 infection 提交 2016-03-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M MES pH 6.5, 15% PEG4K, 20% 2-proponal
分辨率 2.13 Å R-free 0.229
5IRO Crystal structure of a complex between the Human adenovirus type 4 E3-19K protein and MHC class molecule HLA-A2/TAX 提交 2016-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；291 K；1.5M (NH4)2SO4,0.1M Bis-Tris pH6.5, 0.1MNaCI
分辨率 2.64 Å R-free 0.288
5IRO Crystal structure of a complex between the Human adenovirus type 4 E3-19K protein and MHC class molecule HLA-A2/TAX 提交 2016-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；291 K；1.5M (NH4)2SO4,0.1M Bis-Tris pH6.5, 0.1MNaCI
分辨率 2.64 Å R-free 0.288
5IRO Crystal structure of a complex between the Human adenovirus type 4 E3-19K protein and MHC class molecule HLA-A2/TAX 提交 2016-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；291 K；1.5M (NH4)2SO4,0.1M Bis-Tris pH6.5, 0.1MNaCI
分辨率 2.64 Å R-free 0.288
5IRO Crystal structure of a complex between the Human adenovirus type 4 E3-19K protein and MHC class molecule HLA-A2/TAX 提交 2016-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 O 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；291 K；1.5M (NH4)2SO4,0.1M Bis-Tris pH6.5, 0.1MNaCI
分辨率 2.64 Å R-free 0.288
5IRO Crystal structure of a complex between the Human adenovirus type 4 E3-19K protein and MHC class molecule HLA-A2/TAX 提交 2016-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 S 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；291 K；1.5M (NH4)2SO4,0.1M Bis-Tris pH6.5, 0.1MNaCI
分辨率 2.64 Å R-free 0.288
5IRO Crystal structure of a complex between the Human adenovirus type 4 E3-19K protein and MHC class molecule HLA-A2/TAX 提交 2016-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 W 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；291 K；1.5M (NH4)2SO4,0.1M Bis-Tris pH6.5, 0.1MNaCI
分辨率 2.64 Å R-free 0.288
5ISZ Crystal structure of LS01-TCR/M1-HLA-A*02 complex 提交 2016-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 22–119（98 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；14% (w/v) PEG 4000, 100 mM Na-HEPES pH 7.0, 200 mM ammonium sulfate
分辨率 2.06 Å R-free 0.200
5IUE Human leukocyte antigen F (HLA-F) presents peptides and regulates immunity through interactions with NK-cell receptors 提交 2016-03-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 19–119（101 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 10000, tris-HCl
分辨率 2.62 Å R-free 0.241
5IUE Human leukocyte antigen F (HLA-F) presents peptides and regulates immunity through interactions with NK-cell receptors 提交 2016-03-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 19–119（101 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 10000, tris-HCl
分辨率 2.62 Å R-free 0.241
5IUE Human leukocyte antigen F (HLA-F) presents peptides and regulates immunity through interactions with NK-cell receptors 提交 2016-03-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 19–119（101 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 10000, tris-HCl
分辨率 2.62 Å R-free 0.241
5IUE Human leukocyte antigen F (HLA-F) presents peptides and regulates immunity through interactions with NK-cell receptors 提交 2016-03-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 19–119（101 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 10000, tris-HCl
分辨率 2.62 Å R-free 0.241
5J1A Antigen presenting molecule 提交 2016-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–119（119 aa）
未记录 6F8 3-[(8Z,11Z)-pentadeca-8,11-dien-1-yl]benzene-1,2-diol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20-25% PEG 1500 / 10% MMT buffer pH 5-6
分辨率 1.86 Å R-free 0.217
5JHD Crystal structure of LS10-TCR/M1-HLA-A*02 complex 提交 2016-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDT {[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；294 K；10%(W/V) PEG8000, 100mM Tris-Cl, 200mM Magnesium chloirde
分辨率 2.46 Å R-free 0.223
5JHD Crystal structure of LS10-TCR/M1-HLA-A*02 complex 提交 2016-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 EDT {[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；294 K；10%(W/V) PEG8000, 100mM Tris-Cl, 200mM Magnesium chloirde
分辨率 2.46 Å R-free 0.223
5JZI Crystal structure of 1406 TCR bound to HLA-A2 with HCV 1406-1415 antigen peptide 提交 2016-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；298 K；13% PEG 3350, 0.1M Sodium Cacodylate, 0.2m Ammonium Sulfate, 3% w/v 1,5-Diaminopentane dihydrochloride
分辨率 2.50 Å R-free 0.232
5JZI Crystal structure of 1406 TCR bound to HLA-A2 with HCV 1406-1415 antigen peptide 提交 2016-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；298 K；13% PEG 3350, 0.1M Sodium Cacodylate, 0.2m Ammonium Sulfate, 3% w/v 1,5-Diaminopentane dihydrochloride
分辨率 2.50 Å R-free 0.232
5KNM Human leukocyte antigen F (HLA-F) presents peptides and regulates immunity through interactions with NK-cell receptors 提交 2016-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP rrsidues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；27% PEG 550 MME .1 M Tris-HCl 300 mM NaCl
分辨率 3.30 Å R-free 0.326
5L2J Crystal Structure of human CD1b in complex with C36-GMM 提交 2016-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–118（98 aa）
未记录 6UL TETRACOSYL PALMITATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ACT ACETATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 70E 6-O-[(2R,3R)-3-hydroxy-2-tetradecyldocosanoyl]-alpha-L-idopyranose × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；20-30 PEG 4000, 0.2M NaI, 2% EG
分辨率 1.65 Å R-free 0.199
5L2K Crystal structure of GEM42 TCR-CD1b-GMM complex 提交 2016-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–118（98 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 SO4 SULFATE ION × 5 CL CHLORIDE ION × 4 NA SODIUM ION × 2 6UL TETRACOSYL PALMITATE × 1 CS CESIUM ION × 1 70E 6-O-[(2R,3R)-3-hydroxy-2-tetradecyldocosanoyl]-alpha-L-idopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；1.5-2M NH4SO4, 0.1M Tris-HCl pH8.5, 10mM MgCl2, 10mM CeCl2
分辨率 3.20 Å R-free 0.239
5L2K Crystal structure of GEM42 TCR-CD1b-GMM complex 提交 2016-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 21–118（98 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 SO4 SULFATE ION × 20 CL CHLORIDE ION × 16 NA SODIUM ION × 8 6UL TETRACOSYL PALMITATE × 4 CS CESIUM ION × 4 70E 6-O-[(2R,3R)-3-hydroxy-2-tetradecyldocosanoyl]-alpha-L-idopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；1.5-2M NH4SO4, 0.1M Tris-HCl pH8.5, 10mM MgCl2, 10mM CeCl2
分辨率 3.20 Å R-free 0.239
5MEN Human Leukocyte Antigen A02 presenting ILAKFLHWL, in complex with cognate T-Cell Receptor 提交 2016-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M ammonium sulphate, 0.1M HEPES pH7, 20% PEG 8000
分辨率 2.81 Å R-free 0.272
5MEO Human Leukocyte Antigen presenting ILGKFLHRL 提交 2016-11-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M ammonium sulphate, 0.1 M Tris pH 7.5, 25% PEG 8000
分辨率 1.77 Å R-free 0.214
5MEP Human Leukocyte Antigen A02 presenting ILGKFLHWL 提交 2016-11-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M ammonium sulphate, 0.1M MES pH7, 15% PEG 8000
分辨率 2.71 Å R-free 0.239
5MEP Human Leukocyte Antigen A02 presenting ILGKFLHWL 提交 2016-11-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M ammonium sulphate, 0.1M MES pH7, 15% PEG 8000
分辨率 2.71 Å R-free 0.239
5MEQ Human Leukocyte Antigen A02 presenting ILAKFLHTL 提交 2016-11-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M ammonium sulphate, 0.1M HEPES pH7, 20% PEG 8000
分辨率 2.27 Å R-free 0.264
5MER Human Leukocyte Antigen A02 presenting ILAKFLHEL 提交 2016-11-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 CA CALCIUM ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M ammonium sulphate, 0.1M MES pH7, 25% PEG 8000
分辨率 1.88 Å R-free 0.224
5MER Human Leukocyte Antigen A02 presenting ILAKFLHEL 提交 2016-11-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 CA CALCIUM ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 7 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M ammonium sulphate, 0.1M MES pH7, 25% PEG 8000
分辨率 1.88 Å R-free 0.224
5N1Y HLA-A02 carrying MVWGPDPLYV 提交 2017-02-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M ammonium chloride, 0.1M TRIS pH8, 20% PEG 6000
分辨率 1.39 Å R-free 0.201
5N6B Human Leukocyte Antigen Class I A02 Carrying LLWNPGMAV 提交 2017-02-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M ammonium sulphate, 0.1M HEPES pH7, 20% PEG 4000
分辨率 1.71 Å R-free 0.214
5N6B Human Leukocyte Antigen Class I A02 Carrying LLWNPGMAV 提交 2017-02-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M ammonium sulphate, 0.1M HEPES pH7, 20% PEG 4000
分辨率 1.71 Å R-free 0.214
5NHT human 199.54-16 TCR in complex with Melan-A/MART-1 (26-35) peptide and HLA-A2 提交 2017-03-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa） 片段：UNP Residues 25-300
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 1 K POTASSIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG3350 8 %, K Thiocyanate 0.1 M, Bis-Tris propane pH 6.5 0.1 M, protein concentration 3.5 mg/ml
分辨率 3.20 Å R-free 0.299
5NME 868 TCR in complex with HLA A02 presenting SLYNTVATL 提交 2017-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate, pH 6.0, 15% PEG 4000, 0.2 M Ammonium Sulphate
分辨率 2.94 Å R-free 0.263
5NME 868 TCR in complex with HLA A02 presenting SLYNTVATL 提交 2017-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate, pH 6.0, 15% PEG 4000, 0.2 M Ammonium Sulphate
分辨率 2.94 Å R-free 0.263
5NMF 868 TCR in complex with HLA A02 presenting SLYNTIATL 提交 2017-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate, pH 6.0, 15% PEG 4000, 0.2 M Ammonium Sulphate
分辨率 2.89 Å R-free 0.255
5NMF 868 TCR in complex with HLA A02 presenting SLYNTIATL 提交 2017-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate, pH 6.0, 15% PEG 4000, 0.2 M Ammonium Sulphate
分辨率 2.89 Å R-free 0.255
5NMG 868 TCR in complex with HLA A02 presenting SLYFNTIAVL 提交 2017-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate, pH 5.5, 15% PEG 4000, 0.2 M Ammonium Sulphate
分辨率 2.75 Å R-free 0.254
5NMG 868 TCR in complex with HLA A02 presenting SLYFNTIAVL 提交 2017-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate, pH 5.5, 15% PEG 4000, 0.2 M Ammonium Sulphate
分辨率 2.75 Å R-free 0.254
5NMH HLA A02 presenting SLYNTIATL 提交 2017-04-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate, pH 6.0, 25% PEG 4000, 0.2 M Ammonium Sulphate
分辨率 1.55 Å R-free 0.196
5NMK HLA A02 presenting SLFNTIAVL 提交 2017-04-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate, pH 6.0, 25% PEG 4000, 0.2 M Ammonium Sulphate
分辨率 1.66 Å R-free 0.210
5NQ1 Porcine (Sus scrofa) Major Histocompatibility Complex, class I, with human beta2 micro globulin, presenting DFEREGYSL 提交 2017-04-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；PACT screen, condition D02: 0.1M MMT Buffer, pH 5.0, 25% PEG1500
分辨率 2.14 Å R-free 0.283
5NQ1 Porcine (Sus scrofa) Major Histocompatibility Complex, class I, with human beta2 micro globulin, presenting DFEREGYSL 提交 2017-04-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；PACT screen, condition D02: 0.1M MMT Buffer, pH 5.0, 25% PEG1500
分辨率 2.14 Å R-free 0.283
5NQ3 'Porcine (Sus scrofa) Major Histocompatibility Complex, class I, with human beta2 micro globulin, presenting EFEDLTFLA 提交 2017-04-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；JBS screen, condition A07: 30% MPD, 100 mM Na Citrate, pH 5.6, 200 mM Ammonium Acetate
分辨率 1.57 Å R-free 0.262
5NQ3 'Porcine (Sus scrofa) Major Histocompatibility Complex, class I, with human beta2 micro globulin, presenting EFEDLTFLA 提交 2017-04-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；JBS screen, condition A07: 30% MPD, 100 mM Na Citrate, pH 5.6, 200 mM Ammonium Acetate
分辨率 1.57 Å R-free 0.262
5NQK human 199.16 TCR in complex with Melan-A/MART-1 (26-35) peptide and HLA-A2 提交 2017-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG3350 11%, bis-tris propane pH 6.5 0.1M, KNa tartrate 0.1M
分辨率 3.25 Å R-free 0.316
5OPI Crystal structure of the TAPBPR-MHC I peptide editing complex 提交 2017-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；19% PEG400, 5% poly-gamma-glutamic acid, and 450 mM sodium cacodylate pH 6.5
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
5SWQ Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with NA231, an influenza epitope 提交 2016-08-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20%PEG6K, 0.1M Na-Citrate pH6.5, 0.2M NaCl
分辨率 2.00 Å R-free 0.258
5T6W HLA-B*57:01 presenting SSTRGISQLW 提交 2016-09-01 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；12 -20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 1.90 Å R-free 0.263
5T6X HLA-B*57:01 presenting TSTTSVASSW 提交 2016-09-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP resiudes 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；12 -20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 1.69 Å R-free 0.244
5T6Y HLA-B*57:01 presenting TSTFEDVKILAF 提交 2016-09-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；12 -20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 1.76 Å R-free 0.219
5T6Z KIR3DL1 in complex with HLA-B*57:01-TW10 提交 2016-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；16% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0 and 0.1M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.00 Å R-free 0.240
5T70 KIR3DL1 in complex with HLA-B*57:01 presenting TSNLQEQIGW 提交 2016-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；16% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0 and 0.1M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.10 Å R-free 0.225
5TEZ TCR F50 recgonizing M1-HLA-A2 提交 2016-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 20–119（100 aa） 片段：UNP residues 20-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；PEG 3350, 0.1 M imidazole (pH 8.0), and 0.2 M sodium malonate
分辨率 1.70 Å R-free 0.224
5TRZ Crystal structure of MHC-I H2-KD complexed with peptides of Mycobacterial tuberculosis (YQSGLSIVM) 提交 2016-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14% PEG 4000, 0.1M MES buffer, 5% MPD
分辨率 2.25 Å R-free 0.198
5TS1 Crystal structure of MHC-I H2-KD complexed with peptides of Mycobacterial tuberculosis (YYQSGLSIV) 提交 2016-10-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14% PEG 4000, 0.1M MES buffer, 5% MPD
分辨率 2.30 Å R-free 0.224
5TS1 Crystal structure of MHC-I H2-KD complexed with peptides of Mycobacterial tuberculosis (YYQSGLSIV) 提交 2016-10-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14% PEG 4000, 0.1M MES buffer, 5% MPD
分辨率 2.30 Å R-free 0.224
5TS1 Crystal structure of MHC-I H2-KD complexed with peptides of Mycobacterial tuberculosis (YYQSGLSIV) 提交 2016-10-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14% PEG 4000, 0.1M MES buffer, 5% MPD
分辨率 2.30 Å R-free 0.224
5TS1 Crystal structure of MHC-I H2-KD complexed with peptides of Mycobacterial tuberculosis (YYQSGLSIV) 提交 2016-10-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14% PEG 4000, 0.1M MES buffer, 5% MPD
分辨率 2.30 Å R-free 0.224
5TXS Crystal structure of an anaplastic lymphoma kinase-derived neuroblastoma tumor antigen bound to the Human Major Histocompatibility Complex Class I molecule HLA-B*1501 提交 2016-11-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 M HEPES (6.5) 20% PEG 6000
分辨率 1.70 Å R-free 0.196
5U16 Structure of human MR1-2-OH-1-NA in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2016-11-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 7WO 2-hydroxynaphthalene-1-carbaldehyde × 1 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 2.00 Å R-free 0.219
5U16 Structure of human MR1-2-OH-1-NA in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2016-11-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 7WO 2-hydroxynaphthalene-1-carbaldehyde × 1 GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 2.00 Å R-free 0.219
5U17 Structure of human MR1-DA-6-FP in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2016-11-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 7WP 2,4-diaminopteridine-6-carbaldehyde × 1 GOL GLYCEROL × 4 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 2.15 Å R-free 0.224
5U17 Structure of human MR1-DA-6-FP in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2016-11-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 7WP 2,4-diaminopteridine-6-carbaldehyde × 1 GOL GLYCEROL × 5 ACT ACETATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 2.15 Å R-free 0.224
5U1R Structure of human MR1-diclofenac in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2016-11-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NA SODIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 DIF 2-[2,6-DICHLOROPHENYL)AMINO]BENZENEACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 2.70 Å R-free 0.237
5U1R Structure of human MR1-diclofenac in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2016-11-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 ACT ACETATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 DIF 2-[2,6-DICHLOROPHENYL)AMINO]BENZENEACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 2.70 Å R-free 0.237
5U2V Structure of human MR1-HMB in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2016-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 PRO PROLINE × 1 7WQ 2-hydroxy-5-methoxybenzaldehyde × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 2.20 Å R-free 0.221
5U2V Structure of human MR1-HMB in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2016-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 7WQ 2-hydroxy-5-methoxybenzaldehyde × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 2.20 Å R-free 0.221
5U6Q Structure of human MR1-3-F-SA in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2016-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 7ZS 3-methanoyl-2-oxidanyl-benzoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 1.90 Å R-free 0.222
5U6Q Structure of human MR1-3-F-SA in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2016-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 7ZS 3-methanoyl-2-oxidanyl-benzoic acid × 1 ACT ACETATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 1.90 Å R-free 0.222
5U72 Structure of human MR1-5OH-DCF in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2016-12-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 ACT ACETATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 2.50 Å R-free 0.231
5U72 Structure of human MR1-5OH-DCF in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2016-12-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 ACT ACETATE ION × 1 7ZV 5-hydroxydiclofenac × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；BTP, PEG 3350, NaAc
分辨率 2.50 Å R-free 0.231
5U98 The crystal structure of a self-peptide complexed to Abacavir and HLA-B*57:01 提交 2016-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 1KX {(1S,4R)-4-[2-amino-6-(cyclopropylamino)-9H-purin-9-yl]cyclopent-2-en-1-yl}methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；0.1M NACACODYLATE, 0.1MNAACETATE, 25% PEG 8,000, 15% GLYCEROL
分辨率 2.00 Å R-free 0.216
5U98 The crystal structure of a self-peptide complexed to Abacavir and HLA-B*57:01 提交 2016-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 1KX {(1S,4R)-4-[2-amino-6-(cyclopropylamino)-9H-purin-9-yl]cyclopent-2-en-1-yl}methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；0.1M NACACODYLATE, 0.1MNAACETATE, 25% PEG 8,000, 15% GLYCEROL
分辨率 2.00 Å R-free 0.216
5V5L Crystal structure of HLA-B*5801 complex with HIV-1 gag derived peptide TW10 提交 2017-03-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；290 K；15-20% w/v PEG 4000, 20% w/v 2-propanol, 0.1 M MES pH 6.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.214
5V5L Crystal structure of HLA-B*5801 complex with HIV-1 gag derived peptide TW10 提交 2017-03-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；290 K；15-20% w/v PEG 4000, 20% w/v 2-propanol, 0.1 M MES pH 6.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.214
5V5M Crystal structure of HLA-B*5701 complex with HIV-1 gag derived peptide TW10 提交 2017-03-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；290 K；15-20% w/v PEG 4000, 20% w/v 2-propanol, 0.1 M MES pH 6.5
分辨率 2.88 Å R-free 0.244
5V5M Crystal structure of HLA-B*5701 complex with HIV-1 gag derived peptide TW10 提交 2017-03-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；290 K；15-20% w/v PEG 4000, 20% w/v 2-propanol, 0.1 M MES pH 6.5
分辨率 2.88 Å R-free 0.244
5VGD Crystal Structure of HLA-C*0501 in complex with SAE 提交 2017-04-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；1.8M NaMalonate pH7
分辨率 2.32 Å R-free 0.297
5VGE Crystal structure of HLA-C*07:02 in complex with RYR peptide 提交 2017-04-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M HEPES pH 8.5 2 mM ZnSO4 28 % jeffamine ED-2001 (Hampton)
分辨率 2.60 Å R-free 0.221
5VUD HLA-B*57:01 presenting LSSPVTKSW 提交 2017-05-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；12 -20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 2.00 Å R-free 0.209
5VUE HLA-B*57:01 presenting LTVQVARVW 提交 2017-05-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；12 -20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 1.80 Å R-free 0.207
5VUF HLA-B*57:01 presenting LTVQVARVY 提交 2017-05-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；12 -20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 1.90 Å R-free 0.216
5VVP HLA-B*57:03 presenting LSSPVTKSW 提交 2017-05-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；12 -20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 2.00 Å R-free 0.202
5VWD HLA-B*57:03 presenting LTVQVARVW 提交 2017-05-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；12 -20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 1.80 Å R-free 0.208
5VWF HLA-B*58:03 presenting LTVQVARVY 提交 2017-05-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；12 -20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 1.80 Å R-free 0.196
5VWH HLA-B*58:01 presenting LSSPVTKSW 提交 2017-05-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；12 -20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 1.65 Å R-free 0.199
5VWJ HLA-B*58:01 presenting LTVQVARVW 提交 2017-05-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；12 -20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 2.00 Å R-free 0.214
5VZ5 Crystal structure of an anaplastic lymphoma kinase-derived neuroblastoma tumor antigen bound to the Human Major Histocompatibility Complex Class I molecule HLA-B*1501 提交 2017-05-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 7 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；295 K；0.1M Hepes (7.5) 2M Ammonium sulfate 2% PEG400
分辨率 2.59 Å R-free 0.265
5W1V Structure of the HLA-E-VMAPRTLIL/GF4 TCR complex 提交 2017-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M K, Na tartrate, 20% PEG 3350
分辨率 3.31 Å R-free 0.268
5W1V Structure of the HLA-E-VMAPRTLIL/GF4 TCR complex 提交 2017-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M K, Na tartrate, 20% PEG 3350
分辨率 3.31 Å R-free 0.268
5W1V Structure of the HLA-E-VMAPRTLIL/GF4 TCR complex 提交 2017-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M K, Na tartrate, 20% PEG 3350
分辨率 3.31 Å R-free 0.268
5W1V Structure of the HLA-E-VMAPRTLIL/GF4 TCR complex 提交 2017-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M K, Na tartrate, 20% PEG 3350
分辨率 3.31 Å R-free 0.268
5W1W Structure of the HLA-E-VMAPRTLVL/GF4 TCR complex 提交 2017-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 m Na.K tartrate, 20% PEG 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.263
5W1W Structure of the HLA-E-VMAPRTLVL/GF4 TCR complex 提交 2017-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 m Na.K tartrate, 20% PEG 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.263
5W1W Structure of the HLA-E-VMAPRTLVL/GF4 TCR complex 提交 2017-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 m Na.K tartrate, 20% PEG 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.263
5W1W Structure of the HLA-E-VMAPRTLVL/GF4 TCR complex 提交 2017-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 m Na.K tartrate, 20% PEG 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.263
5W67 HLA-C*06:02 presenting VRSRR(ABA)LRL 提交 2017-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；0.1M Na acetate pH 4.5 and 1.8 M ammonium citrate
分辨率 2.30 Å R-free 0.235
5W69 HLA-C*06:02 presenting ARFNDLRFV 提交 2017-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M Na acetate and 20 % PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.223
5W69 HLA-C*06:02 presenting ARFNDLRFV 提交 2017-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M Na acetate and 20 % PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.223
5W69 HLA-C*06:02 presenting ARFNDLRFV 提交 2017-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M Na acetate and 20 % PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.223
5W69 HLA-C*06:02 presenting ARFNDLRFV 提交 2017-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M Na acetate and 20 % PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.223
5W6A HLA-C*06:02 presenting ARTELYRSL 提交 2017-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis-Tris propane pH 7.0, 0.1 M Na fluoride and 20 % PEG 8000
分辨率 1.74 Å R-free 0.201
5W6A HLA-C*06:02 presenting ARTELYRSL 提交 2017-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis-Tris propane pH 7.0, 0.1 M Na fluoride and 20 % PEG 8000
分辨率 1.74 Å R-free 0.201
5WER Crystal Structure of TAPBPR and H2-Dd complex 提交 2017-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；291 K；1.0 M ammonium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.8, 0.2 M NaCl, 0.15-0.20 M sodium citrate, 2%-5% PEG 400
分辨率 3.41 Å R-free 0.269
5WER Crystal Structure of TAPBPR and H2-Dd complex 提交 2017-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；291 K；1.0 M ammonium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.8, 0.2 M NaCl, 0.15-0.20 M sodium citrate, 2%-5% PEG 400
分辨率 3.41 Å R-free 0.269
5WER Crystal Structure of TAPBPR and H2-Dd complex 提交 2017-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；291 K；1.0 M ammonium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.8, 0.2 M NaCl, 0.15-0.20 M sodium citrate, 2%-5% PEG 400
分辨率 3.41 Å R-free 0.269
5WER Crystal Structure of TAPBPR and H2-Dd complex 提交 2017-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；291 K；1.0 M ammonium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.8, 0.2 M NaCl, 0.15-0.20 M sodium citrate, 2%-5% PEG 400
分辨率 3.41 Å R-free 0.269
5WHK Crystal structure of Fab fragment of antibody DX-2507 bound to FcRn-B2M 提交 2017-07-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–119（119 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；DX-2507 Fab FcRn B2M complex at 6.6 mg/mL at 70 uM against an optimization screen against JCSG+ A7 18% PEG 8000, 0.1 M CHES pH 9.8 with seeding from an earlier crystal obtained under similar conditions, supplemented with 20% ethylene glycol as cro-protectant
分辨率 2.50 Å R-free 0.225
5WJL Crystal Structure of HLA-A*11:01 with GTS1 peptide 提交 2017-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；1.4-1.8M NH4SO4, 0.1M Na-cacodylate pH6.5, 200mM NaCl, 2% Ethylen glycol
分辨率 3.15 Å R-free 0.231
5WJL Crystal Structure of HLA-A*11:01 with GTS1 peptide 提交 2017-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；1.4-1.8M NH4SO4, 0.1M Na-cacodylate pH6.5, 200mM NaCl, 2% Ethylen glycol
分辨率 3.15 Å R-free 0.231
5WJL Crystal Structure of HLA-A*11:01 with GTS1 peptide 提交 2017-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；1.4-1.8M NH4SO4, 0.1M Na-cacodylate pH6.5, 200mM NaCl, 2% Ethylen glycol
分辨率 3.15 Å R-free 0.231
5WJN Crystal Structure of HLA-A*11:01-GTS3 提交 2017-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；1.4-1.8M NH4SO4, 0.1M Na-cacodylate pH6.5, 200mM NaCl, 2% Ethylen glycol
分辨率 2.85 Å R-free 0.230
5WJN Crystal Structure of HLA-A*11:01-GTS3 提交 2017-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；1.4-1.8M NH4SO4, 0.1M Na-cacodylate pH6.5, 200mM NaCl, 2% Ethylen glycol
分辨率 2.85 Å R-free 0.230
5WJN Crystal Structure of HLA-A*11:01-GTS3 提交 2017-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；1.4-1.8M NH4SO4, 0.1M Na-cacodylate pH6.5, 200mM NaCl, 2% Ethylen glycol
分辨率 2.85 Å R-free 0.230
5WKE Crystal Structure of Human CD1b in Complex with PS 提交 2017-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CUY tetracosyl octadecanoate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CL CHLORIDE ION × 7 P50 (19S,22S,25R)-25-amino-22-hydroxy-16,22,26-trioxo-17,21,23-trioxa-22lambda~5~-phosphahexacosan-19-yl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27% PEG 3350, 0.2M Sodium Malonate
分辨率 1.69 Å R-free 0.239
5WKF D30 TCR in complex with HLA-A*11:01-GTS1 提交 2017-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；17%PEG8000, 2% Ethylen glycol, 0.1M HEPES pH7.5
分辨率 2.95 Å R-free 0.253
5WKF D30 TCR in complex with HLA-A*11:01-GTS1 提交 2017-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；17%PEG8000, 2% Ethylen glycol, 0.1M HEPES pH7.5
分辨率 2.95 Å R-free 0.253
5WKG Crystal Structure of Human CD1b in Complex with PA 提交 2017-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 D21 (2R)-1-(hexadecanoyloxy)-3-(phosphonooxy)propan-2-yl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 CUY tetracosyl octadecanoate × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CL CHLORIDE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 IOD IODIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27% PET 3350, 0.2M Sodium malonate
分辨率 2.06 Å R-free 0.224
5WKH D30 TCR in complex with HLA-A*11:01-GTS3 提交 2017-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；17%PEG8000, 2% Ethylen glycol, 0.1M HEPES pH7.5
分辨率 3.20 Å R-free 0.246
5WKH D30 TCR in complex with HLA-A*11:01-GTS3 提交 2017-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；17%PEG8000, 2% Ethylen glycol, 0.1M HEPES pH7.5
分辨率 3.20 Å R-free 0.246
5WKI Crystal structure of PG90 TCR-CD1b-PG complex 提交 2017-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CUY tetracosyl octadecanoate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 NA SODIUM ION × 2 D3D (19S,22R,25R)-22,25,26-trihydroxy-16,22-dioxo-17,21,23-trioxa-22lambda~5~-phosphahexacosan-19-yl (9E)-octadec-9-enoate × 1 ACT ACETATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；293 K；12% PEG8K, 0.2M Zinc Acetate, 0.1M MES pH 6.2
分辨率 2.75 Å R-free 0.252
5WL1 Crystal Structure of Human CD1b in Complex with PG 提交 2017-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CUY tetracosyl octadecanoate × 1 IOD IODIDE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 D3D (19S,22R,25R)-22,25,26-trihydroxy-16,22-dioxo-17,21,23-trioxa-22lambda~5~-phosphahexacosan-19-yl (9E)-octadec-9-enoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；26% PEG 3350, 0.2M Sodium Malonate
分辨率 1.38 Å R-free 0.206
5WMN Crystal Structure of HLA-B7 in complex with SPI, an influenza peptide 提交 2017-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；18-24%PEG4000, 0.2 NH4 Acetate, 0.1M Na-cacodylate pH 6.5
分辨率 1.82 Å R-free 0.222
5WMN Crystal Structure of HLA-B7 in complex with SPI, an influenza peptide 提交 2017-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；18-24%PEG4000, 0.2 NH4 Acetate, 0.1M Na-cacodylate pH 6.5
分辨率 1.82 Å R-free 0.222
5WMO Crystal Structure of HLA-B7 in complex with RPP, an EBV peptide 提交 2017-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；18-24%PEG4000, 0.2 NH4 Acetate, 0.1M Na-cacodylate pH 6.5
分辨率 1.62 Å R-free 0.200
5WMP Crystal Structure of HLA-B7 in complex with TPR, a CMV peptide 提交 2017-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 4 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；18-24%PEG4000, 0.2 NH4 Acetate, 0.1M Na-cacodylate pH 6.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.199
5WMQ Crystal Structure of HLA-B8 in complex with ELR, an Influenza A virus peptide 提交 2017-07-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；18-24%PEG4000, 0.2 NH4 Acetate, 0.1M Na-cacodylate pH 6.5
分辨率 1.40 Å R-free 0.216
5WMR Crystal Structure of HLA-B8 in complex with QIK, a CMV peptide 提交 2017-07-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；18-24%PEG4000, 0.2 NH4 Acetate, 0.1M Na-cacodylate pH 6.5
分辨率 1.58 Å R-free 0.228
5WSH Structure of HLA-A2 P130 提交 2016-12-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1mol/L bis-tris(pH6.5), 20%(wt/vol) polyethylene glycol 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.196
5WWI Crystal Structure of HLA-A*2402 in complex with avian influenza A(H7N9) virus-derived peptide H7-25 (data set 1) 提交 2017-01-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% w/v Polyethylene glycol 4000
分辨率 3.19 Å R-free 0.309
5WWJ Crystal Structure of HLA-A*2402 in complex with avian influenza A(H7N9) virus-derived peptide H7-25 (data set 1) 提交 2017-01-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Imidazole pH 7.0, 12% w/v Polyethylene glycol 20000
分辨率 2.29 Å R-free 0.210
5WWJ Crystal Structure of HLA-A*2402 in complex with avian influenza A(H7N9) virus-derived peptide H7-25 (data set 1) 提交 2017-01-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Imidazole pH 7.0, 12% w/v Polyethylene glycol 20000
分辨率 2.29 Å R-free 0.210
5WWU Crystal Structure of HLA-A*2402 in complex with 2009 pandemic influenza A(H1N1) virus and avian influenza A(H5N1) virus-derived peptide H1-25 提交 2017-01-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% w/v Polyethylene glycol 4000
分辨率 2.79 Å R-free 0.284
5WXC Crystal Structure of HLA-A*2402 in complex with avian influenza A(H7N9) virus-derived peptide H7-25 (data set 2) 提交 2017-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% w/v Polyethylene glycol 4000
分辨率 2.29 Å R-free 0.224
5WXC Crystal Structure of HLA-A*2402 in complex with avian influenza A(H7N9) virus-derived peptide H7-25 (data set 2) 提交 2017-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 20–119（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% w/v Polyethylene glycol 4000
分辨率 2.29 Å R-free 0.224
5WXD Crystal Structure of HLA-A*2402 in complex with avian influenza A(H7N9) virus-derived peptide H7-25 (data set 1) 提交 2017-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Imidazole pH 7.0, 12% w/v Polyethylene glycol 20000
分辨率 3.29 Å R-free 0.254
5XOS Crystal structure of HLA-B35 in complex with a pepetide antigen 提交 2017-05-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；0.1M MES monohydrate, pH 6.5, 12%(w/v) PEG20000
分辨率 1.70 Å R-free 0.184
5XOT Crystal structure of pHLA-B35 in complex with TU55 T cell receptor 提交 2017-05-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；5% v/v Tacsimate pH 7.0, 0.1 M HEPES, pH 7.3, 10% w/v polyethylene glycol monomethyl either 5000
分辨率 2.79 Å R-free 0.254
5XOV Crystal structure of peptide-HLA-A24 bound to S19-2 V-delta/V-beta TCR 提交 2017-05-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；5%(v/v) Tacsimate pH 7.0, 0.1M HEPES, pH 7.3, 10%(w/v) polyethylene glycol monomethyl either 5000
分辨率 2.68 Å R-free 0.245
5XOV Crystal structure of peptide-HLA-A24 bound to S19-2 V-delta/V-beta TCR 提交 2017-05-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；5%(v/v) Tacsimate pH 7.0, 0.1M HEPES, pH 7.3, 10%(w/v) polyethylene glycol monomethyl either 5000
分辨率 2.68 Å R-free 0.245
6AEE Crystal structure of the four Ig-like domains of LILRB1 complexed with HLA-G 提交 2018-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M imidazole malate, 15%(w/v) PEG4000, pH 6.0
分辨率 3.30 Å R-free 0.267
6AEE Crystal structure of the four Ig-like domains of LILRB1 complexed with HLA-G 提交 2018-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M imidazole malate, 15%(w/v) PEG4000, pH 6.0
分辨率 3.30 Å R-free 0.267
6AM5 Crystal structure of DMF5 TCR bound to HLA-A2 presenting synthetic peptide SMLGIGIVPV 提交 2017-08-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；13% PEG3350, 0.25 M magnesium chloride, 0.1 M Tris
分辨率 2.39 Å R-free 0.244
6AMT Human Class I MHC HLA-A2 in complex with synthetic peptide MMWDRGLGMM 提交 2017-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；298 K；25% PEG1000, 0.01% sodium azide, 0.1 M MES
分辨率 2.50 Å R-free 0.249
6AMT Human Class I MHC HLA-A2 in complex with synthetic peptide MMWDRGLGMM 提交 2017-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；298 K；25% PEG1000, 0.01% sodium azide, 0.1 M MES
分辨率 2.50 Å R-free 0.249
6AMU Crystal structure of DMF5 TCR bound to HLA-A2 presenting synthetic peptide MMWDRGLGMM 提交 2017-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；298 K；18% PEG3350, 0.25 M magnesium chloride, 0.1 M HEPES
分辨率 2.15 Å R-free 0.226
6APN HLA-A*0201 single chain trimer with HPV.16 E7 peptide LLMGTLGIV 提交 2017-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M MES, pH 6,5, 25% PEG 2000 MME
分辨率 2.22 Å R-free 0.260
6APN HLA-A*0201 single chain trimer with HPV.16 E7 peptide LLMGTLGIV 提交 2017-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M MES, pH 6,5, 25% PEG 2000 MME
分辨率 2.22 Å R-free 0.260
6AT5 Crystal structure of HLA-B*07:02 in complex with an NY-ESO-1 peptide 提交 2017-08-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2 M NaCl and 20 % PEG 3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.230
6AT9 Crystal structure of an anaplastic lymphoma kinase-derived neuroblastoma tumor antigen bound to the Human Major Histocompatibility Complex Class I molecule HLA-A*0101 提交 2017-08-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.18M MgCl2, 0.1M Na-HEPES(7.5),27%PEG400, 10%Glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.307
6AVF Crystal structure of the KFJ5 TCR-NY-ESO-1-HLA-B*07:02 complex 提交 2017-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 M 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 13-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M MIB pH 7.0 and 25 % (w/v) PEG 1500
分辨率 2.03 Å R-free 0.256
6AVG Crystal structure of the KFJ37 TCR-NY-ESO-1-HLA-B*07:02 complex 提交 2017-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 13–119（107 aa） 片段：UNP residues 13-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；0.1 M BTP pH 8.8, 0.2 M Na-Iodide, 14 % w/v PEG 3350 and 2 % w/v PEG 20000
分辨率 2.60 Å R-free 0.248
6AVG Crystal structure of the KFJ37 TCR-NY-ESO-1-HLA-B*07:02 complex 提交 2017-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 13–119（107 aa） 片段：UNP residues 13-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；0.1 M BTP pH 8.8, 0.2 M Na-Iodide, 14 % w/v PEG 3350 and 2 % w/v PEG 20000
分辨率 2.60 Å R-free 0.248
6BJ2 TCR589 in complex with HIV(Pol448-456)/HLA-B35 提交 2017-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 ZN ZINC ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；295 K；0.1 M Tris, pH 8.0, 20% PEG3350, 0.002 M zinc chloride
分辨率 3.35 Å R-free 0.276
6BJ3 TCR55 in complex with HIV(Pol448-456)/HLA-B35 提交 2017-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；295 K；PEG4000, 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.90 Å R-free 0.216
6BJ8 TCR55 in complex with Pep20/HLA-B35 提交 2017-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 27 PO4 PHOSPHATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；295 K；0.04 M potassium phosphate monobasic, 16% w/v PEG8000, 20% v/v glycerol
分辨率 1.75 Å R-free 0.183
6BXP Crystal Structure of HLA-B*57:01 with a modified HIV peptide RKV-Kyn 提交 2017-12-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；18%PEG4000, 0.2M NH4 Ac, 0.1M NaCitrate
分辨率 1.45 Å R-free 0.194
6BXQ Crystal Structure of HLA-B*57:01 with an HIV peptide RKV 提交 2017-12-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–119（99 aa） 片段：residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；18%PEG4000, 0.2M NH4 Ac, 0.1M NaCitrate
分辨率 1.58 Å R-free 0.203
6C09 Ternary crystal structure of the 3C8 TCR-CD1c-monoacylglycerol complex 提交 2017-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EKG (2R)-2,3-dihydroxypropyl hexadecanoate × 1 D10 DECANE × 2 K POTASSIUM ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；20% PEG 3350, 0.2M potassium thiocynate
分辨率 2.95 Å R-free 0.208
6C15 CD1c in complex with phosphatidylcholine 提交 2018-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 D12 DODECANE × 1 6PL (4S,7R)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；10% Dioxane; 1.6 M Ammonium sulfate; 10 mM MES, pH 6.5
分辨率 3.21 Å R-free 0.242
6C97 Crystal structure of FcRn at pH3 提交 2018-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3；289 K；APO FCRN CRYSTALS WERE PRODUCED BY SITTING DROP VAPOR DIFFUSION WITH AN EQUAL VOLUME COMBINATION OF THE PROTEIN COMPLEX, PROVIDED IN A PROTEIN SOLUTION CONTAINING 50MM HEPES PH 7.0 AND 75MM NACL, AND AN OPTIMIZATION SCREEN CONTAINING 0.1M CITRIC ACID/NAOH PH 3.01-3.09 AND 12-16% W/V PEG 6,000.
分辨率 2.00 Å R-free 0.210
6C97 Crystal structure of FcRn at pH3 提交 2018-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3；289 K；APO FCRN CRYSTALS WERE PRODUCED BY SITTING DROP VAPOR DIFFUSION WITH AN EQUAL VOLUME COMBINATION OF THE PROTEIN COMPLEX, PROVIDED IN A PROTEIN SOLUTION CONTAINING 50MM HEPES PH 7.0 AND 75MM NACL, AND AN OPTIMIZATION SCREEN CONTAINING 0.1M CITRIC ACID/NAOH PH 3.01-3.09 AND 12-16% W/V PEG 6,000.
分辨率 2.00 Å R-free 0.210
6C98 Crystal structure of FcRn bound to UCB-84 提交 2018-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CYS CYSTEINE × 1 ER7 1-[7-(3-fluorophenyl)-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-6-yl]ethan-1-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3；289 K；APO FCRN CRYSTALS WERE PRODUCED BY SITTING DROP VAPOR DIFFUSION WITH AN EQUAL VOLUME COMBINATION OF THE PROTEIN COMPLEX, PROVIDED IN A PROTEIN SOLUTION CONTAINING 50MM HEPES PH 7.0 AND 75MM NACL, AND AN OPTIMIZATION SCREEN CONTAINING 0.1M CITRIC ACID/NAOH PH 3.0 AND 20% W/V PEG 6,000. CRYSTALS OF FCRN WERE SOAKED FOR THREE DAYS IN BUFFER CONTAINING 0.1M CITRIC ACID/NAOH PH 3.0, 20% W/V PEG 6,000, AND 20% GLYCEROL AND 20MM UCB-84).
分辨率 1.85 Å R-free 0.213
6C98 Crystal structure of FcRn bound to UCB-84 提交 2018-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 CYS CYSTEINE × 1 ER7 1-[7-(3-fluorophenyl)-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-6-yl]ethan-1-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3；289 K；APO FCRN CRYSTALS WERE PRODUCED BY SITTING DROP VAPOR DIFFUSION WITH AN EQUAL VOLUME COMBINATION OF THE PROTEIN COMPLEX, PROVIDED IN A PROTEIN SOLUTION CONTAINING 50MM HEPES PH 7.0 AND 75MM NACL, AND AN OPTIMIZATION SCREEN CONTAINING 0.1M CITRIC ACID/NAOH PH 3.0 AND 20% W/V PEG 6,000. CRYSTALS OF FCRN WERE SOAKED FOR THREE DAYS IN BUFFER CONTAINING 0.1M CITRIC ACID/NAOH PH 3.0, 20% W/V PEG 6,000, AND 20% GLYCEROL AND 20MM UCB-84).
分辨率 1.85 Å R-free 0.213
6C99 Crystal structure of FcRn bound to UCB-303 提交 2018-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EQY methyl 7-(3,5-difluorophenyl)-5-(pyridin-3-yl)[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidine-6-carboxylate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3；289 K；APO FCRN CRYSTALS WERE PRODUCED BY SITTING DROP VAPOR DIFFUSION WITH AN EQUAL VOLUME COMBINATION OF THE PROTEIN COMPLEX, PROVIDED IN A PROTEIN SOLUTION CONTAINING 50MM HEPES PH 7.0 AND 75MM NACL, AND AN OPTIMIZATION SCREEN CONTAINING 0.1M CITRIC ACID/NAOH PH 3.01-3.09 AND 12-16% W/V PEG 6,000. CRYSTALS OF FCRN WERE SOAKED FOR THREE DAYS IN BUFFER CONTAINING 0.1M CITRIC ACID/NAOH PH 3.0, 20% W/V PEG6,000, AND 20% GLYCEROL AND 12.5MM UCB-303.
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
6C99 Crystal structure of FcRn bound to UCB-303 提交 2018-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 EQY methyl 7-(3,5-difluorophenyl)-5-(pyridin-3-yl)[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidine-6-carboxylate × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3；289 K；APO FCRN CRYSTALS WERE PRODUCED BY SITTING DROP VAPOR DIFFUSION WITH AN EQUAL VOLUME COMBINATION OF THE PROTEIN COMPLEX, PROVIDED IN A PROTEIN SOLUTION CONTAINING 50MM HEPES PH 7.0 AND 75MM NACL, AND AN OPTIMIZATION SCREEN CONTAINING 0.1M CITRIC ACID/NAOH PH 3.01-3.09 AND 12-16% W/V PEG 6,000. CRYSTALS OF FCRN WERE SOAKED FOR THREE DAYS IN BUFFER CONTAINING 0.1M CITRIC ACID/NAOH PH 3.0, 20% W/V PEG6,000, AND 20% GLYCEROL AND 12.5MM UCB-303.
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
6CUG Crystal structure of BC8B TCR-CD1b-PC complex 提交 2018-03-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CUY tetracosyl octadecanoate × 1 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；PEG 3350, Tris-HCl
分辨率 2.40 Å R-free 0.229
6D29 HLA-B*57:01 presenting TSMSFVPRPW 提交 2018-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；294 K；18 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4.
分辨率 1.88 Å R-free 0.222
6D2B HLA-B*57:01 presenting LSDSTARDVTW 提交 2018-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；294 K；18 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4.
分辨率 2.04 Å R-free 0.212
6D2R HLA-B*57:01 presenting GSFDYSGVHLW 提交 2018-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；294 K；18 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4.
分辨率 1.83 Å R-free 0.207
6D2T HLA-B*57:01 presenting LALLTGVRW 提交 2018-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；294 K；18 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4.
分辨率 1.90 Å R-free 0.203
6D64 Crystal Structure of Human CD1b in Complex with POPC 提交 2018-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1 CUY tetracosyl octadecanoate × 1 CL CHLORIDE ION × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 1 IOD IODIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, 0.2M Sodium Iodide, Ethylene Glycol
分辨率 1.70 Å R-free 0.211
6D78 The complex between high-affinity TCR DMF5(alpha-D26Y,beta-L98W) and human Class I MHC HLA-A2 with the bound MART-1(27-35)peptide 提交 2018-04-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M Tris, 12% PEG6000, 0.2 M magnesium chloride
分辨率 2.35 Å R-free 0.255
6D7G Structure of 5F3 TCR in complex with HLA-A2/MART-1 提交 2018-04-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295.15 K；PEG 550 MME, TRIS, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 295K
分辨率 2.75 Å R-free 0.237
6DKP The complex among DMF5(alpha-D26Y, alpha-Y50A,beta-L98W) TCR, human Class I MHC HLA-A2 and MART-1(26-35)(A27L) peptide 提交 2018-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；12% Peg 3350, 250mM MgCl2, 0.1M HEPES
分辨率 2.97 Å R-free 0.286
6EI2 Crystal Structure of HLA-A68 presenting a C-terminally extended peptide 提交 2017-09-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 NI NICKEL (II) ION × 3 CD CADMIUM ION × 2 CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；12% PEG3350 0.005M cobalt chloride 0.005M cadmium chloride 0.005M nickel chloride 0.005M magnesium chloride 0.1M HEPES pH 7.5
分辨率 1.61 Å R-free 0.181
6ENY Structure of the human PLC editing module 提交 2017-10-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6EQA HLA class I histocompatibility antigen 提交 2017-10-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 4000 and 15% glycerol
分辨率 3.16 Å R-free 0.263
6EQB HLA class I histocompatibility antigen 提交 2017-10-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 20% PEG 4000 and 15% glycerol
分辨率 2.81 Å R-free 0.251
6EWA Crystal structure of HLA-A2 in complex with LILRB1 提交 2017-11-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；17.5% PEG 3350, 0.2M Ammonium acetate, 0.1M Tris HCL
分辨率 2.39 Å R-free 0.279
6EWA Crystal structure of HLA-A2 in complex with LILRB1 提交 2017-11-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；17.5% PEG 3350, 0.2M Ammonium acetate, 0.1M Tris HCL
分辨率 2.39 Å R-free 0.279
6EWC Crystal structure of non-phosphorylated form of RLS PHOSPHOPEPTIDE BOUND TO HLA-A2 in complex with LILRB1 提交 2017-11-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；12.8% PEG 3350, 3% Tacsimate, 10% dimethyl sulphoxide
分辨率 3.20 Å R-free 0.246
6EWC Crystal structure of non-phosphorylated form of RLS PHOSPHOPEPTIDE BOUND TO HLA-A2 in complex with LILRB1 提交 2017-11-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；12.8% PEG 3350, 3% Tacsimate, 10% dimethyl sulphoxide
分辨率 3.20 Å R-free 0.246
6EWO Crystal structure of non-phosphorylated form of RTF PHOSPHOPEPTIDE BOUND TO HLA-A2 in complex with LILRB1 提交 2017-11-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% PEG 3350, 0.2M Potassium sodium tartrate
分辨率 2.30 Å R-free 0.276
6EWO Crystal structure of non-phosphorylated form of RTF PHOSPHOPEPTIDE BOUND TO HLA-A2 in complex with LILRB1 提交 2017-11-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% PEG 3350, 0.2M Potassium sodium tartrate
分辨率 2.30 Å R-free 0.276
6FGB Human FcRn extra-cellular domain complexed with Fab fragment of Rozanolixizumab 提交 2018-01-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.15 K；0.1M Sodium citrate pH 5.5, 11% PEG6000
分辨率 2.90 Å R-free 0.284
6G3J MHC A02 Allele presenting MTSAIGILVP 提交 2018-03-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K
分辨率 2.45 Å R-free 0.270
6G3J MHC A02 Allele presenting MTSAIGILVP 提交 2018-03-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K
分辨率 2.45 Å R-free 0.270
6G3K MHC A02 Allele presenting MTSAIGILPV 提交 2018-03-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
6G3K MHC A02 Allele presenting MTSAIGILPV 提交 2018-03-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
6GGM HLA-E*01:03 in complex with the Mtb44 peptide variant: Mtb44*P2-Phe. 提交 2018-05-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.5 K；2.0 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES, 1mM ZnSO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.221
6GGM HLA-E*01:03 in complex with the Mtb44 peptide variant: Mtb44*P2-Phe. 提交 2018-05-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.5 K；2.0 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES, 1mM ZnSO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.221
6GH1 HLA-E*01:03 in complex with Mtb44 提交 2018-05-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES, pH 6
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
6GH1 HLA-E*01:03 in complex with Mtb44 提交 2018-05-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES, pH 6
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
6GH1 HLA-E*01:03 in complex with Mtb44 提交 2018-05-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES, pH 6
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
6GH1 HLA-E*01:03 in complex with Mtb44 提交 2018-05-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES, pH 6
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
6GH4 HLA-E*01:03 in complex with the Mtb44 peptide variant: Mtb44*P2-Gln. 提交 2018-05-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M HEPES, pH 7
分辨率 2.16 Å R-free 0.242
6GH4 HLA-E*01:03 in complex with the Mtb44 peptide variant: Mtb44*P2-Gln. 提交 2018-05-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M HEPES, pH 7
分辨率 2.16 Å R-free 0.242
6GH4 HLA-E*01:03 in complex with the Mtb44 peptide variant: Mtb44*P2-Gln. 提交 2018-05-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M HEPES, pH 7
分辨率 2.16 Å R-free 0.242
6GH4 HLA-E*01:03 in complex with the Mtb44 peptide variant: Mtb44*P2-Gln. 提交 2018-05-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M HEPES, pH 7
分辨率 2.16 Å R-free 0.242
6GHN HLA-E*01:03 in complex with the Mtb44 peptide variant: Mtb44*P9-Phe. 提交 2018-05-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M HEPES, pH 7
分辨率 2.54 Å R-free 0.264
6GHN HLA-E*01:03 in complex with the Mtb44 peptide variant: Mtb44*P9-Phe. 提交 2018-05-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M HEPES, pH 7
分辨率 2.54 Å R-free 0.264
6GK3 Two protofilament beta-2-microglobulin amyloid fibril 提交 2018-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 42–105（64 aa）
链 B 42–105（64 aa）
链 C 42–105（64 aa）
链 D 42–105（64 aa）
链 E 42–105（64 aa）
链 F 42–105（64 aa）
链 G 42–105（64 aa）
链 H 42–105（64 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 2.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.98 Å
6GL1 HLA-E*01:03 in complex with the HIV epitope, RL9HIV 提交 2018-05-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES, pH 6, 0.05% dichloromethane
分辨率 2.62 Å R-free 0.273
6GL1 HLA-E*01:03 in complex with the HIV epitope, RL9HIV 提交 2018-05-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES, pH 6, 0.05% dichloromethane
分辨率 2.62 Å R-free 0.273
6GL1 HLA-E*01:03 in complex with the HIV epitope, RL9HIV 提交 2018-05-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES, pH 6, 0.05% dichloromethane
分辨率 2.62 Å R-free 0.273
6GL1 HLA-E*01:03 in complex with the HIV epitope, RL9HIV 提交 2018-05-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES, pH 6, 0.05% dichloromethane
分辨率 2.62 Å R-free 0.273
6ID4 Defining the structural basis for human alloantibody binding to human leukocyte antigen allele HLA-A*11:01 提交 2018-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1,4-Dioxane, Tris pH 8.2, Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.40 Å R-free 0.246
6ID4 Defining the structural basis for human alloantibody binding to human leukocyte antigen allele HLA-A*11:01 提交 2018-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1,4-Dioxane, Tris pH 8.2, Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.40 Å R-free 0.246
6IEX Crystal structure of HLA-B*4001 in complex with SARS-CoV derived peptide N216-225 GETALALLLL 提交 2018-09-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M sodium citrate tribasic dehydrate, pH 6.5 and 18% w-v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.31 Å R-free 0.261
6ILM Cryo-EM structure of Echovirus 6 complexed with its uncoating receptor FcRn at PH 7.4 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：540-meric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 SPH SPHINGOSINE × 60 K POTASSIUM ION × 60 NA SODIUM ION × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6ILM Cryo-EM structure of Echovirus 6 complexed with its uncoating receptor FcRn at PH 7.4 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 SPH SPHINGOSINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6ILM Cryo-EM structure of Echovirus 6 complexed with its uncoating receptor FcRn at PH 7.4 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：45-meric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 SPH SPHINGOSINE × 5 K POTASSIUM ION × 5 NA SODIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6ILM Cryo-EM structure of Echovirus 6 complexed with its uncoating receptor FcRn at PH 7.4 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：54-meric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 SPH SPHINGOSINE × 6 K POTASSIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6ILM Cryo-EM structure of Echovirus 6 complexed with its uncoating receptor FcRn at PH 7.4 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 SPH SPHINGOSINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6J1V The structure of HLA-A*3003/RT313 提交 2018-12-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 25% (w/v) polyethylene glycol 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.217
6J1W The structure of HLA-A*3001/RT313 提交 2018-12-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1 M sodium citrate tribasic dehydrate (pH 5.5)
分辨率 1.50 Å R-free 0.205
6J29 The structure of HLA-A*3003/MTB 提交 2018-12-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；291 K；0.2M Potassium Sodium Tartrate tetrahydrate, 0.1M Tri-Sodium Citrate dihydrate(pH 5.6), 2.0M Ammonium Sulfate
分辨率 1.60 Å R-free 0.197
6J2A The structure of HLA-A*3003/NP44 提交 2018-12-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；291 K；0.1M Tri-Sodium Citrate dihydrate (pH 5.6), 1.0M Lithium Sulfate monohydrate
分辨率 1.40 Å R-free 0.195
6J2E Crystal structure of bat (Pteropus Alecto) MHC class I Ptal-N*01:01 in complex with Ebola virus-derived peptide EBOV-NP1 提交 2019-01-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M succinic acid pH 7.0, 15%(w/v) polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.10 Å R-free 0.257
6J2E Crystal structure of bat (Pteropus Alecto) MHC class I Ptal-N*01:01 in complex with Ebola virus-derived peptide EBOV-NP1 提交 2019-01-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M succinic acid pH 7.0, 15%(w/v) polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.10 Å R-free 0.257
6J2G Crystal structure of bat (Pteropus Alecto) MHC class I Ptal-N*01:01 in complex with Ebola virus-derived peptide EBOV-NP2 提交 2019-01-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Tris pH 8.0, 16% w/v polyethylene glycol 10,000
分辨率 2.41 Å R-free 0.233
6J2G Crystal structure of bat (Pteropus Alecto) MHC class I Ptal-N*01:01 in complex with Ebola virus-derived peptide EBOV-NP2 提交 2019-01-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Tris pH 8.0, 16% w/v polyethylene glycol 10,000
分辨率 2.41 Å R-free 0.233
6J2H Crystal structure of bat (Pteropus Alecto) MHC class I Ptal-N*01:01 mutant (Met52 Asp53 Leu54 deleted) in complex with Hendra virus-derived peptide HeV1 提交 2019-01-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M sodium formate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.30 Å R-free 0.228
6J2H Crystal structure of bat (Pteropus Alecto) MHC class I Ptal-N*01:01 mutant (Met52 Asp53 Leu54 deleted) in complex with Hendra virus-derived peptide HeV1 提交 2019-01-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M sodium formate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.30 Å R-free 0.228
6J2I Crystal structure of bat (Pteropus Alecto) MHC class I Ptal-N*01:01 in complex with H17N10 influenza-like virus-derivrd peptide H17N10-NP 提交 2019-01-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.075 M HEPES pH 7.5, 15% w/v polyethylene glycol 10,000, 25% v/v glycerol.
分辨率 2.30 Å R-free 0.253
6J2I Crystal structure of bat (Pteropus Alecto) MHC class I Ptal-N*01:01 in complex with H17N10 influenza-like virus-derivrd peptide H17N10-NP 提交 2019-01-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.075 M HEPES pH 7.5, 15% w/v polyethylene glycol 10,000, 25% v/v glycerol.
分辨率 2.30 Å R-free 0.253
6J2J Crystal structure of bat (Pteropus Alecto) MHC class I Ptal-N*01:01 in complex with MERS-CoV-derived peptide MERS-CoV-S3 提交 2019-01-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M sodium acetate trihydrate, 20% w/v polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.50 Å R-free 0.267
6J2J Crystal structure of bat (Pteropus Alecto) MHC class I Ptal-N*01:01 in complex with MERS-CoV-derived peptide MERS-CoV-S3 提交 2019-01-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M sodium acetate trihydrate, 20% w/v polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.50 Å R-free 0.267
6JOZ Crystal structure of BRLF peptide from EBV in complex with HLA-A1101. 提交 2019-03-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；0.2M LITHIUM SULFATE MONOHYDRATE, 0.1M TRIS-HCL, 30% PEG 4000
分辨率 1.35 Å R-free 0.189
6JP3 Crystal structure of peptide in complex with HLA-A1101. 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；289 K；0.2M Sodium malonate, 20% PEG 3350
分辨率 1.66 Å R-free 0.194
6JTN Crystal structure of HLA-C08 in complex with a tumor mut10m peptide 提交 2019-04-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–118（98 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M HEPES (pH 7.5), 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.200
6JTO Crystal structure of HLA-C05 in complex with a tumor mut10m peptide 提交 2019-04-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–118（98 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M HEPES (pH 7.5), 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.208
6JTP Crystal structure of HLA-C08 in complex with a tumor mut9m peptide 提交 2019-04-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–118（98 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M HEPES (pH 7.5), 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.283
6K60 Structural and functional basis for HLA-G isoform recognition of immune checkpoint receptor LILRBs 提交 2019-05-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M sodium iodide, 0.1M Bis Tris propane (pH 8.5), 20% PEG 3350
分辨率 3.15 Å R-free 0.289
6K60 Structural and functional basis for HLA-G isoform recognition of immune checkpoint receptor LILRBs 提交 2019-05-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M sodium iodide, 0.1M Bis Tris propane (pH 8.5), 20% PEG 3350
分辨率 3.15 Å R-free 0.289
6K7T Crystal structure of bat (Pteropus Alecto) MHC class I Ptal-N*01:01 in complex with Hendra virus-derived peptide HeV1--human beta-2 microglobulin 提交 2019-06-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 2% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.234
6LA6 Cryo-EM structure of echovirus 11 complexed with its uncoating receptor FcRn at pH 7.4 提交 2019-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-meric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.39 Å
6LA6 Cryo-EM structure of echovirus 11 complexed with its uncoating receptor FcRn at pH 7.4 提交 2019-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.39 Å
6LA6 Cryo-EM structure of echovirus 11 complexed with its uncoating receptor FcRn at pH 7.4 提交 2019-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.39 Å
6LA6 Cryo-EM structure of echovirus 11 complexed with its uncoating receptor FcRn at pH 7.4 提交 2019-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.39 Å
6LA6 Cryo-EM structure of echovirus 11 complexed with its uncoating receptor FcRn at pH 7.4 提交 2019-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.39 Å
6LA7 Cryo-EM structure of echovirus 11 complexed with its uncoating receptor FcRn at pH 5.5 提交 2019-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-meric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
6LA7 Cryo-EM structure of echovirus 11 complexed with its uncoating receptor FcRn at pH 5.5 提交 2019-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
6LA7 Cryo-EM structure of echovirus 11 complexed with its uncoating receptor FcRn at pH 5.5 提交 2019-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
6LA7 Cryo-EM structure of echovirus 11 complexed with its uncoating receptor FcRn at pH 5.5 提交 2019-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
6LA7 Cryo-EM structure of echovirus 11 complexed with its uncoating receptor FcRn at pH 5.5 提交 2019-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
6M1B A new V27M variant of beta 2 microglobulin induced amyloidosis in a patient with long-term hemodialysis 提交 2020-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 4000, ammonium acetate, glycerol, Phosphate buffer
分辨率 1.88 Å R-free 0.246
6M24 Uncommon structural features of rabbit MHC class I (RLA-A1) complexed with rabbit haemorrhagic disease virus (RHDV) derived peptide, VP60-2 提交 2020-02-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；291 K；0.2M magnesium chloride hexahydrate, 0.1M sodium citrate tribasic, pH 5.0, 10% w/v polyethylene glycol 20000
分辨率 2.29 Å R-free 0.246
6M2J Uncommon structural features of rabbit MHC class I (RLA-A1) complexed with rabbit haemorrhagic disease virus (RHDV) derived peptide, VP60-1 提交 2020-02-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M imidazole (pH 7.0), 12% w/v polyethylene glycol 2000
分辨率 2.20 Å R-free 0.256
6M2K Uncommon structural features of rabbit MHC class I (RLA-A1) complexed with rabbit haemorrhagic disease virus (RHDV) derived peptide, VP60-10 提交 2020-02-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M BIS-TRIS PH 6.5, 20% w/v PEG 5000
分辨率 2.59 Å R-free 0.294
6MPP HLA-A*01:01 complex with NRAS Q61K peptide by NMR 提交 2018-10-08 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成 300 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] MHC-I HLA-A01:01, 300 uM NRAS Q16K, 300 uM Hb2M, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 180 uM [U-15N; U-2H]; [U-15N; U-2H; Methyl-1H; Methyl-13C]-Ala, Ile, Leu & Val MHC-I HLA-A01:01, 180 uM NRAS Q16K, 180 uM Hb2M, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 210 uM [U-15N; U-2H]; [U-15N; U-2H; Methyl-1H; Methyl-13C]-Ala, Ile, Leu & Val; [U-13C; U-15N]-Phe & Tyr MHC-I HLA-A01:01, 210 uM [U-15N] NRAS Q16K, 210 uM [U-2H] Hb2M, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 170 uM [U-15N; U-2H]; [U-15N; U-2H; Methyl-1H; Methyl-13C]-Ala, Ile, Leu & Val MHC-I HLA-A01:01, 170 uM NRAS Q16K, 170 uM Hb2M, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
6MT3 Crystal Structure of HLA-B*18:01 in complex with NP338 influenza peptide 提交 2018-10-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG6000, 0.2M NaCl, 0.1M Na citrate pH 6.5
分辨率 1.21 Å R-free 0.214
6MT4 Crystal Structure of HLA-B*37:01 in complex with NP338-L7S influenza peptide 提交 2018-10-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG6000, 0.2M NaCl, 0.1M Na citrate pH 6.5
分辨率 1.55 Å R-free 0.251
6MT5 Crystal Structure of HLA-B*37:01 in complex with NP338-V6L influenza peptide 提交 2018-10-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG6000, 0.2M NaCl, 0.1M Na citrate pH 6.5
分辨率 1.55 Å R-free 0.207
6MT6 Crystal Structure of HLA-B*37:01 in complex with NP338 influenza peptide 提交 2018-10-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG6000, 0.2M NaCl, 0.1M Na citrate pH 6.5
分辨率 1.31 Å R-free 0.193
6MTL Crystal Structure of HLA-B*44:05 in complex with NP338 influenza peptide 提交 2018-10-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG6000, 0.2M NaCl, 0.1M Na citrate pH 6.5
分辨率 1.35 Å R-free 0.210
6MTM Crystal Structure of EM2 TCR in complex with HLA-B*37:01-NP338 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；19% PEG 3350, 0.2 ammonium tartrate
分辨率 3.00 Å R-free 0.301
6MWR Recognition of MHC-like molecule 提交 2018-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15-17% PEG3350 0.2M CaCl2
分辨率 3.30 Å R-free 0.261
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 i 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 r 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 h 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 q 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 13 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 g 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 14 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 d 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 15 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 n 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 16 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 a 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 17 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 k 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 18 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 c 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 19 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 s 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 b 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 20 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 m 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 l 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 j 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 t 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 f 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 p 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 o 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NCA HLA-A2 (A*02:01) bound to a peptide from the Epstein-Barr virus BRLF1 protein 提交 2018-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 e 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% (w/v) PEG 4000, 35 mM Tris base/ HCl (pH 8.5), 70 mM Li2SO4
分辨率 3.30 Å R-free 0.303
6NHA Crystal structure of SYNT001, a human FcRn blocking monoclonal antibody 提交 2018-12-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277.15 K；0.1M CHES pH 9.5 50% polyethylene glycol 200
分辨率 2.38 Å R-free 0.245
6NPR Crystal structure of H-2Dd with C84-C139 disulfide in complex with gp120 derived peptide P18-I10 提交 2019-01-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Bis-Tris (5.5) and 25%PEG 3350
分辨率 2.37 Å R-free 0.251
6NPR Crystal structure of H-2Dd with C84-C139 disulfide in complex with gp120 derived peptide P18-I10 提交 2019-01-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Bis-Tris (5.5) and 25%PEG 3350
分辨率 2.37 Å R-free 0.251
6NUX CD1a-lipid binary complex 提交 2019-02-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 FOF (2E,6E)-3,7,11-trimethyldodeca-2,6,10-trien-1-ol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20-25% PEG 1500, 0.1M MMT pH 5.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.248
6O4Y Structure of HLA-A2:01 with peptide MM91 提交 2019-03-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295.15 K；30% PEG 4000, 0.1M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2M LITHIUM SULFATE
分辨率 1.58 Å R-free 0.205
6O4Z Structure of HLA-A2:01 with peptide MM92 提交 2019-03-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295.15 K；30% PEG 4000, 0.1M TRIS-HCL PH 8.0, 0.2M LITHIUM SULFATE
分辨率 1.50 Å R-free 0.193
6O51 Structure of HLA-A2:01 with peptide MM90 提交 2019-03-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 6 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295.15 K；30% PEG 4000, 0.1M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2M LITHIUM SULFATE
分辨率 1.55 Å R-free 0.225
6O53 Structure of HLA-A2:01 with peptide MM96 提交 2019-03-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295.15 K；30% PEG 4000, 0.1M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2M LITHIUM SULFATE
分辨率 1.40 Å R-free 0.210
6O9B Crystal structure of HLA-A3*01 in complex with a wild-type beta-catenin peptide 提交 2019-03-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–119（119 aa）
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 IMD IMIDAZOLE × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；0.1 M MES/imidazole, pH 6.5, 0.03 M diethylene glycol, 0.03 M triethylene glycol, 0.03 M tetraethylene glycol, 0.03 M pentaethylene glycol, 20% PEG500 MME, 10% PEG20000
分辨率 2.20 Å R-free 0.227
6O9C Crystal structure of HLA-A3*01 in complex with a mutant beta-catenin peptide 提交 2019-03-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–119（119 aa）
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 10 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；0.1 M MES, pH 6.5, 0.2 M ammonium sulfate, 30% PEG5000 MME
分辨率 2.45 Å R-free 0.259
6OPD Crystal Structure of ILNAMIVKI peptide bound to HLA-A2 提交 2019-04-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 ACT ACETATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；20% PEG8000, 100 mM MES, pH 6.5, 200 mM magnesium acetate
分辨率 1.79 Å R-free 0.204
6P23 Structure of a nested set of N-terminally extended MHC I-peptides provide novel insights into antigen processing presentation 提交 2019-05-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.2 M ammonium sulfate, 18% PEG4000, 0.1 M sodium cacodylate, pH 5.7
分辨率 1.59 Å R-free 0.227
6P27 Structure of a nested set of N-terminally extended MHC I-peptides provides novel insights into antigen processing and presentation 提交 2019-05-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M ammonium sulfate, 18% PEG4000, 0.1 M sodium cacodylate, pH 5.7
分辨率 1.59 Å R-free 0.213
6P2C Structure of a nested set of N-terminally extended MHC I-peptides provides novel insights into antigen processing and presentation 提交 2019-05-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M ammonium sulfate, 18% PEG4000, 0.1 M sodium cacodylate, pH 5.7
分辨率 1.40 Å R-free 0.210
6P2F Structure of a nested set of N-terminally extended MHC I-peptides provides novel insights into antigen processing and presentation 提交 2019-05-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M ammonium sulfate, 18% PEG4000, 0.1 M sodium cacodylate, pH 5.7
分辨率 1.48 Å R-free 0.245
6P2S Structure of a nested set of N-terminally extended MHC I-peptides provide novel insights into antigen processing and presentation 提交 2019-05-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M ammonium sulfate, 18% PEG4000, 0.1 M sodium cacodylate, pH 5.7
分辨率 1.65 Å R-free 0.214
6P64 Alpha-beta TCR Binding to Neoantigen KQWLVWLFL Presented by HLA-A206 提交 2019-05-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295.5 K；8 mg/mL protein, 12.5% PEG3350, 0.1 M MOPS, pH 7.0, 0.25 M lithium nitrate
分辨率 3.05 Å R-free 0.219
6P64 Alpha-beta TCR Binding to Neoantigen KQWLVWLFL Presented by HLA-A206 提交 2019-05-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295.5 K；8 mg/mL protein, 12.5% PEG3350, 0.1 M MOPS, pH 7.0, 0.25 M lithium nitrate
分辨率 3.05 Å R-free 0.219
6PA1 Killer cell immunoglobulin-like receptor 2DL2 in complex with HLA-C*07:02 提交 2019-06-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M Sodium tartrate dibasic dihydrate and 20% w/v PEG 3350
分辨率 3.01 Å R-free 0.310
6PA1 Killer cell immunoglobulin-like receptor 2DL2 in complex with HLA-C*07:02 提交 2019-06-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M Sodium tartrate dibasic dihydrate and 20% w/v PEG 3350
分辨率 3.01 Å R-free 0.310
6PAG Killer cell immunoglobulin-like receptor 2DL3 in complex with HLA-C*07:02 提交 2019-06-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Tris-HCl pH.8.0 and 25% PEG 3350.
分辨率 2.50 Å R-free 0.254
6PBH Crystal Structure of HLA-A*68:01 in complex with NP145-156, a 12 mer influenza peptide 提交 2019-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；8-14%PEG3350, 0.1M NaCl, 0.1M Hepes pH 7.4, 20mM MgCl2, 5mM CdCl2
分辨率 1.89 Å R-free 0.234
6PTB Crystal Structure of ILNAMIAKI peptide bound to HLA-A2 提交 2019-07-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15% v/v PEG3350, 100 mM MES
分辨率 2.15 Å R-free 0.232
6PTB Crystal Structure of ILNAMIAKI peptide bound to HLA-A2 提交 2019-07-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15% v/v PEG3350, 100 mM MES
分辨率 2.15 Å R-free 0.232
6PTE Crystal Structure of ILNAMITKI peptide bound to HLA-A2 提交 2019-07-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；20% v/v PEG3350, 100 mM HEPES, pH 7.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.185
6PTE Crystal Structure of ILNAMITKI peptide bound to HLA-A2 提交 2019-07-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；20% v/v PEG3350, 100 mM HEPES, pH 7.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.185
6PTE Crystal Structure of ILNAMITKI peptide bound to HLA-A2 提交 2019-07-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；20% v/v PEG3350, 100 mM HEPES, pH 7.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.185
6PTE Crystal Structure of ILNAMITKI peptide bound to HLA-A2 提交 2019-07-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；20% v/v PEG3350, 100 mM HEPES, pH 7.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.185
6PUC Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-5-OP-RU 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 Q87 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.85 Å R-free 0.178
6PUC Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-5-OP-RU 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 Q87 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.85 Å R-free 0.178
6PUD Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-5'OH-Pentyl-5-OP-U 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 OYD 6-[(5-hydroxypentyl)amino]-5-[(E)-propylideneamino]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.80 Å R-free 0.200
6PUD Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-5'OH-Pentyl-5-OP-U 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 OYD 6-[(5-hydroxypentyl)amino]-5-[(E)-propylideneamino]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.80 Å R-free 0.200
6PUE Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-4'D-5-OP-RU 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 Q7J 1,4-dideoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-erythro-pentitol × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.90 Å R-free 0.232
6PUE Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-4'D-5-OP-RU 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 Q7J 1,4-dideoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-erythro-pentitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.90 Å R-free 0.232
6PUF Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-5'D-5-OP-RU 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.92 Å R-free 0.221
6PUF Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-5'D-5-OP-RU 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.92 Å R-free 0.221
6PUG Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-2`OH-Ethyl-5-OP-U 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 OZD 6-[(2-hydroxyethyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.80 Å R-free 0.194
6PUG Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-2`OH-Ethyl-5-OP-U 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 OZD 6-[(2-hydroxyethyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.80 Å R-free 0.194
6PUH Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-Ribityl-less 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 OYG 6-methyl-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.88 Å R-free 0.195
6PUH Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-Ribityl-less 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 OYG 6-methyl-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.88 Å R-free 0.195
6PUI Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-4'OH-Butyl-5-OP-U 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 Q7P 6-[(4-hydroxybutyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.96 Å R-free 0.200
6PUI Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-4'OH-Butyl-5-OP-U 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 Q7P 6-[(4-hydroxybutyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.96 Å R-free 0.200
6PUK Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-JYM72 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 OYV 1,2-dideoxy-1-{2,6-dioxo-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}-D-ribo-hexitol × 1 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 2.08 Å R-free 0.202
6PUK Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-JYM72 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 OYV 1,2-dideoxy-1-{2,6-dioxo-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}-D-ribo-hexitol × 1 ACT ACETATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 2.08 Å R-free 0.202
6PUL Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1 3'D-5-OP-RU 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 Q81 1,3-dideoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-erythro-pentitol × 1 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.84 Å R-free 0.184
6PUL Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1 3'D-5-OP-RU 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 Q81 1,3-dideoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-erythro-pentitol × 1 ACT ACETATE ION × 1 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.84 Å R-free 0.184
6PUM Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-2'D-5-OP-RU 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 Q84 1,2-dideoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-erythro-pentitol × 1 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.96 Å R-free 0.190
6PUM Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-2'D-5-OP-RU 提交 2019-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 Q84 1,2-dideoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-erythro-pentitol × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM BTP (pH 6.0 - 6.5), 8-20% PEG3350 and 200 mM sodium acetate
分辨率 1.96 Å R-free 0.190
6PVC Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-DB28 提交 2019-07-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 P1J N-(2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidine-4-carbonyl)-beta-alanine × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BTP (pH 6.0 - 6.5), PEG3350 and sodium acetate
分辨率 1.96 Å R-free 0.212
6PVC Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-DB28 提交 2019-07-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 P1J N-(2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidine-4-carbonyl)-beta-alanine × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BTP (pH 6.0 - 6.5), PEG3350 and sodium acetate
分辨率 1.96 Å R-free 0.212
6PVD Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-NV18.1 提交 2019-07-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 N18 methyl N-(2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidine-4-carbonyl)-beta-alaninate × 1 GOL GLYCEROL × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BTP (pH 6.0 - 6.5), PEG3350 and sodium acetate
分辨率 2.14 Å R-free 0.198
6PVD Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-NV18.1 提交 2019-07-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 N18 methyl N-(2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidine-4-carbonyl)-beta-alaninate × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BTP (pH 6.0 - 6.5), PEG3350 and sodium acetate
分辨率 2.14 Å R-free 0.198
6PYJ Crystal Structure of HLA-B*2705 in complex with LRN, a self-peptide 提交 2019-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20-30% PEG 4K, 0.2M Na Acetate and 0.1M Na Citrate pH 5.6
分辨率 1.44 Å R-free 0.220
6PYL Crystal Structure of HLA-B*2703 in complex with KK10, an HIV peptide 提交 2019-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；277 K；20-30% PEG 4K, 0.2M Na Acetate and 0.1M Na Citrate pH 5.6
分辨率 1.52 Å R-free 0.230
6PYV Crystal Structure of HLA-B*2703-P47G in complex with LRN, a self-peptide 提交 2019-07-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20-30% PEG 4K, 0.2M Na Acetate and 0.1M Na Citrate pH 5.6
分辨率 1.45 Å R-free 0.231
6PYW Crystal Structure of HLA-B*2705-W60A in complex with LRN, a self-peptide 提交 2019-07-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20-30% PEG 4K, 0.2M Na Acetate and 0.1M Na Citrate pH 5.6
分辨率 1.38 Å R-free 0.220
6PZ5 Crystal Structure of HLA-B*2703 in complex with LRN, a self-peptide 提交 2019-07-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20-30% PEG 4K, 0.2M Na Acetate and 0.1M Na Citrate pH 5.6
分辨率 1.53 Å R-free 0.223
6Q3K Engineered Human HLA_A2 MHC Class I molecule in complex with NV9 peptide 提交 2018-12-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 CO COBALT (II) ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；5 mM cobalt chloride, 5 mM cadmium chloride, 5 mM magnesium chloride, 5 mM nickel chloride, 0.1 M HEPES pH 7.5, 12 % PEG 3350.
分辨率 1.50 Å R-free 0.200
6Q3S Engineered Human HLA_A2 MHC Class I molecule in complex with TCR and SV9 peptide 提交 2018-12-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M ammonium acetate; 0.1 M bis-tris pH 5.5, 17 %(w/v) PEG 10.000
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
6QIO Ternary complex of FcRn ectodomain, FcRn binding optimised human serum albumin and the human growth hormone derivative somapacitan 提交 2019-01-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–119（99 aa）
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 CYS CYSTEINE × 2 JG5 Somapacitan × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；ammonium acetate, sodium acetate, PEG4000
分辨率 1.95 Å R-free 0.226
6QIP Ternary complex of FcRn ectodomain, FcRn binding optimised human serum albumin and the albumin-biniding side chain of the human growth hormone derivative somapacitan 提交 2019-01-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–119（99 aa）
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 JG5 Somapacitan × 1 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 CYS CYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；sodium cacodylate, PEG3350
分辨率 2.45 Å R-free 0.259
6R2L NYBR1-A2-SLSKILDTV 提交 2019-03-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 8 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；0.2 M NaCl, 0.1 M MES, 20% PEG 6000, pH 6.0 . Condition B07 from Molecular Dimensions PACT premier HT-96/FX-96, MD1-36
分辨率 2.30 Å R-free 0.265
6RP9 Crystal structure of the T-cell receptor NYE_S3 bound to HLA A2*01-SLLMWITQV 提交 2019-05-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M ammonium sulphate, 15 % PEG8k, 0.1 M Tris pH7.5
分辨率 3.12 Å R-free 0.250
6RP9 Crystal structure of the T-cell receptor NYE_S3 bound to HLA A2*01-SLLMWITQV 提交 2019-05-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M ammonium sulphate, 15 % PEG8k, 0.1 M Tris pH7.5
分辨率 3.12 Å R-free 0.250
6RPA Crystal structure of the T-cell receptor NYE_S2 bound to HLA A2*01-SLLMWITQV 提交 2019-05-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.02 M sodium/potassium phosphate, 20 % PEG 3350
分辨率 2.56 Å R-free 0.293
6RPB Crystal structure of the T-cell receptor NYE_S1 bound to HLA A2*01-SLLMWITQV 提交 2019-05-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 25 %(w/v) PEG 4000, 0.1 M tri-Sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
6RPB Crystal structure of the T-cell receptor NYE_S1 bound to HLA A2*01-SLLMWITQV 提交 2019-05-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 25 %(w/v) PEG 4000, 0.1 M tri-Sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
6RPB Crystal structure of the T-cell receptor NYE_S1 bound to HLA A2*01-SLLMWITQV 提交 2019-05-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 25 %(w/v) PEG 4000, 0.1 M tri-Sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
6RPB Crystal structure of the T-cell receptor NYE_S1 bound to HLA A2*01-SLLMWITQV 提交 2019-05-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 25 %(w/v) PEG 4000, 0.1 M tri-Sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
6RSY The complex between TCR a7b2 and human Class I MHC HLA-A0201-WT1 with the bound RMFPNAPYL peptide. 提交 2019-05-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；297 K；7.5% PEG 8 K , 0.75 M NaCl , 50mM HEPES , pH 7.0
分辨率 2.95 Å R-free 0.291
6RSY The complex between TCR a7b2 and human Class I MHC HLA-A0201-WT1 with the bound RMFPNAPYL peptide. 提交 2019-05-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；297 K；7.5% PEG 8 K , 0.75 M NaCl , 50mM HEPES , pH 7.0
分辨率 2.95 Å R-free 0.291
6SS7 Human Leukocyte Antigen Class I A02 Carrying LLWAGPMAV 提交 2019-09-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 6.0, 0.2 M Ammonium Sulphate, 25% PEG 4000. A2/LLW-7I crystals were grown in 0.1 M Mes pH 7.0, 0.2 M Ammonium Sulphate, 25% PEG 8000
分辨率 2.50 Å R-free 0.304
6SS7 Human Leukocyte Antigen Class I A02 Carrying LLWAGPMAV 提交 2019-09-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 6.0, 0.2 M Ammonium Sulphate, 25% PEG 4000. A2/LLW-7I crystals were grown in 0.1 M Mes pH 7.0, 0.2 M Ammonium Sulphate, 25% PEG 8000
分辨率 2.50 Å R-free 0.304
6SS8 Human Leukocyte Antigen Class I A02 Carrying LLWNGPIAV 提交 2019-09-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Mes pH 7.0, 0.2 M Amonium Sulphate, 25 % PEG 8000
分辨率 2.24 Å R-free 0.277
6SS8 Human Leukocyte Antigen Class I A02 Carrying LLWNGPIAV 提交 2019-09-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 P4G 1-ETHOXY-2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Mes pH 7.0, 0.2 M Amonium Sulphate, 25 % PEG 8000
分辨率 2.24 Å R-free 0.277
6SS9 Human Leukocyte Antigen Class I A02 Carrying LLWNGPMHV 提交 2019-09-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 6.5, 0.2 M Ammonium Sulphate, 20 % PEG 4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.301
6SS9 Human Leukocyte Antigen Class I A02 Carrying LLWNGPMHV 提交 2019-09-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 6.5, 0.2 M Ammonium Sulphate, 20 % PEG 4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.301
6SSA Human Leukocyte Antigen Class I A02 Carrying LLWNGPMQV 提交 2019-09-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 6.5, 0.2 M Ammonium Sulphate, 20 % PEG 4000
分辨率 2.11 Å R-free 0.271
6SSA Human Leukocyte Antigen Class I A02 Carrying LLWNGPMQV 提交 2019-09-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 6.5, 0.2 M Ammonium Sulphate, 20 % PEG 4000
分辨率 2.11 Å R-free 0.271
6SSA Human Leukocyte Antigen Class I A02 Carrying LLWNGPMQV 提交 2019-09-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 6.5, 0.2 M Ammonium Sulphate, 20 % PEG 4000
分辨率 2.11 Å R-free 0.271
6SSA Human Leukocyte Antigen Class I A02 Carrying LLWNGPMQV 提交 2019-09-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 6.5, 0.2 M Ammonium Sulphate, 20 % PEG 4000
分辨率 2.11 Å R-free 0.271
6TDO Crystal structure of the disulfide engineered HLA-A0201 molecule in complex with one GM dipeptide in the A pocket. 提交 2019-11-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GLY GLYCINE × 1 MET METHIONINE × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M magnesium acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, and 20% PEG 800
分辨率 1.65 Å R-free 0.224
6TDP Crystal structure of the disulfide engineered HLA-A0201 molecule in complex with one GL dipeptide in the A pocket. 提交 2019-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 GLY GLYCINE × 1 LEU LEUCINE × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 20% PEG 10 000, 8% ethylene glycol
分辨率 1.40 Å R-free 0.227
6TDQ Crystal structure of the disulfide engineered HLA-A0201 molecule in complex with one GM dipeptide in the A pocket and one GM dipeptide in the F pocket. 提交 2019-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 GLY GLYCINE × 2 MET METHIONINE × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 20% PEG 10 000, 8% ethylene glycol
分辨率 1.60 Å R-free 0.214
6TDQ Crystal structure of the disulfide engineered HLA-A0201 molecule in complex with one GM dipeptide in the A pocket and one GM dipeptide in the F pocket. 提交 2019-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GLY GLYCINE × 2 MET METHIONINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 20% PEG 10 000, 8% ethylene glycol
分辨率 1.60 Å R-free 0.214
6TDR Crystal structure of the disulfide engineered HLA-A0201 molecule devoid of peptide (annealed) 提交 2019-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 20% PEG 10 000, 8% ethylene glycol
分辨率 1.75 Å R-free 0.230
6TDR Crystal structure of the disulfide engineered HLA-A0201 molecule devoid of peptide (annealed) 提交 2019-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 20% PEG 10 000, 8% ethylene glycol
分辨率 1.75 Å R-free 0.230
6TDS Crystal structure of the disulfide engineered HLA-A0201 molecule without peptide bound after NaCl wash 提交 2019-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 20% PEG 10 000, 8% ethylene glycol
分辨率 1.70 Å R-free 0.248
6TDS Crystal structure of the disulfide engineered HLA-A0201 molecule without peptide bound after NaCl wash 提交 2019-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 7 CL CHLORIDE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 20% PEG 10 000, 8% ethylene glycol
分辨率 1.70 Å R-free 0.248
6TMO Structure determination of an enhanced affinity TCR, a24b17, in complex with HLA-A*02:01 presenting a MART-1 peptide, EAAGIGILTV 提交 2019-12-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 SO4 SULFATE ION × 5 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5 0.2 M Ammonium Sulphate 15 % PEG 4000 8.7% Glycerol
分辨率 2.10 Å R-free 0.209
6TRN Crystal structure of HLA A2*01-AVYDGREHTV 提交 2019-12-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M potassium sodium tartrate, 0.1 M bis-tris propane pH6.5, 20 % PEG 3350
分辨率 1.35 Å R-free 0.200
6TRO Crystal structure of the T-cell receptor GVY01 bound to HLA A2*01-GVYDGREHTV 提交 2019-12-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1 M succinic acid, 0.1 M HEPES pH 7.0, 1 % w/v PEG MME 2k
分辨率 3.00 Å R-free 0.270
6UJ7 Crystal structure of HLA-B*07:02 with R140Q mutant IDH2 peptide 提交 2019-10-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–119（119 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 0.2 M NaCl, 25% PEG4000
分辨率 1.90 Å R-free 0.238
6UJ7 Crystal structure of HLA-B*07:02 with R140Q mutant IDH2 peptide 提交 2019-10-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–119（119 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 0.2 M NaCl, 25% PEG4000
分辨率 1.90 Å R-free 0.238
6UJ8 Crystal structure of HLA-B*07:02 with wild-type IDH2 peptide 提交 2019-10-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–119（119 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M KI, 30% PEG4000
分辨率 2.25 Å R-free 0.260
6UJ8 Crystal structure of HLA-B*07:02 with wild-type IDH2 peptide 提交 2019-10-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–119（119 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 SO4 SULFATE ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M KI, 30% PEG4000
分辨率 2.25 Å R-free 0.260
6UJ9 Crystal structure of HLA-B*07:02 with R140Q mutant IDH2 peptide in complex with Fab 提交 2019-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–119（119 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；0.1 M CHES, 20% PEG8000
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
6UJO HHAT L75F Neoantigen Peptide KQWLVWLFL Presented by HLA-A206 提交 2019-10-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295.5 K；10% PEG3350, 0.1 M magnesium chloride, 0.1 M sodium citrate, pH 6.5
分辨率 2.25 Å R-free 0.222
6UJQ HHAT Wild Type Peptide KQWLVWLLL Presented by HLA-A206 提交 2019-10-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；295.5 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.1, 30% PEG4000, 0.20 M ammonium sulfate
分辨率 2.55 Å R-free 0.228
6UK2 Complex of T cell Receptor with HHAT Wild Type Peptide KQWLVWLLL Presented by HLA-A206 提交 2019-10-04 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；0.1 M sodium citrate, pH 6.3, 8.5% PEG6000, 0.20 M lithium nitrate
分辨率 3.14 Å R-free 0.260
6UK4 Complex of T cell Receptor with HHAT Neoantigen Peptide KQWLVWLFL Presented by HLA-A206 提交 2019-10-04 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；0.1 M sodium citrate, pH 6.3, 7.5% PEG6000, 0.2 M lithium nitrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.252
6ULI Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 0.05M CaCl2 dihydrate, 30% PEG MME 500
分辨率 1.88 Å R-free 0.226
6ULK Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 0.05M CaCl2 dihydrate, 30% PEG MME 500
分辨率 1.90 Å R-free 0.270
6ULN Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22% PEG 3350, 0.1M MOPS pH 7.1 and 0.25M MgSO4
分辨率 2.01 Å R-free 0.217
6ULR Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22% PEG 3350, 0.1M MOPS pH 7.1 and 0.25M MgSO4
分辨率 3.20 Å R-free 0.262
6UON Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；12.5% PEG 4000, 0.1M Na Cacodylate pH 5.8, 0.2M (NH4)2SO4 and 10% glycerol
分辨率 3.50 Å R-free 0.294
6UON Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；12.5% PEG 4000, 0.1M Na Cacodylate pH 5.8, 0.2M (NH4)2SO4 and 10% glycerol
分辨率 3.50 Å R-free 0.294
6UZ1 Noncanonical binding of single-chain A6 TCR variant S3-4 in complex with Tax/HLA-A2 提交 2019-11-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；10%w/v Polyethylene glycol 20,000, 100mMMES, pH 6.5
分辨率 3.14 Å R-free 0.239
6UZ1 Noncanonical binding of single-chain A6 TCR variant S3-4 in complex with Tax/HLA-A2 提交 2019-11-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；10%w/v Polyethylene glycol 20,000, 100mMMES, pH 6.5
分辨率 3.14 Å R-free 0.239
6UZM HLA-B*15:02 complexed with a synthetic peptide 提交 2019-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2 ammonium acetate, 0.M tri-sodium citrate dihydrate pH5.6, 30% w/v PEG4000
分辨率 1.80 Å R-free 0.231
6UZN HLA-B*15:02 complexed with a synthetic peptide 提交 2019-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2 ammonium acetate, 0.M tri-sodium citrate dihydrate pH5.6, 30% w/v PEG4000
分辨率 2.22 Å R-free 0.228
6UZO HLA-B*15:02 complexed with a synthetic peptide 提交 2019-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2 ammonium acetate, 0.M tri-sodium citrate dihydrate pH5.6, 30% w/v PEG4000
分辨率 2.35 Å R-free 0.239
6UZP HLA-B*15:01 complexed with a synthetic peptide 提交 2019-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 ACT ACETATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2 ammonium acetate, 0.M tri-sodium citrate dihydrate pH5.6, 30% w/v PEG4000
分辨率 2.08 Å R-free 0.248
6UZQ HLA-B*15:01 complexed with a synthetic peptide 提交 2019-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2 ammonium acetate, 0.M tri-sodium citrate dihydrate pH5.6, 30% w/v PEG4000
分辨率 2.40 Å R-free 0.253
6UZS HLA-B*15:01 complexed with a synthetic peptide 提交 2019-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；0.2 ammonium acetate, 0.M tri-sodium citrate dihydrate pH5.6, 30% w/v PEG4000
分辨率 1.90 Å R-free 0.223
6V2O HLA-B*57:01 presenting the peptide ASLNLPAVSW 提交 2019-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；294 K；20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 1.27 Å R-free 0.159
6V2P HLA-B*57:03 presenting the peptide ASLNLPAVSW 提交 2019-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；294 K；20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 1.30 Å R-free 0.163
6V2Q HLA-B*57:03 presenting the peptide LSSPVTKSF 提交 2019-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；294 K；20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 1.60 Å R-free 0.194
6V3J KIR3DL1 in complex with HLA-B*57:03 presenting the peptide LSSPVTKSF 提交 2019-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；14% PEG 3350, 2% tacsimate, pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 1.98 Å R-free 0.236
6V7Y Human CD1d presenting alpha-Galactosylceramide in complex with VHH nanobody 1D5 提交 2019-12-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SO4 SULFATE ION × 5 AGH N-{(1S,2R,3S)-1-[(ALPHA-D-GALACTOPYRANOSYLOXY)METHYL]-2,3-DIHYDROXYHEPTADECYL}HEXACOSANAMIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2M Ammonium Sulphate, 0.1M Tris-HCl pH 7.0, 0.2M Lithium Sulphate
分辨率 2.40 Å R-free 0.276
6V7Z Human CD1d presenting alpha-Galactosylceramide in complex with VHH nanobody 1D22 提交 2019-12-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 AGH N-{(1S,2R,3S)-1-[(ALPHA-D-GALACTOPYRANOSYLOXY)METHYL]-2,3-DIHYDROXYHEPTADECYL}HEXACOSANAMIDE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 BGC beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；293 K；29% (v/v) PEG3350, 0.2M ammonium sulphate, 0.1M Bis-Tris (pH 5.3), 3% (v/v) glucose monohydrate
分辨率 2.75 Å R-free 0.252
6V7Z Human CD1d presenting alpha-Galactosylceramide in complex with VHH nanobody 1D22 提交 2019-12-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 AGH N-{(1S,2R,3S)-1-[(ALPHA-D-GALACTOPYRANOSYLOXY)METHYL]-2,3-DIHYDROXYHEPTADECYL}HEXACOSANAMIDE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；293 K；29% (v/v) PEG3350, 0.2M ammonium sulphate, 0.1M Bis-Tris (pH 5.3), 3% (v/v) glucose monohydrate
分辨率 2.75 Å R-free 0.252
6V80 Crystal structure of human CD1d presenting alpha-Galactosylceramide in complex with NKT12 TCR and VHH nanobody 1D12 提交 2019-12-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 AGH N-{(1S,2R,3S)-1-[(ALPHA-D-GALACTOPYRANOSYLOXY)METHYL]-2,3-DIHYDROXYHEPTADECYL}HEXACOSANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；21 % (v/v) PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate, 3% (v/v) D-(+)-trehalose dehydrate
分辨率 3.53 Å R-free 0.254
6V80 Crystal structure of human CD1d presenting alpha-Galactosylceramide in complex with NKT12 TCR and VHH nanobody 1D12 提交 2019-12-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 AGH N-{(1S,2R,3S)-1-[(ALPHA-D-GALACTOPYRANOSYLOXY)METHYL]-2,3-DIHYDROXYHEPTADECYL}HEXACOSANAMIDE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；21 % (v/v) PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate, 3% (v/v) D-(+)-trehalose dehydrate
分辨率 3.53 Å R-free 0.254
6VB0 HLA-B*15:02 complexed with a synthetic peptide 提交 2019-12-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M tri-sodium citrate dihydrate pH5.6, 30% w/v PEG4000
分辨率 1.90 Å R-free 0.213
6VB1 HLA-B*15:02 complexed with a synthetic peptide 提交 2019-12-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2 ammonium acetate, 0.M tri-sodium citrate dihydrate pH5.6, 30% w/v PEG4000
分辨率 1.75 Å R-free 0.215
6VB2 HLA-B*15:02 complexed with a synthetic peptide 提交 2019-12-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 22–117（96 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2 ammonium acetate, 0.M tri-sodium citrate dihydrate pH5.6, 30% w/v PEG4000
分辨率 1.41 Å R-free 0.232
6VB3 HLA-B*15:01 complexed with a synthetic peptide 提交 2019-12-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2 ammonium acetate, 0.M tri-sodium citrate dihydrate pH5.6, 30% w/v PEG4000
分辨率 2.00 Å R-free 0.307
6VB4 HLA-B*15:02 complexed with a synthetic peptide 提交 2019-12-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–118（98 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2 ammonium acetate, 0.M tri-sodium citrate dihydrate pH5.6, 30% w/v PEG4000
分辨率 2.33 Å R-free 0.243
6VB5 HLA-B*15:02 complexed with a synthetic peptide 提交 2019-12-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–118（98 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2 ammonium acetate, 0.M tri-sodium citrate dihydrate pH5.6, 30% w/v PEG4000
分辨率 2.15 Å R-free 0.224
6VB6 HLA-B*15:02 complexed with a synthetic peptide 提交 2019-12-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2 ammonium acetate, 0.M tri-sodium citrate dihydrate pH5.6, 30% w/v PEG4000
分辨率 2.15 Å R-free 0.242
6VB7 HLA-B*15:02 complexed with a synthetic peptide 提交 2019-12-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2 ammonium acetate, 0.M tri-sodium citrate dihydrate pH5.6, 30% w/v PEG4000
分辨率 2.10 Å R-free 0.257
6VIU HLA-B*15:02 complexed with a synthetic peptide 提交 2020-01-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2 ammonium acetate, 0.M tri-sodium citrate dihydrate pH5.6, 30% w/v PEG4000
分辨率 2.33 Å R-free 0.243
6VM7 SILv44 T cell receptor bound to HLA-A2 presenting gp100 peptide (ITDQVPFSV) 提交 2020-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；16% v/v PEG3350, 280 mM ammonium citrate dibasic
分辨率 2.41 Å R-free 0.241
6VM8 SILv44 T cell receptor bound to HLA-A2 presenting gp100T2M peptide (IMDQVPFSV) 提交 2020-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
突变：0 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；20% v/v PEG3350, 236 mM ammonium citrate dibasic
分辨率 2.41 Å R-free 0.221
6VM9 T4H2 T cell receptor bound to HLA-A2 presenting gp100T2M peptide (IMDQVPFSV) 提交 2020-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；296 K；18% v/v PEG10000, 16% v/v glycerol, 250 mM Tris pH 8.5, 60 mM sodium chloride, seeded with crushed crystals
分辨率 2.90 Å R-free 0.250
6VMA T4H2 T cell receptor bound to HLA-A2 presenting gp100 peptide (ITDQVPFSV) 提交 2020-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；296 K；18% v/v PEG10000, 16% v/v glycerol, 100 mM Tris pH 8.5, 100 mM sodium chloride
分辨率 2.75 Å R-free 0.219
6VMC T4H2 T cell receptor bound to HLA-A2 presenting gp100T2L peptide (ILDQVPFSV) 提交 2020-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；296 K；18% v/v PEG10000, 16% v/v glycerol, 250 mM Tris pH 8.5, 60 mM sodium chloride
分辨率 2.85 Å R-free 0.238
6VMX Structure of HD14 TCR in complex with HLA-B7 presenting an EBV epitope 提交 2020-01-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；8 mg/mL in 24% PEG 400, 0.1 M NaCl, 0.1 M sodium-citrate pH 6
分辨率 3.10 Å R-free 0.242
6VMX Structure of HD14 TCR in complex with HLA-B7 presenting an EBV epitope 提交 2020-01-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；8 mg/mL in 24% PEG 400, 0.1 M NaCl, 0.1 M sodium-citrate pH 6
分辨率 3.10 Å R-free 0.242
6VPZ HLA-B*27:05 presenting an HIV-1 11mer peptide 提交 2020-02-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；277 K；20 %w/v Polyethylene Glycol 3350, 0.2 M Ammonium Chloride
分辨率 2.10 Å R-free 0.235
6VQ2 HLA-B*27:05 presenting an HIV-1 14mer peptide 提交 2020-02-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20 %w/v Polyethylene Glycol 8000, 0.05 M Potassium di-Hydrogen Phosphate
分辨率 2.25 Å R-free 0.230
6VQD HLA-B*27:05 presenting an HIV-1 8mer peptide 提交 2020-02-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；277 K；20 %w/v Polyethylene Glycol 3350, 0.2 M Potassium di-Hydrogen Phosphate
分辨率 1.88 Å R-free 0.206
6VQE HLA-B*27:05 presenting an HIV-1 13mer peptide 提交 2020-02-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；277 K；20 %w/v Polyethylene Glycol 3350, 0.2 M Potassium di-Hydrogen Phosphate
分辨率 1.77 Å R-free 0.186
6VQO T cell receptor-p53-HLA-A2 complex 提交 2020-02-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；295 K；12% (w/v) PEG 8000, 0.1 M magnesium acetate
分辨率 3.00 Å R-free 0.211
6VQO T cell receptor-p53-HLA-A2 complex 提交 2020-02-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；295 K；12% (w/v) PEG 8000, 0.1 M magnesium acetate
分辨率 3.00 Å R-free 0.211
6VQY HLA-B*27:05 presenting an HIV-1 7mer peptide 提交 2020-02-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ARG ARGININE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30 %w/v Polyethylene Glycol Monomethyl Ether 5000, 0.2 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES pH 6.5
分辨率 2.57 Å R-free 0.238
6VQY HLA-B*27:05 presenting an HIV-1 7mer peptide 提交 2020-02-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 ARG ARGININE × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30 %w/v Polyethylene Glycol Monomethyl Ether 5000, 0.2 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES pH 6.5
分辨率 2.57 Å R-free 0.238
6VQZ HLA-B*27:05 presenting an HIV-1 6mer peptide 提交 2020-02-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ARG ARGININE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30 %w/v Polyethylene Glycol Monomethyl Ether 5000, 0.2 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES pH 6.5
分辨率 2.25 Å R-free 0.244
6VQZ HLA-B*27:05 presenting an HIV-1 6mer peptide 提交 2020-02-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 ARG ARGININE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30 %w/v Polyethylene Glycol Monomethyl Ether 5000, 0.2 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES pH 6.5
分辨率 2.25 Å R-free 0.244
6VR1 Complex of HLA-A2, a class I MHC, with a p53 peptide 提交 2020-02-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；296 K；15% PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M magnesium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.274
6VR1 Complex of HLA-A2, a class I MHC, with a p53 peptide 提交 2020-02-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；296 K；15% PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M magnesium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.274
6VR5 Complex of HLA-A2, a class I MHC, with a p53 peptide 提交 2020-02-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；295 K；15% PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M magnesium chloride
分辨率 2.38 Å R-free 0.280
6VR5 Complex of HLA-A2, a class I MHC, with a p53 peptide 提交 2020-02-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；295 K；15% PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M magnesium chloride
分辨率 2.38 Å R-free 0.280
6VRM T cell receptor-p53-HLA-A2 complex 提交 2020-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；295 K；20% (w/v) polyacrylic acid 5100, 0.1 M HEPES, 20 mM MgCl2
分辨率 2.61 Å R-free 0.275
6VRN T cell receptor-p53-HLA-A2 complex 提交 2020-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；295 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2 M ammonium tartrate dibasic
分辨率 2.46 Å R-free 0.259
6W51 Structure of the antibody fragment H2 in complex with HLA-A*02:01/p53R175H 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.2 M Ammonium chloride, 20% w/v PEG 3350
分辨率 3.53 Å R-free 0.283
6W51 Structure of the antibody fragment H2 in complex with HLA-A*02:01/p53R175H 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.2 M Ammonium chloride, 20% w/v PEG 3350
分辨率 3.53 Å R-free 0.283
6W51 Structure of the antibody fragment H2 in complex with HLA-A*02:01/p53R175H 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.2 M Ammonium chloride, 20% w/v PEG 3350
分辨率 3.53 Å R-free 0.283
6W51 Structure of the antibody fragment H2 in complex with HLA-A*02:01/p53R175H 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 K 1–119（119 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.2 M Ammonium chloride, 20% w/v PEG 3350
分辨率 3.53 Å R-free 0.283
6W9U Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with patient MR1-R9H-Ac-6-FP 提交 2020-03-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 TKG 1-[[6-(1-$l^{1}-oxidanylethyl)-4-$l^{3}-oxidanylidene-2,3,6,8~{a}-tetrahydropteridin-2-yl]-$l^{2}-azanyl]ethanone × 1 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.3；298 K；PEG3350, BTP, Cacl2
分辨率 1.89 Å R-free 0.197
6W9U Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with patient MR1-R9H-Ac-6-FP 提交 2020-03-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 TKG 1-[[6-(1-$l^{1}-oxidanylethyl)-4-$l^{3}-oxidanylidene-2,3,6,8~{a}-tetrahydropteridin-2-yl]-$l^{2}-azanyl]ethanone × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.3；298 K；PEG3350, BTP, Cacl2
分辨率 1.89 Å R-free 0.197
6W9V Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with patient MR1-R9H without ligand 提交 2020-03-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.3；298 K；PEG3350, BTP, Cacl2
分辨率 1.95 Å R-free 0.200
6W9V Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with patient MR1-R9H without ligand 提交 2020-03-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.3；298 K；PEG3350, BTP, Cacl2
分辨率 1.95 Å R-free 0.200
6WNA Next generation monomeric IgG4 Fc 提交 2020-04-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；295 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 30% 1,5-diaminopentane dihydrochloride, 0.1 M MES, pH 6 and 20% PEG 6000 at a protein concentration of 6 mg/mL
分辨率 2.40 Å R-free 0.263
6WOL Next generation monomeric IgG4 Fc bound to neonatal Fc receptor 提交 2020-04-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；295 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 1 M sodium iodide, 0.1 M MES, pH 6 and 20% PEG 6000 at a protein concentration of 6.35 mg/mL
分辨率 2.49 Å R-free 0.270
6WZY Structure of DbNA(10) peptides bound to H-2Db MHC-I 提交 2020-05-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；298 K；0.1M sodium citrate pH 5.7, 0.2M LiSO4 and 24-28% (w/v) PEG3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.204
6X00 Structure of DbNA(11) peptides bound to H-2Db MHC-I 提交 2020-05-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；298 K；0.1M sodium citrate pH 5.7, 0.2M Li2SO4 and 24-28% (w/v) PEG3350
分辨率 1.55 Å R-free 0.215
6XQA Crystal Structure of HLA A*2402 in complex with TYQWVLKNL, an 9-mer epitope from Influenza B virus 提交 2020-07-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；24% PEG8000, 0.1 HEPES pH 7.5, 2% isopropanol, 5% w/v Polyvinylpyrrolidone K15
分辨率 2.16 Å R-free 0.229
6XQA Crystal Structure of HLA A*2402 in complex with TYQWVLKNL, an 9-mer epitope from Influenza B virus 提交 2020-07-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；24% PEG8000, 0.1 HEPES pH 7.5, 2% isopropanol, 5% w/v Polyvinylpyrrolidone K15
分辨率 2.16 Å R-free 0.229
6XQP Structure of human D462-E4 TCR in complex with human MR1-5-OP-RU 提交 2020-07-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 GOL GLYCEROL × 2 BR BROMIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；18-26% PEG3350, 100 mM Bis-Tris Propane 200 mM Sodium Bromide
分辨率 2.90 Å R-free 0.235
6XQP Structure of human D462-E4 TCR in complex with human MR1-5-OP-RU 提交 2020-07-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 GOL GLYCEROL × 5 BR BROMIDE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；18-26% PEG3350, 100 mM Bis-Tris Propane 200 mM Sodium Bromide
分辨率 2.90 Å R-free 0.235
6Y26 Crystal structure of HLA-B2705 complexed with the nona-peptide mA 提交 2020-02-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% (w/v) PEG8000, 150 mM NaCl and 100 mM Tris-HCl, pH 7.0
分辨率 1.20 Å R-free 0.174
6Y27 Crystal structure of HLA-B2709 complexed with the nona-peptide mA 提交 2020-02-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20% (w/v) PEG8000, 150 mM NaCl and 100 mM Tris-HCl, pH 7.0
分辨率 1.38 Å R-free 0.194
6Y28 Crystal structure of HLA-B2705 complexed with the nona-peptide mE 提交 2020-02-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20% (w/v) PEG8000, 150 mM NaCl and 100 mM Tris-HCl, pH 7.0
分辨率 1.69 Å R-free 0.236
6Y29 Crystal structure of HLA-B2709 complexed with the nona-peptide mE 提交 2020-02-15 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20% (w/v) PEG8000, 150 mM NaCl and 100 mM Tris-HCl, pH 7.0
分辨率 1.28 Å R-free 0.169
6Y2A Crystal structure of HLA-B2705 complexed with the nona-peptide mQ 提交 2020-02-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20% (w/v) PEG8000, 150 mM NaCl and 100 mM Tris-HCl, pH 7.0
分辨率 1.25 Å R-free 0.155
6Y2B Crystal structure of HLA-B2709 complexed with the nona-peptide mQ 提交 2020-02-15 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20% (w/v) PEG8000, 150 mM NaCl and 100 mM Tris-HCl, pH 7.0
分辨率 1.37 Å R-free 0.181
6Z9V Human Class I Major Histocompatibility Complex, A02 allele, presenting IIGWMWIPV 提交 2020-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 P4G 1-ETHOXY-2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；PACT premier screen, condition G06: 0.2M Na Formate, 0.1M Bis-Tris Propane, 20% PEG 3350
分辨率 2.01 Å R-free 0.216
6Z9V Human Class I Major Histocompatibility Complex, A02 allele, presenting IIGWMWIPV 提交 2020-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 GOL GLYCEROL × 5 SO4 SULFATE ION × 1 P4G 1-ETHOXY-2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANE × 1 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；PACT premier screen, condition G06: 0.2M Na Formate, 0.1M Bis-Tris Propane, 20% PEG 3350
分辨率 2.01 Å R-free 0.216
6Z9W Human Class I Major Histocompatibility Complex, A02 allele, presenting LLGWVFAQV 提交 2020-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；PACT premier screen, condition D02: 0.1M MMT buffer, 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.281
6Z9W Human Class I Major Histocompatibility Complex, A02 allele, presenting LLGWVFAQV 提交 2020-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；PACT premier screen, condition D02: 0.1M MMT buffer, 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.281
6Z9X Human Class I Major Histocompatibility Complex, A02 allele, presenting LLS (t-butyl)Y FGTPT 提交 2020-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；25% PEG 4000, 0.1 M Cacodylate buffer, 5% glycerol
分辨率 2.68 Å R-free 0.241
6Z9X Human Class I Major Histocompatibility Complex, A02 allele, presenting LLS (t-butyl)Y FGTPT 提交 2020-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；25% PEG 4000, 0.1 M Cacodylate buffer, 5% glycerol
分辨率 2.68 Å R-free 0.241
6ZKW Crystal structure of InhA:01 TCR in complex with HLA-E bound to InhA (53-61) 提交 2020-06-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M TRIS pH 8.5, 25 % (w/v) PEG 4000, 15 % Glycerol
分辨率 2.26 Å R-free 0.287
6ZKX Crystal structure of InhA:01 TCR in complex with HLA-E (Y84C) bound to InhA (53-61 GCG) 提交 2020-06-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris pH 8.5, 25% (w/v) PEG 4000, 15% Glycerol
分辨率 2.17 Å R-free 0.244
6ZKY Crystal structure of InhA:01 TCR in complex with HLA-E (S147C) bound to InhA (53-61 H3C) 提交 2020-06-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.1 M Sodium chloride, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 1.5 M Ammonium sulfate
分辨率 2.65 Å R-free 0.273
6ZKZ Crystal structure of InhA:01 TCR in complex with HLA-E (F116C) bound to InhA (53-61 H4C) 提交 2020-06-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris pH 8.5, 20% (w/v) PEG 4000, 15% Glycerol
分辨率 2.30 Å R-free 0.267
7AFV Crystal structure of tetrameric beta-2-microglobulin deltaN6 S52C stabilized by a covalent ligand 提交 2020-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetramer
链 A 27–116（90 aa）
链 B 27–116（90 aa）
未记录 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 SJK 5-oxidanylidene-~{N}-(2-sulfanylethyl)-2,3-dihydro-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-6-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Drop protein volume 0.2 uL Drop well volume 0.1 uL 0.04 M Porpheus Alcohol Mix (Complex ingredient) 0.1 M Morpheus Buffer System 3 pH 8.5 (Buffer) 31 %w/v Morpheus Precipitant Mix 4 (Precipitant) Stock Solutions: Porpheus Alcohol Mix 0.2 M 1,6-hexanediol, 0.2 M 1-butanol, 0.2 M (RS)-1,2-propanediol, 0.2 M 2-propanol, 0.2 M 1,4-butanediol, 0.2 M 1,3-propanediol (for a final concentration of 6.7 mM of 1,6-hexanediol, 1-butanol, (RS)-1,2-propanediol, 2-propanol, 1,4-butanediol, 1,3-propanediol) Morpheus Buffer System 3 pH 8.5 1M Tris and 1M BICINE (for a final concentration of 39.1 mM Bicine pH = 5.03 and 60.9 M Tris pH = 10.83) Morpheus Precipitant Mix 25% w/v PEG 3350, 25% w/v PEG 1000, 25% v/v MPD (for a final concentration of 7.75% w/v PEG 1000, 7.75% w/v PEG 3350 and 7.75% v/v MPD)
分辨率 2.40 Å R-free 0.288
7ALO Structure of B*27:09/photoRL9 提交 2020-10-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；291 K；20% (w/v) polyethylene glycol 3350, and 200 mM KSCN
分辨率 1.80 Å R-free 0.266
7ALO Structure of B*27:09/photoRL9 提交 2020-10-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 7 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；291 K；20% (w/v) polyethylene glycol 3350, and 200 mM KSCN
分辨率 1.80 Å R-free 0.266
7B5F Structure of echovirus 18 in complex with neonatal Fc receptor 提交 2020-12-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：Hexameric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 1 GUN GUANINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3；Mixed in 1:1 volume ratio {20 mM Tris (pH=7.2), 100 mM NaCl} and {8 mM Na2HPO4, 2 mM KH2PO4 (pH=7.4), 137 mM NaCl, 2.7 mM KCl}=PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å R-free 0.311
7BBG CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-A2-WT1-RMF AND FAB 11D06 提交 2020-12-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 8.0, 20% PEG 4000
分辨率 2.64 Å R-free 0.230
7BH8 3H4-Fab HLA-E-VL9 co-complex 提交 2021-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 B 21–119（99 aa）
链 D 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 10 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.5 K；20% PEG 8000, 0.1 M NA HEPES
分辨率 1.80 Å R-free 0.232
7C9V E30 F-particle in complex with FcRn 提交 2020-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-meric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 MYR MYRISTIC ACID × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7C9V E30 F-particle in complex with FcRn 提交 2020-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 MYR MYRISTIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7C9V E30 F-particle in complex with FcRn 提交 2020-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 MYR MYRISTIC ACID × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7C9V E30 F-particle in complex with FcRn 提交 2020-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 MYR MYRISTIC ACID × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7C9V E30 F-particle in complex with FcRn 提交 2020-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 MYR MYRISTIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7C9V E30 F-particle in complex with FcRn 提交 2020-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-meric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 MYR MYRISTIC ACID × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7CIQ Phosphorylation modification of MHC I polypeptide 提交 2020-07-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2MSodiumchloride,0.1MBis-Tris(pH6.5),25%(w/v)PEG 3,350
分辨率 1.59 Å R-free 0.209
7CIR Peptide phosphorylation modification of MHC class I molecules 提交 2020-07-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1M TRIS-HCl (PH7.9) 17.5%(w/v)PEG8000
分辨率 1.81 Å R-free 0.208
7CIS Peptide modification of MHC class I molecules 提交 2020-07-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1 M TRIS-HCl (pH 7.1), 20.5% (w/v) PEG 8,000
分辨率 2.10 Å R-free 0.222
7DUU Crystal structure of HLA molecule with an KIR receptor 提交 2021-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.2 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v PEG 3350
分辨率 2.51 Å R-free 0.246
7DYN Phosphorylation of MHC I peptide 提交 2021-01-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M HEPES (pH 7.5), 25% (w/v) PEG 3,350
分辨率 2.00 Å R-free 0.208
7DZM Crystal Structure of the cross-restricted T18A TCR and HLAB8101 bound to HIV-1 Gag TL9 peptide 提交 2021-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.2 M Potassium chloride, 0.05 M HEPES pH 7.5, 35% v/v Pentaerythritol propoxylate (5/4 PO/OH)
分辨率 2.25 Å R-free 0.240
7DZN Crystal Structure of the cross-restricted T18A TCR and HLAB4201 bound to HIV-1 Gag TL9 peptide 提交 2021-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.1 M SPG pH 7.0, 25 % w/v PEG 1500
分辨率 2.63 Å R-free 0.261
7EDO First insight into marsupial MHC I peptide presentation: immune features of lower mammals paralleled with bats 提交 2021-03-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1 M Na citrate trisbasic dihydrate (pH 5.0) ,30%v/v Jeffamine ED-2001
分辨率 2.70 Å R-free 0.239
7EDO First insight into marsupial MHC I peptide presentation: immune features of lower mammals paralleled with bats 提交 2021-03-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1 M Na citrate trisbasic dihydrate (pH 5.0) ,30%v/v Jeffamine ED-2001
分辨率 2.70 Å R-free 0.239
7EJL Complex Structure of HLA-A*2402 with the Peptide from HCoV(CoV-2) spike protein 提交 2021-04-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；Na/K phosphate
分辨率 1.89 Å R-free 0.255
7EJM Complex Structure of HLA-A*2402 with the Peptide from HCoV(CoV-229E) spike protein 提交 2021-04-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Na citrate, PEG 3350
分辨率 1.71 Å R-free 0.221
7EJN Complex Structure of HLA-A*2402 with the Peptide from HCoV(CoV-HKU1) spike protein 提交 2021-04-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；PEG 3350, Tris-HCl
分辨率 2.11 Å R-free 0.264
7EU2 Complex structure of HLA0201 with recognizing SARS-CoV-2 epitope S1 提交 2021-05-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；287 K；26% PEG 4000, 0.2 M Sodium acetate, and 0.1 M Tris-HCl pH9.0
分辨率 2.80 Å R-free 0.266
7EU2 Complex structure of HLA0201 with recognizing SARS-CoV-2 epitope S1 提交 2021-05-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；287 K；26% PEG 4000, 0.2 M Sodium acetate, and 0.1 M Tris-HCl pH9.0
分辨率 2.80 Å R-free 0.266
7F4W Complex structure of HLA2402 with recognizing SARS-CoV-2 epitope pep4 提交 2021-06-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；287 K；0.1 M HEPES pH8.1 22%(v/v) PEG8000
分辨率 2.90 Å R-free 0.298
7F4W Complex structure of HLA2402 with recognizing SARS-CoV-2 epitope pep4 提交 2021-06-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；287 K；0.1 M HEPES pH8.1 22%(v/v) PEG8000
分辨率 2.90 Å R-free 0.298
7JWI Crystal structure of B17.R2 TCR in complex with H2D-b-NP366 提交 2020-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；20% PEG3350, 0.2 M potassium/sodium tartrate, 0.1 M Bis-tris propane
分辨率 3.02 Å R-free 0.281
7JYU Crystal Structure of HLA-A*2402 in complex with IYFSPIRVTF, an 10-mer epitope from Influenza B virus 提交 2020-09-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20% PEG 8000, 0.2 MgCl2, 0.1 Tris-HCl pH 8.5
分辨率 2.75 Å R-free 0.259
7JYU Crystal Structure of HLA-A*2402 in complex with IYFSPIRVTF, an 10-mer epitope from Influenza B virus 提交 2020-09-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20% PEG 8000, 0.2 MgCl2, 0.1 Tris-HCl pH 8.5
分辨率 2.75 Å R-free 0.259
7JYV Crystal Structure of HLA A*2402 in complex with YFSPIRVTF, an 9-mer influenza epitope 提交 2020-09-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；19% PEG 3350, 0.2 MgCl2
分辨率 1.51 Å R-free 0.206
7JYW Crystal Structure of HLA A*2402 in complex with TYQWIIRNW, an 9-mer influenza epitope 提交 2020-09-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20% PEG3350, 0.2M Na acetate
分辨率 2.90 Å R-free 0.275
7JYX Crystal Structure of HLA A*2402 in complex with TYQWIIRNWET, an 11-mer epitope from Influenza 提交 2020-09-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；24% PEG8000, 0.1 HEPES pH 7.5, 5% v/v Ethyl acetate
分辨率 2.95 Å R-free 0.275
7JYX Crystal Structure of HLA A*2402 in complex with TYQWIIRNWET, an 11-mer epitope from Influenza 提交 2020-09-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；24% PEG8000, 0.1 HEPES pH 7.5, 5% v/v Ethyl acetate
分辨率 2.95 Å R-free 0.275
7K80 KIR3DL1*001 in complex with HLA-A*24:02 presenting the RYPLTFGW peptide 提交 2020-09-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 1 ACT ACETATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；14% PEG 3350, 2% tacsimate, pH 5.0, and 0.1 M trisodium citrate, pH 5.6
分辨率 2.40 Å R-free 0.249
7K80 KIR3DL1*001 in complex with HLA-A*24:02 presenting the RYPLTFGW peptide 提交 2020-09-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；14% PEG 3350, 2% tacsimate, pH 5.0, and 0.1 M trisodium citrate, pH 5.6
分辨率 2.40 Å R-free 0.249
7K81 KIR3DL1*005 in complex with HLA-A*24:02 presenting the RYPLTFGW peptide 提交 2020-09-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；14% PEG 3350, 2% tacsimate, pH 5.0, and 0.1 M trisodium citrate, pH 5.6
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
7KGO Crystal Structure of HLA-A*0201in complex with SARS-CoV-2 N351-359 提交 2020-10-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 3NI NICKEL (III) ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 CD CADMIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；20% PEG3350 w/v, 0.2 M NaFormate, 1 mM CdCl2
分辨率 2.15 Å R-free 0.229
7KGP Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with SARS-CoV-2 N316-324 提交 2020-10-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 CD CADMIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；20% 3350, 0.2M NaFluoride, 1 mM CdCl2
分辨率 1.40 Å R-free 0.203
7KGQ Crystal Structure of HLA-A*0201in complex with SARS-CoV-2 N222-230 提交 2020-10-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；20% PEG3350, 0.2M KFormate, 1mM CaCl2
分辨率 1.34 Å R-free 0.198
7KGR Crystal Structure of HLA-A*0201in complex with SARS-CoV-2 N159-167 提交 2020-10-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；20% PEG3350 w/v, 0.2 M NaFormate
分辨率 1.55 Å R-free 0.221
7KGS Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with SARS-CoV-2 N138-146 提交 2020-10-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；20% PEG3350 w/v, 0.2 M NaFormate, 1 mM CdCl2
分辨率 1.58 Å R-free 0.197
7KGT Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with SARS-CoV-2 N226-234 提交 2020-10-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；20% PEG3350 w/v, 0.2M KFormate, 1mM CdCl2
分辨率 1.90 Å R-free 0.205
7KOZ CD1a-36:2 SM binary complex 提交 2020-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 WU7 (4S,7S,17Z)-4-hydroxy-7-[(1S,2E)-1-hydroxyhexadec-2-en-1-yl]-N,N,N-trimethyl-4,9-dioxo-3,5-dioxa-8-aza-4lambda~5~-phosphahexacos-17-en-1-aminium × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20-25% PEG 1500, 0.1M MMT pH 5.5
分辨率 2.25 Å R-free 0.246
7KP0 CD1a-42:1 SM binary complex 提交 2020-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 WUA (4R,7S)-4-hydroxy-7-[(1S,2E)-1-hydroxyhexadec-2-en-1-yl]-N,N,N-trimethyl-4,9-dioxo-3,5-dioxa-8-aza-4lambda~5~-phosphadotriacontan-1-aminium × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20-25% PEG 1500, 0.1M MMT pH 5.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.264
7KP1 CD1a-42:2 SM binary complex 提交 2020-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 FO4 sphingomyelin × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20-25% PEG 1500, 0.1M MMT pH 5.5
分辨率 2.02 Å R-free 0.226
7L1B Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a wild-type PIK3CA peptide 提交 2020-12-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；10.00 % w/v Polyethylene glycol 8,000, 200 mM Calcium acetate, 100 mM HEPES; pH 7.5
分辨率 2.04 Å R-free 0.221
7L1C Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2020-12-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 FMT FORMIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277.15 K；20% w/v Polyethylene glycol 3,350, 200 mM Ammonium formate, pH 6.6
分辨率 1.96 Å R-free 0.205
7L1D Crystal structure of human 21LT2-2 TCR bound to HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2020-12-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；10% w/v Polyethylene glycol 8,000, 200mM Magnesium acetate
分辨率 3.11 Å R-free 0.250
7LFZ Human leukocyte antigen B*07:02 in complex with SARS-CoV2 epitope IPRRNVATL 提交 2021-01-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；0.1 M sodium citrate, pH 8.0, 20% PEG4000, 20% isopropanol
分辨率 1.90 Å R-free 0.224
7LG0 Human leukocyte antigen B*07:02 in complex with SARS-CoV2 epitope SPRWYFYYL 提交 2021-01-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP RESIDUES 21-119
未记录 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；290 K；0.1 M HEPES-NaOH, pH 7.5, 2 M ammonium sulfate
分辨率 2.30 Å R-free 0.268
7LG2 Human leukocyte antigen A*0201 in complex with SARS-CoV2 epitope ALWEIQQVV 提交 2021-01-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；290 K；25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 0.2 M magnesium chloride
分辨率 2.40 Å R-free 0.254
7LG3 Human leukocyte antigen A*0201 in complex with SARS-CoV2 epitope KLWAQCVQL 提交 2021-01-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；290 K；20% PEG4000, 0.1 M sodium acetate, pH 5.6, 20% isopropanol
分辨率 2.30 Å R-free 0.248
7LGD HLA-B*07:02 in complex with SARS-CoV-2 nucleocapsid peptide N105-113 提交 2021-01-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；2M Ammonium Sulfate, 0.1M HEPES pH 7.5
分辨率 2.88 Å R-free 0.269
7LGD HLA-B*07:02 in complex with SARS-CoV-2 nucleocapsid peptide N105-113 提交 2021-01-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；2M Ammonium Sulfate, 0.1M HEPES pH 7.5
分辨率 2.88 Å R-free 0.269
7LGT HLA-B*07:02 in complex with 229E-derived coronavirus nucleocapsid peptide N75-83 提交 2021-01-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 8 K POTASSIUM ION × 8 BR BROMIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18% PEG 3350, 0.2 M KI
分辨率 1.97 Å R-free 0.246
7LGT HLA-B*07:02 in complex with 229E-derived coronavirus nucleocapsid peptide N75-83 提交 2021-01-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 NA SODIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 K POTASSIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18% PEG 3350, 0.2 M KI
分辨率 1.97 Å R-free 0.246
7LLI Stimulatory immune receptor protein complex 提交 2021-02-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；30-40% PEG 400, 0.1/0.2 HEPES pH 7.5, 0.2M MgCl2
分辨率 3.20 Å R-free 0.263
7LLI Stimulatory immune receptor protein complex 提交 2021-02-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；30-40% PEG 400, 0.1/0.2 HEPES pH 7.5, 0.2M MgCl2
分辨率 3.20 Å R-free 0.263
7LLJ Inhibitory immune receptor protein complex 提交 2021-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；30-40% PEG 400, 0.1/0.2 HEPES pH 7.5, 0.2M MgCl2
分辨率 3.15 Å R-free 0.276
7LLJ Inhibitory immune receptor protein complex 提交 2021-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；30-40% PEG 400, 0.1/0.2 HEPES pH 7.5, 0.2M MgCl2
分辨率 3.15 Å R-free 0.276
7M8S Crystal Structure of HLA-A*02:01 in complex with KLNDLCFTNV, an 10-mer epitope from SARS-CoV-2 Spike (S386-395) 提交 2021-03-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.2 Ammonium tantrate, 0.001 Cadmium chloride, 14% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.247
7M8S Crystal Structure of HLA-A*02:01 in complex with KLNDLCFTNV, an 10-mer epitope from SARS-CoV-2 Spike (S386-395) 提交 2021-03-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.2 Ammonium tantrate, 0.001 Cadmium chloride, 14% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.247
7M8T Crystal Structure of HLA-A*11:01 in complex with NSASFSTFK, an 9-mer epitope from SARS-CoV-2 spike (S370-378) 提交 2021-03-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；2M Ammonium Sulfate, 0.1M Calcium cacodylate pH 6.5, 0.2M sodium chloride
分辨率 1.50 Å R-free 0.219
7M8U Crystal Structure of HLA-B*35:01 in complex with IPFAMQMAY, an 9-mer epitope from SARS-CoV-2 spike (S896-904) 提交 2021-03-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 sodium fluoride, 18% PEG 3350
分辨率 1.45 Å R-free 0.229
7MJ6 HLA-A*02:01 bound to Neuroblastoma Derived IGFBPL1 peptide 提交 2021-04-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；1M Sodium Citrate Dibasic, 0.1M Sodium Cacodylate pH 6.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.196
7MJ7 HLA-A*02:01 bound to Neuroblastoma Derived IGFBPL1 peptide 提交 2021-04-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；1M Sodium Citrate Dibasic, 0.1M Sodium Cacodylate pH 6.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.192
7MJ8 HLA-A*02:01 bound to Neuroblastoma Derived IGFBPL1 peptide 提交 2021-04-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；1M Sodium Citrate Dibasic, 0.1M Sodium Cacodylate pH 6.5
分辨率 1.79 Å R-free 0.190
7MJ9 HLA-A*02:01 bound to Neuroblastoma Derived mutant IGFBPL1 peptide 提交 2021-04-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M Magnesium Chloride, 0.1 M HEPES pH 7, 20 % PEG 6000
分辨率 1.75 Å R-free 0.194
7MJA HLA-A*24:02 bound to Neuroblastoma derived PHOX2B peptide 提交 2021-04-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 10% PEG 6000
分辨率 1.69 Å R-free 0.199
7MLE Crystal Structure of HLA-A*03:01 in complex with VVRPSVASK, an 9-mer epitope from Influenza B virus 提交 2021-04-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；1M trisodium citrate, 0.1M sodium cacodylate pH 6.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.264
7MX4 CD1c with antigen analogue 1 提交 2021-05-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ZPD (4S,8R,12S,16S,20S)-4,8,12,16,20-pentamethylheptacosyl (1R,2S,3S,4R,5R)-2,3,4-trihydroxy-5-(hydroxymethyl)cyclohexyl hydrogen (R)-phosphate × 1 D12 DODECANE × 1 ZP7 (2S)-2,3-dihydroxypropyl hexadecanoate × 1 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 MLA MALONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.4；293 K；100 mM CHES, 1.05 M sodium citrate, 25 mM triglycine
分辨率 1.73 Å R-free 0.239
7MXF CD1c with antigen analogue 2 提交 2021-05-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 ZQ4 2,6-anhydro-1-deoxy-1-[(S)-hydroxy{[(4R,8S,12R,16R,20S)-4,8,12,16,20-pentamethylheptacosyl]oxy}phosphoryl]-D-glycero-D-galacto-heptitol × 1 D12 DODECANE × 1 ZP7 (2S)-2,3-dihydroxypropyl hexadecanoate × 1 MLA MALONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.4；293 K；100 mM CHES, 1.05 M sodium citrate, 25 mM triglycine
分辨率 2.00 Å R-free 0.242
7MXH CD1c with antigen analogue 3 提交 2021-05-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ZQ7 2,6-anhydro-1-deoxy-1,1-difluoro-1-[(R)-hydroxy{[(4S,8S,12S,16S,20S)-4,8,12,16,20-pentamethylheptacosyl]oxy}phosphoryl]-D-glycero-D-galacto-heptitol × 1 D12 DODECANE × 1 ZP7 (2S)-2,3-dihydroxypropyl hexadecanoate × 1 MLA MALONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.4；293 K；100 mM CHES, 1.05 M sodium citrate, 25 mM triglycine
分辨率 2.11 Å R-free 0.255
7N1A SARS-CoV-2 YLQ peptide binds to HLA-A2 提交 2021-05-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.2M Potassium thiocyanate (pH 7.0), 22% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.06 Å R-free 0.241
7N1A SARS-CoV-2 YLQ peptide binds to HLA-A2 提交 2021-05-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.2M Potassium thiocyanate (pH 7.0), 22% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.06 Å R-free 0.241
7N1B SARS-CoV-2 RLQ peptide binds to HLA-A2 提交 2021-05-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M MES (pH 6.5), 20% (w/v) PEG 8000 by micro-seeding
分辨率 2.81 Å R-free 0.269
7N1B SARS-CoV-2 RLQ peptide binds to HLA-A2 提交 2021-05-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M MES (pH 6.5), 20% (w/v) PEG 8000 by micro-seeding
分辨率 2.81 Å R-free 0.269
7N1E SARS-CoV-2 RLQ peptide-specific TCR pRLQ3 binds to RLQ-HLA-A2 提交 2021-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M MES (pH 6.0), 12% (w/v) PEG 4000
分辨率 2.30 Å R-free 0.258
7N1F SARS-CoV-2 YLQ peptide-specific TCR pYLQ7 binds to YLQ-HLA-A2 提交 2021-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；295 K；in 0.1M Ammonium sulfate, 0.3M Sodium formate, 0.1M Sodium acetate (pH 5.0), 3% (w/v) Gama-PGA (Na+ form, LM), 3% (w/v) PEG 20000
分辨率 2.39 Å R-free 0.236
7N2N TCR-antigen complex AS4.2-PRPF3-HLA*B27 提交 2021-05-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350 with 0.2M Potassium phosphate monobasic
分辨率 2.60 Å R-free 0.291
7N2O AS4.2-YEIH-HLA*B27 提交 2021-05-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350 with 0.2M Ammonium acetate
分辨率 2.30 Å R-free 0.267
7N2P AS4.3-RNASEH2b-HLA*B27 提交 2021-05-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350 with 0.2M Magnesium formate dihydrate
分辨率 2.50 Å R-free 0.288
7N2Q AS4.3-YEIH-HLA*B27 提交 2021-05-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG3350 with 0.2M Ammonium sulfate and 0.1M BIS-TRIS pH 6.5
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
7N2Q AS4.3-YEIH-HLA*B27 提交 2021-05-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG3350 with 0.2M Ammonium sulfate and 0.1M BIS-TRIS pH 6.5
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
7N2R AS4.3-PRPF3-HLA*B27 提交 2021-05-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ASP ASPARTIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG3350 with 0.2M Ammonium sulfate and 0.1M BIS-TRIS pH 6.5
分辨率 2.28 Å R-free 0.288
7N2S AS3.1-PRPF3-HLA*B27 提交 2021-05-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG3350 with 0.2M Ammonium tartrate dibasic dihydrate
分辨率 2.37 Å R-free 0.311
7N4K 6218 TCR in complex with H2-Db PA 224 提交 2021-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG3350, 0.2 M NaF, 0.05 M NaForm, 1% 1,5-Diaminopentane dihydrochloride
分辨率 1.85 Å R-free 0.214
7N5C 6218 TCR in complex with H2Db PA with an engineered TCR-pMHC disulfide bond 提交 2021-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG3350, 0.2M NaF, 0.05M NaForm, 1% 1,5-Diaminopentane dihydrochloride
分辨率 1.87 Å R-free 0.233
7N5P 6218 TCR in complex with H2-Db PA224-233 with a cysteine mutant 提交 2021-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG3350, 0.2M NaF, 0.05M NaForm, 1% 1,5-Diaminopentane dihydrochloride
分辨率 2.09 Å R-free 0.236
7N5Q Peptide-MHC complex of mouse H2-Db presenting PA224 with E4C mutation 提交 2021-06-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 8 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG2000, 0.1M KSCN, 2% MPD
分辨率 1.76 Å R-free 0.218
7N5Q Peptide-MHC complex of mouse H2-Db presenting PA224 with E4C mutation 提交 2021-06-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG2000, 0.1M KSCN, 2% MPD
分辨率 1.76 Å R-free 0.218
7N6D HLA peptide complex 提交 2021-06-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；20% PEG3350, 0.2 M sodium thiocyanate
分辨率 2.30 Å R-free 0.247
7N6D HLA peptide complex 提交 2021-06-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；20% PEG3350, 0.2 M sodium thiocyanate
分辨率 2.30 Å R-free 0.247
7N6D HLA peptide complex 提交 2021-06-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；20% PEG3350, 0.2 M sodium thiocyanate
分辨率 2.30 Å R-free 0.247
7N6D HLA peptide complex 提交 2021-06-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 N 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；20% PEG3350, 0.2 M sodium thiocyanate
分辨率 2.30 Å R-free 0.247
7N6E TCR peptide HLA-A2 complex 提交 2021-06-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；20% PEG3350, 0.2 M sodium thiocyanate, 100 mM Tris-Cl
分辨率 3.20 Å R-free 0.294
7N6E TCR peptide HLA-A2 complex 提交 2021-06-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；20% PEG3350, 0.2 M sodium thiocyanate, 100 mM Tris-Cl
分辨率 3.20 Å R-free 0.294
7N9J Crystal structure of H2DB in complex with HSF2 melanoma neoantigen 提交 2021-06-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；290 K；25% PEG3350, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, 0.2 M sodium acetate, 30% PEG4000
分辨率 1.74 Å R-free 0.213
7NA5 Structure of the H2DB-TCR ternary complex with HSF2 melanoma neoantigen 提交 2021-06-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 13 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；290 K；25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 0.2 M lithium sulfate, 15% glycerol
分辨率 2.50 Å R-free 0.249
7NDQ Gag:02 TCR in complex with HLA-E. 提交 2021-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 BBB 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；23.2% (w/v) PEG 1500, 93 mM MMT pH 9.0
分辨率 2.55 Å R-free 0.296
7NDT UL40:01 TCR in complex with HLA-E with a non-natural amino acid 提交 2021-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 BBB 21–119（99 aa）
链 GGG 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；12% (w/v) PEG 8000, 55 mM MOPS pH 6.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.269
7NDU Gag:02 TCR in complex with HLA-E featuring a non-natural amino acid 提交 2021-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 BBB 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；22.3% (w/v) PEG 1500, 89 mM MMT pH 9.0
分辨率 2.90 Å R-free 0.301
7NMC Crystal structure of beta-2-microglobulin D76E mutant 提交 2021-02-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；100 nL mother liquor / 200 nL protein 15% Glycerol, 0.1 M NaAcetate pH 4.5-5.5, 28-32%PEG 4000, 0.2 M NH4Acetate
分辨率 1.20 Å R-free 0.179
7NMD Human Major Histocompatibility Complex A24 Allele presenting QLPRLFPLL 提交 2021-02-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 4000, 0.1 M TRIS (pH 7.5), 15% glycerol.
分辨率 2.25 Å R-free 0.265
7NMD Human Major Histocompatibility Complex A24 Allele presenting QLPRLFPLL 提交 2021-02-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 4000, 0.1 M TRIS (pH 7.5), 15% glycerol.
分辨率 2.25 Å R-free 0.265
7NME Human MHC Class I, A24 Allele presenting QLPRLFPLL, Complex with 4C6 TCR 提交 2021-02-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；291 K；Molecular Dimensions Pact Premier C06: 0.1M PCTCP buffer, 25% PEG 1500, pH 9.0
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
7NMF Human MHC Class I, A24 Allele presenting QLPRLFPLL, Complex with 4C6 TCR, monoclinic form 提交 2021-02-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1M Sodium Bromide, 0.1 M bis-tris Propane, pH 7.5, 20% PEG 3350
分辨率 2.98 Å R-free 0.259
7NMG Human MHC Class I, A24 Allele presenting LWM, Complex with 4C6 TCR 提交 2021-02-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 1500, 0.1M PCTP Buffer, pH 9.0
分辨率 2.48 Å R-free 0.271
7NMO Crystal structure of beta-2-microglobulin D76A mutant 提交 2021-02-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；100 nL mother liquor / 200 nL protein 15% Glycerol, 0.1 M NaAcetate pH 4.5-5.5, 28-32%PEG 4000, 0.2 M NH4Acetate
分辨率 1.20 Å R-free 0.159
7NMR Crystal structure of beta-2-microglobulin D76S mutant 提交 2021-02-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 21–117（97 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；100 nL mother liquor / 200 nL protein 15% Glycerol, 0.1 M NaAcetate pH 4.5-5.5, 28-32%PEG 4000, 0.2 M NH4Acetate
分辨率 1.15 Å R-free 0.182
7NMT Crystal structure of beta-2-microglobulin D76G mutant 提交 2021-02-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；100 nL mother liquor / 200 nL protein 15% Glycerol, 0.1 M NaAcetate pH 4.5-5.5, 28-32%PEG 4000, 0.2 M NH4Acetate
分辨率 1.20 Å R-free 0.174
7NMV Crystal structure of beta-2-microglobulin D76Q mutant 提交 2021-02-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；100 nL mother liquor / 200 nL protein 15% Glycerol, 0.1 M NaAcetate pH 4.5-5.5, 28-32%PEG 4000, 0.2 M NH4Acetate
分辨率 1.51 Å R-free 0.266
7NMY Crystal structure of beta-2-microglobulin D76Y mutant 提交 2021-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 21–119（99 aa）
突变：D76Y 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；100 nL mother liquor / 200 nL protein 15% Glycerol, 0.1 M NaAcetate pH 4.5-5.5, 28-32%PEG 4000, 0.2 M NH4Acetate
分辨率 1.25 Å R-free 0.227
7NN5 Crystal structure of beta-2-microglobulin D76K mutant 提交 2021-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 21–118（98 aa）
突变：D76K 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；100 nL mother liquor / 200 nL protein 15% Glycerol, 0.1 M NaAcetate pH 4.5-5.5, 28-32%PEG 4000, 0.2 M NH4Acetate
分辨率 1.24 Å R-free 0.230
7NUI Crystal structure of HLA-B*08:01 in complex with ELRSRYWAI viral peptide 提交 2021-03-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；289.15 K；0.2 M sodium iodide, 0.1 M Bis-Tris propane, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.282
7OW3 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS peptide (VVVGAGGVGK) 提交 2021-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium cacodylate pH 6, 25% PEG 4000
分辨率 2.46 Å R-free 0.260
7OW3 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS peptide (VVVGAGGVGK) 提交 2021-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium cacodylate pH 6, 25% PEG 4000
分辨率 2.46 Å R-free 0.260
7OW3 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS peptide (VVVGAGGVGK) 提交 2021-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium cacodylate pH 6, 25% PEG 4000
分辨率 2.46 Å R-free 0.260
7OW3 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS peptide (VVVGAGGVGK) 提交 2021-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium cacodylate pH 6, 25% PEG 4000
分辨率 2.46 Å R-free 0.260
7OW4 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12D peptide (VVVGADGVGK) 提交 2021-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Lithium sulfate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 25% w/v PEG 3500
分辨率 1.81 Å R-free 0.249
7OW4 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12D peptide (VVVGADGVGK) 提交 2021-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Lithium sulfate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 25% w/v PEG 3500
分辨率 1.81 Å R-free 0.249
7OW4 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12D peptide (VVVGADGVGK) 提交 2021-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Lithium sulfate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 25% w/v PEG 3500
分辨率 1.81 Å R-free 0.249
7OW4 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12D peptide (VVVGADGVGK) 提交 2021-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Lithium sulfate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 25% w/v PEG 3500
分辨率 1.81 Å R-free 0.249
7OW5 Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVVGAGGVGK) 提交 2021-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.58 Å R-free 0.274
7OW6 Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS G12D peptide (VVVGADGVGK) 提交 2021-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.64 Å R-free 0.268
7P3D MHC I A02 Allele presenting YLQPRTFLL 提交 2021-07-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M sodium nitrate, 0.1 M Bis Tris propane pH 7.5, and 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.67 Å R-free 0.231
7P3E MHC I A02 Allele presenting YLQLRTFLL 提交 2021-07-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 12 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M sodium iodide, 0.1 M Bis Tris propane pH 7.5, and 20 % w/v PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.248
7P3E MHC I A02 Allele presenting YLQLRTFLL 提交 2021-07-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 12 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M sodium iodide, 0.1 M Bis Tris propane pH 7.5, and 20 % w/v PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.248
7P49 HLA-E*01:03 in complex with Mtb14 提交 2021-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；3 M AS, 0.1 M MES pH 6
分辨率 2.05 Å R-free 0.279
7P49 HLA-E*01:03 in complex with Mtb14 提交 2021-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 SO4 SULFATE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；3 M AS, 0.1 M MES pH 6
分辨率 2.05 Å R-free 0.279
7P49 HLA-E*01:03 in complex with Mtb14 提交 2021-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 6 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；3 M AS, 0.1 M MES pH 6
分辨率 2.05 Å R-free 0.279
7P49 HLA-E*01:03 in complex with Mtb14 提交 2021-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 6 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；3 M AS, 0.1 M MES pH 6
分辨率 2.05 Å R-free 0.279
7P4B HLA-E*01:03 in complex with IL9 提交 2021-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.5 K；2.2 M AS 0.1 M MES pH 5.8
分辨率 1.72 Å R-free 0.237
7P4B HLA-E*01:03 in complex with IL9 提交 2021-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 7 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.5 K；2.2 M AS 0.1 M MES pH 5.8
分辨率 1.72 Å R-free 0.237
7P4B HLA-E*01:03 in complex with IL9 提交 2021-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.5 K；2.2 M AS 0.1 M MES pH 5.8
分辨率 1.72 Å R-free 0.237
7P4B HLA-E*01:03 in complex with IL9 提交 2021-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 7 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.5 K；2.2 M AS 0.1 M MES pH 5.8
分辨率 1.72 Å R-free 0.237
7PB2 Crystal structure of JDI TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS G12D peptide (VVVGADGVGK) 提交 2021-07-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 20 % PEG 8000
分辨率 3.41 Å R-free 0.254
7PB2 Crystal structure of JDI TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS G12D peptide (VVVGADGVGK) 提交 2021-07-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 20 % PEG 8000
分辨率 3.41 Å R-free 0.254
7PBC Crystal structure of engineered TCR (796) complexed to HLA-A*02:01 presenting MAGE-A10 9-mer peptide 提交 2021-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 DDD 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2M Sodium bromide, 0.1M Bis-Tris propane pH 8.5, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.04 Å R-free 0.236
7PBE Emergence of immune escape at dominant SARS-CoV-2 killer T-cell epitope 提交 2021-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M ammonium sulphate, 0.1 M Tris, pH 8.5, and 25 % w/v PEG 4000
分辨率 3.00 Å R-free 0.296
7PBE Emergence of immune escape at dominant SARS-CoV-2 killer T-cell epitope 提交 2021-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M ammonium sulphate, 0.1 M Tris, pH 8.5, and 25 % w/v PEG 4000
分辨率 3.00 Å R-free 0.296
7PDW Crystal structure of parent TCR (728) complexed to HLA-A*02:01 presenting MAGE-A10 9-mer peptide 提交 2021-08-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 DDD 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.02M Sodium/potassium phosphate, 0.1M Bis-Tris propane pH 6.5, 20% w/v PEG 3350
分辨率 1.82 Å R-free 0.229
7PDW Crystal structure of parent TCR (728) complexed to HLA-A*02:01 presenting MAGE-A10 9-mer peptide 提交 2021-08-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 III 21–119（99 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.02M Sodium/potassium phosphate, 0.1M Bis-Tris propane pH 6.5, 20% w/v PEG 3350
分辨率 1.82 Å R-free 0.229
7PHR Structure of a fully assembled T-cell receptor engaging a tumor-associated peptide-MHC I 提交 2021-08-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 L 20–119（100 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
7Q15 Crystal structure of FcRn and beta-2-microglobulin in complex with IgG1-Fc-MST-HN (efgartigimod) 提交 2021-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–119（119 aa）
链 D 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；294 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 7
分辨率 3.30 Å R-free 0.231
7Q98 MHC Class I A02 Allele presenting NLSALGIFST 提交 2021-11-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；25% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulphate, Sodium Cacodylate buffer 0.1 M, pH 6.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
7Q98 MHC Class I A02 Allele presenting NLSALGIFST 提交 2021-11-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 SO4 SULFATE ION × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；25% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulphate, Sodium Cacodylate buffer 0.1 M, pH 6.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
7Q98 MHC Class I A02 Allele presenting NLSALGIFST 提交 2021-11-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；25% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulphate, Sodium Cacodylate buffer 0.1 M, pH 6.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
7Q98 MHC Class I A02 Allele presenting NLSALGIFST 提交 2021-11-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；25% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulphate, Sodium Cacodylate buffer 0.1 M, pH 6.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
7Q98 MHC Class I A02 Allele presenting NLSALGIFST 提交 2021-11-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 N 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；25% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulphate, Sodium Cacodylate buffer 0.1 M, pH 6.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
7Q99 MHC Class I A02 Allele presenting NLSALGIFST, in complex with Mel5 TCR 提交 2021-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 25% PEG 4000, 15% Glycerol, pH 7.5
分辨率 2.55 Å R-free 0.272
7Q9A MHC Class I A02 Allele presenting LLLGIGILVL, in complex with Mel5 TCR 提交 2021-11-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M TRIS, 15% PEG 8000, 15% Glycerol, pH 7.5
分辨率 2.10 Å R-free 0.243
7Q9B MHC Class I A02 Allele presenting EAAGIGILTV, in complex with Mel8 TCR 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 BBB 21–119（99 aa）
链 GGG 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K
分辨率 3.24 Å R-free 0.277
7QNG Structure of a MHC I-Tapasin-ERp57 complex 提交 2021-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；100 mM Gly-Gly, AMPD, pH 8.5, 300 mM lithium sulfate, 300 mM sodium sulfate, 300 mM potassium sulfate, 20% (v/v) PEG8000, 40% (v/v) 1,5-pentanediol
分辨率 2.70 Å R-free 0.229
7QPD Structure of the human MHC I peptide-loading complex editing module 提交 2022-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
7QPJ Crystal structure of engineered TCR (756) complexed to HLA-A*02:01 presenting MAGE-A10 9-mer peptide 提交 2022-01-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.15 K；0.2M Sodium chloride, 0.1M MES pH 6.0, 20% w/v PEG 6000
分辨率 1.54 Å R-free 0.236
7R7V Crystal structure of HLA-B*5301 complex with an HIV-1 Gag-derived epitope QW9 提交 2021-06-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；30% w/v PEG8000, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate, pH 6.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.199
7R7W Crystal structure of HLA-B*5301 complex with an HIV-1 Gag-derived epitope QW9 S3T variant 提交 2021-06-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；30% w/v PEG8000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate, pH 6.5
分辨率 1.17 Å R-free 0.158
7R7X Crystal structure of HLA-B*5701 complex with an HIV-1 Gag-derived epitope QW9 提交 2021-06-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；15-20% w/v PEG4000, 20% w/v 2-propanol, 0.1 M MES, pH 6.5
分辨率 2.10 Å R-free 0.219
7R7X Crystal structure of HLA-B*5701 complex with an HIV-1 Gag-derived epitope QW9 提交 2021-06-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；15-20% w/v PEG4000, 20% w/v 2-propanol, 0.1 M MES, pH 6.5
分辨率 2.10 Å R-free 0.219
7R7Y Crystal structure of HLA-B*5701 complex with an HIV-1 Gag-derived epitope QW9 S3T variant 提交 2021-06-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 22–119（98 aa） 片段：UNP residues 22-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；30% w/v PEG8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate, pH 6.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.189
7R80 Crystal structure of C3 TCR complex with QW9-bound HLA-B*5301 提交 2021-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 21-23% PEG3350
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
7RE7 TCR mimic antibody (Fab fragment) in complex with AFP/HLA-A*02 提交 2021-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 4 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；296.15 K；18% v/v PEG 3350 and 0.2 M sodium formate solution, pH 7.2
分辨率 2.55 Å R-free 0.220
7RE7 TCR mimic antibody (Fab fragment) in complex with AFP/HLA-A*02 提交 2021-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；296.15 K；18% v/v PEG 3350 and 0.2 M sodium formate solution, pH 7.2
分辨率 2.55 Å R-free 0.220
7RE8 Class I MHC (HLA-A*02) presenting alpha fetoprotein peptide (AFP) 提交 2021-07-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；25 mM MES pH6.5, 150 mM NaCl, 25% v/v PEG 3350
分辨率 2.82 Å R-free 0.239
7RE8 Class I MHC (HLA-A*02) presenting alpha fetoprotein peptide (AFP) 提交 2021-07-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；25 mM MES pH6.5, 150 mM NaCl, 25% v/v PEG 3350
分辨率 2.82 Å R-free 0.239
7RK7 The complex between TIL 1383i TCR and human Class I MHC HLA-A2 with the bound Tyrosinase(369-377)(N371D) nonameric peptide 提交 2021-07-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；16% PEG 3350, 2% tacsimate, 100mM Tris (pH 8.5)
分辨率 2.54 Å R-free 0.255
7RM4 Neoantigen p53R175H-specific TCR 6-11 binds to p53R175H-HLA-A2 提交 2021-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris propane (pH 8.5), and 0.2 M Potassium thiocyanate
分辨率 3.33 Å R-free 0.295
7RM4 Neoantigen p53R175H-specific TCR 6-11 binds to p53R175H-HLA-A2 提交 2021-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris propane (pH 8.5), and 0.2 M Potassium thiocyanate
分辨率 3.33 Å R-free 0.295
7RM4 Neoantigen p53R175H-specific TCR 6-11 binds to p53R175H-HLA-A2 提交 2021-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris propane (pH 8.5), and 0.2 M Potassium thiocyanate
分辨率 3.33 Å R-free 0.295
7RM4 Neoantigen p53R175H-specific TCR 6-11 binds to p53R175H-HLA-A2 提交 2021-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris propane (pH 8.5), and 0.2 M Potassium thiocyanate
分辨率 3.33 Å R-free 0.295
7RRG Crystal structure of human 0606T1-2 TCR bound to HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2021-08-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；12% w/v Polyethylene glycol 3,350, 100 mM Succinic acid
分辨率 2.12 Å R-free 0.221
7RTD SARS-CoV-2 Spike-derived peptide S269-277 (YLQPRTFLL) presented by HLA-A*02:01 提交 2021-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2M NaFluoride
分辨率 2.05 Å R-free 0.235
7RTR YLQ-SG3 TCR in complex with SARS-CoV-2 Spike-derived peptide S269-277 (YLQPRTFLL) presented by HLA-A*02:01 提交 2021-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350, 0.05 M Zinc Acetate
分辨率 2.60 Å R-free 0.235
7RYM CD1a-endo-gdTCR complex 提交 2021-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350, 0.2M Ammonium Sulfate
分辨率 3.20 Å R-free 0.286
7RYN CD1a-sulfatide-gdTCR complex 提交 2021-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CIS (15Z)-N-((1S,2R,3E)-2-HYDROXY-1-{[(3-O-SULFO-BETA-D-GALACTOPYRANOSYL)OXY]METHYL}HEPTADEC-3-ENYL)TETRACOS-15-ENAMIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15% PEG 4000, 0.15M Ammonium Sulfate, 0.1M MES pH6
分辨率 2.70 Å R-free 0.268
7RYO CD1a-dideoxymycobactin-gdTCR complex 提交 2021-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 WGR dideoxymycobactin-838 × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Ammonium sulfate
分辨率 3.00 Å R-free 0.267
7RZD CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH MLL(747-755) PEPTIDE 提交 2021-08-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；18-24%PEG4000, 0.1M SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291K
分辨率 1.82 Å R-free 0.236
7RZJ CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH MLL(747-755) PHOSPHOPEPTIDE 提交 2021-08-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；18-24%PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 1.80 Å R-free 0.217
7S79 STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH SYNTHETIC PHOSPHONO-MLL PEPTIDE ANALOG 提交 2021-09-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 4 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；18-24% PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE
分辨率 1.53 Å R-free 0.196
7S7D STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH SYNTHETIC SULFO-MLL PEPTIDE ANALOG 提交 2021-09-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；18-24% PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE
分辨率 1.56 Å R-free 0.195
7S7E STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH DOT1L(998-1006) PEPTIDE 提交 2021-09-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；18-24% PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE
分辨率 2.04 Å R-free 0.235
7S7F STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH DOT1L(998-1006) PHOSPHOPEPTIDE 提交 2021-09-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；18-24% PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE
分辨率 1.88 Å R-free 0.217
7S8A STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH MLL(747-755) PHOSPHOPEPTIDE, CUBIC CRYSTAL FORM 提交 2021-09-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 12P DODECAETHYLENE GLYCOL × 1 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；35% PEG4000, 0.1M TRIS-HCL, PH 8.5, 0.2M SODIUM ACETATE, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE
分辨率 2.10 Å R-free 0.206
7S8E STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH MLL(747-755) PHOSPHOPEPTIDE AND BOUND GLYCEROL 提交 2021-09-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；18-24%PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE
分辨率 1.60 Å R-free 0.195
7S8F STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH MLL(747-755) PEPTIDE AND BOUND GLYCEROL 提交 2021-09-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；18-26%PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE
分辨率 1.80 Å R-free 0.206
7S8Q Crystal Structure of HLA A*1101 in complex with KTNGNAFIGK, an 10-mer epitope from Influenza B 提交 2021-09-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG 3350, 0.1M BisTris pH 6.5
分辨率 2.08 Å R-free 0.217
7S8Q Crystal Structure of HLA A*1101 in complex with KTNGNAFIGK, an 10-mer epitope from Influenza B 提交 2021-09-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG 3350, 0.1M BisTris pH 6.5
分辨率 2.08 Å R-free 0.217
7S8R Crystal Structure of HLA A*1101 in complex with SALEWIKNK, an 9-mer epitope from Influenza B 提交 2021-09-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M Ammonium Sulfate, 0.1 Tris pH 8, 0.2 Lithium Sulfate, 2% PEG 400
分辨率 2.95 Å R-free 0.278
7S8R Crystal Structure of HLA A*1101 in complex with SALEWIKNK, an 9-mer epitope from Influenza B 提交 2021-09-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M Ammonium Sulfate, 0.1 Tris pH 8, 0.2 Lithium Sulfate, 2% PEG 400
分辨率 2.95 Å R-free 0.278
7S8S Crystal Structure of HLA A*1101 in complex with RVLVNGTFLK, an 10-mer epitope from Influenza B 提交 2021-09-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；26% PEG 3350, 0.1M BisTris pH 6.3, 0.2M Lithium Sulfate
分辨率 1.87 Å R-free 0.225
7SA2 SARS-CoV-2 spike-derived peptide S1060-1068 (VVFLHVTYV) presented by HLA-A*02:01 提交 2021-09-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 CD CADMIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M K formate, 1 mM CdCl2
分辨率 1.85 Å R-free 0.196
7SH4 CD1a-phosphatidylglycerol binary structure 提交 2021-10-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MW9 (21R,24R,27S)-24,27,28-trihydroxy-18,24-dioxo-19,23,25-trioxa-24lambda~5~-phosphaoctacosan-21-yl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；20-25% PEG 1500, 0.1M MMT pH 5.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.230
7SIF Crystal Structure of HLA B*3505 in complex with NPDIVIYQY, an 9-mer epitope from HIV-I 提交 2021-10-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M BIS-TRIS, 25% PEG3350
分辨率 1.73 Å R-free 0.230
7SIG Crystal Structure of HLA B*3501 in complex with NPDIVIYQY, an 9-mer epitope from HIV-I 提交 2021-10-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2M Ammonium Acetate, 20% PEG4000
分辨率 1.74 Å R-free 0.216
7SIH Crystal Structure of HLA B*3503 in complex with NPDIVIYQY, an 9-mer epitope from HIV-I 提交 2021-10-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M HEPES, 20% PEG8000
分辨率 1.90 Å R-free 0.232
7SIS SARS-CoV-2 Spike-derived peptide S976-984 (VLNDILSRL) presented by HLA-A*02:01 提交 2021-10-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 ACT ACETATE ION × 1 CD CADMIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Ammonium Formate, 1 mM CdCl2
分辨率 1.90 Å R-free 0.206
7STF Structure of KRAS G12V/HLA-A*03:01 in complex with antibody fragment V2 提交 2021-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 19–119（101 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
7SU9 KRAS-G12D specific TCR9a in complex with C*05-GADGVGKSL 提交 2021-11-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；293 K；22% PEG 3350, 0.1 M Mops and 0.25 M MgSO4
分辨率 1.99 Å R-free 0.214
7T0L HLA-B*27:05 in complex with the pan-HLA-Ia monoclonal antibody W6/32 提交 2021-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 5000 MME, 0.1 M Bis-Tris pH 6.0
分辨率 3.00 Å R-free 0.252
7T0L HLA-B*27:05 in complex with the pan-HLA-Ia monoclonal antibody W6/32 提交 2021-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 5000 MME, 0.1 M Bis-Tris pH 6.0
分辨率 3.00 Å R-free 0.252
7T5M Structure of HLA-A*02:01-FLPTPEELGLLGPPRPQVLA complex 提交 2021-12-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；273 K；0.12M Monosaccharides (D-Glucose; D-Mannose; D-Galactose; L-Fucose; D-Xylose; N-Acetyl-D-Glucosamine), 0.1M of Na-HEPES and MOPS buffer at pH 7.5, 20% W/V Glycerol and 10% W/V PEG 4000
分辨率 1.67 Å R-free 0.208
7T5M Structure of HLA-A*02:01-FLPTPEELGLLGPPRPQVLA complex 提交 2021-12-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；273 K；0.12M Monosaccharides (D-Glucose; D-Mannose; D-Galactose; L-Fucose; D-Xylose; N-Acetyl-D-Glucosamine), 0.1M of Na-HEPES and MOPS buffer at pH 7.5, 20% W/V Glycerol and 10% W/V PEG 4000
分辨率 1.67 Å R-free 0.208
7TLT SARS-CoV-2 Spike-derived peptide S489-497 (YFPLQSYGF) presented by HLA-A*29:02 提交 2022-01-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.9 M Ammonium Sulfate, 20 mM Magnesium chloride, 0.1M Bis-tris propane, 2% Ethylene glycol, 2% 2-Methyl-2,4-pentanediol
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
7TLT SARS-CoV-2 Spike-derived peptide S489-497 (YFPLQSYGF) presented by HLA-A*29:02 提交 2022-01-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.9 M Ammonium Sulfate, 20 mM Magnesium chloride, 0.1M Bis-tris propane, 2% Ethylene glycol, 2% 2-Methyl-2,4-pentanediol
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
7TR4 MA2-MART1-HLAA0201 提交 2022-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 22–119（98 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；20% PEG-6000 0.1M Tris (pH8) 0.2M MgCl2
分辨率 2.30 Å R-free 0.267
7TUC Crystal structure of HLA-B*44:05 (T73C) with 9mer EEFGRAFSF 提交 2022-02-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；16% PEG 3350, 0.1M Tris, 0.2M Ca Acetate
分辨率 1.25 Å R-free 0.195
7TUD Crystal structure of HLA-B*44:05 (T73C) with 6mer EEFGRC and dipeptide GL 提交 2022-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；25% PEG 1500, 0.1M SPG (Succinic acid, Sodium phosphate monobasic monohydrate and Glycine)
分辨率 1.45 Å R-free 0.213
7TUE Crystal structure of Tapasin in complex with HLA-B*44:05 (T73C) 提交 2022-02-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；2.0M AmSO4, 0.1M Tris
分辨率 3.10 Å R-free 0.309
7U1R SARS-CoV-2 Spike-derived peptide S1185-1193 K1191N mutant (RLNEVANNL) presented by HLA-A*02:01 提交 2022-02-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 CD CADMIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；18% P4000, 0.1M HEPES 7.6, 0.1M MgCl2, 1 mM CdCl2
分辨率 1.80 Å R-free 0.196
7U21 Human Class I MHC HLA-A2 in complex with AVGSYVYSV peptide 提交 2022-02-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15% PEG 3350, 0.1M MES pH 6.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.214
7U21 Human Class I MHC HLA-A2 in complex with AVGSYVYSV peptide 提交 2022-02-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15% PEG 3350, 0.1M MES pH 6.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.214
7UC5 Crystal Structure of HLA A*0301 in complex with ILRGSVAHK, a 9-mer epitope from Influenza A 提交 2022-03-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.2 Ammonium Sulfate, 0.1 Bis-Tris propane pH 6.5, 22% PEG 3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.229
7UC5 Crystal Structure of HLA A*0301 in complex with ILRGSVAHK, a 9-mer epitope from Influenza A 提交 2022-03-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.2 Ammonium Sulfate, 0.1 Bis-Tris propane pH 6.5, 22% PEG 3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.229
7UFJ Structure of human MR1-ethylvanillin in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2022-03-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 PRO PROLINE × 1 N36 3-ethoxy-4-hydroxybenzaldehyde × 1 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；BTP PEG 3350 NaAc
分辨率 2.50 Å R-free 0.238
7UFJ Structure of human MR1-ethylvanillin in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2022-03-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 PRO PROLINE × 1 N36 3-ethoxy-4-hydroxybenzaldehyde × 1 GOL GLYCEROL × 7 ACT ACETATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；BTP PEG 3350 NaAc
分辨率 2.50 Å R-free 0.238
7UM2 SARS-CoV-2 Spike-derived peptide S417-425 K417T mutant (TIADYNYKL) presented by HLA-A*02:01 提交 2022-04-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 ZN ZINC ION × 1 CD CADMIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；14% P3350; 0.1M NaFlu; 2% EG; 1 mM CdCl2
分辨率 1.63 Å R-free 0.195
7UMG Crystal structure of human CD8aa-MR1-Ac-6-FP complex 提交 2022-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；Na K Phosphate, PEG 1K and NaCl
分辨率 2.40 Å R-free 0.218
7UR1 SARS-CoV-2 Spike-derived peptide S1215-1224 (YIWLGFIAGL) presented by HLA-A*02:01 提交 2022-04-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% P3350; 0.2 M K Acet
分辨率 2.17 Å R-free 0.277
7WJ2 Crystal structure of HLA-C*1402 complexed with 8-mer HIV gag peptide 提交 2022-01-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 NA SODIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；100 mM sodium acetate, 20 % PEG Smear Low
分辨率 1.28 Å R-free 0.178
7WJ3 Crystal structure of HLA-C*1402 complexed with 4-mer lipopeptide 提交 2022-01-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 MYR MYRISTIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.7；277 K；200 mM ammonium acetate, 100 mM sodium acetate, 5 % ethylene glycol, 25 % PEG Smear Low
分辨率 1.56 Å R-free 0.187
7WKJ A COVID-19 T-cell response detection method based on a newly identified human CD8+ T cell epitope from SARS-CoV-2-Hubei Province, 2021. 提交 2022-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；2.0 M Ammonium sulfate
分辨率 1.50 Å R-free 0.242
7WT3 Crystal structure of HLA-A*2402 complexed with 4-mer lipopeptide 提交 2022-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 ACT ACETATE ION × 2 ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 26 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；2mM ZnCL2, 100mM Tris, 20% PEG 6000
分辨率 1.89 Å R-free 0.235
7WT3 Crystal structure of HLA-A*2402 complexed with 4-mer lipopeptide 提交 2022-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 20–119（100 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；2mM ZnCL2, 100mM Tris, 20% PEG 6000
分辨率 1.89 Å R-free 0.235
7WT4 Crystal structure of HLA-A*2402 complexed with 8-mer Influenza PB1 peptide 提交 2022-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 33 ZN ZINC ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；100mM Tris, 20% PEG 6000
分辨率 1.89 Å R-free 0.232
7WT4 Crystal structure of HLA-A*2402 complexed with 8-mer Influenza PB1 peptide 提交 2022-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 20–119（100 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；100mM Tris, 20% PEG 6000
分辨率 1.89 Å R-free 0.232
7WT5 Crystal structure of HLA-A*2450 complexed with 8-mer model peptide 提交 2022-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；100mM Tris, 20 % PEG 8000
分辨率 2.10 Å R-free 0.228
7WT5 Crystal structure of HLA-A*2450 complexed with 8-mer model peptide 提交 2022-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 20–119（100 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；100mM Tris, 20 % PEG 8000
分辨率 2.10 Å R-free 0.228
7WZZ Crystal structure of peptide KAGQVVTIW in complex with HLA-B5801 提交 2022-02-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.2M Sodium thiocyanate, 20%(w/v) Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.30 Å R-free 0.169
7X00 Crystal structure of peptide VSFIEFVGW in complex with HLA-B5801 提交 2022-02-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；0.04 M Citric acid, 0.06 M BIS-TRIS propane, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 1.45 Å R-free 0.168
7X1B Crystal structure of peptide KAGQVVTI in complex with HLA-B5801 提交 2022-02-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.2 M Sodium thiocyanate, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 1.40 Å R-free 0.179
7X1C Crystal structure of peptide VSFIEFVI in complex with HLA-B5801 提交 2022-02-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；0.04 M Citric acid, 0.06 M BIS-TRIS propane, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 1.41 Å R-free 0.180
7XF3 The structure of HLA-B*1501/BM58-66AF9 提交 2022-03-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% w/v PEG 2000, 0.1M MES
分辨率 1.91 Å R-free 0.232
7YG3 Crystal structure of HLA-B*13:01 提交 2022-07-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.1 M HEPES pH 6.5, 20% PEG 4000, 0.2 M NaCl
分辨率 1.50 Å R-free 0.195
7ZT2 Structure of E8 TCR in complex with human MR1 bound to 5-OP-RU 提交 2022-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 2LJ 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Potassium thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris Propane pH 8.5, 20 % PEG 3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.276
7ZT3 Structure of E8 TCR in complex in human MR1 K43A 提交 2022-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 15 % PEG 4000
分辨率 2.40 Å R-free 0.236
7ZT4 Structure of E8 TCR in complex with human MR1 bound to 6FP 提交 2022-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 JSO 2-azanyl-6-methyl-3~{H}-pteridin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium iodide, 0.1 M Bis-Tris propane pH 8.5 and 20 % w/v PEG 3350
分辨率 2.02 Å R-free 0.268
7ZT5 Structure of E8 TCR in complex in human MR1 bound to 3FSA 提交 2022-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 7ZS 3-methanoyl-2-oxidanyl-benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1 M Bis-Tris Propane pH 8.5, 20% PEG 3350
分辨率 2.09 Å R-free 0.266
7ZT7 Structure of E8 TCR in complex in human MR1 bound to 5FSA 提交 2022-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 54G 2-hydroxy-5-methylbenzoic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium fluoride, 0.1 M Bis-Tris propane pH 8.5, 20% PEG 3350
分辨率 1.84 Å R-free 0.255
7ZT8 Structure of E8 TCR in complex in human MR1 bound to 3FBA 提交 2022-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 OVV 3-methylbenzoic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M MOPS pH 7.5, 12 % PEG 8000
分辨率 2.29 Å R-free 0.263
7ZT9 Structure of E8 TCR in complex in human MR1 bound to 4FBA 提交 2022-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 4MA 4-METHYLBENZOIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 20% PEG 4000, 15% Glycerol
分辨率 2.13 Å R-free 0.244
7ZUC Human Major Histocompatibility Complex A2 allele presenting LLLGIGILV 提交 2022-05-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 3,350, 0.2 M Potassium Thiocyanate, 0.1 M BIS-TRIS Propane pH 7.5
分辨率 1.89 Å R-free 0.247
7ZUC Human Major Histocompatibility Complex A2 allele presenting LLLGIGILV 提交 2022-05-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 3,350, 0.2 M Potassium Thiocyanate, 0.1 M BIS-TRIS Propane pH 7.5
分辨率 1.89 Å R-free 0.247
8A7O beta-2-microglobulin DeltaN6 amyloid fibril form 2PFa 提交 2022-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 27–119（93 aa）
链 B 27–119（93 aa）
链 C 27–119（93 aa）
链 D 27–119（93 aa）
链 E 27–119（93 aa）
链 F 27–119（93 aa）
突变：deltaN6, K6M 突变：deltaN6, K6M 突变：deltaN6, K6M 突变：deltaN6, K6M 突变：deltaN6, K6M 突变：deltaN6, K6M 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；6s blot
分辨率 3.00 Å
8A7P beta-2-microglobulin DeltaN6 amyloid fibril form 2PFb 提交 2022-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 27–119（93 aa）
链 B 27–119（93 aa）
链 C 27–119（93 aa）
链 D 27–119（93 aa）
链 E 27–119（93 aa）
链 F 27–119（93 aa）
突变：deltaN6, K6M 突变：deltaN6, K6M 突变：deltaN6, K6M 突变：deltaN6, K6M 突变：deltaN6, K6M 突变：deltaN6, K6M 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；6s blot
分辨率 3.40 Å
8A7Q beta-2-microglobulin V27M amyloid fibril form 4PF 提交 2022-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 21–119（99 aa）
链 B 21–119（99 aa）
链 C 21–119（99 aa）
链 D 21–119（99 aa）
链 E 21–119（99 aa）
链 F 21–119（99 aa）
链 G 21–119（99 aa）
链 H 21–119（99 aa）
链 I 21–119（99 aa）
链 J 21–119（99 aa）
链 K 21–119（99 aa）
链 L 21–119（99 aa）
突变：V27M 突变：V27M 突变：V27M 突变：V27M 突变：V27M 突变：V27M 突变：V27M 突变：V27M 突变：V27M 突变：V27M 突变：V27M 突变：V27M 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；6s blot
分辨率 2.80 Å
8A7T beta-2-microglobulin D76N amyloid fibril form 2PFa 提交 2022-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–119（99 aa）
链 B 21–119（99 aa）
链 C 21–119（99 aa）
链 D 21–119（99 aa）
链 E 21–119（99 aa）
链 F 21–119（99 aa）
突变：D76N 突变：D76N 突变：D76N 突变：D76N 突变：D76N 突变：D76N 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；6s blot
分辨率 3.00 Å
8BP6 Structure of MHC-class I related molecule MR1 with bound M3Ade. 提交 2022-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
未记录 R8F (1R,5S)-8-(9H-purin-6-yl)-2-oxa-8-azabicyclo[3.3.1]nona-3,6-diene-4,6-dicarbaldehyde × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus-F9
分辨率 2.80 Å R-free 0.247
8BP6 Structure of MHC-class I related molecule MR1 with bound M3Ade. 提交 2022-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 R8F (1R,5S)-8-(9H-purin-6-yl)-2-oxa-8-azabicyclo[3.3.1]nona-3,6-diene-4,6-dicarbaldehyde × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus-F9
分辨率 2.80 Å R-free 0.247
8CX4 TCR-antigen complex AS8.4-YEIH-HLA*B27 提交 2022-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG3350 and 0.1M HEPES pH 7.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.264
8DNT SARS-CoV-2 specific T cell receptor 提交 2022-07-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；13.5% (w/v) PEG 20,000, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 3.18 Å R-free 0.313
8DNT SARS-CoV-2 specific T cell receptor 提交 2022-07-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；13.5% (w/v) PEG 20,000, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 3.18 Å R-free 0.313
8DNT SARS-CoV-2 specific T cell receptor 提交 2022-07-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 T 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；13.5% (w/v) PEG 20,000, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 3.18 Å R-free 0.313
8DNT SARS-CoV-2 specific T cell receptor 提交 2022-07-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Z 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；13.5% (w/v) PEG 20,000, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 3.18 Å R-free 0.313
8DV3 Crystal structure of human CD1b presenting Phosphatidylinositol C34:1 提交 2022-07-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 CL CHLORIDE ION × 6 NA SODIUM ION × 2 6UL TETRACOSYL PALMITATE × 1 IOD IODIDE ION × 2 PIE 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoinositol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；24% PEG 3350, 0.2M Sodium Iodide, 2% ethylene glycol
分辨率 1.90 Å R-free 0.253
8DV4 Crystal structure of the BC8B TCR-CD1b-PI complex 提交 2022-07-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CUY tetracosyl octadecanoate × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；24 %(w/v) PEG 4000, 0.02 M Tris-HCl (pH 7.0), 2% ethylene glycol
分辨率 2.40 Å R-free 0.255
8DVG Structure of KRAS WT(7-16)-HLA-A*03:01 提交 2022-07-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–119（119 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 13 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M ammonium sulfate 0.1M sodium cacodylate pH 6.5 30 % w/v PEG 8,000
分辨率 2.59 Å R-free 0.228
8E13 Structures of HLA-B8E76C loaded with long peptides reveal novel features at the N-terminus of the groove 提交 2022-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；0.2 M ammonium acetate, 18% PEG 4000, 0.1 M sodium citrate,
分辨率 1.37 Å R-free 0.210
8E2Z Structures of HLA-B8E76C loaded with long peptides reveal novel features at the N-terminus of the groove 提交 2022-08-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；277 K；0.2 M ammonium acetate, 15% PEG 4000, 0.1 M sodium citrate, pH5.6,
分辨率 1.13 Å R-free 0.217
8E8I Structures of HLA-B8E76C loaded with long peptides reveal novel features at the N-terminus of the groove 提交 2022-08-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.8；298 K；0.2 M ammonium acetate, 15% PEG 1000, 0.1 M sodium citrate
分辨率 1.49 Å R-free 0.211
8EB2 Structure of HLA-A*02:01 in complex with NY-ESO-1 peptide and PA2.1 Fab 提交 2022-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M L-Proline, 0.1M HEPES pH 7.5, 13% PEG3350
分辨率 2.90 Å R-free 0.284
8EB2 Structure of HLA-A*02:01 in complex with NY-ESO-1 peptide and PA2.1 Fab 提交 2022-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M L-Proline, 0.1M HEPES pH 7.5, 13% PEG3350
分辨率 2.90 Å R-free 0.284
8EB2 Structure of HLA-A*02:01 in complex with NY-ESO-1 peptide and PA2.1 Fab 提交 2022-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M L-Proline, 0.1M HEPES pH 7.5, 13% PEG3350
分辨率 2.90 Å R-free 0.284
8EC5 Structures of HLA-B8E76C loaded with long peptides reveal novel features at the N-terminus of the groove 提交 2022-09-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.8；298 K；0.2 M ammonium acetate, 15% PEG 10000, 0.1 M sodium citrate
分辨率 1.22 Å R-free 0.212
8EK5 Engineered scFv 10LH bound to PHOX2B/HLA-A24:02 提交 2022-09-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 NO3 NITRATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Nitrate
分辨率 2.11 Å R-free 0.212
8ELG Crystal Structure of HLA-B*15:01 in complex with spike derived peptide NQKLIANAF from OC43 virus 提交 2022-09-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；2% ethylene glycol, 20% w/v PEG3350
分辨率 1.65 Å R-free 0.220
8ELH Crystal Structure of HLA-B*15:01 in complex with spike derived peptide NQKLIANQF from SARS-CoV-2 virus 提交 2022-09-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.2 M sodium formate, pH 7.0, 20% w/v PEG3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.223
8EMF Crystal structure of a HLA-B*35:01-NP6 epitope from 1977 H1N1 influenza strain 提交 2022-09-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；PEG
分辨率 1.80 Å R-free 0.203
8EMG Crystal structure of a HLA-B*35:01-NP7 epitope from 2002 H2N1 influenza strain 提交 2022-09-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；PEG
分辨率 1.83 Å R-free 0.206
8EMI Crystal structure of a HLA-B*35:01-NP8 epitope from 2005 H1N1 influenza strain 提交 2022-09-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；297 K；PEG
分辨率 1.57 Å R-free 0.208
8EMJ Crystal structure of HLA-B*35:01-NP9 epitope from 2006 H1N1 influenza strain 提交 2022-09-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；PEG, Acetate
分辨率 1.75 Å R-free 0.214
8EMK Crystal structure of HLA-B*35:01-NP3 epitope from 1957 H2N2 influenza strain 提交 2022-09-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；PEG, NA ACETATE
分辨率 1.67 Å R-free 0.206
8EN8 Cross-reactive 3180 TCR recognition of HLA-B*35:01-NP4 epitope from 1972 influenza strain 提交 2022-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；PEG
分辨率 2.70 Å R-free 0.249
8EN8 Cross-reactive 3180 TCR recognition of HLA-B*35:01-NP4 epitope from 1972 influenza strain 提交 2022-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；PEG
分辨率 2.70 Å R-free 0.249
8ENH Cross-reactive 3180 TCR recognition of HLA-B*35:01-NP7 epitope from 2002 H3N2 influenza strain 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；PEG, ACETATE
分辨率 2.50 Å R-free 0.230
8ENH Cross-reactive 3180 TCR recognition of HLA-B*35:01-NP7 epitope from 2002 H3N2 influenza strain 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；PEG, ACETATE
分辨率 2.50 Å R-free 0.230
8ENH Cross-reactive 3180 TCR recognition of HLA-B*35:01-NP7 epitope from 2002 H3N2 influenza strain 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；PEG, ACETATE
分辨率 2.50 Å R-free 0.230
8ENH Cross-reactive 3180 TCR recognition of HLA-B*35:01-NP7 epitope from 2002 H3N2 influenza strain 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；PEG, ACETATE
分辨率 2.50 Å R-free 0.230
8EO8 Cross-reactive 3180 TCR recognition of HLA-B*35:01-NP8 epitope from 2005 H1N1 influenza strain 提交 2022-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；PEG, ACETATE
分辨率 2.30 Å R-free 0.219
8EO8 Cross-reactive 3180 TCR recognition of HLA-B*35:01-NP8 epitope from 2005 H1N1 influenza strain 提交 2022-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；PEG, ACETATE
分辨率 2.30 Å R-free 0.219
8EO8 Cross-reactive 3180 TCR recognition of HLA-B*35:01-NP8 epitope from 2005 H1N1 influenza strain 提交 2022-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；PEG, ACETATE
分辨率 2.30 Å R-free 0.219
8EO8 Cross-reactive 3180 TCR recognition of HLA-B*35:01-NP8 epitope from 2005 H1N1 influenza strain 提交 2022-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；PEG, ACETATE
分辨率 2.30 Å R-free 0.219
8ERX Structure of chimeric HLA-A*11:01-A*02:01 bound to HIV-1 RT peptide 提交 2022-10-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294.15 K；0.02 Sodium/Potassium phosphate, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 8.5, 18-22% PEG 3350
分辨率 2.07 Å R-free 0.231
8ES8 CryoEM structure of PN45545 TCR-CD3 in complex with HLA-A2 MAGEA4 (230-239) 提交 2022-10-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 M 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
8ES9 CryoEM structure of PN45428 TCR-CD3 in complex with HLA-A2 MAGEA4 提交 2022-10-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 M 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
8ESH Structure of chimeric HLA-A*02:01 bound to CMV peptide 提交 2022-10-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294.15 K；0.2 M Sodium Fluoride, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 8.5, 20-24% PEG 3350
分辨率 2.72 Å R-free 0.260
8F5A Crystal Structure of KS1 TCR in complex with HLA-B*57:01-TW10 提交 2022-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；8 % tacsimate, 20 % PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.237
8F7M Crystal Structure of HLA-B*57:01-TW10-T242N complex 提交 2022-11-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；20 % w/v PEG4000, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium cacodylate
分辨率 1.88 Å R-free 0.220
8FJA CryoEM structure of HLA-A2 MAGEA4 (230-239) in complex with REGN6972 Fab 提交 2022-12-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8FJB CryoEM structure of HLA-A2 MAGEA4 (286-294) in complex with H2aM31345N Fab 提交 2022-12-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
8FRT X-ray crystal structure of the N-terminal region from HCMV US11 binding to HLA-A*02:01 提交 2023-01-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；30% (w/v) PEG3350, 0.1 M DL-malic acid pH 7.0, 83 mM cesium chloride
分辨率 1.80 Å R-free 0.239
8FU4 HCMV US11 peptide binding to HLA-A*02:01 提交 2023-01-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 CD CADMIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；26% (w/v) PEG3350 and 0.1 M DL-malic acid pH 7.0, 83 mM cesium chloride
分辨率 1.60 Å R-free 0.204
8GLE Crystal Structure of Human CD1b in Complex with Lysosulfatide 提交 2023-03-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SGF (2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl 3-O-sulfo-beta-D-galactopyranoside × 1 CUY tetracosyl octadecanoate × 1 IOD IODIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；26% PEG3350, 0.1 M sodium iodide, 2% ethylene glycol
分辨率 1.85 Å R-free 0.229
8GLF Crystal Structure of Human CD1b in Complex with Sphingomyelin C34:2 提交 2023-03-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 3LY [(~{Z},2~{R},3~{S})-2-(hexadecanoylamino)-3-oxidanyl-octadec-4-enyl] 2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethyl hydrogen phosphate × 1 6UL TETRACOSYL PALMITATE × 1 CL CHLORIDE ION × 4 IOD IODIDE ION × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；28% PEG3350, 0.2 M sodium iodide
分辨率 2.00 Å R-free 0.231
8GLG Crystal Structure of Human CD1b in Complex with Phosphatidylethanolamine C34:1 提交 2023-03-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 L9Q (1S)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(octadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 CUY tetracosyl octadecanoate × 1 CL CHLORIDE ION × 4 IOD IODIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27% PEG3350, 0.1 M sodium iodide
分辨率 1.60 Å R-free 0.209
8GLH Crystal Structure of Human CD1b in Complex with Endogenous PC C40:5 提交 2023-03-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 3 3IV (11E)-hexadec-11-enoic acid × 1 3IY [(2~{R})-1-dodecanoyloxy-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-propan-2-yl] (8~{Z},11~{Z},14~{Z},24~{Z},27~{Z})-triaconta-8,11,14,24,27-pentaenoate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；24% PEG3350, 0.2 M sodium iodide, 2% ethylene glycol
分辨率 1.83 Å R-free 0.221
8GLI Crystal Structure of Human CD1b in Complex with Mycobacterial C85-GMM 提交 2023-03-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 ZR2 6-O-[(2R,3R)-3-hydroxy-20-{(1R,2S)-2-[(17R,18R)-17-methoxy-18-methyldotriacontyl]cyclopropyl}-2-pentadecylicosanoyl]-alpha-L-galactopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 IOD IODIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；26% PEG3350, 0.2 M sodium iodide, 2% ethylene glycol
分辨率 2.10 Å R-free 0.267
8GOM SARS-CoV-2 specific private TCR RLQ7 in complex with RLQ-HLA-A2 提交 2022-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 0.01 M Trimethylamine hydrochloride, 15% PEG 6000.
分辨率 2.78 Å R-free 0.248
8GON SARS-CoV-2 specific private TCR RLQ7 in complex with RLQ-T1006I-HLA-A2 提交 2022-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 15% PEG 6000
分辨率 2.60 Å R-free 0.253
8GVB The complex between public TCR TD08 and HLA-A24 bound to HIV-1 Nef138-8 peptide 提交 2022-09-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.06 M divalent ions (MgCl2, CaCl2), 0.1 M Tris (pH 8.5), 0.1 M Bicine (pH 8.5)
分辨率 3.20 Å R-free 0.321
8GVG The complex between public TCR TD08 and HLA-A24 bound to HIV-1 Nef138-8 (2F) peptide 提交 2022-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium sulfate, 0.1 M Bis-Tris Propane (pH 7.5), 20% PEG 3350
分辨率 3.37 Å R-free 0.320
8GVI The complex between H25-11 TCR and HLA-A24 bound to HIV-1 Nef138-8 peptide 提交 2022-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Potassium chloride, 0.1 M tris (pH 8.0), 15% PEG2000 MME
分辨率 3.30 Å R-free 0.314
8HN4 Complex structure of HLA2402 with recognizing SARS-CoV-2 epitope QYIKWPWYI 提交 2022-12-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；287 K；30% PEG 4000, 0.2 M Sodium acetate, and 0.1 M Tris-HCl pH8.5
分辨率 2.85 Å R-free 0.251
8I5C Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；1.0 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 3.34 Å R-free 0.258
8I5C Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 u 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；1.0 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 3.34 Å R-free 0.258
8I5C Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；1.0 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 3.34 Å R-free 0.258
8I5C Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；1.0 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 3.34 Å R-free 0.258
8I5C Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；1.0 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 3.34 Å R-free 0.258
8I5C Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 V 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；1.0 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 3.34 Å R-free 0.258
8I5C Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 a 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；1.0 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 3.34 Å R-free 0.258
8I5C Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 f 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；1.0 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 3.34 Å R-free 0.258
8I5C Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 k 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；1.0 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 3.34 Å R-free 0.258
8I5C Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 p 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；1.0 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 3.34 Å R-free 0.258
8I5D Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 10% w/v PEG 8000/ 8% v/v Ethylene glycol.
分辨率 3.30 Å R-free 0.256
8I5E Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS peptide (VVGAGGVGK) 提交 2023-01-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1 M Tris. 8.0. 25% v/v PEG 350 MME.
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
8ISN HLA-A24 in complex with modified 9mer WT1 peptide 提交 2023-03-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium tartrate dibasic, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.48 Å R-free 0.258
8ISN HLA-A24 in complex with modified 9mer WT1 peptide 提交 2023-03-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium tartrate dibasic, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.48 Å R-free 0.258
8K4T Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12C peptide (VVVGACGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate,Sodium cacodylate pH 6.0, PEG 4000
分辨率 2.30 Å R-free 0.316
8K4T Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12C peptide (VVVGACGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate,Sodium cacodylate pH 6.0, PEG 4000
分辨率 2.30 Å R-free 0.316
8K4V Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12R peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 3.10 Å R-free 0.347
8K4V Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12R peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 3.10 Å R-free 0.347
8K4V Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12R peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 3.10 Å R-free 0.347
8K4V Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12R peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 3.10 Å R-free 0.347
8K50 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12V peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
8K50 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12V peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
8K50 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12V peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
8K50 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12V peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
8QFY Crystal structure of high affinity TCR in complex with pHLA harbouring bacterial peptide 提交 2023-09-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 BBB 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.2 M calcium acetate, 0.1 M imidazole pH 8.0, 10% PEG 8000
分辨率 2.33 Å R-free 0.289
8QFY Crystal structure of high affinity TCR in complex with pHLA harbouring bacterial peptide 提交 2023-09-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 GGG 21–119（99 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.2 M calcium acetate, 0.1 M imidazole pH 8.0, 10% PEG 8000
分辨率 2.33 Å R-free 0.289
8RBU Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with SVLNDILARL, an 10-mer epitope from SARS-CoV-2 Spike (S975-984) 提交 2023-12-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.2M NaCl and 0.1M Tris HCl pH8.5
分辨率 2.70 Å R-free 0.252
8RBV SARS-CoV-2 Spike-derived peptide S976-984 S982A mutant (VLNDILARL) presented by HLA-A*02:01 提交 2023-12-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CD CADMIUM ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；13% P3350; 0.1M NaFlu; 2% EG; 1 mM CdCl2
分辨率 1.80 Å R-free 0.211
8RCV Crystal structure of HLA B*13:01 in complex with SVLNDIFSRL, an 10-mer epitope from SARS-CoV-2 Spike (S975-984) 提交 2023-12-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；14% PEG3350 and 0.1M NaFormate
分辨率 1.65 Å R-free 0.201
8REF Crystal structure of HLA B*13:01 in complex with SVLNDILARL, an 10-mer epitope from SARS-CoV-2 Spike (S975-984) 提交 2023-12-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350 and 2% EG
分辨率 1.90 Å R-free 0.221
8RH6 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with SVLNDILSRL, an 10-mer epitope from SARS-CoV-2 Spike (S975-984) 提交 2023-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.2M NaCl and 0.1M Tris HCl pH8.5
分辨率 3.32 Å R-free 0.251
8RHQ Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with SVLNDIFSRL, an 10-mer epitope from SARS-CoV-2 Spike (S975-984) 提交 2023-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 NA SODIUM ION × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CL CHLORIDE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350, 0.2M Sodium acetate tihydrate pH 7.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.244
8RJ5 P1-15 T-cell Receptor bound to HLA A*2402-NF9 pMHC complex 提交 2023-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；di-Sodium malonate, 0.1M HEPES pH7, 0.1M Poly(acrylic acid sodium salt) 2,100, 30% w/v
分辨率 3.02 Å R-free 0.260
8RJ5 P1-15 T-cell Receptor bound to HLA A*2402-NF9 pMHC complex 提交 2023-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；di-Sodium malonate, 0.1M HEPES pH7, 0.1M Poly(acrylic acid sodium salt) 2,100, 30% w/v
分辨率 3.02 Å R-free 0.260
8RJH HLA A*2402-NF9_6F pMHC complex 提交 2023-12-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene Glycol 4,000, 20% w/v MES, 0.1 M, pH7
分辨率 2.60 Å R-free 0.264
8RJH HLA A*2402-NF9_6F pMHC complex 提交 2023-12-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene Glycol 4,000, 20% w/v MES, 0.1 M, pH7
分辨率 2.60 Å R-free 0.264
8RJH HLA A*2402-NF9_6F pMHC complex 提交 2023-12-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene Glycol 4,000, 20% w/v MES, 0.1 M, pH7
分辨率 2.60 Å R-free 0.264
8RJH HLA A*2402-NF9_6F pMHC complex 提交 2023-12-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene Glycol 4,000, 20% w/v MES, 0.1 M, pH7
分辨率 2.60 Å R-free 0.264
8RJH HLA A*2402-NF9_6F pMHC complex 提交 2023-12-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 N 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene Glycol 4,000, 20% w/v MES, 0.1 M, pH7
分辨率 2.60 Å R-free 0.264
8RJH HLA A*2402-NF9_6F pMHC complex 提交 2023-12-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Q 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene Glycol 4,000, 20% w/v MES, 0.1 M, pH7
分辨率 2.60 Å R-free 0.264
8RJI HLA A*2402-NF9_5R pMHC complex 提交 2023-12-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene glycol 4000, 20% w/v Sodium Cacodylate, 0.1 M, pH 6
分辨率 2.30 Å R-free 0.265
8RJI HLA A*2402-NF9_5R pMHC complex 提交 2023-12-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene glycol 4000, 20% w/v Sodium Cacodylate, 0.1 M, pH 6
分辨率 2.30 Å R-free 0.265
8RJI HLA A*2402-NF9_5R pMHC complex 提交 2023-12-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene glycol 4000, 20% w/v Sodium Cacodylate, 0.1 M, pH 6
分辨率 2.30 Å R-free 0.265
8RJI HLA A*2402-NF9_5R pMHC complex 提交 2023-12-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene glycol 4000, 20% w/v Sodium Cacodylate, 0.1 M, pH 6
分辨率 2.30 Å R-free 0.265
8RLT TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 index peptide 提交 2024-01-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate
分辨率 2.25 Å R-free 0.252
8RLT TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 index peptide 提交 2024-01-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate
分辨率 2.25 Å R-free 0.252
8RLU TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 S3N peptide 提交 2024-01-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate
分辨率 2.35 Å R-free 0.261
8RLU TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 S3N peptide 提交 2024-01-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate
分辨率 2.35 Å R-free 0.261
8RLV TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 L6I peptide 提交 2024-01-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate Collection Temp: 100
分辨率 2.61 Å R-free 0.251
8RLV TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 L6I peptide 提交 2024-01-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate Collection Temp: 100
分辨率 2.61 Å R-free 0.251
8RNE HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Nsp13 peptide, VMPLSAPTL 提交 2024-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.15 M potassium bromide, 20% w/v of PEG 2000 MME
分辨率 1.71 Å R-free 0.243
8RNE HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Nsp13 peptide, VMPLSAPTL 提交 2024-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.15 M potassium bromide, 20% w/v of PEG 2000 MME
分辨率 1.71 Å R-free 0.243
8RNE HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Nsp13 peptide, VMPLSAPTL 提交 2024-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.15 M potassium bromide, 20% w/v of PEG 2000 MME
分辨率 1.71 Å R-free 0.243
8RNF HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Omicron Nsp13 peptide, VIPLSAPTL 提交 2024-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.15 M DL malic acid and 20% w/v of PEG3350
分辨率 1.87 Å R-free 0.220
8RNF HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Omicron Nsp13 peptide, VIPLSAPTL 提交 2024-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.15 M DL malic acid and 20% w/v of PEG3350
分辨率 1.87 Å R-free 0.220
8RNF HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Omicron Nsp13 peptide, VIPLSAPTL 提交 2024-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.15 M DL malic acid and 20% w/v of PEG3350
分辨率 1.87 Å R-free 0.220
8RNG Crystal structure of HLA B*18:01 in complex with TEVETYVL, an 8-mer epitope from Influenza A 提交 2024-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Potassium Nitrate, 20% w/v PEG 3350 at pH 6.5
分辨率 1.45 Å R-free 0.203
8RNH Crystal structure of HLA B*18:01 in complex with EEIEITTHF, an 9-mer epitope from Influenza A 提交 2024-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Lithium Acetate, 20% w/v PEG 3350, and 10 mM MgCl2
分辨率 1.60 Å R-free 0.234
8RNI HLA-A*03:01 with KRAS-G12V-10mer 提交 2024-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1M ammonium citrate tribasic pH7, 12% PEG 3350
分辨率 2.49 Å R-free 0.276
8ROO Crystal structure of HLA B*18:01 in complex with YERMCNIL, an 8-mer epitope from Influenza A 提交 2024-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 NO3 NITRATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Potassium Nitrate, 20% w/v PEG 3350 at pH 6.5
分辨率 1.40 Å R-free 0.189
8ROP Crystal structure of HLA B*18:01 in complex with QEIRTFSF, an 8-mer epitope from Influenza A 提交 2024-01-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Lithium Acetate, 20% w/v PEG 3350, and 10 mM MgCl2
分辨率 1.15 Å R-free 0.168
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 N 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 S 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 X 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 c 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 h 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 m 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8RYM Structure of S2 TCR in complex with HLA-A*03:01 bound to ELFSYLIEK peptide 提交 2024-02-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50 mM HEPES pH 7.0, 13 % w/v PEG 8000
分辨率 2.34 Å R-free 0.272
8RYN Structure of S2 TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to ELFSYLIEK peptide 提交 2024-02-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Amino acids (0.02 M Sodium Glutamate; 0.02 M Alanine; 0.02 M Glycine; 0.02 M Lysine hydrochloride; 0.02 M Serine), 0.1 M Buffer system 1 (Imidazole; MES monohydrate) pH 6.5, 50 % Precipitant mix 2 (20% v/v Ethylene glycol; 10 % w/v PEG 8000)
分辨率 1.97 Å R-free 0.251
8RYO Structure of S2-198 TCR in complex with HLA-A*03:01 bound to ELFSYLIEK peptide 提交 2024-02-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 TOE 2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXYL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50 mM MOPS pH 6.7, 14 % w/v PEG 8000
分辨率 2.05 Å R-free 0.244
8RYP Structure of S8 TCR in complex with HLA-A*03:01 bound to ELFSYLIEK peptide 提交 2024-02-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50 mM Magnesium acetate, 20 mM MOPS pH 7.2, 50 mM Sodium chloride, 12 % w/v PEG 8000
分辨率 1.81 Å R-free 0.241
8RYQ Structure of S8-9F3 TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to ELFSYLIEK peptide 提交 2024-02-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；150 mM Magnesium acetate, 20 mM MOPS pH 7.2, 12 % w/v PEG 8000
分辨率 2.49 Å R-free 0.283
8RYQ Structure of S8-9F3 TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to ELFSYLIEK peptide 提交 2024-02-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；150 mM Magnesium acetate, 20 mM MOPS pH 7.2, 12 % w/v PEG 8000
分辨率 2.49 Å R-free 0.283
8SBK Structure of HLA-A*24:02 in complex with peptide, LYLPVRVLI (ATG2A). 提交 2023-04-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.219
8SBL Structure of HLA-A*24:02 in complex with peptide, LYLPVRVLI 提交 2023-04-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.05M MES monohydrate pH 6.5, 22.5% Polyethylene Glycol w/v 3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.270
8SBL Structure of HLA-A*24:02 in complex with peptide, LYLPVRVLI 提交 2023-04-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.05M MES monohydrate pH 6.5, 22.5% Polyethylene Glycol w/v 3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.270
8SBL Structure of HLA-A*24:02 in complex with peptide, LYLPVRVLI 提交 2023-04-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.05M MES monohydrate pH 6.5, 22.5% Polyethylene Glycol w/v 3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.270
8SBL Structure of HLA-A*24:02 in complex with peptide, LYLPVRVLI 提交 2023-04-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.05M MES monohydrate pH 6.5, 22.5% Polyethylene Glycol w/v 3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.270
8SGB Crystal Structure of CD1d-lipid complexed with Beta-2-Microglobulin, TCR Alpha-Chain and TCR Beta-Chain 提交 2023-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 FO4 sphingomyelin × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG3350, sodium citrate, citrate-bis-Tris pH7
分辨率 2.80 Å R-free 0.249
8SGM Crystal Structure of CD1d-lipid complexed with Beta-2-Microglobulin, TCR Alpha-Chain and TCR Beta-Chain 提交 2023-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 1 A1AHF N-[(2S)-3-oxo-1-(beta-L-talopyranosyloxy)octadecan-2-yl]docosanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG3350, sodium citrate, citrate-bis-Tris pH7
分辨率 2.50 Å R-free 0.234
8SHI Valpha3S1 Vbeta13S1 HLA C 0602 VRSRRCLRL 提交 2023-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；297 K；20% w/v polyethylene glycol 3350, 0.2M NaSO4.
分辨率 2.90 Å R-free 0.291
8SHI Valpha3S1 Vbeta13S1 HLA C 0602 VRSRRCLRL 提交 2023-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；297 K；20% w/v polyethylene glycol 3350, 0.2M NaSO4.
分辨率 2.90 Å R-free 0.291
8SOS Human CD1d presenting sphingomyelin C24:1 in complex with VHH nanobody 1D17 提交 2023-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 FO4 sphingomyelin × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；12% PEG8000, 0.05 M zinc acetate, 0.05 M MES, pH 6.2
分辨率 2.33 Å R-free 0.230
8T6M Human leukocyte antigen bound by two alloreactive antibody Fabs 提交 2023-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
8T7R Crystal structure of human leukocyte antigen A*0101 in complex with the Fab of alloreactive antibody E07 提交 2023-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：50-meric
链 D 21–119（99 aa）
链 H 21–119（99 aa）
链 L 21–119（99 aa）
链 P 21–119（99 aa）
链 T 21–119（99 aa）
链 X 21–119（99 aa）
链 b 21–119（99 aa）
链 f 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；sodium citrate tribasic dihydrate, sodium cacodylate
分辨率 3.84 Å R-free 0.263
8TBV Human Class I MHC HLA-A2 in complex with sorting nexin 24 (127-135) neoantigen KLSHQLVLL 提交 2023-06-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Purified protein complexes were concentrated to 7.4 mg/mL before crystallization. The crystals were grown in 12.5% PEG 4000 and 0.1 M MES (pH 6.5) via hanging drop vapor diffusion. Crystals were harvested and cryoprotected in 8% glycerol/92% mother liquor and immediately stored in liquid nitrogen
分辨率 2.64 Å R-free 0.274
8TBV Human Class I MHC HLA-A2 in complex with sorting nexin 24 (127-135) neoantigen KLSHQLVLL 提交 2023-06-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Purified protein complexes were concentrated to 7.4 mg/mL before crystallization. The crystals were grown in 12.5% PEG 4000 and 0.1 M MES (pH 6.5) via hanging drop vapor diffusion. Crystals were harvested and cryoprotected in 8% glycerol/92% mother liquor and immediately stored in liquid nitrogen
分辨率 2.64 Å R-free 0.274
8TBW Human Class I MHC HLA-A2 in complex with sorting nexin 24 (127-135) peptide KLSHQPVLL 提交 2023-06-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NO3 NITRATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Purified protein complexes were concentrated to 7.4 mg/mL before crystallization. The crystals were grown in 12.5% PEG 4000 and 0.1 M MES (pH 6.5) via hanging drop vapor diffusion. Crystals were harvested and cryoprotected in 8% glycerol/92% mother liquor and immediately stored in liquid nitrogen
分辨率 2.08 Å R-free 0.205
8TBW Human Class I MHC HLA-A2 in complex with sorting nexin 24 (127-135) peptide KLSHQPVLL 提交 2023-06-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NO3 NITRATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Purified protein complexes were concentrated to 7.4 mg/mL before crystallization. The crystals were grown in 12.5% PEG 4000 and 0.1 M MES (pH 6.5) via hanging drop vapor diffusion. Crystals were harvested and cryoprotected in 8% glycerol/92% mother liquor and immediately stored in liquid nitrogen
分辨率 2.08 Å R-free 0.205
8TMU HLA-B*73:01 bound to a 10mer peptide in complex with KIR2DL2 提交 2023-07-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Tris-HCl pH 8.75 and 20% PEG 8000
分辨率 2.90 Å R-free 0.258
8TQ5 Crystal structure of Fab DX17 in complex with MHC-I (HLA-B*44:05) 提交 2023-08-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；12% PEG20000, 0.1 M MES, pH 6.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.234
8TQ6 Crystal structure of Fab.B1.23.2 in complex with MHC-I (HLA-B*44:05) 提交 2023-08-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；291 K；16% PEG3350, 0.04 M sodium citrate, 0.06 M Bis-Tris, pH 8.8
分辨率 3.20 Å R-free 0.268
8TQ6 Crystal structure of Fab.B1.23.2 in complex with MHC-I (HLA-B*44:05) 提交 2023-08-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；291 K；16% PEG3350, 0.04 M sodium citrate, 0.06 M Bis-Tris, pH 8.8
分辨率 3.20 Å R-free 0.268
8TUB HLA B7:02 with HPNGYKSLSTL 提交 2023-08-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG
分辨率 2.40 Å R-free 0.238
8TUB HLA B7:02 with HPNGYKSLSTL 提交 2023-08-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG
分辨率 2.40 Å R-free 0.238
8TUB HLA B7:02 with HPNGYKSLSTL 提交 2023-08-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG
分辨率 2.40 Å R-free 0.238
8TUB HLA B7:02 with HPNGYKSLSTL 提交 2023-08-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG
分辨率 2.40 Å R-free 0.238
8TUH HLA B7:02 with RPIIRPATL 提交 2023-08-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
8U9G Human Class I MHC HLA-A2 bound to sorting nexin 24 (127-135) neoantigen KLSHQLVLL 提交 2023-09-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Purified protein complexes were concentrated to 7.4 mg/mL before crystallization. The crystals were grown in 12.5% PEG 4000 and 0.1 M MES (pH 6.5) via hanging drop vapor diffusion. Crystals were harvested and cryoprotected in 8% glycerol/92% mother liquor and immediately stored in liquid nitrogen
分辨率 2.87 Å R-free 0.245
8U9G Human Class I MHC HLA-A2 bound to sorting nexin 24 (127-135) neoantigen KLSHQLVLL 提交 2023-09-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Purified protein complexes were concentrated to 7.4 mg/mL before crystallization. The crystals were grown in 12.5% PEG 4000 and 0.1 M MES (pH 6.5) via hanging drop vapor diffusion. Crystals were harvested and cryoprotected in 8% glycerol/92% mother liquor and immediately stored in liquid nitrogen
分辨率 2.87 Å R-free 0.245
8UDR Structure of the P1B7 antibody bound to the Sotorasib-modified KRas G12C peptide presented by the A*03:01 MHC I complex 提交 2023-09-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 MOV AMG 510 (bound form) × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES ph 7.5, 100 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8UTC HUMAN LEUKOCYTE ANTIGEN B*07:02 IN COMPLEX WITH SARS-COV2 EPITOPE N105-113 (Y111F mutant) 提交 2023-10-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.1 M HEPES-NaOH, pH 7.5, 25% PEG 3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.240
8UTC HUMAN LEUKOCYTE ANTIGEN B*07:02 IN COMPLEX WITH SARS-COV2 EPITOPE N105-113 (Y111F mutant) 提交 2023-10-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.1 M HEPES-NaOH, pH 7.5, 25% PEG 3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.240
8V4Z Crystal structure of a HLA-B*35:01-NP7 with D1 TCR 提交 2023-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
突变：M1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
8V4Z Crystal structure of a HLA-B*35:01-NP7 with D1 TCR 提交 2023-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
突变：M1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
8V4Z Crystal structure of a HLA-B*35:01-NP7 with D1 TCR 提交 2023-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
突变：M1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
8V4Z Crystal structure of a HLA-B*35:01-NP7 with D1 TCR 提交 2023-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 21–119（99 aa）
突变：M1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
8V50 Crystal structure of a HLA-B*35:01-NP6 with D1 TCR 提交 2023-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
突变：artificial starting M 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG
分辨率 2.65 Å R-free 0.265
8V50 Crystal structure of a HLA-B*35:01-NP6 with D1 TCR 提交 2023-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
突变：artificial starting M 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG
分辨率 2.65 Å R-free 0.265
8V50 Crystal structure of a HLA-B*35:01-NP6 with D1 TCR 提交 2023-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
突变：artificial starting M 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG
分辨率 2.65 Å R-free 0.265
8V50 Crystal structure of a HLA-B*35:01-NP6 with D1 TCR 提交 2023-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 21–119（99 aa）
突变：artificial starting M 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG
分辨率 2.65 Å R-free 0.265
8V51 Crystal structure of a HLA-B*35:01-NP10 with D1 TCR 提交 2023-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG
分辨率 2.10 Å R-free 0.244
8V8Q HUMAN LEUKOCYTE ANTIGEN B*07:02 IN COMPLEX WITH MERS-COV EPITOPE N95-103 (A95S mutant) 提交 2023-12-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 BCT BICARBONATE ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.1 M HEPES: NaOH, pH 7.5, 25 % PEG 3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.210
8VCL Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2023-12-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277.15 K；12% w/v Polyethylene glycol 3,350, 4% v/v TacsimateTM, pH 6.0
分辨率 2.40 Å R-free 0.230
8VJZ HLA-A*03:01 with WT KRAS-10mer 提交 2024-01-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1M ammonium citrate tribasic pH7, 12% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.214
8VR9 Structure of a synthetic antibody in complex with a class I MHC presenting a hapten-peptide conjugate 提交 2024-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 MOV AMG 510 (bound form) × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
8VRA Structure of a synthetic antibody in complex with a class I MHC presenting a hapten-peptide conjugate 提交 2024-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 MOV AMG 510 (bound form) × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
8VRB Structure of a synthetic antibody in complex with a class I MHC presenting a hapten-peptide conjugate 提交 2024-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 20–119（100 aa） 片段：UNP residues 20-119
未记录 MOV AMG 510 (bound form) × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
8WTE Crystal structure of TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289.15 K；20% (w/v) PEG 3350 0.2 M sodium citrate.
分辨率 2.17 Å R-free 0.216
8WTE Crystal structure of TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289.15 K；20% (w/v) PEG 3350 0.2 M sodium citrate.
分辨率 2.17 Å R-free 0.216
8WUL Crystal structure of affinity enhanced TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 M 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289.15 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2M ammonium citrate tribasic at pH 7.0
分辨率 2.36 Å R-free 0.235
8WUL Crystal structure of affinity enhanced TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 J 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289.15 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2M ammonium citrate tribasic at pH 7.0
分辨率 2.36 Å R-free 0.235
8WUL Crystal structure of affinity enhanced TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 P 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289.15 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2M ammonium citrate tribasic at pH 7.0
分辨率 2.36 Å R-free 0.235
8WUL Crystal structure of affinity enhanced TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2023-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 S 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289.15 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2M ammonium citrate tribasic at pH 7.0
分辨率 2.36 Å R-free 0.235
8XES The structure of HLA-A/L1-1 提交 2023-12-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris, 20%w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 5000
分辨率 1.78 Å R-free 0.235
8XFZ The structure of HLA-A/L1-2 提交 2023-12-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M Imidazole, 20%w/v PEG 6000
分辨率 2.32 Å R-free 0.251
8XG2 The structure of HLA-A/Pep14 提交 2023-12-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris, 20%w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 5000
分辨率 1.84 Å R-free 0.230
8XKC The structure of HLA-A/Pep16 提交 2023-12-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M Imidazole, 20%w/v PEG 6000
分辨率 2.18 Å R-free 0.291
8XKE The structure of HLA-A/14-3-D 提交 2023-12-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M Bis-Tris, 20%w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 5000
分辨率 1.92 Å R-free 0.251
8Y6X Crystal structure of ternary complex of human MR1, ligand #4, and MAIT-TCR A-F7 提交 2024-02-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 A1LXU 5-(2-oxidanylidenepropyl)-8-[(2~{S},3~{S},4~{R})-2,3,4,5-tetrakis(oxidanyl)pentyl]-1,7-dihydropteridine-2,4,6-trione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.1M Tris (pH 8.2), 20mM Magnesium chloride, 22% (v/v) polyacrylic acid sodium salt 5,100
分辨率 3.40 Å R-free 0.208
8YE4 The complex of TCR NYN-I and HLA-A24 bound to SARS-CoV-2 Spike448-456 peptide NYNYLYRLF 提交 2024-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；8% Tacsimate 7.0, 20% PEG3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8YE4 The complex of TCR NYN-I and HLA-A24 bound to SARS-CoV-2 Spike448-456 peptide NYNYLYRLF 提交 2024-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；8% Tacsimate 7.0, 20% PEG3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8YIV N17.1.2 recognition of NRAS neoantigens 提交 2024-02-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10mg/ml, 8% TacsimateTM pH7.0, 20% PEG4K
分辨率 2.10 Å R-free 0.226
8YJ2 N17.1.2 recognition of NRAS neoantigens 提交 2024-02-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10mg/ml, 0.2 M NH4 citrate tribasic, 16% PEG3350, pH 7.4
分辨率 2.26 Å R-free 0.229
8YZR The structure of HLA-A*2402 complex with peptide from SARS-CoV-2 S448-456 NYNYLYRLL(EG.5.1) 提交 2024-04-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 20% (w/v) Polyethylene glycol 2,000
分辨率 1.80 Å R-free 0.262
8YZW The structure of HLA-A*2402 complex with peptide from SARS-CoV-2 S448-456 NYDYWYRLF(BA.2.86) 提交 2024-04-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate , 18% (w/v) Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.278
8YZW The structure of HLA-A*2402 complex with peptide from SARS-CoV-2 S448-456 NYDYWYRLF(BA.2.86) 提交 2024-04-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate , 18% (w/v) Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.278
8YZZ The structure of HLA-A*2402 complex with peptide from SARS-CoV-2 S448-456 NYNYLYRLF(Prototype) 提交 2024-04-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate ,18%w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 1.88 Å R-free 0.224
8Z05 The structure of HLA-A*0201 complex with peptide from SARS-CoV-2 N222-230 LLLDRLNKL(BA.2.86/JN.1) 提交 2024-04-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5, 18% (w/v) Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.96 Å R-free 0.275
8Z06 The structure of HLA-A*2402 complex with peptide from SARS-CoV-2 S448-456 NYDYWYRSF(JN.1) 提交 2024-04-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% (w/v) Polyethylene glycol 4,000
分辨率 2.39 Å R-free 0.232
8Z07 The structure of HLA-A*2402 complex with peptide from SARS-CoV-2 S448-456 NYNYRYRLF(Delta/BA.5.2) 提交 2024-04-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% (w/v) Polyethylene glycol 4,000
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
8Z08 The structure of HLA-A*2402 complex with peptide from SARS-CoV-2 S448-456 NYNYQYRLF(BA.2.12.1) 提交 2024-04-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M Bis-Tris, 20%w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 5000
分辨率 2.01 Å R-free 0.233
8ZOX 3D structure of Y-50 TCR-TMM-CD1b ternary complex 提交 2024-05-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 6UL TETRACOSYL PALMITATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 GLC alpha-D-glucopyranose × 1 A1L2B [(2R,3S,4S,5R,6S)-3,4,5,6-tetrakis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl (2R,3R)-3-oxidanyl-2-tetradecyl-octadecanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
8ZV9 Complex structure of HLA2402 with recognizing SARS-CoV-2 Y453F epitope NYNYLFRLF 提交 2024-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；287 K；20% PEG8000, 0.1 M HEPES 7.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.289
8ZV9 Complex structure of HLA2402 with recognizing SARS-CoV-2 Y453F epitope NYNYLFRLF 提交 2024-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；287 K；20% PEG8000, 0.1 M HEPES 7.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.289
8ZV9 Complex structure of HLA2402 with recognizing SARS-CoV-2 Y453F epitope NYNYLFRLF 提交 2024-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；287 K；20% PEG8000, 0.1 M HEPES 7.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.289
9ASF Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a wild-type PIK3CA peptide analogue (Trp-6 Bta) 提交 2024-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；15% w/v Polyethylene glycol 6,000, 50 mM Potassium chloride; 10 mM Magnesium chloride
分辨率 1.77 Å R-free 0.237
9ASG Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide analogue (Trp-6 Bta) 提交 2024-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；15% w/v Polyethylene glycol 3,350, 150mM Cesium chloride
分辨率 2.03 Å R-free 0.238
9BL2 KIR3DL1*001 in complex with HLA-B*57:03 presenting the AW10 peptide 提交 2024-04-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；18% PEG-3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.10 Å R-free 0.231
9BL3 KIR3DL1*114 in complex with HLA-B*57:03 presenting the AW10 peptide 提交 2024-04-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；16% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.00 Å R-free 0.229
9BL4 KIR3DL1*086 in complex with HLA-B*57:03 presenting the AW10 peptide 提交 2024-04-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；16% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 1.75 Å R-free 0.227
9BL5 KIR3DL1*001 in complex with HLA-A*24:02 presenting the TW9 peptide 提交 2024-04-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；16% PEG-3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.00 Å R-free 0.231
9BL6 KIR3DL1*114 in complex with HLA-A*24:02 presenting the TW9 peptide 提交 2024-04-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；14% PEG 3550, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.40 Å R-free 0.256
9BL9 KIR3DL1*114 in complex with HLA-A*24:02 presenting the NEF peptide 提交 2024-04-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；14% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.60 Å R-free 0.246
9BLA KIR3DL1*086 in complex with HLA-A*24:02 presenting the NEF peptide 提交 2024-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；14% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 3.00 Å R-free 0.248
9BTX Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-3,4-dihydroxybenzaldehyde 提交 2024-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 4 H6N Protocatechuic aldehyde × 1 ACT ACETATE ION × 4 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG3350, Na-acetate, BTP
分辨率 2.05 Å R-free 0.218
9BTX Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-3,4-dihydroxybenzaldehyde 提交 2024-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 H6N Protocatechuic aldehyde × 1 ACT ACETATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG3350, Na-acetate, BTP
分辨率 2.05 Å R-free 0.218
9BTY Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-veratraldehyde 提交 2024-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 XIK 3,4-dimethoxybenzaldehyde × 2 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG 3350, Na acetate, BTP
分辨率 2.85 Å R-free 0.223
9BTZ Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-nicotinaldehyde 提交 2024-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 XIE Nicotinaldehyde × 1 ACT ACETATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG 3350, Na acetate, BTP
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
9BTZ Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-nicotinaldehyde 提交 2024-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 XIE Nicotinaldehyde × 1 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG 3350, Na acetate, BTP
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
9BU0 Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-salicylaldehyde 提交 2024-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NK SALICYLALDEHYDE × 2 GOL GLYCEROL × 5 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG 3350, Na acetate, BTP
分辨率 2.89 Å R-free 0.238
9BYS Structure of human MAIT BV28 TCR in complex with human MR1-5-OP-RU 提交 2024-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 AAAD 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 Q87 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；PEG3350, Na-acetate, BTP
分辨率 3.10 Å R-free 0.252
9C3E TCR - CD3 complex bound to HLA 提交 2024-05-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 H 21–118（98 aa）
突变：C9V NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CLR CHOLESTEROL × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9C42 Structure of human MR1-ellagic acid in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2024-06-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 REF 2,3,7,8-tetrahydroxychromeno[5,4,3-cde]chromene-5,10-dione × 1 NA SODIUM ION × 3 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；PEG 3350, bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.69 Å R-free 0.246
9C42 Structure of human MR1-ellagic acid in complex with human MAIT A-F7 TCR 提交 2024-06-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 REF 2,3,7,8-tetrahydroxychromeno[5,4,3-cde]chromene-5,10-dione × 1 ACY ACETIC ACID × 2 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；PEG 3350, bis-tris propane, sodium acetate
分辨率 2.69 Å R-free 0.246
9C6V Crystal Structure of a single chain trimer composed of HLA-B*39:06 Y84C variant, beta-2microglobulin, and NRVMLPKAA peptide from NLRP2 (1 molecule/asymmetric unit) 提交 2024-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M Potassium sulfate
分辨率 1.70 Å R-free 0.219
9C6W Crystal Structure of a single chain trimer composed of HLA-B*39:06 Y84C variant, beta-2microglobulin, and NRVMLPKAA peptide from NLRP2 (2 molecules/asymmetric unit) 提交 2024-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；2M Ammonuim sulfate,0.2 M Lithium sulfate, 0.1 M HEPES
分辨率 1.70 Å R-free 0.215
9C6W Crystal Structure of a single chain trimer composed of HLA-B*39:06 Y84C variant, beta-2microglobulin, and NRVMLPKAA peptide from NLRP2 (2 molecules/asymmetric unit) 提交 2024-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 CL CHLORIDE ION × 2 P3G 3,6,9,12,15-PENTAOXAHEPTADECANE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；2M Ammonuim sulfate,0.2 M Lithium sulfate, 0.1 M HEPES
分辨率 1.70 Å R-free 0.215
9C6X Crystal Structure of a single chain trimer composed of HLA-B*39:01 Y84C variant, beta-2microglobulin, and NRVMLPKAA peptide from NLRP2 提交 2024-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–119（99 aa）
未记录 P4G 1-ETHOXY-2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；25% PEG 3350 and 0.1 M Tris
分辨率 1.70 Å R-free 0.232
9C96 Cryo-EM structure of TAP binding protein related (TAPBPR) in complex with HLA-A*02:01 bound to a suboptimal peptide. 提交 2024-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–118（98 aa）
突变：H31C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9C9D Protein receptor 提交 2024-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 8 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；295 K；PEG 8K, (NH4)2SO4, MES
分辨率 2.90 Å R-free 0.215
9CGR Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-Pyridoxal 提交 2024-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 PXL 3-HYDROXY-5-(HYDROXYMETHYL)-2-METHYLISONICOTINALDEHYDE × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACY ACETIC ACID × 2 CL CHLORIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG 3350, BTP, Ca acetate
分辨率 2.40 Å R-free 0.216
9CGR Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-Pyridoxal 提交 2024-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 PXL 3-HYDROXY-5-(HYDROXYMETHYL)-2-METHYLISONICOTINALDEHYDE × 1 GOL GLYCEROL × 7 ACY ACETIC ACID × 3 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG 3350, BTP, Ca acetate
分辨率 2.40 Å R-free 0.216
9CGS Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-Pyridoxal-5'-phosphate 提交 2024-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 ACY ACETIC ACID × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；PEG 3350, BTP, Ca acetate
分辨率 2.00 Å R-free 0.200
9CGS Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-Pyridoxal-5'-phosphate 提交 2024-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；PEG 3350, BTP, Ca acetate
分辨率 2.00 Å R-free 0.200
9CWY Crystal structure of HLA-A*03:02 in complex with a wild-type PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 ACT ACETATE ION × 2 FMT FORMIC ACID × 7 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277.15 K；12% w/v polyethylene glycol 3,350, 4% v/v Tacsimate (Hampton Research)
分辨率 1.98 Å R-free 0.224
9CWZ Crystal structure of HLA-A*03:02 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；277.15 K；20% w/v polyethylene glycol 3,350, 200 mM lithium nitrate
分辨率 2.05 Å R-free 0.238
9CX0 Crystal structure of HLA-A*03:01 E152V mutant in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277.15 K；12% w/v polyethylene glycol 3,350, 100 mM sodium malonate
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
9CX1 Crystal structure of HLA-A*03:01 L156Q mutant in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；20% w/v polyethylene glycol 3,350, 200 mM sodium malonate
分辨率 2.00 Å R-free 0.221
9CX2 Crystal structure of HLA-A*03:01 L156Q mutant in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；10% w/v polyethylene glycol 20,000, 100 mM MES
分辨率 2.30 Å R-free 0.219
9D73 CryoEM structure of anti-MHC-I mAb B1.23.2 complex with HLA-B44:05 提交 2024-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
9D74 CryoEM structure of anti-MHC-I Fab B1.23.2 complex with HLA-B44:05 提交 2024-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
9D95 TRAV35/TRBV20 TCR - HLA-B38 complex 提交 2024-08-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M Bis-Tris, pH6.5, 22%PEG3350, 0.2M (NH4)2SO4
分辨率 2.80 Å R-free 0.235
9D95 TRAV35/TRBV20 TCR - HLA-B38 complex 提交 2024-08-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M Bis-Tris, pH6.5, 22%PEG3350, 0.2M (NH4)2SO4
分辨率 2.80 Å R-free 0.235
9D95 TRAV35/TRBV20 TCR - HLA-B38 complex 提交 2024-08-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M Bis-Tris, pH6.5, 22%PEG3350, 0.2M (NH4)2SO4
分辨率 2.80 Å R-free 0.235
9D95 TRAV35/TRBV20 TCR - HLA-B38 complex 提交 2024-08-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M Bis-Tris, pH6.5, 22%PEG3350, 0.2M (NH4)2SO4
分辨率 2.80 Å R-free 0.235
9D96 KIR3DL1 - HLA-B38-YHL complex 提交 2024-08-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；15% PEG 3350, 2% Tacsimate, pH 5.0, and 0.1 M trisodium citrate, pH 5.6
分辨率 2.40 Å R-free 0.238
9D96 KIR3DL1 - HLA-B38-YHL complex 提交 2024-08-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；15% PEG 3350, 2% Tacsimate, pH 5.0, and 0.1 M trisodium citrate, pH 5.6
分辨率 2.40 Å R-free 0.238
9D97 KIR3DL1 - HLA-B*38-YHE complex 提交 2024-08-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；15% PEG 3350, 2% Tacsimate, pH 5.0, 0.1 M Na3citrate, pH 5.6
分辨率 1.60 Å R-free 0.195
9D97 KIR3DL1 - HLA-B*38-YHE complex 提交 2024-08-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；15% PEG 3350, 2% Tacsimate, pH 5.0, 0.1 M Na3citrate, pH 5.6
分辨率 1.60 Å R-free 0.195
9DBT Crystal structure of human astrovirus 1 capsid spike bound to human neonatal Fc receptor 提交 2024-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 21–119（99 aa）
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；295.15 K；Sodium chloride, Ammonium sulfate, BIS-TRIS
分辨率 3.40 Å R-free 0.263
9DBT Crystal structure of human astrovirus 1 capsid spike bound to human neonatal Fc receptor 提交 2024-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–119（99 aa）
链 J 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；295.15 K；Sodium chloride, Ammonium sulfate, BIS-TRIS
分辨率 3.40 Å R-free 0.263
9DL1 Crystal Structure of HLA-A*02:01/NY-ESO-1 (SLLMWITQV) and a target specific TRACeR-I 提交 2024-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Sulfate and 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.265
9DY8 Crystal structure of HLA-B*18:01 in complex with PEMTFFSVK, an 9-mer epitope from Influenza B 提交 2024-10-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 NA SODIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Lithium Acetate and 20% polyethylene glycol 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.248
9EK6 Crystal structure of MAIT TCR in complex with MR1-5FU 提交 2024-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 TDR THYMINE × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG3350, sodium acetate, BTP
分辨率 2.22 Å R-free 0.210
9EK6 Crystal structure of MAIT TCR in complex with MR1-5FU 提交 2024-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 TDR THYMINE × 1 GOL GLYCEROL × 4 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG3350, sodium acetate, BTP
分辨率 2.22 Å R-free 0.210
9EK7 Crystal structure of MAIT TCR in complex with MR1-5FdU 提交 2024-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 YC6 1-(2-deoxy-alpha-D-erythro-pentofuranosyl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG3350, sodium acetate, BTP
分辨率 2.15 Å R-free 0.206
9EK7 Crystal structure of MAIT TCR in complex with MR1-5FdU 提交 2024-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 4 ACT ACETATE ION × 2 THM THYMIDINE × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG3350, sodium acetate, BTP
分辨率 2.15 Å R-free 0.206
9F13 Crystal structure of HLA-C*12:02 in complex with KAYNVTQAF (KF9), a 9-mer epitope from SARS-CoV-2 Nucleocapsid (N266-274) 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2% PEG400, 20% PEG3350
分辨率 1.61 Å R-free 0.231
9FE1 Cryo-EM structure of the ternary DARPin NY_1/HLA-A0201/NY-ESO1 complex. 提交 2024-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；25 mM HEPES, 150 mM NaCl, pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9GV6 Structure of TCR in complex with peptide-HLA 提交 2024-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5, and 20 % w/v PEG 3350
分辨率 2.77 Å R-free 0.274
9GV6 Structure of TCR in complex with peptide-HLA 提交 2024-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5, and 20 % w/v PEG 3350
分辨率 2.77 Å R-free 0.274
9GV7 Structure of reverse docking TCR in complex with peptide-HLA 提交 2024-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MMT pH 9, 25% PEG 1500
分辨率 1.86 Å R-free 0.212
9HI7 Structure of MC.7.G5 T cell receptor in complex with MR1 R9H 提交 2024-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50 mM HEPES pH 7.0, 250 mM NaCl and 11% PEG 8000
分辨率 2.81 Å R-free 0.296
9HI7 Structure of MC.7.G5 T cell receptor in complex with MR1 R9H 提交 2024-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50 mM HEPES pH 7.0, 250 mM NaCl and 11% PEG 8000
分辨率 2.81 Å R-free 0.296
9HKQ Structure of VHH5 targeting NY-ESO-1(SLLMWITQC)/HLA-A*02:01 提交 2024-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9HLJ Crystal structure of GV37-TCR in complex with HLA-C*12:02 with KAYNVTQAF (KF9), a 9-mer epitope from SARS-CoV-2 Nucleocapsid (N266-274) 提交 2024-12-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Magnesium formate dihydrate, 20% PEG3350
分辨率 2.54 Å R-free 0.257
9IKY Crystal structure of 1-2C-T96F TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2024-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 p 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium HEPES (pH 7.0) 15% w/v PEG 4000.
分辨率 3.45 Å R-free 0.234
9IKY Crystal structure of 1-2C-T96F TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2024-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 k 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium HEPES (pH 7.0) 15% w/v PEG 4000.
分辨率 3.45 Å R-free 0.234
9IKY Crystal structure of 1-2C-T96F TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2024-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 u 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium HEPES (pH 7.0) 15% w/v PEG 4000.
分辨率 3.45 Å R-free 0.234
9IKY Crystal structure of 1-2C-T96F TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2024-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium HEPES (pH 7.0) 15% w/v PEG 4000.
分辨率 3.45 Å R-free 0.234
9IKY Crystal structure of 1-2C-T96F TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2024-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium HEPES (pH 7.0) 15% w/v PEG 4000.
分辨率 3.45 Å R-free 0.234
9IKY Crystal structure of 1-2C-T96F TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2024-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium HEPES (pH 7.0) 15% w/v PEG 4000.
分辨率 3.45 Å R-free 0.234
9IKY Crystal structure of 1-2C-T96F TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2024-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium HEPES (pH 7.0) 15% w/v PEG 4000.
分辨率 3.45 Å R-free 0.234
9IKY Crystal structure of 1-2C-T96F TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2024-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 V 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium HEPES (pH 7.0) 15% w/v PEG 4000.
分辨率 3.45 Å R-free 0.234
9IKY Crystal structure of 1-2C-T96F TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2024-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 a 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium HEPES (pH 7.0) 15% w/v PEG 4000.
分辨率 3.45 Å R-free 0.234
9IKY Crystal structure of 1-2C-T96F TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2024-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 f 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium HEPES (pH 7.0) 15% w/v PEG 4000.
分辨率 3.45 Å R-free 0.234
9IKY Crystal structure of 1-2C-T96F TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS-G12V peptide (VVGAVGVGK) 提交 2024-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 f 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium HEPES (pH 7.0) 15% w/v PEG 4000.
分辨率 3.45 Å R-free 0.234
9J4S Structural basis for recognition of SARS-CoV-2 conserved nucleocapside epitopes by dominant T cell receptors 提交 2024-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Tris-base/hydrochloric acid (pH 7.0), 0.2 M lithium sulfate, and 1.9 M ammonium sulfate
分辨率 2.95 Å R-free 0.238
9J4S Structural basis for recognition of SARS-CoV-2 conserved nucleocapside epitopes by dominant T cell receptors 提交 2024-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Tris-base/hydrochloric acid (pH 7.0), 0.2 M lithium sulfate, and 1.9 M ammonium sulfate
分辨率 2.95 Å R-free 0.238
9J4S Structural basis for recognition of SARS-CoV-2 conserved nucleocapside epitopes by dominant T cell receptors 提交 2024-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 D 21–119（99 aa）
链 H 21–119（99 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 9 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Tris-base/hydrochloric acid (pH 7.0), 0.2 M lithium sulfate, and 1.9 M ammonium sulfate
分辨率 2.95 Å R-free 0.238
9J4T Structural basis for recognition of SARS-CoV-2 conserved nucleocapside epitopes by dominant T cell receptors 提交 2024-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M ammonium citrate dibasic, and 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.04 Å R-free 0.232
9J4U Structural basis for recognition of SARS-CoV-2 conserved nucleocapside epitopes by dominant T cell receptors 提交 2024-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate, and 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.17 Å R-free 0.239
9J4V Structural basis for recognition of SARS-CoV-2 conserved nucleocapside epitopes by dominant T cell receptors 提交 2024-08-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 HEPES (pH 7.5), 0.2 M ammonium acetate, and 24% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.98 Å R-free 0.243
9J4V Structural basis for recognition of SARS-CoV-2 conserved nucleocapside epitopes by dominant T cell receptors 提交 2024-08-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 HEPES (pH 7.5), 0.2 M ammonium acetate, and 24% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.98 Å R-free 0.243
9K2I Rac1 epitope specific TCR 5934 binding to Rac1P29S-HLA-A2 提交 2024-10-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2M Potassium Citrate, 21% PEG 4000, 0.1M Hepes, pH7.0
分辨率 3.05 Å R-free 0.290
9K2I Rac1 epitope specific TCR 5934 binding to Rac1P29S-HLA-A2 提交 2024-10-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2M Potassium Citrate, 21% PEG 4000, 0.1M Hepes, pH7.0
分辨率 3.05 Å R-free 0.290
9K2I Rac1 epitope specific TCR 5934 binding to Rac1P29S-HLA-A2 提交 2024-10-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2M Potassium Citrate, 21% PEG 4000, 0.1M Hepes, pH7.0
分辨率 3.05 Å R-free 0.290
9K2I Rac1 epitope specific TCR 5934 binding to Rac1P29S-HLA-A2 提交 2024-10-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2M Potassium Citrate, 21% PEG 4000, 0.1M Hepes, pH7.0
分辨率 3.05 Å R-free 0.290
9K2R Human T cell receptor (TRAV24*01/TRBV27*01) in complex with HLA-C*1202 and IY11 peptide 提交 2024-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES pH7.0, 1.6M ammonium sulfate, 0.2M sodium thiocyanate
分辨率 2.98 Å R-free 0.233
9K2R Human T cell receptor (TRAV24*01/TRBV27*01) in complex with HLA-C*1202 and IY11 peptide 提交 2024-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES pH7.0, 1.6M ammonium sulfate, 0.2M sodium thiocyanate
分辨率 2.98 Å R-free 0.233
9K2R Human T cell receptor (TRAV24*01/TRBV27*01) in complex with HLA-C*1202 and IY11 peptide 提交 2024-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES pH7.0, 1.6M ammonium sulfate, 0.2M sodium thiocyanate
分辨率 2.98 Å R-free 0.233
9K2S Killer cell immunoglobulin-like receptor 2DL2 in complex with HLA-C*1202 and IY10 peptide 提交 2024-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M K/Na tartrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.299
9K2T Crystal structure of HLA-C*1202 in complex with IY10 peptide 提交 2024-10-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
9K2U Crystal structure of HLA-C*1202 in complex with IY11V9A peptide 提交 2024-10-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Sodium bromide, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.247
9L47 Crystal structure of HLA-C*12:03-MY9 提交 2024-12-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2 M Lithium sulfate 0.1M Tris pH8.5 30% w/v PEG4,000
分辨率 2.80 Å R-free 0.265
9L47 Crystal structure of HLA-C*12:03-MY9 提交 2024-12-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2 M Lithium sulfate 0.1M Tris pH8.5 30% w/v PEG4,000
分辨率 2.80 Å R-free 0.265
9L48 Crystal structure of HLA-C*12:02-RV9 提交 2024-12-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2 M sodium citrate tribasic dihydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.90 Å R-free 0.204
9L49 Crystal structure of HLA-C*12:03-RV9 提交 2024-12-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；1.5 M Ammonium sulfate 0.1 M Sodium HEPES pH7.5 2% v/v PEG400
分辨率 3.00 Å R-free 0.235
9L4A Crystal structure of HLA-C*12:02-MY9 提交 2024-12-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2M Sodium formate 0.1M Bis-Tris propane pH8.5 20% w/v PEG3,350
分辨率 1.90 Å R-free 0.207
9L4A Crystal structure of HLA-C*12:02-MY9 提交 2024-12-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2M Sodium formate 0.1M Bis-Tris propane pH8.5 20% w/v PEG3,350
分辨率 1.90 Å R-free 0.207
9L4G Crystal structure of HLA-C*14:03 complexed with 8-mer HIV gag peptide 提交 2024-12-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；6% v/v 2-Propanol, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.5 and 26% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
分辨率 2.70 Å R-free 0.255
9L4H Crystal structure of HLA-C*14:03 complexed with KIR2DL2 提交 2024-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2 M Potassium phosphate dibasic and 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.10 Å R-free 0.252
9L4I Crystal structure of HLA-C*14:02 complexed with KIR2DL2 提交 2024-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2 M Potassium citrate tribasic monohydrate and 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.50 Å R-free 0.253
9MDA Conformational flexibility in HLA-B8: peptide tuning structural and dynamical changes 提交 2024-12-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；12.5-16% PEG 4000,100mM citrate acid pH5.5 ,100mM ammonium acetate
分辨率 1.60 Å R-free 0.239
9MEF Conformational flexibility in HLA-B8: peptide tuning structural and dynamical changes 提交 2024-12-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；15% PEG4000, 0.1m citrate acid pH5.4, 0.2M ammonium acetate
分辨率 1.27 Å R-free 0.227
9MEG Conformational flexibility in HLA-B8: peptide tuning structural and dynamical changes 提交 2024-12-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；50% PEG4000, 20% citrate acid pH5.5, 0.1M ammonium acetate
分辨率 1.61 Å R-free 0.227
9MI6 Crystal structure of human FcRn in complex with nipocalimab Fab fragment 提交 2024-12-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；10% PEG 1000, 10% PEG 8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.248
9MIN Structure of a designed minibinder to NYESO1-A*02:01 提交 2024-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
突变：insertion of MG at N-terminus - cloning artifact GOL GLYCEROL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.2 M ammonium acetate 0.1 M bis-tris pH 5.5 25% PEG 3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.267
9MIN Structure of a designed minibinder to NYESO1-A*02:01 提交 2024-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 21–119（99 aa）
突变：insertion of MG at N-terminus - cloning artifact GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.2 M ammonium acetate 0.1 M bis-tris pH 5.5 25% PEG 3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.267
9MS0 Structure of cord Blood MAIT A2 TCR in complex with human MR1-5-OP-RU 提交 2025-01-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–118（98 aa）
未记录 Q87 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG3350, Na-acetate, BTP
分辨率 2.52 Å R-free 0.213
9NAV CryoEM structure of human astrovirus 1 spike in complex with human neonatal Fc receptor 提交 2025-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 H 21–119（99 aa）
链 J 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.81 Å
9NFB Structure of the cross-HLA supertype antibody R302 bound to a class I MHC presenting a divarasib-modified KRAS-G12C peptide on HLA-A*02 提交 2025-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 A1AWR 1-{(3S)-4-[(7M)-7-[6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloro-8-fluoro-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}quinazolin-4-yl]-3-methylpiperazin-1-yl}propan-1-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot time 4 s blot force 5
分辨率 3.23 Å
9NFC Structure of the cross-HLA supertype antibody R302 bound to a class I MHC presenting a divarasib-modified KRAS-G12C peptide on HLA-A*03 提交 2025-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 A1AWR 1-{(3S)-4-[(7M)-7-[6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloro-8-fluoro-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}quinazolin-4-yl]-3-methylpiperazin-1-yl}propan-1-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot time 4 s blot force 5
分辨率 2.58 Å
9NKH Conformational flexibility in HLA-B8: peptide tuning structural and dynamical changes 提交 2025-02-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；298 K；25% PEG3350, 0.1M Tris pH8.4, 0.1M (NH4)2SO4, 90mM Cesium chloride
分辨率 1.94 Å R-free 0.259
9NKH Conformational flexibility in HLA-B8: peptide tuning structural and dynamical changes 提交 2025-02-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；298 K；25% PEG3350, 0.1M Tris pH8.4, 0.1M (NH4)2SO4, 90mM Cesium chloride
分辨率 1.94 Å R-free 0.259
9NMU TCR156 bound to HLA A*02:01-PAP 提交 2025-03-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；295 K；0.2 M Sodium malonate, 0.1 M bis Tris-propane pH 7.5, 17% PEG 3500
分辨率 2.10 Å R-free 0.227
9NMV TCR156 S32Halpha bound to HLA A*02:01-PAP 提交 2025-03-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；0.2 M Sodium malonate, 0.1 M bis Tris-propane pH 7.5, 20% PEG3500
分辨率 1.97 Å R-free 0.217
9NMW TCR156 S30Ealpha S32Qalpha bound to HLA A*02:01-PAP 提交 2025-03-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 11 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；0.2 M Na2SO4, bis tris propane pH 7.5, 20% PEG 3350
分辨率 2.11 Å R-free 0.232
9NMX TCR156 S32Malpha variant bound to HLA A*02:01-PAP 提交 2025-03-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 MLI MALONATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 12 NA SODIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；0.2 M Sodium malonate, 0.1 M bis Tris-propane pH 7.5, 17% PEG 3500
分辨率 2.19 Å R-free 0.229
9NMY TCR156 S32Qalpha bound to HLA A*02:01-PAP 提交 2025-03-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 9 MLI MALONATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.3；295 K；0.2 M sodium malonat, 20% PEG 3350
分辨率 2.01 Å R-free 0.227
9NNF Cryo-EM structure of a de-novo designed binder NY1-B04 in complex with HLA-A*02:01 and NY-ESO-1-derived peptide SLLMWITQC 提交 2025-03-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9NW6 CA147v24 Fab bound to HLA-E-VL9 提交 2025-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M potassium iodide, 0.1 M MES pH 6.5, 25% PEG 4000
分辨率 3.10 Å R-free 0.258
9NW6 CA147v24 Fab bound to HLA-E-VL9 提交 2025-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M potassium iodide, 0.1 M MES pH 6.5, 25% PEG 4000
分辨率 3.10 Å R-free 0.258
9NW7 CA117v2v8 Fab bound to HLA-E-VL9 提交 2025-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.233
9NW8 CA117v2v8 Fab bound to HLA-E-Mtb44 提交 2025-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M magnesium acetate, 20% PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.246
9NW9 CA117v2v8 Fab bound to HLA-E-RL9HIV 提交 2025-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M magnesium chloride, 20% PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.239
9NYN Conformational flexibility in HLA-B8: peptide tuning structural and dynamical changes 提交 2025-03-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；15% PEG 4000, 0.1M Sodium cacodylate pH 5.4, 0.2M ammonium acetate
分辨率 1.43 Å R-free 0.215
9O05 Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-riboflavin 提交 2025-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 RBF RIBOFLAVIN × 1 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；298 K；Bis-Tris-propane, PEG3350 and sodium acetate
分辨率 1.95 Å R-free 0.201
9O05 Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-riboflavin 提交 2025-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 RBF RIBOFLAVIN × 1 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；298 K；Bis-Tris-propane, PEG3350 and sodium acetate
分辨率 1.95 Å R-free 0.201
9O06 Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-10-formylmethylflavin 提交 2025-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 A1B7N (7,8-dimethyl-2,4-dioxo-3,4-dihydrobenzo[g]pteridin-10(2H)-yl)acetaldehyde × 2 GOL GLYCEROL × 4 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；298 K；Bis-Tris-propane, PEG3350 and sodium acetate
分辨率 2.00 Å R-free 0.210
9O07 Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-lumiflavin 提交 2025-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 LFN LUMIFLAVIN × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；298 K；Bis-Tris-propane, PEG3350 and sodium acetate
分辨率 1.97 Å R-free 0.195
9O07 Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-lumiflavin 提交 2025-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 LFN LUMIFLAVIN × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；298 K；Bis-Tris-propane, PEG3350 and sodium acetate
分辨率 1.97 Å R-free 0.195
9O08 Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-lumichrome 提交 2025-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 2 LUM LUMICHROME × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；298 K；Bis-Tris-propane, PEG3350 and sodium acetate
分辨率 2.20 Å R-free 0.220
9O08 Structure of human MAIT A-F7 TCR in complex with human MR1-lumichrome 提交 2025-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 GOL GLYCEROL × 3 LUM LUMICHROME × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；298 K；Bis-Tris-propane, PEG3350 and sodium acetate
分辨率 2.20 Å R-free 0.220
9O4X Gamma delta T cell receptor bound to CD1d 提交 2025-04-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 FO4 sphingomyelin × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16% PEG 3350, 0.05M CBTP pH 5
分辨率 2.86 Å R-free 0.255
9O5S minibinder-antigen complex BXMart1-3-MART1-HLA*A02 提交 2025-04-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M potassium thiocyanate, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.27 Å R-free 0.234
9O5S minibinder-antigen complex BXMart1-3-MART1-HLA*A02 提交 2025-04-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M potassium thiocyanate, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.27 Å R-free 0.234
9O5S minibinder-antigen complex BXMart1-3-MART1-HLA*A02 提交 2025-04-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M potassium thiocyanate, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.27 Å R-free 0.234
9O5S minibinder-antigen complex BXMart1-3-MART1-HLA*A02 提交 2025-04-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 M 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M potassium thiocyanate, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.27 Å R-free 0.234
9OC6 Crystal structure of receptor FcRn bound to Human Astrovirus 6 spike 提交 2025-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 30% 1,2-propanediol, 20% PEG-400
分辨率 2.97 Å R-free 0.281
9OC7 Crystal structure of FcRn in complex with Human Astrovirus 2 spike 提交 2025-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 21–119（99 aa）
链 Z 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.9；293 K；25% 1,2-propanediol, 10% glycerol, 5% PEG-3000, 0.1 M phosphate-citrate
分辨率 3.07 Å R-free 0.239
9OHT CD1c presenting GD3 ganglioside 提交 2025-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 A1CB5 (2S)-2,3-dihydroxypropyl heptadecanoate × 1 KZF 2-(cyclohexylazaniumyl)ethanesulfonate × 1 MLA MALONIC ACID × 2 A1CB4 (2S,3R,4E)-3-hydroxy-2-octadecanamidooctadec-4-en-1-yl 5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl-(2->8)-5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl-(2->3)-beta-D-galactopyranosyl-(1->4)-beta-D-glucopyranoside × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.46；293 K；0.1 M CHES pH 9.46 1.05 M tri-Na citrate 0.025 M tri-glycine
分辨率 2.98 Å R-free 0.251
9OHU CD1c presenting GM3 ganglioside 提交 2025-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 A1CB5 (2S)-2,3-dihydroxypropyl heptadecanoate × 1 KZF 2-(cyclohexylazaniumyl)ethanesulfonate × 1 MLA MALONIC ACID × 2 CL CHLORIDE ION × 2 A1CB6 (2S,3R,4E)-3-hydroxy-2-octadecanamidooctadec-4-en-1-yl 5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl-(2->3)-beta-D-galactopyranosyl-(1->4)-beta-D-glucopyranoside × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.46；293 K；0.1 M CHES pH 9.46 1.05 M tri-Na Citrate 0.025 M tri-glycine
分辨率 2.90 Å R-free 0.272
9OHV CD1c presenting dual lipids MPM and GD3 ganglioside 提交 2025-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–118（98 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 A1CB4 (2S,3R,4E)-3-hydroxy-2-octadecanamidooctadec-4-en-1-yl 5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl-(2->8)-5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl-(2->3)-beta-D-galactopyranosyl-(1->4)-beta-D-glucopyranoside × 1 MK0 1-O-[(S)-hydroxy{[(4S,8S,16S,20S)-4,8,12,16,20-pentamethylheptacosyl]oxy}phosphoryl]-beta-D-mannopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 KZF 2-(cyclohexylazaniumyl)ethanesulfonate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.46；293 K；0.1 M CHES pH 9.46 1.05 M tri-Na Citrate 0.025 M tri-glycine
分辨率 2.12 Å R-free 0.260
9OHW CD1c presenting GM1 ganglioside 提交 2025-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 20–118（99 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MK0 1-O-[(S)-hydroxy{[(4S,8S,16S,20S)-4,8,12,16,20-pentamethylheptacosyl]oxy}phosphoryl]-beta-D-mannopyranose × 1 GGG glycylglycylglycine × 3 KZF 2-(cyclohexylazaniumyl)ethanesulfonate × 3 MLA MALONIC ACID × 1 A1CB7 (2S,3R,4E)-3-hydroxy-2-octadecanamidooctadec-4-en-1-yl 5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl-(2->3)-[beta-D-galactopyranosyl-(1->3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranosyl-(1->4)]-beta-D-galactopyranosyl-(1->4)-beta-D-glucopyranoside × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.46；293 K；0.1 M CHES pH 9.46 1.05 M tri-Na Citrate 0.025 M tri-glycine
分辨率 2.50 Å R-free 0.246
9OHX CD1c presenting endogenous lipids 提交 2025-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 KZF 2-(cyclohexylazaniumyl)ethanesulfonate × 3 EKG (2R)-2,3-dihydroxypropyl hexadecanoate × 1 D10 DECANE × 1 D12 DODECANE × 1 R16 HEXADECANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.4；293 K；100 mM CHES, 1.05 M sodium citrate, 25 mM triglycine
分辨率 1.68 Å R-free 0.217
9OHY CD1c presenting phosphomycoketide in its open conformation 提交 2025-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 Z7B (4S,8S,16S,20S)-4,8,12,16,20-pentamethylheptacosyl dihydrogen phosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 D12 DODECANE × 2 KZF 2-(cyclohexylazaniumyl)ethanesulfonate × 3 GGG glycylglycylglycine × 1 MLA MALONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.46；293 K；0.1 M CHES pH 9.46 1.05 M tri-Na Citrate 0.025 M tri-glycine
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
9OHZ Crystal structure of CD1a presenting ganglioside GD3 提交 2025-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 20–119（100 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 A1CB9 N-{(2S,3R)-1-[(4-O-beta-D-galactopyranosyl-beta-D-glucopyranosyl)oxy]-3-hydroxyoctadecan-2-yl}tetracosanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；21% PEG 1500, 0.1M MMT pH 5.5
分辨率 2.14 Å R-free 0.247
9OI0 Crystal structure of CD1b presenting ganglioside GD3 提交 2025-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–118（98 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 A1CDL N-{(2S,3R,4E)-1-[(4-O-beta-D-galactopyranosyl-beta-D-glucopyranosyl)oxy]-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl}octadecanamide × 1 CUY tetracosyl octadecanoate × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22% PEG 3350, 0.1 M Sodium Iodide
分辨率 1.84 Å R-free 0.266
9PBG TCR 19.2 complex with YEIH-HLA B*27:05 提交 2025-06-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 9 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M sodium malonate pH 6.4 17% PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.258
9PBH AS19.2 TCR complex with PSG5-HLA B*27:05 提交 2025-06-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M sodium formate; 20% PEG 3350
分辨率 2.13 Å R-free 0.246
9PIX Mur14 Fab with HBV c18V pMHC 提交 2025-07-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；300 K；0.2 M NH4F, 20% PEG3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.235
9PKC Mur35 Fab with HBV c18V pMHC 提交 2025-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；300 K；0.15 M NH4F + 15% PEG3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
9PKF Mur35 Fab with HBV c18I pMHC 提交 2025-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；300 K；0.2 M NH4F + 20% PEG3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.303
9PKV HU-38 Fab with PRAME pMHC 提交 2025-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.72 Å
9QQE Cryo-EM structure of the SN230G6 Fab - HLA-A*02:01 human alloantibody-HLA complex 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；1X Phosphate-Buffered Saline (PBS)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
9QQF Cryo-EM structure of the WIM8E5 Fab - HLA-A*11:01 human alloantibody-HLA complex 提交 2025-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；1X Phosphate-Buffered Saline (PBS)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9QWJ Crystal structure of S2c TCR in complex with CD1c 提交 2025-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–118（98 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 BMA beta-D-mannopyranose × 1 D12 DODECANE × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.4, 0.2 M Calcium chloride dihydrate, 16 % (w/v) PEG 3350 and 3 % (w/v) 1,6-Hexanediol
分辨率 2.04 Å R-free 0.235
9QWJ Crystal structure of S2c TCR in complex with CD1c 提交 2025-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 N 21–118（98 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 BMA beta-D-mannopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 2 D10 DECANE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.4, 0.2 M Calcium chloride dihydrate, 16 % (w/v) PEG 3350 and 3 % (w/v) 1,6-Hexanediol
分辨率 2.04 Å R-free 0.235
9QWK Crystal structure of S2c-a5b6 TCR in complex with CD1c 提交 2025-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 21–118（98 aa）
链 B 21–118（98 aa）
未记录 D10 DECANE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium thiocyanate and 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.27 Å R-free 0.253
9QWK Crystal structure of S2c-a5b6 TCR in complex with CD1c 提交 2025-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 21–118（98 aa）
链 J 21–118（98 aa）
未记录 D10 DECANE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium thiocyanate and 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.27 Å R-free 0.253
9QWK Crystal structure of S2c-a5b6 TCR in complex with CD1c 提交 2025-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 21–118（98 aa）
链 O 21–118（98 aa）
未记录 D10 DECANE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium thiocyanate and 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.27 Å R-free 0.253
9QWK Crystal structure of S2c-a5b6 TCR in complex with CD1c 提交 2025-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 Q 21–118（98 aa）
链 T 21–118（98 aa）
未记录 D10 DECANE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium thiocyanate and 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.27 Å R-free 0.253
9RCV Structure of the Human Peptide-Loading Complex Arrested by HCMV US6 提交 2025-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 D 1–119（119 aa）
链 H 1–119（119 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5；20 mM HEPES-NaOH pH 6.5, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 2.5 mM biotin, 0.05% (w/v) glycodiosgenin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force 5, Blot time 5 s
分辨率 2.70 Å
9RUP Cryo-EM structure of TCRpub/pMHC dimer 提交 2025-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 21–119（99 aa）
链 e 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；30 mM HEPES pH 7.4, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.11 Å
9RXM Cryo-EM structure of TCRpriv/pMHC 提交 2025-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；30 mM HEPES pH 7.4, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9SKO Crystal structure of HLA-A0201 in complex with peptide LLWNGPMAVS 提交 2025-09-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 8 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 11 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M Ammonium nitrate, 0.1M HEPES 7.5, 20% w/v PEG Smear Broad BCS Screen E9
分辨率 1.49 Å R-free 0.204
9SKP Crystal structure of HLA-A0201 in complex with peptide SLLWNGPMAV 提交 2025-09-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 NA SODIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291.15 K；0.005M Nickel(II)chloride hexahydrate, 0.1 M TRIS 7.5 20% w/v PEG 4000 Clear Strategy 2 F9
分辨率 1.89 Å R-free 0.229
9SL0 Crystal structure of HLA-A0201 in complex with peptide LLWNGPMAV 提交 2025-09-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.005 M Cadmium chloride hemi(pentahydrate), 0.1 M Tris 8.5, 20% w/v PEG 4000 Clear-Strategy-Screen-II H3
分辨率 1.60 Å R-free 0.264
9UV8 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12D 9-mer peptide (VVGADGVGK) 提交 2025-05-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；27% PEG3350,0.1M Bis-Tris,0.2M Lithium sulfate,additve 0.1M Spermidine
分辨率 1.79 Å R-free 0.231
9UVI Crystal structure of beta 2 microglobulin in complex with antibody BBM.1 提交 2025-05-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate 0.1 M Bis-Tris propane 8.5 20 % w/v PEG 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.246
9WBD Crystal structure of HLA-B*07:02 in complex with SPR epitope and Q04 TCR 提交 2025-08-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；Tris-HCl, calcium chloride, PEG 3350
分辨率 2.75 Å R-free 0.270
9WBD Crystal structure of HLA-B*07:02 in complex with SPR epitope and Q04 TCR 提交 2025-08-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 21–119（99 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；Tris-HCl, calcium chloride, PEG 3350
分辨率 2.75 Å R-free 0.270
9WBD Crystal structure of HLA-B*07:02 in complex with SPR epitope and Q04 TCR 提交 2025-08-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 N 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；Tris-HCl, calcium chloride, PEG 3350
分辨率 2.75 Å R-free 0.270
9WBD Crystal structure of HLA-B*07:02 in complex with SPR epitope and Q04 TCR 提交 2025-08-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 S 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；Tris-HCl, calcium chloride, PEG 3350
分辨率 2.75 Å R-free 0.270
9WVE Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12A 10-mer peptide (VVVGAAGVGK) 提交 2025-09-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；23% PEG3350, 0.1M Bis-Tris, PH5.8, 0.2M Lithium sulfate
分辨率 2.80 Å R-free 0.267
9WVE Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12A 10-mer peptide (VVVGAAGVGK) 提交 2025-09-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；23% PEG3350, 0.1M Bis-Tris, PH5.8, 0.2M Lithium sulfate
分辨率 2.80 Å R-free 0.267
9WVE Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12A 10-mer peptide (VVVGAAGVGK) 提交 2025-09-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；23% PEG3350, 0.1M Bis-Tris, PH5.8, 0.2M Lithium sulfate
分辨率 2.80 Å R-free 0.267
9WVE Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12A 10-mer peptide (VVVGAAGVGK) 提交 2025-09-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；23% PEG3350, 0.1M Bis-Tris, PH5.8, 0.2M Lithium sulfate
分辨率 2.80 Å R-free 0.267
9WVF Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12S 10-mer peptide (VVVGASGVGK) 提交 2025-09-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；29% PEG3350,0.1M Bis-Tris,PH5.2,0.2M Lithium sulfate
分辨率 2.80 Å R-free 0.291
9WVF Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12S 10-mer peptide (VVVGASGVGK) 提交 2025-09-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；29% PEG3350,0.1M Bis-Tris,PH5.2,0.2M Lithium sulfate
分辨率 2.80 Å R-free 0.291
9WVF Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12S 10-mer peptide (VVVGASGVGK) 提交 2025-09-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；29% PEG3350,0.1M Bis-Tris,PH5.2,0.2M Lithium sulfate
分辨率 2.80 Å R-free 0.291
9WVF Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12S 10-mer peptide (VVVGASGVGK) 提交 2025-09-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；29% PEG3350,0.1M Bis-Tris,PH5.2,0.2M Lithium sulfate
分辨率 2.80 Å R-free 0.291
9WYD Crystal structure of HAstV8 spike and FcRn 提交 2025-09-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；291.15 K；0.1 M BICINE pH 8.5, 8% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 5,000
分辨率 2.65 Å R-free 0.232
9Y0T Crystal structure of human MAIT A-F7 TCR-MR1*02-5-OP-RU complex 提交 2025-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–119（99 aa）
链 F 21–119（99 aa）
未记录 Q87 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 2 ACT ACETATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, BTP, Cacl2
分辨率 2.30 Å R-free 0.218
9Y0U Crystal structure of human MAIT A-F7 TCR-MR1*03-5-OP-RU complex 提交 2025-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
链 F 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 ACY ACETIC ACID × 2 Q87 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 2 GOL GLYCEROL × 8 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, BTP, CaCl2
分辨率 2.10 Å R-free 0.187
9Y0V Crystal Structure of human MAIT A-F7 TCR-MR1*04 complex 提交 2025-08-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 6000, HEPES, Lithium Chloride
分辨率 3.00 Å R-free 0.244
9Y0V Crystal Structure of human MAIT A-F7 TCR-MR1*04 complex 提交 2025-08-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 21–119（99 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 6000, HEPES, Lithium Chloride
分辨率 3.00 Å R-free 0.244
9Y0W Crystal Structure of human MAIT A-F7 TCR-MR1*05-5-OP-RU complex 提交 2025-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 21–119（99 aa）
链 F 21–119（99 aa）
未记录 Q87 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 2 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, BTP, CaCl2
分辨率 2.40 Å R-free 0.217
9YTD Designed antibody vAB66 targeting PAP-HLA A*02:01 提交 2025-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
9YTF TCR mimic antibody vAB-30 in complex with MAGE-A3 in HLA-A1 提交 2025-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–119（99 aa） 片段：UNP residues 21-119
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å

共 1313 个其他 PDB 条目、1998 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 B2MG_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 2–100； UniProt 21–119

Spike protein S1

物种未注明

UniProt P0DTC2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 269–277 片段：epitope YLQPRTFLL (UNP residues 269-277) MHC class I antigen × 1 （U5YJM1） Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；290 K；17% PEG10000, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 0.1 M ammonium acetate 分辨率 1.90 Å R-free 0.209

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7MKB Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
10MU SARS-CoV-2 S2 in complex with polyclonal Fab_Donor2 提交 2026-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 698–1161（464 aa）
链 D 698–1161（464 aa）
链 E 698–1161（464 aa）
突变：S704C, K790C, G880C, F888C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, T961F, V991W, T998W 突变：S704C, K790C, G880C, F888C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, T961F, V991W, T998W 突变：S704C, K790C, G880C, F888C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, T961F, V991W, T998W NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
11HK SARS-CoV-2 spike S2 trimer stabilized in the early fusion intermediate conformation (E-FICs-v3) bound to the VN01H1 Fab (Fab local refinement) 提交 2026-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 914–1131（218 aa）
链 A 703–833（131 aa）
链 D 914–1131（218 aa）
链 D 703–833（131 aa）
链 G 914–1131（218 aa）
链 G 703–833（131 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
11HL SARS-CoV-2 spike S2 trimer stabilized in the early fusion intermediate conformation (E-FICs-v3) bound to the VN01H1 Fab (S2 local refinement) 提交 2026-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 914–1131（218 aa）
链 A 703–833（131 aa）
链 B 914–1131（218 aa）
链 B 703–833（131 aa）
链 C 914–1131（218 aa）
链 C 703–833（131 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
11HN SARS-CoV-2 spike S2 trimer stabilized in the early fusion intermediate conformation (E-FICs-v3) bound to C77G12 (S2 local refinement) 提交 2026-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 914–1131（218 aa）
链 A 703–833（131 aa）
链 B 914–1131（218 aa）
链 B 703–833（131 aa）
链 C 914–1131（218 aa）
链 C 703–833（131 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
11HW SARS-CoV-2 spike S2 trimer stabilized in the early fusion intermediate conformation (E-FICs-v3) bound to C77G12 (Fab local refinement) 提交 2026-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 914–1131（218 aa）
链 A 703–833（131 aa）
链 B 914–1131（218 aa）
链 B 703–833（131 aa）
链 G 914–1131（218 aa）
链 G 703–833（131 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6LVN Structure of the 2019-nCoV HR2 Domain 提交 2020-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1168–1203（36 aa） 片段：HR2 domain
链 B 1168–1203（36 aa） 片段：HR2 domain
链 C 1168–1203（36 aa） 片段：HR2 domain
链 D 1168–1203（36 aa） 片段：HR2 domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M Tris HCl, pH 8.5, 25% PEG3350
分辨率 2.47 Å R-free 0.258
6LXT Structure of post fusion core of 2019-nCoV S2 subunit 提交 2020-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 910–988（79 aa） 片段：HR1 domain,HR2 domain
链 A 1162–1206（45 aa） 片段：HR1 domain,HR2 domain
链 B 910–988（79 aa） 片段：HR1 domain,HR2 domain
链 B 1162–1206（45 aa） 片段：HR1 domain,HR2 domain
链 C 910–988（79 aa） 片段：HR1 domain,HR2 domain
链 C 1162–1206（45 aa） 片段：HR1 domain,HR2 domain
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289 K；10% PEG 8000, 200 mM zinc acetate, 0.1 M MES, pH 6.0
分辨率 2.90 Å R-free 0.290
6LXT Structure of post fusion core of 2019-nCoV S2 subunit 提交 2020-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 910–988（79 aa） 片段：HR1 domain,HR2 domain
链 D 1162–1206（45 aa） 片段：HR1 domain,HR2 domain
链 E 910–988（79 aa） 片段：HR1 domain,HR2 domain
链 E 1162–1206（45 aa） 片段：HR1 domain,HR2 domain
链 F 910–988（79 aa） 片段：HR1 domain,HR2 domain
链 F 1162–1206（45 aa） 片段：HR1 domain,HR2 domain
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289 K；10% PEG 8000, 200 mM zinc acetate, 0.1 M MES, pH 6.0
分辨率 2.90 Å R-free 0.290
6LZG Structure of novel coronavirus spike receptor-binding domain complexed with its receptor ACE2 提交 2020-02-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–527（209 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M MES pH 6.5,10%w/v PEG 5000 MME,12% v/v 1-propanol
分辨率 2.50 Å R-free 0.216
6M0J Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain bound with ACE2 提交 2020-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 319–541（223 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M MES, PEG5000mme
分辨率 2.45 Å R-free 0.227
6M17 The 2019-nCoV RBD/ACE2-B0AT1 complex 提交 2020-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 319–541（223 aa）
链 F 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 LEU LEUCINE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6M1V Crystal structure of post fusion core of 2019-nCoV S2 subunit 提交 2020-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 918–966（49 aa）
链 A 1162–1203（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M bis-tris, pH 6.5, and 25% (wt/vol) polyethylene glycol 3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.212
6VSB Prefusion 2019-nCoV spike glycoprotein with a single receptor-binding domain up 提交 2020-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P, R682G, R683S, R685S 突变：K986P, V987P, R682G, R683S, R685S 突变：K986P, V987P, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
6VW1 Structure of SARS-CoV-2 chimeric receptor-binding domain complexed with its receptor human ACE2 提交 2020-02-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 455–518（64 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Tris, PEG 6000, and 100 mM NaCl.
分辨率 2.68 Å R-free 0.229
6VW1 Structure of SARS-CoV-2 chimeric receptor-binding domain complexed with its receptor human ACE2 提交 2020-02-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 455–518（64 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Tris, PEG 6000, and 100 mM NaCl.
分辨率 2.68 Å R-free 0.229
6VXX Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein (closed state) 提交 2020-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa） 片段：ectodomain
链 B 14–1211（1198 aa） 片段：ectodomain
链 C 14–1211（1198 aa） 片段：ectodomain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6VYB SARS-CoV-2 spike ectodomain structure (open state) 提交 2020-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa） 片段：ectodomain
链 B 14–1211（1198 aa） 片段：ectodomain
链 C 14–1211（1198 aa） 片段：ectodomain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6W41 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with human antibody CR3022 提交 2020-03-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 319–541（223 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；80 mM sodium acetate pH 4.6, 1.5 M ammonium sulfate, and 20% glycerol
分辨率 3.08 Å R-free 0.243
6WPS Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with the S309 neutralizing antibody Fab fragment 提交 2020-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa） 片段：;signaling sequence + ectodomain (UNP residues 14-1211) + foldon trimerization domain + TEV cleavage site + His-tag,signaling sequence + ectodomain (UNP residues 14-1211) + foldon trimerization domain + TEV cleavage site + His-tag ;
链 B 14–1211（1198 aa） 片段：;signaling sequence + ectodomain (UNP residues 14-1211) + foldon trimerization domain + TEV cleavage site + His-tag,signaling sequence + ectodomain (UNP residues 14-1211) + foldon trimerization domain + TEV cleavage site + His-tag ;
链 E 14–1211（1198 aa） 片段：;signaling sequence + ectodomain (UNP residues 14-1211) + foldon trimerization domain + TEV cleavage site + His-tag,signaling sequence + ectodomain (UNP residues 14-1211) + foldon trimerization domain + TEV cleavage site + His-tag ;
突变：R701S,R702G,R704G,K1005P,V1005P 突变：R701S,R702G,R704G,K1005P,V1005P 突变：R701S,R702G,R704G,K1005P,V1005P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6WPT Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with the S309 neutralizing antibody Fab fragment (open state) 提交 2020-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 14–1211（1198 aa） 片段：;signaling sequence + ectodomain (UNP residues 14-1211) + foldon trimerization domain + TEV cleavage site + His-tag,signaling sequence + ectodomain (UNP residues 14-1211) + foldon trimerization domain + TEV cleavage site + His-tag ;
链 B 14–1211（1198 aa） 片段：;signaling sequence + ectodomain (UNP residues 14-1211) + foldon trimerization domain + TEV cleavage site + His-tag,signaling sequence + ectodomain (UNP residues 14-1211) + foldon trimerization domain + TEV cleavage site + His-tag ;
链 C 14–1211（1198 aa） 片段：;signaling sequence + ectodomain (UNP residues 14-1211) + foldon trimerization domain + TEV cleavage site + His-tag,signaling sequence + ectodomain (UNP residues 14-1211) + foldon trimerization domain + TEV cleavage site + His-tag ;
突变：R701S,R702G,R704G,K1005P,V1005P 突变：R701S,R702G,R704G,K1005P,V1005P 突变：R701S,R702G,R704G,K1005P,V1005P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6X29 SARS-CoV-2 rS2d Down State Spike Protein Trimer 提交 2020-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1208（1193 aa） 片段：ectodomain (UNP residues 16-1208)
链 B 16–1208（1193 aa） 片段：ectodomain (UNP residues 16-1208)
链 C 16–1208（1193 aa） 片段：ectodomain (UNP residues 16-1208)
突变：D985C+S383C 突变：D985C+S383C 突变：D985C+S383C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6X2A SARS-CoV-2 u1S2q 1-RBD Up Spike Protein Trimer 提交 2020-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1208（1193 aa） 片段：ectodomain (UNP residues 16-1208)
链 B 16–1208（1193 aa） 片段：ectodomain (UNP residues 16-1208)
链 C 16–1208（1193 aa） 片段：ectodomain (UNP residues 16-1208)
突变：F855Y+N856I+A570L+T572I 突变：F855Y+N856I+A570L+T572I 突变：F855Y+N856I+A570L+T572I 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6X2B SARS-CoV-2 u1S2q 2-RBD Up Spike Protein Trimer 提交 2020-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1208（1193 aa） 片段：ectodomain (UNP residues 16-1208)
链 B 16–1208（1193 aa） 片段：ectodomain (UNP residues 16-1208)
链 C 16–1208（1193 aa） 片段：ectodomain (UNP residues 16-1208)
突变：F855Y+N856I+A570L+T572I 突变：F855Y+N856I+A570L+T572I 突变：F855Y+N856I+A570L+T572I 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6X2C SARS-CoV-2 u1S2q All Down RBD State Spike Protein Trimer 提交 2020-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1208（1193 aa） 片段：ectodomain (UNP residues 16-1208)
链 B 16–1208（1193 aa） 片段：ectodomain (UNP residues 16-1208)
链 C 16–1208（1193 aa） 片段：ectodomain (UNP residues 16-1208)
突变：F855Y+N856I+A570L+T572I 突变：F855Y+N856I+A570L+T572I 突变：F855Y+N856I+A570L+T572I 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6X45 SARS-CoV2 spike glycoprotein N-terminal heptad repeat domain + SARS-CoV2(QEYKKEKE) 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 912–966（55 aa）
链 B 912–966（55 aa）
链 C 912–966（55 aa）
链 D 1168–1203（36 aa）
链 E 1168–1203（36 aa）
链 F 1168–1203（36 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：G1171Q, Q1180E, K1181Y, D1184K, R1185K, N1187E, N1192K, N1194E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：G1171Q, Q1180E, K1181Y, D1184K, R1185K, N1187E, N1192K, N1194E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：G1171Q, Q1180E, K1181Y, D1184K, R1185K, N1187E, N1192K, N1194E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Peptide solution: Lyophilized TFA salt dissolved in 1% w/v beta-D-octylglucoside; HRN (4 mg/mL), HRC-QEYKKEKE (3 mg/mL) Well solution: 0.1 M Tris pH 7.8, 26% w/v PEG3350, 0.3 M MgCl2 Drop: 1 uL peptide solution, 1 uL well solution Reservoir: 150 uL in VDXm plate
分辨率 2.20 Å R-free 0.278
6X6P Characterization of the SARS-CoV-2 S Protein: Biophysical, Biochemical, Structural, and Antigenic Analysis 提交 2020-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 15–1208（1194 aa）
链 B 15–1208（1194 aa）
链 C 15–1208（1194 aa）
突变：R682G R683S R685S K986P V987P 突变：R682G R683S R685S K986P V987P 突变：R682G R683S R685S K986P V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
6X79 Prefusion SARS-CoV-2 S ectodomain trimer covalently stabilized in the closed conformation 提交 2020-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa） 片段：ectodomain(UNP residues 14-1211)
链 B 14–1211（1198 aa） 片段：ectodomain(UNP residues 14-1211)
链 C 14–1211（1198 aa） 片段：ectodomain(UNP residues 14-1211)
突变：S383C,D985C 突变：S383C,D985C 突变：S383C,D985C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6XC2 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody CC12.1 提交 2020-06-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.1M sodium citrate pH 5.5 15% polyethylene glycol 6000
分辨率 3.11 Å R-free 0.267
6XC2 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody CC12.1 提交 2020-06-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Z 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.1M sodium citrate pH 5.5 15% polyethylene glycol 6000
分辨率 3.11 Å R-free 0.267
6XC3 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies CC12.1 and CR3022 提交 2020-06-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；20% PEG 3000, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 2.70 Å R-free 0.225
6XC4 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody CC12.3 提交 2020-06-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.1 M sodium phosphate pH 6.5 12% polyethylene glycol 8000
分辨率 2.34 Å R-free 0.219
6XC4 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody CC12.3 提交 2020-06-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Z 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.1 M sodium phosphate pH 6.5 12% polyethylene glycol 8000
分辨率 2.34 Å R-free 0.219
6XC7 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies CC12.3 and CR3022 提交 2020-06-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.1M Tris pH 8 15% ethylene glycol 1M lithium chloride 10% PEG 6000
分辨率 2.88 Å R-free 0.259
6XCM Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with the C105 neutralizing antibody Fab fragment (state 1) 提交 2020-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliters added, blotted for 3 s with 0 blot force
分辨率 3.42 Å
6XCN Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with the C105 neutralizing antibody Fab fragment (state 2) 提交 2020-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
链 E 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliters added, blotted for 3 s with 0 blot force
分辨率 3.66 Å
6XDG Complex of SARS-CoV-2 receptor binding domain with the Fab fragments of two neutralizing antibodies 提交 2020-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 319–541（223 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 319-541)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6XE1 Structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor binding domain in complex with a potent neutralizing antibody, CV30 Fab 提交 2020-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 319–591（273 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2M ammonium citrate, tribasic, 12% PEG 3350
分辨率 2.75 Å R-free 0.239
6XEY Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein bound to Fab 2-4 提交 2020-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
6XF5 Cryo-EM structure of a biotinylated SARS-CoV-2 spike probe in the prefusion state (RBDs down) 提交 2020-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
6XF6 Cryo-EM structure of a biotinylated SARS-CoV-2 spike probe in the prefusion state (1 RBD up) 提交 2020-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6XKL SARS-CoV-2 HexaPro S One RBD up 提交 2020-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.21 Å
6XKP Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody CV07-270 提交 2020-06-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.1 M sodium cacodylate pH 6.5 0.2 M sodium chloride 2 M ammonium sulfate 15% (v/v) ethylene glycol
分辨率 2.72 Å R-free 0.269
6XKP Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody CV07-270 提交 2020-06-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.1 M sodium cacodylate pH 6.5 0.2 M sodium chloride 2 M ammonium sulfate 15% (v/v) ethylene glycol
分辨率 2.72 Å R-free 0.269
6XKQ Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody CV07-250 提交 2020-06-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.085 M HEPES pH 7.5 10% (v/v) ethylene glycol 15% (v/v) glycerol 8.5% (v/v) 2-propanol 17% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 2.55 Å R-free 0.255
6XLU Structure of SARS-CoV-2 spike at pH 4.0 提交 2020-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
6XM0 Consensus structure of SARS-CoV-2 spike at pH 5.5 提交 2020-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6XM3 Structure of SARS-CoV-2 spike at pH 5.5, single RBD up, conformation 1 提交 2020-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6XM4 Structure of SARS-CoV-2 spike at pH 5.5, single RBD up, conformation 2 提交 2020-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6XM5 Structure of SARS-CoV-2 spike at pH 5.5, all RBDs down 提交 2020-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6XR8 Distinct conformational states of SARS-CoV-2 spike protein 提交 2020-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6XRA Distinct conformational states of SARS-CoV-2 spike protein 提交 2020-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 MAN alpha-D-mannopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6XS6 SARS-CoV-2 Spike D614G variant, minus RBD 提交 2020-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6YLA Crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with CR3022 Fab 提交 2020-04-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 330–532（203 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 MLI MALONATE ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium malonate, 0.1 M Tris pH 8.0 and 30% w/v Polyethylene glycol 1,000
分辨率 2.42 Å R-free 0.237
6YLA Crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with CR3022 Fab 提交 2020-04-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 330–532（203 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 MLI MALONATE ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium malonate, 0.1 M Tris pH 8.0 and 30% w/v Polyethylene glycol 1,000
分辨率 2.42 Å R-free 0.237
6YM0 Crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with CR3022 Fab (crystal form 1) 提交 2020-04-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 330–532（203 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Sodium malonate, 0.1 M Tris pH 8.0 and 30% w/v Polyethylene glycol 1,000.
分辨率 4.36 Å R-free 0.319
6YOR Structure of the SARS-CoV-2 spike S1 protein in complex with CR3022 Fab 提交 2020-04-15 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 330–532（203 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；2 mM Tris pH 8.0, 200 mM NaCl, 0.02 % NaN3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率未提供
6YOR Structure of the SARS-CoV-2 spike S1 protein in complex with CR3022 Fab 提交 2020-04-15 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 330–532（203 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；2 mM Tris pH 8.0, 200 mM NaCl, 0.02 % NaN3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率未提供
6YZ5 H11-D4 complex with SARS-CoV-2 RBD 提交 2020-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 ACT ACETATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；the crystallization buffer containing 0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M MES pH 6.0, 20 % w/v PEG 8000. The crystals grew overnight and were flash cooled in a solution containing the mother liquor with 30 % (v/v) ethylene glycol.
分辨率 1.80 Å R-free 0.193
6YZ7 H11-D4, SARS-CoV-2 RBD, CR3022 ternary complex 提交 2020-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 AAA 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；The best crystals were grown in condition containing 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.0, 10% (w/v) Polyethylene glycol 6000.
分辨率 3.30 Å R-free 0.269
6YZ7 H11-D4, SARS-CoV-2 RBD, CR3022 ternary complex 提交 2020-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 EEE 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；The best crystals were grown in condition containing 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.0, 10% (w/v) Polyethylene glycol 6000.
分辨率 3.30 Å R-free 0.269
6Z2M H11-D4, SARS-CoV-2 RBD, CR3022 ternary complex 提交 2020-05-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 332–528（197 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Purified RBD, Fab CR3022 and nanobody H11-D4 were mixed together at a molar ratio of 1:1:1 to a final concentration of approximately 7 mg/ml and incubated at room temperature for one hour. Initial screening was performed in 96-well plates using the nanolitre sitting-drop vapour diffusion method. The best crystals were grown in condition containing 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.0, 10% (w/v) Polyethylene glycol 6000.
分辨率 2.71 Å R-free 0.241
6Z2M H11-D4, SARS-CoV-2 RBD, CR3022 ternary complex 提交 2020-05-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 332–528（197 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Purified RBD, Fab CR3022 and nanobody H11-D4 were mixed together at a molar ratio of 1:1:1 to a final concentration of approximately 7 mg/ml and incubated at room temperature for one hour. Initial screening was performed in 96-well plates using the nanolitre sitting-drop vapour diffusion method. The best crystals were grown in condition containing 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.0, 10% (w/v) Polyethylene glycol 6000.
分辨率 2.71 Å R-free 0.241
6Z43 Cryo-EM Structure of SARS-CoV-2 Spike : H11-D4 Nanobody Complex 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 6 seconds with a blotting force of -1
分辨率 3.30 Å
6Z97 Structure of the prefusion SARS-CoV-2 spike glycoprotein 提交 2020-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
6ZB4 SARS CoV-2 Spike protein, Closed conformation, C1 symmetry 提交 2020-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.03 Å
6ZB5 SARS CoV-2 Spike protein, Closed conformation, C3 symmetry 提交 2020-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.85 Å
6ZBP H11-H4 complex with SARS-CoV-2 提交 2020-06-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 EEE 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Crystals were grown at using the sitting drop vapor diffusion method by mixing 0.2 uL of the 18 mg/mL H11-H4 RBD complex with 0.1 uL of the crystallization buffer containing 0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M MES pH 6.0, 20 % w/v PEG 8000. The crystals grew overnight and were flash cooled in a solution containing the mother liquor with 30 % (v/v) ethylene glycol.
分辨率 1.85 Å R-free 0.217
6ZCZ Crystal structure of receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in ternary complex with EY6A Fab and a nanobody. 提交 2020-06-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25 % (w/v) PEG 3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 2.65 Å R-free 0.260
6ZDG Association of three complexes of largely structurally disordered Spike ectodomain with bound EY6A Fab 提交 2020-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 333–526（194 aa）
链 D 333–526（194 aa）
链 E 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.70 Å
6ZDH SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with a neutralizing antibody EY6A Fab 提交 2020-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.70 Å
6ZER Crystal structure of receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with EY6A Fab 提交 2020-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.02 M NaH2PO4, 0.98 M K2HPO4
分辨率 3.80 Å R-free 0.251
6ZER Crystal structure of receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with EY6A Fab 提交 2020-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.02 M NaH2PO4, 0.98 M K2HPO4
分辨率 3.80 Å R-free 0.251
6ZER Crystal structure of receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with EY6A Fab 提交 2020-06-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.02 M NaH2PO4, 0.98 M K2HPO4
分辨率 3.80 Å R-free 0.251
6ZFO Association of two complexes of largely structurally disordered Spike ectodomain with bound EY6A Fab 提交 2020-06-17 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.40 Å
6ZFO Association of two complexes of largely structurally disordered Spike ectodomain with bound EY6A Fab 提交 2020-06-17 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.40 Å
6ZGE Uncleavable Spike Protein of SARS-CoV-2 in Closed Conformation 提交 2020-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
6ZGG Furin Cleaved Spike Protein of SARS-CoV-2 with One RBD Erect 提交 2020-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6ZGH Furin Cleaved Spike Protein of SARS-CoV-2 in Intermediate Conformation 提交 2020-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6ZGI Furin Cleaved Spike Protein of SARS-CoV-2 in Closed Conformation 提交 2020-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6ZH9 Ternary complex CR3022 H11-H4 and RBD (SARS-CoV-2) 提交 2020-06-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 EEE 332–528（197 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；mixing 0.2 uL of the 18 mg/mL complex with 0.1 uL of the crystallization buffer containing 0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M MES pH 6.0, 20 % w/v PEG 8000.
分辨率 3.31 Å R-free 0.305
6ZHD H11-H4 bound to Spike 提交 2020-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；50 mM Tris, pH 7, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；SPT Labtech prototype 300 mesh 1.2/2.0 nanowire grids with a highly reproduceable rectangular bar cross-section were used. The grids were glow-discharged on low for 90 s (Plasma Cleaner PDC-002-CE, Harrick Plasma) to activate the nanowires. Approximately 6 nL of the complex were applied to the grids using a Chameleon EP system (SPT Labtech) at 81 % relative humidity and ambient temperature.
分辨率 3.70 Å
6ZLR Soaking competent crystal form of the SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain (RBD):CR3022 complex. 提交 2020-07-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 EEE 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；293 K；0.1 M SODIUM MALONATE, 0.1 M TRIS PH 7.7, 22% W/V POLYETHYLENE GLYCOL 1,000
分辨率 3.10 Å R-free 0.247
6ZLR Soaking competent crystal form of the SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain (RBD):CR3022 complex. 提交 2020-07-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 AAA 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；293 K；0.1 M SODIUM MALONATE, 0.1 M TRIS PH 7.7, 22% W/V POLYETHYLENE GLYCOL 1,000
分辨率 3.10 Å R-free 0.247
6ZLR Soaking competent crystal form of the SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain (RBD):CR3022 complex. 提交 2020-07-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 DDD 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；293 K；0.1 M SODIUM MALONATE, 0.1 M TRIS PH 7.7, 22% W/V POLYETHYLENE GLYCOL 1,000
分辨率 3.10 Å R-free 0.247
6ZOW SARS-CoV-2 spike in prefusion state 提交 2020-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 a 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, E987P 突变：K986P, E987P 突变：K986P, E987P 突变：K986P, E987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6ZOX Structure of Disulphide-stabilized SARS-CoV-2 Spike Protein Trimer (x2 disulphide-bond mutant, G413C, V987C, single Arg S1/S2 cleavage site) 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
突变：G413C, V987C, Single Arg S1/S2 cleavage site 突变：G413C, V987C, Single Arg S1/S2 cleavage site 突变：G413C, V987C, Single Arg S1/S2 cleavage site NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6ZOY Structure of Disulphide-stabilized SARS-CoV-2 Spike Protein Trimer (x1 disulphide-bond mutant, S383C, D985C, K986P, V987P, single Arg S1/S2 cleavage site) in Closed State 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
突变：S383C, D985C, K986P, V987P, Single Arg S1/S2 cleavage site 突变：S383C, D985C, K986P, V987P, Single Arg S1/S2 cleavage site 突变：S383C, D985C, K986P, V987P, Single Arg S1/S2 cleavage site NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6ZOZ Structure of Disulphide-stabilized SARS-CoV-2 Spike Protein Trimer (x1 disulphide-bond mutant, S383C, D985C, K986P, V987P, single Arg S1/S2 cleavage site) in Locked State 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
突变：S383C, D985C, K986P, V987P, Single Arg S1/S2 cleavage site 突变：S383C, D985C, K986P, V987P, Single Arg S1/S2 cleavage site 突变：S383C, D985C, K986P, V987P, Single Arg S1/S2 cleavage site NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 BLA BILIVERDINE IX ALPHA × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6ZP0 Structure of SARS-CoV-2 Spike Protein Trimer (single Arg S1/S2 cleavage site) in Closed State 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
突变：Single Arg S1/S2 Cleavage site 突变：Single Arg S1/S2 Cleavage site 突变：Single Arg S1/S2 Cleavage site NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6ZP1 Structure of SARS-CoV-2 Spike Protein Trimer (K986P, V987P, single Arg S1/S2 cleavage site) in Closed State 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
突变：K986P, V987P, Single Arg S1/S2 cleavage site 突变：K986P, V987P, Single Arg S1/S2 cleavage site 突变：K986P, V987P, Single Arg S1/S2 cleavage site NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6ZP2 Structure of SARS-CoV-2 Spike Protein Trimer (K986P, V987P, single Arg S1/S2 cleavage site) in Locked State 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1141（1128 aa）
链 B 14–1141（1128 aa）
链 C 14–1141（1128 aa）
突变：K986P, V987P, Single Arg S1/S2 cleavage site 突变：K986P, V987P, Single Arg S1/S2 cleavage site 突变：K986P, V987P, Single Arg S1/S2 cleavage site BLA BILIVERDINE IX ALPHA × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6ZP5 SARS-CoV-2 spike in prefusion state (flexibility analysis, 1-up closed conformation) 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6ZP7 SARS-CoV-2 spike in prefusion state (flexibility analysis, 1-up open conformation) 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6ZWV Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike Proteins on intact virions: 3 Closed RBDs 提交 2020-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6ZXN Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein bound to neutralizing nanobodies (Ty1) 提交 2020-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.93 Å
7A25 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein bound to neutralizing sybodies (Sb23) 提交 2020-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1146（1146 aa）
链 B 1–1146（1146 aa）
链 C 1–1146（1146 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
7A29 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein bound to neutralizing sybodies (Sb23) 2-up conformation 提交 2020-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
7A4N Cryo-EM structure of a prefusion stabilized SARS-CoV-2 Spike (D614N, R682S, R685G, A892P, A942P and V987P)(S-closed trimer) 提交 2020-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614N,R682S,R685G,A892P,A942P,V987P 突变：D614N,R682S,R685G,A892P,A942P,V987P 突变：D614N,R682S,R685G,A892P,A942P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
7A5R Complex of SARS-CoV-2 spike and CR3022 Fab (Non-Uniform Refinement) 提交 2020-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7A5S Complex of SARS-CoV-2 spike and CR3022 Fab (Homogeneous Refinement) 提交 2020-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7A91 Dissociated S1 domain of SARS-CoV-2 Spike bound to ACE2 (Non-Uniform Refinement) 提交 2020-09-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–685（685 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7A92 Dissociated S1 domain of SARS-CoV-2 Spike bound to ACE2 (Unmasked Refinement) 提交 2020-09-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–676（676 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7A93 SARS-CoV-2 Spike Glycoprotein with 2 RBDs Erect 提交 2020-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
7A94 SARS-CoV-2 Spike Glycoprotein with 1 ACE2 Bound 提交 2020-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7A95 SARS-CoV-2 Spike Glycoprotein with 1 ACE2 Bound and 1 RBD Erect in Clockwise Direction 提交 2020-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7A96 SARS-CoV-2 Spike Glycoprotein with 1 ACE2 Bound and 1 RBD Erect in Anticlockwise Direction 提交 2020-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7A97 SARS-CoV-2 Spike Glycoprotein with 2 ACE2 Bound 提交 2020-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7A98 SARS-CoV-2 Spike Glycoprotein with 3 ACE2 Bound 提交 2020-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.40 Å
7AD1 Cryo-EM structure of a prefusion stabilized SARS-CoV-2 Spike (D614N, R682S, R685G, A892P, A942P and V987P)(One up trimer) 提交 2020-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
7AKD Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with the 47D11 neutralizing antibody Fab fragment 提交 2020-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 FUC alpha-L-fucopyranose × 3 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7B14 Nanobody E bound to Spike-RBD in a localized reconstruction 提交 2020-11-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 333–528（196 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.79 Å
7B17 SARS-CoV-spike RBD bound to two neutralising nanobodies. 提交 2020-11-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 334–528（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.01 Å
7B18 SARS-CoV-spike bound to two neutralising nanobodies 提交 2020-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.62 Å
7B3O Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with STE90-C11 Fab 提交 2020-12-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 331–524（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；13.3% (w/v) polyethylene glycol 6,000, 0.1M MES pH 5.6 0.24M tri sodium citrate
分辨率 2.00 Å R-free 0.225
7B62 Crystal structure of SARS-CoV-2 spike protein N-terminal domain in complex with biliverdin 提交 2020-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–311（311 aa）
未记录 BLA BILIVERDINE IX ALPHA × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 3 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；24% PEG 3350 (w/v) and 0.25 M NaSCN
分辨率 1.82 Å R-free 0.200
7BEH Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-316 Fab 提交 2020-12-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M bis-Tris pH 5.5 and 25 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.230
7BEI Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-150 Fab 提交 2020-12-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 NO3 NITRATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；0.09 M of NPS (nitrate, phosphate and sulphate), 0.1 M MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG 8000 and 20% (v/v) ethylene glycol
分辨率 2.30 Å R-free 0.232
7BEJ Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-158 Fab (crystal form 1) 提交 2020-12-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 FMT FORMIC ACID × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；294 K；containing 3.5 M NaCOOH pH 7.0
分辨率 2.42 Å R-free 0.231
7BEK Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-158 Fab (crystal form 2) 提交 2020-12-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 6 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；294 K；0.15 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris pH 7.6 and 14.6% (w/v) PEG 4000
分辨率 2.04 Å R-free 0.220
7BEL Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in a ternary complex with COVOX-88 and COVOX-45 Fabs 提交 2020-12-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 333–528（196 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；0.15 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris pH 8.0 and 15% (w/v) PEG 4000
分辨率 2.53 Å R-free 0.286
7BEL Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in a ternary complex with COVOX-88 and COVOX-45 Fabs 提交 2020-12-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 X 333–528（196 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；0.15 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris pH 8.0 and 15% (w/v) PEG 4000
分辨率 2.53 Å R-free 0.286
7BEM Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-269 scFv 提交 2020-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 PRO PROLINE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.2 M Proline, 0.1 M HEPES pH 7.5 and 10% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.52 Å R-free 0.247
7BEN Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in a ternary complex with COVOX-253 and COVOX-75 Fabs 提交 2020-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 IMD IMIDAZOLE × 2 GOL GLYCEROL × 4 BR BROMIDE ION × 6 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 16% (w/v) PEG 10000
分辨率 2.50 Å R-free 0.282
7BEN Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in a ternary complex with COVOX-253 and COVOX-75 Fabs 提交 2020-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 333–528（196 aa）
未记录 IMD IMIDAZOLE × 2 GOL GLYCEROL × 1 BR BROMIDE ION × 8 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 IOD IODIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 16% (w/v) PEG 10000
分辨率 2.50 Å R-free 0.282
7BEO Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in a ternary complex with COVOX-253H55L and COVOX-75 Fabs 提交 2020-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 333–528（196 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；294 K；0.1 M ammonium acetate, 0.1 M bis-Tris pH 5.5 and 17% (w/v) PEG 10000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
7BEO Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in a ternary complex with COVOX-253H55L and COVOX-75 Fabs 提交 2020-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 X 333–528（196 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 5 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；294 K；0.1 M ammonium acetate, 0.1 M bis-Tris pH 5.5 and 17% (w/v) PEG 10000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
7BEP Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in a ternary complex with COVOX-384 and S309 Fabs 提交 2020-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 IMD IMIDAZOLE × 3 CL CHLORIDE ION × 5 GLU GLUTAMIC ACID × 1 GLY GLYCINE × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；containing 0.1 M amino acids (Glu, Ala, Gly, Lys, Ser), 0.1 M MES/imidazole/ pH 6.5, 10% (w/v) PEG 20000 and 20% (w/v) PEG MME 550.
分辨率 2.61 Å R-free 0.241
7BEP Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in a ternary complex with COVOX-384 and S309 Fabs 提交 2020-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 333–528（196 aa）
未记录 IMD IMIDAZOLE × 2 CL CHLORIDE ION × 5 GLU GLUTAMIC ACID × 1 GLY GLYCINE × 3 GOL GLYCEROL × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；containing 0.1 M amino acids (Glu, Ala, Gly, Lys, Ser), 0.1 M MES/imidazole/ pH 6.5, 10% (w/v) PEG 20000 and 20% (w/v) PEG MME 550.
分辨率 2.61 Å R-free 0.241
7BH9 SARS-CoV-2 RBD-62 in complex with ACE2 peptidase domain 提交 2021-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7BNM Closed conformation of D614G SARS-CoV-2 spike protein 提交 2021-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1146（1146 aa）
链 B 1–1146（1146 aa）
链 C 1–1146（1146 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7BNN Open conformation of D614G SARS-CoV-2 spike with 1 Erect RBD 提交 2021-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7BNO Open conformation of D614G SARS-CoV-2 spike with 2 Erect RBDs 提交 2021-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1146（1146 aa）
链 B 1–1146（1146 aa）
链 C 1–1146（1146 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7BWJ crystal structure of SARS-CoV-2 antibody with RBD 提交 2020-04-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 319–529（211 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2M magnesium formate dihydrate, 0.1M sodium acetate trihydrate, pH 4.0, 18% PEG 5000 mme
分辨率 2.85 Å R-free 0.264
7BYR BD23-Fab in complex with the S ectodomain trimer 提交 2020-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683G, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683G, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683G, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.84 Å
7BZ5 Structure of COVID-19 virus spike receptor-binding domain complexed with a neutralizing antibody 提交 2020-04-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；0.15 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6, 15% w/v PEG 400
分辨率 1.84 Å R-free 0.191
7C01 Molecular basis for a potent human neutralizing antibody targeting SARS-CoV-2 RBD 提交 2020-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；24 % w/v PEG 1500, 20 % v/v Glycerol
分辨率 2.88 Å R-free 0.265
7C01 Molecular basis for a potent human neutralizing antibody targeting SARS-CoV-2 RBD 提交 2020-04-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；24 % w/v PEG 1500, 20 % v/v Glycerol
分辨率 2.88 Å R-free 0.265
7C2L S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with 4A8 提交 2020-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7C53 Crystal Structure of SARS-CoV-2 HR1 motif in complex with pan-CoVs inhibitor EK1 提交 2020-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 910–975（66 aa） 片段：HR1 motif
链 B 910–975（66 aa） 片段：HR1 motif
链 C 910–975（66 aa） 片段：HR1 motif
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；30% MPD, 0.1 M Na Acetate pH 5.0, 0.02 M Calcium Chloride
分辨率 2.28 Å R-free 0.242
7C53 Crystal Structure of SARS-CoV-2 HR1 motif in complex with pan-CoVs inhibitor EK1 提交 2020-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 910–975（66 aa） 片段：HR1 motif
链 E 910–975（66 aa） 片段：HR1 motif
链 F 910–975（66 aa） 片段：HR1 motif
未记录 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；30% MPD, 0.1 M Na Acetate pH 5.0, 0.02 M Calcium Chloride
分辨率 2.28 Å R-free 0.242
7C8D Cryo-EM structure of cat ACE2 and SARS-CoV-2 RBD 提交 2020-05-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.00 Å
7C8J Structural basis for cross-species recognition of COVID-19 virus spike receptor binding domain to bat ACE2 提交 2020-06-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa） 片段：UNP residues 333-527
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Succinic acid pH 7.0, 0.1 M BICINE pH 8.5, 30% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
分辨率 3.18 Å R-free 0.271
7C8V Structure of sybody SR4 in complex with the SARS-CoV-2 S Receptor Binding domain (RBD) 提交 2020-06-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 330–531（202 aa） 片段：Receptor binding domain (RBD)
未记录 GOL GLYCEROL × 8 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% (w/v) PEG 3000, 100mM HEPES pH 7.5, 200mM sodium chloride
分辨率 2.15 Å R-free 0.224
7C8W Structure of sybody MR17 in complex with the SARS-CoV-2 S receptor-binding domain (RBD) 提交 2020-06-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 330–531（202 aa） 片段：Receptor binding domain
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M magnesium formate dihydrate, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.77 Å R-free 0.267
7CAB Structural basis for neutralization of SARS-CoV-2 and SARS-CoV by a potent therapeutic antibody 提交 2020-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
链 C 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
突变：R682G, R683S, R685S, K835M, T844M, A846Y, D848A, L849M, I850Q, C851M, Q853Y, K854R K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K835M, T844M, A846Y, D848A, L849M, I850Q, C851M, Q853Y, K854R K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K835M, T844M, A846Y, D848A, L849M, I850Q, C851M, Q853Y, K854R K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
7CAC SARS-CoV-2 S trimer with one RBD in the open state and complexed with one H014 Fab. 提交 2020-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K835M, T844M, A846Y, C851M, Q853Y, K854R K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K835M, T844M, A846Y, C851M, Q853Y, K854R K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K835M, T844M, A846Y, C851M, Q853Y, K854R K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
7CAH The interface of H014 Fab binds to SARS-CoV-2 S 提交 2020-06-08 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–527（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7CAI SARS-CoV-2 S trimer with two RBDs in the open state and complexed with two H014 Fab 提交 2020-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
链 C 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
突变：R682G, R683S, R685S, K835M, I844M, A846Y, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K835M, I844M, A846Y, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K835M, I844M, A846Y, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7CAK SARS-CoV-2 S trimer with three RBD in the open state and complexed with three H014 Fab 提交 2020-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
链 C 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
突变：R682G, R683S, R685S, K835M, I844M, A846Y, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K835M, I844M, A846Y, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K835M, I844M, A846Y, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7CAN Structure of sybody MR17-K99Y in complex with the SARS-CoV-2 S Receptor-binding domain (RBD) 提交 2020-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 330–531（202 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M MgCl2, 20% PEG 3350
分辨率 2.94 Å R-free 0.267
7CDI Crystal structure of SARS-CoV-2 antibody P2C-1F11 with RBD 提交 2020-06-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 319–529（211 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.8, 20% PEG 6000
分辨率 2.96 Å R-free 0.254
7CDJ Crystal structure of SARS-CoV-2 antibody P2C-1A3 with RBD 提交 2020-06-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 319–529（211 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1M lithium sulfate monohydrate, 0.1M citric acid, pH 3.5, 18% PEG 6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.271
7CH4 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with BD-604 Fab 提交 2020-07-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Potassium phosphate dibasic(pH 9.2),20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 3.15 Å R-free 0.273
7CH5 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with BD-629 Fab 提交 2020-07-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0 and 18% w/v Polyethylene glycol 20000
分辨率 2.70 Å R-free 0.260
7CHB Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with BD-236 Fab 提交 2020-07-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium Citrate, pH 5.0, 8% (w/v) PEG 8000
分辨率 2.40 Å R-free 0.226
7CHC Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with BD-629 Fab and BD-368-2 Fab 提交 2020-07-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M Imidazole pH 7.0 and 20% w/v Polyethylene glycol 6000
分辨率 2.71 Å R-free 0.286
7CHE Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with BD-236 Fab and BD-368-2 Fab 提交 2020-07-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M sodium acetate pH 4.0 and 10% (w/v) Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
分辨率 3.42 Å R-free 0.239
7CHF Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with BD-604 Fab and BD-368-2 Fab 提交 2020-07-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M ammonium sulfate and 12% (w/v) polyethylene glycol 8000
分辨率 2.67 Å R-free 0.270
7CHH Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 S-6P in complex with BD-368-2 Fabs 提交 2020-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7CHO Crystal structure of SARS-CoV-2 antibody P5A-1D2 with RBD 提交 2020-07-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 319–529（211 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1M Tris, pH 8.5, 3.4M 1,6-Hexanediol
分辨率 2.56 Å R-free 0.247
7CHO Crystal structure of SARS-CoV-2 antibody P5A-1D2 with RBD 提交 2020-07-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–529（211 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1M Tris, pH 8.5, 3.4M 1,6-Hexanediol
分辨率 2.56 Å R-free 0.247
7CHP Crystal structure of SARS-CoV-2 antibody P5A-3C8 with RBD 提交 2020-07-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 319–529（211 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2M Lithium sulfate monohydrate, 0.1M HEPES, pH 7.5, 25% w/v PEG 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.220
7CHS Crystal structure of SARS-CoV-2 antibody P22A-1D1 with RBD 提交 2020-07-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 319–529（211 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1M potassium chloride, 0.1M NaHEPES, pH 7.0, 15% PEG 5000MME
分辨率 2.40 Å R-free 0.224
7CJF Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with a neutralizing antibody Fab 提交 2020-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 334–527（194 aa） 片段：receptor binding domain, RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；20%(w/v)PEG 3350 0.2M potassium citrate tribasic
分辨率 2.11 Å R-free 0.229
7CM4 Crystal Structure of COVID-19 virus spike receptor-binding domain complexed with a neutralizing antibody CT-P59 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–536（218 aa）
未记录 NI NICKEL (II) ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；100 mM Tris-Cl pH 8.0 16% (w/v) Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000 10 mM Nickel(II) Chloride hexahydrate
分辨率 2.71 Å R-free 0.242
7CN9 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike ectodomain 提交 2020-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1140（1127 aa）
链 B 14–1140（1127 aa）
链 C 14–1140（1127 aa）
突变：R682G, R683S, R685G, K986P, V986P 突变：R682G, R683S, R685G, K986P, V986P 突变：R682G, R683S, R685G, K986P, V986P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
7COT Structure of post fusion core of SARS-CoV-2 S2 subunit 提交 2020-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 910–988（79 aa）
链 A 1162–1206（45 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；283 K；25% PEG 3350, 0.07M Bis-Tris propane pH 8.5, 0.03M citric acid
分辨率 2.16 Å R-free 0.247
7COT Structure of post fusion core of SARS-CoV-2 S2 subunit 提交 2020-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 910–988（79 aa）
链 B 1162–1206（45 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；283 K；25% PEG 3350, 0.07M Bis-Tris propane pH 8.5, 0.03M citric acid
分辨率 2.16 Å R-free 0.247
7COT Structure of post fusion core of SARS-CoV-2 S2 subunit 提交 2020-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 910–988（79 aa）
链 C 1162–1206（45 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；283 K；25% PEG 3350, 0.07M Bis-Tris propane pH 8.5, 0.03M citric acid
分辨率 2.16 Å R-free 0.247
7CT5 S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with T-ACE2 提交 2020-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：P986K, P987V 突变：P986K, P987V 突变：P986K, P987V NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7CWL SARS-CoV-2 spike protein and P17 fab complex with one RBD in close state 提交 2020-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7CWM Complex of SARS-CoV-2 spike protein and Fab P17 with one RBD in open state and two RBD in closed state 提交 2020-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7CWN P17-H014 Fab cocktail in complex with SARS-CoV-2 spike protein 提交 2020-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7CWO SARS-CoV-2 spike protein RBD and P17 fab complex 提交 2020-08-29 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7CWS SARS-CoV-2 Spike Proteins Trimer in Complex with FC05 and H014 Fabs Cocktail 提交 2020-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 O 14–1147（1134 aa）
链 Q 14–1147（1134 aa）
链 R 14–1147（1134 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7CWT SARS-CoV-2 Spike protein in complex with hb27 and fc05 Fab cocktail 提交 2020-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 14–1147（1134 aa）
链 B 14–1147（1134 aa）
链 C 14–1147（1134 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7CWU SARS-CoV-2 spike proteins trimer in complex with P17 and FC05 Fabs cocktail 提交 2020-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：30-meric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7CYH Binding interface of SARS-CoV-2 RBD and its neutralizing antibody HB27 提交 2020-09-03 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–527（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7CYP Complex of SARS-CoV-2 spike trimer with its neutralizing antibody HB27 提交 2020-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：24-meric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K835M, I844M, A846Y, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K835M, I844M, A846Y, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K835M, I844M, A846Y, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7CYV Crystal structure of FD20, a neutralizing single-chain variable fragment (scFv) in complex with SARS-CoV-2 Spike receptor-binding domain (RBD) 提交 2020-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 330–531（202 aa） 片段：receptor-binding domain (RBD)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.2 M lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 3.13 Å R-free 0.276
7CZP S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P2B-1A1 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7CZQ S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P2B-1A10 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7CZR S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-1B8_2B 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7CZS S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-1B8_3B 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7CZT S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-2G9 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7CZU S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-1B6_2B 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7CZV S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-1B6_3B 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7CZW S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-2G7 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7CZX S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-1B9 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7CZY S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-2F11_2B 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7CZZ S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-2F11_3B 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7D00 S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with FabP5A-1B8 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7D03 S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with FabP5A-2G7 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7D0B S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-3C12_1B 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7D0C S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-3A1 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7D0D S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-3C12_2B 提交 2020-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7D2Z Structure of sybody SR31 in complex with the SARS-CoV-2 S Receptor Binding domain (RBD) 提交 2020-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 330–531（202 aa） 片段：Receptor binding domain (RBD)
未记录 FMT FORMIC ACID × 13 GOL GLYCEROL × 5 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.0M sodium formate, 0.1M sodium acetate trihydrate pH 4.6
分辨率 1.97 Å R-free 0.207
7D30 Structure of sybody MR17-SR31 fusion in complex with the SARS-CoV-2 S Receptor Binding domain (RBD) 提交 2020-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 330–531（202 aa） 片段：Receptor binding domain (RBD)
未记录 GOL GLYCEROL × 5 ACT ACETATE ION × 14 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 BU2 1,3-BUTANEDIOL × 5 CD CADMIUM ION × 17 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M cadmium chloride, 30% (v/v) PEG 400, 4%(v/v) 1,3-butanediol, 0.1M sodium acetate pH 4.5
分辨率 2.10 Å R-free 0.236
7D4G A proof of concept for neutralizing antibody-guided vaccine design against SARS-CoV-2 提交 2020-09-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 13–290（278 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7D6I A neutralizing MAb targeting receptor-binding-domain of SARS-CoV-2 提交 2020-09-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–532（214 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；50 mM Calcium chloride dihydrate, 100 mM BIS-TRIS pH 6.5, 30% v/v Polyethylene glycol and monomethyl ether 550
分辨率 3.41 Å R-free 0.255
7DCC S-3C1-F3b structure, all the three RBDs are in the up conformation and each of them associates with a 3C1 Fab 提交 2020-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 E 1–1208（1208 aa）
链 I 1–1208（1208 aa）
链 K 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7DCX S-3C1-F3a structure, two RBDs are up and one RBD is down, each RBD binds with a 3C1 fab. 提交 2020-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 K 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
7DD2 S-3C1-F2 structure, two RBDs are up and one RBD is down, the two up RBD bind with a 3C1 fab. 提交 2020-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 K 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
7DD8 S-3C1-F1 structure, one RBD is up and two RBDs are down, the up RBD binds with a 3C1 fab 提交 2020-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.50 Å
7DDD SARS-Cov2 S protein at close state 提交 2020-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
链 C 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7DDN SARS-Cov2 S protein at open state 提交 2020-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.30 Å
7DEO Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with a neutralizing antibody scFv 提交 2020-11-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 334–530（197 aa） 片段：RBD
未记录 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；1% w/v Tryptone, 0.001M Sodium azide, 0.05M HEPES sodium pH 7.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.232
7DEO Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with a neutralizing antibody scFv 提交 2020-11-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 334–530（197 aa） 片段：RBD
未记录 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；1% w/v Tryptone, 0.001M Sodium azide, 0.05M HEPES sodium pH 7.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.232
7DET Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with a neutralizing antibody scFv 提交 2020-11-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 334–530（197 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2M sodium chloride, 0.1M Tris pH 8.5, 29% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.260
7DET Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with a neutralizing antibody scFv 提交 2020-11-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 334–530（197 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2M sodium chloride, 0.1M Tris pH 8.5, 29% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.260
7DEU Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with a neutralizing antibody scFv 提交 2020-11-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 334–530（197 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.8M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M Tris pH 8.5, 0.5% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 5000
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
7DF3 SARS-CoV-2 S trimer, S-closed 提交 2020-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7DF4 SARS-CoV-2 S-ACE2 complex 提交 2020-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7DHX Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD binding to pangolin ACE2 提交 2020-11-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–527（209 aa） 片段：Receptor binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05M potassium phosphate, 20% w/v Polyethylene glycol 8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.235
7DJZ Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with MW01 Fab 提交 2020-11-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 319–541（223 aa） 片段：Receptor Binding Domain
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；289 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.6, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 14% (v/v) 2-propanol, and 0.01 M barium chloride.
分辨率 2.40 Å R-free 0.230
7DK0 Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with MW05 Fab 提交 2020-11-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 319–541（223 aa） 片段：Receptor Binding Domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M sodium citrate tribasic, 21% (w/v) PEG 3350, 0.02 M urea
分辨率 3.20 Å R-free 0.265
7DK2 Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with MW07 Fab 提交 2020-11-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 319–541（223 aa） 片段：Receptor Binding Domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；12% (w/v) polyethylene glycol 20000, 100 mM MES, pH 6.5, and 0.01 M TCEP
分辨率 3.00 Å R-free 0.304
7DK2 Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with MW07 Fab 提交 2020-11-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 319–541（223 aa） 片段：Receptor Binding Domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；12% (w/v) polyethylene glycol 20000, 100 mM MES, pH 6.5, and 0.01 M TCEP
分辨率 3.00 Å R-free 0.304
7DK2 Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with MW07 Fab 提交 2020-11-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 319–541（223 aa） 片段：Receptor Binding Domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；12% (w/v) polyethylene glycol 20000, 100 mM MES, pH 6.5, and 0.01 M TCEP
分辨率 3.00 Å R-free 0.304
7DK2 Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with MW07 Fab 提交 2020-11-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 319–541（223 aa） 片段：Receptor Binding Domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；12% (w/v) polyethylene glycol 20000, 100 mM MES, pH 6.5, and 0.01 M TCEP
分辨率 3.00 Å R-free 0.304
7DK3 SARS-CoV-2 S trimer, S-open 提交 2020-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.00 Å
7DK4 S-2H2-F3a structure, two RBDs are up and one RBD is down, each RBD binds with a 2H2 Fab. 提交 2020-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7DK5 S-2H2-F1 structure, one RBD is up and two RBDs are down, only up RBD binds with a 2H2 Fab 提交 2020-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 13.50 Å
7DK6 S-2H2-F2 structure, two RBDs are up and one RBD is down, each up RBD binds with a 2H2 Fab. 提交 2020-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7DK7 S-2H2-F3b structure, three RBDs are up and each RBD binds with a 2H2 Fab. 提交 2020-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.70 Å
7DMU Structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain complexed with high affinity ACE2 mutant 3N39 提交 2020-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–531（213 aa） 片段：receptor-binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.25 M lithium sulfate, and 0.05 M CAPS pH 10.5
分辨率 3.20 Å R-free 0.198
7DMU Structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain complexed with high affinity ACE2 mutant 3N39 提交 2020-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 319–531（213 aa） 片段：receptor-binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.25 M lithium sulfate, and 0.05 M CAPS pH 10.5
分辨率 3.20 Å R-free 0.198
7DPM Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with MW06 Fab 提交 2020-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 319–541（223 aa） 片段：RBD domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；289 K；12% EG, 0.1 M Citrate-Na, pH 3.5, 14% PEG 6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
7DPM Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with MW06 Fab 提交 2020-12-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 319–541（223 aa） 片段：RBD domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；289 K；12% EG, 0.1 M Citrate-Na, pH 3.5, 14% PEG 6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
7DPM Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with MW06 Fab 提交 2020-12-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 319–541（223 aa） 片段：RBD domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；289 K；12% EG, 0.1 M Citrate-Na, pH 3.5, 14% PEG 6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
7DPM Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with MW06 Fab 提交 2020-12-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 319–541（223 aa） 片段：RBD domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；289 K；12% EG, 0.1 M Citrate-Na, pH 3.5, 14% PEG 6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
7DQA Cryo-EM structure of SARS-CoV2 RBD-ACE2 complex 提交 2020-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 333–526（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7DWX Conformation 1 of S-ACE2-B0AT1 ternary complex 提交 2021-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–1273（1273 aa）
链 F 1–1273（1273 aa）
链 G 1–1273（1273 aa）
链 H 1–1273（1273 aa）
链 I 1–1273（1273 aa）
链 J 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 64 LEU LEUCINE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.30 Å
7DWY S protein of SARS-CoV-2 in the locked conformation 提交 2021-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 59 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7DWZ S protein of SARS-CoV-2 in the active conformation 提交 2021-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7DX0 Trypsin-digested S protein of SARS-CoV-2 提交 2021-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7DX1 S protein of SARS-CoV-2 D614G mutant 提交 2021-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：D614G, K986P, V987P 突变：D614G, K986P, V987P 突变：D614G, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7DX2 Trypsin-digested S protein of SARS-CoV-2 D614G mutant 提交 2021-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：D614G, K986P, V987P 突变：D614G, K986P, V987P 突变：D614G, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7DX3 S protein of SARS-CoV-2 bound with PD of ACE2 in the conformation 1 (1 up RBD and no PD bound) 提交 2021-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7DX4 The structure of FC08 Fab-hA.CE2-RBD complex 提交 2021-01-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7DX5 S protein of SARS-CoV-2 bound with PD of ACE2 in the conformation 2 (1 up RBD and 1 PD bound) 提交 2021-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7DX6 S protein of SARS-CoV-2 bound with PD of ACE2 in the conformation 3 (2 up RBD and 1 PD bound) 提交 2021-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7DX7 Trypsin-digested S protein of SARS-CoV-2 bound with PD of ACE2 in the conformation 1 (1 up RBD and 1 PD bound) 提交 2021-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7DX8 Trypsin-digested S protein of SARS-CoV-2 bound with PD of ACE2 in the conformation 2 (2 up RBD and 2 PD bound) 提交 2021-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7DX9 Trypsin-digested S protein of SARS-CoV-2 bound with PD of ACE2 in the conformation 3 (3 up RBD and 2 PD bound) 提交 2021-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7DZW Apo spike protein from SARS-CoV2 提交 2021-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1254（1241 aa）
链 B 14–1254（1241 aa）
链 C 14–1254（1241 aa）
突变：D614G, R682G, R683S, R685G, K986P, V987P 突变：D614G, R682G, R683S, R685G, K986P, V987P 突变：D614G, R682G, R683S, R685G, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
7DZX Spike protein from SARS-CoV2 with Fab fragment of enhancing antibody 8D2 提交 2021-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 27–1147（1121 aa）
链 B 27–1147（1121 aa）
链 C 27–1147（1121 aa）
突变：D614G, R682G, R683S, R685G, K986P, V987P 突变：D614G, R682G, R683S, R685G, K986P, V987P 突变：D614G, R682G, R683S, R685G, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.53 Å
7DZY Spike protein from SARS-CoV2 with Fab fragment of enhancing antibody 2490 提交 2021-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 27–1211（1185 aa）
链 B 27–1211（1185 aa）
链 C 27–1211（1185 aa）
突变：D614G, R682G, R683S, R685G, K986P, V987P 突变：D614G, R682G, R683S, R685G, K986P, V987P 突变：D614G, R682G, R683S, R685G, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7E23 SARS-CoV-2 spike in complex with the CA521 neutralizing antibody Fab (focused refinement on Fab-RBD) 提交 2021-02-04 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7E39 SARS-CoV-2 spike in complex with the Ab4 neutralizing antibody (State 3) 提交 2021-02-08 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7E3B SARS-Cov-2 spike in complex with the Ab5 neutralizing antibody (focused refinement on Fab-RBD) 提交 2021-02-08 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7E3C SARS-CoV-2 spike in complex with the Ab1 neutralizing antibody (focused refinement on Fab-RBD) 提交 2021-02-08 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7E3J Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD binding to dog ACE2 提交 2021-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；2% 1,4-dioxane, 0.1 M tris pH 8.0,15% polyethylene glycol 3,350.
分辨率 2.99 Å R-free 0.248
7E3K Ultrapotent SARS-CoV-2 neutralizing antibodies with protective efficacy against newly emerged mutational variants 提交 2021-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7E3L Ultrapotent SARS-CoV-2 neutralizing antibodies with protective efficacy against newly emerged mutational variants 提交 2021-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7E3O Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody nCoV617 提交 2021-02-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 337–527（191 aa） 片段：UNP residues 337-527
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；152 mM NH4Cl, 22.8% PEG8000
分辨率 2.51 Å R-free 0.259
7E5O Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with antibody NT-193 提交 2021-02-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 322–536（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 10% (w/v) PEG 8000, 8% (w/v) Ethylene glycol
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
7E5R SARS-CoV-2 S trimer with three-antibody cocktail complex 提交 2021-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7E5S SARS-CoV-2 S trimer with four-antibody cocktail complex 提交 2021-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7E5Y Molecular basis for neutralizing antibody 2B11 targeting SARS-CoV-2 RBD 提交 2021-02-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M ammonium sulfate, 12% w/v PEG 8000, and 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5
分辨率 3.59 Å R-free 0.277
7E5Y Molecular basis for neutralizing antibody 2B11 targeting SARS-CoV-2 RBD 提交 2021-02-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M ammonium sulfate, 12% w/v PEG 8000, and 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5
分辨率 3.59 Å R-free 0.277
7E7B Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 furin site mutant S-Trimer from a subunit vaccine candidate 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1211（1211 aa）
链 B 1–1211（1211 aa）
链 C 1–1211（1211 aa）
突变：R685A 突变：R685A 突变：R685A NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELA Elaidic acid × 3 VCG 2-hydroxyethyl 2-deoxy-3,5-bis-O-(2-hydroxyethyl)-6-O-(2-{[(9E)-octadec-9-enoyl]oxy}ethyl)-alpha-L-xylo-hexofuranoside × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot time 2 seconds, blot force 4, waiting time 8 seconds
分辨率 2.60 Å
7E7D Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 wild-type S-Trimer from a subunit vaccine candidate 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1211（1211 aa）
链 B 1–1211（1211 aa）
链 C 1–1211（1211 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELA Elaidic acid × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot time 2 seconds, blot force 4, waiting time 8 seconds
分辨率 3.20 Å
7E7X SARS-CoV-2 Spike Protein N terminal domain in Complex with N11 Fab 提交 2021-02-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 13–303（291 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.2 M Magnesium chloride, 0.1 M Tris, pH 7.0, and 10% (w/v) polyethylene glycol 8000
分辨率 2.78 Å R-free 0.279
7E7X SARS-CoV-2 Spike Protein N terminal domain in Complex with N11 Fab 提交 2021-02-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 13–303（291 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.2 M Magnesium chloride, 0.1 M Tris, pH 7.0, and 10% (w/v) polyethylene glycol 8000
分辨率 2.78 Å R-free 0.279
7E7Y Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with BD-623 Fab 提交 2021-02-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, and 18% (w/v) polyethylene glycol 8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.241
7E7Y Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with BD-623 Fab 提交 2021-02-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, and 18% (w/v) polyethylene glycol 8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.241
7E86 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with BD-508 Fab 提交 2021-03-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M sodium citrate pH 5.0, and 11% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 2.90 Å R-free 0.255
7E88 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with BD-515 Fab 提交 2021-03-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3 M Ammonium sulfate, 0.1 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, and 25% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 3.14 Å R-free 0.255
7E88 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with BD-515 Fab 提交 2021-03-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3 M Ammonium sulfate, 0.1 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, and 25% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 3.14 Å R-free 0.255
7E88 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with BD-515 Fab 提交 2021-03-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3 M Ammonium sulfate, 0.1 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, and 25% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 3.14 Å R-free 0.255
7E88 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with BD-515 Fab 提交 2021-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：trimeric
链 L 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3 M Ammonium sulfate, 0.1 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, and 25% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 3.14 Å R-free 0.255
7E8C SARS-CoV-2 S-6P in complex with 9 Fabs 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
7E8F SARS-CoV-2 NTD in complex with N9 Fab 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 13–303（291 aa）
链 R 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
7E8M Crystal structure of SARS-CoV-2 antibody P2C-1F11 with mutated RBD 提交 2021-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–527（195 aa）
突变：K417N, E484K, N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Tris pH 8.5, 12%w/v PEG 8000
分辨率 2.09 Å R-free 0.199
7E9N Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 S-6P in complex with 35B5 Fab(1 down RBD, state1) 提交 2021-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 27–1147（1121 aa）
链 B 27–1147（1121 aa）
链 C 27–1147（1121 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
7E9O Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 S-6P in complex with 35B5 Fab(3 up RBDs, state2) 提交 2021-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
7E9P Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 S-6P in complex with 35B5 Fab(state2, local refinement of the RBD and 35B5 Fab) 提交 2021-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
7E9Q Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 S-6P in complex with 35B5 Fab(1 out RBD, state3) 提交 2021-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
7E9T Nanometer resolution in situ structure of SARS-CoV-2 post-fusion spike 提交 2021-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 703–1234（532 aa）
链 B 703–1234（532 aa）
链 C 703–1234（532 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.90 Å
7EAM immune complex of SARS-CoV-2 RBD and cross-neutralizing antibody 7D6 提交 2021-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa） 片段：UNP residues 319-541
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；293.15 K；PEG D5, 0.2M Potassium dihydrogen phosphate, 20% PEG3350
分辨率 1.40 Å R-free 0.181
7EAM immune complex of SARS-CoV-2 RBD and cross-neutralizing antibody 7D6 提交 2021-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–541（223 aa） 片段：UNP residues 319-541
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；293.15 K；PEG D5, 0.2M Potassium dihydrogen phosphate, 20% PEG3350
分辨率 1.40 Å R-free 0.181
7EAN immune complex of SARS-CoV-2 RBD and cross-neutralizing antibody 6D6 提交 2021-03-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；293.15 K；0.2M sodium sulfocyanate, 20%PEG3350
分辨率 1.91 Å R-free 0.224
7EAZ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike D614G variant, one RBD-up conformation 1 提交 2021-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.50 Å
7EB0 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike D614G variant, one RBD-up conformation 2 提交 2021-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.60 Å
7EB3 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike D614G variant, one RBD-up conformation 3 提交 2021-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.60 Å
7EB4 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike D614G variant, two RBD-up conformation 1 提交 2021-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.50 Å
7EB5 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike D614G variant, two RBD-up conformation 2 提交 2021-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.40 Å
7EDF Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-UK variant (B.1.1.7), one RBD-up conformation 1 提交 2021-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1208（1193 aa）
链 B 16–1208（1193 aa）
链 C 16–1208（1193 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.20 Å
7EDG Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-UK variant (B.1.1.7), one RBD-up conformation 2 提交 2021-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1208（1193 aa）
链 B 16–1208（1193 aa）
链 C 16–1208（1193 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.20 Å
7EDH Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-UK variant (B.1.1.7), one RBD-up conformation 3 提交 2021-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1208（1193 aa）
链 B 16–1208（1193 aa）
链 C 16–1208（1193 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.60 Å
7EDI Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-UK variant (B.1.1.7), two RBD-up conformation 提交 2021-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1208（1193 aa）
链 B 16–1208（1193 aa）
链 C 16–1208（1193 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.30 Å
7EDJ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-UK variant (B.1.1.7) in complex with Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) ectodomain 提交 2021-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 16–1208（1193 aa）
链 B 16–1208（1193 aa）
链 C 16–1208（1193 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.30 Å
7EFP Structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain in complex with high affinity ACE2 mutant (S19W,N330Y) 提交 2021-03-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 320–537（218 aa） 片段：UNP 320-537
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；1.6 M Ammonium sulfate, 0.1 M MES pH6.5, 10 % v/v 1,4-Dioxane
分辨率 2.70 Å R-free 0.224
7EFR Structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain in complex with high affinity ACE2 mutant (T27W,N330Y) 提交 2021-03-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 321–537（217 aa） 片段：UNP residues 321-537
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；2.0 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium HEPES pH7.5 , 2 % v/v PEG 400
分辨率 2.49 Å R-free 0.229
7EH5 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-D614G variant in complex with neutralizing antibodies, RBD-chAb15 and RBD-chAb45 提交 2021-03-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 4.00 Å
7EJ4 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with a neutralizing antibody RBD-chAb-25 提交 2021-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.60 Å
7EJ5 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with a neutralizing antibody RBD-chAb-45 提交 2021-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.50 Å
7EJY Complex Structure of antibody BD-503 and RBD of COVID-19 提交 2021-04-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–541（223 aa） 片段：Receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.15M Ammonium sulfate, 0.1M Tris, pH 8.0, 15% (w/v) PEG 400
分辨率 3.04 Å R-free 0.254
7EJZ Complex Structure of antibody BD-503 and RBD-S477N of COVID-19 提交 2021-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–541（223 aa） 片段：Receptor binding domain
突变：S477N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1M Sodium citrate, pH 5.0, 15% (w/v) PEG 4000
分辨率 3.63 Å R-free 0.284
7EK0 Complex Structure of antibody BD-503 and RBD-N501Y of COVID-19 提交 2021-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–541（223 aa） 片段：Receptor binding domain
突变：N501Y 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M Sodium citrate, pH 5.5, 15% (w/v) PEG 6000
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
7EK6 Structure of viral peptides IPB19/N52 提交 2021-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 906–957（52 aa）
链 B 1175–1211（37 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；296 K；1.26M Sodium phosphate monobasic monohydrate, 0.14M Potassium phosphate dibasic, pH 5.6
分辨率 1.24 Å R-free 0.185
7EKC Structure of SARS-CoV-2 Gamma variant spike receptor-binding domain complexed with human ACE2 提交 2021-04-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
突变：K417T, E484K, N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M MES, pH 6.5, 12% w/v PEG 20000
分辨率 2.80 Å R-free 0.225
7EKE Structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain F486L mutation complexed with human ACE2 提交 2021-04-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
突变：F486L NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M MES, pH 6.5, 10% w/v PEG 5000 MME, 12% v/v1-Propanol
分辨率 2.70 Å R-free 0.241
7EKF Structure of SARS-CoV-2 Alpha variant spike receptor-binding domain complexed with human ACE2 提交 2021-04-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
突变：N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M MES, pH 6.5, 10% w/v PEG 5000 MME, 12% v/v1-Propanol
分辨率 2.85 Å R-free 0.224
7EKG Structure of SARS-CoV-2 Beta variant spike receptor-binding domain complexed with human ACE2 提交 2021-04-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
突变：K417N, E484K, N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M MES, pH 6.5, 12% w/v PEG 20000
分辨率 2.63 Å R-free 0.248
7EKH Structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain Y453F mutation complexed with human ACE2 提交 2021-04-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
突变：Y453F NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M MES, pH 6.5, 10% w/v PEG 5000 MME, 12% v/v1-Propanol
分辨率 2.40 Å R-free 0.228
7ENF Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 S-6P in complex with Fab30 提交 2021-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
链 C 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
7ENG Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 S-6P in complex with Fab30 (local refinement of the RBD and Fab30) 提交 2021-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
7EPX S protein of SARS-CoV-2 in complex with GW01 提交 2021-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7EY0 Local CryoEM structure of the SARS-CoV-2 S6PV2 in complex with BD-813 Fab and BD-744 Fab 提交 2021-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 N 1–1207（1207 aa）
链 R 1–1207（1207 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7EY4 Local CryoEM of the SARS-CoV-2 S6PV2 in complex with BD-667 提交 2021-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 N 1–290（290 aa）
链 R 1–1207（1207 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
7EY5 Local CryoEM structure of the SARS-CoV-2 S6PV2 in complex with BD-771 Fab and BD-821 Fab 提交 2021-05-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
分辨率 3.40 Å
7EYA Local CryoEM structure of the SARS-CoV-2 S6PV2 in complex with BD-804 Fab 提交 2021-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 N 1–290（290 aa）
链 R 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.77 Å
7EZV local CryoEM structure of the SARS-CoV-2 S6PV2 in complex with BD-812 Fab and BD-836 Fab 提交 2021-06-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7F0X A SARS-CoV-2 neutralizing antibody 提交 2021-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 334–527（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.2M Potassium phosphate monobasic pH4.8, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.270
7F12 A SARS-CoV-2 neutralizing antibody 提交 2021-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 334–528（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.2M Sodium phosphate monobasic monohydrate pH 4.7, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 3.15 Å R-free 0.245
7F15 A SARS-CoV-2 neutralizing antibody 提交 2021-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 334–530（197 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Sodium malonate pH 4.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.65 Å R-free 0.245
7F3Q SARS-CoV-2 RBD in complex with A5-10 Fab and A34-2 Fab 提交 2021-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7F46 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 S-6P in complex with 35B5 Fab (state1, local refinement of the RBD, NTD and 35B5 Fab) 提交 2021-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
链 C 1–1208（1208 aa） 片段：UNP residues 1-1208
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.79 Å
7F5G The crystal structure of RBD-Nanobody complex, DL4 (SA4) 提交 2021-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 330–531（202 aa） 片段：Receptor binding domain (RBD)
未记录 GOL GLYCEROL × 8 ACT ACETATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6 and 25% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.75 Å R-free 0.217
7F5G The crystal structure of RBD-Nanobody complex, DL4 (SA4) 提交 2021-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 330–531（202 aa） 片段：Receptor binding domain (RBD)
未记录 GOL GLYCEROL × 7 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6 and 25% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.75 Å R-free 0.217
7F5H The crystal structure of RBD-Nanobody complex, DL28 (SC4) 提交 2021-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 330–531（202 aa） 片段：Receptor binding domain (RBD)
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M Potassium phosphate dibasic, 20% PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.248
7F5H The crystal structure of RBD-Nanobody complex, DL28 (SC4) 提交 2021-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 330–531（202 aa） 片段：Receptor binding domain (RBD)
未记录 GOL GLYCEROL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M Potassium phosphate dibasic, 20% PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.248
7F5R Crystal structure of SARS-CoV-2 Y453F-RBD bound to mink ACE2 提交 2021-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；1.6M sodium/potassium phosphate
分辨率 3.01 Å R-free 0.218
7F5R Crystal structure of SARS-CoV-2 Y453F-RBD bound to mink ACE2 提交 2021-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；1.6M sodium/potassium phosphate
分辨率 3.01 Å R-free 0.218
7F5R Crystal structure of SARS-CoV-2 Y453F-RBD bound to mink ACE2 提交 2021-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；1.6M sodium/potassium phosphate
分辨率 3.01 Å R-free 0.218
7F62 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with a neutralizing antibody chAb-25 (Focused refinement of S-RBD and chAb-25 region) 提交 2021-06-24 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.60 Å
7F63 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with a neutralizing antibody chAb-45 (Focused refinement of S-RBD and chAb-45 region) 提交 2021-06-24 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.90 Å
7F6Y Complex Structure of antibody BD-503 and RBD-E484K of COVID-19 提交 2021-06-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–541（223 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1M Sodium citrate, pH 5.0, 15% (w/v) PEG 4000
分辨率 3.00 Å R-free 0.253
7F6Z Complex Structure of antibody BD-503 and RBD-501Y.V2 of COVID-19 提交 2021-06-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–541（223 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Tris, pH 8.5, 12% (w/v) PEG 8000
分辨率 3.00 Å R-free 0.254
7F7E SARS-CoV-2 S protein RBD in complex with A5-10 Fab 提交 2021-06-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–527（195 aa） 片段：RBD domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Tris, PEG 6000, 100mM NaCl
分辨率 2.49 Å R-free 0.256
7F7H SARS-CoV-2 S protein RBD in complex with A8-1 Fab 提交 2021-06-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 334–515（182 aa） 片段：RBD domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Tris, PEG 6000, 100mM NaCl
分辨率 3.19 Å R-free 0.275
7F7H SARS-CoV-2 S protein RBD in complex with A8-1 Fab 提交 2021-06-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 334–515（182 aa） 片段：RBD domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Tris, PEG 6000, 100mM NaCl
分辨率 3.19 Å R-free 0.275
7FAE S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P36-5D2(state2) 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P,K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P,K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P,K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
7FAF S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P36-5D2 (state1) 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
7FAT Structure Determination of the RBD-NB1A7 提交 2021-07-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 333–523（191 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；8% PEG6000, 0.1 M citric acid pH 3.5 and 2% ethylene glycol
分辨率 1.99 Å R-free 0.242
7FAU Structure Determination of the NB1B11-RBD Complex 提交 2021-07-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 333–523（191 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；16% PEG3350 and 0.1 M Zinc acetate, dehydrate
分辨率 2.08 Å R-free 0.228
7FAU Structure Determination of the NB1B11-RBD Complex 提交 2021-07-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 333–523（191 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；16% PEG3350 and 0.1 M Zinc acetate, dehydrate
分辨率 2.08 Å R-free 0.228
7FB0 SARS-CoV-2 spike protein in closed state 提交 2021-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7FB1 SARS-CoV-2 spike protein in one-RBD open state 提交 2021-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7FB3 SARS-CoV-2 spike protein in one-RBD weak state after CTSL-treatment 提交 2021-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7FB4 SARS-CoV-2 spike protein in two-RBD weak state after CTSL-treatment 提交 2021-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7FBJ Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing nanobody 17F6 提交 2021-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 332–527（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.22M Sodium citrate tribasic dihydrate 23% PEG 3350
分辨率 2.85 Å R-free 0.300
7FBJ Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing nanobody 17F6 提交 2021-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 332–527（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.22M Sodium citrate tribasic dihydrate 23% PEG 3350
分辨率 2.85 Å R-free 0.300
7FBJ Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing nanobody 17F6 提交 2021-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 332–527（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.22M Sodium citrate tribasic dihydrate 23% PEG 3350
分辨率 2.85 Å R-free 0.300
7FBJ Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing nanobody 17F6 提交 2021-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 332–527（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.22M Sodium citrate tribasic dihydrate 23% PEG 3350
分辨率 2.85 Å R-free 0.300
7FBJ Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing nanobody 17F6 提交 2021-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 332–527（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.22M Sodium citrate tribasic dihydrate 23% PEG 3350
分辨率 2.85 Å R-free 0.300
7FBJ Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing nanobody 17F6 提交 2021-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 332–527（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.22M Sodium citrate tribasic dihydrate 23% PEG 3350
分辨率 2.85 Å R-free 0.300
7FBJ Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing nanobody 17F6 提交 2021-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 M 332–527（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.22M Sodium citrate tribasic dihydrate 23% PEG 3350
分辨率 2.85 Å R-free 0.300
7FBJ Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing nanobody 17F6 提交 2021-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 O 332–527（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.22M Sodium citrate tribasic dihydrate 23% PEG 3350
分辨率 2.85 Å R-free 0.300
7FBK Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain N501Y mutant in complex with neutralizing nanobody 20G6 提交 2021-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 332–527（196 aa） 片段：receptor binding domain
突变：N501Y 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；70mM Citric acid, 30mM Bis-Tris propane pH 3.4, 20% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.239
7FBK Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain N501Y mutant in complex with neutralizing nanobody 20G6 提交 2021-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 332–527（196 aa） 片段：receptor binding domain
突变：N501Y 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；70mM Citric acid, 30mM Bis-Tris propane pH 3.4, 20% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.239
7FC5 Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD and horse ACE2 提交 2021-07-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–529（197 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2M Sodium formate, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.259
7FCD Structure of the SARS-CoV-2 A372T spike glycoprotein (open) 提交 2021-07-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：A372T, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：A372T, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：A372T, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7FCE Structure of the SARS-CoV-2 A372T spike glycoprotein (closed) 提交 2021-07-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：A372T, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：A372T, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：A372T, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7FCP Crystallographic structure of two neutralizing antibodies in complex with SARS-CoV-2 spike receptor-binding Domain (RBD) 提交 2021-07-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 321–591（271 aa）
未记录 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.05 M HEPES pH 7.0 20%(w/v) PEG3350 1%(w/v) Tryptone
分辨率 2.40 Å R-free 0.245
7FCQ Crystallographic structure of neutralizing antibody P14-44 in complex with SARS-CoV-2 spike receptor-binding Domain (RBD) 提交 2021-07-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 332–528（197 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；291 K；0.1 M Sodium citrate pH 5.6 20%(w/v) PEG4000 20%(V/V) Isopropanol
分辨率 1.89 Å R-free 0.201
7FDG SARS-COV-2 Spike RBDMACSp6 binding to hACE2 提交 2021-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–526（194 aa）
突变：N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
7FDH SARS-COV-2 Spike RBDMACSp25 binding to hACE2 提交 2021-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–526（194 aa）
突变：Q493H, N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.72 Å
7FDI SARS-COV-2 Spike RBDMACSp36 binding to hACE2 提交 2021-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–526（194 aa）
突变：K417N, Q493H, N501H NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
7FDK SARS-COV-2 Spike RBDMACSp36 binding to mACE2 提交 2021-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–526（194 aa）
突变：K417N, Q493H, N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
7FEM SARS-CoV-2 B.1.1.7 S-ACE2 complex 提交 2021-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：eicosameric
链 A 15–1208（1194 aa）
链 B 15–1208（1194 aa）
链 C 15–1208（1194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7FET SARS-CoV-2 B.1.1.7 Spike Glycoprotein trimer 提交 2021-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 15–1208（1194 aa）
链 B 15–1208（1194 aa）
链 C 15–1208（1194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7FG2 Minor cryo-EM structure of S protein trimer of SARS-CoV2 with K-874A VHH, composite map 提交 2021-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7FG3 Major cryo-EM structure of S protein trimer of SARS-CoV2 with K-874, composite map 提交 2021-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7FG7 Cryo-EM structure of S protein trimer of SARS-CoV2 提交 2021-07-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–1273（1273 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
7FH0 Crystallographic structure of two neutralizing nanobodies in complex with SARS-CoV-2 spike receptor-binding Domain (RBD) 提交 2021-07-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–537（219 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M (NH4)2SO4 0.1 M TRIS pH7.5 20% (w/v) PEG1500
分辨率 3.20 Å R-free 0.263
7FJC Crystal structure of SARS-CoV-2 Beta RBD complexed with P36-5D2 Fab 提交 2021-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–519（187 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.1M Sodium HEPES 7.5, 10% w/v PEG6000, 5% v/v MPD
分辨率 2.96 Å R-free 0.269
7FJN Cryo-EM structure of South African (B.1.351) SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with two T6 Fab 提交 2021-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 16–1208（1193 aa）
链 B 16–1208（1193 aa）
链 C 16–1208（1193 aa）
突变：R682G,R683S,R685S,K968P,V969P,S305T 突变：R682G,R683S,R685S,K968P,V969P,S305T 突变：R682G,R683S,R685S,K968P,V969P,S305T NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
7FJO Cryo-EM structure of South African (B.1.351) SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with three T6 Fab 提交 2021-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 16–1208（1193 aa）
链 B 16–1208（1193 aa）
链 C 16–1208（1193 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.34 Å
7FJS Crystal structure of T6 Fab bound to theSARS-CoV-2 RBD of B.1.351 提交 2021-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 333–527（195 aa） 片段：receptor binding domain
链 E 333–527（195 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 5 % v/v 2-propanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.285
7JJC Crystal structure of neuropilin-1 b1 domain in complex with SARS-CoV-2 S1 C-end rule (CendR) peptide 提交 2020-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 679–685（7 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Sodium Citrate pH 5, 20% PEG 6K
分辨率 2.36 Å R-free 0.250
7JJC Crystal structure of neuropilin-1 b1 domain in complex with SARS-CoV-2 S1 C-end rule (CendR) peptide 提交 2020-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 679–685（7 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Sodium Citrate pH 5, 20% PEG 6K
分辨率 2.36 Å R-free 0.250
7JJC Crystal structure of neuropilin-1 b1 domain in complex with SARS-CoV-2 S1 C-end rule (CendR) peptide 提交 2020-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 679–685（7 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Sodium Citrate pH 5, 20% PEG 6K
分辨率 2.36 Å R-free 0.250
7JJC Crystal structure of neuropilin-1 b1 domain in complex with SARS-CoV-2 S1 C-end rule (CendR) peptide 提交 2020-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 679–685（7 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Sodium Citrate pH 5, 20% PEG 6K
分辨率 2.36 Å R-free 0.250
7JJI Structure of SARS-CoV-2 3Q-2P full-length prefusion spike trimer (C3 symmetry) 提交 2020-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R682Q, R683Q, R685Q, K986P, V987P 突变：R682Q, R683Q, R685Q, K986P, V987P 突变：R682Q, R683Q, R685Q, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 VCG 2-hydroxyethyl 2-deoxy-3,5-bis-O-(2-hydroxyethyl)-6-O-(2-{[(9E)-octadec-9-enoyl]oxy}ethyl)-alpha-L-xylo-hexofuranoside × 3 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JJJ Structure of SARS-CoV-2 3Q-2P full-length dimers of spike trimers 提交 2020-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
链 D 1–1273（1273 aa）
链 E 1–1273（1273 aa）
链 F 1–1273（1273 aa）
突变：R682Q, R683Q, R685Q, K986P, V987P 突变：R682Q, R683Q, R685Q, K986P, V987P 突变：R682Q, R683Q, R685Q, K986P, V987P 突变：R682Q, R683Q, R685Q, K986P, V987P 突变：R682Q, R683Q, R685Q, K986P, V987P 突变：R682Q, R683Q, R685Q, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7JMO Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody COVA2-04 提交 2020-08-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；8.5% isopropanol 10% ethylene glycol 15% glycerol 0.085 M HEPES pH 7.5 17% polyethylene glycol 4000
分辨率 2.36 Å R-free 0.238
7JMP Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody COVA2-39 提交 2020-08-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate pH 5.6 20% isopropanol 10% ethylene glycol 20% polyethylene glycol 4000
分辨率 1.71 Å R-free 0.209
7JMW Crystal structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor-binding domain in complex with cross-neutralizing antibody COVA1-16 Fab 提交 2020-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；293.15 K；20% PEG 3350, 0.2 M Na-iodide, pH 6.9
分辨率 2.89 Å R-free 0.291
7JV2 SARS-CoV-2 spike in complex with the S2H13 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the receptor-binding motif and Fab variable domains) 提交 2020-08-20 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7JV4 SARS-CoV-2 spike in complex with the S2H13 neutralizing antibody (one RBD open) 提交 2020-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7JV6 SARS-CoV-2 spike in complex with the S2H13 neutralizing antibody (closed conformation) 提交 2020-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 E 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7JVA SARS-CoV-2 spike in complex with the S2A4 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the receptor-binding domain and Fab variable domains) 提交 2020-08-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JVB Crystal structure of the SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain (RBD) with nanobody Nb20 提交 2020-08-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 CAC CACODYLATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；290 K；100 mM sodium cacodylate pH 6.5, 1 M sodium citrate
分辨率 3.29 Å R-free 0.322
7JVB Crystal structure of the SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain (RBD) with nanobody Nb20 提交 2020-08-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 CAC CACODYLATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；290 K；100 mM sodium cacodylate pH 6.5, 1 M sodium citrate
分辨率 3.29 Å R-free 0.322
7JVC SARS-CoV-2 spike in complex with the S2A4 neutralizing antibody Fab fragment 提交 2020-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 E 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7JW0 SARS-CoV-2 spike in complex with the S304 neutralizing antibody Fab fragment 提交 2020-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 E 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7JWB SARS CoV2 Spike ectodomain with engineered trimerized VH binder 提交 2020-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G,R683S,R685S,R986P,V987P 突变：R682G,R683S,R685S,R986P,V987P 突变：R682G,R683S,R685S,R986P,V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES, pH 8, 200 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率未提供
7JWY Structure of SARS-CoV-2 spike at pH 4.5 提交 2020-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7JX3 Mapping neutralizing and immunodominant sites on the SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain by structure-guided high-resolution serology 提交 2020-08-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 R 328–531（204 aa） 片段：Receptor binding domain (UNP residues 328-531)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；16.2% w/v PEG4000, 0.09 M sodium citrate, pH 6.0, 0.18 M ammonium acetate, 0.02 M potassium acetate, 0.01 MES, pH 6, 1.5% v/v pentaerythritol ethoxylate (15/4 EO/OH)
分辨率 2.65 Å R-free 0.288
7JZL SARS-CoV-2 spike in complex with LCB1 (2RBDs open) 提交 2020-09-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JZM SARS-CoV-2 spike in complex with LCB3 (local refinement of the RBD and LCB3) 提交 2020-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7JZN SARS-CoV-2 spike in complex with LCB3 (2RBDs open) 提交 2020-09-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7JZU SARS-CoV-2 spike in complex with LCB1 (local refinement of the RBD and LCB1) 提交 2020-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7K43 SARS-CoV-2 spike in complex with the S2M11 neutralizing antibody Fab fragment 提交 2020-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 E 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7K45 SARS-CoV-2 spike in complex with the S2E12 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the RBD and Fab variable domains) 提交 2020-09-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7K4N SARS-CoV-2 spike in complex with the S2E12 neutralizing antibody Fab fragment 提交 2020-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7K8M Structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C102 提交 2020-09-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 331–517（187 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 331-517)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M sodium citrate tribasic, 20% w/v PEG3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.234
7K8S Structure of the SARS-CoV-2 S 2P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C002 (state 1) 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot, 0 blot force
分辨率 3.40 Å
7K8T Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C002 (State 2) 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot, 0 blot force
分辨率 3.40 Å
7K8U Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C104 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot, 0 blot force
分辨率 3.80 Å
7K8V Structure of the SARS-CoV-2 S 2P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C110 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot
分辨率 3.80 Å
7K8W Structure of the SARS-CoV-2 S 2P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C119 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 G 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot, 0 blot force
分辨率 3.60 Å
7K8X Structure of the SARS-CoV-2 S 2P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C121 (State 1) 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot
分辨率 3.90 Å
7K8Y Structure of the SARS-CoV-2 S 2P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C121 (State 2) 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–1213（1213 aa）
链 D 1–1213（1213 aa）
链 E 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot
分辨率 4.40 Å
7K8Z Structure of the SARS-CoV-2 S 2P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C135 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot, 0 blot force
分辨率 3.50 Å
7K90 Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C144 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot
分辨率 3.24 Å
7K9H SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing Fab 2B04 (one up, two down conformation) 提交 2020-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
突变：R685A, R686*, A687*, R688*, K989P, V990P 突变：R685A, R686*, A687*, R688*, K989P, V990P 突变：R685A, R686*, A687*, R688*, K989P, V990P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；20s wait time 2s blot time
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；20s wait time 2s blot time
分辨率 3.20 Å
7K9I SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with neutralizing Fab 2B04 (local refinement) 提交 2020-09-29 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–527（195 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 333-527)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7K9J SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing Fab 2H04 (three down conformation) 提交 2020-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
突变：R685A, R686*, A687*, R688*, K989P, V990P 突变：R685A, R686*, A687*, R688*, K989P, V990P 突变：R685A, R686*, A687*, R688*, K989P, V990P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7K9K SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with neutralizing Fab 2H04 (local refinement) 提交 2020-09-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–527（195 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 333-527)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；20s wait time 2s blot time
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；20s wait time 2s blot time
分辨率 3.14 Å
7K9Z Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with the Fab fragments of neutralizing antibodies 298 and 52 提交 2020-09-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；20% (w/v) 2-propanol, 20% (w/v) PEG 4000, 0.1 M sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.95 Å R-free 0.287
7KDG SARS-CoV-2 RBD down Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS) 提交 2020-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
链 C 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
突变：R682G, R683S, R685S 突变：R682G, R683S, R685S 突变：R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
7KDH SARS-CoV-2 RBD up Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS) 提交 2020-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
链 C 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
突变：R682G R683S R685S 突变：R682G R683S R685S 突变：R682G R683S R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 58 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
7KDI SARS-CoV-2 D614G 3 RBD down Spike Protein Trimer fully cleaved by furin without the P986-P987 stabilizing mutations (S-RRAR-D614G) 提交 2020-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
链 C 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
突变：D614G 突变：D614G 突变：D614G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.26 Å
7KDJ SARS-CoV-2 D614G 1-RBD-up Spike Protein Trimer fully cleaved by furin without the P986-P987 stabilizing mutations (S-RRAR-D614G) 提交 2020-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
链 C 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
突变：D614G 突变：D614G 突变：D614G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7KDK SARS-CoV-2 D614G 3 RBD down Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-D614G) 提交 2020-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
链 C 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7KDL SARS-CoV-2 D614G 1-RBD up Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-D614G) 提交 2020-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
链 C 1–1208（1208 aa） 片段：ectodomain
突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
7KE4 SARS-CoV-2 D614G 3 RBD down Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-D614G Sub-class) 提交 2020-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.21 Å
7KE6 SARS-CoV-2 D614G 3 RBD down Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-D614G sub-classification) 提交 2020-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7KE7 SARS-CoV-2 D614G 3-RBD-down Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-D614G Sub-Classification) 提交 2020-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
7KE8 SARS-CoV-2 D614G 3 RBD down Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-D614G sub-classification) 提交 2020-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.26 Å
7KE9 SARS-CoV-2 D614G 1-RBD-up Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-D614G sub-classification) 提交 2020-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
7KEA SARS-CoV-2 D614G 1-RBD-up Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-D614G sub classification) 提交 2020-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
7KEB SARS-CoV-2 D614G 1RBD up Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-D614G sub-classification) 提交 2020-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
7KEC SARS-CoV-2 D614G 1-RBD-up Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-D614G Sub-Classification) 提交 2020-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S 突变：D614G R682G R683S R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.84 Å
7KFV Structural basis for a germline-biased antibody response to SARS-CoV-2 (RBD:C1A-B12 Fab) 提交 2020-10-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293.15 K；protein sample: 13 mg/mL in 150mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, pH 7.5 mother liquor composition (equal volume): 0.1 M BICINE pH 8.5, 20% (w/v ) PEG 10000
分辨率 2.10 Å R-free 0.215
7KFV Structural basis for a germline-biased antibody response to SARS-CoV-2 (RBD:C1A-B12 Fab) 提交 2020-10-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293.15 K；protein sample: 13 mg/mL in 150mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, pH 7.5 mother liquor composition (equal volume): 0.1 M BICINE pH 8.5, 20% (w/v ) PEG 10000
分辨率 2.10 Å R-free 0.215
7KFV Structural basis for a germline-biased antibody response to SARS-CoV-2 (RBD:C1A-B12 Fab) 提交 2020-10-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293.15 K；protein sample: 13 mg/mL in 150mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, pH 7.5 mother liquor composition (equal volume): 0.1 M BICINE pH 8.5, 20% (w/v ) PEG 10000
分辨率 2.10 Å R-free 0.215
7KFW Structural basis for a germline-biased antibody response to SARS-CoV-2 (RBD:C1A-B3 Fab) 提交 2020-10-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；protein sample: 13 mg/mL in 150mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, pH 7.5 mother liquor composition (equal volume): 0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.79 Å R-free 0.229
7KFW Structural basis for a germline-biased antibody response to SARS-CoV-2 (RBD:C1A-B3 Fab) 提交 2020-10-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；protein sample: 13 mg/mL in 150mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, pH 7.5 mother liquor composition (equal volume): 0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.79 Å R-free 0.229
7KFW Structural basis for a germline-biased antibody response to SARS-CoV-2 (RBD:C1A-B3 Fab) 提交 2020-10-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；protein sample: 13 mg/mL in 150mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, pH 7.5 mother liquor composition (equal volume): 0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.79 Å R-free 0.229
7KFX Structural basis for a germline-biased antibody response to SARS-CoV-2 (RBD:C1A-C2 Fab) 提交 2020-10-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；protein sample: 13 mg/mL in 150mM NaCl, 25 mM Tris-HCl pH 7.5 mother liquor composition (equal volume): 0.03 M Citric acid, 0.07M BIS-TRIS propane/pH 7.6, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.23 Å R-free 0.226
7KFY Structural basis for a germline-biased antibody response to SARS-CoV-2 (RBD:C1A-F10 Fab) 提交 2020-10-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；protein sample: 13 mg/mL in 150mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, pH 7.5 mother liquor composition (equal volume): 0.10% (w/v) n-Octyl-B-glucoside, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 4.5, 22% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.16 Å R-free 0.249
7KGJ Crystal structure of synthetic nanobody (Sb45) complexes with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2020-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 333–528（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；12% PEG 8000, 0.1M Hepes pH 7.5, 0.2M NaCl
分辨率 2.30 Å R-free 0.216
7KGK Crystal structure of synthetic nanobody (Sb16) complexes with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2020-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 333–527（195 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；15% PEG 20000, and 0.1M Hepes pH 7.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
7KJ2 SARS-CoV-2 Spike Glycoprotein with one ACE2 Bound 提交 2020-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7KJ3 SARS-CoV-2 Spike Glycoprotein with two ACE2 Bound 提交 2020-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 40 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7KJ4 SARS-CoV-2 Spike Glycoprotein with three ACE2 Bound 提交 2020-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7KJ5 SARS-CoV-2 Spike Glycoprotein, prefusion with one RBD up conformation 提交 2020-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7KKK SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing nanobody Nb6 提交 2020-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
7KKL SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing nanobody mNb6 提交 2020-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
7KL9 Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the ACE2 protein decoy, CTC-445.2 (State 4) 提交 2020-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot, 0 blot force
分辨率 4.10 Å
7KLG SARS-CoV-2 RBD in complex with Fab 15033 提交 2020-10-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 328–528（201 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；1.4 M (NH4)2SO4, 10% 1,2-propanediol
分辨率 3.20 Å R-free 0.290
7KLG SARS-CoV-2 RBD in complex with Fab 15033 提交 2020-10-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 328–528（201 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；1.4 M (NH4)2SO4, 10% 1,2-propanediol
分辨率 3.20 Å R-free 0.290
7KLH SARS-CoV-2 RBD in complex with Fab 15033-7 提交 2020-10-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 328–528（201 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；1.4 M (NH4)2SO4 16% glycerol
分辨率 3.00 Å R-free 0.283
7KLH SARS-CoV-2 RBD in complex with Fab 15033-7 提交 2020-10-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 328–528（201 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；1.4 M (NH4)2SO4 16% glycerol
分辨率 3.00 Å R-free 0.283
7KLW Crystal structure of synthetic nanobody (Sb45+Sb68) complexes with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2020-11-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–527（194 aa） 片段：RBD domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；10% PEG 8000, 0.1M Sodium Cacodylate pH 6.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.255
7KM5 Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD complexed with Nanosota-1 提交 2020-11-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 319–535（217 aa） 片段：receptor-binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM MnCl2, 50 mM MES (pH 6.0), 20% (W/V) PEG 4000
分辨率 3.19 Å R-free 0.294
7KM5 Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD complexed with Nanosota-1 提交 2020-11-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–535（217 aa） 片段：receptor-binding domain
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM MnCl2, 50 mM MES (pH 6.0), 20% (W/V) PEG 4000
分辨率 3.19 Å R-free 0.294
7KMB ACE2-RBD Focused Refinement Using Symmetry Expansion of Applied C3 for Triple ACE2-bound SARS-CoV-2 Trimer Spike at pH 7.4 提交 2020-11-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 16–1208（1193 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
7KMG LY-CoV555 neutralizing antibody against SARS-CoV-2 提交 2020-11-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 329–527（199 aa） 片段：receptor-binding domain
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；20% PEG 10000, sodium acetate pH 4.6
分辨率 2.16 Å R-free 0.257
7KMG LY-CoV555 neutralizing antibody against SARS-CoV-2 提交 2020-11-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 329–527（199 aa） 片段：receptor-binding domain
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；20% PEG 10000, sodium acetate pH 4.6
分辨率 2.16 Å R-free 0.257
7KMH LY-CoV488 neutralizing antibody against SARS-CoV-2 提交 2020-11-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 329–527（199 aa） 片段：receptor-binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 1 PRO PROLINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；293 K；8% PEG 3350, 200 mM L-Proline, 100 mM Hepes pH 7.7
分辨率 1.72 Å R-free 0.242
7KMI LY-CoV481 neutralizing antibody against SARS-CoV-2 提交 2020-11-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 329–527（199 aa） 片段：receptor-binding domain
未记录 GOL GLYCEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；14% PEG 4000, 10% 2-Propanol, 100 mM Tri-Sodium Citrate pH 5.8
分辨率 1.73 Å R-free 0.217
7KMK cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with Fab 15033-7, two RBDs bound 提交 2020-11-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1211（1211 aa）
链 B 1–1211（1211 aa）
链 C 1–1211（1211 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting force = 1 blotting time = 2.5 s
分辨率 4.20 Å
7KML cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with Fab 15033-7, three RBDs bound 提交 2020-11-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1211（1211 aa）
链 B 1–1211（1211 aa）
链 C 1–1211（1211 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting force = 1 blotting time = 2.5 s
分辨率 3.80 Å
7KMS Cryo-EM structure of triple ACE2-bound SARS-CoV-2 trimer spike at pH 7.4 提交 2020-11-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 55 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å
7KMZ Cryo-EM structure of double ACE2-bound SARS-CoV-2 trimer Spike at pH 7.4 提交 2020-11-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 53 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
7KN3 Crystal structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor-binding domain complexed with a pre-pandemic antibody S-B8 Fab 提交 2020-11-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 SO4 SULFATE ION × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M sodium sulfate, pH 6.6
分辨率 2.25 Å R-free 0.222
7KN3 Crystal structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor-binding domain complexed with a pre-pandemic antibody S-B8 Fab 提交 2020-11-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M sodium sulfate, pH 6.6
分辨率 2.25 Å R-free 0.222
7KN4 Crystal structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor-binding domain complexed with a pre-pandemic antibody S-E6 Fab 提交 2020-11-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；20% isopropanol, 20% PEG 4000, 0.1 M citrate pH 5.6
分辨率 2.70 Å R-free 0.291
7KN4 Crystal structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor-binding domain complexed with a pre-pandemic antibody S-E6 Fab 提交 2020-11-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；20% isopropanol, 20% PEG 4000, 0.1 M citrate pH 5.6
分辨率 2.70 Å R-free 0.291
7KN5 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain complexed with nanobodies VHH E and U 提交 2020-11-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG-3000, 0.1 M citrate pH 5.5
分辨率 1.87 Å R-free 0.213
7KN5 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain complexed with nanobodies VHH E and U 提交 2020-11-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG-3000, 0.1 M citrate pH 5.5
分辨率 1.87 Å R-free 0.213
7KN6 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain complexed with nanobody VHH V and antibody Fab CC12.3 提交 2020-11-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M Na2HPO4, pH 9.1
分辨率 2.55 Å R-free 0.238
7KN7 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain complexed with nanobody VHH W and antibody Fab CC12.3 提交 2020-11-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.0 M Li-chloride, 10% PEG-6000, 0.1 M Bicine pH 9.0
分辨率 2.73 Å R-free 0.241
7KNB Cryo-EM structure of single ACE2-bound SARS-CoV-2 trimer spike at pH 7.4 提交 2020-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 46 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.93 Å
7KNE Cryo-EM structure of single ACE2-bound SARS-CoV-2 trimer spike at pH 5.5 提交 2020-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 44 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5；PBS with NaAcetate pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
7KNH Cryo-EM Structure of Double ACE2-Bound SARS-CoV-2 Trimer Spike at pH 5.5 提交 2020-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 48 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5；PBS with NaAcetate pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
7KNI Cryo-EM structure of Triple ACE2-bound SARS-CoV-2 Trimer Spike at pH 5.5 提交 2020-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 56 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5；PBS with NaAcetate pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.91 Å
7KQB SARS-CoV-2 spike glycoprotein:Fab 5A6 complex I 提交 2020-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；8-10 seconds, blot force 0
分辨率 2.42 Å
7KQE SARS-CoV-2 spike glycoprotein:Fab 3D11 complex 提交 2020-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；8-10 seconds, blot force 0
分辨率 2.88 Å
7KRQ Structural impact on SARS-CoV-2 spike protein by D614G substitution 提交 2020-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：D614G 突变：D614G 突变：D614G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å R-free 0.425
7KRR Structural impact on SARS-CoV-2 spike protein by D614G substitution 提交 2020-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å R-free 0.437
7KRS Structural impact on SARS-CoV-2 spike protein by D614G substitution 提交 2020-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å R-free 0.479
7KS9 Cryo-EM structure of prefusion SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with 910-30 Fab 提交 2020-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.75 Å
7KSG SARS-CoV-2 spike in complex with nanobodies E 提交 2020-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 51 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
7KXJ SARS-CoV-2 spike protein in complex with Fab 15033-7, 3-"up", asymmetric 提交 2020-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1211（1211 aa）
链 B 1–1211（1211 aa）
链 C 1–1211（1211 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting force = 1 blotting time = 2.5 s
分辨率 6.40 Å
7KXK SARS-CoV-2 spike protein in complex with Fab 15033-7, 2-"up"-1-"down" conformation 提交 2020-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1211（1211 aa）
链 B 1–1211（1211 aa）
链 C 1–1211（1211 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting force = 1 blotting time = 2.5 s
分辨率 5.00 Å
7KZB Potent SARS-CoV-2 binding and neutralization through maturation of iconic SARS-CoV-1antibodies 提交 2020-12-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 333–528（196 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM NaCl, 100 mM Tris (pH 8.0), 20% (w/v) PEG3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.336
7L02 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 2P S ectodomain bound to one copy of domain-swapped antibody 2G12 提交 2020-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 27–1147（1121 aa）
链 B 27–1147（1121 aa）
链 C 27–1147（1121 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7L06 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 2P S ectodomain bound to two copies of domain-swapped antibody 2G12 提交 2020-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 A 27–1147（1121 aa）
链 B 27–1147（1121 aa）
链 C 27–1147（1121 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7L09 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 2P S ectodomain bound domain-swapped antibody 2G12 from masked 3D refinement 提交 2020-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 27–1147（1121 aa）
链 B 27–1147（1121 aa）
链 C 27–1147（1121 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7L0N Circulating SARS-CoV-2 spike N439K variants maintain fitness while evading antibody-mediated immunity 提交 2020-12-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 R 328–531（204 aa） 片段：Binding domain
未记录 CL CHLORIDE ION × 8 SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 4 PG5 1-METHOXY-2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHANE × 1 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.09 M Buffer System 3 pH 8.5 contains Tris (base); BICINE 27% Precipitant Mix 2 contains Ethylene glycol and PEG8000 0.1 M Ammonium sulfate
分辨率 2.78 Å R-free 0.325
7L0N Circulating SARS-CoV-2 spike N439K variants maintain fitness while evading antibody-mediated immunity 提交 2020-12-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 S 328–531（204 aa） 片段：Binding domain
未记录 CL CHLORIDE ION × 19 SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.09 M Buffer System 3 pH 8.5 contains Tris (base); BICINE 27% Precipitant Mix 2 contains Ethylene glycol and PEG8000 0.1 M Ammonium sulfate
分辨率 2.78 Å R-free 0.325
7L2C Crystallographic structure of neutralizing antibody 2-51 in complex with SARS-CoV-2 spike N-terminal domain (NTD) 提交 2020-12-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–334（334 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 23 ACT ACETATE ION × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.16 M Calcium Acetate, 0.08 M Sodium Cacodylate, 14.4% PEG 8000, 20% Glycerol
分辨率 3.65 Å R-free 0.272
7L2C Crystallographic structure of neutralizing antibody 2-51 in complex with SARS-CoV-2 spike N-terminal domain (NTD) 提交 2020-12-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–334（334 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 CA CALCIUM ION × 16 ACT ACETATE ION × 6 CAC CACODYLATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.16 M Calcium Acetate, 0.08 M Sodium Cacodylate, 14.4% PEG 8000, 20% Glycerol
分辨率 3.65 Å R-free 0.272
7L2D Cryo-EM structure of NTD-directed neutralizing antibody 1-87 in complex with prefusion SARS-CoV-2 spike glycoprotein 提交 2020-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
7L2E Cryo-EM structure of NTD-directed neutralizing antibody 4-18 in complex with prefusion SARS-CoV-2 spike glycoprotein 提交 2020-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
7L2F Cryo-EM structure of NTD-directed neutralizing antibody 5-24 in complex with prefusion SARS-CoV-2 spike glycoprotein 提交 2020-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7L3N SARS-CoV 2 Spike Protein bound to LY-CoV555 提交 2020-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 13–1208（1196 aa）
链 B 13–1208（1196 aa）
链 C 13–1208（1196 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
7L4Z Structure of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with cyclic peptide 提交 2020-12-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM ammonium sulfate, 24% PEG 4000, 12% glycerol
分辨率 3.96 Å R-free 0.282
7L4Z Structure of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with cyclic peptide 提交 2020-12-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 319–541（223 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM ammonium sulfate, 24% PEG 4000, 12% glycerol
分辨率 3.96 Å R-free 0.282
7L4Z Structure of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with cyclic peptide 提交 2020-12-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 319–541（223 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM ammonium sulfate, 24% PEG 4000, 12% glycerol
分辨率 3.96 Å R-free 0.282
7L4Z Structure of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with cyclic peptide 提交 2020-12-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 319–541（223 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM ammonium sulfate, 24% PEG 4000, 12% glycerol
分辨率 3.96 Å R-free 0.282
7L4Z Structure of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with cyclic peptide 提交 2020-12-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 319–541（223 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM ammonium sulfate, 24% PEG 4000, 12% glycerol
分辨率 3.96 Å R-free 0.282
7L56 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein bound to Fab 2-43 提交 2020-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P, R682G, R683S, R685S 突变：K986P, V987P, R682G, R683S, R685S 突变：K986P, V987P, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7L57 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein bound to Fab 2-15 提交 2020-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P, R682G, R683S, R685S 突变：K986P, V987P, R682G, R683S, R685S 突变：K986P, V987P, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.87 Å
7L58 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein bound to Fab H4 提交 2020-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P, R682G, R683S, R685S 突变：K986P, V987P, R682G, R683S, R685S 突变：K986P, V987P, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.07 Å
7L5B Crystallographic structure of neutralizing antibody 2-15 in complex with SARS-CoV-2 spike receptor-binding Domain (RBD). 提交 2020-12-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–537（219 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M Hepes, 70 % MPD
分辨率 3.18 Å R-free 0.239
7L7D Crystal structure of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with human monoclonal antibody AZD8895 提交 2020-12-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 330–529（200 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 330-529)
未记录 GOL GLYCEROL × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；16% PEG3350, 0.2 M Tris-HCl, pH 8.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.231
7L7E Crystal structure of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with human monoclonal antibodies AZD8895 and AZD1061 提交 2020-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 330–529（200 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 330-529)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；5% PEG1000, 40% reagent alcohol, 0.1 M sodium phosphate dibasic/citric acid, pH 4.2
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
7L7E Crystal structure of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with human monoclonal antibodies AZD8895 and AZD1061 提交 2020-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 b 330–529（200 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 330-529)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；5% PEG1000, 40% reagent alcohol, 0.1 M sodium phosphate dibasic/citric acid, pH 4.2
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
7L7E Crystal structure of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with human monoclonal antibodies AZD8895 and AZD1061 提交 2020-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 S 330–529（200 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 330-529)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；5% PEG1000, 40% reagent alcohol, 0.1 M sodium phosphate dibasic/citric acid, pH 4.2
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
7L7E Crystal structure of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with human monoclonal antibodies AZD8895 and AZD1061 提交 2020-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 K 330–529（200 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 330-529)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；5% PEG1000, 40% reagent alcohol, 0.1 M sodium phosphate dibasic/citric acid, pH 4.2
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
7L7F Cryo-EM structure of human ACE2 receptor bound to protein encoded by vaccine candidate BNT162b1 提交 2020-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–16（16 aa）
链 E 327–528（202 aa）
链 F 1–16（16 aa）
链 F 327–528（202 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
7L7K Cryo-EM structure of protein encoded by vaccine candidate BNT162b2 提交 2020-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
7LAA Structure of SARS-CoV-2 S protein in complex with Receptor Binding Domain antibody DH1041 提交 2021-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 27–1147（1121 aa）
链 B 27–1147（1121 aa）
链 C 27–1147（1121 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 17 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
7LAB Structure of SARS-CoV-2 S protein in complex with N-terminal domain antibody DH1052 提交 2021-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 27–1147（1121 aa）
链 B 27–1147（1121 aa）
链 C 27–1147（1121 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
7LC8 SARS-CoV-2 spike Protein TM domain 提交 2021-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1217–1237（21 aa） 片段：TM domain, residues 1217-1237
链 B 1217–1237（21 aa） 片段：TM domain, residues 1217-1237
链 C 1217–1237（21 aa） 片段：TM domain, residues 1217-1237
突变：M1229L, M1233L 突变：M1229L, M1233L 突变：M1229L, M1233L 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成 55 mM [U-99% 2H] 1,2-dimyristoyl-sn-Glycero-3-Phosphocholine, 100 mM [U-99% 2H] 1,2-dihexanoyl-sn-Glycero-3-Phosphocholine, 20 mM TRIS, 0.02 % sodium azide, 20 mM sodium chloride, 1 mM [U-13C; U-15N] Spike glycoprotein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 55 mM [U-99% 2H] 1,2-dimyristoyl-sn-Glycero-3-Phosphocholine, 100 mM [U-99% 2H] 1,2-dihexanoyl-sn-Glycero-3-Phosphocholine, 20 mM TRIS, 0.02 % sodium azide, 20 mM sodium chloride, 1 mM [U-13C; U-15N; U-2H] Spike glycoprotein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 55 mM 1,2-dimyristoyl-sn-Glycero-3-Phosphocholine, 100 mM 1,2-dihexanoyl-sn-Glycero-3-Phosphocholine, 20 mM TRIS, 0.02 % sodium azide, 20 mM sodium chloride, 1 mM [U-15N; U-2H] Spike glycoprotein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 55 mM 1,2-dimyristoyl-sn-Glycero-3-Phosphocholine, 100 mM 1,2-dihexanoyl-sn-Glycero-3-Phosphocholine, 20 mM TRIS, 0.02 % sodium azide, 20 mM sodium chloride, 1 mM [U-13C; U-15N; U-2H] Spike glycoprotein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
7LCN Structure of SARS-CoV-2 S protein in complex with N-terminal domain antibody DH1050.1 提交 2021-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 27–1147（1121 aa）
链 C 27–1147（1121 aa）
链 K 27–1147（1121 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7LD1 Structure of SARS-CoV-2 S protein in complex with Receptor Binding Domain antibody DH1047 提交 2021-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 27–1147（1121 aa）
链 B 27–1147（1121 aa）
链 C 27–1147（1121 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7LDJ SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with WNb-2 提交 2021-01-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 331-527)
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；PEG4000, potassium thiocyanate, sodium cacodylate
分辨率 2.36 Å R-free 0.268
7LDJ SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with WNb-2 提交 2021-01-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 331-527)
未记录 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；PEG4000, potassium thiocyanate, sodium cacodylate
分辨率 2.36 Å R-free 0.268
7LDJ SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with WNb-2 提交 2021-01-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 331-527)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；PEG4000, potassium thiocyanate, sodium cacodylate
分辨率 2.36 Å R-free 0.268
7LDJ SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with WNb-2 提交 2021-01-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 331-527)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；PEG4000, potassium thiocyanate, sodium cacodylate
分辨率 2.36 Å R-free 0.268
7LJR SARS-CoV-2 Spike Protein Trimer bound to DH1043 fab 提交 2021-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
7LM8 Crystal structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor-binding domain in complex with two cross-neutralizing antibodies CV38-142 and COVA1-16 Fabs isolated from COVID-19 patients 提交 2021-02-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；10% (w/v) polyethylene glycol 6000, 0.1 M citric acid pH 4.0
分辨率 1.94 Å R-free 0.201
7LO4 SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain with a G485R mutation in complex with human ACE2 提交 2021-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–530（198 aa）
突变：G485R NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；Protein: 5 mg/mL in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl Reservoir: 0.1 M HEPES pH 7.0, 16% w/v PEG 8000 Cryobuffer: reservoir solution + 20% ethylene glycol
分辨率 2.46 Å R-free 0.251
7LOP Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies CV05-163 and CR3022 提交 2021-02-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Z 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；293.15 K；0.1 M sodium citrate - citric acid buffer at pH 4.8 and 19% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 2.25 Å R-free 0.268
7LOP Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies CV05-163 and CR3022 提交 2021-02-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；293.15 K；0.1 M sodium citrate - citric acid buffer at pH 4.8 and 19% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 2.25 Å R-free 0.268
7LQ7 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies CV503 and COVA1-16 提交 2021-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 333–530（198 aa）
链 B 333–530（198 aa）
链 E 333–530（198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate pH 4.2, 1 M lithium chloride, and 9% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.233
7LQV Cryo-EM structure of NTD-directed neutralizing antibody 4-8 Fab in complex with SARS-CoV-2 S2P spike 提交 2021-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
7LQW Cryo-EM structure of NTD-directed neutralizing antibody 2-17 Fab in complex with SARS-CoV-2 S2P spike 提交 2021-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.47 Å
7LRS Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with neutralizing antibody A23-58.1 that targets the receptor-binding domain 提交 2021-02-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 332–527（196 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 332-527)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；100 mM HEPES, pH 7.4, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 1.5 seconds before plugging.
分辨率 3.89 Å
7LRT Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with neutralizing antibody A23-58.1 that targets the receptor-binding domain 提交 2021-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plugging.
分辨率 3.54 Å
7LS9 Cryo-EM structure of neutralizing antibody 1-57 in complex with prefusion SARS-CoV-2 spike glycoprotein 提交 2021-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
7LSS Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein bound to Fab 2-7 提交 2021-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.72 Å
7LWI Mink Cluster 5-associated SARS-CoV-2 spike protein (S-GSAS-D614G-delFV) in the 3-RBD down conformation 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
7LWJ Mink Cluster 5-associated SARS-CoV-2 spike protein (S-GSAS-D614G-delFV) in the 3-RBD down conformation 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
7LWK Mink Cluster 5-associated SARS-CoV-2 spike protein (S-GSAS-D614G-delFV) in the 3-RBD down conformation 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
7LWL Mink Cluster 5-associated SARS-CoV-2 spike protein (S-GSAS-D614G-delFV) in the 3-RBD down conformation 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.84 Å
7LWM Mink Cluster 5-associated SARS-CoV-2 spike protein (S-GSAS-D614G-delFV) in the 1-RBD up conformation 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
7LWN Mink Cluster 5-associated SARS-CoV-2 spike protein (S-GSAS-D614G-delFV) in the 1-RBD up conformation 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
7LWO Mink Cluster 5-associated SARS-CoV-2 spike protein (S-GSAS-D614G-delFV) in the 1-RBD up conformation 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
7LWP Mink Cluster 5-associated SARS-CoV-2 spike protein (S-GSAS-D614G-delFV) in the 2-RBD up conformation 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
7LWQ Mink Cluster 5-associated SARS-CoV-2 spike protein(S-GSAS-D614G-delFV) missing the S1 subunit and SD2 subdomain of one protomer 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), Y453F, D614G, I692V, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
7LWS UK (B.1.1.7) SARS-CoV-2 S-GSAS-D614G variant spike protein in the 3-RBD-down conformation 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：del(H69-V70), del(Y144), N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), del(Y144), N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), del(Y144), N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
7LWT UK (B.1.1.7) SARS-CoV-2 spike protein variant (S-GSAS-B.1.1.7) in the 1-RBD-up conformation 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：del(H69-V70), del(Y144), N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), del(Y144), N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), del(Y144), N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.19 Å
7LWU UK (B.1.1.7) SARS-CoV-2 spike protein variant (S-GSAS-B.1.1.7) in the 1-RBD-up conformation 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：del(H69-V70), del(Y144), N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), del(Y144), N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), del(Y144), N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
7LWV UK (B.1.1.7) SARS-CoV-2 spike protein variant (S-GSAS-B.1.1.7) in the 1-RBD-up conformation 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：del(H69-V70), del(Y144), N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), del(Y144), N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H, R682G, R683S, R685S 突变：del(H69-V70), del(Y144), N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
7LWW Triple mutant (K417N-E484K-N501Y) SARS-CoV-2 spike protein in the 1-RBD-up conformation (S-GSAS-D614G-K417N-E484K-N501Y) 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y, K417N, E484K, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, D614G, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7LX5 The SARS-CoV-2 spike protein receptor binding domain bound to neutralizing nanobodies WNb 2 and WNb 10 提交 2021-03-03 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
7LXW SARS-CoV-2 S/S2M11/S2X333 Local Refinement 提交 2021-03-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7LXX SARS-CoV-2 S/S2M11/S2L28 Local Refinement 提交 2021-03-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7LXY SARS-CoV-2 S/S2M11/S2X333 Global Refinement 提交 2021-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 J 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.20 Å
7LXZ SARS-CoV-2 S/S2M11/S2L28 Global Refinement 提交 2021-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 K 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7LY0 SARS-CoV-2 S/S2M11/S2M28 Local Refinement 提交 2021-03-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7LY2 SARS-CoV-2 S/S2M11/S2M28 Global Refinement 提交 2021-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 J 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7LY3 Crystal structure of SARS-CoV-2 S NTD bound to S2M28 Fab 提交 2021-03-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–307（294 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 XYL Xylitol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.75；293 K；10 mM HEPES-HCl pH 8.0 750 mM NaCl 0.1 M Ammonium Sulfate 0.05 M Sodium Citrate pH 4.75 12.5 % PEG4000
分辨率 3.00 Å R-free 0.234
7LY3 Crystal structure of SARS-CoV-2 S NTD bound to S2M28 Fab 提交 2021-03-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 14–307（294 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 XYL Xylitol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.75；293 K；10 mM HEPES-HCl pH 8.0 750 mM NaCl 0.1 M Ammonium Sulfate 0.05 M Sodium Citrate pH 4.75 12.5 % PEG4000
分辨率 3.00 Å R-free 0.234
7LYK South African (B.1.351) SARS-CoV-2 spike protein variant (S-GSAS-B.1.351) in the 2-RBD-up conformation 提交 2021-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
7LYL South African (B.1.351) SARS-CoV-2 spike protein variant (S-GSAS-B.1.351) in the RBD-down conformation 提交 2021-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.72 Å
7LYM South African (B.1.351) SARS-CoV-2 spike protein variant (S-GSAS-B.1.351) in the RBD-down conformation 提交 2021-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.57 Å
7LYN South African (B.1.351) SARS-CoV-2 spike protein variant (S-GSAS-B.1.351) in the 1-RBD-up conformation 提交 2021-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 38 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
7LYO South African (B.1.351) SARS-CoV-2 spike protein variant (S-GSAS-B.1.351) in the 1-RBD-up conformation 提交 2021-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 40 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
7LYP South African (B.1.351) SARS-CoV-2 spike protein variant (S-GSAS-B.1.351) in the 1-RBD-up conformation 提交 2021-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.05 Å
7LYQ South African (B.1.351) SARS-CoV-2 spike protein variant (S-GSAS-B.1.351) in the 1-RBD-up conformation 提交 2021-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S 突变：N501Y, K417N, E484K, L18F, D80A, D215G, R246I, A701V, D614G, R682G, R683S, R685S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 38 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.34 Å
7M0J SARS-CoV-2 u1S2q All Down RBD State Spike Protein Trimer - asymmetric refinement 提交 2021-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1208（1193 aa） 片段：ectodomain (UNP residues 16-1208)
链 B 16–1208（1193 aa） 片段：ectodomain (UNP residues 16-1208)
链 C 16–1208（1193 aa） 片段：ectodomain (UNP residues 16-1208)
突变：A570L, T572I, F855Y, N856I, K986V, V987P, R682G, R683S, R685S 突变：A570L, T572I, F855Y, N856I, K986V, V987P, R682G, R683S, R685S 突变：A570L, T572I, F855Y, N856I, K986V, V987P, R682G, R683S, R685S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
7M3I Structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor binding domain in complex with a neutralizing antibody, CV2-75 Fab 提交 2021-03-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 319–591（273 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Tris, pH 7.5, 0.1M Calcium acetate, 15% PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
7M3I Structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor binding domain in complex with a neutralizing antibody, CV2-75 Fab 提交 2021-03-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–591（273 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Tris, pH 7.5, 0.1M Calcium acetate, 15% PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
7M42 Complex of SARS-CoV-2 receptor binding domain with the Fab fragments of neutralizing antibodies REGN10985 and REGN10989 提交 2021-03-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 319–541（223 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 319-541)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7M53 B6 Fab fragment bound to the SARS-CoV/SARS-CoV-2 spike stem helix peptide 提交 2021-03-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1146–1161（16 aa） 片段：residues 1146-1161 of the spike glycoprotein
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Potassium Chloride and 20% (w/v) PEG3350
分辨率 1.40 Å R-free 0.174
7M6D Structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with neutralizing antibodies BG4-25 and CR3022 提交 2021-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 328–533（206 aa） 片段：Receptor Binding Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；0.05 M citric acid, 0.05 M BIS-TRIS propane pH 5.0, 16% polyethylene glycol 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.259
7M6E Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, BG10-19 提交 2021-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot, 0 blot force
分辨率 3.30 Å
7M6F Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, BG1-22 提交 2021-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot, 0 blot force
分辨率 3.90 Å
7M6G Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, BG7-15 提交 2021-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot, 0 blot force
分辨率 3.70 Å
7M6H Structure of the SARS-CoV-2 S 2P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, BG7-20 提交 2021-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot, 0 blot force
分辨率 4.00 Å
7M6I Structure of the SARS-CoV-2 S 2P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, BG1-24 提交 2021-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot, 0 blot force
分辨率 4.00 Å
7M71 SARS-CoV-2 Spike:5A6 Fab complex I focused refinement 提交 2021-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
突变：R682G,R683S,R685S,K986P,V987P 突变：R682G,R683S,R685S,K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；8-10 seconds, blot force 0
分辨率 2.66 Å
7M7B SARS-CoV-2 Spike:Fab 3D11 complex focused refinement 提交 2021-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：R682G,R683S,R685S,K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；8-10 seconds, blot force 0
分辨率 2.95 Å
7M7W Antibodies to the SARS-CoV-2 receptor-binding domain that maximize breadth and resistance to viral escape 提交 2021-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 S 328–531（204 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 328-531)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；30% Precipitant Mix 2 (Molecular Dimensions; ethylene glycol, PEG8000), 0.1 M Buffer System 3, pH 8.5 (Molecular Dimensions; Tris (base)/BICINE), 0.12 M Monosaccharides Mix (Molecular Dimensions), 0.02 M sodium chloride, 0.01 M MES, pH 6, 3% v/v Jeffamine ED-2003
分辨率 2.65 Å R-free 0.271
7M7W Antibodies to the SARS-CoV-2 receptor-binding domain that maximize breadth and resistance to viral escape 提交 2021-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 328–531（204 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 328-531)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；30% Precipitant Mix 2 (Molecular Dimensions; ethylene glycol, PEG8000), 0.1 M Buffer System 3, pH 8.5 (Molecular Dimensions; Tris (base)/BICINE), 0.12 M Monosaccharides Mix (Molecular Dimensions), 0.02 M sodium chloride, 0.01 M MES, pH 6, 3% v/v Jeffamine ED-2003
分辨率 2.65 Å R-free 0.271
7M8J SARS-CoV-2 S-NTD + Fab CM25 提交 2021-03-29 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–270（257 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；-4 force, 3 s blot
分辨率 3.48 Å
7M8K Cryo-EM structure of Brazil (P.1) SARS-CoV-2 spike glycoprotein variant in the prefusion state (1 RBD up) 提交 2021-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7M8S Crystal Structure of HLA-A*02:01 in complex with KLNDLCFTNV, an 10-mer epitope from SARS-CoV-2 Spike (S386-395) 提交 2021-03-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 386–395（10 aa） 片段：UNP residues 386-395
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.2 Ammonium tantrate, 0.001 Cadmium chloride, 14% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.247
7M8S Crystal Structure of HLA-A*02:01 in complex with KLNDLCFTNV, an 10-mer epitope from SARS-CoV-2 Spike (S386-395) 提交 2021-03-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 386–395（10 aa） 片段：UNP residues 386-395
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.2 Ammonium tantrate, 0.001 Cadmium chloride, 14% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.247
7M8T Crystal Structure of HLA-A*11:01 in complex with NSASFSTFK, an 9-mer epitope from SARS-CoV-2 spike (S370-378) 提交 2021-03-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 370–378（9 aa） 片段：UNP residues 370-378
未记录 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；2M Ammonium Sulfate, 0.1M Calcium cacodylate pH 6.5, 0.2M sodium chloride
分辨率 1.50 Å R-free 0.219
7M8U Crystal Structure of HLA-B*35:01 in complex with IPFAMQMAY, an 9-mer epitope from SARS-CoV-2 spike (S896-904) 提交 2021-03-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 896–904（9 aa） 片段：UNP residues 896-904
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 sodium fluoride, 18% PEG 3350
分辨率 1.45 Å R-free 0.229
7MDW CryoEM structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with nanobodies Nb21 and Nb105 提交 2021-04-06 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7ME7 CryoEM structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with nanobodies Nb17 and Nb105 提交 2021-04-06 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
7MEJ CryoEM structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with nanobodies Nb21 and Nb36 提交 2021-04-06 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
7MF1 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody 47D1 提交 2021-04-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；8.5% isopropanol, 17% PEG 4000, 0.085 M HEPES pH 7.5, 15% glycerol
分辨率 2.09 Å R-free 0.250
7MFU Crystal structure of synthetic nanobody (Sb14+Sb68) complexes with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2021-04-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 332–528（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 8000, 0.1M Hepes pH 7.5
分辨率 1.70 Å R-free 0.215
7MFU Crystal structure of synthetic nanobody (Sb14+Sb68) complexes with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2021-04-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 332–528（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 8000, 0.1M Hepes pH 7.5
分辨率 1.70 Å R-free 0.215
7MJG Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 N501Y mutant spike protein ectodomain 提交 2021-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y 突变：N501Y 突变：N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7MJH Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 N501Y mutant spike protein ectodomain bound to VH ab8 提交 2021-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y 突变：N501Y 突变：N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.66 Å
7MJI Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 N501Y mutant spike protein ectodomain bound to VH ab8 (focused refinement of RBD and VH ab8) 提交 2021-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7MJJ Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 N501Y mutant spike protein ectodomain bound to Fab ab1 (class 1) 提交 2021-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y 突变：N501Y 突变：N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
7MJK Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 N501Y mutant spike protein ectodomain bound to Fab ab1 (class 2) 提交 2021-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y 突变：N501Y 突变：N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
7MJL Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 N501Y mutant spike protein ectodomain bound to Fab ab1 (focused refinement of RBD and Fab ab1) 提交 2021-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
7MJM Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 N501Y mutant spike protein ectodomain bound to human ACE2 ectodomain 提交 2021-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y 突变：N501Y 突变：N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
7MJN Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 N501Y mutant spike protein ectodomain bound to human ACE2 ectodomain (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2021-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
7MKL SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing Fab SARS2-38 (three down conformation) 提交 2021-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 27–1147（1121 aa）
链 B 27–1147（1121 aa）
链 C 27–1147（1121 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7MKM SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with neutralizing Fab SARS2-38 (local refinement) 提交 2021-04-24 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–520（188 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 333-520)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
7MLZ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with neutralizing antibody B1-182.1 that targets the receptor-binding domain 提交 2021-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 331-527
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；100 mM HEPES, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plugging.
分辨率 3.71 Å
7MM0 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with neutralizing antibody B1-182.1 that targets the receptor-binding domain 提交 2021-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；100 mM HEPES, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plugging.
分辨率 3.15 Å
7MMO LY-CoV1404 neutralizing antibody against SARS-CoV-2 提交 2021-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 329–527（199 aa） 片段：receptor-binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；200mM Trimethylamine N-oxide, 20% PEG MME 2K, 100mM Tris HCl pH 6.0-7.0
分辨率 2.43 Å R-free 0.253
7MMO LY-CoV1404 neutralizing antibody against SARS-CoV-2 提交 2021-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 329–527（199 aa） 片段：receptor-binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；200mM Trimethylamine N-oxide, 20% PEG MME 2K, 100mM Tris HCl pH 6.0-7.0
分辨率 2.43 Å R-free 0.253
7MSQ Complex between the Fab arm of AB-3467 and the SARS-CoV-2 receptor binding domain (RBD) 提交 2021-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–528（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 SCN THIOCYANATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；Protein complex (5 mg/mL in 25 mM Tris (pH 8.0), 200 mM NaCl) was mixed with an equal volume (2 uL) of well solution comprising 100 mM BisTrisPropane (pH 6.9), 800 mM KSCN, 10% (v/v) glycerol, and 18%(m/v) PEG8000
分辨率 2.29 Å R-free 0.245
7MSQ Complex between the Fab arm of AB-3467 and the SARS-CoV-2 receptor binding domain (RBD) 提交 2021-05-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 333–528（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 CL CHLORIDE ION × 5 SCN THIOCYANATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；Protein complex (5 mg/mL in 25 mM Tris (pH 8.0), 200 mM NaCl) was mixed with an equal volume (2 uL) of well solution comprising 100 mM BisTrisPropane (pH 6.9), 800 mM KSCN, 10% (v/v) glycerol, and 18%(m/v) PEG8000
分辨率 2.29 Å R-free 0.245
7MTC Structure of freshly purified SARS-CoV-2 S2P spike at pH 7.4 提交 2021-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7MTD Structure of aged SARS-CoV-2 S2P spike at pH 7.4 提交 2021-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7MTE Structure of SARS-CoV-2 S2P spike at pH 7.4 refolded by low-pH treatment 提交 2021-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7MW2 Structure of the SARS-CoV-2 Spike trimer with all RBDs down in complex with the Fab fragment of human neutralizing antibody clone 6 提交 2021-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
7MW3 Structure of the SARS-CoV-2 Spike trimer with two RBDs down in complex with the Fab fragment of human neutralizing antibody clone 6 提交 2021-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
7MW4 Structure of the SARS-CoV-2 Spike trimer with one RBD down in complex with the Fab fragment of human neutralizing antibody clone 6 提交 2021-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
7MW5 Structure of the SARS-CoV-2 Spike trimer with one RBD down in complex with the Fab fragment of human neutralizing antibody clone 2 提交 2021-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
7MW6 Structure of the SARS-CoV-2 Spike trimer with three RBDs up in complex with the Fab fragment of human neutralizing antibody clone 2 提交 2021-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
7MXP Cryo-EM structure of NTD-directed neutralizing antibody LP5 Fab in complex with SARS-CoV-2 S2P spike 提交 2021-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.46 Å
7MY2 CryoEM structure of neutralizing nanobody Nb30 in complex with SARS-CoV2 spike 提交 2021-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；5mM Hepes pH7.4, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
7MY3 CryoEM structure of neutralizing nanobody Nb12 in complex with SARS-CoV2 spike 提交 2021-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；5mM Hepes pH7.4, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7MY8 Fusion Peptide of SARS-CoV-2 Spike Rearranges into a Wedge Inserted in Bilayered Micelles 提交 2021-05-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 816–857（42 aa） 片段：residues 816-857
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5；305 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 0
NMR样品组成 0.4 mM [U-99% 15N] Spike Fusion Peptide, Bicelles, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Spike Fusion Peptide, Bicelles, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
7MZF SARS-CoV-2 receptor binding domain bound to Fab PDI 37 提交 2021-05-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M ammonium sulphate, 20% PEG3350, 0.1 M Tris chloride pH 8.5
分辨率 2.49 Å R-free 0.227
7MZG SARS-CoV-2 receptor binding domain bound to Fab PDI 42 提交 2021-05-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；293 K；10% PEG8000, 0.2 M NaCl, 0.1 M sodium dihydrogen-dipotassium hydrogen phosphate pH 6.2
分辨率 2.00 Å R-free 0.236
7MZH SARS-CoV-2 receptor binding domain bound to Fab WCSL 119 提交 2021-05-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 331–527（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；14% PEG3350, 0.2 M potassium thiocyanate
分辨率 2.10 Å R-free 0.265
7MZH SARS-CoV-2 receptor binding domain bound to Fab WCSL 119 提交 2021-05-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；14% PEG3350, 0.2 M potassium thiocyanate
分辨率 2.10 Å R-free 0.265
7MZI SARS-CoV-2 receptor binding domain bound to Fab WCSL 129 提交 2021-05-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 GOL GLYCEROL × 14 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；18% PEG3350, 0.1 M tri sodium citrate pH 5.5
分辨率 1.85 Å R-free 0.207
7MZJ SARS-CoV-2 receptor binding domain bound to Fab WCSL 129 and Fab PDI 93 提交 2021-05-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 331–527（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；23% PEG3350, 0.1 M sodium acetate pH 4.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.268
7MZJ SARS-CoV-2 receptor binding domain bound to Fab WCSL 129 and Fab PDI 93 提交 2021-05-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 331–527（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；23% PEG3350, 0.1 M sodium acetate pH 4.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.268
7MZK SARS-CoV-2 receptor binding domain bound to Fab WCSL 129 and Fab PDI 96 提交 2021-05-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 331–527（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Tri-sodium citrate pH 5.5, 10% PEG8000
分辨率 2.25 Å R-free 0.235
7MZK SARS-CoV-2 receptor binding domain bound to Fab WCSL 129 and Fab PDI 96 提交 2021-05-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 331–527（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Tri-sodium citrate pH 5.5, 10% PEG8000
分辨率 2.25 Å R-free 0.235
7MZL SARS-CoV-2 receptor binding domain bound to Fab PDI 210 提交 2021-05-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；15% PEG6000, 0.1% (w/v) n-Octyl-b-D-glucoside
分辨率 3.70 Å R-free 0.256
7MZM SARS-CoV-2 receptor binding domain bound to Fab PDI 215 提交 2021-05-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；in 12% isopropanol, 12% PEG4000, 0.1 M tri sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.30 Å R-free 0.257
7MZN SARS-CoV-2 receptor binding domain bound to Fab PDI 231 提交 2021-05-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；18% PEG3350, 10% N,N-Dimethyldodecylamine N-oxide (LDAO), 0.2 M sodium sulphate
分辨率 3.10 Å R-free 0.259
7N0G CryoEm structure of SARS-CoV-2 spike protein (S-6P, 1-up) in complex with sybodies (Sb45) 提交 2021-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
7N0H CryoEM structure of SARS-CoV-2 spike protein (S-6P, 2-up) in complex with sybodies (Sb45) 提交 2021-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.34 Å
7N1A SARS-CoV-2 YLQ peptide binds to HLA-A2 提交 2021-05-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 269–277（9 aa） 片段：epitope YLQPRTFLL (UNP residues 269-277)
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.2M Potassium thiocyanate (pH 7.0), 22% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.06 Å R-free 0.241
7N1A SARS-CoV-2 YLQ peptide binds to HLA-A2 提交 2021-05-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 269–277（9 aa） 片段：epitope YLQPRTFLL (UNP residues 269-277)
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.2M Potassium thiocyanate (pH 7.0), 22% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.06 Å R-free 0.241
7N1B SARS-CoV-2 RLQ peptide binds to HLA-A2 提交 2021-05-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1000–1008（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M MES (pH 6.5), 20% (w/v) PEG 8000 by micro-seeding
分辨率 2.81 Å R-free 0.269
7N1B SARS-CoV-2 RLQ peptide binds to HLA-A2 提交 2021-05-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1000–1008（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M MES (pH 6.5), 20% (w/v) PEG 8000 by micro-seeding
分辨率 2.81 Å R-free 0.269
7N1E SARS-CoV-2 RLQ peptide-specific TCR pRLQ3 binds to RLQ-HLA-A2 提交 2021-05-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1000–1008（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M MES (pH 6.0), 12% (w/v) PEG 4000
分辨率 2.30 Å R-free 0.258
7N1F SARS-CoV-2 YLQ peptide-specific TCR pYLQ7 binds to YLQ-HLA-A2 提交 2021-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 269–277（9 aa） 片段：epitope YLQPRTFLL (UNP residues 269-277)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；295 K；in 0.1M Ammonium sulfate, 0.3M Sodium formate, 0.1M Sodium acetate (pH 5.0), 3% (w/v) Gama-PGA (Na+ form, LM), 3% (w/v) PEG 20000
分辨率 2.39 Å R-free 0.236
7N1Q Structural basis for enhanced infectivity and immune evasion of SARS-CoV-2 variants 提交 2021-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å R-free 0.425
7N1T Structural basis for enhanced infectivity and immune evasion of SARS-CoV-2 variants 提交 2021-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å R-free 0.425
7N1U Structural basis for enhanced infectivity and immune evasion of SARS-CoV-2 variants 提交 2021-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
7N1V Structural basis for enhanced infectivity and immune evasion of SARS-CoV-2 variants 提交 2021-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.21 Å R-free 0.437
7N1W Structural basis for enhanced infectivity and immune evasion of SARS-CoV-2 variants 提交 2021-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
7N1X Structural basis for enhanced infectivity and immune evasion of SARS-CoV-2 variants 提交 2021-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7N1Y Structural basis for enhanced infectivity and immune evasion of SARS-CoV-2 variants 提交 2021-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7N3I Crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment C098 提交 2021-06-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 328–533（206 aa） 片段：Receptor Binding Domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.05 M citric acid, 0.05M BIS-TRIS propane pH 5.0, 14% PEG 3350
分辨率 2.03 Å R-free 0.208
7N4I Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing human antibody WRAIR-2057. 提交 2021-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain (RBD)
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；8% v/v Tacsimate pH 5.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.28 Å R-free 0.238
7N4J Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing human antibody WRAIR-2173. 提交 2021-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.09M NPS (Sodium nitrate, Sodium phosphate dibasic, Ammonium sulfate), 0.1M buffer system 3 (Tris base and BICINE, pH 8.5), 50% precipitant mix 4 (25% v/v MPD; 25% PEG 1000; 25% w/v PEG 3350)
分辨率 2.21 Å R-free 0.207
7N4L Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing human antibody WRAIR-2125. 提交 2021-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.12 M alcohol mixture (1,6-Hexanediol; 1-Butanol; 1,2-Propanediol; 2-Propanol; 1,4-Butanediol; 1,3-Propanediol), 0.1M buffer system 3 (Tris base and BICINE, pH 8.5), 50% precipitant mix 4 (25% v/v MPD; 25% PEG 1000; 25% w/v PEG 3350) and 0.1 M Manganese(II) chloride tetrahydrate
分辨率 3.60 Å R-free 0.329
7N4M Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing human antibody WRAIR-2151. 提交 2021-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6, 2.0 M Ammonium sulfate
分辨率 3.79 Å R-free 0.317
7N5H Cryo-EM structure of broadly neutralizing antibody 2-36 in complex with prefusion SARS-CoV-2 spike glycoprotein 提交 2021-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot time 3s wait time 30s blot force 0
分辨率 3.24 Å
7N62 SARS-CoV-2 Spike (2P) in complex with C12C9 Fab (NTD local reconstruction) 提交 2021-06-07 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7N64 SARS-CoV-2 Spike (2P) in complex with G32R7 Fab (RBD and NTD local reconstruction) 提交 2021-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7N6D HLA peptide complex 提交 2021-06-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 269–277（9 aa） 片段：epitope YLQPRTFLL (UNP residues 269-277)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；20% PEG3350, 0.2 M sodium thiocyanate
分辨率 2.30 Å R-free 0.247
7N6D HLA peptide complex 提交 2021-06-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 269–277（9 aa） 片段：epitope YLQPRTFLL (UNP residues 269-277)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；20% PEG3350, 0.2 M sodium thiocyanate
分辨率 2.30 Å R-free 0.247
7N6D HLA peptide complex 提交 2021-06-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 269–277（9 aa） 片段：epitope YLQPRTFLL (UNP residues 269-277)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；20% PEG3350, 0.2 M sodium thiocyanate
分辨率 2.30 Å R-free 0.247
7N6D HLA peptide complex 提交 2021-06-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 O 269–277（9 aa） 片段：epitope YLQPRTFLL (UNP residues 269-277)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；20% PEG3350, 0.2 M sodium thiocyanate
分辨率 2.30 Å R-free 0.247
7N6E TCR peptide HLA-A2 complex 提交 2021-06-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 269–277（9 aa） 片段：epitope YLQPRTFLL (UNP residues 269-277)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；20% PEG3350, 0.2 M sodium thiocyanate, 100 mM Tris-Cl
分辨率 3.20 Å R-free 0.294
7N6E TCR peptide HLA-A2 complex 提交 2021-06-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 269–277（9 aa） 片段：epitope YLQPRTFLL (UNP residues 269-277)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；20% PEG3350, 0.2 M sodium thiocyanate, 100 mM Tris-Cl
分辨率 3.20 Å R-free 0.294
7N8H SARS-CoV-2 S (B.1.429 / epsilon variant) + S2M11 + S2L20 Global Refinement 提交 2021-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 F 1–1208（1208 aa）
链 K 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7N8I SARS-CoV-2 S (B.1.429 / epsilon variant) + S2M11 + S2L20 (Local Refinement of the NTD/S2L20) 提交 2021-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7N9A Potent neutralizing nanobodies resist convergent circulating variants of SARS-CoV-2 by targeting novel and conserved epitopes-CovS RBD with NB21 提交 2021-06-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 334–528（195 aa） 片段：Receptor Binding Domain
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7N9B Potent neutralizing nanobodies resist convergent circulating variants of SARS-CoV-2 by targeting novel and conserved epitopes-CovS with NB21 提交 2021-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7N9C Potent neutralizing nanobodies resist convergent circulating variants of SARS-CoV-2 by targeting novel and conserved epitopes-CovS with NB95 提交 2021-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
7N9E Potent neutralizing nanobodies resist convergent circulating variants of SARS-CoV-2 by targeting novel and conserved epitopes-CovS with NB34 提交 2021-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
7N9T CryoEM structure of SARS-CoV-2 Spike in complex with Nb17 提交 2021-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 25–1147（1123 aa）
链 B 25–1147（1123 aa）
链 C 25–1147（1123 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
7NAB Crystal structure of human neutralizing mAb CV3-25 binding to SARS-CoV-2 S MPER peptide 1140-1165 提交 2021-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1140–1165（26 aa） 片段：SARS-CoV-2 S2 peptide (1140-1165)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NA SODIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；10mg/mL CV3-25 Fab mixed with 10-fold (molar-ratio) of S2 peptide (1140-1165), 0.1M Na citrate pH 5.6, 20% PEG4000, 20% isopropanol
分辨率 2.15 Å R-free 0.238
7NAB Crystal structure of human neutralizing mAb CV3-25 binding to SARS-CoV-2 S MPER peptide 1140-1165 提交 2021-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1140–1165（26 aa） 片段：SARS-CoV-2 S2 peptide (1140-1165)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NA SODIUM ION × 6 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；10mg/mL CV3-25 Fab mixed with 10-fold (molar-ratio) of S2 peptide (1140-1165), 0.1M Na citrate pH 5.6, 20% PEG4000, 20% isopropanol
分辨率 2.15 Å R-free 0.238
7ND3 EM structure of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-40 Fab 提交 2021-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7ND4 EM structure of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-88 Fab 提交 2021-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7ND5 EM structure of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-150 Fab 提交 2021-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7ND6 EM structure of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-40 Fab 提交 2021-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
7ND7 EM structure of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-316 Fab 提交 2021-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7ND8 EM structure of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-384 Fab 提交 2021-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7ND9 EM structure of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein (one RBD up) in complex with COVOX-253H55L Fab 提交 2021-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7NDA EM structure of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein (all RBD down) in complex with COVOX-253H55L Fab 提交 2021-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7NDB EM structure of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-253H165L Fab 提交 2021-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
7NDC EM structure of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein (all RBD down) in complex with COVOX-159 提交 2021-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7NDD EM structure of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein (one RBD up) in complex with COVOX-159 提交 2021-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7NEH Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-269 Fab 提交 2021-02-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19 NO3 NITRATE ION × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；0.09 M NPS, 0.1 M sodium HEPES and MOPS, 30% EDO_P8K
分辨率 1.77 Å R-free 0.198
7NKT RBD domain of SARS-CoV2 in complex with neutralizing nanobody NM1226 提交 2021-02-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 AAA 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；50mM K2HPO4, 20% (w/v) PEG 8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.224
7NLL SARS-CoV-2 Spike RBD (dimer) in complex with two Fu2 nanobodies 提交 2021-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 319–540（222 aa）
链 D 319–540（222 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7NP1 Crystal Structure of the SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain in Complex with Antibody ION-360 提交 2021-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；16% PEG3350 0.2 M ammonium citrate tribasic
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
7NP1 Crystal Structure of the SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain in Complex with Antibody ION-360 提交 2021-02-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；16% PEG3350 0.2 M ammonium citrate tribasic
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
7NP1 Crystal Structure of the SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain in Complex with Antibody ION-360 提交 2021-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；16% PEG3350 0.2 M ammonium citrate tribasic
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
7NP1 Crystal Structure of the SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain in Complex with Antibody ION-360 提交 2021-02-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；16% PEG3350 0.2 M ammonium citrate tribasic
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
7NS6 SARS-CoV-2 Spike (dimers) in complex with six Fu2 nanobodies 提交 2021-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 I 1–1208（1208 aa）
链 J 1–1208（1208 aa）
链 K 1–1208（1208 aa）
链 L 1–1208（1208 aa）
链 M 1–1208（1208 aa）
链 N 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 46 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
7NT9 Trimeric SARS-CoV-2 spike ectodomain in complex with biliverdin (closed conformation) 提交 2021-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 BLA BILIVERDINE IX ALPHA × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；150 mM NaCl, 1 mM ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA), 25 mM Tris-HCl, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
7NTA Trimeric SARS-CoV-2 spike ectodomain in complex with biliverdin (one RBD erect) 提交 2021-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 BLA BILIVERDINE IX ALPHA × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；150 mM NaCl, 1 mM ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA), 25 mM Tris-HCl, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7NTC Trimeric SARS-CoV-2 spike ectodomain bound to P008_056 Fab 提交 2021-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 BLA BILIVERDINE IX ALPHA × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；150 mM NaCl, 1 mM ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA), 25 mM Tris-HCl, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7NX6 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-222 and EY6A Fabs 提交 2021-03-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 7 SO4 SULFATE ION × 10 GOL GLYCEROL × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Citric acid pH 3.5, 18% w/v PEG 6,000
分辨率 2.25 Å R-free 0.248
7NX7 Crystal structure of the K417N mutant receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-222 and EY6A Fabs 提交 2021-03-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 13 CL CHLORIDE ION × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Citric acid pH 3.5, 18% w/v PEG 6,000.
分辨率 2.30 Å R-free 0.239
7NX8 Crystal structure of the K417T mutant receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-222 and EY6A Fabs 提交 2021-03-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 SO4 SULFATE ION × 12 CIT CITRIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Citric acid pH 3.5, 18% w/v PEG 6,000.
分辨率 1.95 Å R-free 0.246
7NX9 Crystal structure of the N501Y mutant receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-222 and EY6A Fabs 提交 2021-03-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 10 GOL GLYCEROL × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Citric acid pH 3.5, 18% w/v PEG 6,000.
分辨率 2.40 Å R-free 0.229
7NXA Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 B.1.351 variant Spike glycoprotein in complex with COVOX-222 and EY6A Fabs 提交 2021-03-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 19 GOL GLYCEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Citric acid pH 3.5, 18% w/v PEG 6,000.
分辨率 2.50 Å R-free 0.253
7NXB Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 P.1 variant Spike glycoprotein in complex with COVOX-222 and EY6A Fabs 提交 2021-03-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 15 GOL GLYCEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Citric acid pH 3.5, 18% w/v PEG 6,000
分辨率 2.67 Å R-free 0.246
7NXC Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 P.1 variant Spike glycoprotein in complex with ACE2 提交 2021-03-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–528（196 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；294 K；0.1 M Imidazole pH 7.0 and 20% w/v Polyethylene glycol 6,000
分辨率 3.14 Å R-free 0.278
7OAN Nanobody C5 bound to Spike 提交 2021-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；Standard buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7OAO Nanobody C5 bound to RBD 提交 2021-04-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 EEE 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2 M Sodium Acetate, 0.1 M Sodium Cacodylate pH 6.5, 30 % w/v PEG 8000
分辨率 1.50 Å R-free 0.186
7OAP Nanobody H3 AND C1 bound to RBD 提交 2021-04-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 EEE 331–532（202 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CIT CITRIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4, 20 % Peg 6000
分辨率 1.90 Å R-free 0.204
7OAQ Nanobody H3 AND C1 bound to RBD with Kent mutation 提交 2021-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 EEE 330–532（203 aa）
突变：N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CIT CITRIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4, 20 % Peg 6000
分辨率 1.55 Å R-free 0.178
7OAU Nanobody C5 bound to Kent variant RBD (N501Y) 提交 2021-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 AAA 330–532（203 aa）
突变：N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium fluoride and 20 % Peg 3350
分辨率 1.65 Å R-free 0.199
7OAU Nanobody C5 bound to Kent variant RBD (N501Y) 提交 2021-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 EEE 330–532（203 aa）
突变：N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium fluoride and 20 % Peg 3350
分辨率 1.65 Å R-free 0.199
7OAY Nanobody F2 bound to RBD 提交 2021-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 AAA 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M SPG, pH 8, 25 % Peg 1500,
分辨率 2.34 Å R-free 0.228
7OAY Nanobody F2 bound to RBD 提交 2021-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 CCC 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M SPG, pH 8, 25 % Peg 1500,
分辨率 2.34 Å R-free 0.228
7OAY Nanobody F2 bound to RBD 提交 2021-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 EEE 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M SPG, pH 8, 25 % Peg 1500,
分辨率 2.34 Å R-free 0.228
7OAY Nanobody F2 bound to RBD 提交 2021-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 GGG 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M SPG, pH 8, 25 % Peg 1500,
分辨率 2.34 Å R-free 0.228
7OAY Nanobody F2 bound to RBD 提交 2021-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 III 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M SPG, pH 8, 25 % Peg 1500,
分辨率 2.34 Å R-free 0.228
7OAY Nanobody F2 bound to RBD 提交 2021-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 KKK 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M SPG, pH 8, 25 % Peg 1500,
分辨率 2.34 Å R-free 0.228
7OD3 SARS CoV-2 Spike protein, Bristol UK Deletion variant, Closed conformation, C3 symmetry 提交 2021-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 EIC LINOLEIC ACID × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7ODL SARS CoV-2 Spike protein, Bristol UK Deletion variant, Closed conformation, C1 symmetry 提交 2021-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 EIC LINOLEIC ACID × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.03 Å
7OLZ Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD with neutralizing-VHHs Re5D06 and Re9F06 提交 2021-05-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–527（195 aa）
未记录 DMX 3-[BENZYL(DIMETHYL)AMMONIO]PROPANE-1-SULFONATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M MOPS pH 7.5, 2.07 M ammonium sulfate, 0.1 M NDSB-256
分辨率 1.75 Å R-free 0.209
7OR9 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-222 and COVOX-278 Fabs 提交 2021-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 4 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M amino acids (Glu, Ala, Gly, Lys, Ser), 0.1 M MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG 20000 and 20% (v/v) PEG MME 550.
分辨率 2.34 Å R-free 0.230
7ORA Crystal structure of the T478K mutant receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-45 and COVOX-253 Fabs 提交 2021-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 333–528（196 aa）
突变：T478K GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BICINE pH 8.5 and 20% (w/v) PEG 10,000
分辨率 2.60 Å R-free 0.245
7ORA Crystal structure of the T478K mutant receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-45 and COVOX-253 Fabs 提交 2021-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 333–528（196 aa）
突变：T478K GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BICINE pH 8.5 and 20% (w/v) PEG 10,000
分辨率 2.60 Å R-free 0.245
7ORB Crystal structure of the L452R mutant receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-75 and COVOX-253 Fabs 提交 2021-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 333–528（196 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 9 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CL CHLORIDE ION × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5 and 16% (w/v) PEG 10000
分辨率 2.50 Å R-free 0.251
7ORB Crystal structure of the L452R mutant receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with COVOX-75 and COVOX-253 Fabs 提交 2021-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 X 333–528（196 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 CL CHLORIDE ION × 3 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5 and 16% (w/v) PEG 10000
分辨率 2.50 Å R-free 0.251
7OWX Structure of coiled-coil tetramer from SARS-CoV-2 spike stalk region 提交 2021-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1177–1203（27 aa）
链 B 1177–1203（27 aa）
链 C 1177–1203（27 aa）
链 D 1177–1203（27 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.002 M zinc chloride, 0.1 M Tris pH 8, 20 % w/v PEG 6000
分辨率 1.93 Å R-free 0.233
7P19 Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD Q498Y complexed with human ACE2 提交 2021-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 334–541（208 aa）
突变：Q498Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 M sodium phosphate pH 6.5, 12% w/v PEG 8000
分辨率 3.24 Å R-free 0.288
7P19 Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD Q498Y complexed with human ACE2 提交 2021-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 334–541（208 aa）
突变：Q498Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 M sodium phosphate pH 6.5, 12% w/v PEG 8000
分辨率 3.24 Å R-free 0.288
7P3D MHC I A02 Allele presenting YLQPRTFLL 提交 2021-07-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 269–277（9 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M sodium nitrate, 0.1 M Bis Tris propane pH 7.5, and 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.67 Å R-free 0.231
7P5G NMR structure of a peptide deriving from SARS-CoV-2 S RBD 482-506 fragment in HFIP/H2O 提交 2021-07-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 482–506（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 2.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成 2.5 mM SMIMIC-OR, 50 % v/v Hexafluoroisopropanol, 40 % v/v H2O, 10 % v/v [U-100% 2H] D2O, 50% hexafluoroisopropanol/40% H2O/10% D2O | 50% hexafluoroisopropanol/40% H2O/10% D2O
分辨率未提供
7P5Q NMR structure of a peptide deriving from SARS-CoV-2 Lineage B.1.1.7 S RBD 482-506 fragment in HFIP/H2O 提交 2021-07-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 482–506（25 aa）
突变：N501Y 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 2.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成 2.5 mM SMIMIC-a, 50 % v/v Hexafluoroisopropanol, 40 % v/v H2O, 10 % v/v [U-100% 2H] D2O, 50% hexafluoroisopropanol/40% H2O/10% D2O | 50% hexafluoroisopropanol/40% H2O/10% D2O
分辨率未提供
7P5S NMR structure of a peptide deriving from SARS-CoV-2 Lineages P.1 and B.1.351 S RBD 482-506 fragment in HFIP/H2O 提交 2021-07-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 482–506（25 aa）
突变：E484K, N501Y 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 2.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成 2.5 mM SMIMIC-bg, 50 % v/v Hexafluoroisopropanol, 40 % v/v H2O, 10 % v/v [U-100% 2H] D2O, 50% hexafluoroisopropanol/40% H2O/10% D2O | 50% hexafluoroisopropanol/40% H2O/10% D2O
分辨率未提供
7P77 SARS-CoV-2 spike protein in complex with sybody#15 and sybody#68 in a 3up conformation 提交 2021-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；2 mM Tris-HCl pH 8.0, 200 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.98 Å
7P78 SARS-CoV-2 spike protein in complex with sybody#15 and sybody#68 in a 1up/1up-out/1down conformation 提交 2021-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；2 mM Tris-HCl pH 8.0, 200 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.32 Å
7P79 SARS-CoV-2 spike protein in complex with sybodyb#15 in a 1up/1up-out/1down conformation. 提交 2021-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；2 mM Tris-HCl pH 8.0, 200 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.00 Å
7P7A SARS-CoV-2 spike protein in complex with sybody#68 in a 2up/1flexible conformation 提交 2021-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；2 mM Tris-HCl pH 8.0, 200 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.76 Å
7P7B SARS-CoV-2 spike protein in complex with sybody no68 in a 1up/2down conformation 提交 2021-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；2 mM Tris-HCl pH 8.0, 200 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.13 Å
7PBE Emergence of immune escape at dominant SARS-CoV-2 killer T-cell epitope 提交 2021-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 269–277（9 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M ammonium sulphate, 0.1 M Tris, pH 8.5, and 25 % w/v PEG 4000
分辨率 3.00 Å R-free 0.296
7PBE Emergence of immune escape at dominant SARS-CoV-2 killer T-cell epitope 提交 2021-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 269–277（9 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M ammonium sulphate, 0.1 M Tris, pH 8.5, and 25 % w/v PEG 4000
分辨率 3.00 Å R-free 0.296
7PQY Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with FI-3A Fab 提交 2021-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.08 M sodium citrate tribasic and 24% (w/v) PEG 550.
分辨率 3.00 Å R-free 0.245
7PQY Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with FI-3A Fab 提交 2021-09-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.08 M sodium citrate tribasic and 24% (w/v) PEG 550.
分辨率 3.00 Å R-free 0.245
7PQZ Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with FI-3A and FD-11A Fabs 提交 2021-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.9 M sodium formate pH 7.0
分辨率 3.20 Å R-free 0.240
7PR0 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with FD-5D Fab 提交 2021-09-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 3 NO3 NITRATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% (w/v) PEG 20 000, 20% (v/v) PEG MME 550, 0.03 M of each NPS (NaNO3; Na2HPO4; (NH4)2SO4) and 0.1 M bicine/Trizma base pH 8.5.
分辨率 2.92 Å R-free 0.251
7PR0 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with FD-5D Fab 提交 2021-09-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NO3 NITRATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% (w/v) PEG 20 000, 20% (v/v) PEG MME 550, 0.03 M of each NPS (NaNO3; Na2HPO4; (NH4)2SO4) and 0.1 M bicine/Trizma base pH 8.5.
分辨率 2.92 Å R-free 0.251
7PR0 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Spike glycoprotein in complex with FD-5D Fab 提交 2021-09-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% (w/v) PEG 20 000, 20% (v/v) PEG MME 550, 0.03 M of each NPS (NaNO3; Na2HPO4; (NH4)2SO4) and 0.1 M bicine/Trizma base pH 8.5.
分辨率 2.92 Å R-free 0.251
7PRY Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with COVOX-45 and beta-6 Fabs 提交 2021-09-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, and 18% (w/v) PEG 20000
分辨率 3.10 Å R-free 0.291
7PRY Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with COVOX-45 and beta-6 Fabs 提交 2021-09-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, and 18% (w/v) PEG 20000
分辨率 3.10 Å R-free 0.291
7PRZ Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with beta-22 Fabs 提交 2021-09-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；containing 0.2 M Lithium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0 and 20% (w/v) PEG 4000
分辨率 3.20 Å R-free 0.223
7PS0 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with beta-24 Fabs 提交 2021-09-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 7.5 and 20% (w/v) PEG 5000 MME.
分辨率 2.92 Å R-free 0.271
7PS0 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with beta-24 Fabs 提交 2021-09-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 7.5 and 20% (w/v) PEG 5000 MME.
分辨率 2.92 Å R-free 0.271
7PS1 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with Beta-27 Fab 提交 2021-09-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 4 IOD IODIDE ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Potassium iodide, 0.1 M MES pH 6.5 and 25% (w/v) PEG 4000.
分辨率 2.40 Å R-free 0.215
7PS2 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with Beta-29 and Beta-53 Fabs 提交 2021-09-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 333–526（194 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 14 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium chloride, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5 and 1.5 M Ammonium sulfate.
分辨率 2.99 Å R-free 0.266
7PS4 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with Beta-38 提交 2021-09-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.8 M Sodium/potassium phosphate pH 7.5
分辨率 1.94 Å R-free 0.231
7PS4 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with Beta-38 提交 2021-09-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–526（194 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.8 M Sodium/potassium phosphate pH 7.5
分辨率 1.94 Å R-free 0.231
7PS5 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with Beta-47 Fab 提交 2021-09-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Potassium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0 and 15% (w/v) PEG 2000 MME
分辨率 3.14 Å R-free 0.274
7PS6 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with Beta-44 and Beta-54 Fabs 提交 2021-09-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 GOL GLYCEROL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Citric acid pH 3.5 and 25% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.26 Å R-free 0.240
7PS7 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with Beta-40 Fab 提交 2021-09-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；12.5% (w/v) PEG 1000, 12.5% (w/v) PEG 3350, 12.5% (v/v) MPD, 0.02 M of each carboxylic acid and 0.1 M MES/imidazole pH 6.5
分辨率 3.90 Å R-free 0.284
7PS7 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with Beta-40 Fab 提交 2021-09-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；12.5% (w/v) PEG 1000, 12.5% (w/v) PEG 3350, 12.5% (v/v) MPD, 0.02 M of each carboxylic acid and 0.1 M MES/imidazole pH 6.5
分辨率 3.90 Å R-free 0.284
7Q0A SARS-CoV-2 Spike ectodomain with Fab FI3A 提交 2021-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7Q0G Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with Beta-49 and FI-3A Fabs 提交 2021-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 13 CL CHLORIDE ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 TAR D(-)-TARTARIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 10% w/v Polyethylene glycol 10,000
分辨率 1.82 Å R-free 0.224
7Q0H Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with Beta-50 and Beta-54 提交 2021-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 8.0, 28% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 3.65 Å R-free 0.303
7Q0I Crystal structure of the N-terminal domain of SARS-CoV-2 beta variant spike glycoprotein in complex with Beta-43 提交 2021-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 13–305（293 aa）
链 D 13–305（293 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium HEPES, 25 % w/v PEG 2000 MME
分辨率 2.39 Å R-free 0.242
7Q1Z Structure of formaldehyde cross-linked SARS-CoV-2 S glycoprotein 提交 2021-10-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7Q6E Beta049 fab in complex with SARS-CoV2 beta-Spike glycoprotein, The Beta mAb response underscores the antigenic distance to other SARS-CoV-2 variants 提交 2021-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1205（1205 aa）
链 B 1–1205（1205 aa）
链 C 1–1205（1205 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7Q9F Beta-50 fab in complex with SARS-CoV-2 beta-Spike glycoprotein 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7Q9G COVOX-222 fab in complex with SARS-CoV-2 beta-Spike glycoprotein 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Q9I Beta-43 fab in complex with SARS-CoV-2 beta-Spike glycoprotein 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
7Q9J Beta-26 fab in complex with SARS-CoV-2 beta-Spike glycoprotein 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1205（1205 aa）
链 B 1–1205（1205 aa）
链 C 1–1205（1205 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7Q9K Beta-32 fab in complex with SARS-CoV-2 beta-Spike glycoprotein 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7Q9M Beta-53 fab in complex with SARS-CoV-2 beta-Spike glycoprotein 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7Q9P Beta-06 fab in complex with SARS-CoV-2 beta-Spike glycoprotein 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1205（1205 aa）
链 B 1–1205（1205 aa）
链 C 1–1205（1205 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7QDG SARS-CoV-2 S protein S:A222V + S:D614G mutant 1-up 提交 2021-11-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 15–1213（1199 aa）
链 B 15–1213（1199 aa）
链 C 15–1213（1199 aa）
突变：S:A222V + S:D614G 突变：S:A222V + S:D614G 突变：S:A222V + S:D614G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7QDH SARS-CoV-2 S protein S:D614G mutant 1-up 提交 2021-11-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 15–1213（1199 aa）
链 B 15–1213（1199 aa）
链 C 15–1213（1199 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7QEZ Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with the ultrapotent antibody CV2.1169 and CR3022 提交 2021-12-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 331–528（198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；15% PEG 8000, 0.5 M lithium sulfate
分辨率 2.89 Å R-free 0.281
7QF0 Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with the human antibody CV2.2325 提交 2021-12-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–528（198 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；296 K；0.1 M ammonium citrate (pH 7.0), 12% PEG 3350,
分辨率 2.30 Å R-free 0.221
7QF1 Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with the human antibody CV2.6264 提交 2021-12-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 331–528（198 aa）
链 F 331–528（198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；0.1 M NaAc, 7% PEG 6000, 30% ethanol
分辨率 2.80 Å R-free 0.254
7QO9 SARS-CoV-2 S Omicron Spike B.1.1.529 - RBD and NTD (Local) 提交 2021-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.88 Å
7QTI SARS-CoV-2 S Omicron Spike B.1.1.529 - 3-P2G3 and 1-P5C3 Fabs (Global) 提交 2022-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 A 1–1205（1205 aa）
链 D 1–1205（1205 aa）
链 K 1–1205（1205 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
7QUR SARS-CoV-2 Spike with ethylbenzamide-tri-iodo Siallyllactose, C3 symmetry 提交 2022-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 GE9 2,3,5-tris(iodanyl)benzamide × 3 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.27 Å
7QUS SARS-CoV-2 Spike, C3 symmetry 提交 2022-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.39 Å
7R0Z Dissociated S1 domain of Alpha Variant SARS-CoV-2 Spike bound to ACE2 (Non-Uniform Refinement) 提交 2022-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7R10 Dissociated S1 domain of Alpha Variant SARS-CoV-2 Spike bound to ACE2 提交 2022-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7R11 Dissociated S1 domain of Beta Variant SARS-CoV-2 Spike bound to ACE2 (Non-Uniform Refinement) 提交 2022-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7R12 Dissociated S1 domain of Mink Variant SARS-CoV-2 Spike bound to ACE2 (Non-Uniform Refinement) 提交 2022-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7R13 Alpha Variant SARS-CoV-2 Spike in Closed conformation 提交 2022-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7R14 Alpha Variant SARS-CoV-2 Spike with 1 Erect RBD 提交 2022-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7R16 Beta Variant SARS-CoV-2 Spike with 1 Erect RBD 提交 2022-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7R17 Beta Variant SARS-CoV-2 Spike with 2 Erect RBDs 提交 2022-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7R18 Mink Variant SARS-CoV-2 Spike in Closed conformation 提交 2022-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1146（1146 aa）
链 B 1–1146（1146 aa）
链 C 1–1146（1146 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7R19 Mink Variant SARS-CoV-2 Spike with 2 Erect RBDs 提交 2022-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7R1A Furin Cleaved Alpha Variant SARS-CoV-2 Spike in complex with 3 ACE2 提交 2022-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 48 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7R1B Mink Variant SARS-CoV-2 Spike with 1 Erect RBD 提交 2022-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7R40 Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with the 87G7 antibody Fab fragment 提交 2022-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7R4I The SARS-CoV-2 spike in complex with the 2.15 neutralizing nanobody 提交 2022-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7R4Q The SARS-CoV-2 spike in complex with the 1.29 neutralizing nanobody 提交 2022-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7R4R The SARS-CoV-2 spike in complex with the 1.10 neutralizing nanobody 提交 2022-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7R6W SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain (RBD) in complex with S2X35 Fab and S309 Fab 提交 2021-06-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 328–531（204 aa） 片段：receptor-binding domain (UNP reisdues 328-531)
未记录 SO4 SULFATE ION × 23 GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 3 POL N-PROPANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；1.85 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris, pH 8.17, 0.8% w/v polyvinyl alcohol, 1% v/v 1-propanol, 0.01 M HEPES, pH 7
分辨率 1.83 Å R-free 0.232
7R6X SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain (RBD) in complex with S2E12 Fab, S309 Fab, and S304 Fab 提交 2021-06-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 R 328–531（204 aa） 片段：receptor-binding domain (UNP residues 328-531)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；Crystal 1: 0.09 M phosphate/citrate, pH 5.5, 27% v/v PEG Smear Low, 4% v/v polypropylene glycol 400, 0.02 M imidazole, pH 7, Crystal 2: 0.09 M phosphate/citrate, pH 5.5, 27% v/v PEG Smear Low, 0.01 M potassium/sodium phosphate, pH 7, 1% v/v PPGBA 230, 1.5% v/v PPGBA 400
分辨率 2.95 Å R-free 0.262
7R7N SARS-CoV-2 spike in complex with the S2D106 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the RBD and S2D106) 提交 2021-06-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
7R8L Structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with neutralizing antibody C099 and CR3022 提交 2021-06-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 334–528（195 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1M Sodium cacodylate, 40% 2-Methyl-2,4-pentanediol (MPD), and 5% PEG8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.229
7R8M Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with neutralizing antibody C032 提交 2021-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot, 0 blot force
分辨率 3.40 Å
7R8N Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with neutralizing antibody C051 提交 2021-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 E 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot, 0 blot force
分辨率 3.55 Å
7R8O Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with neutralizing antibody C548 提交 2021-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 E 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3s blot, 0 blot force
分辨率 3.50 Å
7R95 Membrane bound structure of HR1 domain of SARS-CoV-2 spike protein 提交 2021-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 919–965（47 aa） 片段：Heptad repeat 1 domain, residues 919-965
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；308 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR测量条件 pH 6；308 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR样品组成 0.4 mM [U-13C; U-15N; U-2H] SARS-CoV-2 spike protein HR1 domain, 20 mM sodium phosphate buffer, 30 mM NaCl, 150 mM DMPC/DHPC, 97% H2O/3% D2O | 97% H2O/3% D2O
NMR样品组成 0.3 mM 15N, 2H SARS-CoV-2 spike protein HR1 domain, 20 mM sodium phosphate buffer, 30 mM NaCl, 150 mM DMPC/DHPC, 97% H2O/3% D2O | 97% H2O/3% D2O
NMR样品组成 0.1 mM 15N, 2H SARS-CoV-2 spike protein HR1 domain, 20 mM sodium phosphate buffer, 30 mM NaCl, 100 mM DMPC/DHPC, 97% H2O/3% D2O | 97% H2O/3% D2O
NMR样品组成 0.15 mM 15N, 2H SARS-CoV-2 spike protein HR1 domain, 20 mM sodium phosphate buffer, 30 mM NaCl, 120 mM DMPC/DHPC, 97% H2O/3% D2O | 97% H2O/3% D2O
分辨率未提供
7RA8 SARS-CoV-2 S glycoprotein in complex with S2X259 Fab 提交 2021-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7RAL SARS-CoV-2 S bound to S2X259 Fab (local refinement of the RBD/S2X259 variable domains) 提交 2021-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7RAQ Crystal structure of CV3-25 Fab bound to SARS-CoV-2 spike stem helix peptide 提交 2021-07-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 1149–1167（19 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 7 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Na Acetate:HCl, pH 4.5, 2.0M (NH4)2SO4, 0.01M SrCl
分辨率 1.74 Å R-free 0.203
7RBU SARS-CoV-2 Spike in complex with PVI.V6-14 Fab 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 14–307（294 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 14-307)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7RBV SARS-CoV-2 Spike in complex with PVI.V6-14 Fab 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7RBY Crystal structure of Nanobody nb112 and SARS-CoV-2 RBD 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 329–538（210 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；0.1M Mg(OAc)2, 0.1 M MOPS pH 7.5, 12% w/v PEG8000
分辨率 2.82 Å R-free 0.287
7RBY Crystal structure of Nanobody nb112 and SARS-CoV-2 RBD 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 329–538（210 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；0.1M Mg(OAc)2, 0.1 M MOPS pH 7.5, 12% w/v PEG8000
分辨率 2.82 Å R-free 0.287
7RKU Structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C022 提交 2021-07-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 328–533（206 aa） 片段：Receptor Binding Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.05M ammonium sulfate, 0.05M BIS-Tris, 30% v/v pentaerythritol ethoxylate (15/4 EO/OH)
分辨率 3.20 Å R-free 0.231
7RKU Structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C022 提交 2021-07-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 328–533（206 aa） 片段：Receptor Binding Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.05M ammonium sulfate, 0.05M BIS-Tris, 30% v/v pentaerythritol ethoxylate (15/4 EO/OH)
分辨率 3.20 Å R-free 0.231
7RKU Structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C022 提交 2021-07-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 328–533（206 aa） 片段：Receptor Binding Domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.05M ammonium sulfate, 0.05M BIS-Tris, 30% v/v pentaerythritol ethoxylate (15/4 EO/OH)
分辨率 3.20 Å R-free 0.231
7RKU Structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C022 提交 2021-07-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 328–533（206 aa） 片段：Receptor Binding Domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.05M ammonium sulfate, 0.05M BIS-Tris, 30% v/v pentaerythritol ethoxylate (15/4 EO/OH)
分辨率 3.20 Å R-free 0.231
7RKV Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with neutralizing antibody C118 (State 1) 提交 2021-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
7RNJ S2P6 Fab fragment bound to the SARS-CoV/SARS-CoV-2 spike stem helix peptide 提交 2021-07-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1146–1159（14 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium acetate pH 4.6, 25% (v/v) PEG Smear Broad
分辨率 2.67 Å R-free 0.274
7RPV Crystal structure of affinity-enhancing and catalytically inactive ACE2 in complex with SARS-CoV-2 RBD 提交 2021-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 320–537（218 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH6.5, 20% PEG8000
分辨率 3.54 Å R-free 0.292
7RPV Crystal structure of affinity-enhancing and catalytically inactive ACE2 in complex with SARS-CoV-2 RBD 提交 2021-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 320–537（218 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH6.5, 20% PEG8000
分辨率 3.54 Å R-free 0.292
7RPV Crystal structure of affinity-enhancing and catalytically inactive ACE2 in complex with SARS-CoV-2 RBD 提交 2021-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 320–537（218 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH6.5, 20% PEG8000
分辨率 3.54 Å R-free 0.292
7RPV Crystal structure of affinity-enhancing and catalytically inactive ACE2 in complex with SARS-CoV-2 RBD 提交 2021-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 320–537（218 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH6.5, 20% PEG8000
分辨率 3.54 Å R-free 0.292
7RQ6 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with non-neutralizing NTD-directed CV3-13 Fab isolated from convalescent individual 提交 2021-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.18 Å
7RR0 SARS-CoV-2 receptor binding domain bound to Fab PDI 222 提交 2021-08-08 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–527（194 aa） 片段：RBD domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
7RTD SARS-CoV-2 Spike-derived peptide S269-277 (YLQPRTFLL) presented by HLA-A*02:01 提交 2021-08-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 269–277（9 aa） 片段：epitope YLQPRTFLL (UNP residues 269-277)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2M NaFluoride
分辨率 2.05 Å R-free 0.235
7RTR YLQ-SG3 TCR in complex with SARS-CoV-2 Spike-derived peptide S269-277 (YLQPRTFLL) presented by HLA-A*02:01 提交 2021-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 269–277（9 aa） 片段：epitope YLQPRTFLL (UNP residues 269-277)
未记录 NA SODIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350, 0.05 M Zinc Acetate
分辨率 2.60 Å R-free 0.235
7RU1 SARS-CoV-2-6P-Mut7 S protein (C3 symmetry) 提交 2021-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Detergent added shortly before freezing
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blot time
分辨率 2.80 Å
7RU2 SARS-CoV-2-6P-Mut7 S protein (asymmetric) 提交 2021-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Detergent added shortly before freezing
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blot time
分辨率 3.00 Å
7RU3 CC6.33 IgG in complex with SARS-CoV-2-6P-Mut7 S protein (non-uniform refinement) 提交 2021-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Detergent added shortly before freezing
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blot time
分辨率 3.30 Å
7RU4 CC6.33 IgG in complex with SARS-CoV-2-6P-Mut7 S protein (RBD/Fv local refinement) 提交 2021-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Detergent added shortly before freezing
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blot time
分辨率 3.30 Å
7RU5 CC6.30 fragment antigen binding in complex with SARS-CoV-2-6P-Mut7 S protein (non-uniform refinement) 提交 2021-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Detergent added shortly before freezing
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blot time
分辨率 3.60 Å
7RU8 CC6.30 fragment antigen binding in complex with SARS-CoV-2-6P-Mut7 S protein (RBD/Fv local refinement) 提交 2021-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Detergent added shortly before freezing
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blot time
分辨率 3.80 Å
7RW2 Cryo-EM structure of NTD-directed neutralizing antibody 5-7 in complex with prefusion SARS-CoV-2 spike glycoprotein 提交 2021-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 48 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7RXD CryoEM structure of RBD domain of COVID-19 in complex with Legobody 提交 2021-08-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 334–526（193 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7RZQ Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex 提交 2021-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 917–988（72 aa）
链 B 917–988（72 aa）
链 C 917–988（72 aa）
链 D 1162–1201（40 aa）
链 E 1162–1201（40 aa）
链 F 1162–1201（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.09 Å
7RZR Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex with D936Y mutation 提交 2021-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 917–988（72 aa）
链 B 917–988（72 aa）
链 C 917–988（72 aa）
链 D 1162–1201（40 aa）
链 E 1162–1201（40 aa）
链 F 1162–1201（40 aa）
突变：D936Y 突变：D936Y 突变：D936Y 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.27 Å
7RZS Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex with L938F mutation 提交 2021-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 917–988（72 aa）
链 B 917–988（72 aa）
链 C 917–988（72 aa）
链 D 1162–1201（40 aa）
链 E 1162–1201（40 aa）
链 F 1162–1201（40 aa）
突变：L938F 突变：L938F 突变：L938F 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.52 Å
7RZT Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex with S940F mutation 提交 2021-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 917–988（72 aa）
链 B 917–988（72 aa）
链 C 917–988（72 aa）
链 D 1162–1201（40 aa）
链 E 1162–1201（40 aa）
链 F 1162–1201（40 aa）
突变：S940F 突变：S940F 突变：S940F 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.35 Å
7RZU Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex with A942S mutation 提交 2021-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 917–988（72 aa）
链 B 917–988（72 aa）
链 C 917–988（72 aa）
链 D 1162–1201（40 aa）
链 E 1162–1201（40 aa）
链 F 1162–1201（40 aa）
突变：A942S 突变：A942S 突变：A942S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7RZV Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex with V1176F mutation 提交 2021-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 917–988（72 aa）
链 B 917–988（72 aa）
链 C 917–988（72 aa）
链 D 1157–1201（45 aa）
链 E 1157–1201（45 aa）
链 F 1157–1201（45 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.11 Å
7S0B Structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with neutralizing antibody N-612-056 提交 2021-08-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 319–533（215 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M Lithium citrate tribasic tetrahydrate and 20% w/v polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.90 Å R-free 0.260
7S0B Structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with neutralizing antibody N-612-056 提交 2021-08-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 319–533（215 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M Lithium citrate tribasic tetrahydrate and 20% w/v polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.90 Å R-free 0.260
7S0C Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with neutralizing antibody N-612-017 提交 2021-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
7S0D Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with neutralizing antibody N-612-014 提交 2021-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7S0E Structure of the SARS-CoV-2 S1 subunit in complex with antibody N-612-004 提交 2021-08-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1213（1213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
7S3N SARS-CoV-2 S stem helix peptide bound to Fab22 提交 2021-09-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1146–1164（19 aa） 片段：stem helix peptide (UNP residues 1146-1164)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.5, 23% PEG8000
分辨率 1.90 Å R-free 0.235
7S4S Crystal Structure of SARS-CoV-2 S receptor-binding domain (RBD) in complex CoV11 Fab 提交 2021-09-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 5 ACT ACETATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；15% PEG 4000 150 mM ammonium sulfate 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.05 Å R-free 0.198
7S5P Crystal structure of SARS-CoV-2 B.1.351 variant receptor binding domain in complex with neutralizing antibody CS23 提交 2021-09-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 13 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293.15 K；1.6 M ammonium sulfate and 0.1 M bicine pH 9.0
分辨率 2.86 Å R-free 0.247
7S5Q Crystal structure of SARS-CoV-2 B.1.351 variant receptor binding domain in complex with neutralizing antibodies CS44 and COVA1-16 提交 2021-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 SO4 SULFATE ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293.15 K；1.6 M ammonium sulfate and 0.1 M citric acid pH 4.0
分辨率 2.88 Å R-free 0.257
7S5R Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibodies CV07-287 and COVA1-16 提交 2021-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293.15 K；1.6 M ammonium sulfate and 0.1 M bicine pH 9.0
分辨率 2.45 Å R-free 0.237
7S6I SARS-CoV-2-6P-Mut2 S protein 提交 2021-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：S383C, R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, D985C, K986P, V987P 突变：S383C, R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, D985C, K986P, V987P 突变：S383C, R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, D985C, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Detergent added shortly before freezing
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blot time
分辨率 3.20 Å
7S6J J08 fragment antigen binding in complex with SARS-CoV-2-6P-Mut2 S protein (conformation 1) 提交 2021-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
突变：S383C, R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, D985C, K986P, V987P 突变：S383C, R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, D985C, K986P, V987P 突变：S383C, R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, D985C, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Detergent added shortly before freezing
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blot time
分辨率 3.40 Å
7S6K J08 fragment antigen binding in complex with SARS-CoV-2-6P-Mut2 S protein (conformation 2) 提交 2021-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
突变：S383C, R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, D985C, K986P, V987P 突变：S383C, R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, D985C, K986P, V987P 突变：S383C, R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, D985C, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Detergent added shortly before freezing
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blot time
分辨率 3.40 Å
7S6L J08 fragment antigen binding in complex with SARS-CoV-2-6P-Mut7 S protein (conformation 3) 提交 2021-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Detergent added shortly before freezing
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blot time
分辨率 4.00 Å
7S83 Crystal structure of SARS CoV-2 Spike Receptor Binding Domain in complex with shark neutralizing VNARs ShAb01 and ShAb02 提交 2021-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain (RBD)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；14.5% PEG20000, 0.1M HEPES pH7.0
分辨率 2.52 Å R-free 0.278
7SA2 SARS-CoV-2 spike-derived peptide S1060-1068 (VVFLHVTYV) presented by HLA-A*02:01 提交 2021-09-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1060–1068（9 aa） 片段：UNP residues 1060-1068
未记录 CD CADMIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M K formate, 1 mM CdCl2
分辨率 1.85 Å R-free 0.196
7SBK Closed state of pre-fusion SARS-CoV-2 Delta variant spike protein 提交 2021-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å R-free 0.425
7SBL One RBD-up 1 of pre-fusion SARS-CoV-2 Delta variant spike protein 提交 2021-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å R-free 0.425
7SBO One RBD-up 2 of pre-fusion SARS-CoV-2 Delta variant spike protein 提交 2021-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å R-free 0.425
7SBP Closed state of pre-fusion SARS-CoV-2 Kappa variant spike protein 提交 2021-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å R-free 0.425
7SBQ One RBD-up 1 of pre-fusion SARS-CoV-2 Kappa variant spike protein 提交 2021-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å R-free 0.437
7SBR One RBD-up 2 of pre-fusion SARS-CoV-2 Kappa variant spike protein 提交 2021-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å R-free 0.437
7SBS One RBD-up 1 of pre-fusion SARS-CoV-2 Gamma variant spike protein 提交 2021-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å R-free 0.437
7SBT One RBD-up 2 of pre-fusion SARS-CoV-2 Gamma variant spike protein 提交 2021-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å R-free 0.437
7SBU Crystal structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor-binding domain in complex with a highly potent antibody J08 Fab 提交 2021-09-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；17% (w/v) PEG 4000, 15% (v/v) Glycerol, 8.5% (v/v) Isopropanol, 0.085 M Sodium HEPES pH 7.5
分辨率 2.53 Å R-free 0.261
7SC1 Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, R40-1G8 提交 2021-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7SD5 Crystallographic structure of neutralizing antibody 10-40 in complex with SARS-CoV-2 spike receptor binding domain 提交 2021-09-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–537（219 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 319-537)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；310 K；0.2 M potassium thiocyanate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5, 8% PEG550 MME, 8% PEG20000
分辨率 1.53 Å R-free 0.206
7SI2 Crystal structure of neutralizing antibody 10-28 in complex with SARS-CoV-2 spike receptor binding domain (RBD) 提交 2021-10-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–537（219 aa） 片段：receptor-binding domain (UNP reisdues 319-537)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350, 30% PEG2000 MME
分辨率 3.20 Å R-free 0.261
7SI2 Crystal structure of neutralizing antibody 10-28 in complex with SARS-CoV-2 spike receptor binding domain (RBD) 提交 2021-10-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 319–537（219 aa） 片段：receptor-binding domain (UNP reisdues 319-537)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350, 30% PEG2000 MME
分辨率 3.20 Å R-free 0.261
7SI2 Crystal structure of neutralizing antibody 10-28 in complex with SARS-CoV-2 spike receptor binding domain (RBD) 提交 2021-10-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–537（219 aa） 片段：receptor-binding domain (UNP reisdues 319-537)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350, 30% PEG2000 MME
分辨率 3.20 Å R-free 0.261
7SIS SARS-CoV-2 Spike-derived peptide S976-984 (VLNDILSRL) presented by HLA-A*02:01 提交 2021-10-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 976–984（9 aa） 片段：UNP residues 976-984
未记录 ACT ACETATE ION × 1 CD CADMIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Ammonium Formate, 1 mM CdCl2
分辨率 1.90 Å R-free 0.206
7SJ0 Antibody A7V3 bound to N-terminal domain of the spike 提交 2021-10-15 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；2 mM Tris pH 7.5, 200 mM NaCl, 0.02% NaN3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
7SJS Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem helix peptide in complex with neutralizing antibody CC40.8 提交 2021-10-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1140–1164（25 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.26；293.15 K；0.1 M sodium acetate buffer at pH 4.26, 0.2 M ammonium sulfate, and 28% (w/v) polyethylene glycol monomethyl ether 2000
分辨率 1.61 Å R-free 0.206
7SN2 Structure of human SARS-CoV-2 neutralizing antibody C1C-A3 Fab 提交 2021-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4-6 seconds
分辨率 4.30 Å
7SN3 Structure of human SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer bound by neutralizing antibody C1C-A3 Fab (variable region) 提交 2021-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 4-6 seconds
分辨率 3.10 Å
7SO9 SARS-CoV-2 S B.1.617.2 delta variant + S2M11 + S2L20 Global Refinement 提交 2021-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 F 1–1208（1208 aa）
链 K 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
7SOA SARS-CoV-2 S NTD B.1.617.2 delta variant + S2L20 Local Refinement 提交 2021-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7SOB SARS-CoV-2 S B.1.617.1 kappa variant + S309 + S2L20 Global Refinement 提交 2021-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 K 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 51 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
7SOC SARS-CoV-2 S RBD B.1.617.1 kappa variant S309 Local Refinement 提交 2021-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7SOD SARS-CoV-2 S NTD B.1.617.1 kappa variant S2L20 Local Refinement 提交 2021-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7SOE SARS-CoV-2 S B.1.617.1 kappa variant + S2X303 Global Refinement 提交 2021-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 F 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 51 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7SOF SARS-CoV-2 S NTD B.1.617.1 kappa variant S2X303 Local Refinement 提交 2021-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7SPO Crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with VNAR 3B4 提交 2021-11-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 330–532（203 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.226
7SPO Crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with VNAR 3B4 提交 2021-11-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 330–532（203 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.226
7SPP Crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with VNAR 2C02 提交 2021-11-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 319–535（217 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M sodium sulfate and 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 1.96 Å R-free 0.224
7SWN G32A4 Fab in complex with SARS-CoV-2 Spike 6P (RBD local reconstruction) 提交 2021-11-20 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–527（194 aa） 片段：RBD domain
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7SWO C98C7 Fab in complex with SARS-CoV-2 Spike 6P (RBD local reconstruction) 提交 2021-11-20 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–528（195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7SWP G32Q4 Fab in complex with SARS-CoV-2 Spike 6P (RBD local reconstruction) 提交 2021-11-20 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–528（195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7SWW SARS-CoV-2 Spike NTD in complex with neutralizing Fab SARS2-57 (local refinement) 提交 2021-11-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–304（291 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 14-304)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
7SWX SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing Fab SARS2-57 (three down conformation) 提交 2021-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 14–1146（1133 aa）
链 B 14–1146（1133 aa）
链 C 14–1146（1133 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
7SXR Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G mutant spike protein ectodomain 提交 2021-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G 突变：D614G 突变：D614G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7SXS Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G,L452R mutant spike protein ectodomain 提交 2021-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G, L452R 突变：D614G, L452R 突变：D614G, L452R NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.64 Å
7SXT Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G,N501Y mutant spike protein ectodomain 提交 2021-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G, N501Y 突变：D614G, N501Y 突变：D614G, N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.31 Å
7SXU Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G,N501Y,E484K mutant spike protein ectodomain 提交 2021-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G, N501Y, E484K 突变：D614G, N501Y, E484K 突变：D614G, N501Y, E484K NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7SXV Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G,N501Y,E484K,K417N mutant spike protein ectodomain 提交 2021-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G, N501Y, E484K, K417N 突变：D614G, N501Y, E484K, K417N 突变：D614G, N501Y, E484K, K417N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
7SXW Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G,N501Y,E484K,K417T mutant spike protein ectodomain 提交 2021-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G, N501Y, E484K, K417T 突变：D614G, N501Y, E484K, K417T 突变：D614G, N501Y, E484K, K417T NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
7SXX Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G mutant spike protein ectodomain bound to human ACE2 ectodomain (global refinement) 提交 2021-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.66 Å
7SXY Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G mutant spike protein ectodomain bound to human ACE2 ectodomain (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2021-11-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
7SXZ Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G,L452R mutant spike protein ectodomain bound to human ACE2 ectodomain (global refinement) 提交 2021-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.61 Å
7SY0 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G,L452R mutant spike protein ectodomain bound to human ACE2 ectodomain (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2021-11-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7SY1 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G,N501Y mutant spike protein ectodomain bound to human ACE2 ectodomain (global refinement) 提交 2021-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G, N501Y 突变：D614G, N501Y 突变：D614G, N501Y NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
7SY2 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G,N501Y mutant spike protein ectodomain bound to human ACE2 ectodomain (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2021-11-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7SY3 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G,N501Y,E484K mutant spike protein ectodomain bound to human ACE2 ectodomain (global refinement) 提交 2021-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
7SY4 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G,N501Y,E484K mutant spike protein ectodomain bound to human ACE2 ectodomain (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2021-11-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7SY5 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G,N501Y,E484K,K417N mutant spike protein ectodomain bound to human ACE2 ectodomain (global refinement) 提交 2021-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G, N501Y, E484K, K417N 突变：D614G, N501Y, E484K, K417N 突变：D614G, N501Y, E484K, K417N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.59 Å
7SY6 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G,N501Y,E484K,K417N mutant spike protein ectodomain bound to human ACE2 ectodomain (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2021-11-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7SY7 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G,N501Y,E484K,K417T mutant spike protein ectodomain bound to human ACE2 ectodomain (global refinement) 提交 2021-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7SY8 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 D614G,N501Y,E484K,K417T mutant spike protein ectodomain bound to human ACE2 ectodomain (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2021-11-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
7T01 SARS-CoV-2 S-RBD + Fab 54042-4 提交 2021-11-29 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 329–529（201 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；-4 force, 3 s blot
分辨率 2.69 Å
7T3M SARS-CoV-2 S (Spike Glycoprotein) D614G with Three (3) RBDs Up, Bound to Antibody 2-7 scFv, composite map 提交 2021-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1149（1149 aa）
链 C 1–1149（1149 aa）
链 G 1–1149（1149 aa）
突变：D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V986P 突变：D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V986P 突变：D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V986P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7T67 SARS-CoV-2 S (Spike Glycoprotein) D614G with One(1) RBD Up 提交 2021-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1149（1149 aa）
链 C 1–1149（1149 aa）
链 G 1–1149（1149 aa）
突变：D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V986P 突变：D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V986P 突变：D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V986P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7T72 Epitope-based selection of SARS-CoV-2 neutralizing antibodies from convalescent patients 提交 2021-12-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–528（196 aa） 片段：Receptor Binding Domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Equal volumes (2 uL) of protein solution (~5 mg/ml in 25 mM Tris (pH 8.0), 200 mM NaCl) and well solution (100 mM citrate (pH 4.25), 500 mM LiCl, 13% (w/v) PEG6000) were combined
分辨率 3.18 Å R-free 0.308
7T7B Crystal structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor-binding domain in complex with a cross-neutralizing antibody ADI-62113 Fab 提交 2021-12-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293.15 K；0.08 M sodium acetate pH 4.6, 0.16 M ammonium sulfate, 20% (w/v) polyethylene glycol 4000, and 20% (v/v) glycerol
分辨率 2.59 Å R-free 0.267
7T9J Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 Omicron spike protein 提交 2021-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
7T9K Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron spike protein in complex with human ACE2 提交 2021-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.45 Å
7T9L Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron spike protein in complex with human ACE2 (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2021-12-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.66 Å
7TAS SARS-CoV-2 spike in complex with the S2K146 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the RBD and S2K146) 提交 2021-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–1208（1208 aa）
突变：R682G,R683S,R685S,F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7TAT SARS-CoV-2 spike in complex with the S2K146 neutralizing antibody Fab fragment (two receptor-binding domains open) 提交 2021-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G,R683S,R685S,F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：R682G,R683S,R685S,F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：R682G,R683S,R685S,F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7TB8 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with antibodies B1-182.1 and A19-61.1 提交 2021-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；100 mM HEPES, pH 7.4, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 2-3.5 seconds before plugging.
分辨率 2.83 Å
7TBF Locally refined region of SARS-CoV-2 spike in complex with antibodies B1-182.1 and A19-61.1 提交 2021-12-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 332–527（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；100 mM HEPES, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 2-3.5 seconds before plugging.
分辨率 3.10 Å
7TC9 Locally refined region of SARS-CoV-2 spike in complex with antibody A19-46.1 提交 2021-12-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 332–526（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；100 mM HEPES, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 2-3.5 seconds before plugging.
分辨率 5.08 Å
7TCA Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron spike in complex with antibody A19-46.1 提交 2021-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 14–1205（1192 aa）
链 B 14–1205（1192 aa）
链 C 14–1205（1192 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；100 mM HEPES, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 2-3.5 seconds before plugging.
分辨率 3.85 Å
7TCC Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron spike in complex with antibodies A19-46.1 and B1-182.1 提交 2021-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 14–1205（1192 aa）
链 B 14–1205（1192 aa）
链 C 14–1205（1192 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；100 mM HEPES, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 2-3.5 seconds before plugging.
分辨率 3.86 Å
7TCQ Crystal structure of SARS-CoV-2 neutralizing antibody WS6 in complex with spike S2 peptide 提交 2021-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1148–1157（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 11 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.5 M Ammonium sulfate and 30 % PEG400
分辨率 2.02 Å R-free 0.213
7TCQ Crystal structure of SARS-CoV-2 neutralizing antibody WS6 in complex with spike S2 peptide 提交 2021-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1148–1157（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.5 M Ammonium sulfate and 30 % PEG400
分辨率 2.02 Å R-free 0.213
7TE1 SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain in Complex with Ab17 提交 2022-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 319–529（211 aa）
链 E 319–529（211 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；0.1 M HEPES pH 7.0 and 30% v/v Jeffamine ED-2001 pH 7.0
分辨率 3.50 Å R-free 0.344
7TEI SARS-CoV-2 Omicron 1-RBD up Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-Omicron) 提交 2022-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1147（1147 aa）
链 B 1–1147（1147 aa）
链 C 1–1147（1147 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7TEW Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Delta (B.1.617.2) spike protein in complex with human ACE2 (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2022-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1206（1206 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
7TEX Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Delta (B.1.617.2) spike protein in complex with human ACE2 提交 2022-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
7TEY Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Delta (B.1.617.2) spike protein 提交 2022-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.25 Å
7TEZ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Kappa (B.1.617.1) spike protein in complex with human ACE2 (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2022-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
7TF0 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Kappa (B.1.617.1) spike protein in complex with human ACE2 提交 2022-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
7TF1 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Kappa (B.1.617.1) Q484I spike protein (focused refinement of RBD) 提交 2022-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
链 F 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.57 Å
7TF2 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Kappa (B.1.617.1) Q484I spike protein 提交 2022-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
链 F 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 48 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
7TF3 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Kappa (B.1.617.1) Q484A spike protein 提交 2022-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.25 Å
7TF4 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Kappa (B.1.617.1) spike protein (focused refinement of RBD) 提交 2022-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
链 F 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
7TF5 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Kappa (B.1.617.1) spike protein 提交 2022-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
链 F 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 48 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
7TF8 SARS-CoV-2 Omicron 3-RBD down Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-Omicron) 提交 2022-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1147（1147 aa）
链 B 1–1147（1147 aa）
链 C 1–1147（1147 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
7TGW Omicron spike at 3.0 A (open form) 提交 2022-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7TGX Prototypic SARS-CoV-2 G614 spike (open form) 提交 2022-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7TGY Prototypic SARS-CoV-2 G614 spike (closed form) 提交 2022-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7THE Structure of RBD directed antibody DH1042 in complex with SARS-CoV-2 spike: Local refinement of RBD-Fab interface 提交 2022-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–527（195 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.87 Å
7THK Cryo-EM structure of prefusion SARS-CoV-2 spike omicron B.1.1.529 variant 提交 2022-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1205（1205 aa）
链 B 1–1205（1205 aa）
链 C 1–1205（1205 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 38 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7THT CryoEM structure of SARS-CoV-2 S protein in complex with Receptor Binding Domain antibody DH1042 提交 2022-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 C 27–1147（1121 aa）
链 S 27–1147（1121 aa）
链 V 27–1147（1121 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
7TIK Structure of the SARS-CoV-2 Omicron spike post-fusion bundle 提交 2022-01-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1157–1201（45 aa）
链 E 1157–1201（45 aa）
链 F 1157–1201（45 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
7TL1 SARS-CoV-2 Omicron 3-RBD down Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-Omicron) 提交 2022-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1147（1147 aa）
链 B 1–1147（1147 aa）
链 C 1–1147（1147 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7TL9 SARS-CoV-2 Omicron 1-RBD up Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-Omicron) 提交 2022-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1147（1147 aa）
链 B 1–1147（1147 aa）
链 C 1–1147（1147 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.50 Å
7TLA Down-state locked rS2d SARS-CoV-2 spike ectodomain in the RBD-down conformation, State 1 提交 2022-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
7TLB Down-state locked rS2d SARS-CoV-2 spike ectodomain in the RBD-down conformation, State 2 提交 2022-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
7TLC Down-state locked, S2 stabilized rS2d-HexaPro SARS-CoV-2 spike ectodomain in the RBD-down conformation, State 1 提交 2022-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
7TLD Down-state locked, S2 stabilized rS2d-HexaPro SARS-CoV-2 spike ectodomain in the RBD-down conformation, State 2 提交 2022-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7TLT SARS-CoV-2 Spike-derived peptide S489-497 (YFPLQSYGF) presented by HLA-A*29:02 提交 2022-01-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 489–497（9 aa） 片段：UNP residues 489-497 (YFPLQSYGF)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.9 M Ammonium Sulfate, 20 mM Magnesium chloride, 0.1M Bis-tris propane, 2% Ethylene glycol, 2% 2-Methyl-2,4-pentanediol
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
7TLT SARS-CoV-2 Spike-derived peptide S489-497 (YFPLQSYGF) presented by HLA-A*29:02 提交 2022-01-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 489–497（9 aa） 片段：UNP residues 489-497 (YFPLQSYGF)
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.9 M Ammonium Sulfate, 20 mM Magnesium chloride, 0.1M Bis-tris propane, 2% Ethylene glycol, 2% 2-Methyl-2,4-pentanediol
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
7TLY SARS-CoV-2 S B.1.1.529 Omicron variant (RBD + S309 Local Refinement) 提交 2022-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 1–145（145 aa）
链 I 146–212（67 aa）
链 I 215–1205（991 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7TLZ SARS-CoV-2 S NTD B.1.1.529 Omicron variant + S309 Local Refinement 提交 2022-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–145（145 aa）
链 J 146–212（67 aa）
链 J 215–1205（991 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7TM0 SARS-CoV-2 S B.1.1.529 Omicron variant + S309 + S2L20 Global Refinement 提交 2022-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–145（145 aa）
链 A 146–212（67 aa）
链 A 215–1205（991 aa）
链 B 1–145（145 aa）
链 B 146–212（67 aa）
链 B 215–1205（991 aa）
链 C 1–145（145 aa）
链 C 146–212（67 aa）
链 C 215–1205（991 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 50 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TN0 SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with human ACE2 and S304 Fab and S309 Fab 提交 2022-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 324–531（208 aa） 片段：Receptor-binding domain
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 CL CHLORIDE ION × 11 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；20% v/v Ethylene glycol, 10% w/v PEG 8000, 0.1 M Tris (base)/BICINE pH 8.5, 0.1 M NDSB-256
分辨率 2.85 Å R-free 0.268
7TN0 SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with human ACE2 and S304 Fab and S309 Fab 提交 2022-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 S 324–531（208 aa） 片段：Receptor-binding domain
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 CL CHLORIDE ION × 10 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；20% v/v Ethylene glycol, 10% w/v PEG 8000, 0.1 M Tris (base)/BICINE pH 8.5, 0.1 M NDSB-256
分辨率 2.85 Å R-free 0.268
7TNW Structural and functional impact by SARS-CoV-2 Omicron spike mutations 提交 2022-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TO4 Structural and functional impact by SARS-CoV-2 Omicron spike mutations 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7TOU Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 3-RBD-down conformation; consensus state D1 提交 2022-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
7TOV Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 1-RBD-up conformation; consensus state D2 提交 2022-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
7TOW Antibody DH1058 Fab fragment bound to SARS-CoV-2 fusion peptide 提交 2022-01-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 808–833（26 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；20% PEG3000, 100mM Tris base/HCl pH 7.0, 200mM calcium acetate
分辨率 2.15 Å R-free 0.234
7TOW Antibody DH1058 Fab fragment bound to SARS-CoV-2 fusion peptide 提交 2022-01-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 808–833（26 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；20% PEG3000, 100mM Tris base/HCl pH 7.0, 200mM calcium acetate
分辨率 2.15 Å R-free 0.234
7TOX Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 3-RBD-down conformation; Subclassification D5 state 提交 2022-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
7TOY Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 3-RBD-down conformation; Subclassification D6 state 提交 2022-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.53 Å
7TOZ Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 3-RBD-down conformation; Subclassification D7 state 提交 2022-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7TP0 Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 3-RBD-down conformation; Subclassification D8 state 提交 2022-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.57 Å
7TP1 Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 3-RBD-down conformation; Subclassification D9 state 提交 2022-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.81 Å
7TP2 Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 3-RBD-down conformation; Subclassification D10 state 提交 2022-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.72 Å
7TP3 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody K288.2 提交 2022-01-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Z 319–541（223 aa）
未记录 CAC CACODYLATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 40% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol, and 5% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 8000
分辨率 2.33 Å R-free 0.231
7TP4 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody K398.22 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Z 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M ammonium formate and 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.231
7TP7 Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 1-RBD-up conformation; Subclassification D11 state 提交 2022-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
7TP8 Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 1-RBD-up conformation; Subclassification D12 state 提交 2022-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7TP9 Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 1-RBD-up conformation; Subclassification D13 state 提交 2022-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
7TPA Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 1-RBD-up conformation; Subclassification D14 state 提交 2022-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7TPC Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 1-RBD-up conformation; Subclassification D15 state 提交 2022-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.91 Å
7TPE Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 1-RBD-up conformation; Subclassification D16 state 提交 2022-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7TPF Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 1-RBD-up conformation; Subclassification D17 state 提交 2022-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7TPH Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the 2-RBD-up conformation - D3 提交 2022-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7TPI SARS-CoV-2 E406W mutant Spike ectodomain 提交 2022-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa） 片段：Ectodomain
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：Ectodomain
链 C 1–1208（1208 aa） 片段：Ectodomain
突变：E406W 突变：E406W 突变：E406W NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7TPK SARS-CoV-2 E406W mutant RBD - Local Refinement 提交 2022-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 333–526（194 aa） 片段：Receptor-binding domain
突变：E406W NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7TPL Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 variant spike protein (S-GSAS-Delta) in the M1 conformation, D4 提交 2022-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N 突变：T19R, G142D, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R683S, D950N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.87 Å
7TPR Camel nanobodies 7A3 and 8A2 broadly neutralize SARS-CoV-2 variants 提交 2022-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 15–1159（1145 aa）
链 B 15–1159（1145 aa）
链 C 15–1159（1145 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, and residues 682-685 from RRAR to GSAS 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, and residues 682-685 from RRAR to GSAS 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, and residues 682-685 from RRAR to GSAS 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.39 Å
7TYZ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with FSR22, an anti-SARS-CoV-2 DARPin 提交 2022-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
链 E 14–1208（1195 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES, 7.4, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
7TZ0 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with FSR22, an anti-SARS-CoV-2 DARPin (Local refinement of FSR22 and RBD) 提交 2022-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES, 7.4, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.17 Å
7U0P SARS-Cov2 S protein structure in complex with neutralizing monoclonal antibody 002-S21F2 提交 2022-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 20 seconds and blot time 3 seconds
分辨率 3.76 Å
7U0Q SARS-Cov2 S protein structure in complex with neutralizing monoclonal antibody 002-02 提交 2022-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；20 second wait time and 3 seconds blot time
分辨率 3.86 Å
7U0X SARS-Cov2 S protein structure in complex with neutralizing monoclonal antibody 002-13 提交 2022-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；20 second wait time and 3 seconds blot time
分辨率 3.82 Å
7U1R SARS-CoV-2 Spike-derived peptide S1185-1193 K1191N mutant (RLNEVANNL) presented by HLA-A*02:01 提交 2022-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1185–1193（9 aa） 片段：RLNEVANNL
突变：K1191N CD CADMIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；18% P4000, 0.1M HEPES 7.6, 0.1M MgCl2, 1 mM CdCl2
分辨率 1.80 Å R-free 0.196
7U2D Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody ADG20 提交 2022-02-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 5 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.16；293.15 K；0.1 M sodium citrate, pH 4.16 and 1.45 M ammonium sulfate
分辨率 2.76 Å R-free 0.259
7U2E Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody ADI-55688 提交 2022-02-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.8；293.15 K；0.08 M sodium acetate, pH 3.8, 1.6 M ammonium sulfate, and 20% (v/v) glycerol
分辨率 2.85 Å R-free 0.284
7U8E Crystal structure of antibody Ab246 in complex with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2022-03-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 6 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；291 K；0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6, 2.0 M Ammonium sulfate
分辨率 2.29 Å R-free 0.247
7U9O SARS-CoV-2 spike trimer RBD in complex with Fab NE12 提交 2022-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 14–1208（1195 aa） 片段：Receptor-binding domain
链 B 14–1208（1195 aa） 片段：Receptor-binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7U9P SARS-CoV-2 spike trimer RBD in complex with Fab NA8 提交 2022-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 14–1208（1195 aa） 片段：Receptor-binding domain
链 B 14–1208（1195 aa） 片段：Receptor-binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7UAP Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the neutralizing antibody Fab fragment, C1520 提交 2022-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7UAQ Structure of the SARS-CoV-2 NTD in complex with C1520, local refinement 提交 2022-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UAR Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the neutralizing antibody Fab fragment, C1717 提交 2022-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7UB0 SARS-CoV-2 Omicron-BA.2 3-RBD down Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-Omicron-BA.2) 提交 2022-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
7UB5 SARS-CoV-2 Omicron-BA.2 3-RBD down Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-Omicron-BA.2) 提交 2022-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7UB6 SARS-CoV-2 Omicron-BA.2 3-RBD down Spike Protein Trimer without the P986-P987 stabilizing mutations (S-GSAS-Omicron-BA.2) 提交 2022-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
7UHB SARS-CoV-2 spike in complex with AHB2-2GS-SB175 (local refinement of the RBD and AHB2) 提交 2022-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682,R683,R685,F817,A892,A899,A942,K986,V987 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7UHC SARS-CoV-2 spike in complex with AHB2-2GS-SB175 提交 2022-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
突变：R682,R683,R685,F817,A892,A899,A942,K986,V987 突变：R682,R683,R685,F817,A892,A899,A942,K986,V987 突变：R682,R683,R685,F817,A892,A899,A942,K986,V987 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UKL Cryo-EM structure of Antibody 12-16 in complex with prefusion SARS-CoV-2 Spike glycoprotein 提交 2022-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：D614G 突变：D614G 突变：D614G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 48 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
7UKM Cryo-EM structure of Antibody 12-19 in complex with prefusion SARS-CoV-2 Spike glycoprotein 提交 2022-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：D614G 突变：D614G 突变：D614G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 47 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
7UL0 Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with the ridge-binding nAb EH8 isolated from a nonvaccinated pediatric patient 提交 2022-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–537（219 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M Na HEPES pH 7.5, 12% w/v PEG 8000
分辨率 2.49 Å R-free 0.256
7UL1 Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with the neutralizing IGHV3-53-encoded antibody EH3 isolated from a nonvaccinated pediatric patient 提交 2022-04-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 329–538（210 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；294 K；0.1M sodium citrate pH 5.0, 8% w/v PEG8000
分辨率 2.65 Å R-free 0.221
7UOW SARS-Cov2 S protein structure in complex with neutralizing monoclonal antibody 034_32 提交 2022-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 20 seconds and blot time 3 seconds
分辨率 4.40 Å
7UPL SARS-Cov2 Omicron varient S protein structure in complex with neutralizing monoclonal antibody 002-S21F2 提交 2022-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1207（1207 aa）
链 B 1–1207（1207 aa）
链 C 1–1207（1207 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 20 seconds and blot time 3 seconds
分辨率 4.10 Å
7UPW Three RBD-down state of SARS-CoV-2 D614G spike in complex with the SP1-77 neutralizing antibody Fab fragment 提交 2022-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：D614G 突变：D614G 突变：D614G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å R-free 0.425
7UPX Three RBD-down state of SARS-CoV-2 D614G spike in complex with the SP1-77 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the RBD and Fab variable domains) 提交 2022-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
突变：D614G 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7UPY An antibody from single human VH-rearranging mouse neutralizes all SARS-CoV-2 variants through BA.5 by inhibiting membrane fusion 提交 2022-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：D614G 突变：D614G 突变：D614G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å R-free 0.425
7URQ Crystal Structure of SARS-CoV-2 S delta variant receptor-binding domain (RBD) in complex CoV11 Fab crystal form 1 提交 2022-04-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–537（219 aa）
突变：L452R, T478K NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；294 K；10% PEG 4000 0.2 M sodium acetate 0.1 M sodium citrate pH 5.5
分辨率 2.05 Å R-free 0.208
7URS Crystal Structure of SARS-CoV-2 S delta variant receptor-binding domain (RBD) in complex CoV11 Fab crystal form 2 提交 2022-04-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
突变：L452R, T478K NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；12% PEG 8000 0.1 M sodium phosphate pH 6.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.224
7UZ4 Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the mouse antibody Fab fragment, M8a-3 提交 2022-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
链 B 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
链 C 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V 突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V 突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UZ5 Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the mouse antibody Fab fragment, M8a-6 提交 2022-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
链 B 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
链 C 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V 突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V 突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 48 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7UZ6 Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the mouse antibody Fab fragment, M8a-28 提交 2022-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
链 B 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
链 C 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V 突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V 突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7UZ7 Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the mouse antibody Fab fragment, M8a-31 提交 2022-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
链 B 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
链 C 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V 突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V 突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UZ8 Structure of the SARS-CoV-2 Omicron BA.1 S 6P trimer in complex with the mouse antibody Fab fragment, M8a-31 提交 2022-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1212（1212 aa） 片段：Omicron BA.1 Spike 6P
链 B 1–1212（1212 aa） 片段：Omicron BA.1 Spike 6P
链 C 1–1212（1212 aa） 片段：Omicron BA.1 Spike 6P
突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V 突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V 突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UZ9 Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the mouse antibody Fab fragment, M8a-34 提交 2022-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
链 B 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
链 C 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V 突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V 突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7UZA Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the mouse antibody Fab fragment, HSW-1 提交 2022-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
链 B 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
链 C 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V 突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V 突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UZB Structure of the SARS-CoV-2 S S1 doamin in complex with the mouse antibody Fab fragment, HSW-2 提交 2022-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1213（1213 aa） 片段：Spike S1 domain
突变：P817F,P892A,P899A,P942A,P986K,P987V NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7UZC Structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with the mouse antibody Fab fragment, M8a-34 提交 2022-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 328–533（206 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2% v/v tacsimate pH 4.0, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6, 16 % PEG 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
7UZC Structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with the mouse antibody Fab fragment, M8a-34 提交 2022-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 328–533（206 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2% v/v tacsimate pH 4.0, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6, 16 % PEG 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
7UZD Structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with the mouse antibody Fab fragment, HSW-2 提交 2022-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 328–533（206 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M sodium/potassium phosphate pH 6.5, 25 % PEG 1000
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
7V20 CryoEM structure of del68-76/del679-688 prefusion-stabilized spike 提交 2021-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
7V22 Local CryoEM structure del68-76/del679-688 prefusion-stabilized spike 提交 2021-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
7V23 CryoEM structure of del68-76/del679-688 prefusion-stabilized spike in complex with the Fab of N12-9 提交 2021-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
7V24 Local CryoEM structure of del68-76/del679-688 prefusion-stabilized spike in complex with the Fab of N12-9 提交 2021-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
7V26 XG005-bound SARS-CoV-2 S 提交 2021-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
7V27 RBD/XG005 local refinement 提交 2021-08-07 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.18 Å
7V2A SARS-CoV-2 Spike trimer in complex with XG014 Fab 提交 2021-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7V76 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Beta variant (B.1.351), uncleavable form, one RBD-up conformation 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.20 Å
7V77 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Beta variant (B.1.351), uncleavable form, two RBD-up conformation 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 17 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.30 Å
7V78 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Gamma variant (P.1), one RBD-up conformation 1 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.40 Å
7V79 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Gamma variant (P.1), one RBD-up conformation 2 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.30 Å
7V7A Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Gamma variant (P.1), two RBD-up conformation 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.40 Å
7V7D Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Kappa variant (B.1.617.1), all RBD-down conformation 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.00 Å
7V7E Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Kappa variant (B.1.617.1), one RBD-up conformation 1 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 2.90 Å
7V7F Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Kappa variant (B.1.617.1), one RBD-up conformation 2 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 2.90 Å
7V7G Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Kappa variant (B.1.617.1), two RBD-up conformation 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.10 Å
7V7H Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Kappa variant (B.1.617.1), dimer of S trimer conformation 1 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
链 F 1–1208（1208 aa）
突变：G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q107H, H1101D 突变：G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q107H, H1101D 突变：G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q107H, H1101D 突变：G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q107H, H1101D 突变：G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q107H, H1101D 突变：G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q107H, H1101D NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.20 Å
7V7I Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Kappa variant (B.1.617.1), dimer of S trimer conformation 2 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
链 F 1–1208（1208 aa）
突变：G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q107H, H1101D 突变：G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q107H, H1101D 突变：G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q107H, H1101D 突变：G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q107H, H1101D 突变：G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q107H, H1101D 突变：G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q107H, H1101D NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.30 Å
7V7J Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Kappa variant (B.1.617.1), dimer of S trimer conformation 3 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
链 F 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.40 Å
7V7N Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Delta variant (B.1.617.2), all RBD-down conformation 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 2.90 Å
7V7O Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Delta variant (B.1.617.2), one RBD-up conformation 1 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 2.90 Å
7V7P Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Delta variant (B.1.617.2), one RBD-up conformation 2 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 2.90 Å
7V7Q Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Delta variant (B.1.617.2), one RBD-up conformation 3 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 2.80 Å
7V7R Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Delta variant (B.1.617.2), one RBD-up conformation 4 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 2.90 Å
7V7S Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Delta variant (B.1.617.2), one RBD-up conformation 5 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.00 Å
7V7T Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Delta variant (B.1.617.2), two RBD-up conformation 1 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.00 Å
7V7U Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Delta variant (B.1.617.2), two RBD-up conformation 2 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.00 Å
7V7V Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Delta variant (B.1.617.2), two RBD-up conformation 3 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P 突变：T19R, G142D, E156G, deletion157-158, L452R, T478K, D614G, P681R, R682G, R683S, R685S, D950N, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.10 Å
7V7Z Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Beta variant (B.1.351) in complex with Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) ectodomain, three ACE2-bound form 提交 2021-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R246I, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R246I, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R246I, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 17 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.10 Å
7V80 Local refinement of SARS-CoV-2 S-Beta variant (B.1.351) RBD and Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) ectodomain 提交 2021-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：R246I, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.90 Å
7V81 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Gamma variant (P.1) in complex with Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) ectodomain, two ACE2-bound form 提交 2021-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.20 Å
7V82 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Gamma variant (P.1) in complex with Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) ectodomain, three ACE2-bound form conformation 1 提交 2021-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 2.80 Å
7V83 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Gamma variant (P.1) in complex with Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) ectodomain, three ACE2-bound form conformation 2 提交 2021-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：G142D, E154K, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：G142D, E154K, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：G142D, E154K, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 2.80 Å
7V84 Local refinement of SARS-CoV-2 S-Gamma variant (P.1) RBD and Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) ectodomain 提交 2021-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.00 Å
7V85 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Kappa variant (B.1.617.1) in complex with Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) ectodomain, two ACE2-bound form 提交 2021-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：E154K, E484Q, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q1071H, H1101D 突变：E154K, E484Q, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q1071H, H1101D 突变：E154K, E484Q, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q1071H, H1101D NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.30 Å
7V86 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Kappa variant (B.1.617.1) in complex with Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) ectodomain, three ACE2-bound form 提交 2021-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：G142D, E154K, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q1071H, H1101D 突变：G142D, E154K, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q1071H, H1101D 突变：G142D, E154K, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P, Q1071H, H1101D NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 2.80 Å
7V87 Local refinement of SARS-CoV-2 S-Kappa variant (B.1.617.1) RBD and Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) ectodomain 提交 2021-08-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.30 Å
7V88 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Delta variant (B.1.617.2) in complex with Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) ectodomain, two ACE2-bound form 提交 2021-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.30 Å
7V89 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Delta variant (B.1.617.2) in complex with Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) ectodomain, three ACE2-bound form conformation 1 提交 2021-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 2.80 Å
7V8A Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Delta variant (B.1.617.2) in complex with Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) ectodomain, three ACE2-bound form conformation 2 提交 2021-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 2.70 Å
7V8B Local refinement of SARS-CoV-2 S-Delta variant (B.1.617.2) RBD and Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) ectodomain 提交 2021-08-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.20 Å
7V8C Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-Beta variant (B.1.351), Cleavable form, one RBD-up conformation 提交 2021-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 17 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 seconds before plunging; blot force: 0; waiting time: 30s
分辨率 3.40 Å
7VHH Delta variant of SARS-CoV-2 Spike protein 提交 2021-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1148（1135 aa）
链 B 14–1148（1135 aa）
链 C 14–1148（1135 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.45
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7VHJ Furin Site deletion of SARS-CoV-2 spike 提交 2021-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1147（1134 aa）
链 B 14–1147（1134 aa）
链 C 14–1147（1134 aa）
突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7VHK S1-S2 deletion S-2P trimer(3 down) 提交 2021-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 27–1147（1121 aa）
链 B 27–1147（1121 aa）
链 C 27–1147（1121 aa）
突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7VHL Double deletion S-2P trimer(1 Up) 提交 2021-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1147（1134 aa）
链 B 14–1147（1134 aa）
链 C 14–1147（1134 aa）
突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7VHM Double deletion S-2P trimer(3 down) 提交 2021-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1147（1134 aa）
链 B 14–1147（1134 aa）
链 C 14–1147（1134 aa）
突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7VHN Spike of SARS-CoV-2 spike protein(1 up) 提交 2021-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1148（1135 aa）
链 B 14–1148（1135 aa）
链 C 14–1148（1135 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7VMU Crystal Structure of SARS-CoV Spike Receptor-Binding Domain Complexed with Neutralizing Antibody 提交 2021-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 335–515（181 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；20% w/v PEG3350, 0.2M potassium citrate tribasic
分辨率 2.89 Å R-free 0.273
7VNB Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with a human single domain antibody n3113 提交 2021-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–531（213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；4.3M sodium chloride and 0.1M HEPES, pH 7.5
分辨率 2.27 Å R-free 0.203
7VNC Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with a human single domain antibody n3113 (UDD-state, state 1) 提交 2021-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7VND Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with a human single domain antibody n3113 (UUD-state, state 2) 提交 2021-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7VNE Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with a human single domain antibody n3113.1 (UUU-state) 提交 2021-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G,R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7VOA Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with aRBD5 提交 2021-10-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 321–528（208 aa） 片段：UNP residues 321-528
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.15 K；0.1M Sodium cacodylate pH 5.5, 25%(w/v) PEG 4000
分辨率 1.80 Å R-free 0.226
7VQ0 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P86 提交 2021-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：D614G, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
7VRV VAS5 Spike (1 RBD up) 提交 2021-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 13–1213（1201 aa）
链 B 13–1213（1201 aa）
链 C 13–1213（1201 aa）
突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7VRW VAS5 Spike (3 RBD down) 提交 2021-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 13–1213（1201 aa）
链 B 13–1213（1201 aa）
链 C 13–1213（1201 aa）
突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7VX1 SARS-CoV-2 Beta variant spike protein in open state 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7VX4 ACE2-RBD in SARS-CoV-2 Beta variant S-ACE2 complex 提交 2021-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–1206（1206 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7VX5 ACE2-RBD in SARS-CoV-2 Kappa variant S-ACE2 complex 提交 2021-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7VX9 SARS-CoV-2 Kappa variant spike protein in complex wth ACE2, state C1 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 14–1146（1133 aa）
链 B 14–1146（1133 aa）
链 D 14–1146（1133 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7VXA SARS-CoV-2 Kappa variant spike protein in complex with ACE2, state C2a 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7VXB SARS-CoV-2 Kappa variant spike protein in C2b state 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7VXC SARS-CoV-2 Kappa variant spike protein in C3 state 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7VXD SARS-CoV-2 spike protein in complex with ACE2, Beta variant, C1 state 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 D 1–1206（1206 aa）
突变：deletions 241-243 突变：deletions 241-243 突变：deletions 241-243 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7VXE SARS-CoV-2 Kappa variant spike protein in open state 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7VXF SARS-CoV-2 spike protein in complex with ACE2, Beta variant, C2B state 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 D 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7VXI SARS-CoV-2 Kappa variant spike protein in transition state 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7VXK SARS-CoV-2 spike protein in complex with ACE2, Beta variant, C2A state 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 D 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7VXM SARS-CoV-2 spike protein in complex with ACE2, Beta variant, C3 state 提交 2021-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 D 1–1206（1206 aa）
突变：deletions 241-243 突变：deletions 241-243 突变：deletions 241-243 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7VYR Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with the D27 neutralizing antibody Fab fragment 提交 2021-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；20% (v/v) PEG 3350, 200mM NH4Cl
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
7VYR Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with the D27 neutralizing antibody Fab fragment 提交 2021-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；20% (v/v) PEG 3350, 200mM NH4Cl
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
7VZT A human neutralizing antibody targeting SARS-CoV-2 RBD 提交 2021-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–532（200 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100mM HEPES (pH 7.5), 40% (v/v) Polyethylene glycol monomethyl ether 400
分辨率 3.41 Å R-free 0.263
7W1S Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain in complex with neutralizing nanobody Nb-007 提交 2021-11-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 320–537（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium chloride, 20% w/v Polyethylene glycol 3350, pH 6.9
分辨率 2.00 Å R-free 0.224
7W6U Structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain complexed with its receptor equine ACE2 提交 2021-12-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa） 片段：UNP residues 319-541
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10% (w/v) PEG 1000, 10% (w/v) PEG 8000
分辨率 2.56 Å R-free 0.227
7W8S Structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain Y453F mutation complexed with American mink ACE2 提交 2021-12-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa） 片段：Y453F
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
7W92 Open state of SARS-CoV-2 Delta variant spike protein 提交 2021-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7W94 Transition state of SARS-CoV-2 Delta variant spike protein 提交 2021-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7W98 SARS-CoV-2 Delta S-ACE2-C1 提交 2021-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7W99 SARS-CoV-2 Delta S-ACE2-C2a 提交 2021-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
链 D 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7W9B SARS-CoV-2 Delta S-ACE2-C2b 提交 2021-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
链 D 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7W9C SARS-CoV-2 Delta S-ACE2-C3 提交 2021-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
链 D 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7W9E SARS-CoV-2 Delta S-8D3 提交 2021-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7W9F SARS-CoV-2 Delta S-RBD-8D3 提交 2021-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7W9I SARS-CoV-2 Delta S-RBD-ACE2 提交 2021-12-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WA1 Structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain F486L mutation complexed with American mink ACE2 提交 2021-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
突变：F486L ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7WBH overall structure of hu33 and spike 提交 2021-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 27–1146（1120 aa）
链 B 27–1146（1120 aa）
链 C 27–1146（1120 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7WBL Cryo-EM structure of human ACE2 complexed with SARS-CoV-2 Omicron RBD 提交 2021-12-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WBP Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Omicron variant spike glycoprotein in complex with its receptor human ACE2 提交 2021-12-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M MES pH 6.5,10%w/v PEG 5000 MME,12% v/v 1-propanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.204
7WBQ Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Delta variant spike glycoprotein in complex with its receptor human ACE2 提交 2021-12-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M MES pH 6.5,10%w/v PEG 5000 MME,12% v/v 1-propanol
分辨率 3.34 Å R-free 0.226
7WBQ Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Delta variant spike glycoprotein in complex with its receptor human ACE2 提交 2021-12-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M MES pH 6.5,10%w/v PEG 5000 MME,12% v/v 1-propanol
分辨率 3.34 Å R-free 0.226
7WBZ Crystal structure of the SARS-Cov-2 RBD in complex with Fab 2303 提交 2021-12-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–529（211 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；309 K；0.2 M sodium tartrate dibasic dihydrate, 14% (w/v) polyethylene glycol 3350
分辨率 2.42 Å R-free 0.220
7WCD Cryo EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with TAU-2212 mAbs in conformation 4 提交 2021-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1208（1208 aa）
链 H 1–1208（1208 aa）
链 J 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S,K986P,V987P 突变：R682G, R683S, R685S,K986P,V987P 突变：R682G, R683S, R685S,K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7WCR RBD-1 of SARS-CoV-2 Beta spike in complex with S5D2 Fab 提交 2021-12-20 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7WCZ SARS-CoV-2 Beta spike in complex with one S5D2 Fab 提交 2021-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7WD0 SARS-CoV-2 Beta spike in complex with two S5D2 Fabs 提交 2021-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7WD1 Crystal structure of R14 bound to SARS-CoV-2 RBD 提交 2021-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 333–528（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.10% w/v n-Octyl-b-D-glucoside, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.5), 22% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.239
7WD1 Crystal structure of R14 bound to SARS-CoV-2 RBD 提交 2021-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–528（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.10% w/v n-Octyl-b-D-glucoside, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.5), 22% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.239
7WD2 Crystal structure of S43 bound to SARS-CoV-2 RBD 提交 2021-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 333–530（198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Lithium sulfate, 0.1M Tris (pH 8.5), 30% w/v PEG 4000
分辨率 2.69 Å R-free 0.229
7WD2 Crystal structure of S43 bound to SARS-CoV-2 RBD 提交 2021-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–530（198 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Lithium sulfate, 0.1M Tris (pH 8.5), 30% w/v PEG 4000
分辨率 2.69 Å R-free 0.229
7WD7 SARS-CoV-2 Beta spike in complex with three S5D2 Fabs 提交 2021-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7WD8 SARS-CoV-2 Beta spike SD1 in complex with S3H3 Fab 提交 2021-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7WD9 SARS-CoV-2 Beta spike in complex with three S3H3 Fabs 提交 2021-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7WDF SARS-CoV-2 Beta spike in complex with two S3H3 Fabs 提交 2021-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7WE7 SARS-CoV-2 Omicron variant spike protein in complex with Fab XGv282 提交 2021-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1273（1273 aa）
链 E 1–1273（1273 aa）
链 G 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7WE8 SARS-CoV-2 Omicron variant spike protein in complex with Fab XGv265 提交 2021-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7WE9 SARS-CoV-2 Omicron variant spike protein in complex with Fab XGv289 提交 2021-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 F 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7WEA SARS-CoV-2 Omicron variant spike protein in complex with two XGv347 binding to one close state RBD and one open state RBD 提交 2021-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：deletions 突变：deletions 突变：deletions NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7WEB SARS-CoV-2 Omicron variant spike protein with two XGv347 binding to two open state RBDs 提交 2021-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
链 D 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7WEC SARS-CoV-2 Omicron variant spike protein with three XGv347 Fabs binding to three closed state RBDs 提交 2021-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7WED SARS-CoV-2 Omicron variant spike RBD in complex with Fab XGv347 提交 2021-12-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 330–530（201 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7WEE SARS-CoV-2 Omicron variant spike RBD in complex with Fab XGv265 提交 2021-12-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–1273（1273 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7WEF SARS-CoV-2 Omicron variant spike RBD in complex with Fab XGv289 提交 2021-12-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 330–530（201 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7WEV SARS-COV-2 BETA VARIANT SPIKE PROTEIN IN TRANSITION STATE 提交 2021-12-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7WG6 Neutral Omicron Spike Trimer 提交 2021-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1162（1149 aa）
链 B 14–1162（1149 aa）
链 C 14–1162（1149 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WG7 Acidic Omicron Spike Trimer 提交 2021-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7WG8 Delta Spike Trimer(3 RBD Down) 提交 2021-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1148（1135 aa）
链 B 14–1148（1135 aa）
链 C 14–1148（1135 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7WG9 Delta Spike Trimer(1 RBD Up) 提交 2021-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7WGB Neutral Omicron Spike Trimer in complex with ACE2 提交 2021-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7WGC Neutral Omicron Spike Trimer in complex with ACE2. 提交 2021-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7WGV SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer in closed state 提交 2021-12-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 EIC LINOLEIC ACID × 3 BLR 3-[5-[(Z)-(4-ethenyl-3-methyl-5-oxidanylidene-pyrrol-2-ylidene)methyl]-2-[[5-[(Z)-(3-ethenyl-4-methyl-5-oxidanylidene-pyrrol-2-ylidene)methyl]-3-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-4-methyl-1H-pyrrol-2-yl]methyl]-4-methyl-1H-pyrrol-3-yl]propanoic acid × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7WGX SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer in closed state after treatment with Cathepsin L 提交 2021-12-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 BLR 3-[5-[(Z)-(4-ethenyl-3-methyl-5-oxidanylidene-pyrrol-2-ylidene)methyl]-2-[[5-[(Z)-(3-ethenyl-4-methyl-5-oxidanylidene-pyrrol-2-ylidene)methyl]-3-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-4-methyl-1H-pyrrol-2-yl]methyl]-4-methyl-1H-pyrrol-3-yl]propanoic acid × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7WGY SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer in Intermediate state 提交 2021-12-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7WGZ SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer in open state 提交 2021-12-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7WH8 SARS-CoV-2 spike in complex with the ZB8 neutralizing antibody Fab (focused refinement on Fab-RBD) 提交 2021-12-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 317–593（277 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7WHB SARS-CoV-2 spike in complex with the ZB8 neutralizing antibody Fab (3U) 提交 2021-12-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 27–1146（1120 aa）
链 B 27–1146（1120 aa）
链 C 27–1146（1120 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.67 Å
7WHD SARS-CoV-2 spike in complex with the ZB8 neutralizing antibody Fab (2u1d) 提交 2021-12-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 27–1146（1120 aa）
链 B 27–1146（1120 aa）
链 C 27–1146（1120 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
7WHH Crystal structure of SARS-CoV-2 omicron RBD and human ACE2 提交 2021-12-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–526（194 aa） 片段：Omicron RBD
未记录 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M L-Proline, 0.1 M HEPES pH 7.5, 10% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.231
7WHI The state 2 complex structure of Omicron spike with Bn03 (2-up RBD, 4 nanobodies) 提交 2021-12-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.93 Å
7WHJ The state 1 complex structure of Omicron spike with Bn03 (1-up RBD, 3 nanobodies) 提交 2021-12-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 40 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
7WHK The state 3 complex structure of Omicron spike with Bn03 (2-up RBD, 5 nanobodies) 提交 2021-12-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
7WHZ SARS-CoV-2 spike protein in complex with three human neutralizing antibodies 提交 2022-01-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
7WI0 SARS-CoV-2 Omicron variant spike in complex with three human neutralizing antibodies 提交 2022-01-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
7WJY Omicron spike trimer with 6m6 antibody 提交 2022-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 G 1–1208（1208 aa）
突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
7WJZ Omicron Spike bitrimer with 6m6 antibody 提交 2022-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 B 1–1208（1208 aa）
链 I 1–1208（1208 aa）
链 J 1–1208（1208 aa）
链 K 1–1208（1208 aa）
链 L 1–1208（1208 aa）
链 M 1–1208（1208 aa）
突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 49 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.34 Å
7WK0 Local refine of Omicron spike bitrimer with 6m6 antibody 提交 2022-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 331–528（198 aa） 片段：RBD
链 F 331–528（198 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
7WK2 SARS-CoV-2 Omicron S-close 提交 2022-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7WK3 SARS-CoV-2 Omicron S-open 提交 2022-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WK4 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron spike protein with ACE2, C1 state 提交 2022-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–1205（1205 aa）
链 C 1–1205（1205 aa）
链 D 1–1205（1205 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
7WK5 Cryo-EM structure of Omicron S-ACE2, C2 state 提交 2022-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–1205（1205 aa）
链 C 1–1205（1205 aa）
链 D 1–1205（1205 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
7WK6 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron spike protein with human ACE2 (focus refinement on RBD-1/ACE2) 提交 2022-01-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.67 Å
7WK8 SARS-CoV-2 Omicron spike protein SD1 in complex with S3H3 Fab 提交 2022-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.61 Å
7WK9 SARS-CoV-2 Omicron open state spike protein in complex with S3H3 Fab 提交 2022-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
7WKA SARS-CoV-2 Omicron closed state spike protein in complex with S3H3 Fab 提交 2022-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å
7WLC SARS-CoV-2 Omicron variant spike RBD in complex with Fab XGv282 提交 2022-01-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 330–530（201 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7WLY Cryo-EM structure of the Omicron S in complex with 35B5 Fab(1 down- and 2 up RBDs) 提交 2022-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WLZ Cryo-EM structure of the Omicron S in complex with 35B5 Fab(1 down-, 1 up- and 1 invisible RBDs) 提交 2022-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
7WM0 Cryo-EM structure of the Omicron RBD in complex with 35B5 Fab( local refinement of the RBD and 35B5 Fab) 提交 2022-01-14 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7WN2 Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain (RBD) in complex with NCV2SG53 Fab 提交 2022-01-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 321–536（216 aa） 片段：Receptor-binding domain
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.25 M ammonium sulfate, 22.5% PEG3350, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.279
7WN2 Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain (RBD) in complex with NCV2SG53 Fab 提交 2022-01-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 321–536（216 aa） 片段：Receptor-binding domain
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.25 M ammonium sulfate, 22.5% PEG3350, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.279
7WNB Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain (RBD) in complex with NCV2SG48 Fab 提交 2022-01-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 321–536（216 aa） 片段：Receptor-binding domain
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.5 M ammonium sulfate, 19% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 2.18 Å R-free 0.281
7WNM Structure of SARS-CoV-2 Gamma variant receptor-binding domain complexed with high affinity human ACE2 mutant (T27F,R273Q) 提交 2022-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 319–541（223 aa） 片段：Receptor-binding domain
突变：N501Y ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；0.1 M magnesium chloride, 0.1 M MES (pH 6.0) and 8% w/v polyethylene glycol 6000
分辨率 2.70 Å R-free 0.223
7WO4 SARS-CoV-2 Spike in complex with IgG 553-15 (S-553-15 dimer trimer ) 提交 2022-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 J 1–1208（1208 aa）
链 K 1–1208（1208 aa）
链 L 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 90 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.47 Å
7WO5 SARS-CoV-2 Spike in complex with IgG 553-15 (S-553-15 trimer) 提交 2022-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
7WO7 Locally refined region of SARS-CoV-2 Spike in complex with IgG 553-15 提交 2022-01-20 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7WOA SARS-CoV-2 Spike in complex with IgG 553-60 (1-up trimer) 提交 2022-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
7WOB SARS-CoV-2 Spike in complex with IgG 553-60 (2-up trimer) 提交 2022-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 38 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
7WOC Locally refined region of SARS-CoV-2 Spike in complex with IgG 553-60 提交 2022-01-21 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7WOG SARS-CoV-2 Omicron S monomer complexed with 553-49 提交 2022-01-21 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 331–528（198 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.06 Å
7WON Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S2P trimer in complex with neutralizing antibody VacW-209 (local refinement) 提交 2022-01-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 333–521（189 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7WOP The local refined map of Omicron spike with bispecific antibody FD01 提交 2022-01-22 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–528（198 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
7WOQ The state 1 of Omicron Spike with bispecific antibody FD01 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
7WOR The state 2 of Omicron Spike with bispecific antibody FD01 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7WOS The state 3 of Omicron Spike with bispecific antibody FD01 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.91 Å
7WOU The state 4 of Omicron Spike with bispecific antibody FD01 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
7WOV The state 5 of Omicron Spike with bispecific antibody FD01 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.87 Å
7WOW The state 6 of Omicron Spike with bispecific antibody FD01 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.11 Å
7WOW The state 6 of Omicron Spike with bispecific antibody FD01 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1208（1208 aa）
链 K 1–1208（1208 aa）
链 L 1–1208（1208 aa）
突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 突变：hexaPro mutations 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.11 Å
7WP0 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Delta S6P trimer in complex with neutralizing antibody VacW-209 (local refinement) 提交 2022-01-22 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 333–521（189 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
7WP1 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Mu S6P trimer in complex with neutralizing antibody VacW-209 (local refinement) 提交 2022-01-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 333–521（189 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.77 Å
7WP2 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 C.1.2 S6P trimer in complex with neutralizing antibody VacW-209 (local refinement) 提交 2022-01-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 333–521（189 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
7WP5 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron S6P trimer in complex with neutralizing antibody VacW-209 (local refinement) 提交 2022-01-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 333–521（189 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7WP6 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 recombinant spike protein STFK in complex with three neutralizing antibodies 提交 2022-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 333–521（189 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.81 Å
7WP8 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 recombinant spike protein STFK1628x in complex with three neutralizing antibodies 提交 2022-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 336–518（183 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.88 Å
7WP9 SARS-CoV-2 Omicron Variant SPIKE trimer, all RBDs down 提交 2022-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
7WPA SARS-CoV-2 Omicron Variant SPIKE trimer complexed with ACE2 提交 2022-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.77 Å
7WPB SARS-CoV-2 Omicron Variant RBD complexed with ACE2 提交 2022-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R684S, R685S, K989P, V990P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
7WPC The second RBD of SARS-CoV-2 Omicron Variant in complexed with RBD-ACE2 提交 2022-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.57 Å
7WPD SARS-CoV-2 Omicron Variant S Trimer complexed with one JMB2002 Fab 提交 2022-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.18 Å
7WPE SARS-CoV-2 Omicron Variant S Trimer complexed with two JMB2002 Fab 提交 2022-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：Q498R, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：Q498R, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：Q498R, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.69 Å
7WPF SARS-CoV-2 Omicron Variant S Trimer complexed with three JMB2002 Fab 提交 2022-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：Q498R, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：Q498R, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：Q498R, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.92 Å
7WPH SARS-CoV2 RBD bound to Fab06 提交 2022-01-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–591（273 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2M magnesium formate dihydrate, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.269
7WPH SARS-CoV2 RBD bound to Fab06 提交 2022-01-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–591（273 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2M magnesium formate dihydrate, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.269
7WQV Crystal structure of a neutralizing monoclonal antibody (Ab08) in complex with SARS-CoV-2 receptor-binding domain (RBD) 提交 2022-01-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 330–531（202 aa） 片段：RBD
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Magnesium chloride hexahydrate, calcium chloride dihydrate, sodium HEPES, MOPS (acid), MPD, PEG 1000, PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.251
7WQV Crystal structure of a neutralizing monoclonal antibody (Ab08) in complex with SARS-CoV-2 receptor-binding domain (RBD) 提交 2022-01-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 330–531（202 aa） 片段：RBD
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Magnesium chloride hexahydrate, calcium chloride dihydrate, sodium HEPES, MOPS (acid), MPD, PEG 1000, PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.251
7WQV Crystal structure of a neutralizing monoclonal antibody (Ab08) in complex with SARS-CoV-2 receptor-binding domain (RBD) 提交 2022-01-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 330–531（202 aa） 片段：RBD
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Magnesium chloride hexahydrate, calcium chloride dihydrate, sodium HEPES, MOPS (acid), MPD, PEG 1000, PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.251
7WQV Crystal structure of a neutralizing monoclonal antibody (Ab08) in complex with SARS-CoV-2 receptor-binding domain (RBD) 提交 2022-01-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 330–531（202 aa） 片段：RBD
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Magnesium chloride hexahydrate, calcium chloride dihydrate, sodium HEPES, MOPS (acid), MPD, PEG 1000, PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.251
7WQV Crystal structure of a neutralizing monoclonal antibody (Ab08) in complex with SARS-CoV-2 receptor-binding domain (RBD) 提交 2022-01-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 330–531（202 aa） 片段：RBD
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Magnesium chloride hexahydrate, calcium chloride dihydrate, sodium HEPES, MOPS (acid), MPD, PEG 1000, PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.251
7WQV Crystal structure of a neutralizing monoclonal antibody (Ab08) in complex with SARS-CoV-2 receptor-binding domain (RBD) 提交 2022-01-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 330–531（202 aa） 片段：RBD
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Magnesium chloride hexahydrate, calcium chloride dihydrate, sodium HEPES, MOPS (acid), MPD, PEG 1000, PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.251
7WQV Crystal structure of a neutralizing monoclonal antibody (Ab08) in complex with SARS-CoV-2 receptor-binding domain (RBD) 提交 2022-01-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 M 330–531（202 aa） 片段：RBD
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Magnesium chloride hexahydrate, calcium chloride dihydrate, sodium HEPES, MOPS (acid), MPD, PEG 1000, PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.251
7WQV Crystal structure of a neutralizing monoclonal antibody (Ab08) in complex with SARS-CoV-2 receptor-binding domain (RBD) 提交 2022-01-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 O 330–531（202 aa） 片段：RBD
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Magnesium chloride hexahydrate, calcium chloride dihydrate, sodium HEPES, MOPS (acid), MPD, PEG 1000, PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.251
7WR8 Local CryoEM structure of the SARS-CoV-2 S6P(B.1.1.529) in complex with BD55-3152 Fab 提交 2022-01-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 334–526（193 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7WRH Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike protein in complex with mouse ACE2 提交 2022-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 15–1208（1194 aa）
链 B 15–1208（1194 aa）
链 C 15–1208（1194 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.66 Å
7WRI Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron spike receptor-binding domain in complex with mouse ACE2 提交 2022-01-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 14–1205（1192 aa） 片段：UNP residues 14-1205
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
7WRJ Local CryoEM structure of the SARS-CoV-2 S6P(B.1.1.529) in complex with BD55-4637 Fab 提交 2022-01-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 334–526（193 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
7WRL Local structure of BD55-1239 Fab and SARS-COV2 Omicron RBD complex 提交 2022-01-27 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 334–526（193 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.51 Å
7WRO Local structure of BD55-3372 and delta spike 提交 2022-01-27 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 334–516（183 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WRV The interface of JMB2002 Fab binds to SARS-CoV-2 Omicron Variant S 提交 2022-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R684G, R685G, K989P, V990P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.47 Å
7WRY Local structure of BD55-3546 Fab and SARS-COV2 Delta RBD complex 提交 2022-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 334–526（193 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.28 Å
7WRZ Local resolution of BD55-5840 Fab and SARS-COV2 Omicron RBD 提交 2022-01-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 335–527（193 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.26 Å
7WS0 Structures of Omicron Spike complexes illuminate broad-spectrum neutralizing antibody development 提交 2022-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7WS1 Structures of Omicron Spike complexes illuminate broad-spectrum neutralizing antibody development 提交 2022-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WS2 Structures of Omicron Spike complexes illuminate broad-spectrum neutralizing antibody development 提交 2022-01-28 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–530（200 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7WS3 Structures of Omicron Spike complexes illuminate broad-spectrum neutralizing antibody development 提交 2022-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7WS4 Ultrapotent SARS-CoV-2 neutralizing antibodies with protective efficacy against newly emerged mutational variants 提交 2022-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：deletion (H69-V70,V143-Y145), insertion(214 EPE) 突变：deletion (H69-V70,V143-Y145), insertion(214 EPE) 突变：deletion (H69-V70,V143-Y145), insertion(214 EPE) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7WS5 Structures of Omicron Spike complexes illuminate broad-spectrum neutralizing antibody development 提交 2022-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：RRAR(682-685)GSAS, K986P, V987P 突变：RRAR(682-685)GSAS, K986P, V987P 突变：RRAR(682-685)GSAS, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7WS6 Structures of Omicron Spike complexes illuminate broad-spectrum neutralizing antibody development 提交 2022-01-28 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 319–536（218 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7WS7 Structures of Omicron Spike complexes illuminate broad-spectrum neutralizing antibody development 提交 2022-01-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 326–530（205 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WS8 Structures of Omicron Spike complexes illuminate broad-spectrum neutralizing antibody development 提交 2022-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7WS9 Structures of Omicron Spike complexes illuminate broad-spectrum neutralizing antibody development 提交 2022-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7WSA Structures of Omicron Spike complexes illuminate broad-spectrum neutralizing antibody development 提交 2022-01-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 330–530（201 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7WSC Local structure of BD55-3500 and omicron RBD complex 提交 2022-01-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
7WSE Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain complexed with its receptor minke whale ACE2 提交 2022-01-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.93 Å
7WSH Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain in complex with sea lion ACE2 提交 2022-01-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7WSK Crystal structure of SARS-CoV-2 Omicron spike receptor-binding domain in complex with civet ACE2 提交 2022-01-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Potassium thiocyanate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
7WT7 SARS-CoV-2 Omicron variant spike in complex with Fab 9A8 (State 1) 提交 2022-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 41 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WT8 SARS-CoV-2 Omicron variant spike in complex with Fab 9A8 (State 2) 提交 2022-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7WT9 SARS-CoV-2 Omicron variant spike RBD in complex with Fab 9A8 提交 2022-02-04 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–1273（1273 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7WTF SARS-CoV-2 Omicron variant spike in complex with Fab XGv051 提交 2022-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 B 14–1162（1149 aa）
链 C 14–1162（1149 aa）
链 D 14–1162（1149 aa）
突变：deletion, insersion, K986P, V987P 突变：deletion, insersion, K986P, V987P 突变：deletion, insersion, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7WTG SARS-CoV-2 Omicron variant spike RBD in complex with Fab XGv051 提交 2022-02-04 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 330–530（201 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7WTH SARS-CoV-2 Omicron variant spike RBD in complex with Fab XGv264 提交 2022-02-04 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 330–530（201 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7WTI SARS-CoV-2 Omicron variant spike in complex with Fab XGv264 提交 2022-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7WTJ SARS-CoV-2 Omicron variant spike RBD in complex with Fab XGv286 提交 2022-02-04 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 330–530（201 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WTK SARS-CoV-2 Omicron variant spike in complex with Fab XGv286 提交 2022-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1162（1149 aa）
链 B 14–1162（1149 aa）
链 C 14–1162（1149 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7WUE Crystal structure of SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain in complex with the monoclonal antibody m31A7 提交 2022-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–527（195 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；2.0 M Ammonia sulfate, 0.1M sodium acetate pH 4.6
分辨率 3.20 Å R-free 0.295
7WUE Crystal structure of SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain in complex with the monoclonal antibody m31A7 提交 2022-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 333–527（195 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；2.0 M Ammonia sulfate, 0.1M sodium acetate pH 4.6
分辨率 3.20 Å R-free 0.295
7WUH SARS-CoV-2 Spike in complex with Fab of m31A7 提交 2022-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
链 E 14–1208（1195 aa）
突变：D614G 突变：D614G 突变：D614G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
7WVL Structure of P4A2 Fab in complex with Spike-RBD from SARS-CoV-2 提交 2022-02-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 332–532（201 aa） 片段：Receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；20% Peg 5K MME, 0.2 M Magnesium formate
分辨率 3.00 Å R-free 0.279
7WVN SARS-CoV-2 Omicron S-open 提交 2022-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1205（1205 aa）
链 B 1–1205（1205 aa）
链 C 1–1205（1205 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WVO SARS-CoV-2 Omicron S-open-2 提交 2022-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1205（1205 aa）
链 B 1–1205（1205 aa）
链 C 1–1205（1205 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
7WVP Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron Spike protein with human ACE2 receptor, C2 state 提交 2022-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7WVQ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron Spike protein with human ACE2 receptor, C3 state 提交 2022-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.04 Å
7WWI SARS-CoV-2 BA.1 Spike trimer in complex with 55A8 Fab in the class 1 conformation 提交 2022-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7WWJ SARS-CoV-2 BA.1 Spike trimer in complex with 55A8 Fab in the class 2 conformation 提交 2022-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7WWK Local refinement of the SARS-CoV-2 BA.1 Spike trimer in complex with 55A8 Fab 提交 2022-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 334–527（194 aa）
链 C 334–527（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WWL S protein of Delta variant in complex with ZWD12 提交 2022-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：Six proline substitutions at residues 817, 892, 899, 942, 986, and 987 突变：Six proline substitutions at residues 817, 892, 899, 942, 986, and 987 突变：Six proline substitutions at residues 817, 892, 899, 942, 986, and 987 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7WWM S protein of Delta variant in complex with ZWC6 提交 2022-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：Six proline substitutions at residues 817, 892, 899, 942, 986, and 987 突变：Six proline substitutions at residues 817, 892, 899, 942, 986, and 987 突变：Six proline substitutions at residues 817, 892, 899, 942, 986, and 987 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7WXZ Crystal structure of the recombinant protein HR121 from the S2 protein of SARS-CoV-2 提交 2022-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 912–988（77 aa）
链 A 1163–1206（44 aa）
链 B 912–988（77 aa）
链 B 1163–1206（44 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.2M sodium fluoride, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.41 Å R-free 0.294
7WXZ Crystal structure of the recombinant protein HR121 from the S2 protein of SARS-CoV-2 提交 2022-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 912–988（77 aa）
链 C 1163–1206（44 aa）
链 D 912–988（77 aa）
链 D 1163–1206（44 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.2M sodium fluoride, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.41 Å R-free 0.294
7WZ1 SARS-CoV-2 Omicron Spike trimer 提交 2022-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WZ2 SARS-CoV-2 (D614G) Spike trimer 提交 2022-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7X08 S protein of SARS-CoV-2 in complex with 2G1 提交 2022-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7X1M The complex structure of Omicron BA.1 RBD with BD604, S309,and S304 提交 2022-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 M 333–541（209 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.74 Å
7X2H Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain bound with 6-2C Fab 提交 2022-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 334–528（195 aa） 片段：receptor-binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1M BIS-TRIS pH 6.5, 16% w/v Polyethylene glycol 10000
分辨率 2.10 Å R-free 0.269
7X2H Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain bound with 6-2C Fab 提交 2022-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 334–528（195 aa） 片段：receptor-binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1M BIS-TRIS pH 6.5, 16% w/v Polyethylene glycol 10000
分辨率 2.10 Å R-free 0.269
7X2K Crystal structure of nanobody Nb70 with antibody 1F11 fab and SARS-CoV-2 RBD 提交 2022-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 333–526（194 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M DL-Malic acid pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.245
7X2L Crystal structure of nanobody 3-2A2-4 with SARS-CoV-2 RBD 提交 2022-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–528（196 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1M DL-Malic acid pH7.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.287
7X2M Crystal structure of nanobody 1-2C7 with SARS-CoV-2 RBD 提交 2022-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–529（197 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Bis Tris pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.207
7X63 SARS-CoV-2-Beta-RBD and BD-236-GWP/P-VK antibody complex 提交 2022-03-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–537（219 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；4% v/v Tacsimate pH 8.0, 12% w/v Polyethylene Glycol 3350
分辨率 2.24 Å R-free 0.224
7X66 SARS-CoV-2-Omicron-RBD and BD-236-GWP/P-VK antibody complex 提交 2022-03-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–528（210 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；4% v/v Tacsimate pH 6.0, 12% w/v Polyethylene Glycol 3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.238
7X6A SARS-CoV-2 BA.2 variant spike protein in complex with Fab BD55-5840 提交 2022-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 D 1–1273（1273 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7X7D SARS-CoV-2 Delta RBD and Nb22 提交 2022-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 334–527（194 aa） 片段：Delta RBD
链 D 334–527（194 aa） 片段：Delta RBD
链 E 334–527（194 aa） 片段：Delta RBD
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；290 K；0.1 M Tris (pH 7.0), 37.5% Jeffamine
分辨率 2.92 Å R-free 0.256
7X7E SARS-CoV-2 RBD and Nb22 提交 2022-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 334–527（194 aa）
链 D 334–527（194 aa）
链 F 334–527（194 aa）
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；290 K；0.1 M HEPES (pH 480 7.0), 5% MPD, 10% PEG 10000
分辨率 2.67 Å R-free 0.249
7X7N 3D model of the 3-RBD up single trimeric spike protein of SARS-CoV2 in the presence of synthetic peptide SIH-5. 提交 2022-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.47 Å
7X7O SARS-CoV-2 spike RBD in complex with neutralizing antibody UT28K 提交 2022-03-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 322–536（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Citric acid pH5.0, 1.0 M Lithium chloride, 10% (w/v) PEG 6000
分辨率 3.75 Å R-free 0.336
7X7O SARS-CoV-2 spike RBD in complex with neutralizing antibody UT28K 提交 2022-03-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 322–536（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Citric acid pH5.0, 1.0 M Lithium chloride, 10% (w/v) PEG 6000
分辨率 3.75 Å R-free 0.336
7X7O SARS-CoV-2 spike RBD in complex with neutralizing antibody UT28K 提交 2022-03-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 322–536（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Citric acid pH5.0, 1.0 M Lithium chloride, 10% (w/v) PEG 6000
分辨率 3.75 Å R-free 0.336
7X7O SARS-CoV-2 spike RBD in complex with neutralizing antibody UT28K 提交 2022-03-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 322–536（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Citric acid pH5.0, 1.0 M Lithium chloride, 10% (w/v) PEG 6000
分辨率 3.75 Å R-free 0.336
7X7T Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike protein in complex with three nAbs X01, X10 and X17 提交 2022-03-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 324–527（204 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
7X7U Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Delta variant spike protein in complex with three nAbs X01, X10 and X17 提交 2022-03-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 324–527（204 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.77 Å
7X8W The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab354 提交 2022-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7X8Y The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab159 提交 2022-03-15 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7X8Z The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab188 提交 2022-03-15 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7X90 The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab326 提交 2022-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7X91 The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with an Fv-clasp form of a human neutralizing antibody Ab496 提交 2022-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7X92 The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab445 提交 2022-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7X93 The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab765 提交 2022-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 G 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7X94 The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab712 提交 2022-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7X95 The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab709 提交 2022-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7X96 The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab847 提交 2022-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7X9E Crystal structure of the 76E1 Fab in complex with a SARS-CoV-2 spike peptide 提交 2022-03-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 809–833（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；289 K；0.1M sodium citrate pH 4.5, 20% PEG 4000
分辨率 2.60 Å R-free 0.243
7X9E Crystal structure of the 76E1 Fab in complex with a SARS-CoV-2 spike peptide 提交 2022-03-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 809–833（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；289 K；0.1M sodium citrate pH 4.5, 20% PEG 4000
分辨率 2.60 Å R-free 0.243
7XA7 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor-binding domain in complex with intermediate horseshoe bat ACE2 提交 2022-03-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 319–541（223 aa） 片段：Receptor binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M sodium citrate pH 5.5, 5 % (w/v) PEG 4000
分辨率 3.31 Å R-free 0.254
7XA7 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor-binding domain in complex with intermediate horseshoe bat ACE2 提交 2022-03-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa） 片段：Receptor binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M sodium citrate pH 5.5, 5 % (w/v) PEG 4000
分辨率 3.31 Å R-free 0.254
7XA7 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor-binding domain in complex with intermediate horseshoe bat ACE2 提交 2022-03-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 319–541（223 aa） 片段：Receptor binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M sodium citrate pH 5.5, 5 % (w/v) PEG 4000
分辨率 3.31 Å R-free 0.254
7XA7 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor-binding domain in complex with intermediate horseshoe bat ACE2 提交 2022-03-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 319–541（223 aa） 片段：Receptor binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M sodium citrate pH 5.5, 5 % (w/v) PEG 4000
分辨率 3.31 Å R-free 0.254
7XAZ Crystal structure of Omicron BA.1.1 RBD complexed with hACE2 提交 2022-03-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa） 片段：Omicron RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.2 M Potassium thiocyanate 20 % w/v PEG 3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.230
7XAZ Crystal structure of Omicron BA.1.1 RBD complexed with hACE2 提交 2022-03-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 333–527（195 aa） 片段：Omicron RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.2 M Potassium thiocyanate 20 % w/v PEG 3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.230
7XB0 Crystal structure of Omicron BA.2 RBD complexed with hACE2 提交 2022-03-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa） 片段：Omicron BA.2 RBD
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris
分辨率 2.90 Å R-free 0.255
7XB1 Crystal structure of Omicron BA.3 RBD complexed with hACE2 提交 2022-03-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa） 片段：BA.3 RBD
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Imidazole pH7.0, 12% w/v Polyethylene glycol 20000
分辨率 2.70 Å R-free 0.248
7XBY The crystal structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.1 variant RBD in complex with equine ACE2 提交 2022-03-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 BR BROMIDE ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Sodium bromide, 0.1M Bis-Tris propane 8.5, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.85 Å R-free 0.263
7XCH Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron spike protein (S-6P-RRAR) in complex with human ACE2 ectodomain (two-RBD-up state) 提交 2022-03-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XCI Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with human ACE2 ectodomain (local refinement) 提交 2022-03-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa） 片段：UNP residues 333-527
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7XCK Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with S309 fab (local refinement) 提交 2022-03-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 M 322–590（269 aa） 片段：UNP residues 322-590
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7XCO Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron spike protein (S-6P-RRAR) in complex with S309 fab 提交 2022-03-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7XCP Cryo-EM structure of Omicron RBD complexed with ACE2 and 304 Fab 提交 2022-03-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 333–527（195 aa） 片段：UNP residues 333-527
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
7XCZ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Delta RBD in complex with BA7054 and BA7125 fab (local refinement) 提交 2022-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–528（196 aa）
突变：L435R, T461K 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7XD2 SARS-CoV-2 S ectodomain trimer in complex with neutralizing antibody 10-5B 提交 2022-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G,R683S,R685S,K986P,V987P 突变：R682G,R683S,R685S,K986P,V987P 突变：R682G,R683S,R685S,K986P,V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7XDA Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Delta RBD in complex with BA7208 and BA7125 fab (local refinement) 提交 2022-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 334–528（195 aa）
突变：L434R, T460K 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
7XDB Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron Spike protein in complex with BA7208 fab 提交 2022-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 26–1144（1119 aa）
链 B 26–1144（1119 aa）
链 C 26–1144（1119 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.62 Å
7XDK Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Delta Spike protein in complex with BA7054 and BA7125 fab 提交 2022-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 26–1143（1118 aa）
链 B 26–1143（1118 aa）
链 C 26–1143（1118 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7XDL Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Delta Spike protein in complex with BA7208 and BA7125 fab 提交 2022-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 26–1143（1118 aa）
链 B 26–1143（1118 aa）
链 C 26–1143（1118 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
7XEG SARS-CoV-2-Beta-RBD and CB6-092-Fab complex 提交 2022-03-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–537（219 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；Tris pH 8.0, PEG 2000
分辨率 2.69 Å R-free 0.248
7XEG SARS-CoV-2-Beta-RBD and CB6-092-Fab complex 提交 2022-03-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–537（219 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；Tris pH 8.0, PEG 2000
分辨率 2.69 Å R-free 0.248
7XEI SARS-CoV-2-prototyped-RBD and CB6-092-Fab complex 提交 2022-03-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–537（219 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；Ammonium nitrate, PEG 3350
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
7XEI SARS-CoV-2-prototyped-RBD and CB6-092-Fab complex 提交 2022-03-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–537（219 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；Ammonium nitrate, PEG 3350
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
7XH8 The structure of ZCB11 Fab against SARS-CoV-2 Omicron Spike 提交 2022-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：deletions, insertions, R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.99 Å
7XIC S-ECD (Omicron) in complex with STS165 提交 2022-04-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：deletions, insertions, K986P, V987P 突变：deletions, insertions, K986P, V987P 突变：deletions, insertions, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7XID S-ECD (Omicron) in complex with PD of ACE2 提交 2022-04-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：deletions, insersions, K986P, V987P 突变：deletions, insersions, K986P, V987P 突变：deletions, insersions, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7XIK SARS-CoV-2-Omicron-RBD and B38-GWP/P-VK antibody complex 提交 2022-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–537（219 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；15% v/v 2-Propanol, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% Polyethylene glycol 10000
分辨率 2.89 Å R-free 0.263
7XIL SARS-CoV-2-Beta-RBD and B38-GWP/P-VK antibody complex 提交 2022-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–537（219 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Imidazole malate, 15% W/V PEG 4000
分辨率 2.91 Å R-free 0.256
7XIW SARS-CoV-2 Omicron BA.2 variant spike (state 1) 提交 2022-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 D 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
7XIX SARS-CoV-2 Omicron BA.2 variant spike (state 2) 提交 2022-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
7XIY SARS-CoV-2 Omicron BA.3 variant spike 提交 2022-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
7XIZ SARS-CoV-2 Omicron BA.3 variant spike (local) 提交 2022-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 323–589（267 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
7XJ6 SARS-CoV-2 BA.1 Spike trimer in complex with 55A8 Fab and 58G6 Fab in the class 1 conformation 提交 2022-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
7XJ8 SARS-CoV-2 BA.1 Spike trimer in complex with 55A8 Fab and 58G6 Fab in the class 2 conformation 提交 2022-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7XJ9 Local refinement of the SARS-CoV-2 BA.1 Spike trimer in complex with 55A8 Fab and 58G6 Fab 提交 2022-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 334–527（194 aa） 片段：UNP residues 334-527
链 C 334–527（194 aa） 片段：UNP residues 334-527
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
7XMX Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with three F61 Fab 提交 2022-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
7XMZ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with three D2 Fab 提交 2022-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
7XNQ SARS-CoV-2 Omicron BA.4 variant spike 提交 2022-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
7XNR SARS-CoV-2 Omicron BA.2.13 variant spike 提交 2022-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7XNS SARS-CoV-2 Omicron BA.2.12.1 variant spike 提交 2022-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
7XO4 SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Variant Spike Trimer with two mouse ACE2 Bound 提交 2022-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
7XO5 SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Variant Spike Trimer with one mouse ACE2 Bound 提交 2022-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
7XO6 SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Variant RBD with mouse ACE2 Bound 提交 2022-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7XO7 SARS-CoV-2 Omicron BA.2 Variant Spike Trimer with two human ACE2 Bound 提交 2022-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R682G, R682S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R682S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R682S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 CL CHLORIDE ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
7XO8 SARS-CoV-2 Omicron BA.2 Variant Spike Trimer with three human ACE2 Bound 提交 2022-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 CL CHLORIDE ION × 3 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
7XO9 SARS-CoV-2 Omicron BA.2 Variant RBD complexed with human ACE2 提交 2022-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7XOA SARS-CoV-2 Omicron BA.2 Variant Spike Trimer with one mouse ACE2 Bound 提交 2022-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7XOB SARS-CoV-2 Omicron BA.2 Variant Spike Trimer with two mouse ACE2 Bound 提交 2022-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7XOC SARS-CoV-2 Omicron BA.2 Variant RBD complexed with mouse ACE2 提交 2022-05-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7XOD SARS-CoV-2 Omicron BA.2 Variant Spike Trimer with three JMB2002 Fab Bound 提交 2022-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R682G, R682S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R682S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R682S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
7XOE Cryo-EM structure of S glycoprotein encoded by the Covid-19 mRNA vaccine candidate RQ3013 (Prefusion state) 提交 2022-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1255（1255 aa）
链 B 1–1255（1255 aa）
链 C 1–1255（1255 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7XOG Cryo-EM structure of S glycoprotein encoded by the Covid-19 mRNA vaccine candidate RQ3013 (Postfusion state) 提交 2022-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1255（1255 aa）
链 B 1–1255（1255 aa）
链 C 1–1255（1255 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 MAN alpha-D-mannopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7XQS The structure of FLA-K*00701/KP-CoV-9 提交 2022-05-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 815–823（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291.15 K；0.1M Sodium chloride, 0.1M HEPES PH 7, 25% (W/V) SOKALAN PA 25 CL
分辨率 2.69 Å R-free 0.292
7XRP Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike protein in complex with nanobody C5G2 (localized refinement) 提交 2022-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 27–309（283 aa） 片段：NTD
链 F 330–521（192 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.88 Å
7XS8 Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor binding domain bound with P5S-1H1 Fab 提交 2022-05-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；2% v/v Tacsimate pH 5.0, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.4, 13% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.267
7XSA Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor binding domain bound with P2S-2E9 Fab 提交 2022-05-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–527（195 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；15% v/v 2-Propanol, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 4.8, 11% w/v Polyethylene glycol 10000
分辨率 2.20 Å R-free 0.283
7XSA Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor binding domain bound with P2S-2E9 Fab 提交 2022-05-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 333–527（195 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；15% v/v 2-Propanol, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 4.8, 11% w/v Polyethylene glycol 10000
分辨率 2.20 Å R-free 0.283
7XSB Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor binding domain bound with P5S-3B11 Fab 提交 2022-05-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–528（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.05M Citric acid pH 4.4, 0.05M BIS-TRIS propane, 16% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.324
7XSB Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor binding domain bound with P5S-3B11 Fab 提交 2022-05-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–528（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.05M Citric acid pH 4.4, 0.05M BIS-TRIS propane, 16% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.324
7XSB Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor binding domain bound with P5S-3B11 Fab 提交 2022-05-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 333–528（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.05M Citric acid pH 4.4, 0.05M BIS-TRIS propane, 16% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.324
7XSB Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor binding domain bound with P5S-3B11 Fab 提交 2022-05-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 333–528（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.05M Citric acid pH 4.4, 0.05M BIS-TRIS propane, 16% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.324
7XSC Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor binding domain bound with P5S-2B10 提交 2022-05-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 319–529（211 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2M Magnesium sulfate heptahydrate, 17% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.88 Å R-free 0.250
7XSC Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor binding domain bound with P5S-2B10 提交 2022-05-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 319–529（211 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2M Magnesium sulfate heptahydrate, 17% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.88 Å R-free 0.250
7XST Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron spike glycoprotein in complex with three F61 Fab and three D2 Fab 提交 2022-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
7XTZ Structure of SARS-CoV-2 Spike Protein with Engineered x3 Disulfide (x3(D427C, V987C) and single Arg S1/S2 cleavage site), Locked-1 Conformation 提交 2022-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1141（1128 aa）
链 B 14–1141（1128 aa）
链 C 14–1141（1128 aa）
突变：D427C, V987C 突变：D427C, V987C 突变：D427C, V987C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 BLA BILIVERDINE IX ALPHA × 3 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7XU0 Structure of SARS-CoV-2 Spike Protein with Engineered x3 Disulfide (x3(D427C, V987C) and single Arg S1/S2 cleavage site), Locked-211 Conformation 提交 2022-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1141（1128 aa）
链 B 14–1141（1128 aa）
链 C 14–1141（1128 aa）
突变：D427C, V987C 突变：D427C, V987C 突变：D427C, V987C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 38 EIC LINOLEIC ACID × 3 BLA BILIVERDINE IX ALPHA × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7XU1 Structure of SARS-CoV-2 Spike Protein with Engineered x3 Disulfide (x3(D427C, V987C) and single Arg S1/S2 cleavage site), Locked-122 Conformation 提交 2022-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
突变：D427C, V987C 突变：D427C, V987C 突变：D427C, V987C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37 BLA BILIVERDINE IX ALPHA × 3 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7XU2 Structure of SARS-CoV-2 Spike Protein with Engineered x3 Disulfide (x3(D427C, V987C) and single Arg S1/S2 cleavage site), Locked-2 Conformation 提交 2022-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1140（1127 aa）
链 B 14–1140（1127 aa）
链 C 14–1140（1127 aa）
突变：D427C, V987C 突变：D427C, V987C 突变：D427C, V987C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 BLA BILIVERDINE IX ALPHA × 3 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7XU3 Structure of SARS-CoV-2 Spike Protein with Engineered x3 Disulfide (x3(D427C, V987C) and single Arg S1/S2 cleavage site), Closed Conformation 提交 2022-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1140（1127 aa）
链 B 14–1140（1127 aa）
链 C 14–1140（1127 aa）
突变：D427C, V987C 突变：D427C, V987C 突变：D427C, V987C BLA BILIVERDINE IX ALPHA × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7XU4 Structure of SARS-CoV-2 D614G Spike Protein with Engineered x3 Disulfide (x3(D427C, V987C) and single Arg S1/S2 cleavage site), Locked-2 Conformation 提交 2022-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1140（1127 aa）
链 B 14–1140（1127 aa）
链 C 14–1140（1127 aa）
突变：D427C, D614G, V987C 突变：D427C, D614G, V987C 突变：D427C, D614G, V987C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 BLA BILIVERDINE IX ALPHA × 3 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7XU5 Structure of SARS-CoV-2 D614G Spike Protein with Engineered x3 Disulfide (x3(D427C, V987C) and single Arg S1/S2 cleavage site), Closed Conformation 提交 2022-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1140（1127 aa）
链 B 14–1140（1127 aa）
链 C 14–1140（1127 aa）
突变：D614G, D427C, V987C 突变：D614G, D427C, V987C 突变：D614G, D427C, V987C BLA BILIVERDINE IX ALPHA × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XU6 Structure of SARS-CoV-2 Spike Protein with Engineered x3 Disulfide (x3(D427C, V987C) and single Arg S1/S2 cleavage site), incubated in Low pH after 40-Day Storage in PBS, Locked-2 Conformation 提交 2022-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1140（1127 aa）
链 B 14–1140（1127 aa）
链 C 14–1140（1127 aa）
突变：D427C, V987C 突变：D427C, V987C 突变：D427C, V987C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 BLA BILIVERDINE IX ALPHA × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7XWA Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Omicron BA.4/5 variant spike protein in complex with its receptor ACE2 提交 2022-05-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–536（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1M MES pH6.5, 11-13% PEG6000, 5% MPD
分辨率 3.36 Å R-free 0.287
7XWA Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Omicron BA.4/5 variant spike protein in complex with its receptor ACE2 提交 2022-05-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 322–536（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1M MES pH6.5, 11-13% PEG6000, 5% MPD
分辨率 3.36 Å R-free 0.287
7XXL RBD in complex with Fab14 提交 2022-05-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 331–532（202 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；PBS pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
7XY3 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with VHH14 提交 2022-05-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 14–1145（1132 aa）
链 B 14–1145（1132 aa）
链 C 14–1145（1132 aa）
突变：R682G, R683G, R685S, K986P and V987P 突变：R682G, R683G, R685S, K986P and V987P 突变：R682G, R683G, R685S, K986P and V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 38 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
7XY4 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with VHH21 提交 2022-05-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 14–1145（1132 aa）
链 B 14–1145（1132 aa）
链 C 14–1145（1132 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 40 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Y0C Crystal structure of BD55-1403 and SARS-CoV-2 Omicron RBD 提交 2022-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 330–528（199 aa） 片段：Omicron RBD
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION, RECRYSTALLIZATION；pH 5；291.15 K；PEG3350, Sodium citrate tribasic dihydrate
分辨率 2.94 Å R-free 0.278
7Y0C Crystal structure of BD55-1403 and SARS-CoV-2 Omicron RBD 提交 2022-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 330–528（199 aa） 片段：Omicron RBD
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION, RECRYSTALLIZATION；pH 5；291.15 K；PEG3350, Sodium citrate tribasic dihydrate
分辨率 2.94 Å R-free 0.278
7Y0N SARS-CoV-2 WT Spike in complex with R15 Fab and P14 Nanobody 提交 2022-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–1147（1147 aa）
链 B 1–1147（1147 aa）
链 D 1–1147（1147 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7Y0O Interface of SARS-CoV-2 WT Spike in complex with R15 Fab and P14 Nanobody 提交 2022-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 334–527（194 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7Y0V The co-crystal structure of BA.1-RBD with Fab-5549 提交 2022-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 325–541（217 aa） 片段：BA.1-RBD
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.25；291 K；0.1 M HEPES sodium pH 7.25, 10% v/v 2-Propanol, 18% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 2.48 Å R-free 0.268
7Y0W Local structure of BD55-5514 and BD55-5840 Fab and Omicron BA.1 RBD complex 提交 2022-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 335–527（193 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.42 Å
7Y1Y S-ECD (Omicron BA.2) in complex with PD of ACE2 提交 2022-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：P986K,P987V 突变：P986K,P987V 突变：P986K,P987V NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Y1Z S-ECD (Omicron BA.3) in complex with three PD of ACE2 提交 2022-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：P986K,P987V 突变：P986K,P987V 突变：P986K,P987V NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7Y20 S-ECD (Omicron BA.3) in complex with two PD of ACE2 提交 2022-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7Y21 S-ECD (Omicron BA.5) in complex with PD of ACE2 提交 2022-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7Y3O Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with human antibody BIOLS56 提交 2022-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–527（194 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.2 M Imidazole malate, pH 7.0, 20% w/v PEG 4000
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
7Y42 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with all-trans retinoic acid 提交 2022-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 27–1147（1121 aa）
链 B 27–1147（1121 aa）
链 D 27–1147（1121 aa）
突变：C66F, K986P, V987P 突变：C66F, K986P, V987P 突变：C66F, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 REA RETINOIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
7Y6D Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Delta variant spike proteins on intact virions: 3 Closed RBD 提交 2022-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 4.39 Å
7Y6K Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with K202.B bispecific antibody 提交 2022-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.34 Å
7Y6L The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab816 提交 2022-06-21 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7Y6N The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab803 提交 2022-06-21 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7Y71 SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer complexed with Fab fragment of anti-RBD antibody E7 提交 2022-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 16–1213（1198 aa）
链 B 16–1213（1198 aa）
链 C 16–1213（1198 aa）
突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A942P, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A942P, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
7Y72 SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer complexed with Fab fragment of anti-RBD antibody E7 (focused refinement on Fab-RBD interface) 提交 2022-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 16–1213（1198 aa）
链 C 16–1213（1198 aa）
突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.03 Å
7Y75 SIT1-ACE2-BA.2 RBD 提交 2022-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 319–541（223 aa） 片段：BA.2 RBD
链 F 319–541（223 aa） 片段：BA.2 RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7Y76 SIT1-ACE2-BA.5 RBD 提交 2022-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 319–541（223 aa） 片段：BA.4 RBD
链 F 319–541（223 aa） 片段：BA.4 RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Y7J SARS-CoV-2 S trimer in complex with 1F Fab 提交 2022-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：YES 突变：YES 突变：YES NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7Y7K SARS-CoV-2 RBD in complex with 1F Fab 提交 2022-06-22 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 336–514（179 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7Y8J 3D1 in complex with 6-mer HR1 peptide from SARS-CoV-2 提交 2022-06-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 950–956（7 aa） 片段：HR1 domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M HEPES pH7.5, 25% PEG8000
分辨率 1.03 Å R-free 0.145
7Y9N an engineered 5-helix bundle derived from SARS-CoV-2 S2 in complex with HR2P 提交 2022-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 918–967（50 aa）
链 A 1167–1203（37 aa）
链 B 1168–1203（36 aa） 片段：HR2 domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Citric acid (pH 3.5), 14% w/v Polyethylene glycol 1000
分辨率 1.89 Å R-free 0.212
7Y9S Cryo-EM structure of apo SARS-CoV-2 Omicron spike protein (S-2P-GSAS) 提交 2022-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 15–1208（1194 aa）
链 B 15–1208（1194 aa）
链 C 15–1208（1194 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Y9Z Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron spike protein (S-6P-RRAR) in complex with human ACE2 ectodomain (one-RBD-up state) 提交 2022-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
7YA0 Cryo-EM structure of hACE2-bound SARS-CoV-2 Omicron spike protein with L371S, P373S and F375S mutations (S-6P-RRAR) 提交 2022-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
突变：F817P, A892P, A899P,A942P,K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P,A942P,K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P,A942P,K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7YA1 Cryo-EM structure of hACE2-bound SARS-CoV-2 Omicron spike protein with L371S, P373S and F375S mutations (local refinement) 提交 2022-06-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7YAD Cryo-EM structure of S309-RBD-RBD-S309 in the S309-bound Omicron spike protein (local refinement) 提交 2022-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 330–529（200 aa）
链 M 330–529（200 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.66 Å
7YBH SARS-CoV-2 lambda variant spike 提交 2022-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 17 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.50 Å
7YBI SARS-CoV-2 Mu variant spike (open state) 提交 2022-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7YBJ SARS-CoV-2 Mu variant spike(close state) 提交 2022-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
7YBK SARS-CoV-2 B.1.620 variant spike (open state) 提交 2022-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.90 Å
7YBL SARS-CoV-2 B.1.620 variant spike (close state) 提交 2022-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7YBM SARS-CoV-2 C.1.2 variant spike (Close state) 提交 2022-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
7YBN SARS-CoV-2 C.1.2 variant spike (Open state) 提交 2022-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：A892P, A899P, A942P 突变：A892P, A899P, A942P 突变：A892P, A899P, A942P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.82 Å
7YC5 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with K202.B bispecific antibody 提交 2022-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7YCK Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with FP-12A Fab 提交 2022-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293.15 K；0.2M Ammonium sulfate; 0.05 M Magnesium sulfate heptahydrate, 0.1M BICINE pH 9.0, 2.5% w/v PEG 3350, 2.5%w/v PEG 4000, 2.5% w/v PEG 2000, 2.5% w/v PEG 5000 MME
分辨率 2.60 Å R-free 0.264
7YCK Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with FP-12A Fab 提交 2022-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 333–530（198 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293.15 K；0.2M Ammonium sulfate; 0.05 M Magnesium sulfate heptahydrate, 0.1M BICINE pH 9.0, 2.5% w/v PEG 3350, 2.5%w/v PEG 4000, 2.5% w/v PEG 2000, 2.5% w/v PEG 5000 MME
分辨率 2.60 Å R-free 0.264
7YCL Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with IS-9A Fab 提交 2022-07-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 333–530（198 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；2% v/v 1,4-Dioxane, 0.1M Tris pH 8.0, 15% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.13 Å R-free 0.217
7YCL Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with IS-9A Fab 提交 2022-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 333–530（198 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；2% v/v 1,4-Dioxane, 0.1M Tris pH 8.0, 15% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.13 Å R-free 0.217
7YCN Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with IY-2A Fab 提交 2022-07-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；0.2M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1M Imidazole pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether
分辨率 2.85 Å R-free 0.250
7YCN Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with IY-2A Fab 提交 2022-07-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–527（195 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；0.2M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1M Imidazole pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether
分辨率 2.85 Å R-free 0.250
7YCN Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with IY-2A Fab 提交 2022-07-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；0.2M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1M Imidazole pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether
分辨率 2.85 Å R-free 0.250
7YCN Crystal structure of SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with IY-2A Fab 提交 2022-07-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 333–527（195 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；0.2M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1M Imidazole pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether
分辨率 2.85 Å R-free 0.250
7YCO Crystal structure of SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain bound to A6 repebody 提交 2022-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 333–530（198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M sodium citrate tribasic dihydrate, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 1.96 Å R-free 0.259
7YCY SARS-CoV-2 Omicron 1-RBD up Spike trimer complexed with three XG005 molecules 提交 2022-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
7YCZ SARS-CoV-2 Omicron 2-RBD up Spike trimer complexed with three XG005 molecules 提交 2022-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
7YD0 SARS-CoV-2 Omicron 1-RBD up spike trimer complexed with two XG005 Fab 提交 2022-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7YD1 Local refinement of SARS-CoV-2 Omicron S trimer complexed with XG005 提交 2022-07-02 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 331–528（198 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.99 Å
7YDI SARS-CoV-2 Spike (6P) in complex with 3 R1-32 Fabs and 3 ACE2, focused refinement of RBD region 提交 2022-07-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 334–526（193 aa） 片段：Spike protomer RBD domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.98 Å
7YDY SARS-CoV-2 Spike (6P) in complex with 1 R1-32 Fab 提交 2022-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.75 Å
7YE5 SARS-CoV-2 Spike (6P) in complex with 2 R1-32 Fabs 提交 2022-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.75 Å
7YE9 SARS-CoV-2 Spike (6P) in complex with 3 R1-32 Fabs 提交 2022-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R682S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R682S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R682S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.17 Å
7YEG SARS-CoV-2 Spike (6P) in complex with 3 R1-32 Fabs and 3 ACE2 提交 2022-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R682S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R682S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R682S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
7YH6 Structure of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with neutralizing antibody NIV-8 提交 2022-07-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；octyl-maltoside, fluorinated solution was added to PBS solution to a final concentration of 0.01%
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.40 Å
7YH7 SARS-CoV-2 spike in complex with neutralizing antibody NIV-8 (state 2) 提交 2022-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 12–1210（1199 aa）
链 B 12–1210（1199 aa）
链 C 12–1210（1199 aa）
突变：R682G, R683S, R685G, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685G, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685G, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.30 Å
7YHW Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2.12.1 RBD in complex with human ACE2 (local refinement) 提交 2022-07-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
7YJ3 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 RBD in complex with human ACE2 (local refinement) 提交 2022-07-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa） 片段：RBD
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
7YKJ Omicron RBDs bound with P3E6 Fab (one up and one down) 提交 2022-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7YOW Crystal structure of SARS-CoV-2 omicron variant spike receptor-binding domain (RBD) in complex with NCV2SG48 Fab 提交 2022-08-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 321–536（216 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.5 M ammonium sulfate, 19.5% PEG 3350, 1 mM EDTA, 10% golycerol, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 3.30 Å R-free 0.254
7YOW Crystal structure of SARS-CoV-2 omicron variant spike receptor-binding domain (RBD) in complex with NCV2SG48 Fab 提交 2022-08-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 321–536（216 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.5 M ammonium sulfate, 19.5% PEG 3350, 1 mM EDTA, 10% golycerol, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 3.30 Å R-free 0.254
7YQT SARS-CoV-2 BA.2.75 S Trimer (1 RBD Up) 提交 2022-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942A, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942A, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942A, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
7YQU SARS-CoV-2 BA.2.75 S Trimer (3 RBD Down) 提交 2022-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942A, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942A, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942A, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.19 Å
7YQV pH 5.5 SARS-CoV-2 BA.2.75 S Trimer (1 RBD Up) 提交 2022-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942A, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942A, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942A, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7YQW SARS-CoV-2 BA.2.75 S Trimer (3 RBD Down) 提交 2022-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
7YQX SARS-CoV-2 BA.2.75 S Trimer in complex with S309 (state1) 提交 2022-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.72 Å
7YQY SARS-CoV-2 BA.2.75 S Trimer in complex with S309 (state2) 提交 2022-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
7YQZ SARS-CoV-2 BA.2.75 S Trimer in complex with S309 (state3) 提交 2022-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942A, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942A, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942A, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.84 Å
7YR0 SARS-CoV-2 BA.2.75 S Trimer in complex with S309 (interface) 提交 2022-08-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 332–527（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.98 Å
7YR1 SARS-CoV-2 BA.2.75 S Trimer in complex with XG2v024 提交 2022-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
7YR2 SARS-CoV-2 BA.2.75 S Trimer in complex with ACE2(state1) 提交 2022-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–1273（1273 aa）
链 D 1–1273（1273 aa）
链 E 1–1273（1273 aa）
突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942A, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942A, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942A, K986P, V987P ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 49 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7YR3 SARS-CoV-2 BA.2.75 S Trimer in complex with ACE2(state2) 提交 2022-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
链 F 1–1273（1273 aa）
突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 53 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
7YR4 SARS-CoV-2 BA.2.75 S Trimer in complex with ACE2(interface) 提交 2022-08-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 334–528（195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.12 Å
7YTN Crystal structure of SARS-CoV-2 Alpha RBD in complex with the D27LEY neutralizing antibody Fab fragment 提交 2022-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；200 mM ammonium citrate tribasic (pH 7.0), 20% (v/v) polyethyleneglycol 3350
分辨率 3.51 Å R-free 0.274
7YUE Epitope-directed anti-SARS CoV 2 scFv engineered against the key spike protein region. 提交 2022-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 815–826（12 aa） 片段：SARS CoV 2 epitope
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；293 K；0.2 M sodium thiocyanate at pH 5.9 20% PEG 1000
分辨率 2.35 Å R-free 0.232
7YV8 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 RBD in complex with golden hamster ACE2 (local refinement) 提交 2022-08-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 332–528（197 aa） 片段：RBD
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
7YVE Omicron BA.4/5 SARS-CoV-2 S in complex with TH027 Fab 提交 2022-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7YVF Omicron BA.4/5 SARS-CoV-2 S RBD in complex with TH027 Fab 提交 2022-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
突变：986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7YVG Omicron BA.4/5 SARS-CoV-2 S in complex with TH132 Fab 提交 2022-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7YVH Omicron BA.4/5 SARS-CoV-2 S RBD in complex with TH132 Fab 提交 2022-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7YVI Omicron BA.4/5 SARS-CoV-2 S in complex with TH236 Fab 提交 2022-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7YVJ Omicron BA.4/5 SARS-CoV-2 S RBD in complex with TH236 Fab 提交 2022-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7YVK Omicron BA.4/5 SARS-CoV-2 S in complex with TH272 Fab 提交 2022-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7YVL Omicron BA.4/5 SARS-CoV-2 S RBD in complex with TH272 Fab 提交 2022-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7YVM Omicron BA.4/5 SARS-CoV-2 S RBD in complex with TH272 Fab 提交 2022-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7YVN Omicron BA.4/5 SARS-CoV-2 S in complex with TH281 Fab 提交 2022-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7YVO Omicron BA.4/5 SARS-CoV-2 S in complex with TH027/132 Fab 提交 2022-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7YVP Omicron BA.4/5 SARS-CoV-2 S in complex with TH272/281 Fab 提交 2022-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P 突变：K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7YVU Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 RBD in complex with mouse ACE2 (local refinement) 提交 2022-08-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z0X THSC20.HVTR26 Fab bound to SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain 提交 2022-02-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 331–527（197 aa）
未记录 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293.15 K；15% (w/v) PEG 20,000, 100 mM HEPES / Sodium hydroxide pH 7.0
分辨率 1.80 Å R-free 0.188
7Z0Y THSC20.HVTR04 Fab bound to SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain 提交 2022-02-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 331–527（197 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；1.5M ammonium sulfate, 12%(v/v) isopropanol, 0.1M imidazole HCl pH 6.5
分辨率 2.95 Å R-free 0.241
7Z1A Nanobody H11 and F2 bound to RBD 提交 2022-02-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BICINE pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol 10,000
分辨率 2.59 Å R-free 0.241
7Z1A Nanobody H11 and F2 bound to RBD 提交 2022-02-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BICINE pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol 10,000
分辨率 2.59 Å R-free 0.241
7Z1B Nanobody H11-A10 and F2 bound to RBD 提交 2022-02-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium citrate, pH 5.5, 20 % Peg 3000
分辨率 2.30 Å R-free 0.243
7Z1B Nanobody H11-A10 and F2 bound to RBD 提交 2022-02-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium citrate, pH 5.5, 20 % Peg 3000
分辨率 2.30 Å R-free 0.243
7Z1C Nanobody H11-B5 and H11-F2 bound to RBD 提交 2022-02-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% v/v Tacsimate pH 6.0, 0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 25% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.90 Å R-free 0.199
7Z1C Nanobody H11-B5 and H11-F2 bound to RBD 提交 2022-02-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% v/v Tacsimate pH 6.0, 0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 25% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.90 Å R-free 0.199
7Z1D Nanobody H11-H6 bound to RBD 提交 2022-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 EEE 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES, pH 7.5 and 20% w/v PEG 8000
分辨率 1.55 Å R-free 0.186
7Z1E Nanobody H11-H4 Q98R H100E bound to RBD 提交 2022-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 EEE 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 3 NO3 NITRATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Ammonium nitrate, 20 % Peg 3350
分辨率 1.59 Å R-free 0.202
7Z3Z Locked Wuhan SARS-CoV2 Prefusion Spike ectodomain with lipid bound 提交 2022-03-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 STE STEARIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7Z6V CRYO-EM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE : H11 nanobody complex 提交 2022-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；SPT Labtech prototype 300 mesh 1.2/2.0 nanowire grids with a highly reproduceable rectangular bar cross-section were used. The grids were glow-discharged on low for 120 s (Plasma Cleaner PDC-002-CE, Harrick Plasma) to activate the nanowires. Approximately 6 nL of the complex were applied to the grids using a Chameleon EP system (SPT Labtech) at 82% relative humidity and ambient temperature.
分辨率 3.10 Å
7Z7X CRYO-EM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE : H11-H6 nanobody complex 提交 2022-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；SPT Labtech prototype 300 mesh 1.2/2.0 nanowire grids with a highly reproduceable rectangular bar cross-section were used. The grids were glow-discharged on low for 120 s (Plasma Cleaner PDC-002-CE, Harrick Plasma) or for 60-80 s, 12 mA (easiGlow, Pelco) to activate the nanowires. Approximately 6 nL of the complex were applied to the grids using a Chameleon EP system (SPT Labtech) at 79-81% relative humidity and ambient temperature.
分辨率 3.30 Å
7Z85 CRYO-EM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE : H11-B5 nanobody complex 提交 2022-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；SPT Labtech prototype 300 mesh 1.2/2.0 nanowire grids with a highly reproduceable rectangular bar cross-section were used. The grids were glow-discharged on low for 190 s (Plasma Cleaner PDC-002-CE, Harrick Plasma) to activate the nanowires. Approximately 6 nL of the complex were applied to the grids using a Chameleon EP system (SPT Labtech) at 83% relative humidity and ambient temperature.
分辨率 3.10 Å
7Z86 CRYO-EM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE : H11-H4 Q98R H100E nanobody complex in 1Up2Down conformation 提交 2022-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7Z8O Crystal structure of SARS-CoV-2 S RBD in complex with a stapled peptide 提交 2022-03-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 333–527（195 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 KZ0 2,4,6-tris(chloromethyl)-1,3,5-triazine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；22 %v/v PEGSB, 0.1 M Na Phos Cit 5.5 pH
分辨率 0.96 Å R-free 0.169
7Z9Q CRYO-EM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE : H11-A10 nanobody complex 提交 2022-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；SPT Labtech prototype 300 mesh 1.2/2.0 nanowire grids with a highly reproduceable rectangular bar cross-section were used. The grids were glow-discharged on low for 260 s (Plasma Cleaner PDC-002-CE, Harrick Plasma) to activate the nanowires. Approximately 6 nL of the complex were applied to the grids using a Chameleon EP system (SPT Labtech) at 80% relative humidity and ambient temperature.
分辨率 3.60 Å
7Z9R CRYO-EM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE : H11-H4 Q98R H100E nanobody complex in 2Up1Down conformation 提交 2022-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7ZBU CryoEM structure of SARS-CoV-2 spike monomer in complex with neutralising antibody P008_60 提交 2022-03-24 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 3Q9 3-[5-[(4-ethyl-3-methyl-5-oxidanylidene-pyrrol-2-yl)methyl]-2-[[5-[(3-ethyl-4-methyl-5-oxidanylidene-pyrrol-2-yl)methyl]-3-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-4-methyl-1H-pyrrol-2-yl]methyl]-4-methyl-1H-pyrrol-3-yl]propanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；0.1% n-octyl glucoside in 150 mM NaCl, 20 mM Tris-HCl, pH8.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 to 4 sec before plunging
分辨率 4.31 Å
7ZCE SARS-CoV-2 Spike protein in complex with the single chain fragment scFv76 提交 2022-03-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7ZCF SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with the single chain fragment scFv76 (Focused Refinement) 提交 2022-03-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7ZDQ Cryo-EM structure of Human ACE2 bound to a high-affinity SARS CoV-2 mutant 提交 2022-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
突变：Q498H, S477N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds. Wait time of 30 seconds for graphene oxide grids and 0 seconds for holey grids.
分辨率 3.20 Å
7ZF3 SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with Omi-3 and EY6A Fabs 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 30% (v/v) Jeffamine ED-2001 pH 7.0
分辨率 3.15 Å R-free 0.266
7ZF4 SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with Omi-9 Fab and nanobody F2 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.5 and 30% (w/v) PEG 1500
分辨率 4.18 Å R-free 0.385
7ZF5 SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with Omi-12 and Beta-54 Fabs 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 18% (w/v) PEG 20000
分辨率 5.32 Å R-free 0.256
7ZF5 SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with Omi-12 and Beta-54 Fabs 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 18% (w/v) PEG 20000
分辨率 5.32 Å R-free 0.256
7ZF7 SARS-CoV-2 Omicron BA.2 RBD in complex with ACE2 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.09 M MES monohydrate pH 6.0, 18% (w/v) PEG monomethyl ether 2000
分辨率 3.46 Å R-free 0.269
7ZF8 SARS-CoV-2 Omicron BA.2 RBD in complex with COVOX-150 Fab 提交 2022-04-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5, 18% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.95 Å R-free 0.258
7ZF9 SARS-CoV-2 Omicron BA.2 RBD in complex with COVOX-150 Fab (P21) 提交 2022-04-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.5 and 30% (w/v) PEG 1500
分辨率 3.25 Å R-free 0.265
7ZF9 SARS-CoV-2 Omicron BA.2 RBD in complex with COVOX-150 Fab (P21) 提交 2022-04-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.5 and 30% (w/v) PEG 1500
分辨率 3.25 Å R-free 0.265
7ZFA SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with Omi-6 and COVOX-150 Fabs 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium HEPES pH 7.0, 15 % w/v PEG 4000
分辨率 4.24 Å R-free 0.272
7ZFA SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with Omi-6 and COVOX-150 Fabs 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium HEPES pH 7.0, 15 % w/v PEG 4000
分辨率 4.24 Å R-free 0.272
7ZFA SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with Omi-6 and COVOX-150 Fabs 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium HEPES pH 7.0, 15 % w/v PEG 4000
分辨率 4.24 Å R-free 0.272
7ZFA SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with Omi-6 and COVOX-150 Fabs 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium HEPES pH 7.0, 15 % w/v PEG 4000
分辨率 4.24 Å R-free 0.272
7ZFB SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with nanobody C1, Omi-18 and Omi-31 Fabs 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.5, 20 % w/v PEG 8000
分辨率 3.08 Å R-free 0.308
7ZFB SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with nanobody C1, Omi-18 and Omi-31 Fabs 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.5, 20 % w/v PEG 8000
分辨率 3.08 Å R-free 0.308
7ZFC SARS-CoV-2 Beta RBD in complex with nanobody C1, Omi-18 and Omi-31 Fabs 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.04 M Potassium phosphate monobasic, 16% w/v PEG 8000
分辨率 3.24 Å R-free 0.299
7ZFD SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with Omi-25 Fab 提交 2022-04-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 330–532（203 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Proplex 1-31: 3.0 M Sodium formate, 0.1 M Tris pH 7.5
分辨率 3.39 Å R-free 0.338
7ZFD SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with Omi-25 Fab 提交 2022-04-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 330–532（203 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Proplex 1-31: 3.0 M Sodium formate, 0.1 M Tris pH 7.5
分辨率 3.39 Å R-free 0.338
7ZFE SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with Omi-32 Fab and nanobody C1 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Citric acid pH 3.5, 18% w/v Polyethylene glycol 6,000
分辨率 3.25 Å R-free 0.293
7ZFE SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with Omi-32 Fab and nanobody C1 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Citric acid pH 3.5, 18% w/v Polyethylene glycol 6,000
分辨率 3.25 Å R-free 0.293
7ZFE SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with Omi-32 Fab and nanobody C1 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Citric acid pH 3.5, 18% w/v Polyethylene glycol 6,000
分辨率 3.25 Å R-free 0.293
7ZFE SARS-CoV-2 Omicron RBD in complex with Omi-32 Fab and nanobody C1 提交 2022-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Citric acid pH 3.5, 18% w/v Polyethylene glycol 6,000
分辨率 3.25 Å R-free 0.293
7ZJL Delta SARS-CoV-2 spike protein in complex with REGN10987 Fab homologue. 提交 2022-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 15–1146（1132 aa）
链 B 15–1146（1132 aa）
链 C 15–1146（1132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7ZR2 Crystal structure of a chimeric protein mimic of SARS-CoV-2 Spike HR1 in complex with HR2 提交 2022-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 915–988（74 aa）
链 B 1164–1202（39 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1M sodium HEPES, 20% (w/v) PEG4000, 10% (v/v) isopropanol
分辨率 1.45 Å R-free 0.209
7ZR7 OMI-42 FAB IN COMPLEX WITH SARS-COV-2 BETA SPIKE GLYCOPROTEIN 提交 2022-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7ZR8 OMI-38 FAB IN COMPLEX WITH SARS-COV-2 BETA SPIKE RBD (local refinement) 提交 2022-05-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7ZR9 OMI-2 FAB IN COMPLEX WITH SARS-COV-2 BETA SPIKE GLYCOPROTEIN 提交 2022-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7ZRC OMI-38 FAB IN COMPLEX WITH SARS-COV-2 BETA SPIKE 提交 2022-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7ZRV cryo-EM structure of omicron spike in complex with de novo designed binder, full map 提交 2022-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZSD cryo-EM structure of omicron spike in complex with de novo designed binder, local 提交 2022-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 M 332–527（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
7ZSS cryo-EM structure of D614 spike in complex with de novo designed binder 提交 2022-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1146（1146 aa）
链 B 1–1146（1146 aa）
链 C 1–1146（1146 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
7ZXU SARS-CoV-2 Omicron BA.4/5 RBD in complex with Beta-27 Fab and C1 nanobody 提交 2022-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 10 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；4% (v/v) 2-propanol, 0.1M BIS-Tris propane, pH9.0, 20% (w/v) PEG monomethyl ether 5000
分辨率 1.89 Å R-free 0.209
8A94 SARS CoV2 Spike in the 2-up state in complex with Fab47. 提交 2022-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 43 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8A95 SARS Cov2 Spike RBD in complex with Fab47 提交 2022-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.64 Å
8A96 SARS Cov2 Spike RBD in complex with Fab47 提交 2022-06-27 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 327–531（205 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8A99 SARS Cov2 Spike in 1-up conformation complex with Fab47 提交 2022-06-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 44 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8AAA Crystal structure of SARS-CoV-2 S RBD in complex with a stapled peptide 提交 2022-06-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 333–527（195 aa）
未记录 29N 1,1',1''-(1,3,5-triazinane-1,3,5-triyl)tripropan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；22% PEGSM, 2% Glycerol, 0.01M CoCl2, 0.2M MgCl2, 0.1M Bis TRIS
分辨率 1.90 Å R-free 0.236
8AJA Structure of the Ancestral Scaffold Antigen-5 of Coronavirus Spike protein 提交 2022-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1208（1193 aa）
链 B 16–1208（1193 aa）
链 C 16–1208（1193 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.59 Å
8AJL Structure of the Ancestral Scaffold Antigen-6 of Coronavirus Spike protein 提交 2022-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1208（1193 aa）
链 B 16–1208（1193 aa）
链 C 16–1208（1193 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.77 Å
8AQS BA.4/5 SARS-CoV-2 Spike bound to human ACE2 (local) 提交 2022-08-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
8AQT Beta SARS-CoV-2 Spike bound to mouse ACE2 (local) 提交 2022-08-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8AQU BA.1 SARS-CoV-2 Spike bound to mouse ACE2 (local) 提交 2022-08-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
8AQV BA.2.12.1 SARS-CoV-2 Spike bound to mouse ACE2 (local) 提交 2022-08-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
8AQW BA.4/5 SARS-CoV-2 Spike bound to mouse ACE2 (local) 提交 2022-08-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8ASY SARS-CoV-2 Omicron BA.2.75 RBD in complex with ACE2 提交 2022-08-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–526（194 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 12 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CL CHLORIDE ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1% (w/v) n-Octyl-b-D-glucoside, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5 and 22% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.85 Å R-free 0.265
8BBN SARS-CoV-2 Delta-RBD complexed with BA.2-10 and EY6A Fabs 提交 2022-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Y 333–528（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% (v/v) 2-propanol, 0.1 M BICINE, pH 8.5 and 30% (w/v) PEG 1500
分辨率 3.58 Å R-free 0.314
8BBN SARS-CoV-2 Delta-RBD complexed with BA.2-10 and EY6A Fabs 提交 2022-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 X 333–528（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% (v/v) 2-propanol, 0.1 M BICINE, pH 8.5 and 30% (w/v) PEG 1500
分辨率 3.58 Å R-free 0.314
8BBN SARS-CoV-2 Delta-RBD complexed with BA.2-10 and EY6A Fabs 提交 2022-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 333–528（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% (v/v) 2-propanol, 0.1 M BICINE, pH 8.5 and 30% (w/v) PEG 1500
分辨率 3.58 Å R-free 0.314
8BCZ SARS-CoV-2 Delta-RBD complexed with Fabs BA.2-36, BA.2-23, EY6A and COVOX-45 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 R 333–528（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8BE1 SARS-CoV-2 RBD in complex with a Fab fragment of a neutralising antibody mRBD2 提交 2022-10-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 333–527（195 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；281 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 6.5 0.2 M Potassium thiocyanate 20 % w/v PEG 3350 10 % v/v Ethylene glycol
分辨率 1.98 Å R-free 0.284
8BE1 SARS-CoV-2 RBD in complex with a Fab fragment of a neutralising antibody mRBD2 提交 2022-10-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 333–527（195 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；281 K；0.1 M Bis Tris Propane pH 6.5 0.2 M Potassium thiocyanate 20 % w/v PEG 3350 10 % v/v Ethylene glycol
分辨率 1.98 Å R-free 0.284
8BEC Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1375 scFV 提交 2022-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 334–527（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；pT1375-RBD at 15,5 mg/ml using 1.5 M Ammonium sulfate, 15 % w/v glycerol, 100 mM Tris pH 8.5 as reservoir and micro seeds in 18% PEG 3350, 100 mM citrate pH 4, 200 mM Na3Cit stabilization solution
分辨率 1.70 Å R-free 0.207
8BEC Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1375 scFV 提交 2022-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 334–527（194 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；pT1375-RBD at 15,5 mg/ml using 1.5 M Ammonium sulfate, 15 % w/v glycerol, 100 mM Tris pH 8.5 as reservoir and micro seeds in 18% PEG 3350, 100 mM citrate pH 4, 200 mM Na3Cit stabilization solution
分辨率 1.70 Å R-free 0.207
8BEV Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike (HexaPro variant) in complex with nanobody W25 (map 3, focus refinement on RBD, W25 and adjacent NTD) 提交 2022-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；1s blotting time
分辨率 5.92 Å
8BG1 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1511 scFV 提交 2022-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 334–527（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；pT1511-RBD at 9.5 mg/ml using 16% PEG 3350, 200 mM sodium malonate, 100 mM Bis-tris propane pH 7.5 as reservoir
分辨率 2.88 Å R-free 0.244
8BG1 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1511 scFV 提交 2022-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 334–527（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；pT1511-RBD at 9.5 mg/ml using 16% PEG 3350, 200 mM sodium malonate, 100 mM Bis-tris propane pH 7.5 as reservoir
分辨率 2.88 Å R-free 0.244
8BG1 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1511 scFV 提交 2022-10-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；pT1511-RBD at 9.5 mg/ml using 16% PEG 3350, 200 mM sodium malonate, 100 mM Bis-tris propane pH 7.5 as reservoir
分辨率 2.88 Å R-free 0.244
8BG1 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1511 scFV 提交 2022-10-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；pT1511-RBD at 9.5 mg/ml using 16% PEG 3350, 200 mM sodium malonate, 100 mM Bis-tris propane pH 7.5 as reservoir
分辨率 2.88 Å R-free 0.244
8BG2 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1580 scFV 提交 2022-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；pT1580-RBD at 9,8 mg/ml using 1.4 M Na-Tartrate, 100 mM Tris pH 8.5 as reservoir
分辨率 2.10 Å R-free 0.227
8BG2 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1580 scFV 提交 2022-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；pT1580-RBD at 9,8 mg/ml using 1.4 M Na-Tartrate, 100 mM Tris pH 8.5 as reservoir
分辨率 2.10 Å R-free 0.227
8BG3 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1610 scFV 提交 2022-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；pT1610-RBD at 10.2 mg/ml using 20% PEG 3350, 100 mM MES pH 6, 200 mM NaF as reservoir
分辨率 1.90 Å R-free 0.214
8BG3 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1610 scFV 提交 2022-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；pT1610-RBD at 10.2 mg/ml using 20% PEG 3350, 100 mM MES pH 6, 200 mM NaF as reservoir
分辨率 1.90 Å R-free 0.214
8BG4 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1611 scFV 提交 2022-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；pT1611-RBD at 18.7 mg/ml using 1.6 M ammonium-sulfate, 2 % PEG 1000, 100 mM HEPES pH 8 as reservoir
分辨率 1.60 Å R-free 0.208
8BG4 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1611 scFV 提交 2022-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；pT1611-RBD at 18.7 mg/ml using 1.6 M ammonium-sulfate, 2 % PEG 1000, 100 mM HEPES pH 8 as reservoir
分辨率 1.60 Å R-free 0.208
8BG5 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1631 scFV 提交 2022-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；pT1631-RBD at 15.8 mg/ml using 16 % PEG 4000, 100 mM Tris pH 8.5, 200 mM Li2SO4 as reservoir and micro seeds in 18% PEG 3350, 100 mM citrate pH 4, 200 mM Na3Cit stabilization solution
分辨率 2.05 Å R-free 0.217
8BG5 Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1631 scFV 提交 2022-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；pT1631-RBD at 15.8 mg/ml using 16 % PEG 4000, 100 mM Tris pH 8.5, 200 mM Li2SO4 as reservoir and micro seeds in 18% PEG 3350, 100 mM citrate pH 4, 200 mM Na3Cit stabilization solution
分辨率 2.05 Å R-free 0.217
8BG6 SARS-CoV-2 S protein in complex with pT1644 Fab 提交 2022-10-27 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 16–1208（1193 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.11 Å
8BG8 SARS-CoV-2 S protein in complex with pT1696 Fab 提交 2022-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1208（1193 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å
8BGG Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike (Omicron BA.1 variant) in complex with nanobody W25 (map 5, focus refinement on RBD, W25 and adjacent NTD) 提交 2022-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1207（1207 aa）
链 C 1–1207（1207 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.04 Å
8BH5 SARS-CoV-2 BA.2.12.1 RBD in complex with Beta-27 Fab and C1 nanobody 提交 2022-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 333–528（196 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 12 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dehydrate, pH 5.5, 18% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.38 Å R-free 0.233
8BON Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with the macrocyclic peptide S1B3inL1 提交 2022-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8BSE CRYSTAL STRUCTURE OF SARS-COV-2 RECEPTOR BINDING DOMAIN (RBD) in complex with 1D1 Fab 提交 2022-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 5 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；18% PEG Smear Broad 0.08 M MgCl2 0.08 M tri-sodium citrate 0.1 M Bis-Tris pH 6.0
分辨率 1.90 Å R-free 0.216
8BSF CRYSTAL STRUCTURE OF SARS-COV-2 RECEPTOR BINDING DOMAIN (RBD-beta variant) in complex with 3D2 Fab 提交 2022-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.04 M potassium dihydrogen phosphate 18 % PEG 8000 20 % glycerol
分辨率 2.20 Å R-free 0.229
8C0Y SARS-CoV2 Omicron BA.1 RBD in complex with CAB-A17 antibody 提交 2022-12-19 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–526（193 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.68 Å
8C1V SARS-CoV-2 S-trimer (3 RBDs up) bound to TriSb92, fitted into cryo-EM map 提交 2022-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 26–1149（1124 aa）
链 B 26–1149（1124 aa）
链 C 26–1149（1124 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris pH 8 + 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8C2R SARS-CoV2 Omicron BA.1 spike in complex with CAB-A17 antibody 提交 2022-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 26–1147（1122 aa）
链 B 26–1147（1122 aa）
链 C 26–1147（1122 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8C3V SARS-CoV-2 Delta-RBD complexed with BA.2-13 Fab and C1 nanobody 提交 2022-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 R 333–528（196 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BICINE pH 8.5, 15% PEG 1,500
分辨率 2.74 Å R-free 0.258
8C3V SARS-CoV-2 Delta-RBD complexed with BA.2-13 Fab and C1 nanobody 提交 2022-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 X 333–528（196 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BICINE pH 8.5, 15% PEG 1,500
分辨率 2.74 Å R-free 0.258
8C3V SARS-CoV-2 Delta-RBD complexed with BA.2-13 Fab and C1 nanobody 提交 2022-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 Y 333–528（196 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BICINE pH 8.5, 15% PEG 1,500
分辨率 2.74 Å R-free 0.258
8C89 SARS-CoV-2 spike in complex with the 17T2 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of RBD and Fab) 提交 2023-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 324–533（210 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.41 Å
8C8P Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with the 10D12 heavy-chain-only antibody (local refinement) 提交 2023-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8, 150 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8CBD SARS-CoV-2 Delta-RBD complexed with BA.4/5-1 and EY6A Fabs 提交 2023-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5 and 22% (w/v) PEG 1000
分辨率 3.52 Å R-free 0.266
8CBD SARS-CoV-2 Delta-RBD complexed with BA.4/5-1 and EY6A Fabs 提交 2023-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Y 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5 and 22% (w/v) PEG 1000
分辨率 3.52 Å R-free 0.266
8CBD SARS-CoV-2 Delta-RBD complexed with BA.4/5-1 and EY6A Fabs 提交 2023-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 X 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5 and 22% (w/v) PEG 1000
分辨率 3.52 Å R-free 0.266
8CBE SARS-CoV-2 Delta-RBD complexed with BA.4/5-2 and Beta-49 Fabs 提交 2023-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0 and 18% (w/v) PEG 20000
分辨率 3.16 Å R-free 0.266
8CBF SARS-CoV-2 Delta-RBD complexed with Omi-42 and Beta-49 Fabs 提交 2023-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；containing 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5 and 22% (w/v) PEG 1000
分辨率 2.33 Å R-free 0.255
8CII Delta-RBD complex with BA.2-07 fab, SARS1-34 fab and C1 nanobody 提交 2023-02-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 327–528（202 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8CIM BA.2-07 FAB IN COMPLEX WITH SARS-COV-2 BA.2.12.1 SPIKE GLYCOPROTEIN 提交 2023-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8CIN BA.4/5-5 FAB IN COMPLEX WITH SARS-COV-2 BA.4 SPIKE GLYCOPROTEIN 提交 2023-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 28–1147（1120 aa）
链 B 28–1147（1120 aa）
链 C 28–1147（1120 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8CMA SARS-CoV-2 Delta-RBD complexed with BA.4/5-35 Fab 提交 2023-02-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5, 18% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.29 Å R-free 0.268
8CMB Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 Spike peptide S486-505 提交 2023-02-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 486–505（20 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 DHL 2-AMINO-ETHANETHIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；0.1 M MES pH 6.0, 20 % PEG1500
分辨率 1.84 Å R-free 0.231
8CMC Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 Spike peptide S511-530 提交 2023-02-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 511–530（20 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 SO4 SULFATE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M MES pH 7.0, 25 % PEG8000, 0.2 M (NH4)2SO4
分辨率 1.42 Å R-free 0.208
8CMD Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 Spike peptide S761-775 提交 2023-02-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 761–775（15 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；0.1 M MES pH 5.0, 20 % PEG1500
分辨率 2.54 Å R-free 0.238
8CMD Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 Spike peptide S761-775 提交 2023-02-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 761–775（15 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；0.1 M MES pH 5.0, 20 % PEG1500
分辨率 2.54 Å R-free 0.238
8CMD Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 Spike peptide S761-775 提交 2023-02-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 761–775（15 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；0.1 M MES pH 5.0, 20 % PEG1500
分辨率 2.54 Å R-free 0.238
8CMH Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 Omicron (BA.1) Spike peptide S486-505 提交 2023-02-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 486–505（20 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 30 SO4 SULFATE ION × 1 DHL 2-AMINO-ETHANETHIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；0.1 M Sodium cacodylate pH 6.0, 25 % PEG4000, 0.2 M ammonium sulphate
分辨率 1.64 Å R-free 0.208
8CMI Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 Omicron (BA.1) Spike peptide S761-775 提交 2023-02-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 761–775（15 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M TRIS pH 7.0, 28 % PEG8000, 0.2 M ammonium sulphate
分辨率 2.60 Å R-free 0.236
8CMI Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 Omicron (BA.1) Spike peptide S761-775 提交 2023-02-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 761–775（15 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M TRIS pH 7.0, 28 % PEG8000, 0.2 M ammonium sulphate
分辨率 2.60 Å R-free 0.236
8CMI Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 Omicron (BA.1) Spike peptide S761-775 提交 2023-02-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 761–775（15 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M TRIS pH 7.0, 28 % PEG8000, 0.2 M ammonium sulphate
分辨率 2.60 Å R-free 0.236
8CSA Triple mutant (K417N-E484K-N501Y) SARS-CoV-2 spike protein in the 3-RBD-Down conformation (S-GSAS-D614G-K417N-E484K-N501Y) 提交 2022-05-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：N501Y; K417N; E484K; D614G; esidues 682-685 RRAR mutated to GSAS 突变：N501Y; K417N; E484K; D614G; esidues 682-685 RRAR mutated to GSAS 突变：N501Y; K417N; E484K; D614G; esidues 682-685 RRAR mutated to GSAS 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.84 Å
8CSJ Cryo-EM structure of NTD-directed non-neutralizing antibody 4-33 in complex with prefusion SARS-CoV-2 spike glycoprotein 提交 2022-05-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1147（1134 aa）
链 B 14–1147（1134 aa）
链 C 14–1147（1134 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.53 Å
8CWI Fab arm of antibody 10G4 bound to CoV-2 receptor binding domain (RBD) 提交 2022-05-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–528（196 aa） 片段：receptor binding domain (RBD)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；Equal volumes (0.4 uL) of protein solution (~5 mg/mL in 25 mM Tris (pH 8.0), 200 mM NaCl) were combined with well solution (200 mM MgCl2, 100 mM sodium acetate (pH 5.0), 20 % (w/v) PEG6000) in a sitting drop format.
分辨率 1.87 Å R-free 0.205
8CWK Fab arm of antibodies 4G1-C2 and 10G4 bound to CoV-2 receptor binding domain (RBD) 提交 2022-05-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 333–528（196 aa） 片段：receptor binding domain (RBD)
未记录 GOL GLYCEROL × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Equal volume (2 uL) of protein solution (approx 5 mg/mL, in 25 mM Tris (pH 8.0), 200 mM NaCl) was mixed with an equal volume of well solution comprising 200 mM sodium citrate, 100 mM Bis-Tris-Propane (pH 7.4), 18% PEG3350). For cryoprotection the crystal was swum briefly (5-10 sec) in well solution doped with glycerol to a final concentration of ~25%.
分辨率 2.37 Å R-free 0.223
8CWU Crystal structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor-binding domain in complex with a cross-neutralizing nanobody 1-21 提交 2022-05-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10.5；293 K；20% polyethylene glycol 8000, 0.1 M NaCl, 0.1 M CAPS pH 10.5
分辨率 1.71 Å R-free 0.203
8CWV Crystal structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor-binding domain in complex with a cross-neutralizing nanobody 2-31 and a human antibody CC12.1 Fab 提交 2022-05-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；40% MPD, 0.1M cacodylate pH 6.5 5% (w/v) PEG-8000, final pH 7.0
分辨率 2.51 Å R-free 0.264
8CXN SARS-CoV-2 Spike protein in complex with a pan-sarbecovirus nanobody 2-57 提交 2022-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8CXQ SARS-CoV-2 Spike protein in complex with a pan-sarbecovirus nanobody 1-22 提交 2022-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
8CY6 SARS-CoV-2 Spike protein in complex with a pan-sarbecovirus nanobody 2-65 提交 2022-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8CY7 SARS-CoV-2 Spike protein in complex with a pan-sarbecovirus nanobody 2-34 提交 2022-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 50 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8CY9 SARS-CoV-2 Spike protein in complex with a pan-sarbecovirus nanobody 1-23 提交 2022-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8CYA SARS-CoV-2 Spike protein in complex with a pan-sarbecovirus nanobody 2-67 提交 2022-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8CYB SARS-CoV-2 Spike protein in complex with a pan-sarbecovirus nanobody 1-8 提交 2022-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 AH2 1-deoxy-alpha-D-mannopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8CYC SARS-CoV-2 Spike protein in complex with a pan-sarbecovirus nanobody 2-34 提交 2022-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8CYD SARS-CoV-2 Spike protein in complex with a pan-sarbecovirus nanobody 2-45 提交 2022-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 15–1147（1133 aa）
链 B 15–1147（1133 aa）
链 C 15–1147（1133 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8CYJ RBD of SARS-CoV-2 Spike protein in complex with pan-sarbecovirus nanobodies 2-10, 2-67, 2-62 and 1-25 提交 2022-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 1–1273（1273 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8CZI Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex with extended HR2 提交 2022-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 917–988（72 aa）
链 B 917–988（72 aa）
链 C 917–988（72 aa）
链 D 1157–1201（45 aa）
链 E 1157–1201（45 aa）
链 F 1157–1201（45 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.22 Å
8D0Z S728-1157 IgG in complex with SARS-CoV-2-6P-Mut7 Spike protein (focused refinement) 提交 2022-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Detergent (LMNG) added shortly before vitrification
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8D36 Crystal structure of SARS-CoV-2 fusion peptide in complex with neutralizing antibody COV44-62 提交 2022-05-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 812–826（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293.15 K；0.1 M sodium citrate, pH 4, 1 M lithium chloride, and 10% PEG6000
分辨率 1.45 Å R-free 0.219
8D47 fp.006 Fab in complex with SARS-CoV-2 Fusion Peptide 提交 2022-06-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 812–831（20 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；289 K；0.2 M Potassium phosphate monobasic, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.238
8D47 fp.006 Fab in complex with SARS-CoV-2 Fusion Peptide 提交 2022-06-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 812–831（20 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；289 K；0.2 M Potassium phosphate monobasic, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.238
8D48 sd1.040 Fab in complex with SARS-CoV-2 Spike 2P glycoprotein 提交 2022-06-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1213（1213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8D55 Closed state of SARS-CoV-2 BA.2 variant spike protein 提交 2022-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8D56 One RBD-up state of SARS-CoV-2 BA.2 variant spike protein 提交 2022-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8D5A Middle state of SARS-CoV-2 BA.2 variant spike protein 提交 2022-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8D6Z Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem fusion peptide in complex with neutralizing antibody COV91-27 提交 2022-06-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 809–823（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；70% 2-methyl-2,4-pentanediol and 0.1M HEPES, pH 7.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.279
8D6Z Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem fusion peptide in complex with neutralizing antibody COV91-27 提交 2022-06-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 809–823（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；70% 2-methyl-2,4-pentanediol and 0.1M HEPES, pH 7.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.279
8D6Z Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem fusion peptide in complex with neutralizing antibody COV91-27 提交 2022-06-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 809–823（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；70% 2-methyl-2,4-pentanediol and 0.1M HEPES, pH 7.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.279
8D6Z Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem fusion peptide in complex with neutralizing antibody COV91-27 提交 2022-06-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 809–823（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；70% 2-methyl-2,4-pentanediol and 0.1M HEPES, pH 7.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.279
8D8Q SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with DMAbs 2130 and 2196 提交 2022-06-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 16–1175（1160 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8D8R SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with DMAb 2196 提交 2022-06-08 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1175（1160 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8DAD SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with AZ090 Fab 提交 2022-06-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1213（1213 aa） 片段：Spike 6P
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8DAO Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem fusion peptide in complex with neutralizing antibody COV44-79 提交 2022-06-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 809–823（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 0.01 M nickel (II) chloride, and 20% PEG monomethyl ether 2000
分辨率 2.80 Å R-free 0.284
8DAO Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem fusion peptide in complex with neutralizing antibody COV44-79 提交 2022-06-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 J 809–823（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 0.01 M nickel (II) chloride, and 20% PEG monomethyl ether 2000
分辨率 2.80 Å R-free 0.284
8DCC SARS-CoV-2 Receptor-Binding Domain SPEEDesign Immunogen 3 Bound to P2B-2F6 Fab 提交 2022-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–526（194 aa） 片段：RBD SPEEDesign Immunogen 3 (UNP residues 333-526)
突变：T333K, A363Y, N388K, N394Y, I468T, S514T, H519D, A522P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；0.2 M sodium fluoride, 20% w/v PEG3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.272
8DCE SARS-CoV-2 Receptor-Binding Domain SPEEDesign Immunogen 1 Bound to C144 scFv 提交 2022-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 333–526（194 aa） 片段：RBD SPEEDesign Immunogen 1 (UNP residues 333-526)
突变：T333M,A348P,V362Y,A363Y,N394Q,Y396F,I468T,H519D,A522P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.04 M potassium dihydrogen phosphate, 16% PEG8000, 20% glycerol
分辨率 2.00 Å R-free 0.203
8DF5 SARS-CoV-2 Beta RBD in complex with human ACE2 and S304 Fab and S309 Fab 提交 2022-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 R 328–529（202 aa）
链 S 328–529（202 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 30 CL CHLORIDE ION × 22 ZN ZINC ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10% w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol, 0.1 M Tris (base)/bicine pH 8.5, 3% w/v D- sorbitol
分辨率 2.70 Å R-free 0.217
8DGU Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem helix peptide in complex with Fab of broadly neutralizing antibody CC25.106 isolated from a vaccinated COVID-19 convalescent 提交 2022-06-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1140–1164（25 aa） 片段：Stem helix peptide, residues 1140-1164
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293.15 K；19% (v/v) Isopropanol, 19% (w/v) PEG 4000, 5% (v/v) Glycerol, 0.095 M Sodium citrate pH 5.6
分辨率 1.89 Å R-free 0.245
8DI5 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Beta (B.1.351) spike protein in complex with VH domain F6 (focused refinement of RBD and VH F6) 提交 2022-06-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G,R683S,R685S,F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8DLI Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Alpha (B.1.1.7) spike protein 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8DLJ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Alpha (B.1.1.7) spike protein in complex with human ACE2 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8DLK Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Alpha (B.1.1.7) spike protein in complex with human ACE2 (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2022-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8DLL Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Beta (B.1.351) spike protein 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8DLM Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Beta (B.1.351) spike protein in complex with human ACE2 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
8DLN Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Beta (B.1.351) spike protein in complex with human ACE2 (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2022-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8DLO Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Gamma (P.1) spike protein 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.25 Å
8DLP Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Gamma (P.1) spike protein in complex with human ACE2 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.64 Å
8DLQ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Gamma (P.1) spike protein in complex with human ACE2 (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2022-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.77 Å
8DLR Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Gamma (P.1) spike protein in complex with Fab 4-8 (focused refinement of NTD and 4-8) 提交 2022-07-08 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.51 Å
8DLS Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Gamma (P.1) spike protein in complex with Fab 4A8 (focused refinement of NTD and 4A8) 提交 2022-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.66 Å
8DLT Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Epsilon (B.1.429) spike protein 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8DLU Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Epsilon (B.1.429) spike protein in complex with human ACE2 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
8DLV Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Epsilon (B.1.429) spike protein in complex with human ACE2 (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2022-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
8DLW Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Epsilon (B.1.429) spike protein in complex with Fab S2M11 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.16 Å
8DLX Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Epsilon (B.1.429) spike protein in complex with VH ab6 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.45 Å
8DLY Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Epsilon (B.1.429) spike protein in complex with VH ab6 (focused refinement of NTD and VH ab6) 提交 2022-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8DLZ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 D614G spike protein in complex with VH ab6 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G 突变：D614G 突变：D614G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.57 Å
8DM0 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 D614G spike protein in complex with VH ab6 (focused refinement of NTD and VH ab6) 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：D614G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.21 Å
8DM1 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike protein 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8DM2 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike protein (focused refinement of NTD) 提交 2022-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8DM3 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike protein in complex with Fab 4A8 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.37 Å
8DM4 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike protein in complex with Fab 4A8 (focused refinement of NTD and 4A8) 提交 2022-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.45 Å
8DM5 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike protein in complex with human ACE2 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.51 Å
8DM6 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike protein in complex with human ACE2 (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2022-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.77 Å
8DM7 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike protein in complex with mouse ACE2 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.49 Å
8DM8 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike protein in complex with mouse ACE2 (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2022-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.68 Å
8DM9 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike protein in complex with mouse ACE2 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8DMA Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike protein in complex with mouse ACE2 (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2022-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8DNN Crystal structure of neutralizing antibody 80 in complex with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2022-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 319–541（223 aa）
链 D 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M di-ammonium tartarate, 20% (w/v) polyethylene glycol 3350
分辨率 3.12 Å R-free 0.252
8DPZ Local refinement of SARS-CoV-2 vaccine induced antibody DH1338 bound to SARS-CoV-2 HexaPro RBD Spike ectodomain 提交 2022-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 326–530（205 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
8DT3 Cryo-EM structure of spike binding to Fab of neutralizing antibody (locally refined) 提交 2022-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8DT8 LM18/Nb136 bispecific tetra-nanobody immunoglobulin in complex with SARS-CoV-2-6P-Mut7 S protein (focused refinement) 提交 2022-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Detergent added shortly to grid application
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.34 Å
8DTK Structure of RBD directed antibody DH1047 in complex with SARS-CoV-2 spike: Local refinement of RBD-Fab interace 提交 2022-07-25 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.77 Å
8DTR Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem helix peptide in complex with neutralizing antibody COV30-14 提交 2022-07-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1145–1159（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.1M sodium cacodylate, pH6.5, 0.2M sodium chloride, and 2M ammonium sulfate
分辨率 1.50 Å R-free 0.222
8DTR Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem helix peptide in complex with neutralizing antibody COV30-14 提交 2022-07-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1145–1159（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.1M sodium cacodylate, pH6.5, 0.2M sodium chloride, and 2M ammonium sulfate
分辨率 1.50 Å R-free 0.222
8DTT Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem helix peptide in complex with neutralizing antibody COV93-03 提交 2022-07-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1148–1162（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；0.2M sodium chloride, 0.1M Tris, pH7, 30% PEG3000
分辨率 1.75 Å R-free 0.225
8DTT Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem helix peptide in complex with neutralizing antibody COV93-03 提交 2022-07-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1148–1162（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；0.2M sodium chloride, 0.1M Tris, pH7, 30% PEG3000
分辨率 1.75 Å R-free 0.225
8DTX Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem helix peptide in complex with neutralizing antibody COV89-22 提交 2022-07-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 1145–1159（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293.15 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.6, 20% 2-propanol, and 20% PEG4000
分辨率 1.60 Å R-free 0.210
8DTX Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem helix peptide in complex with neutralizing antibody COV89-22 提交 2022-07-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1145–1159（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293.15 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.6, 20% 2-propanol, and 20% PEG4000
分辨率 1.60 Å R-free 0.210
8DV1 SARS-CoV-2 Wuhan-hu-1-Spike-RBD bound to linker variant of affinity matured ACE2 mimetic CVD432 提交 2022-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8DV2 SARS-CoV-2 Wuhan-hu-1-Spike-RBD bound to computationally engineered ACE2 mimetic CVD293 提交 2022-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8DW2 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with anti-SARS-CoV-2 DARPin,SR22, and two antibody Fabs, S309 and CR3022 提交 2022-07-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 330–526（197 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 330-526)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES, 7.4, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.11 Å
8DW3 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with anti-SARS-CoV-2 DARPin,SR16m, and two antibody Fabs, S309 and CR3022 提交 2022-07-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 330–526（197 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 330-526)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES, 7.4, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.26 Å
8DW9 Crystal structure of neutralizing antibody D29 Fab in complex with SARS-CoV-2 spike receptor binding domain (RBD) 提交 2022-08-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–527（195 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 333-527)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2 M ammonium sulfate, 0.05 M MES, pH 6.0, 5 mM magnesium acetate tetrahydrate
分辨率 4.00 Å R-free 0.381
8DW9 Crystal structure of neutralizing antibody D29 Fab in complex with SARS-CoV-2 spike receptor binding domain (RBD) 提交 2022-08-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 333–527（195 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 333-527)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2 M ammonium sulfate, 0.05 M MES, pH 6.0, 5 mM magnesium acetate tetrahydrate
分辨率 4.00 Å R-free 0.381
8DWA Crystal structure of neutralizing antibody P1D9 Fab in complex with SARS-CoV-2 spike receptor binding domain (RBD) 提交 2022-08-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 335–515（181 aa） 片段：receptor binding domain (UNP residues 335-515)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES, pH 6.5, 18% w/v PEG5000 MME
分辨率 3.20 Å R-free 0.297
8DXS Cryo-EM structure of RBD-directed neutralizing antibody P2B4 in complex with prefusion SARS-CoV-2 spike glycoprotein 提交 2022-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 44 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.76 Å
8DXT Fab arm of antibody GAR12 bound to the receptor binding domain of SARS-CoV-2. 提交 2022-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 333–528（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；An equal volume (2 uL) of protein solution at ~5 mg/mL (in 25 mM Tris (pH 8.0), 200 mM NaCl) was combined with well solution (100 mM ammonium citrate (pH 5.5), 20% (w/v) PEG3350.
分辨率 2.25 Å R-free 0.254
8DXU Fab arms of antibodies GAR03 and 10G4 bound to the receptor binding domain of SARS-CoV-2 in a 1:1:1 complex. 提交 2022-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 333–528（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；Two uL of protein solution (~5 mg/mL of 1:1:1 complex in 25 mM Tris (pH 8.0), 200 mM NaCl) was combined with an equal volume of well solution (100 mM MMT buffer system (Molecular Dimensions) (pH 6.0), 19% (w/v) PEG6000.
分辨率 2.73 Å R-free 0.269
8DZH Structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.1.1.529 Spike trimer with two RBDs down in complex with the Fab fragment of human neutralizing antibody MB.02 提交 2022-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8DZI Structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.1.1.529 Spike trimer with one RBD down in complex with the Fab fragment of human neutralizing antibody MB.02 提交 2022-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8E1G SARS-CoV-2 RBD in complex with Omicron-neutralizing antibody 2A10 提交 2022-08-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–591（273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1 uL 7.4 mg/mL protein; 1 uL 23%w/v PEG 3350, 230 mM Ammonium fluoride
分辨率 2.57 Å R-free 0.244
8E1G SARS-CoV-2 RBD in complex with Omicron-neutralizing antibody 2A10 提交 2022-08-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–591（273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1 uL 7.4 mg/mL protein; 1 uL 23%w/v PEG 3350, 230 mM Ammonium fluoride
分辨率 2.57 Å R-free 0.244
8EDF Bovine Fab SKD in complex with Sars COV-2 receptor binding domain 提交 2022-09-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；293.15 K；0.4M Lithium chloride, 10% Peg6000, 0.1M sodium citrate
分辨率 3.40 Å R-free 0.299
8EKD Cryo-EM map of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike in complex with 2130-1-0114-112 提交 2022-09-20 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 333–516（184 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8EL2 SARS-CoV-2 RBD bound to neutralizing antibody Fab ICO-hu23 提交 2022-09-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；10% PEG 8000, 0.1 M MES at pH 5.5, 0.2 M zinc acetate, 3% ethylene glycol, 3% glycerol, 10 mM cadmium chloride hydrate, 4% v/v polypropylene glycol P 400, 3% v/v 2-propanol
分辨率 2.89 Å R-free 0.281
8EL2 SARS-CoV-2 RBD bound to neutralizing antibody Fab ICO-hu23 提交 2022-09-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；10% PEG 8000, 0.1 M MES at pH 5.5, 0.2 M zinc acetate, 3% ethylene glycol, 3% glycerol, 10 mM cadmium chloride hydrate, 4% v/v polypropylene glycol P 400, 3% v/v 2-propanol
分辨率 2.89 Å R-free 0.281
8ELH Crystal Structure of HLA-B*15:01 in complex with spike derived peptide NQKLIANQF from SARS-CoV-2 virus 提交 2022-09-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 919–927（9 aa） 片段：NQK-OC43 peptide (UNP residues 919-927)
未记录 ACT ACETATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.2 M sodium formate, pH 7.0, 20% w/v PEG3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.223
8ELJ SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with the ICO-hu23 neutralizing antibody Fab fragment 提交 2022-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 13–1211（1199 aa）
链 B 13–1211（1199 aa）
链 C 13–1211（1199 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8ELO Crystal structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor-binding domain in complex with antibody CC12.1 Fab and nanobody Nb-C4-225 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% (w/v) PEG-3350, 0.2 M di-Ammonium citrate
分辨率 2.72 Å R-free 0.261
8ELP Crystal structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor-binding domain in complex with antibody CC12.1 Fab and nanobody Nb-C4-240 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；0.16 M ammonium sulfate, 0.08 M sodium acetate pH 4.6, 20% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20% (v/v) glycerol
分辨率 2.83 Å R-free 0.284
8ELQ Crystal structure of SARS-CoV-2 spike protein receptor-binding domain in complex with antibody CC12.1 Fab and nanobody Nb-C4-255 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4.6, 25% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 2.21 Å R-free 0.285
8EOO Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing human antibodies WRAIR-2063 and WRAIR-2151 提交 2022-10-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain (RBD)
未记录 GOL GLYCEROL × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM Bis-Tris propane HCl pH 8.5, 200 mM Na malonate dibasic, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.77 Å R-free 0.255
8EOO Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing human antibodies WRAIR-2063 and WRAIR-2151 提交 2022-10-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain (RBD)
未记录 GOL GLYCEROL × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM Bis-Tris propane HCl pH 8.5, 200 mM Na malonate dibasic, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.77 Å R-free 0.255
8EPN Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike trimer S2D14 in the 3-RBD Down conformation 提交 2022-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 27–1147（1121 aa）
链 B 27–1147（1121 aa）
链 C 27–1147（1121 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10mM Tris + 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8EPP Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike trimer S2D14 with two RBDs in the open conformation 提交 2022-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 27–1147（1121 aa）
链 B 27–1147（1121 aa）
链 C 27–1147（1121 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10mM Tris + 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8EPQ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike trimer S2D14 with two RBDs exposed 提交 2022-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 27–1147（1121 aa）
链 B 27–1147（1121 aa）
链 C 27–1147（1121 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10mM Tris + 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8EQF cryoEM structure of a broadly neutralizing anti-SARS-CoV-2 antibody STI-9167 提交 2022-10-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
8ERQ SARS-CoV-2 BA.1 spike ectodomain trimer in complex with the S2X324 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the RBD and S2X324) 提交 2022-10-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–210（210 aa）
链 A 212–1207（996 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8ERR SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike ectodomain trimer in complex with the S2X324 neutralizing antibody Fab fragment 提交 2022-10-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–210（210 aa）
链 A 212–1207（996 aa）
链 B 1–210（210 aa）
链 B 212–1207（996 aa）
链 C 1–210（210 aa）
链 C 212–1207（996 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 48 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8EYG SARS-CoV-2 spike protein complexed with two nanobodies 提交 2022-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 14–1149（1136 aa）
链 B 14–1149（1136 aa）
链 C 14–1149（1136 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 20 seconds and blot time 3 seconds
分辨率 3.73 Å
8EYH SARS-CoV-2 spike protein bound with a nanobody 提交 2022-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 14–1149（1136 aa）
链 B 14–1149（1136 aa）
链 C 14–1149（1136 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å
8F0G Structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike in complex with antibody Fab 1C3 提交 2022-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；TBS buffer pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8F0H Structure of SARS-CoV-2 spike with antibody Fabs 2A10 and 1H2 (Local refinement of the RBD and Fabs 1H2 and 2A10) 提交 2022-11-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；TBS buffer pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
8F0I Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with human antibody COVA309-22 提交 2022-11-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.5, 0.2 M magnesium chloride, and 20% (w/v) polyethylene glycol 1000
分辨率 3.70 Å R-free 0.275
8F0I Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with human antibody COVA309-22 提交 2022-11-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.5, 0.2 M magnesium chloride, and 20% (w/v) polyethylene glycol 1000
分辨率 3.70 Å R-free 0.275
8F0I Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with human antibody COVA309-22 提交 2022-11-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.5, 0.2 M magnesium chloride, and 20% (w/v) polyethylene glycol 1000
分辨率 3.70 Å R-free 0.275
8F2J Crystal structure of antibody WRAIR-2134 in complex with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2022-11-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；8% v/v Tacsimate pH 5.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 3.16 Å R-free 0.245
8F2J Crystal structure of antibody WRAIR-2134 in complex with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2022-11-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；8% v/v Tacsimate pH 5.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 3.16 Å R-free 0.245
8F2J Crystal structure of antibody WRAIR-2134 in complex with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2022-11-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；8% v/v Tacsimate pH 5.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 3.16 Å R-free 0.245
8F2J Crystal structure of antibody WRAIR-2134 in complex with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2022-11-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；8% v/v Tacsimate pH 5.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 3.16 Å R-free 0.245
8F2X Crystal structure of antibody WRAIR-2123 in complex with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2022-11-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.12 M alcohol mixture (1,6-Hexanediol; 1-Butanol; 1,2-Propanediol; 2-Propanol; 1,4-Butanediol; 1,3-Propanediol), 0.1M buffer system 3 (Tris base and BICINE, pH 8.5), 50% precipitant mix 4 (25% v/v MPD; 25% PEG 1000; 25% w/v PEG 3350) and 0.1 M Manganese(II) chloride tetrahydrate.
分辨率 3.50 Å R-free 0.324
8F4P SARS-CoV-2 spike protein trimer (down conformation) bound with a nanobody 提交 2022-11-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 14–1149（1136 aa）
链 B 14–1149（1136 aa）
链 C 14–1149（1136 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8FA1 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex with N969K mutation 提交 2022-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1157–1201（45 aa）
链 E 1157–1201（45 aa）
链 F 1157–1201（45 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.51 Å
8FA2 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 Omicron HR1-42G complex 提交 2022-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 917–988（72 aa）
链 B 917–988（72 aa）
链 C 917–988（72 aa）
链 D 1157–1201（45 aa）
链 E 1157–1201（45 aa）
链 F 1157–1201（45 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
8FAH Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with SARS-CoV-2 reactive human antibody CR3022 提交 2022-11-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1M Succinic acid, 0.1M HEPES pH 7.0 and 2% PEG MME2000
分辨率 4.22 Å R-free 0.286
8FDW Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 postfusion spike in membrane 提交 2022-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 686–1273（588 aa）
链 B 686–1273（588 aa）
链 C 686–1273（588 aa）
未记录 MAN alpha-D-mannopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8FEZ Prefusion-stabilized SARS-CoV-2 spike protein 提交 2022-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：N856L, A899Q, L916F, Y917W, T941D, A956L, K964E, D985N, P1143Q 突变：N856L, A899Q, L916F, Y917W, T941D, A956L, K964E, D985N, P1143Q 突变：N856L, A899Q, L916F, Y917W, T941D, A956L, K964E, D985N, P1143Q 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.72 Å
8FHY Crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody WRAIR-5021 提交 2022-12-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 GOL GLYCEROL × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium malonate pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.53 Å R-free 0.256
8FHY Crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody WRAIR-5021 提交 2022-12-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 GOL GLYCEROL × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium malonate pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.53 Å R-free 0.256
8FHY Crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody WRAIR-5021 提交 2022-12-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 GOL GLYCEROL × 9 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MLI MALONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium malonate pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.53 Å R-free 0.256
8FI9 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody WRAIR-5001 提交 2022-12-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Phosphate-citrate pH 4.5, 20% w/v PEG 8000
分辨率 4.20 Å R-free 0.296
8FI9 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody WRAIR-5001 提交 2022-12-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Phosphate-citrate pH 4.5, 20% w/v PEG 8000
分辨率 4.20 Å R-free 0.296
8FI9 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody WRAIR-5001 提交 2022-12-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 O 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Phosphate-citrate pH 4.5, 20% w/v PEG 8000
分辨率 4.20 Å R-free 0.296
8FI9 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody WRAIR-5001 提交 2022-12-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Phosphate-citrate pH 4.5, 20% w/v PEG 8000
分辨率 4.20 Å R-free 0.296
8FU7 Structure of Covid Spike variant deltaN135 in fully closed form 提交 2023-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1204（1204 aa）
链 B 1–1204（1204 aa）
链 C 1–1204（1204 aa）
突变：A892P, A942P, D614N,V987P 突变：A892P, A942P, D614N,V987P 突变：A892P, A942P, D614N,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 48 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.21 Å
8FU8 Structure of Covid Spike variant deltaN135 with one erect RBD 提交 2023-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：A892P,A942P,D614N,V987P 突变：A892P,A942P,D614N,V987P 突变：A892P,A942P,D614N,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 48 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
8FU9 Structure of Covid Spike variant deltaN25 with one erect RBD 提交 2023-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：A892P,A942P,V987P,D614N,D253N,L452Q,F490S,T859N 突变：A892P,A942P,V987P,D614N,D253N,L452Q,F490S,T859N 突变：A892P,A942P,V987P,D614N,D253N,L452Q,F490S,T859N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 38 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
8FXB SARS-CoV-2 XBB.1 spike RBD bound to the human ACE2 ectodomain and the S309 neutralizing antibody Fab fragment 提交 2023-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 328–528（201 aa） 片段：Receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8FXC SARS-CoV-2 BQ.1.1 spike RBD bound to the human ACE2 ectodomain and the S309 neutralizing antibody Fab fragment 提交 2023-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 328–528（201 aa） 片段：Receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8G70 SARS-CoV-2 spike/nanobody mixture complex 提交 2023-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 D 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8G71 Spike/Nb2 complex with 1 RBD up 提交 2023-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 D 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.10 Å
8G72 SARS-CoV-2 spike/Nb2 complex with 1 RBD up (local refinement at 5.6 A) 提交 2023-02-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 14–1211（1198 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
8G73 SARS-CoV-2 spike/Nb3 complex with 2 RBDs up and 3 Nb3 bound at 2.5 A 提交 2023-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 D 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8G74 SARS-CoV-2 spike/Nb3 complex with 1 RBD up and 2 Nb3 提交 2023-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 D 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8G75 SARS-CoV-2 spike/Nb4 complex with 2 RBDs up and 3 Nb4 bound 提交 2023-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 D 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8G76 SARS-CoV-2 spike/Nb5 complex 提交 2023-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 D 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8G77 SARS-CoV-2 spike/Nb6 complex 提交 2023-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 D 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8G78 Local refinement of SARS-CoV-2 spike/nanobody mixture complex around NTD 提交 2023-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 D 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8G79 Local refinement of SARS-CoV-2 spike/nanobody mixture complex around RBD 提交 2023-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 D 14–1211（1198 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
8G7A SARS-CoV-2 spike/Nb3 complex with 2 RBDs up and 3 Nb3 (local refinement) 提交 2023-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 D 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8G7B SARS-CoV-2 spike/Nb3 complex with 1 RBD up and 2 Nb3 (local refinement) 提交 2023-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 D 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8G7C local refinement of SARS-CoV-2 spike/Nb4 complex with 2 RBDs up and 3 Nb4 bound 提交 2023-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 D 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8GB0 SARS-CoV-2 Spike H655Y variant, One RBD Open 提交 2023-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8GB5 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody 25F9 提交 2023-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 BCN BICINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9, and 15% glycerol
分辨率 3.35 Å R-free 0.320
8GB5 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody 25F9 提交 2023-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 BCN BICINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9, and 15% glycerol
分辨率 3.35 Å R-free 0.320
8GB5 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody 25F9 提交 2023-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 BCN BICINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9, and 15% glycerol
分辨率 3.35 Å R-free 0.320
8GB5 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody 25F9 提交 2023-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9, and 15% glycerol
分辨率 3.35 Å R-free 0.320
8GB6 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody 21B6 提交 2023-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.3；298.15 K；0.1 M sodium citrate, pH 3.3 and 1.45 M ammonium sulfate
分辨率 1.75 Å R-free 0.221
8GB7 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody 20A7 提交 2023-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.2 M CaCl2, 10% ethylene glycol (v/v), and 20% polyethylene glycol 3350 (w/v)
分辨率 2.57 Å R-free 0.245
8GB8 Crystal structure of SARS-CoV-2 BA.2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody 20A7 提交 2023-02-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 319–541（223 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 319-541
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GOL GLYCEROL × 1 GLY GLYCINE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 10% (v/v) glycerol, 5% (w/v) polyethylene glycol 3000, and 30% (v/v) polyethylene glycol 400
分辨率 2.30 Å R-free 0.228
8GDR SARS-Cov2 S protein structure in complex with neutralizing monoclonal antibody 002-S21B10 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 14–1149（1136 aa）
链 E 14–1149（1136 aa）
链 F 14–1149（1136 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8GF2 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies eCR3022.20 and CC12.3 提交 2023-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate - citric acid buffer pH 5.0, 15% (v/v) ethylene glycol, 1 M lithium chloride, and 10% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 2.85 Å R-free 0.252
8GF2 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies eCR3022.20 and CC12.3 提交 2023-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate - citric acid buffer pH 5.0, 15% (v/v) ethylene glycol, 1 M lithium chloride, and 10% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 2.85 Å R-free 0.252
8GJM 17b10 fab in complex with full-length SARS-CoV-2 Spike G614 trimer 提交 2023-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8GJN 17B10 fab in complex with up-RBD of SARS-CoV-2 Spike G614 trimer 提交 2023-03-16 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 333–530（198 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8GNH Complex structure of BD-218 and Spike protein 提交 2022-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；25mM Tris, pH 8.0, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
8GOM SARS-CoV-2 specific private TCR RLQ7 in complex with RLQ-HLA-A2 提交 2022-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1000–1008（9 aa） 片段：RLQ epitope
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 0.01 M Trimethylamine hydrochloride, 15% PEG 6000.
分辨率 2.78 Å R-free 0.248
8GON SARS-CoV-2 specific private TCR RLQ7 in complex with RLQ-T1006I-HLA-A2 提交 2022-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1000–1008（9 aa） 片段：RLQ mutant epitope
突变：T10006I PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 15% PEG 6000
分辨率 2.60 Å R-free 0.253
8GOU Omicron BA.4/5 SARS-CoV-2 S in complex with TH003 Fab 提交 2022-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S,F817P, A892P, A899P,A942P K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S,F817P, A892P, A899P,A942P K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S,F817P, A892P, A899P,A942P K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8GPY Crystal structure of Omicron BA.4/5 RBD in complex with a neutralizing antibody scFv 提交 2022-08-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Potassium formate, PEG 3350
分辨率 2.51 Å R-free 0.251
8GPY Crystal structure of Omicron BA.4/5 RBD in complex with a neutralizing antibody scFv 提交 2022-08-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 B 333–530（198 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Potassium formate, PEG 3350
分辨率 2.51 Å R-free 0.251
8GRY Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 RBD in complex with rat ACE2 (local refinement) 提交 2022-09-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa） 片段：RBD
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
8GS6 Structure of the SARS-CoV-2 BA.2.75 spike glycoprotein (closed state 1) 提交 2022-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 12–1210（1199 aa）
链 B 12–1210（1199 aa）
链 C 12–1210（1199 aa）
突变：R682G, R683S, R685G, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685G, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685G, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Octyl glucoside solution was added to PBS solution to a final concentration of 0.01%
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 2.86 Å
8GS9 SARS-CoV-2 BA.2 spike RBD in complex bound with VacBB-551 提交 2022-09-05 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 337–517（181 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 5s, wait for 2s, blot force:0
分辨率 2.66 Å
8GSB SARS-COV-2 BA.1 Spike incomplex with VacBB-665 提交 2022-09-05 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 5s, waiting for 2.5s, blot force 0
分辨率 3.99 Å
8GTO cryo-EM structure of Omicron BA.5 S protein in complex with XGv282 提交 2022-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8GTP cryo-EM structure of Omicron BA.5 S protein in complex with XGv289 提交 2022-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8GTQ cryo-EM structure of Omicron BA.5 S protein in complex with S2L20 提交 2022-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8GX9 Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD with P2C-1F11 and P2B-1G5 提交 2022-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 319–529（211 aa）
链 E 319–529（211 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2M sodium chloride, 0.1M MES, pH 6.0, 20% PEG 2000 MME
分辨率 4.01 Å R-free 0.297
8GZ5 Crystal structure of neutralizing VHH P17 in complex with SARS-CoV-2 Alpha variant spike receptor-binding domain 提交 2022-09-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 333–530（198 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1M Bis-Tris propane pH 7.0, 1.0M succinic acid pH 7.0
分辨率 1.70 Å R-free 0.189
8GZZ Local refinement of SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Spike glycoprotein in complex with rabbit monoclonal antibody 1H1 Fab 提交 2022-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 334–527（194 aa） 片段：SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Spike glycoprotein receptor binding domain
链 B 334–527（194 aa） 片段：SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Spike glycoprotein receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
8H00 SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Spike glycoprotein in complex with rabbit monoclonal antibody 1H1 Fab in the class 1 conformation 提交 2022-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
8H01 SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Spike glycoprotein in complex with rabbit monoclonal antibody 1H1 Fab in class 2 conformation 提交 2022-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F819P, A892P, A899P, A942P 突变：R682G, R683S, R685S, F819P, A892P, A899P, A942P 突变：R682G, R683S, R685S, F819P, A892P, A899P, A942P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8H06 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.4/5 RBD in complex with human ACE2 (local refinement) 提交 2022-09-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.66 Å
8H07 SARS-CoV-2 BA.4 variants S ectodomain trimer in complex with neutralizing antibody 10-5B and 6-2C 提交 2022-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8H08 SARS-CoV-2 BA.1 variants S ectodomain trimer in complex with neutralizing antibody 10-5B and 6-2C 提交 2022-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8H3D Structure of apo SARS-CoV-2 spike protein with one RBD up 提交 2022-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1211（1211 aa） 片段：SARS-CoV-2 spike protein,SARS-CoV-2 spike protein
链 B 1–1211（1211 aa） 片段：SARS-CoV-2 spike protein,SARS-CoV-2 spike protein
链 C 1–1211（1211 aa） 片段：SARS-CoV-2 spike protein,SARS-CoV-2 spike protein
突变：R682S,R683G,R685G,K986P,V987P 突变：R682S,R683G,R685G,K986P,V987P 突变：R682S,R683G,R685G,K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
8H3E Complex structure of a small molecule (SPC-14) bound SARS-CoV-2 spike protein, closed state 提交 2022-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1211（1211 aa） 片段：SARS-CoV-2 spike protein,SARS-CoV-2 spike protein
链 B 1–1211（1211 aa） 片段：SARS-CoV-2 spike protein,SARS-CoV-2 spike protein
链 C 1–1211（1211 aa） 片段：SARS-CoV-2 spike protein,SARS-CoV-2 spike protein
突变：R682S,R683G,R685G,K986P,V987P 突变：R682S,R683G,R685G,K986P,V987P 突变：R682S,R683G,R685G,K986P,V987P Q83 7-(6-nitro-2,3-dihydroindol-1-yl)-7-oxidanyidene-heptanoic acid × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
8H3M Conformation 1 of SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Variant Spike protein complexed with MO1 Fab 提交 2022-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1212（1212 aa）
链 B 1–1212（1212 aa）
链 C 1–1212（1212 aa）
突变：;D614G, R682del, R683del, R685del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P A67V, H69del, V70del, T95I, G142D, V143del, Y144del, Y145del, N211del, L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F ; 突变：;D614G, R682del, R683del, R685del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P A67V, H69del, V70del, T95I, G142D, V143del, Y144del, Y145del, N211del, L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F ; 突变：;D614G, R682del, R683del, R685del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P A67V, H69del, V70del, T95I, G142D, V143del, Y144del, Y145del, N211del, L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.48 Å
8H3N Conformation 2 of SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Variant Spike protein complexed with MO1 Fab 提交 2022-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1212（1212 aa）
链 B 1–1212（1212 aa）
链 C 1–1212（1212 aa）
突变：;D614G, R682del, R683del, R685del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P A67V, H69del, V70del, T95I, G142D, V143del, Y144del, Y145del, N211del, L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981 ; 突变：;D614G, R682del, R683del, R685del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P A67V, H69del, V70del, T95I, G142D, V143del, Y144del, Y145del, N211del, L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981 ; 突变：;D614G, R682del, R683del, R685del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P A67V, H69del, V70del, T95I, G142D, V143del, Y144del, Y145del, N211del, L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981 ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
8H5C Structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2.75 RBD in complex with human ACE2 提交 2022-10-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.15 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium HEPES, 20 % w/v PEG 4000
分辨率 2.90 Å R-free 0.242
8H5T Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain in complex with neutralizing nanobody Nb-015 提交 2022-10-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 320–537（218 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M sodium formate, pH 7.2, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.205
8H5U Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain in complex with neutralizing nanobody Nb-021 提交 2022-10-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 320–537（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.0, 18% w/v polyethylene glycol 20000
分辨率 2.40 Å R-free 0.245
8H5U Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain in complex with neutralizing nanobody Nb-021 提交 2022-10-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 320–537（218 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.0, 18% w/v polyethylene glycol 20000
分辨率 2.40 Å R-free 0.245
8H6F Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike protein in complex with A6 repebody 提交 2022-10-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K980P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K980P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K980P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 200mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8H7L Cryo-EM Structure of SARS-CoV-2 BA.2 Spike protein in complex with BA7535 提交 2022-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 18–1143（1126 aa）
链 B 18–1143（1126 aa）
链 C 18–1143（1126 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.44 Å
8H7Z Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 BA.2 RBD in complex with BA7535 fab (local refinement) 提交 2022-10-21 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 332–528（197 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
8H91 Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain in complex with nanobody N19 提交 2022-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 334–527（194 aa）
链 B 334–527（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；1%(w/v) Tryptone, 0.001 M Sodiumazide, 0.05 M HepesSodium pH7.0, 20%(w/v) polyethyleneglycol3350
分辨率 3.07 Å R-free 0.284
8HC2 SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike trimer (6P) in complex with 1 YB9-258 Fab (1 RBD up) 提交 2022-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
突变：671-674del,F817P,A892P,A899P,A942P,K976P,V977P 突变：671-674del,F817P,A892P,A899P,A942P,K976P,V977P 突变：671-674del,F817P,A892P,A899P,A942P,K976P,V977P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.21 Å
8HC3 SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike trimer (6P) in complex with 2 YB9-258 Fabs (2 RBD up) 提交 2022-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.35 Å
8HC4 SARS-CoV-2 wildtype spike trimer (6P) in complex with 3 YB9-258 Fabs and 3 R1-32 Fabs (3 RBD up) 提交 2022-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8HC5 SARS-CoV-2 wildtype S1 in complex with YB9-258 Fab and R1-32 Fab 提交 2022-11-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–676（676 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
8HC6 SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike trimer (6P) in complex with YB9-258 Fab, focused refinement of Fab region 提交 2022-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 14–289（276 aa）
链 C 322–588（267 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.69 Å
8HC7 SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike trimer (6P) complex with YB9-258 Fab, focused refinement of RBD-dimer region 提交 2022-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 322–588（267 aa）
链 C 14–526（513 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.54 Å
8HC8 SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike trimer (6P) in complex with YB13-292 Fab, focused refinement of Fab region 提交 2022-11-01 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 332–517（186 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8HC9 SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike trimer (6P) in complex with 3 YB13-292 Fabs (3 RBD down) 提交 2022-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.03 Å
8HCA SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike trimer (6P) in complex with 3 YB13-292 Fabs (1 RBD up) 提交 2022-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.35 Å
8HCB SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike trimer (6P) in complex with 3 YB13-292 Fabs (2 RBD up) 提交 2022-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.18 Å
8HEB SARS-CoV-2 Spike trimer in complex with RmAb 9H1 Fab in the class 1 conformation 提交 2022-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.53 Å
8HEC SARS-CoV-2 Spike trimer in complex with RmAb 9H1 Fab in the class 2 conformation 提交 2022-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8HED Local refinement of the SARS-CoV-2 Spike trimer in complex with RmAb 9H1 Fab 提交 2022-11-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 331–530（200 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
8HES Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD and NIV-10 complex 提交 2022-11-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 322–536（215 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Sodium nitrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.241
8HFX Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike protein in complex with white-tailed deer ACE2 提交 2022-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
8HFY SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike protein receptor-binding domain in complex with white-tailed deer ACE2 提交 2022-11-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.21 Å
8HFZ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 prototype spike protein in complex with white-tailed deer ACE2 提交 2022-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1217（1217 aa）
链 B 1–1217（1217 aa）
链 C 1–1217（1217 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.71 Å
8HG0 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 prototype spike protein receptor-binding domain in complex with white-tailed deer ACE2 提交 2022-11-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
8HGL SARS-CoV-2 spike in complex with neutralizing antibody NIV-11 提交 2022-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；octyl-maltoside, fluorinated solution was added to PBS solution to a final concentration of 0.03%
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 2.90 Å
8HGM Structure of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with neutralizing antibody NIV-11 提交 2022-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；octyl-maltoside, fluorinated solution was added to PBS solution to a final concentration of 0.03%
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.40 Å
8HHX SARS-CoV-2 Delta Spike in complex with FP-12A 提交 2022-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Tris pH 7.5 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
8HHY SARS-CoV-2 Delta Spike in complex with IS-9A 提交 2022-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Tris pH 7.5 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.77 Å
8HHZ SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Spike in complex with IY-2A 提交 2022-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1210（1197 aa）
链 B 14–1210（1197 aa）
链 C 14–1210（1197 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Tris pH 7.5 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
8HLC S protein of SARS-CoV-2 in complex with 3711 提交 2022-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P 突变：K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 38 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8HLD S protein of SARS-CoV-2 in complex with 26434 提交 2022-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8HN6 Crystal structure of monoclonal antibody complexed with SARS-CoV-2 RBD 提交 2022-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 333–527（195 aa）
链 F 333–527（195 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；PEG 3350,0.1 M HEPES,0.2 M LProline
分辨率 2.07 Å R-free 0.214
8HN7 Crystal structure of monoclonal antibody complexed with SARS-CoV-2 RBD 提交 2022-12-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；PEG4000,magnesium chloride, HEPES
分辨率 3.00 Å R-free 0.263
8HN7 Crystal structure of monoclonal antibody complexed with SARS-CoV-2 RBD 提交 2022-12-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；PEG4000,magnesium chloride, HEPES
分辨率 3.00 Å R-free 0.263
8HP9 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 S-trimer in complex with fab L4.65 and L5.34 提交 2022-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 14–1147（1134 aa）
链 B 14–1147（1134 aa）
链 C 14–1147（1134 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
8HPF Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 RBD in complex with fab L4.65 and L5.34 提交 2022-12-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 335–527（193 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.34 Å
8HPQ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.4 S-trimer in complex with fab L4.65 and L5.34 提交 2022-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 14–1147（1134 aa）
链 B 14–1147（1134 aa）
链 C 14–1147（1134 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
8HPU Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.4 RBD in complex with fab L4.65 and L5.34 提交 2022-12-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8HPV Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron Prototype S-trimer in complex with fab L4.65 and L5.34 提交 2022-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 14–1147（1134 aa）
链 B 14–1147（1134 aa）
链 C 14–1147（1134 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
8HQ7 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron Prototype RBD in complex with fab L4.65 and L5.34 提交 2022-12-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–527（195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8HR2 Ternary Crystal Complex Structure of RBD with NB1B5 and NB1C6 提交 2022-12-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–523（191 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293.15 K；0.2 mM HEPES pH7.0;12% PEG3350
分辨率 1.94 Å R-free 0.222
8HRD Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Delta variant in complex with IMCAS74 Fab and W14 Fab 提交 2022-12-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Ammonium formate, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.86 Å R-free 0.244
8HRD Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Delta variant in complex with IMCAS74 Fab and W14 Fab 提交 2022-12-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Ammonium formate, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.86 Å R-free 0.244
8HRD Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Delta variant in complex with IMCAS74 Fab and W14 Fab 提交 2022-12-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 K 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Ammonium formate, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.86 Å R-free 0.244
8HRD Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Delta variant in complex with IMCAS74 Fab and W14 Fab 提交 2022-12-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 T 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Ammonium formate, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.86 Å R-free 0.244
8HRI SARS-CoV-2 Delta variant spike protein 提交 2022-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 15–1208（1194 aa）
链 B 15–1208（1194 aa）
链 C 15–1208（1194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8HRJ SARS-CoV-2 Delta variant spike protein 提交 2022-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 15–1208（1194 aa）
链 B 15–1208（1194 aa）
链 C 15–1208（1194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8HRK SARS-CoV-2 Delta S-RBD-ACE2 complex 提交 2022-12-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8HRL SARS-CoV-2 Delta S-RBD-ACE2 提交 2022-12-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8HWS The complex structure of Omicron BA.4 RBD with BD604, S309, and S304 提交 2023-01-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 333–528（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.36 Å
8HWT SARS-CoV-2 Omicron BA.2 RBD complexed with BD-604 and S304 Fab 提交 2023-01-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8HXJ BANAL-20-52 Spike trimer 提交 2023-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8I3S Local CryoEM structure of the SARS-CoV-2 S6P in complex with 7B3 Fab 提交 2023-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1213（1200 aa） 片段：RBD region
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8I3U Local CryoEM structure of the SARS-CoV-2 S6P in complex with 14B1 Fab 提交 2023-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1213（1200 aa） 片段：RBD region
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I4E Omicron spike variant XBB with Bn03 提交 2023-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–1208（1181 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.98 Å
8I4F Omicron spike variant XBB with n3130v-Fc 提交 2023-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–1208（1181 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8I4G Omicron spike variant BQ.1.1 with n3130v-Fc 提交 2023-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–1208（1181 aa）
突变：R682G, R683S, R685S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
8I4H Omicron spike variant BA.1 with Bn03 提交 2023-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.81 Å
8I5H Crystal structure of SARS-CoV-2 delta variant spike receptor-binding domain (RBD) in complex with NCV2SG48 Fab 提交 2023-01-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 334–527（194 aa） 片段：Delta RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；pH 6.5 100 mM Bis-Tris, 17.5% PEG 10K, 100 mM Ammonium acetate, 5% Glycerol
分辨率 2.38 Å R-free 0.230
8I5H Crystal structure of SARS-CoV-2 delta variant spike receptor-binding domain (RBD) in complex with NCV2SG48 Fab 提交 2023-01-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–527（194 aa） 片段：Delta RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；pH 6.5 100 mM Bis-Tris, 17.5% PEG 10K, 100 mM Ammonium acetate, 5% Glycerol
分辨率 2.38 Å R-free 0.230
8I5H Crystal structure of SARS-CoV-2 delta variant spike receptor-binding domain (RBD) in complex with NCV2SG48 Fab 提交 2023-01-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 334–527（194 aa） 片段：Delta RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；pH 6.5 100 mM Bis-Tris, 17.5% PEG 10K, 100 mM Ammonium acetate, 5% Glycerol
分辨率 2.38 Å R-free 0.230
8I5I Crystal structure of SARS-CoV-2 delta variant spike receptor-binding domain (RBD) in complex with NCV2SG53 Fab 提交 2023-01-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 321–536（216 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG 1500
分辨率 3.06 Å R-free 0.372
8I9B S-ECD (Omicron BA.2.75) in complex with PD of ACE2 提交 2023-02-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1206（1206 aa）
链 B 1–1206（1206 aa）
链 C 1–1206（1206 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8I9C S-ECD (Omicron BF.7) in complex with PD of ACE2 提交 2023-02-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8I9D S-ECD (Omicron XBB.1) in complex with PD of ACE2 提交 2023-02-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8I9E S-RBD(Omicron BA.3) in complex with PD of ACE2 提交 2023-02-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8I9F S-RBD (Omicron BA.2.75) in complex with PD of ACE2 提交 2023-02-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8I9G S-RBD (Omicron BF.7) in complex with PD of ACE2 提交 2023-02-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8I9H S-RBD (Omicron XBB.1) in complex with PD of ACE2 提交 2023-02-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8IDN Cryo-EM structure of RBD/E77-Fab complex 提交 2023-02-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 332–531（200 aa） 片段：Receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8IF2 Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Omicron BQ.1.1 variant spike protein in complex with its receptor ACE2 提交 2023-02-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–536（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；Sodium acetate, Ammonium acetate, PEG4000
分辨率 2.78 Å R-free 0.245
8IFY Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.4/5 spike protein in complex with white-tailed deer ACE2 提交 2023-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 28–1145（1118 aa）
链 B 28–1145（1118 aa）
链 C 28–1145（1118 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8IFZ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.4/5 spike protein receptor-binding domain in complex with white-tailed deer ACE2 提交 2023-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
8IOS Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1 spike glycoprotein (closed-1 state) 提交 2023-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 12–1210（1199 aa）
链 B 12–1210（1199 aa）
链 C 12–1210（1199 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；calcium- and magnesium-free PBS buffer.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 2.50 Å
8IOT Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1 spike glycoprotein (closed-2 state) 提交 2023-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 12–1210（1199 aa）
链 B 12–1210（1199 aa）
链 C 12–1210（1199 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；calcium- and magnesium-free PBS buffer.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 2.51 Å
8IOU Structure of SARS-CoV-2 XBB.1 spike glycoprotein in complex with ACE2 (1-up state) 提交 2023-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 12–1210（1199 aa）
链 B 12–1210（1199 aa）
链 C 12–1210（1199 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；calcium- and magnesium-free PBS buffer.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.18 Å
8IOV Structure of SARS-CoV-2 XBB.1 spike RBD in complex with ACE2 提交 2023-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 12–1210（1199 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；calcium- and magnesium-free PBS buffer.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.29 Å
8ITU SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Spike glycoprotein in complex with rabbit monoclonal antibody 1H1 IgG. 提交 2023-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
8IV4 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike protein in complex with double nAbs 8H12 and 3E2 (local refinement) 提交 2023-03-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 324–527（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
8IV5 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike protein in complex with double nAbs 8H12 and 1C4 (local refinement) 提交 2023-03-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 324–527（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.77 Å
8IV8 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike protein in complex with double nAbs 3E2 and 1C4 (local refinement) 提交 2023-03-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 324–527（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.92 Å
8IVA Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike protein in complex with double nAbs XMA01 and 3E2 (local refinement) 提交 2023-03-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 324–527（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8IX3 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 BA.4/5 spike protein in complex with 1G11 (local refinement) 提交 2023-03-31 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 333–557（225 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.98 Å
8J1Q CryoEM structure of SARS CoV-2 RBD and Aptamer complex 提交 2023-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric
链 C 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；1mM MgCl2, 0.15% amphipol A8-35 and 0.003% cymal-6 additive added during sample preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of samples placed on grid before plunge frozen with 5s blot time
分辨率 3.30 Å
8J1T Local refined cryo-EM structure of Omicron BA.5 RBD in complex with 8-9D Fab 提交 2023-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 334–527（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8J1V Cryo-EM structure of SARS-CoV2 Omicron BA.5 spike in complex with 8-9D Fabs 提交 2023-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 25–1141（1117 aa）
链 B 25–1141（1117 aa）
链 E 25–1141（1117 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
8J26 CryoEM structure of SARS CoV-2 RBD and Aptamer complex 提交 2023-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric
链 C 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；1mM MgCl2, 0.15% amphipol A8-35 and 0.003% cymal-6 additive added during sample preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of samples placed on grid before plunge frozen with 5s blot time
分辨率 3.40 Å
8JAP Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 WT RBD in complex with W328-6H2 (local refinement) 提交 2023-05-06 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–540（540 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.81 Å
8JIN The local refined map of XBB spike protein (S) in complex with bispecific antibody G7-Fc 提交 2023-05-27 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1208（1181 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.45 Å
8JIO XBB spike protein (S) in complex with monoclonal antibody 6I18 提交 2023-05-27 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1208（1181 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8JJE RBD of SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy 提交 2023-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 14–1211（1198 aa）
突变：R682G,R683S,R685G,K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8JMM Structure of XBB spike protein (S) dimer-trimer in complex with bispecific antibody G7-Fc at 3.75 Angstroms resolution. 提交 2023-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 28–1208（1181 aa）
链 B 28–1208（1181 aa）
链 C 28–1208（1181 aa）
链 D 28–1208（1181 aa）
链 E 28–1208（1181 aa）
链 F 28–1208（1181 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å
8JVA Cryo-EM structure of the N-terminal domain of Omicron BA.1 in complex with nanobody N235 and S2L20 Fab 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–303（303 aa） 片段：N-terminal
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
8JYK Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 1) 提交 2023-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 2.59 Å
8JYK Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 1) 提交 2023-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 2.59 Å
8JYK Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 1) 提交 2023-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 2.59 Å
8JYM Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 2) 提交 2023-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 2.79 Å
8JYM Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 2) 提交 2023-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 2.79 Å
8JYM Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 2) 提交 2023-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 2.79 Å
8JYN Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein in complex with ACE2 (1-up state) 提交 2023-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 28–1210（1183 aa）
链 B 28–1210（1183 aa）
链 C 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.04 Å
8JYO Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up state) 提交 2023-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 28–1210（1183 aa）
链 B 28–1210（1183 aa）
链 C 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.20 Å
8JYP Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike RBD in complex with ACE2 提交 2023-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.38 Å
8JYS SARS-CoV-2 Spike RBD (dimer) in complex with two 2S-1244 nanobodies 提交 2023-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 333–528（196 aa）
链 D 333–528（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8K18 Neutralization antibody ZCP4C9 bound with SARS-CoV-2 Omicron BA.5 RBD 提交 2023-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 334–526（193 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
8K19 Neutralization antibody ZCP3B4 bound with SARS-CoV-2 Omicron BA.5 RBD 提交 2023-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 334–526（193 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.88 Å
8K3K The crystal structure of nanobody Nb4 in complex with receptor binding domain (RBD) of BA.1 Spike protein 提交 2023-07-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 319–531（213 aa） 片段：receptor binding domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M potassium thiocyanate, 20 %(w/v) PEG 3350
分辨率 2.43 Å R-free 0.269
8K45 A potent and broad-spectrum neutralizing nanobody for SARS-CoV-2 viruses including all major Omicron strains 提交 2023-07-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
8K46 A potent and broad-spectrum neutralizing nanobody for SARS-CoV-2 viruses including all major Omicron strains 提交 2023-07-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
8K47 A potent and broad-spectrum neutralizing nanobody for SARS-CoV-2 viruses including all major Omicron strains 提交 2023-07-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8K5G Structure of the SARS-CoV-2 BA.1 RBD with UT28-RD 提交 2023-07-21 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 325–549（225 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
8K5H Structure of the SARS-CoV-2 BA.1 spike with UT28-RD 提交 2023-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 12–1210（1199 aa）
链 B 12–1210（1199 aa）
链 C 12–1210（1199 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
8K9B SARS-CoV-2 spike protein in complex with one S2H5 Fab 提交 2023-07-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8K9J SARS-CoV-2 spike protein in complex with two S2H5 Fabs on NTD-1 and NTD-2 提交 2023-08-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
8K9M SARS-CoV-2 spike protein in complex with two S2H5 Fabs on NTD-1 and NTD-3 提交 2023-08-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
8KA8 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Delta RBD in complex with golden hamster ACE2 (local refinement) 提交 2023-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
8KC2 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 BA.3 RBD in complex with golden hamster ACE2 (local refinement) 提交 2023-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8KDR The local refined map of SARS-CoV-2 XBB Variant Spike protein complexed with antibody PW5-535 提交 2023-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8KEH State 2 of SARS-CoV-2 XBB Variant Spike protein trimer complexed with antibody PW5-5 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 28–1208（1181 aa）
链 B 28–1208（1181 aa）
链 C 28–1208（1181 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.21 Å
8KEJ Monomer state of SARS-CoV-2 XBB Variant Spike protein trimer complexed with antibody PW5-5 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1208（1181 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
8KEO Structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Spike complexed with antibody PW5-570 提交 2023-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
8KEP The local refined map of SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Spike complexed with antibody PW5-570 提交 2023-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.93 Å
8KEQ State 1 of SARS-CoV-2 XBB Variant Spike protein trimer complexed with antibody PW5-5 提交 2023-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 28–1208（1181 aa）
链 B 28–1208（1181 aa）
链 C 28–1208（1181 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
8KER Structure of SARS-CoV-2 XBB Variant Spike protein complexed with broadly neutralizing antibody PW5-535 提交 2023-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 28–1208（1181 aa）
链 B 28–1208（1181 aa）
链 C 28–1208（1181 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
8KHC SARS-CoV-2 Omicron spike in complex with 5817 Fab 提交 2023-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 27–1146（1120 aa）
链 B 27–1146（1120 aa）
链 C 27–1146（1120 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8KHD The interface structure of Omicron RBD binding to 5817 Fab 提交 2023-08-21 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 330–530（201 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8OWT SARS-CoV-2 spike RBD with A8 and H3 nanobodies bound 提交 2023-04-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 BBB 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；NaCl, potassium citrate pH 4.2, PEG 8000
分辨率 2.37 Å R-free 0.249
8OWT SARS-CoV-2 spike RBD with A8 and H3 nanobodies bound 提交 2023-04-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 EEE 330–532（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；NaCl, potassium citrate pH 4.2, PEG 8000
分辨率 2.37 Å R-free 0.249
8OWV H6 and F2 nanobodies bound to SARS-CoV-2 spike RBD 提交 2023-04-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 EEE 331–532（202 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 4000
分辨率 1.73 Å R-free 0.223
8OWW B5-5 nanobody bound to SARS-CoV-2 spike RBD (Wuhan) 提交 2023-04-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 330–531（202 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 2 NO3 NITRATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Tris pH 8.5, PEG smear low Seeded from crystals grown in ammonium nitrate, PEG 3350
分辨率 1.97 Å R-free 0.223
8OYT Stabilised BA.1 SARS-CoV-2 spike with H6 nanobodies in '3 up' RBD conformation 提交 2023-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8OYU Stabilised BA.1 SARS-CoV-2 spike with H6 nanobodies in '2 up 1 down' RBD conformation 提交 2023-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8P5M SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with Mab-23 (Fab) 提交 2023-05-24 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 333–528（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8P99 SARS-CoV-2 S-protein:D614G mutant in 1-up conformation 提交 2023-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 15–681（667 aa）
链 A 685–1213（529 aa）
链 B 15–681（667 aa）
链 B 685–1213（529 aa）
链 C 15–681（667 aa）
链 C 685–1213（529 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；HEPES pH 7.2 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8P9Y SARS-CoV-2 S protein S:D614G mutant in 3-down with binding site of an entry inhibitor 提交 2023-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 15–681（667 aa）
链 A 685–1213（529 aa）
链 B 15–681（667 aa）
链 B 685–1213（529 aa）
链 C 15–681（667 aa）
链 C 685–1213（529 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 NA SODIUM ION × 3 XIO [(2~{S})-2-[[4-(2-azanylethanoylamino)-7-[[(2~{S})-3-[2-(4-nitrophenyl)sulfanyl-1~{H}-indol-3-yl]-1-oxidanylidene-1-sodiooxy-propan-2-yl]amino]-4-[3-[[(2~{S})-3-[2-(4-nitrophenyl)sulfanyl-1~{H}-indol-3-yl]-1-oxidanylidene-1-sodiooxy-propan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propyl]-7-oxidanylidene-heptanoyl]amino]-3-[2-(4-nitrophenyl)sulfanyl-1~{H}-indol-3-yl]propanoyl]oxysodium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；HEPES pH 7.2 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8PQ2 XBB 1.0 RBD bound to P4J15 (Local) 提交 2023-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8PSD SARS-CoV-2 XBB 1.0 closed conformation. 提交 2023-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1207（1207 aa）
链 B 1–1207（1207 aa）
链 C 1–1207（1207 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8Q5Y cryoEM structure of SARS-CoV2 Spike trimer in complex with Fab23 提交 2023-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 E 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8Q7S Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD (Wuhan) with neutralizing VHHs Ma6F06 and Re21H01 提交 2023-08-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–526（193 aa）
未记录 P4G 1-ETHOXY-2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293.15 K；0.1 M Sodium Citrate pH 4.5 20% (w/v) PEG 4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.283
8Q7S Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD (Wuhan) with neutralizing VHHs Ma6F06 and Re21H01 提交 2023-08-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 334–526（193 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293.15 K；0.1 M Sodium Citrate pH 4.5 20% (w/v) PEG 4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.283
8Q7S Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD (Wuhan) with neutralizing VHHs Ma6F06 and Re21H01 提交 2023-08-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 334–526（193 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293.15 K；0.1 M Sodium Citrate pH 4.5 20% (w/v) PEG 4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.283
8Q7S Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD (Wuhan) with neutralizing VHHs Ma6F06 and Re21H01 提交 2023-08-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 334–526（193 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293.15 K；0.1 M Sodium Citrate pH 4.5 20% (w/v) PEG 4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.283
8Q7S Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD (Wuhan) with neutralizing VHHs Ma6F06 and Re21H01 提交 2023-08-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 M 334–526（193 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293.15 K；0.1 M Sodium Citrate pH 4.5 20% (w/v) PEG 4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.283
8Q93 Crystal structure of the SARS-COV-2 RBD with neutralizing-VHHs Re30H02 and Re21D01 提交 2023-08-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–526（193 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；28% PEG smear broad, 50 mM arginine, 50 mM MSG, 5% Glycerol
分辨率 3.10 Å R-free 0.257
8Q94 Crystal structure of The SARS-COV-2 BA.2.75 RBD with neutralizing-VHHs Re32D03 and Ma3B12 提交 2023-08-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–517（184 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 18% PEG 12000
分辨率 2.50 Å R-free 0.277
8Q95 Crystal structure of the SARS-CoV-2 BA.1 RBD with neutralizing-VHHs Ma16B06 and Ma3F05 提交 2023-08-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–517（184 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；293 K；0.1 M HEPES, 20% (v/v) PEG smear high, 0.15 M Lithium sulphate, 0.05 M magnesium chloride
分辨率 1.60 Å R-free 0.206
8QH0 Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD with the antibody Cv2.3194 提交 2023-09-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–528（198 aa）
未记录 PRO PROLINE × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M lithium citrate
分辨率 1.87 Å R-free 0.209
8QPR SARS-CoV-2 S protein bound to human neutralising antibody UZGENT_G5 提交 2023-10-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8QQ0 SARS-CoV-2 S protein bound to neutralising antibody UZGENT_A3 提交 2023-10-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QRF SARS-CoV-2 delta RBD complexed with XBB-6 and beta-49 Fabs 提交 2023-10-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M citric acid pH 3.5 and 28% (w/v) PEG 8000
分辨率 3.70 Å R-free 0.317
8QRG SARS-CoV-2 delta RBD complexed with XBB-2 Fab and NbC1 提交 2023-10-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2% (v/v) 1,4-Dioxane, 0.1 M Tris pH 8.0 and 15% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.228
8QSQ Locally refined SARS-CoV-2 BA-2.86 Spike receptor binding domain (RBD) complexed with angiotensin converting enzyme 2 (ACE2) 提交 2023-10-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 332–527（196 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8QTD Local refinement of SARS-CoV-2 BA.2.86 Spike and XBB-7 Fab 提交 2023-10-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8QZR SARS-CoV-2 delta RBD complexed with BA.4/5-9 Fab 提交 2023-10-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 2% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550, 1.8 M Ammonium sulfate
分辨率 3.77 Å R-free 0.300
8QZR SARS-CoV-2 delta RBD complexed with BA.4/5-9 Fab 提交 2023-10-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 2% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550, 1.8 M Ammonium sulfate
分辨率 3.77 Å R-free 0.300
8R1C SD1-2 Fab in complex with SARS-CoV-2 BA.2.12.1 Spike Glycoprotein 提交 2023-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.20 Å
8R1D SD1-3 Fab in complex with SARS-CoV-2 BA.2.12.1 Spike Glycoprotein 提交 2023-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.37 Å
8R80 SARS-CoV-2 Delta RBD in complex with XBB-9 Fab and an anti-Fab nanobody 提交 2023-11-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 R 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Calcium acetate hydrate, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 40% PEG 300.
分辨率 4.03 Å R-free 0.313
8R80 SARS-CoV-2 Delta RBD in complex with XBB-9 Fab and an anti-Fab nanobody 提交 2023-11-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Calcium acetate hydrate, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 40% PEG 300.
分辨率 4.03 Å R-free 0.313
8R87 Cryo-EM structure of the Sars-Cov2 S trimer without RBDs 提交 2023-11-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–331（331 aa）
链 A 530–1208（679 aa）
链 B 1–331（331 aa）
链 B 530–1208（679 aa）
链 C 1–331（331 aa）
链 C 530–1208（679 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8R8K XBB-4 Fab in complex with SARS-CoV-2 BA.2.12.1 Spike Glycoprotein 提交 2023-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1195（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
8RBU Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with SVLNDILARL, an 10-mer epitope from SARS-CoV-2 Spike (S975-984) 提交 2023-12-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 975–984（10 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.2M NaCl and 0.1M Tris HCl pH8.5
分辨率 2.70 Å R-free 0.252
8RBY The crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with the neutralizing nanobody 1.26 提交 2023-12-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 332–528（197 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；40% PEG-5000 MME, 100mM MOPS pH 7, 10 mM CaCl2
分辨率 1.90 Å R-free 0.234
8RCV Crystal structure of HLA B*13:01 in complex with SVLNDIFSRL, an 10-mer epitope from SARS-CoV-2 Spike (S975-984) 提交 2023-12-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 975–984（10 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；14% PEG3350 and 0.1M NaFormate
分辨率 1.65 Å R-free 0.201
8REF Crystal structure of HLA B*13:01 in complex with SVLNDILARL, an 10-mer epitope from SARS-CoV-2 Spike (S975-984) 提交 2023-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 975–984（10 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350 and 2% EG
分辨率 1.90 Å R-free 0.221
8RH6 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with SVLNDILSRL, an 10-mer epitope from SARS-CoV-2 Spike (S975-984) 提交 2023-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 G 975–984（10 aa）
链 H 975–984（10 aa）
链 I 975–984（10 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.2M NaCl and 0.1M Tris HCl pH8.5
分辨率 3.32 Å R-free 0.251
8RHQ Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with SVLNDIFSRL, an 10-mer epitope from SARS-CoV-2 Spike (S975-984) 提交 2023-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 G 975–984（10 aa）
链 H 975–984（10 aa）
链 I 975–984（10 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 NA SODIUM ION × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CL CHLORIDE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350, 0.2M Sodium acetate tihydrate pH 7.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.244
8RJ5 P1-15 T-cell Receptor bound to HLA A*2402-NF9 pMHC complex 提交 2023-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 448–456（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；di-Sodium malonate, 0.1M HEPES pH7, 0.1M Poly(acrylic acid sodium salt) 2,100, 30% w/v
分辨率 3.02 Å R-free 0.260
8RJ5 P1-15 T-cell Receptor bound to HLA A*2402-NF9 pMHC complex 提交 2023-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 448–456（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；di-Sodium malonate, 0.1M HEPES pH7, 0.1M Poly(acrylic acid sodium salt) 2,100, 30% w/v
分辨率 3.02 Å R-free 0.260
8RJ7 The crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with the neutralizing nanobody 1.29 提交 2023-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 332–528（197 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；15% PEG-3350, 100mM Bicine pH 9, 20 mM (NH4)2SO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.222
8RJ7 The crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with the neutralizing nanobody 1.29 提交 2023-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 332–528（197 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 LYS LYSINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；15% PEG-3350, 100mM Bicine pH 9, 20 mM (NH4)2SO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.222
8RJ7 The crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with the neutralizing nanobody 1.29 提交 2023-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 332–528（197 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；15% PEG-3350, 100mM Bicine pH 9, 20 mM (NH4)2SO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.222
8RJ7 The crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with the neutralizing nanobody 1.29 提交 2023-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 332–528（197 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；15% PEG-3350, 100mM Bicine pH 9, 20 mM (NH4)2SO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.222
8RJ7 The crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with the neutralizing nanobody 1.29 提交 2023-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 332–528（197 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；15% PEG-3350, 100mM Bicine pH 9, 20 mM (NH4)2SO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.222
8RRN Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1616 Fab 提交 2024-01-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–527（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；30% PEG 3000, 200 mM NaCl, 100 mM Tris pH 7.0
分辨率 3.11 Å R-free 0.291
8RRN Crystal structure of the SARS-CoV-2 S RBD in complex with pT1616 Fab 提交 2024-01-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 334–527（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；30% PEG 3000, 200 mM NaCl, 100 mM Tris pH 7.0
分辨率 3.11 Å R-free 0.291
8S6M SARS-CoV-2 BQ.1.1 RBD bound to the S2V29 and the S2H97 Fab fragments 提交 2024-02-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 328–531（204 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Tris pH 8.5, 20% PEG-MME 2000, and 10 mM NiCl2
分辨率 1.67 Å R-free 0.203
8S9G SARS-CoV-2 BN.1 spike RBD bound to the human ACE2 ectodomain and the S309 neutralizing antibody Fab fragment 提交 2023-03-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 328–529（202 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8SDF Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody CC25.4 提交 2023-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Z 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；65% MPD and 0.1 M Bicine pH 9.0
分辨率 1.79 Å R-free 0.218
8SDF Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody CC25.4 提交 2023-04-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；65% MPD and 0.1 M Bicine pH 9.0
分辨率 1.79 Å R-free 0.218
8SDG Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody CC25.43 提交 2023-04-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；1.0 M Li-chloride, 10% PEG-6000, and 0.1 M citric acid pH 4.0
分辨率 2.71 Å R-free 0.308
8SDG Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody CC25.43 提交 2023-04-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；1.0 M Li-chloride, 10% PEG-6000, and 0.1 M citric acid pH 4.0
分辨率 2.71 Å R-free 0.308
8SDH Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody CC25.56 提交 2023-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；10% ethylene glycol (v/v), 0.11 M MgCl2, and 16% polyethylene glycol 3350 (w/v)
分辨率 2.84 Å R-free 0.283
8SDH Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody CC25.56 提交 2023-04-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；10% ethylene glycol (v/v), 0.11 M MgCl2, and 16% polyethylene glycol 3350 (w/v)
分辨率 2.84 Å R-free 0.283
8SGU Crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2023-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% Jeffamine D2000, 10% Jeffamine M2005, 0.2 M NaCl, 0.1M MES pH 5.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.199
8SIQ Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain in complex with broadly neutralizing antibodies CC25.36 and CV38-142 Fab 提交 2023-04-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；273 K；20% (w/v) PEG-3350, 0.2 M di-Ammonium citrate
分辨率 2.50 Å R-free 0.287
8SIR Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain in complex with broadly neutralizing antibody CC25.54 Fab 提交 2023-04-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M potassium sodium tartrate, pH 7.2
分辨率 3.30 Å R-free 0.236
8SIS Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain in complex with broadly neutralizing antibody CC84.2 Fab 提交 2023-04-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% (w/v) PEG 3000, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5
分辨率 3.08 Å R-free 0.303
8SIT Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain in complex with broadly neutralizing antibody CC84.24 Fab 提交 2023-04-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% (w/v) PEG 3000, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5
分辨率 2.91 Å R-free 0.309
8SIT Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain in complex with broadly neutralizing antibody CC84.24 Fab 提交 2023-04-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% (w/v) PEG 3000, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5
分辨率 2.91 Å R-free 0.309
8SIT Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain in complex with broadly neutralizing antibody CC84.24 Fab 提交 2023-04-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% (w/v) PEG 3000, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5
分辨率 2.91 Å R-free 0.309
8SIT Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain in complex with broadly neutralizing antibody CC84.24 Fab 提交 2023-04-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% (w/v) PEG 3000, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5
分辨率 2.91 Å R-free 0.309
8SK5 Crystal structure of the SARS-CoV-2 neutralizing VHH 7A9 bound to the spike receptor binding domain 提交 2023-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 319–541（223 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.2 M Sodium malonate pH 6.0, 18% PEG 3350
分辨率 2.01 Å R-free 0.211
8SMI Crystal structure of antibody WRAIR-2123 in complex with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.12 M alcohol mixture (1,6-Hexanediol; 1-Butanol; 1,2-Propanediol; 2-Propanol; 1,4-Butanediol; 1,3-Propanediol), 0.1M buffer system 3 (Tris base and BICINE, pH 8.5), 50% precipitant mix 4 (25% v/v MPD; 25% PEG 1000; 25% w/v PEG 3350), 0.1 M Manganese(II) chloride tetrahydrate
分辨率 3.50 Å R-free 0.295
8SMT Crystal structure of antibody WRAIR-2134 in complex with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2023-04-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；8% v/v Tacsimate pH 5.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.16 Å R-free 0.249
8SMT Crystal structure of antibody WRAIR-2134 in complex with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；8% v/v Tacsimate pH 5.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.16 Å R-free 0.249
8SMT Crystal structure of antibody WRAIR-2134 in complex with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2023-04-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；8% v/v Tacsimate pH 5.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.16 Å R-free 0.249
8SMT Crystal structure of antibody WRAIR-2134 in complex with SARS-CoV-2 receptor binding domain 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 331–527（197 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；8% v/v Tacsimate pH 5.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.16 Å R-free 0.249
8SUO BA.2/AZD1061/AZD3152 structure analysis 提交 2023-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–527（195 aa） 片段：receptor-binding domain (UNP residues 333-527)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.12 M D-glucose, 0.12 M D-mannose, 0.12 M D-galactose, 0.12 M L-fructose, 0.12 M D-xylose, 0.12 M N-acetyl-D-glucosamine, 0.1 M Tris, 0.1 M bicine, pH 8.5, 40% v/v ethylene glycol, 20% w/v PEG8000
分辨率 3.30 Å R-free 0.332
8SWH Local refinement of SARS-CoV-2 (HP-GSAS-Mut7) spike NTD in complex with TXG-0078 Fab 提交 2023-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；1X TBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.88 Å
8T20 Cryo-EM structure of mink variant Y453F trimeric spike protein bound to two mink ACE2 receptors 提交 2023-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8.0, 200 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
8T22 Cryo-EM structure of mink variant Y453F trimeric spike protein bound to one mink ACE2 receptors at downRBD conformation 提交 2023-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
8T23 Cryo-EM structure of the RBD-ACE2 interface of the SARS-CoV-2 trimeric spike protein bound to ACE2 receptor after local refinement at upRBD conformation 提交 2023-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 321–528（208 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8.0, 200 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.87 Å
8T25 Cryo-EM structure of the RBD-ACE2 interface of the SARS-CoV-2 trimeric spike protein bound to ACE2 receptor after local refinement at downRBD conformation. 提交 2023-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 321–528（208 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
8TAZ Cryo-EM structure of mink variant Y453F trimeric spike protein bound to one mink ACE2 receptors 提交 2023-06-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8.0, 200 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å
8THF SARS-CoV-2 BA.1 S-6P-no-RBD 提交 2023-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–327（314 aa） 片段：RBD truncated,RBD truncated
链 A 525–1211（687 aa） 片段：RBD truncated,RBD truncated
链 B 14–327（314 aa） 片段：RBD truncated,RBD truncated
链 B 525–1211（687 aa） 片段：RBD truncated,RBD truncated
链 C 14–327（314 aa） 片段：RBD truncated,RBD truncated
链 C 525–1211（687 aa） 片段：RBD truncated,RBD truncated
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
8TM1 Antibody N3-1 bound to RBDs in the up and down conformations 提交 2023-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
突变：Hexapro construct 突变：Hexapro construct 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；2 mM Tris pH 8.0, 200 mM NaCl, 0.02% NaN3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8TMA Antibody N3-1 bound to RBD in the up conformation 提交 2023-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：Hexapro construct 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；2 mM Tris pH 8.0, 200 mM NaCl, 0.02% NaN3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8TMY Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem helix peptide in complex with neutralizing antibody CHM-16 提交 2023-07-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 M 1140–1164（25 aa）
未记录 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, and 1 M sodium citrate
分辨率 3.07 Å R-free 0.286
8TMY Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem helix peptide in complex with neutralizing antibody CHM-16 提交 2023-07-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 N 1140–1164（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, and 1 M sodium citrate
分辨率 3.07 Å R-free 0.286
8TMY Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem helix peptide in complex with neutralizing antibody CHM-16 提交 2023-07-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 S 1140–1164（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, and 1 M sodium citrate
分辨率 3.07 Å R-free 0.286
8TYL Structural and biochemical rationale for Beta variant protein booster vaccine broad cross-neutralization of SARS-CoV-2 提交 2023-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
8TYO Structural and biochemical rationale for Beta variant protein booster vaccine broad cross-neutralization of SARS-CoV-2 提交 2023-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 19–1211（1193 aa）
链 B 19–1211（1193 aa）
链 C 19–1211（1193 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
8U1G Prefusion-stabilized SARS-CoV-2 S2 subunit 提交 2023-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 697–1141（445 aa）
突变：S704C, K790C, F817P, A892P, A899P, A942P, Q957E, K986P, V987P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 8% (v/v) ethylene glycol and 10% (v/v) PEG 8000
分辨率 3.20 Å R-free 0.262
8U1G Prefusion-stabilized SARS-CoV-2 S2 subunit 提交 2023-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 697–1141（445 aa）
突变：S704C, K790C, F817P, A892P, A899P, A942P, Q957E, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 8% (v/v) ethylene glycol and 10% (v/v) PEG 8000
分辨率 3.20 Å R-free 0.262
8U28 Gaussian mixture model based single particle refinement - SARS (SARS-CoV-2 Spike Proteins on intact virions from EMPIAR-10492) 提交 2023-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8UG9 XBB.1.5 spike/Nb5 complex 提交 2023-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
8UIR SARS-CoV-2 Omicron-XBB.1.16 3-RBD down Spike Protein Trimer consensus (S-GSAS-Omicron-XBB.1.16) 提交 2023-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：residues 682-685 mutated from RRAR to GSAS 突变：residues 682-685 mutated from RRAR to GSAS 突变：residues 682-685 mutated from RRAR to GSAS NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8UK1 SARS-CoV-2 Omicron-XBB.1.16 3-RBD-down Spike Protein Trimer consensus (S-RRAR-Omicron-XBB.1.16) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8UKD SARS-CoV-2 Omicron-XBB.1.5 3-RBD down Spike Protein Trimer consensus (S-GSAS-Omicron-XBB.1.5) 提交 2023-10-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8UKF SARS-CoV-2 Omicron-EG.5 3-RBD down Spike Protein Trimer consensus (S-GSAS-Omicron-EG.5) 提交 2023-10-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8USZ Cryo-EM Structure of Full-Length Spike Protein of Omicron XBB.1.5 提交 2023-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1273（1258 aa）
链 B 16–1273（1258 aa）
链 C 16–1273（1258 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25mM Tris (pH 7.5), 150mM NaCl, 1.0mM EDTA, 0.02% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
8UUL Prototypic SARS-CoV-2 spike (containing K417) in the closed conformation 提交 2023-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1211（1211 aa）
链 B 1–1211（1211 aa）
链 C 1–1211（1211 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8UUM Prototypic SARS-CoV-2 spike (containing K417) in the open conformation 提交 2023-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1211（1211 aa）
链 B 1–1211（1211 aa）
链 C 1–1211（1211 aa）
未记录 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8UUN Prototypic SARS-CoV-2 spike (containing V417) in the closed conformation 提交 2023-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1211（1211 aa）
链 B 1–1211（1211 aa）
链 C 1–1211（1211 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8UUO Prototypic SARS-CoV-2 spike (containing V417) in the open conformation 提交 2023-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1211（1211 aa）
链 B 1–1211（1211 aa）
链 C 1–1211（1211 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8V0L SARS-CoV-2 Omicron-XBB.1.16 3-RBD-down Spike Protein Trimer 1 (S-RRAR-Omicron-XBB.1.16) 提交 2023-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8V0M SARS-CoV-2 Omicron-XBB.1.16 3-RBD-down Spike Protein Trimer 2 (S-RRAR-Omicron-XBB.1.16) 提交 2023-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8V0N SARS-CoV-2 Omicron-XBB.1.16 3-RBD-down Spike Protein Trimer 3 (S-RRAR-Omicron-XBB.1.16) 提交 2023-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8V0O SARS-CoV-2 Omicron-XBB.1.16 3-RBD down Spike Protein Trimer 1 (S-GSAS-Omicron-XBB.1.16) 提交 2023-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8V0P SARS-CoV-2 Omicron-XBB.1.16 3-RBD down Spike Protein Trimer 2 (S-GSAS-Omicron-XBB.1.16) 提交 2023-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8V0Q SARS-CoV-2 Omicron-XBB.1.16 3-RBD down Spike Protein Trimer 3 (S-GSAS-Omicron-XBB.1.16) 提交 2023-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8V0R SARS-CoV-2 Omicron-XBB.1.5 3-RBD down Spike Protein Trimer 1 (S-GSAS-Omicron-XBB.1.5) 提交 2023-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8V0S SARS-CoV-2 Omicron-XBB.1.5 3-RBD down Spike Protein Trimer 2 (S-GSAS-Omicron-XBB.1.5) 提交 2023-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8V0T SARS-CoV-2 Omicron-XBB.1.5 3-RBD down Spike Protein Trimer 3 (S-GSAS-Omicron-XBB.1.5) 提交 2023-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8V0U SARS-CoV-2 Omicron-XBB.1.5 3-RBD down Spike Protein Trimer 4 (S-GSAS-Omicron-XBB.1.5) 提交 2023-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8V0V SARS-CoV-2 Omicron-EG.5 3-RBD down Spike Protein Trimer 1 (S-GSAS-Omicron-EG.5) 提交 2023-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8V0W SARS-CoV-2 Omicron-EG.5 3-RBD down Spike Protein Trimer 2 (S-GSAS-Omicron-EG.5) 提交 2023-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8V0X SARS-CoV-2 Omicron-EG.5 3-RBD down Spike Protein Trimer 3 (S-GSAS-Omicron-EG.5) 提交 2023-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8V4F Model and map from local refinement of a CAB-A17 - Omicron Ba.1 spike complex 提交 2023-11-29 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–526（193 aa） 片段：Omicron BA.1 RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.68 Å
8V5V Structure of a SARS-CoV-2 spike S2 subunit in a pre-fusion, open conformation 提交 2023-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 E 691–1211（521 aa）
链 F 691–1211（521 aa）
链 G 691–1211（521 aa）
突变：F817P,A892P,A899P,A942P,V987P,Y707C,T883C,Y788C,A876C 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,V987P,Y707C,T883C,Y788C,A876C 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,V987P,Y707C,T883C,Y788C,A876C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Filtered and degased
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；6 seconds blotting time at force 0
分辨率 2.93 Å
8VAO Simulation-driven design of prefusion stabilized SARS-CoV-2 spike S2 antigen 提交 2023-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 697–1208（512 aa）
链 B 697–1208（512 aa）
链 C 697–1208（512 aa）
突变：S704C, K790C, F817P, A892P, A899P, A942P, Q957E, K986P, V987P, V991W, T998W 突变：S704C, K790C, F817P, A892P, A899P, A942P, Q957E, K986P, V987P, V991W, T998W 突变：S704C, K790C, F817P, A892P, A899P, A942P, Q957E, K986P, V987P, V991W, T998W NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8VCR SARS-CoV-2 Spike S2 bound to Fab 54043-5 提交 2023-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 697–1208（512 aa）
链 B 697–1208（512 aa）
链 C 697–1208（512 aa）
突变：S704C, K790C, F817P, A892P, A899P, A942P, Q957E, K986P, V987P 突变：S704C, K790C, F817P, A892P, A899P, A942P, Q957E, K986P, V987P 突变：S704C, K790C, F817P, A892P, A899P, A942P, Q957E, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8VIA Protective effect of human non-neutralizing cross-reactive spike antibodies elicited by SARS-CoV-2 mRNA vaccination 提交 2024-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 677–1208（532 aa）
链 D 15–676（662 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8VIF SARS-CoV-2 spike omicron (BA.1) ectodomain trimer in complex with SC27 Fab, local refinement 提交 2024-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 1–1208（1208 aa）
突变：pre-fusion stabilized: F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VKE SARS-CoV-2 spike omicron (BA.1) RBD ectodomain dimer-of-trimers in complex with SC27 Fabs 提交 2024-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1208（1208 aa）
链 R 1–1208（1208 aa）
突变：pre-fusion stabilized: F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS 突变：pre-fusion stabilized: F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VKK Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike protein 提交 2024-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1207（1207 aa）
链 B 1–1207（1207 aa）
链 C 1–1207（1207 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
8VKL Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike protein in complex with mouse ACE2 (conformation 2) 提交 2024-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1207（1207 aa）
链 B 1–1207（1207 aa）
链 C 1–1207（1207 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8VKM Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike protein in complex with mouse ACE2 (conformation 1) 提交 2024-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1207（1207 aa）
链 B 1–1207（1207 aa）
链 C 1–1207（1207 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
8VKN Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike protein in complex with mouse ACE2 (focused refinement of RBD and mouse ACE2) 提交 2024-01-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 327–527（201 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.93 Å
8VKO Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike protein in complex with human ACE2 提交 2024-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1207（1207 aa）
链 B 1–1207（1207 aa）
链 C 1–1207（1207 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.68 Å
8VKP Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike protein in complex with human ACE2 (focused refinement of RBD and ACE2) 提交 2024-01-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 327–527（201 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.77 Å
8VQ9 Prefusion stabilized structure of the SARS-CoV-2 fusion machinery 提交 2024-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 686–1208（523 aa）
链 B 686–1208（523 aa）
链 C 686–1208（523 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VQA Prefusion stabilized structure of the SARS-CoV-2 fusion machinery 提交 2024-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 686–1208（523 aa）
链 B 686–1208（523 aa）
链 C 686–1208（523 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8VQB Prefusion stabilized structure of the SARS-CoV-2 fusion machinery 提交 2024-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 686–1208（523 aa）
链 B 686–1208（523 aa）
链 C 686–1208（523 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8VQR Crystal structure of chimeric SARS-CoV-2 RBD complexed with chimeric raccoon dog ACE2 提交 2024-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 319–536（218 aa） 片段：receptor-binding domain
突变：;Q321V, T323S, E324G, S325D, I326V, A348P, N354E, R357K, A372T, S373F, P384A, T393S, I402V, R403K, E406D, K417V, T430M, I434L, S438T, N439R, L441I, S443A, V445S, G446T, L452K, H519N, K529L, N532D, V534I, N536S ; ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Tris (pH 8-8.5), 18-22% PEG 6000, 100 mM NaCl and ethylene glycol (0.5-2%)
分辨率 2.56 Å R-free 0.264
8VQR Crystal structure of chimeric SARS-CoV-2 RBD complexed with chimeric raccoon dog ACE2 提交 2024-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 319–536（218 aa） 片段：receptor-binding domain
突变：;Q321V, T323S, E324G, S325D, I326V, A348P, N354E, R357K, A372T, S373F, P384A, T393S, I402V, R403K, E406D, K417V, T430M, I434L, S438T, N439R, L441I, S443A, V445S, G446T, L452K, H519N, K529L, N532D, V534I, N536S ; ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Tris (pH 8-8.5), 18-22% PEG 6000, 100 mM NaCl and ethylene glycol (0.5-2%)
分辨率 2.56 Å R-free 0.264
8VYA SARS-CoV-2 Omicron Variant Spike Glycoprotein Fusion Core (Q954H) 提交 2024-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 912–966（55 aa）
链 B 912–966（55 aa）
链 C 912–966（55 aa）
链 D 1168–1203（36 aa）
链 E 1168–1203（36 aa）
链 F 1168–1203（36 aa）
突变：Q954H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q954H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q954H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；20 mM 1,6-hexanediol; 20 mM 1 butanol; 20 mM 1,2-propanediol; 20 mM 2-propanol; 20 mM 1,4-butanediol; 20 mM 1,3-propanediol; 12.5% PEG1000; 12.5% PEG3350; 12.5% 2-methyl-2,4-pentanediol; 100 mM imidazole/MES monohydrate buffer (pH 6.5)
分辨率 2.12 Å R-free 0.250
8VYE SARS-CoV-2 S (C.37 Lambda variant) plus S309, S2L20, and S2X303 Fabs 提交 2024-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric
链 E 1–1208（1208 aa）
链 K 1–1208（1208 aa）
链 O 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 57 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VYF SARS-CoV-2 S NTD (C.37 Lambda variant) plus S2L20 and S2X303 Fabs, local refinement 提交 2024-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8VYG SARS-CoV-2 S RBD (C.37 Lambda variant) plus S309 Fab, local refinement 提交 2024-02-08 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8W4F SARS-CoV-2 spike protein in complex with a trivalent nanobody 提交 2023-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 27–1146（1120 aa）
链 B 27–1146（1120 aa）
链 C 27–1146（1120 aa）
突变：R683A/R685A/F817P/A892P/A899P/A942P/R986P/V987P 突变：R683A/R685A/F817P/A892P/A899P/A942P/R986P/V987P 突变：R683A/R685A/F817P/A892P/A899P/A942P/R986P/V987P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris,150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8WDR Crystal structure of BQ.1.1 RBD complexed with human ACE2 提交 2023-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Sodium citrate 5.5, 15% w/v PEG 6000 (MD1-38-1-43)
分辨率 3.47 Å R-free 0.269
8WDR Crystal structure of BQ.1.1 RBD complexed with human ACE2 提交 2023-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 319–541（223 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Sodium citrate 5.5, 15% w/v PEG 6000 (MD1-38-1-43)
分辨率 3.47 Å R-free 0.269
8WDS Crystal structure of BF.7 RBD complexed with human ACE2 提交 2023-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0, 20% w/v PEG 6000 (MD1-29-1-43)
分辨率 3.40 Å R-free 0.271
8WDS Crystal structure of BF.7 RBD complexed with human ACE2 提交 2023-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 319–541（223 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0, 20% w/v PEG 6000 (MD1-29-1-43)
分辨率 3.40 Å R-free 0.271
8WDY SARS-CoV-2 Omicron BQ.1.1 RBD complexed with human ACE2 提交 2023-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8WDZ SARS-CoV-2 Omicron BQ.1 RBD complexed with human ACE2 提交 2023-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–540（222 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.71 Å
8WE0 SARS-CoV-2 Omicron XBB RBD complexed with human ACE2 提交 2023-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8WE1 SARS-CoV-2 Omicron BF.7 RBD complexed with human ACE2 提交 2023-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.47 Å
8WE4 SARS-CoV-2 Omicron XBB.1.5 RBD complexed with human ACE2 and S304 提交 2023-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 319–541（223 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8WFH Crystal structure of Omicron BA.4/5 in complex with a neutralizing antibody scFv D1 提交 2023-09-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；25% w/v PEG 1500, SPG Buffer/NaOH pH 8.5
分辨率 2.72 Å R-free 0.250
8WFM Crystal structure of Omicron BA.1 in complex with a neutralizing antibody scFv T11 提交 2023-09-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.05M Citric acid,0.05M BIS-TRIS propane/PH5.0,16%Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.99 Å R-free 0.265
8WFM Crystal structure of Omicron BA.1 in complex with a neutralizing antibody scFv T11 提交 2023-09-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.05M Citric acid,0.05M BIS-TRIS propane/PH5.0,16%Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.99 Å R-free 0.265
8WFM Crystal structure of Omicron BA.1 in complex with a neutralizing antibody scFv T11 提交 2023-09-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.05M Citric acid,0.05M BIS-TRIS propane/PH5.0,16%Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.99 Å R-free 0.265
8WFM Crystal structure of Omicron BA.1 in complex with a neutralizing antibody scFv T11 提交 2023-09-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.05M Citric acid,0.05M BIS-TRIS propane/PH5.0,16%Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.99 Å R-free 0.265
8WGV BA.2(S375) Spike (S6P)/hACE2 complex 提交 2023-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 51 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
8WGW Local refinement of RBD-ACE2 提交 2023-09-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1208（1208 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8WHS Spike Trimer of BA.2.86 in complex with one hACE2 提交 2023-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 28–1208（1181 aa）
链 B 28–1208（1181 aa）
链 C 28–1208（1181 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
8WHU Spike Trimer of BA.2.86 in complex with two hACE2s 提交 2023-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 28–1208（1181 aa）
链 B 28–1208（1181 aa）
链 C 28–1208（1181 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 41 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8WHV Spike Trimer of BA.2.86 with three RBDs down 提交 2023-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1208（1181 aa）
链 B 28–1208（1181 aa）
链 C 28–1208（1181 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
8WHW Spike Trimer of BA.2.86 with single RBD up 提交 2023-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1208（1181 aa）
链 B 28–1208（1181 aa）
链 C 28–1208（1181 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8WHZ BA.2.86 RBD in complex with hACE2 (local refinement) 提交 2023-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.93 Å
8WLO Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 prototype spike protein in complex with hippopotamus ACE2 提交 2023-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1217（1217 aa）
链 B 1–1217（1217 aa）
链 C 1–1217（1217 aa）
突变：R682G,R683S,R685S,F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：R682G,R683S,R685S,F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：R682G,R683S,R685S,F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.62 Å
8WLR Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 prototype spike protein receptor-binding domain in complex with hippopotamus ACE2 提交 2023-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1217（1217 aa） 片段：receptor-binding domain
突变：R682G,R683S,R685S,F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
8WMD Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein (closed-2 state) 提交 2023-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：monomeric
链 A 12–1210（1199 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；calcium- and magnesium-free PBS buffer.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 2.71 Å
8WMF Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein (closed-1 state) 提交 2023-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：trimeric
链 A 12–1210（1199 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；calcium- and magnesium-free PBS buffer.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 2.51 Å
8WOX Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 prototype RBD in complex with rabbit ACE2 (local refinement) 提交 2023-10-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
8WOY Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.4/5 RBD in complex with rabbit ACE2 (local refinement) 提交 2023-10-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–539（221 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
8WP8 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2.86 RBD in complex with human ACE2 提交 2023-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
8WPW Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 receptor-binding domain (RBD) complexed with CB6 mutant,S309, and S304 antibodies 提交 2023-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 R 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.49 Å
8WPY Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 receptor-binding domain (RBD) complexed with CB6 mutant,S309, and S304 antibodies 提交 2023-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 R 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
8WRH SARS-CoV-2 XBB.1.5.70 in complex with ACE2 提交 2023-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 334–529（196 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
8WRL XBB.1.5 RBD in complex with ACE2 提交 2023-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–537（219 aa） 片段：RBD domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
8WRM XBB.1.5 spike protein in complex with ACE2 提交 2023-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–1140（1140 aa）
链 F 1–1140（1140 aa）
链 G 1–1140（1140 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.34 Å
8WRO XBB.1.5.10 spike protein in complex with ACE2 提交 2023-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8WTD XBB.1.5.10 RBD in complex with ACE2 提交 2023-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 334–534（201 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
8WTJ XBB.1.5.70 spike protein in complex with ACE2 提交 2023-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.64 Å
8WXL Structure of the SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein (closed state) 提交 2023-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 2.59 Å
8WYH The global map of Omicron Subvariants Spike with ACE2 提交 2023-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–1147（1131 aa）
链 B 17–1147（1131 aa）
链 C 17–1147（1131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8WYJ The global map of Omicron Subvariants Spike with two antibodies 提交 2023-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric
链 A 17–1147（1131 aa）
链 B 17–1147（1131 aa）
链 C 17–1147（1131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8WZI One RBD up state of Spike glycoprotein, SARS-CoV-2 提交 2023-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
突变：(RRAR)682A,K986P, V987P 突变：(RRAR)682A,K986P, V987P 突变：(RRAR)682A,K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force, 0
分辨率 3.00 Å
8X0X Crystal structure of JE-5C in complex with SARS-CoV-2 RBD 提交 2023-11-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 334–528（195 aa） 片段：receptor-binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M magnesium sulfate heptahydrate 20 % (w/v) polyethylene glycol 3350
分辨率 3.45 Å R-free 0.285
8X0X Crystal structure of JE-5C in complex with SARS-CoV-2 RBD 提交 2023-11-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 334–528（195 aa） 片段：receptor-binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M magnesium sulfate heptahydrate 20 % (w/v) polyethylene glycol 3350
分辨率 3.45 Å R-free 0.285
8X0Y Crystal structure of JM-1A in complex with SARS-CoV-2 RBD 提交 2023-11-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 333–528（196 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；1M lithium chloride, 0.1M citrate pH 4.0, 20% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 1.94 Å R-free 0.223
8X0Y Crystal structure of JM-1A in complex with SARS-CoV-2 RBD 提交 2023-11-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–528（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；1M lithium chloride, 0.1M citrate pH 4.0, 20% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 1.94 Å R-free 0.223
8X4H SARS-CoV-2 JN.1 Spike 提交 2023-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
8X4Z BA.2.86 Spike Trimer with ins483V mutation (3 RBD down) 提交 2023-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
8X50 BA.2.86 Spike Trimer with ins483V mutation (1 RBD up) 提交 2023-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
8X55 BA.2.86 Spike Trimer with T356K mutation (3 RBD down) 提交 2023-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å
8X56 BA.2.86 Spike Trimer with T356K mutation (1 RBD up) 提交 2023-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.93 Å
8X5Q SARS-CoV-2 BA.2.75 Spike with K356T mutation (3 RBD down) 提交 2023-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：K356T 突变：K356T 突变：K356T NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
8X5R SARS-CoV-2 BA.2.75 Spike with K356T mutation (1 RBD up) 提交 2023-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：K356T 突变：K356T 突变：K356T NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.72 Å
8XAL Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-BQ.1 in complex with ACE2 提交 2023-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：;T19I, L24S, 25-27del, 69-70del, G142D, V213G, G339D, S371F, S373P, S375F, T376A, D405N, R408S, K417N, N440K, K444T, L452R, N460K, S477N, T478K, E484A, F486V, Q498R, N501Y, Y505H, D614G, H655Y, N679K, P681H, R682G, R683S, R685S, N764K, D796Y, F817P, N856K, A892P, A899P, A942P, Q954H, N969K, K986, V987P ; 突变：;T19I, L24S, 25-27del, 69-70del, G142D, V213G, G339D, S371F, S373P, S375F, T376A, D405N, R408S, K417N, N440K, K444T, L452R, N460K, S477N, T478K, E484A, F486V, Q498R, N501Y, Y505H, D614G, H655Y, N679K, P681H, R682G, R683S, R685S, N764K, D796Y, F817P, N856K, A892P, A899P, A942P, Q954H, N969K, K986, V987P ; 突变：;T19I, L24S, 25-27del, 69-70del, G142D, V213G, G339D, S371F, S373P, S375F, T376A, D405N, R408S, K417N, N440K, K444T, L452R, N460K, S477N, T478K, E484A, F486V, Q498R, N501Y, Y505H, D614G, H655Y, N679K, P681H, R682G, R683S, R685S, N764K, D796Y, F817P, N856K, A892P, A899P, A942P, Q954H, N969K, K986, V987P ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
分辨率 3.20 Å
8XBF Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-BQ.1 in complex with antibody O5C2 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：;T19I, L24S, 25-27del, 69-70del, G142D, V213G, G339D, S371F, S373P, S375F, T376A, D405N, R408S, K417N, N440K, K444T, L452R, N460K, S477N, T478K, E484A, F486V, Q498R, N501Y, Y505H, D614G, H655Y, N679K, P681H, R682G, R683S, R685S, N764K, D796Y, F817P, N856K, A892P, A899P, A942P, Q954H, N969K, K986, V987P ; 突变：;T19I, L24S, 25-27del, 69-70del, G142D, V213G, G339D, S371F, S373P, S375F, T376A, D405N, R408S, K417N, N440K, K444T, L452R, N460K, S477N, T478K, E484A, F486V, Q498R, N501Y, Y505H, D614G, H655Y, N679K, P681H, R682G, R683S, R685S, N764K, D796Y, F817P, N856K, A892P, A899P, A942P, Q954H, N969K, K986, V987P ; 突变：;T19I, L24S, 25-27del, 69-70del, G142D, V213G, G339D, S371F, S373P, S375F, T376A, D405N, R408S, K417N, N440K, K444T, L452R, N460K, S477N, T478K, E484A, F486V, Q498R, N501Y, Y505H, D614G, H655Y, N679K, P681H, R682G, R683S, R685S, N764K, D796Y, F817P, N856K, A892P, A899P, A942P, Q954H, N969K, K986, V987P ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
分辨率 3.60 Å
8XE9 XBB.1.5 RBD in complex with BD55-1205 提交 2023-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 334–529（196 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8XEA XBB.1.5 spike protein in complex with BD55-1205 提交 2023-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1140（1140 aa）
链 E 1–1140（1140 aa）
链 F 1–1140（1140 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
8XEF Cocktail GC2050-GC2225 提交 2023-12-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 334–528（195 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.41 Å
8XG2 The structure of HLA-A/Pep14 提交 2023-12-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 340–351（12 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris, 20%w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 5000
分辨率 1.84 Å R-free 0.230
8XI6 SARS-CoV-2 Omicron BQ.1.1 Variant Spike Protein Complexed with MO11 Fab 提交 2023-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
8XK2 A neutralizing nanobody VHH60 against wt SARS-CoV-2 提交 2023-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 319–531（213 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.0 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M Sodium HEPES 7.5
分辨率 3.40 Å R-free 0.300
8XK2 A neutralizing nanobody VHH60 against wt SARS-CoV-2 提交 2023-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 319–531（213 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.0 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M Sodium HEPES 7.5
分辨率 3.40 Å R-free 0.300
8XK2 A neutralizing nanobody VHH60 against wt SARS-CoV-2 提交 2023-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 319–531（213 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.0 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M Sodium HEPES 7.5
分辨率 3.40 Å R-free 0.300
8XK2 A neutralizing nanobody VHH60 against wt SARS-CoV-2 提交 2023-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 319–531（213 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.0 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M Sodium HEPES 7.5
分辨率 3.40 Å R-free 0.300
8XKC The structure of HLA-A/Pep16 提交 2023-12-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 361–369（9 aa） 片段：Pep16
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M Imidazole, 20%w/v PEG 6000
分辨率 2.18 Å R-free 0.291
8XKI A neutralizing nanobody VHH60 against wt SARS-CoV-2 提交 2023-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8XLM Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein in complex with ACE2 (1-up state) 提交 2023-12-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 12–1210（1199 aa）
链 B 12–1210（1199 aa）
链 C 12–1210（1199 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；calcium- and magnesium-free PBS buffer.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.22 Å
8XLN Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike RBD in complex with ACE2 提交 2023-12-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 12–1210（1199 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；calcium- and magnesium-free PBS buffer.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.78 Å
8XLV Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2.86 spike protein(6P), 1-RBD-up state 提交 2023-12-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1147（1120 aa）
链 B 28–1147（1120 aa）
链 C 28–1147（1120 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
8XM5 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron EG.5 spike protein(6P), RBD-closed state 提交 2023-12-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1208（1181 aa）
链 B 28–1208（1181 aa）
链 C 28–1208（1181 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.61 Å
8XMG Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron HV.1 spike protein(6P), RBD-closed state 提交 2023-12-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1208（1181 aa）
链 B 28–1208（1181 aa）
链 C 28–1208（1181 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 38 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8XMT Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron EG.5.1 spike protein(6P), RBD-closed state 提交 2023-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1207（1192 aa）
链 B 16–1207（1192 aa）
链 C 16–1207（1192 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
8XN2 SARS-CoV-2 Omicron EG.5.1 RBD in complex with human ACE2 (local refined from the spike protein) 提交 2023-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8XN3 SARS-CoV-2 Omicron HV.1 RBD in complex with human ACE2 (local refinement from the spike protein) 提交 2023-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.64 Å
8XN5 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron EG.5.1 spike protein(6P) in complex with human ACE2 提交 2023-12-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 16–1207（1192 aa）
链 C 16–1207（1192 aa）
链 D 16–1207（1192 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
8XNF Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2.86 spike protein(6P) in complex with human ACE2 提交 2023-12-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 28–1147（1120 aa）
链 C 28–1147（1120 aa）
链 D 28–1147（1120 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.26 Å
8XNK Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron HV.1 spike protein(6P) in complex with human ACE2 提交 2023-12-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 28–1208（1181 aa）
链 C 28–1208（1181 aa）
链 D 28–1208（1181 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
8XRQ SARS-CoV-2 BA.1 spike RBD in complex bound with VacBB-639 提交 2024-01-08 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 5s, wait for 2s, blot force:0
分辨率 4.19 Å
8XSD BA.5 Spike complex with CR9 提交 2024-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
8XSE SARS-CoV-2 RBD + IMCAS-123 + IMCAS-72 Fab 提交 2024-01-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 319–527（209 aa） 片段：RBD domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8XSF SARS-CoV-2 RBD + IMCAS-364 + hACE2 提交 2024-01-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 319–527（209 aa） 片段：RBD domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.16 Å
8XSI SARS-CoV-2 RBD + IMCAS-364 (Local Refinement) 提交 2024-01-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 319–527（209 aa） 片段：RBD domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.10 Å
8XSJ SARS-CoV-2 Omicron BA.4 RBD + IMCAS-316 + ACE2 提交 2024-01-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 319–541（223 aa） 片段：RBD domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.61 Å
8XSL SARS-CoV-2 spike + IMCAS-123 提交 2024-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8XUR BA.2.86 Spike Trimer in complex with heparan sulfate 提交 2024-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 IDU 2-O-sulfo-beta-L-altropyranuronic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8XUS JN.1 Spike Trimer in complex with heparan sulfate 提交 2024-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 54 IDU 2-O-sulfo-beta-L-altropyranuronic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
8XUT XBB.1.5 Spike Trimer in complex with heparan sulfate 提交 2024-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 48 IDU 2-O-sulfo-beta-L-altropyranuronic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8XUU BA.2.86-T356K Spike Trimer in complex with heparan sulfate (Local refinement) 提交 2024-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：T356K NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 IDU 2-O-sulfo-beta-L-altropyranuronic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
8XUX Structure of the SARS-CoV-2 BA.2.86 spike protein (1-up state) 提交 2024-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1210（1183 aa）
链 B 28–1210（1183 aa）
链 C 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.22 Å
8XUY Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up state) 提交 2024-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 28–1210（1183 aa）
链 B 28–1210（1183 aa）
链 C 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 38 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.14 Å
8XUZ Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up and 1-down state) 提交 2024-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 28–1210（1183 aa）
链 B 28–1210（1183 aa）
链 C 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.05 Å
8XV0 Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike RBD in complex with ACE2 (up state) 提交 2024-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.00 Å
8XV1 Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike RBD in complex with ACE2 (down state) 提交 2024-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.05 Å
8XVM Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein in complex with ACE2 (3-up state) 提交 2024-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：dimeric
链 A 28–1210（1183 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 2.77 Å
8XXW Fab M2-7 complexed with SARS-Cov2 RBD and human ACE2 提交 2024-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 336–515（180 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
8XY9 Crystal structure of SARS-CoV-2 BF.7 RBD and human ACE2 complex 提交 2024-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–526（194 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.0,10%w/v Polyethylene glycol 6000.
分辨率 3.64 Å R-free 0.261
8XY9 Crystal structure of SARS-CoV-2 BF.7 RBD and human ACE2 complex 提交 2024-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 333–526（194 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.0,10%w/v Polyethylene glycol 6000.
分辨率 3.64 Å R-free 0.261
8XYE Crystal structure of SARS-CoV-2 BA.4 RBD and human ACE2 提交 2024-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 333–526（194 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1M BICINE, pH9.0,10% w/v PEG20000,2% v/v 1,4-Dioxane
分辨率 3.32 Å R-free 0.242
8XYE Crystal structure of SARS-CoV-2 BA.4 RBD and human ACE2 提交 2024-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 333–526（194 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1M BICINE, pH9.0,10% w/v PEG20000,2% v/v 1,4-Dioxane
分辨率 3.32 Å R-free 0.242
8XYG Crystal structure of SARS-CoV-2 BQ.1.1 RBD and human ACE2 提交 2024-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 334–525（192 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M BIS-TRIS, pH6.5, 16% w/v PEG10000
分辨率 3.64 Å R-free 0.291
8XYG Crystal structure of SARS-CoV-2 BQ.1.1 RBD and human ACE2 提交 2024-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 334–525（192 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M BIS-TRIS, pH6.5, 16% w/v PEG10000
分辨率 3.64 Å R-free 0.291
8XYH Cryo-EM structure of BANAL-20-52 spike protein (6P) 提交 2024-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1217（1217 aa）
链 B 1–1217（1217 aa）
链 C 1–1217（1217 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8XYM Cryo-EM structure of CX1 spike protein (6P) 提交 2024-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1214（1214 aa）
链 B 1–1214（1214 aa）
链 C 1–1214（1214 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.74 Å
8XYO Cryo-EM structure of CX1 receptor binding domain in complex with human ACE2 提交 2024-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1214（1214 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8XYZ The structure of fox ACE2 and PT RBD complex 提交 2024-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 323–541（219 aa） 片段：RBD
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
8XZ0 Crystal complex structure of SARS-CoV-2 S bound to human ezrin 提交 2024-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1260–1273（14 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；289 K；0.22 M Magnesium acetate and 19% PEG 3350,
分辨率 2.04 Å R-free 0.253
8XZ4 SARS-CoV-2 S and radixin complex structure 提交 2024-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1260–1273（14 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；75 mM Sodium acetate, 0.1 M Tris-HCl, pH 7.4, 5.5% PEG 3350
分辨率 2.13 Å R-free 0.266
8XZ5 SARS-CoV-2 S and moesin complex structure 提交 2024-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1260–1273（14 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M Tris, pH 7.4, 0.2 M NH4Ac, and 21% PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.232
8XZ8 BA.2.86 Spike in complex with bovine ACE2 (bound 1 ACE2) 提交 2024-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
8XZ9 BA.2.86 Spike in complex with bovine ACE2 (bound 2 ACE2) 提交 2024-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 28–1144（1117 aa）
链 C 28–1144（1117 aa）
链 D 28–1144（1117 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
8XZA BA.2.86 Spike in complex with bovine ACE2 (Local refinement) 提交 2024-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
8XZD The structure of fox ACE2 and Omicron BF.7 RBD complex 提交 2024-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
8Y0Y Cryo-EM structure of the 123-316 scDb/PT-RBD complex 提交 2024-01-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–527（209 aa） 片段：Receptor binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8Y16 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron JN.1 spike protein in complex with human ACE2 提交 2024-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P ZN ZINC ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
8Y18 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron JN.1 RBD in complex with human ACE2 (local refinement from the spike protein) 提交 2024-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1208（1208 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8Y4A BA.2.86 S-trimer in complex with Nab XG2v046 提交 2024-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8Y4C BA.2.86 S-trimer in complex with Nab XGv280 提交 2024-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 54 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å
8Y5J Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron JN.1 spike protein 提交 2024-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8Y6A Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.2.86 RBD in complex with human ACE2 and S309 Fab 提交 2024-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.72 Å
8YBS State - I: Spike 2-up RBD with THSC20.HVTR04 (Fab4) 提交 2024-02-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.54 Å
8YBY State - I: Spike 2-up RBD with THSC20.HVTR26 (Fab26) - single Fab masked 提交 2024-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–1273（1273 aa）
链 D 1–1273（1273 aa）
链 E 1–1273（1273 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8YBZ State - II: Spike 3-up RBD with THSC20.HVTR26 (Fab26) 提交 2024-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8YDP Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 spike protein in complex with Ce9 提交 2024-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 10% PEG 8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.263
8YDP Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 spike protein in complex with Ce9 提交 2024-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 10% PEG 8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.263
8YDQ Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 variant spike protein in complex with Ce149 提交 2024-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–526（194 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M sodium thiocyanate, 20% PEG 6000
分辨率 1.90 Å R-free 0.249
8YDR Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Alpha variant spike protein in complex with Ce59 提交 2024-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.08 M MES (pH 6.5), 0.16 M calcium acetate hydrate, 14.4% PEG 8000, 20% glycerol
分辨率 2.30 Å R-free 0.266
8YDS Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Delta variant spike protein in complex with Ce59 提交 2024-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–526（194 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M BICINE (pH 9.0), 20% PEG 6000
分辨率 1.90 Å R-free 0.226
8YDT Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Alpha variant spike protein in complex with Ce41 提交 2024-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M magnesium formate dihydrate
分辨率 2.50 Å R-free 0.268
8YDT Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Alpha variant spike protein in complex with Ce41 提交 2024-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 333–526（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M magnesium formate dihydrate
分辨率 2.50 Å R-free 0.268
8YDU Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 variant spike protein in complex with CeSPIACE 提交 2024-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–526（194 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BIS-Tris (pH 5.5), 0.1 M ammonium acetate, 17% PEG 1000
分辨率 1.70 Å R-free 0.252
8YDV Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Omicron BA.5 variant spike protein in complex with CeSPIACE 提交 2024-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–526（194 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 10% PEG 6000, 5% MPD
分辨率 2.20 Å R-free 0.221
8YDV Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Omicron BA.5 variant spike protein in complex with CeSPIACE 提交 2024-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 333–526（194 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 10% PEG 6000, 5% MPD
分辨率 2.20 Å R-free 0.221
8YDW Crystal structure of the receptor binding domain of SARS-CoV-2 Omicron XBB.1.5 variant spike protein in complex with CeSPIACE 提交 2024-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–526（194 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M CHES (pH 9.5), 20% PEG 8000
分辨率 2.00 Å R-free 0.254
8YDX Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike ectodomain (HexaPro, Omicron BA.2 variant) in complex with CeSPIACE 提交 2024-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 13–1208（1196 aa）
链 B 13–1208（1196 aa）
链 C 13–1208（1196 aa）
突变：F817P, A892P, A898P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A898P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A898P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
8YDY Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike ectodomain (HexaPro, Omicron BA.5 variant) in complex with CeSPIACE, class 1 提交 2024-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 13–1208（1196 aa）
链 B 13–1208（1196 aa）
链 C 13–1208（1196 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.00 Å
8YDZ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike ectodomain (HexaPro, Omicron BA.5 variant) in complex with CeSPIACE, class 2 提交 2024-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 13–1208（1196 aa）
链 B 13–1208（1196 aa）
链 C 13–1208（1196 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
8YE4 The complex of TCR NYN-I and HLA-A24 bound to SARS-CoV-2 Spike448-456 peptide NYNYLYRLF 提交 2024-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 448–456（9 aa） 片段：448-456 peptide
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；8% Tacsimate 7.0, 20% PEG3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8YE4 The complex of TCR NYN-I and HLA-A24 bound to SARS-CoV-2 Spike448-456 peptide NYNYLYRLF 提交 2024-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 448–456（9 aa） 片段：448-456 peptide
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；8% Tacsimate 7.0, 20% PEG3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8YF2 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 prototype RBD in complex with raccoon dog ACE2 (local refinement) 提交 2024-02-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.64 Å
8YFT Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 alpha variant spike protein in complex with raccoon dog ACE2 (local refinement) 提交 2024-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa） 片段：RBD domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
8YKG Structure of SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with NT-108 scFv (1-up state) 提交 2024-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 12–1210（1199 aa）
链 B 12–1210（1199 aa）
链 C 12–1210（1199 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.28 Å
8YKH Structure of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with NT-108 scFv 提交 2024-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 12–1210（1199 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 3.27 Å
8YRO SARS-CoV-2 Delta Spike in complex with JL-8C 提交 2024-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 D 14–1208（1195 aa）
链 P 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
8YRP SARS-CoV-2 Delta Spike in complex with JM-1A 提交 2024-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å
8YUB Crystal structure of SARS-CoV-2 ConSp RBD in complex with neutralizing antibody CC25.4 Fab 提交 2024-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 333–529（197 aa） 片段：RBD
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 8.5, 15% (w/v) PEG 6000
分辨率 2.49 Å R-free 0.255
8YUB Crystal structure of SARS-CoV-2 ConSp RBD in complex with neutralizing antibody CC25.4 Fab 提交 2024-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 333–529（197 aa） 片段：RBD
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 8.5, 15% (w/v) PEG 6000
分辨率 2.49 Å R-free 0.255
8YUC Crystal structure of SARS-CoV-2 ConSp RBD in complex with antibodies PDI222 Fab and COVA1-16 Fab 提交 2024-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 334–529（196 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.0 M NH4-sulfate
分辨率 4.51 Å R-free 0.308
8YWE Local refinement of SARS-CoV-2 Omicron BA.2.86 S complexed with Abs G7-Fc 提交 2024-03-31 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–541（223 aa） 片段：RBD domain
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8YWW The structure of HKU1-B S protein with bsAb1 提交 2024-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–1210（1210 aa）
链 B 1–1210（1210 aa）
链 C 1–1210（1210 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8YWX the complex structure of the H4B6 Fab with the RBD of Omicron BA.5 S protein 提交 2024-04-01 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 27–1146（1120 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8YZ5 SARS-CoV-2 Delta Spike in complex with Fab of JE-5C 提交 2024-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
链 D 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Tris-HCL, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.93 Å
8YZ6 SARS-CoV-2 Spike (BA.1) in complex with Fab of JH-8B 提交 2024-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 14–1210（1197 aa）
链 B 14–1210（1197 aa）
链 C 14–1210（1197 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Tris-HCL, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.55 Å
8YZB BA.2.86 RBD protein in complex with ACE2. 提交 2024-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 14–1208（1195 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
8YZC Structure of BA.2.86 spike protein in complex with ACE2. 提交 2024-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8YZD Structure of JN.1 RBD protein in complex with ACE2. 提交 2024-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 14–1208（1195 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
8YZE The JN.1 spike protein (S) in complex with ACE2. 提交 2024-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
8YZJ The structure of Banal-52 RBD and hACE2 complex 提交 2024-04-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
8YZR The structure of HLA-A*2402 complex with peptide from SARS-CoV-2 S448-456 NYNYLYRLL(EG.5.1) 提交 2024-04-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 448–456（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 20% (w/v) Polyethylene glycol 2,000
分辨率 1.80 Å R-free 0.262
8YZW The structure of HLA-A*2402 complex with peptide from SARS-CoV-2 S448-456 NYDYWYRLF(BA.2.86) 提交 2024-04-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 448–456（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate , 18% (w/v) Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.278
8YZW The structure of HLA-A*2402 complex with peptide from SARS-CoV-2 S448-456 NYDYWYRLF(BA.2.86) 提交 2024-04-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 448–456（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate , 18% (w/v) Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.278
8YZZ The structure of HLA-A*2402 complex with peptide from SARS-CoV-2 S448-456 NYNYLYRLF(Prototype) 提交 2024-04-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 448–456（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate ,18%w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 1.88 Å R-free 0.224
8Z05 The structure of HLA-A*0201 complex with peptide from SARS-CoV-2 N222-230 LLLDRLNKL(BA.2.86/JN.1) 提交 2024-04-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1181–1189（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5, 18% (w/v) Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.96 Å R-free 0.275
8Z06 The structure of HLA-A*2402 complex with peptide from SARS-CoV-2 S448-456 NYDYWYRSF(JN.1) 提交 2024-04-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 448–456（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% (w/v) Polyethylene glycol 4,000
分辨率 2.39 Å R-free 0.232
8Z07 The structure of HLA-A*2402 complex with peptide from SARS-CoV-2 S448-456 NYNYRYRLF(Delta/BA.5.2) 提交 2024-04-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 448–456（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% (w/v) Polyethylene glycol 4,000
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
8Z2E Crystal structure of nanobody Tnb04-1 with antibody 1F11 fab and SARS-CoV-2 RBD 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 319–529（211 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.30 Å R-free 0.234
8Z3W Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 D614G S with one ACE2 receptor binding (RB1) in prefusion conformation 提交 2024-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8Z4X Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 D614G S with two ACE2 receptors binding (RB2) in prefusion conformation 提交 2024-04-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8Z64 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 D614G S with three ACE2 receptors binding (RB3) in prefusion conformation (focused refinement of NTD-SD1-RBD-ACE2) 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.53 Å
8Z6A Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 D614G S with three ACE2 receptors binding (RB3) in prefusion conformation 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.99 Å
8Z6Q SARS-CoV-2 XBB.1.16 Spike in complex with CYFN1006-1(S-CYFN1006-1 dimer trimer). 提交 2024-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
链 J 14–1208（1195 aa）
链 K 14–1208（1195 aa）
链 L 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.41 Å
8Z6R Structure of XBB.1.16 S trimer with 3 down-RBDs complex with antibody CYFN1006-1. 提交 2024-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
8Z6S Structure of XBB.1.16 S trimer with 2 down-RBDs complex with antibody CYFN1006-1. 提交 2024-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.84 Å
8Z6T Structure of XBB.1.16 RBD in complex with antibody CYFN1006-1. 提交 2024-04-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
8Z6U SARS-CoV-2 EG.5.1 Spike in complex with CYFN1006-2(S-CYFN1006-2 dimer trimer). 提交 2024-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
链 D 14–1208（1195 aa）
链 E 14–1208（1195 aa）
链 F 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
8Z6W Structure of EG.5.1 S trimer with 3 down-RBDs complex with antibody CYFN1006-2. 提交 2024-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8Z6X Structure of EG.5.1 RBD in complex with antibody CYFN1006-2. 提交 2024-04-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa） 片段：RBD,RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
8Z7B Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S trimer in the early fusion intermediate conformation (E-FIC) (focused refinement of NTD-SD1-RBD-ACE2) 提交 2024-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
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分辨率 3.30 Å
8Z7G Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S trimer in the early fusion intermediate conformation (E-FIC) (focused refinement of intact S2) 提交 2024-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
8Z7L Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S trimer in the early fusion intermediate conformation (E-FIC) (focused refinement of S-bottom) 提交 2024-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
8Z7P Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S trimer in the early fusion intermediate conformation (E-FIC) 提交 2024-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8Z86 BA.5 RBD in complex with CR9 提交 2024-04-21 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 328–528（201 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.87 Å
8Z9L Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD bound to Rhinolophus affinis ACE2 提交 2024-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 333–527（195 aa） 片段：RBD domain
链 R 333–527（195 aa） 片段：RBD domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1M HEPES pH7.5, 10% w/v Polyethylene 8000, 8% v/v Ethylene glycol
分辨率 3.60 Å R-free 0.277
8Z9L Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD bound to Rhinolophus affinis ACE2 提交 2024-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 333–527（195 aa） 片段：RBD domain
链 X 333–527（195 aa） 片段：RBD domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1M HEPES pH7.5, 10% w/v Polyethylene 8000, 8% v/v Ethylene glycol
分辨率 3.60 Å R-free 0.277
8ZBQ Local map of Omicron Subvariant JN.1 RBD with ACE2 提交 2024-04-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 336–518（183 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
8ZBY SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike trimer (x2-4P) in complex with 3 D1F6 Fabs (0 RBD up) 提交 2024-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
突变：681-684del, G413C, F817P, A892P, A899P, A942P, V987C 突变：681-684del, G413C, F817P, A892P, A899P, A942P, V987C 突变：681-684del, G413C, F817P, A892P, A899P, A942P, V987C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.67 Å
8ZBZ SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike trimer (6P) in complex with 3 D1F6 Fabs (1 RBD up) 提交 2024-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.71 Å
8ZC0 SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike trimer (6P) in complex with 3 D1F6 Fabs (2 RBD up) 提交 2024-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.17 Å
8ZC1 SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike trimer (6P) in complex with D1F6 Fab, focused refinement of RBD region 提交 2024-04-28 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 332–527（196 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.17 Å
8ZC2 SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike trimer (6P) in complex with D1F6 Fab, head-to-head aggregate 提交 2024-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
链 D 14–1211（1198 aa）
链 E 14–1211（1198 aa）
链 F 14–1211（1198 aa）
突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.82 Å
8ZC3 SARS-CoV-2 Omicron BA.4 spike trimer (6P) in complex with 3 D1F6 Fabs (1 RBD up) 提交 2024-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.69 Å
8ZC4 SARS-CoV-2 Omicron BA.4 spike trimer (6P) in complex with 3 D1F6 Fabs (2 RBD up) 提交 2024-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8ZC5 SARS-CoV-2 Omicron BA.4 spike trimer (6P) in complex with D1F6 Fab, focused refinement of RBD region 提交 2024-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 332–527（196 aa） 片段：RBD
链 B 332–527（196 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.91 Å
8ZC6 SARS-CoV-2 Omicron BA.4 spike trimer (6P) in complex with D1F6 Fab, head-to-head aggregate 提交 2024-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
链 D 14–1211（1198 aa）
链 E 14–1211（1198 aa）
链 F 14–1211（1198 aa）
突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：681-684del, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.85 Å
8ZER Crystal structure of the complex of Wuhan SARS-CoV-2 RBD (319-541) with P2C5 nanobody 提交 2024-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 25% PEG 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
8ZER Crystal structure of the complex of Wuhan SARS-CoV-2 RBD (319-541) with P2C5 nanobody 提交 2024-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 25% PEG 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
8ZER Crystal structure of the complex of Wuhan SARS-CoV-2 RBD (319-541) with P2C5 nanobody 提交 2024-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 25% PEG 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
8ZER Crystal structure of the complex of Wuhan SARS-CoV-2 RBD (319-541) with P2C5 nanobody 提交 2024-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 25% PEG 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
8ZER Crystal structure of the complex of Wuhan SARS-CoV-2 RBD (319-541) with P2C5 nanobody 提交 2024-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 25% PEG 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
8ZES Crystal structure of the Wuhan SARS-CoV-2 RBD (333-541) complexed with P2C5 nanobody 提交 2024-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 333–541（209 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288 K；0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 0.1 M Imidazole pH 7.0, 22% PEG MME 550
分辨率 3.70 Å R-free 0.269
8ZES Crystal structure of the Wuhan SARS-CoV-2 RBD (333-541) complexed with P2C5 nanobody 提交 2024-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 333–541（209 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288 K；0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 0.1 M Imidazole pH 7.0, 22% PEG MME 550
分辨率 3.70 Å R-free 0.269
8ZES Crystal structure of the Wuhan SARS-CoV-2 RBD (333-541) complexed with P2C5 nanobody 提交 2024-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 333–541（209 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288 K；0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 0.1 M Imidazole pH 7.0, 22% PEG MME 550
分辨率 3.70 Å R-free 0.269
8ZES Crystal structure of the Wuhan SARS-CoV-2 RBD (333-541) complexed with P2C5 nanobody 提交 2024-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 333–541（209 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288 K；0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 0.1 M Imidazole pH 7.0, 22% PEG MME 550
分辨率 3.70 Å R-free 0.269
8ZES Crystal structure of the Wuhan SARS-CoV-2 RBD (333-541) complexed with P2C5 nanobody 提交 2024-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 333–541（209 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288 K；0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 0.1 M Imidazole pH 7.0, 22% PEG MME 550
分辨率 3.70 Å R-free 0.269
8ZHD SARS-CoV-2 spike trimer (6P) in complex with two R1-26 Fabs 提交 2024-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 11–1208（1198 aa）
链 B 11–1208（1198 aa）
链 C 11–1208（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
8ZHE SARS-CoV-2 spike trimer (6P) in complex with three R1-26 Fabs 提交 2024-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 11–1208（1198 aa）
链 B 11–1208（1198 aa）
链 C 11–1208（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
8ZHF SARS-CoV-2 spike trimer (6P) in complex with R1-26 Fab, head-to-head aggregate 提交 2024-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 11–1208（1198 aa）
链 B 11–1208（1198 aa）
链 C 11–1208（1198 aa）
链 D 11–1208（1198 aa）
链 E 11–1208（1198 aa）
链 I 11–1208（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.26 Å
8ZHG SARS-CoV-2 spike trimer (6P) in complex with R1-26 Fab, focused refinement of RBD-Fab region 提交 2024-05-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 11–1208（1198 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
8ZHH SARS-CoV-2 spike trimer (6P) in complex with two H18 Fabs 提交 2024-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 11–1208（1198 aa）
链 B 11–1208（1198 aa）
链 C 11–1208（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.55 Å
8ZHI SARS-CoV-2 spike trimer (6P) in complex with three H18 Fabs 提交 2024-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 11–1208（1198 aa）
链 B 11–1208（1198 aa）
链 C 11–1208（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.05 Å
8ZHJ SARS-CoV-2 spike trimer (6P) in complex with three H18 Fabs, head-to-head aggregate (C1 symmetry) 提交 2024-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 11–1208（1198 aa）
链 B 11–1208（1198 aa）
链 C 11–1208（1198 aa）
链 G 11–1208（1198 aa）
链 H 11–1208（1198 aa）
链 I 11–1208（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 66 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.45 Å
8ZHK SARS-CoV-2 spike trimer (6P) in complex with three H18 Fabs, head-to-head aggregate (C3 symmetry) 提交 2024-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 11–1208（1198 aa）
链 B 11–1208（1198 aa）
链 C 11–1208（1198 aa）
链 G 11–1208（1198 aa）
链 H 11–1208（1198 aa）
链 I 11–1208（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 66 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.30 Å
8ZHL SARS-CoV-2 spike trimer (6P) in complex with two H18 and two R1-32 Fabs 提交 2024-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 A 11–1208（1198 aa）
链 B 11–1208（1198 aa）
链 C 11–1208（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.96 Å
8ZHM SARS-CoV-2 spike trimer (6P) in complex with three H18 and three R1-32 Fabs 提交 2024-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 11–1208（1198 aa）
链 B 11–1208（1198 aa）
链 C 11–1208（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
8ZHN SARS-CoV-2 spike trimer (6P) in complex with three H18 and three R1-32 Fabs (one RBD rotated) 提交 2024-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 11–1208（1198 aa）
链 B 11–1208（1198 aa）
链 C 11–1208（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.12 Å
8ZHO SARS-CoV-2 S1 in complex with H18 and R1-32 Fab 提交 2024-05-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 11–676（666 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8ZHP Dimer of SARS-CoV-2 S1 in complex with H18 and R1-32 Fabs 提交 2024-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 11–676（666 aa）
链 C 11–676（666 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
8ZPP Local CryoEM structure of the SARS-CoV-2 BA.5 in complex with ORB10 Fab 提交 2024-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8ZPQ Crystal structure of SARS-Cov-2-BQ1.1-RBD and 70fab 提交 2024-05-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M Na HEPES, pH7.0, 10% w/v PEG6000
分辨率 2.75 Å R-free 0.281
8ZPQ Crystal structure of SARS-Cov-2-BQ1.1-RBD and 70fab 提交 2024-05-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M Na HEPES, pH7.0, 10% w/v PEG6000
分辨率 2.75 Å R-free 0.281
8ZRD The complex structure of SARS-CoV-2 RBD and llama single-domain antibody S4 提交 2024-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 319–529（211 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M citrate at pH 5.0 and 20% PEG6000
分辨率 2.71 Å R-free 0.295
8ZRD The complex structure of SARS-CoV-2 RBD and llama single-domain antibody S4 提交 2024-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 319–529（211 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M citrate at pH 5.0 and 20% PEG6000
分辨率 2.71 Å R-free 0.295
8ZV9 Complex structure of HLA2402 with recognizing SARS-CoV-2 Y453F epitope NYNYLFRLF 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 448–456（9 aa）
突变：Y453F EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；287 K；20% PEG8000, 0.1 M HEPES 7.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.289
8ZV9 Complex structure of HLA2402 with recognizing SARS-CoV-2 Y453F epitope NYNYLFRLF 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 448–456（9 aa）
突变：Y453F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；287 K；20% PEG8000, 0.1 M HEPES 7.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.289
8ZV9 Complex structure of HLA2402 with recognizing SARS-CoV-2 Y453F epitope NYNYLFRLF 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 448–456（9 aa）
突变：Y453F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；287 K；20% PEG8000, 0.1 M HEPES 7.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.289
8ZYF Crystal structure of ZW2G10 Fab in complex with omicron RBD 提交 2024-06-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 335–529（195 aa） 片段：RBD domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M MES pH 6.5, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZYF Crystal structure of ZW2G10 Fab in complex with omicron RBD 提交 2024-06-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 335–529（195 aa） 片段：RBD domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M MES pH 6.5, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
9ARU COVA2-15 fragment antigen binding in complex with SARS-CoV-2 6P-mut7 S protein 提交 2024-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9ASD VIR-7229 Fab fragment bound the SARS-CoV-2 BA.2.86 spike trimer (local refinement of the BA 2.86 RBD/VIR-7229 VHVL) 提交 2024-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 1–1208（1208 aa） 片段：Prefusion-stabilized BA2.86 spike trimer
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9ATO XBB.1.5 spike/Nanosota-3C complex 提交 2024-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9ATP local refinement of XBB.1.5 spike/Nanosota-3C complex 提交 2024-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9ATQ XBB.1.5 spike/Nanosota-8 complex 提交 2024-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9ATR local refinement of XBB.1.5 spike/Nanosota-8 complex 提交 2024-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9AU2 VIR-7229 Fab fragment bound the BA.2.86 spike trimer (global refinement) 提交 2024-02-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa） 片段：Prefusion-stabilized BA2.86 spike trimer
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：Prefusion-stabilized BA2.86 spike trimer
链 C 1–1208（1208 aa） 片段：Prefusion-stabilized BA2.86 spike trimer
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9AYW SARS-CoV-2 Omicron-EG.5.1 3-RBD down Spike Protein Trimer 1 (S-GSAS-Omicron-EG.5.1) 提交 2024-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9AYX SARS-CoV-2 Omicron-EG.5.1 3-RBD down Spike Protein Trimer 2 (S-GSAS-Omicron-EG.5.1) 提交 2024-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9AYY SARS-CoV-2 Omicron-EG.5.1 3-RBD down Spike Protein Trimer 3 (S-GSAS-Omicron-EG.5.1) 提交 2024-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9B0Y SARS CoV-2 Spike protein Ectodomain with internal tag, all RBD-down conformation 提交 2024-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 17 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.32 Å
9B2V SARS CoV-2 Spike protein Ectodomain with internal tag, 1RBD-up conformation 提交 2024-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS 突变：K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS 突变：K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
9B4X SARS CoV-2 full-length spike protein with Lys1269Ala and His1271Ala substitutions in the coatomer binding motif, 1RBD-up conformation (SPIKE-AXA) 提交 2024-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：;D614G variant, residues 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P, K1269A, H1271A, strep-tag inserted between residues 18 and 19 ; 突变：;D614G variant, residues 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P, K1269A, H1271A, strep-tag inserted between residues 18 and 19 ; 突变：;D614G variant, residues 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P, K1269A, H1271A, strep-tag inserted between residues 18 and 19 ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
9B82 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody COVA2-15 提交 2024-03-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.095 M sodium citrate, pH 5.6, 19% (v/v) 2-propanol, 5% (v/v) glycerol, and 19% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 3.38 Å R-free 0.295
9B82 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody COVA2-15 提交 2024-03-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.095 M sodium citrate, pH 5.6, 19% (v/v) 2-propanol, 5% (v/v) glycerol, and 19% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 3.38 Å R-free 0.295
9B82 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody COVA2-15 提交 2024-03-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.095 M sodium citrate, pH 5.6, 19% (v/v) 2-propanol, 5% (v/v) glycerol, and 19% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 3.38 Å R-free 0.295
9B82 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody COVA2-15 提交 2024-03-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.095 M sodium citrate, pH 5.6, 19% (v/v) 2-propanol, 5% (v/v) glycerol, and 19% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 3.38 Å R-free 0.295
9B82 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody COVA2-15 提交 2024-03-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.095 M sodium citrate, pH 5.6, 19% (v/v) 2-propanol, 5% (v/v) glycerol, and 19% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 3.38 Å R-free 0.295
9B82 Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing antibody COVA2-15 提交 2024-03-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.095 M sodium citrate, pH 5.6, 19% (v/v) 2-propanol, 5% (v/v) glycerol, and 19% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 3.38 Å R-free 0.295
9B8F SARS CoV-2 full-length spike protein with Lys1269Ala and His1271Ala substitutions in the coatomer binding motif, 2RBD-up conformation (SPIKE-AXA) 提交 2024-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：;D614G variant, residues 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P, K1269A, H1271A, strep-tag inserted between residues 18 and 19 ; 突变：;D614G variant, residues 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P, K1269A, H1271A, strep-tag inserted between residues 18 and 19 ; 突变：;D614G variant, residues 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P, K1269A, H1271A, strep-tag inserted between residues 18 and 19 ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.15 Å
9B9U SARS-CoV-2 full-length spike protein with His1271Lys substitution in the coatomer binding motif, 1RBD-up conformation (SPIKE-KXK) 提交 2024-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：D614G variant, 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P, H1271K, internal strep-tag near N-terminus 突变：D614G variant, 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P, H1271K, internal strep-tag near N-terminus 突变：D614G variant, 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P, H1271K, internal strep-tag near N-terminus NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 17 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25 mM Tris(7.5) 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9BBK SARS-CoV-2 full-length spike protein with His1271Lys substitution in the coatomer binding motif, 2RBD-up conformation (SPIKE-KxK) 提交 2024-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：D614G variant, 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P, H1271K 突变：D614G variant, 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P, H1271K 突变：D614G variant, 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P, H1271K NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25 mM Tris(7.5) 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
9BD9 SARS CoV-2 full-length WT spike protein, 1RBD-up conformation (SPIKE-WT) 提交 2024-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：D614G variant, residues 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P 突变：D614G variant, residues 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P 突变：D614G variant, residues 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25 mM Tris(7.5) 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
9BEA Structure of SARS-CoV-2 full-length WT spike protein with internal tag, 2RBD-up conformation (SPIKE-WT) 提交 2024-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
突变：D614G variant, residues 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P 突变：D614G variant, residues 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P 突变：D614G variant, residues 682-685 RRAR substituted with GSAS, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25 mM Tris(7.5) 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
9BJ2 Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C1533 (local refinement of NTD and C1533) 提交 2024-04-24 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BJ3 Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C1596 提交 2024-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 S 1–1213（1213 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
9BJ4 Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer complex with the human neutralizing antibody Fab fragment, C952 提交 2024-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9BLL Cryo-EM of RBD(EG5.1)/1301B7 Fab Complex 提交 2024-04-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 27–1210（1184 aa） 片段：RBD(EG5.1)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9BND SARS-CoV-2 spike HexaPro protein in complex with T0A trimeric antagonist 提交 2024-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–1208（1208 aa）
链 D 1–1208（1208 aa）
链 F 1–1208（1208 aa）
突变：hexapro construct (F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, 682-685 mutated from RRAR to GSAS) 突变：hexapro construct (F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, 682-685 mutated from RRAR to GSAS) 突变：hexapro construct (F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, 682-685 mutated from RRAR to GSAS) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；1x PBS 137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 1.8 mM KH2PO4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.19 Å
9BNE SARS-CoV-2 spike HexaPro protein in complex with T3A trimeric antagonist 提交 2024-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：extracellular portion
链 D 1–1208（1208 aa） 片段：extracellular portion
链 F 1–1208（1208 aa） 片段：extracellular portion
突变：hexapro construct (F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, 682-685 mutated from RRAR to GSAS) 突变：hexapro construct (F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, 682-685 mutated from RRAR to GSAS) 突变：hexapro construct (F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, 682-685 mutated from RRAR to GSAS) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；1x PBS 137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 1.8 mM KH2PO4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9BNF SARS-CoV-2 spike HexaPro protein in complex with T5A trimeric antagonist 提交 2024-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：extracellular portion
链 D 1–1208（1208 aa） 片段：extracellular portion
链 F 1–1208（1208 aa） 片段：extracellular portion
突变：hexapro construct (F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, 682-685 mutated from RRAR to GSAS) 突变：hexapro construct (F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, 682-685 mutated from RRAR to GSAS) 突变：hexapro construct (F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, 682-685 mutated from RRAR to GSAS) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；1x PBS: 137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 1.8 mM KH2PO4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
9BNG SARS-CoV-2 spike HexaPro protein in complex with T18A trimeric antagonist 提交 2024-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–1208（1208 aa） 片段：extracellular portion
链 D 1–1208（1208 aa） 片段：extracellular portion
链 F 1–1208（1208 aa） 片段：extracellular portion
突变：hexapro construct (F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, 682-685 mutated from RRAR to GSAS) 突变：hexapro construct (F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, 682-685 mutated from RRAR to GSAS) 突变：hexapro construct (F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, 682-685 mutated from RRAR to GSAS) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；1x PBS 137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 1.8 mM KH2PO4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
9C44 SARS-CoV-2 S + S2L20 提交 2024-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9C45 SARS-CoV-2 S + S2L20 (local refinement of NTD and S2L20 Fab variable region) 提交 2024-06-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9C6Y Crystal structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 RBD bound to COV2-3906 Fab 提交 2024-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 319–534（216 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.1, 2 mM DL-panthenol
分辨率 2.68 Å R-free 0.242
9C6Y Crystal structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 RBD bound to COV2-3906 Fab 提交 2024-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 319–534（216 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.1, 2 mM DL-panthenol
分辨率 2.68 Å R-free 0.242
9C7S Cryo EM structure of SARS-COV-2 (BQ 1.1) RBD in complex with Fab COV2-3891 (local refine) 提交 2024-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 322–589（268 aa） 片段：RBD
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9C7X Crystal structure of SARS-CoV-2 antibody 1H06 in complex with a HR2 peptide 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1179–1197（19 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；88 mM Tris (pH 7.0), 31% PEG monomethyl ether 2000
分辨率 1.96 Å R-free 0.215
9CB0 SARS-CoV-2 S protein - Accum modified 提交 2024-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1213（1198 aa）
链 B 16–1213（1198 aa）
链 C 16–1213（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 17 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CCI Dissecting human monoclonal antibody responses from mRNA and protein-based booster vaccinations against XBB1.5 SARS-CoV-2 提交 2024-06-21 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9CCJ Dissecting human monoclonal antibody responses from mRNA and protein-based booster vaccinations against XBB1.5 SARS-CoV-2 提交 2024-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.37 Å
9CFE Cryo-EM Local Refinement of Antibody 19-77 in complex with prefusion SARS-CoV-2 Spike glycoprotein RBD 提交 2024-06-27 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 335–527（193 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
9CFF Cryo-EM Refinement of Antibody 19-77 in complex with SARS-CoV-2 HK.3 RBD 提交 2024-06-27 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–537（219 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9CFG Cryo-EM Refinement of Antibody 19-77 R71V in complex with SARS-CoV-2 HK.3 RBD 提交 2024-06-27 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–537（219 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9CFH Cryo-EM Refinement of Antibody 19-77 R71V in complex with SARS-CoV-2 JD.1.1 RBD 提交 2024-06-27 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 319–537（219 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CO6 BA.5 spike/Nanosota-9 complex 提交 2024-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 7–1225（1219 aa）
链 B 7–1225（1219 aa）
链 C 7–1225（1219 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
9CO7 Local refinement of BA.5 spike/Nanosota-9 complex 提交 2024-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 14–1216（1203 aa）
链 B 14–1216（1203 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
9CO8 JN.1 spike/Nanosota-9 complex 提交 2024-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 28–1211（1184 aa）
链 B 28–1211（1184 aa）
链 C 28–1211（1184 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.99 Å
9CO9 Local refinement of JN.1 spike/Nanosota-9 complex 提交 2024-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1216（1216 aa）
链 B 1–1216（1216 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
9CPP Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies M22-17 and CC12.3 提交 2024-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 CIT CITRIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate citric acid buffer (pH 3.83), 25% (v/v) polyethylene glycol 200, and 9% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 3.19 Å R-free 0.279
9CPQ Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies M22-44 and CC12.3 提交 2024-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–530（198 aa）
未记录 CIT CITRIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate citric acid buffer (pH 3.83), 25% (v/v) polyethylene glycol 200, and 9% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 2.88 Å R-free 0.251
9CPR Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies M22-90 and CC12.3 提交 2024-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate citric acid buffer (pH 4.33), 25% (v/v) polyethylene glycol 200, and 7% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.247
9CPS Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies M22-91 and CC12.3 提交 2024-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 CIT CITRIC ACID × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate citric acid buffer (pH 4.33), 25% (v/v) polyethylene glycol 200, and 7% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 3.03 Å R-free 0.253
9CPT Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies M22-92 and CC12.3 提交 2024-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain, UNP residues 333-530
未记录 CIT CITRIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate citric acid buffer (pH 4), 25% (v/v) polyethylene glycol 200, and 5% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 3.51 Å R-free 0.269
9CPU Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies C03-0304 and CC12.3 提交 2024-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain (UNP residues 333-530)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M Tris, pH 8, 15% v/v ethylene glycol, 1 M lithium chloride, 10% w/v PEG6000
分辨率 2.60 Å R-free 0.239
9CPV Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies C03-0614 and CC12.3 提交 2024-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain (UNP residues 333-530)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate / citric acid, pH 4.33, 25% v/v PEG200, 6% w/v PEG6000
分辨率 3.00 Å R-free 0.262
9CPW Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies C11-1036 and CC12.3 提交 2024-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain (UNP residues 333-530)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate / citric acid, pH 3.83, 25% v/v PEG200, 7% w/v PEG6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.234
9CPX Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies C03-0138 and CC12.3 提交 2024-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain (UNP residues 333-530)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate / citric acid buffer, pH 3.33, 25% v/v PEG200, 9% w/v PEG6000
分辨率 2.70 Å R-free 0.271
9CPY Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies C11-0860 and CC12.3 提交 2024-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 333–530（198 aa） 片段：Receptor binding domain (UNP residues 333-530)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate / citric acid, pH 3.66, 25% v/v PEG200, 8% w/v PEG6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.250
9CRC Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike Proteins on intact virions: B.1 variant 3 closed RBDs 提交 2024-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9CRD Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike Proteins on intact virions: B.1 variant 1 open RBD 提交 2024-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9CRE Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike Proteins on intact virions: Alpha (B.1.1.7) variant 3 closed RBDs 提交 2024-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9CRF Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike Proteins on intact virions: Alpha (B.1.1.7) variant 1 open RBD 提交 2024-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9CRG Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike Proteins on intact virions: Gamma (P.1) variant 3 closed RBDs 提交 2024-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9CRH Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike Proteins on intact virions: Delta (B.1.617.2) variant 3 closed RBDs 提交 2024-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9CRI Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike Proteins on intact virions: Mu (B.1.621) variant 3 closed RBDs 提交 2024-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1273（1273 aa）
链 B 1–1273（1273 aa）
链 C 1–1273（1273 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9CSS Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike protein Ecto-domain with internal tag, 1UP RBD conformation 提交 2024-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS 突变：K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS 突变：K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.72 Å
9CT2 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike protein Ecto-domain with internal tag, All RBD down conformation, State-3 提交 2024-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS 突变：K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS 突变：K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9CVH Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike protein Ecto-domain with internal tag, 1RBD UP, State-2 提交 2024-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS 突变：K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS 突变：K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
9CXE SARS CoV-2 Spike protein Ectodomain with internal tag, all RBD-down conformation -C1 提交 2024-07-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS 突变：K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS 突变：K986P, V987P, 682-685 RRAR mutated to GSAS NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.48 Å
9D8H JN.1 SARS-COV-2 Spike 3-down conformation 提交 2024-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1273（1246 aa）
链 B 28–1273（1246 aa）
链 C 28–1273（1246 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9D8I JN.1 SARS-COV-2 Spike 1-up conformation 提交 2024-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1273（1246 aa）
链 B 28–1273（1246 aa）
链 C 28–1273（1246 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9D8K KP.2 SARS-COV-2 Spike 1-up conformation 提交 2024-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1273（1246 aa）
链 B 28–1273（1246 aa）
链 C 28–1273（1246 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9D8L KP.2 SARS-COV-2 Spike 2-up conformation 提交 2024-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 28–1273（1246 aa）
链 B 28–1273（1246 aa）
链 C 28–1273（1246 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9DHY Structure of SARS-CoV-2 spike in complex with antibody Fab COVIC-154 提交 2024-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 C 14–1208（1195 aa）
链 F 14–1208（1195 aa）
链 K 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；TBS buffer pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9DSG Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with the cow antibody P2 提交 2024-09-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 328–533（206 aa） 片段：Receptor-Binding Domain
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1 M Citric acid pH 3.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.40 Å R-free 0.263
9DSL Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the cow antibody 99 Fab 提交 2024-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
突变：Spike 6P construct, arginines in the furin site deleted 突变：Spike 6P construct, arginines in the furin site deleted 突变：Spike 6P construct, arginines in the furin site deleted NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9ECZ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike protein in complex with human neutralizing antibody WRAIR-2008 (focused refinement of NTD and WRAIR-2008) 提交 2024-11-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS + 2% v/v glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.89 Å
9ELE Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron KP.3.1.1 RBD in complex with human ACE2 (local refinement of RBD and hACE2) 提交 2024-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–527（210 aa） 片段：receptor-binding domain (UNP residues 318-527)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
9ELF Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron KP.3.1.1 spike protein in complex with human ACE2 提交 2024-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–1208（1208 aa）
链 F 1–1208（1208 aa）
链 G 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
9ELG Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron KP.3.1.1 spike RBD and NTD (local refinement of RBD and NTD) 提交 2024-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–293（293 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 1-293)
链 C 318–590（273 aa） 片段：receptor-binding domain (UNP residues 318-590)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
9ELH Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron KP.3.1.1 spike protein (one RBD up state) 提交 2024-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
9ELI Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron KP.3.1.1 spike protein (closed state) 提交 2024-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9ELN Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron JN.1.11+S31 deletion spike protein (one RBD up state) 提交 2024-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.93 Å
9ELO Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron JN.1.11+S31 deletion spike protein (closed state) 提交 2024-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.74 Å
9ELP Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron JN.1.11.1+S31 deletion spike protein (one RBD up state) 提交 2024-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 17 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
9ELQ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron JN.1.11.1+S31 deletion spike protein (closed state) 提交 2024-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.64 Å
9F9Y SARS-CoV-2 BA-2.87.1 Spike ectodomain 提交 2024-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1183（1183 aa）
链 B 1–1183（1183 aa）
链 C 1–1183（1183 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9FC2 The crystal structure of the SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with the neutralizing nanobody 4. 提交 2024-05-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 332–534（203 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；22,5 % PEG 8000, 100mM NaAc pH 4.5, 200mM NaCl
分辨率 1.21 Å R-free 0.170
9FCM Single-domain antibody binding the SARS-COV2 S2 提交 2024-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1159–1211（53 aa）
链 E 1159–1211（53 aa）
链 F 1159–1211（53 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M sodium citrate pH 5.0, and 15% PEG4000
分辨率 1.94 Å R-free 0.247
9FGR SARS-CoV-2 (wuhan variant) Spike protein in complex with the single chain fragment scFv76-77 (focused refinement) 提交 2024-05-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9FGS SARS-CoV-2 (wuhan variant) Spike protein in complex with the single chain fragment scFv41N (focused refinement) 提交 2024-05-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9FGT SARS-CoV-2 (B.1.1.529/Omicron variant) Spike protein in complex with the single chain fragment scFv76 (focused refinement) 提交 2024-05-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9FGU SARS-CoV-2 (B.1.1.529/Omicron variant) Spike protein in complex with the single chain fragment scFv76-77 (focused refinement) 提交 2024-05-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9FJK Omicron BA.1 Spike protein with neutralizing NTD specific mAb K501SP6 提交 2024-05-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1207（1207 aa）
链 B 1–1207（1207 aa）
链 C 1–1207（1207 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；TBS, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.84 Å
9FMW Omicron BA.1 Spike protein with neutralizing NTD specific mAb K501SP6 提交 2024-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1207（1207 aa）
链 B 1–1207（1207 aa）
链 C 1–1207（1207 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；TBS, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9FR3 Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with nanobody 7F 提交 2024-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 D 14–1208（1195 aa）
链 G 14–1208（1195 aa）
链 H 14–1208（1195 aa）
链 J 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9FR4 Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with nanobody 7F (local refinement) 提交 2024-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 14–1208（1195 aa）
链 D 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9GDX SARS-CoV-2 Spike protein Beta Variant at 4C structural flexibility / heterogeneity analyses 提交 2024-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9GDY SARS-CoV-2 Spike protein Beta Variant at 37C structural flexibility / heterogeneity analyses 提交 2024-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9GXE Structure of the SARS-CoV spike glycoprotein in complex with a homotrimeric Bicycle molecule 提交 2024-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1146（1133 aa）
链 B 14–1146（1133 aa）
链 C 14–1146（1133 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 STE STEARIC ACID × 3 KZ0 2,4,6-tris(chloromethyl)-1,3,5-triazine × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
9GXG Structure of the SARS-CoV spike glycoprotein in complex with a biparatopic Bicycle molecule 提交 2024-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1146（1133 aa）
链 B 14–1146（1133 aa）
链 C 14–1146（1133 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 STE STEARIC ACID × 3 R06 1-[3,5-bis(2-chloranylethanoyl)-1,3,5-triazinan-1-yl]-2-chloranyl-ethanone × 3 KZ0 2,4,6-tris(chloromethyl)-1,3,5-triazine × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 1.92 Å
9H6U SARS-CoV-2 S protein in complex with pT1679 Fab 提交 2024-10-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–1208（1193 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
9IB0 Cryo-EM consensus map of prefusion SARS-CoV-2 spike (RBDs: 1 up & 2 down) bound to RBD-targeting MO176-117 antibody 提交 2025-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9IB1 Cryo-EM focus map of prefusion SARS-CoV-2 spike (RBDs: 1 up & 2 down) bound to RBD-targeting MO176-117 antibody 提交 2025-02-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9IB2 Cryo-EM consensus map of prefusion SARS-CoV-2 spike (RBDs: 2 up & 1 down) bound to RBD-targeting MO176-117 antibody 提交 2025-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9IB3 Cryo-EM focus map of prefusion SARS-CoV-2 spike (RBDs: 2 up & 1 down) bound to RBD-targeting MO176-117 antibody 提交 2025-02-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9IQP Crystal structure of the Wuhan SARS-CoV-2 Spike RBD (319-541) complexed with 1p1B10 nanobody 提交 2024-07-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
分辨率 1.55 Å R-free 0.208
9IU1 Structure of SARS-CoV-2 JN.1 spike RBD in complex with ACE2 (up state) 提交 2024-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 28–1210（1183 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, R682G, R683S, R685G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time 5 s and blotting force 5.
分辨率 4.30 Å
9IUP KP.3 RBD in complex with ACE2 提交 2024-07-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9IUQ KP.2 RBD in complex with ACE2 提交 2024-07-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 334–524（191 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9IUU JN.1 RBD with Q493E in complex with ACE2 提交 2024-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–527（195 aa）
突变：Q493E ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
9J66 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the human neutralizing antibody Fab fragment CAV-C65 (local refinement) 提交 2024-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 333–527（195 aa）
链 D 333–527（195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9JEB Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with a neutralizing antibody scFv N1 提交 2024-09-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–529（197 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2M Magnesium sulfate heptahydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3350, pH 6.0
分辨率 2.30 Å R-free 0.206
9JEB Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with a neutralizing antibody scFv N1 提交 2024-09-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 333–529（197 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2M Magnesium sulfate heptahydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3350, pH 6.0
分辨率 2.30 Å R-free 0.206
9JRC Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor-binding domain complexed with squirrel ACE2 提交 2024-09-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2M Ammonium chloride, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 3.16 Å R-free 0.229
9JS4 Cryo-EM structure of neutralizing antibody 8G3 in complex with BA.1 RBD 提交 2024-09-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 16–1207（1192 aa） 片段：RBD domain
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9JTE Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain complexed with fox ACE2 提交 2024-10-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2M Ammonium sulfate, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 3.66 Å R-free 0.249
9JTE Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain complexed with fox ACE2 提交 2024-10-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 333–527（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2M Ammonium sulfate, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 3.66 Å R-free 0.249
9K6J Crystal structure of SARS-CoV-2 WT RBD bound with P5-1C8 Fab 提交 2024-10-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 319–537（219 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291.15 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic,28% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.39 Å R-free 0.283
9K6Y Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 prototype spike protein in complex with H4 Fab (local refinement) 提交 2024-10-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.67 Å
9KT3 Structure of EG.5.1 S trimer with 2 down-RBDs complex with antibody CYFN1006-2. 提交 2024-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.63 Å
9KUD Crystal structure of SARS-CoV-2 JN.1 variant RBD complexed with squirrel ACE2 提交 2024-12-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 332–527（196 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M Sodium malonate pH 6.0 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.14 Å R-free 0.281
9KUD Crystal structure of SARS-CoV-2 JN.1 variant RBD complexed with squirrel ACE2 提交 2024-12-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 332–527（196 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M Sodium malonate pH 6.0 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.14 Å R-free 0.281
9KVD Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 prototype spike protein in complex with triple-nAb 3G5, 4H5 and 4C11 提交 2024-12-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 334–527（194 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
9KVE Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 prototype spike protein in complex with triple-nAb 4H1, 4A5 and 4C1 提交 2024-12-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 334–527（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
9KVF Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 EG.1 spike protein in complex with triple-nAb 4A5, 4C1 and 2E10 提交 2024-12-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 317–600（284 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9KVJ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 BA.5 spike protein in complex with nAb 1C4 (local refinement) 提交 2024-12-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 333–528（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
9KVK Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike protein in complex with three-nAb 8H12, 3E2 and 1C4 提交 2024-12-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
9KVQ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 BA.1 spike protein in complex with three-nAb 8H12, 3E2 and 1C4 提交 2024-12-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
9KVT Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 BA.2 spike protein in complex with triple-nAb 8H12, 3E2 and 1C4 (local refinement) 提交 2024-12-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9KWY Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with ACE2 and mAb 1C4 提交 2024-12-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 334–517（184 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9KZD The local refined map of SARS-CoV-2 EG.5.1 Variant Spike protein complexed with antibody XGi-171 提交 2024-12-10 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
9KZE The local refined map of SARS-CoV-2 EG.5.1 Variant Spike protein complexed with antibody XGi-183 提交 2024-12-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9KZZ Structure of SARS-CoV-2 EG.5.1 Variant Spike protein complexed with antibody XGi-171 提交 2024-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
9L05 The local refined map of SARS-CoV-2 EG.5.1 Variant Spike protein complexed with antibody XGi-198 提交 2024-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
9L07 The local refined map of SARS-CoV-2 EG.5.1 Variant Spike protein complexed with antibody XGi-203 提交 2024-12-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9L15 Structure of SARS-CoV-2 EG.5.1 Variant Spike protein complexed with antibody XGi-203 提交 2024-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
9L2L Structure of SARS-CoV-2 EG.5.1 Variant Spike protein complexed with antibody XGi-198 提交 2024-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
链 D 14–1208（1195 aa）
链 E 14–1208（1195 aa）
链 F 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 48 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
9L3I Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 BA.2.75 Spike Protein complex with a potent broad-spectrum macrocyclic peptide inhibitor 6L3-3P11K 提交 2024-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 28–1144（1117 aa）
链 B 28–1144（1117 aa）
链 C 28–1144（1117 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9L3Q Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 PT Spike Protein complex with a potent broad-spectrum macrocyclic peptide inhibitor 6L3-3P11K 提交 2024-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 B 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9L6C Cryo-EM structure of Delta RBD complexed with ConD-852, P2C-1F11 and S304 Fabs 提交 2024-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 333–526（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS, pH=7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
9LAE Locally refined region of SARS-CoV-2 spike in complex with antibodies 9G11 and 3E2. 提交 2025-01-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 319–541（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
9LBS Cryo-EM structure of Omicron BA.1 RBD complexed with ConBA-998,S309 and S304Fabs 提交 2025-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 337–517（181 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot time:4s wait time:2.5s blot force:0
分辨率 3.41 Å
9LD2 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 wide-type S trimer in the early fusion intermediate conformation (E-FIC) complexed with ACE2 and 76E1-Fab (focused refinement of the S2-76E1) 提交 2025-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
9LDJ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 wide-type S trimer in the early fusion intermediate conformation (E-FIC) complexed with ACE2 and 76E1-Fab 提交 2025-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 48 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.21 Å
9LDS Crystal structure of nanobody H145 bound to SARS-CoV-2 spike stem-helix 提交 2025-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1139–1153（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 70% v/v (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol
分辨率 1.60 Å R-free 0.202
9LDS Crystal structure of nanobody H145 bound to SARS-CoV-2 spike stem-helix 提交 2025-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1139–1153（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 70% v/v (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol
分辨率 1.60 Å R-free 0.202
9LH2 Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain (Delta) in complex with pH-dependent nanobody MNb-11. 提交 2025-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 320–537（218 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291.15 K；0.09M NPS, 0.1M Tris (base), 0.1M BICINE, pH 8.5, 20% v/v PEG 500* MME, 10 % w/v PEG 20000
分辨率 2.30 Å R-free 0.236
9LH2 Crystal structure of SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain (Delta) in complex with pH-dependent nanobody MNb-11. 提交 2025-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 320–537（218 aa） 片段：Receptor-binding domain (RBD)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291.15 K；0.09M NPS, 0.1M Tris (base), 0.1M BICINE, pH 8.5, 20% v/v PEG 500* MME, 10 % w/v PEG 20000
分辨率 2.30 Å R-free 0.236
9LOY Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 JN.1 spike glycoprotein in complex with F61R2-780 Fab 提交 2025-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.66 Å
9LOZ Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 JN.1 RBD in complex with F61R2-780 Fab 提交 2025-01-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 333–527（195 aa） 片段：RBD domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9LP0 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 KP.3.1.1 spike glycoprotein in complex with F61R2-780 Fab 提交 2025-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.61 Å
9LP1 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 KP.3.1.1 RBD in complex with F61R2-780 Fab 提交 2025-01-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 334–528（195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
9LS3 S-ECD of SARS-CoV-2 Delta variant in complex with Fab854 提交 2025-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9LVI Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike protein 提交 2025-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 2.86 Å
9LVS Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein in complex with S416 提交 2025-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EZO 2-[(E)-[[4-(2-chlorophenyl)-1,3-thiazol-2-yl]-methyl-hydrazinylidene]methyl]benzoic acid × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 2.95 Å
9LYO Alpha SARS-CoV-2 spike protein in complex with REGN10987 Fab homologue. 提交 2025-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 16–1208（1193 aa）
链 B 16–1208（1193 aa）
链 C 16–1208（1193 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
9MI3 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike protein in complex with neutralizing human antibody WRAIR-2008 提交 2024-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1208（1195 aa）
链 C 14–1208（1195 aa）
链 K 14–1208（1195 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS + 2% v/v glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9ML4 Structure of the SARS-CoV-2 Spike 6P in complex with the rabbit M8b-A10 Fab 提交 2024-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9ML5 Structure of the SARS-CoV-2 Spike 6P in complex with the rabbit M8b-B8 Fab 提交 2024-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9ML6 Structure of the SARS-CoV-2 Spike 6P in complex with the rabbit M8b-C9 Fab 提交 2024-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9ML7 Structure of the SARS-CoV-2 Spike 6P in complex with the rabbit M8b-C10 Fab 提交 2024-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1213（1213 aa）
链 B 1–1213（1213 aa）
链 C 1–1213（1213 aa）
突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9ML8 Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with the rabbit M8b-B1 Fab 提交 2024-12-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 328–533（206 aa） 片段：Receptor-Binding Domain
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M lithium sulfate 0.1 sodium citrate 20% (w/v) PEG 1,000
分辨率 2.40 Å R-free 0.247
9ML8 Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with the rabbit M8b-B1 Fab 提交 2024-12-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 328–533（206 aa） 片段：Receptor-Binding Domain
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M lithium sulfate 0.1 sodium citrate 20% (w/v) PEG 1,000
分辨率 2.40 Å R-free 0.247
9ML8 Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with the rabbit M8b-B1 Fab 提交 2024-12-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 328–533（206 aa） 片段：Receptor-Binding Domain
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M lithium sulfate 0.1 sodium citrate 20% (w/v) PEG 1,000
分辨率 2.40 Å R-free 0.247
9ML8 Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with the rabbit M8b-B1 Fab 提交 2024-12-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 328–533（206 aa） 片段：Receptor-Binding Domain
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M lithium sulfate 0.1 sodium citrate 20% (w/v) PEG 1,000
分辨率 2.40 Å R-free 0.247
9ML9 Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD in complex with the rabbit M8b-C9 Fab 提交 2024-12-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 328–533（206 aa） 片段：Receptor-Binding Domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；297 K；2% v/v 1,4-dioxane 0.1M Tris pH 8.0 15% (w/v) PEG 3,350
分辨率 2.59 Å R-free 0.257
9MPW SARS-CoV2 Spike S2 Subunit in complex with M15 Antibody Fragment 提交 2024-12-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 S 686–1208（523 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
9MR1 SARS-CoV-2 S2 monomer in complex with R125-61 Fab 提交 2025-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 698–1161（464 aa）
突变：F817P, G880C, F888C, A892P, A899P, A942P, T912P, K986P, V987P, T1117C, D1139C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9MR2 SARS-CoV-2 S2 monomer in complex with NICA01A-1401 Fab 提交 2025-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 698–1161（464 aa）
突变：F817P, G880C, F888C, A892P, A899P, A942P, T912P, K986P, V987P, T1117C, D1139C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.79 Å
9N2L Cryo-EM structure of locally refined up conformation of SARS-CoV-2 spike protein Receptor Binding Domain 提交 2025-01-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.99 Å
9NVG Structure of SARS-CoV-2 BA.1 spike RBD bound to COV2-3835 Fab 提交 2025-03-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
突变：HexaPro construct 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9NXY Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike S2' trimer 提交 2025-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 686–1273（588 aa）
链 B 686–1273（588 aa）
链 C 686–1273（588 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
9O5T Crystal structure of chimeric SARS-CoV-2 RBD complexed with chimeric Rhinolophus sinicus ACE2 提交 2025-04-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 319–536（218 aa） 片段：receptor-binding domain (UNP residues 319-536)
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5-8.5, 16-24% PEG6000, 100 mM sodium chloride
分辨率 2.90 Å R-free 0.251
9O5T Crystal structure of chimeric SARS-CoV-2 RBD complexed with chimeric Rhinolophus sinicus ACE2 提交 2025-04-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 319–536（218 aa） 片段：receptor-binding domain (UNP residues 319-536)
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5-8.5, 16-24% PEG6000, 100 mM sodium chloride
分辨率 2.90 Å R-free 0.251
9O5V Crystal structure of chimeric BANAL-52 RBD complexed with chimeric Rhinolophus sinicus ACE2 提交 2025-04-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 319–536（218 aa） 片段：receptor-binding domain (UNP residues 319-536)
未记录 ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5-8.5, 16-24% PEG6000, 100 mM sodium chloride
分辨率 3.35 Å R-free 0.266
9O5V Crystal structure of chimeric BANAL-52 RBD complexed with chimeric Rhinolophus sinicus ACE2 提交 2025-04-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 319–536（218 aa） 片段：receptor-binding domain (UNP residues 319-536)
未记录 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5-8.5, 16-24% PEG6000, 100 mM sodium chloride
分辨率 3.35 Å R-free 0.266
9OG4 SARS-COV-2-6P-MUT7 S PROTEIN-DY-III-281 complex closed conformation 提交 2025-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 5 s
分辨率 3.56 Å
9OG5 SARS-COV-2-6P-MUT7 S PROTEIN-DY-III-281 complex 1 RBD up conformation 提交 2025-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 5 s
分辨率 3.30 Å
9OG6 Apo SARS-COV-2-6P-MUT7 S PROTEIN closed conformation 提交 2025-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot time of 5 s
分辨率 3.14 Å
9OG7 APO SARS-COV-2-6P-MUT7 S PROTEIN 1 RBD UP CONFORMATION 提交 2025-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P 突变：R682G, R683S, R685S, V705C, F817P, T883C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；5 s blot time.
分辨率 3.09 Å
9PSN Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies BoWLB-105 and CC12.3 提交 2025-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–533（201 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate citric acid buffer (pH 4.0), 25% (v/v) polyethylene glycol 200, and 5% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 2.54 Å R-free 0.254
9PSN Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies BoWLB-105 and CC12.3 提交 2025-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 T 333–533（201 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate citric acid buffer (pH 4.0), 25% (v/v) polyethylene glycol 200, and 5% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 2.54 Å R-free 0.254
9PSO Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies BoWLB-622 and CC12.3 提交 2025-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 333–533（201 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 11 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate citric acid buffer (pH 5.0), 1.6 M ammonium sulfate, and 20% (v/v) glycerol
分辨率 2.62 Å R-free 0.258
9PSP Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies BoWLB-1173 and CC12.3 提交 2025-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 T 333–533（201 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate citric acid buffer (pH 4.0), 25% (v/v) polyethylene glycol 200, and 5% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 2.81 Å R-free 0.247
9PSP Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with antibodies BoWLB-1173 and CC12.3 提交 2025-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 U 333–533（201 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M sodium citrate citric acid buffer (pH 4.0), 25% (v/v) polyethylene glycol 200, and 5% (w/v) polyethylene glycol 6000
分辨率 2.81 Å R-free 0.247
9PW4 Structure of V30V4 in complex with SARS-CoV-2 spike 提交 2025-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–684（684 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
9RN6 Crystal structure of a protein mimic of SARS-CoV-2 spike's HR1 domain in complex with two nanobodies bound to different epitopes 提交 2025-06-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 915–988（74 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；288 K；0.15 M NaCl, PEG 6000 50% (v/v), 0.1 M Tris/HCl
分辨率 2.40 Å R-free 0.263
9SAT Monoclonal Antibodies from COVID-19 Convalescent Patients Target Cryptic Epitopes for Universal SARS-CoV-2 Neutralization 提交 2025-08-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 319–541（223 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289.15 K；0.2M Zinc Acetate Dehydrate, 0.1M Sodium Cacodylate Trihydrate, 15% PEG 8000
分辨率 2.56 Å R-free 0.275
9SBB Monoclonal Antibodies from COVID-19 Convalescent Patients Target Cryptic Epitopes for Universal SARS-CoV-2 Neutralization 提交 2025-08-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 327–535（209 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 LI LITHIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.2M Lithium Citrate Tribasic Tetrahydrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.12 Å R-free 0.230
9T74 2'-fluoro-modified pyrimidine (FY) RNA aptamer binding to the receptor binding domain (RBD) of the SARS-CoV-2 spike protein. (focus map: RBD-aptamer) 提交 2025-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 B 14–1147（1134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
9UE6 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 KP.2 spike RBD in complex with ACE2 提交 2025-04-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 333–528（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9UG3 Structure of SARS-CoV-2 spike-CD147 complex at 3.75 Angstroms resolution 提交 2025-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 27–1146（1120 aa）
链 B 27–1146（1120 aa）
链 C 27–1146（1120 aa）
突变：residues 1-1208 突变：residues 1-1208 突变：residues 1-1208 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Pbs
分辨率 3.75 Å
9UPR Cryo-EM structure of the N-terminal domain of Omicron BA.1 in complex with nanobody N103 and S2L20 Fab 提交 2025-04-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–305（305 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.77 Å
9UTF Crystal Structure of SARS-CoV-2 S receptor-binding domain (RBD) in complex XG83 Fab 提交 2025-05-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 321–591（271 aa） 片段：receptor binding domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；288 K；18% PEG 6000, G11. 0.15M Lithium sulfate monohydrate, 0.1M Citric Acid pH 3.5.
分辨率 2.95 Å R-free 0.295
9UXD SARS-CoV2 Spike protein with Fab fragment antibody KXD355,state1 提交 2025-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：F817P/A892P/A899P/A942P/K986P/V987P 突变：F817P/A892P/A899P/A942P/K986P/V987P 突变：F817P/A892P/A899P/A942P/K986P/V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
9UXE SARS-CoV2 Spike protein with Fab fragment antibody KXD355,state2 提交 2025-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
突变：F817P/A892P/A899P/A942P/K986P/V987P 突变：F817P/A892P/A899P/A942P/K986P/V987P 突变：F817P/A892P/A899P/A942P/K986P/V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
9UXS The local refine of 3D reconstruction of the complex formed by SARS-CoV2 BA.1 spike glycoprotein and a single-domain antibody 提交 2025-05-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 14–1208（1195 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9UYD SARS-CoV-2 Ancestral strain spike S-cred 提交 2025-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 27–1146（1120 aa）
链 B 27–1146（1120 aa）
链 F 27–1146（1120 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å
9VLS Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 S trimer in the early fusion intermediate conformation (E-FIC) complexed with ACE2 and 76E1-Fab (focused refinement of the S2-76E1) 提交 2025-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9VLT Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 S trimer in the early fusion intermediate conformation (E-FIC) complexed with ACE2 and 76E1-Fab 提交 2025-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.65 Å
9W14 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 WT spike protein in complex with nAb 1C4 提交 2025-07-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 319–541（223 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.33 Å
9WLA Local refinement region of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with antibodies CT1-5. 提交 2025-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.60 Å
9WLB Local refinement region of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with antibodies S309 and CT1-1. 提交 2025-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 319–541（223 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.74 Å
9WSP Cryo-EM structure of SARS CoV2 S protein with stabilising mutations 提交 2025-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–1147（1121 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.55 Å
9XGO Omicron-specific ultra-potent SARS-CoV-2 neutralizing antibodies targeting the N1/N2 loop of Spike N-terminal domain 提交 2025-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 N 15–303（289 aa）
链 R 323–545（223 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.77 Å
9Y5Y Structure of the Omicron Spike RBD bound by the monobody s19382 (local refinement from dimerized Spike protein ECDs) 提交 2025-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 334–528（195 aa） 片段：receptor-binding domain
链 C 334–528（195 aa） 片段：receptor-binding domain
链 E 334–528（195 aa） 片段：receptor-binding domain
链 G 334–528（195 aa） 片段：receptor-binding domain
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
9YNX Local refinement of Fab-14/SARS-CoV-2 D614G spike complex, Mode IV, Subgroup I conformation 提交 2025-10-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 323–527（205 aa）
链 B 323–527（205 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9YOK Fab-14/SARS-CoV-2 D614G spike complex, Mode I conformation 提交 2025-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9YPB Fab-14/SARS-CoV-2 D614G spike complex, Mode IV, subgroup II conformation 提交 2025-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9YPR Fab-14/SARS-CoV-2 D614G spike complex, Mode IV, subgroup I conformation 提交 2025-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–1208（1208 aa）
链 B 1–1208（1208 aa）
链 C 1–1208（1208 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
9YYU SARS-CoV-2 spike trimer in the early fusion intermediate conformation bound to the VN01H1 Fab (Fab local refinement) 提交 2025-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
突变：D614G variant, R682S, R683G 突变：D614G variant, R682S, R683G 突变：D614G variant, R682S, R683G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9YYV SARS-CoV-2 spike trimer in the early fusion intermediate conformation bound to the VN01H1 Fab (S2 local refinement) 提交 2025-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–1211（1198 aa）
链 B 14–1211（1198 aa）
链 C 14–1211（1198 aa）
突变：R682S, R683G 突变：R682S, R683G 突变：R682S, R683G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9Z3K SARS-CoV-2 S2 trimer stabilized in the early fusion intermediate conformation by circular permutation and clamping by gp41 (E-FICs-v1) 提交 2025-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 914–1131（218 aa）
链 A 703–828（126 aa）
链 B 914–1131（218 aa）
链 B 703–828（126 aa）
链 C 914–1131（218 aa）
链 C 703–828（126 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9Z80 SARS-CoV-2 S2 in complex with polyclonal Fab_Donor1 提交 2025-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric
链 C 698–1161（464 aa）
链 D 698–1161（464 aa）
链 E 698–1161（464 aa）
突变：S704C, K790C, G880C, F888C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, T961F, V991W, T998W 突变：S704C, K790C, G880C, F888C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, T961F, V991W, T998W 突变：S704C, K790C, G880C, F888C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, T961F, V991W, T998W NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
9ZDU Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD in complex with human Ab401 Fab 提交 2025-11-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 328–533（206 aa） 片段：Receptor-Binding Domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2 M Ammonium phosphate monobasic 20% PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.253
9ZT5 SARS-CoV-2 S2 in complex with polyclonal Fab-B_Donor3 提交 2025-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 698–1161（464 aa）
链 D 698–1161（464 aa）
链 E 698–1161（464 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.21 Å
9ZT6 SARS-CoV-2 S2 in complex with polyclonal Fab-B_Donor8 提交 2025-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 698–1161（464 aa）
链 D 698–1161（464 aa）
链 E 698–1161（464 aa）
突变：S704C, K790C, G880C, F888C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, T961F, V991W, T998W 突变：S704C, K790C, G880C, F888C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, T961F, V991W, T998W 突变：S704C, K790C, G880C, F888C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, T961F, V991W, T998W NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
9ZT7 SARS-CoV-2 S2 in complex with COV2-2509 提交 2025-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 698–1161（464 aa）
链 D 698–1161（464 aa）
链 E 698–1161（464 aa）
突变：S704C, K790C, G880C, F888C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, T961F, V991W, T998W 突变：S704C, K790C, G880C, F888C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, T961F, V991W, T998W 突变：S704C, K790C, G880C, F888C, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P, T961F, V991W, T998W NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
9ZT8 Stabilized SARS-CoV-2 S2 apo 提交 2025-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 698–1161（464 aa）
链 B 698–1161（464 aa）
链 C 698–1161（464 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å

共 2152 个其他 PDB 条目、2473 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SPIKE_SARS2
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–9； UniProt 269–277

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7mkb

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7mkb
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7mkb
沉积日期 deposition_date2021-04-22
结构标题 titleHuman leukocyte antigen A*0201 in complex with SARS-CoV-2 epitope YLQPRTFLL
关键词 keywords;SARS-CoV-2, CD8+, epitope, HLA, human major histocompatibility complex, MHC-I, YLQPRTFLL, HLA-A2, HLA-A*02:01 IMMUNE SYSTEM-VIRAL PROTEIN complex, IMMUNE SYSTEM-VIRAL PROTEIN complex ;; IMMUNE SYSTEM/VIRAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier24.08 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron22.90 Å
零角强度 I(0) i036426200.00
分子量 molecular_weight44891.0 kDa
排除体积 excluded_volume55417 ų
包络体积 envelope_volume67867 ų
水化壳体积 shell_volume24764 ų
包络直径 envelope_diameter78.3 Å
壳层 Rg shell_rg29.85 Å
包络 Rg envelope_rg22.99 Å
形状 Rg shape_rg22.88 Å
总 Rg total_rg23.79 Å
总原子数 total_atoms3170
残基数 n_residues383
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax74.7 Å
Rg (实空间) rg_real24.01 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.46 Å
I(0) (实空间) i0_real3.6430e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.3820e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal24.03 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal36430000.0000
解质量估计 total_estimate0.9097
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary30.3 Å
偏度 Skewness skewness0.242
峰度 Kurtosis kurtosis-0.476
角度范围 angular_range— – 0.3300 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha9662000.0000
实空间数据点数 n_real_points65
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.953; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.965
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)